Biotecnologia 2012 Univ Trujillo.PDF
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2012
PROFESOR: M.Sc. Jos
Gavidia Valencia
20/02/2012
BIOTECNOLOGA
UNIVERSIDAD NACIONAL DE TRUJILLO FACULTAD DE FARMACIA Y BIOQUMICA
Chacaltana Lozano Carlo
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Biotecnologa
A. H. Scragg
La federacin Europea de Biotecnologa
de la ingeniera, la bioqumica y la microbiologa para conseguir la aplicacin tecnolgica
(industrial) de la capacidad de los microorganismos, clulas de tejido cultivado y sus
industria manufacturera o en operaciones de servicio. El termino biotecnologa puede
significar que se trata de una disciplina individual, pero la esencia de la biotecnologa en su
naturaleza multidisciplinaria, la cual requiere amplias aportaciones de la ciencia y la
ingeniera. Esto quiz se ilustre mejor en la figura 1.1 es debido a estos requerimientos
multidisciplinarios de la biotecnologa que este libro, y el curso del cual se derivo, se
diseo para presentar el tema a los ingenieros quienes por lo general tienen muy poco
contacto con la biociencias. La terminologa propia de cualquier materia puede ser
obstculo para entenderla.
A menudo se piensa que la biotecnologa consiste solo en la ingeniera gentica y
anticuerpos monoclonales. Tener una definicin tan simple sera un error puesto que ignora
la mayor parte de la biotecnologa, incluyendo algunas de las reas ms exitosas.
En la tabla 1.1 se da una lista con ejemplos de algunos productos se la biotecnologa.
En contradiccin con la creencia popular, la biotecnologa no es un tema de creacin
reciente, sino que data de los sumerios y los egipcios, 6000 a 4000 aos antes de Cristo.
La escala de tiempo en evolucin de la biotecnologa se ilustra bien en la tabla preparada
por Howink (1984), la tabla 1.2. la evolucin de la biotecnologa se puede dividir en cinco
eras.
1.1 LA ERA ANTERIOR A PASTER
Esta se basaba en los alimentos y bebidas fermentadas tradicionales sin ningn
conocimiento de biologa. La produccin de cerveza fue producida por los sumerios
hace aproximadamente 6000 aos a. C. fueron los chinos quienes inventaron la
destilacin en el ao 14 d. C. para la produccin de bebidas con alto contenido de
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alcohol. El uso de levaduras para formar dixido de carbono y, as, esponjar el pan, se
introdujo tambin en Egipto 4000aos a. C. en esta poca se crearon otros usos de los
microorganismos, en la formacin del acido actico a partir del etanol (vinagre), la
elaboracin de queso y yogurts. Sin embargo, no fue sino hasta el siglo XVII, que
Antonio van leeuwenhoek demostr por primera vez la presencia de microorganismos.
Tabla 1.1 Ejemplos de productos de diferentes categoras en la biotecnologa (segn
Cooney, 1983).
Masa celular Levadura de Baker, protena celular.
Componentes celulares Protenas intracelulares.
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Productos biosintticos Antibiticos, vitaminas, aminocidos, cidos orgnicos.
Productos catablicos Etanol, metano y acido lctico.
Bioconversin Jarabe de maz rico en fructosa, acido 6 amino penicilanico.
Tratamiento de
desechos
Lodo activado, digestin anaerobia.
Tabla 1.2 Biotecnologa calendario de eventos (segn Houwink, 1984)
La era prepasteur, antes de 1985
Bebidas alcohlicas (cerveza y vino)
Productos lcteos (queso, yogurt)
Otros alimentos fermentados
La era de pasteur, 1865-1940
Etanol, butanol, acetona, glicerol
cidos orgnicos (acido ctrico)
Tratamiento aerobio de aguas residuales
La era de los antibiticos, 1940-1960
Penicilinas: tecnologa de la fermentacin sumergida
Gran variedad de antibiticos
Tecnologa de la estructura de la clula animal, vacunas contra virus
Transformaciones microbiolgicas de esteroides
La era post antibiticos, 1960-1975
Aminocidos
Protena celular (SCP)
Tecnologa de las clulas y las enzimas inmovilizadas (glucosa isomerasa)
Tratamiento anaerobio de aguas de desecho (biogas)
Polisacridos bacterianos (goma de xantn)
Gasohol
La era de la nueva biotecnologa 1975-
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Tecnologa de los hibridosomas: anticuerpos monoclonales
Prueba diagnstica con anticuerpos monoclonales (1980)
Ingeniera gentica (1974)
Vacuna de origen animal contra la diarrea (1982)
Insulina humana (1982)
1.2 LA ERA PASTEUR
El trabajo de Pasteur mostro por primera vez que los microoranismos eran los agentes
activos en procesos como la produccin de cerveza, vino y la descomposicin de los
alimentos. A este trabajo lo secundaron escasos progresos en el estudio de los
microorganismos hasta el comienzo del siglo XIX, cuando se introdujeron los procesos
microbiolgicos para la produccin de acetona, butanol, glicerol y acido ctrico. Quiz
fue el descubrimiento de weizman, realizado en 1913-1915 en manchester, de un
proceso microbiolgico para la produccin de acetona y butanol por clostridium
acetobutylicum, el que anunci el comienzo real de la biotecnologa. Este proceso solo
se optimizo en los aos 50. Otro proceso importante creado en manchester fue el uso de
lodos activados para tratar aguas negras, el cual comenz en 1914. La primera guerra
mundial impulso la produccin microbiolgica del glicerol a partir de la glucosa en
Alemania.
1.3 LA ERA DE LOS ANTIBIOTICOS
La investigacin entre 1920 y 1940 gradualmente dio como resultado una mejor
comprensin de la biologa, y se reconoci a las enzimas catalizan los procesos
biolgicos. As mismo, los estudios en gentica introdujeron el concepto de que genes
individuales llevan informacin para formar enzimas particulares. Aunque Flemming
descubri la penicilina en 1928, no fue sino hasta 1940 que los avances en su
aislamiento permitieron su produccin en masa. Al principio la penicilina se produjo en
botellas, pero se aplicaron las tecnologas de los procesos qumicos y de los alimentos,
las cuales permitieron que por primera vez el cultivo en gran escala de Penicillum en
fermentadores o birreactores. En la actualidad, cada ao se producen unas 12 000
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toneladas de penicilina. A la produccin de penicilina le siguieron una amplia variedad
de antibiticos como la estreptomicina y la eritromicina.
1.4 LA ERA DE LOS POSTANTIBIOTICOS
Durante este periodo el reconocimiento del metabolismo microbiano permiti una
explotacin mucho ms amplia de las capacidades de una variedad de microorganismos.
Estos se usaron para producir las vitaminas B2 B12 y los aminocidos lisina y acido
glutamico (glutamato monosodico), los ltimos en volumen de 30 000 y 40 000
toneladas, respectivamente. Esta era tambin presencio la produccin masiva de
enzimas para uso industrial, como la adicin de las proteasas a los detergentes
domsticos y la transformacin enzimtica de la glucosa a fructosa para producir un
high-fructose syrup, HFS jarabe rico en fructosa.
En los inicio de los aos sesenta se estuvo de acuerdo en que habra escases de
protenas, en particular en los pases de tercer mundo. Entonces, se buscaron otras
fuentes de protenas; estas incluyeron microorganismos como algas, bacterias y
levaduras. En 1964 el profesor Wilson del instituto de tecnologa de Massachusetts
(MIT) acuo la palabra single- elul para denominar las
protenas microbianas. Los microorganismos tienen la capacidad de crecer en una vasta
composicin de compuestos. Estas fuentes se dividen en dos grupos principales,
renovables y no renovables. Los recursos renovables son mucho de los productos de
desechos agrcolas como el bagazo (residuo de la caa de azcar), el almidn y la
celulosa. Muchas compaa grandes, participaron en la creacin de estos procesos. La
mayora de las investigaciones se enfoco al mejoramiento de estos desechos agrcolas
para producir alimentos para animales, pero una compaa, la Rank Hovis Mcdougall,
procedi a cultivar un moho para producir un alimento para humanos. Tuvieron que
pasar 20 aos para asegurarse de que el producto conocido como microproteina fuese
apto para el consumo humano. Las fuentes no renovables investigadas para usarlas en la
produccin de protena celular fueron, principalmente, subproductos de la industria
petroqumica, como los alcanos, el metano o el metanol. De nuevo fueron las
compaas petroqumicas, quienes participaron en la investigacin. La British
Petroleum (BP) investigo el uso de los alcanos en la obtencin de protena celular a
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partir de levaduras (tropina), en tanto que las industrias Shell y la Imperial Chemical
Industries Lid (ICI), utilizaron metano y metanol respectivamente.
Solo el proceso ICI alcanzo una escala comercial con el cultivo de la bacteria
methilophilus methylotrophus en metanol, en un proceso continuo con un volumen de
1.5 millones de litros. El mejoramiento de este y otros procesos, condujera al avance
considerable en la tecnologa de la fermentacin. Sin embargo, la disponibilidad de
protenas de soya barata ha hecho que el proceso SCP sea incontestable y, segn parece,
el mundo actual no tiene dficit de protena.
La era pos antibitica tambin presencio el mejoramiento de la fermentacin en la
produccin de etanol para que fuera utilizado como combustible (gasohol), provocado
por la crisis del petrleo en 1974. Otros productos formados por microorganismos son
los polisacridos extracelulares, como la goma de xantano, usada para reemplazar la
goma natural en los alimentos y en los lodos de perforacin. Al mismo tiempo se ha
creado los cultivos de clulas vegetales y animales para la produccin de compuestos
especiales. Los microorganismos se han usado tambin como auxiliares en la
lixiviacin de minerales como el Zinc y el cobre a partir de minerales de grado menor.
1.5 LA NUEVA BIOTECNOLOGIA
Las nuevas biotecnologas se consideran a menudo como la biotecnologa misma. Sus
principales avances han sido los anticuerpos monoclonales y la ingeniera gentica. Los
anticuerpos monoclonales son los productos de la tecnologa del hibridoma. Esta se
basa en la fusin de las clulas animales, las del sistema inmune que, por lo general, no
pueden ser cultivadas in vitro, con clulas cancerosas que si pueden hacerlo. Las lneas
de clulas hibridas que se forman, tiene la capacidad de crecer y producir anticuerpos
altamente especficos, los cuales se conocen como anticuerpos monoclonales. La
produccin de anticuerpos monoclonales ha sido rpida, desde su descubrimiento en
1975 y, actualmente, hay ms de 50 en el mercado. Se han utilizado en pruebas de
diagnostico rpido, frmacos de accin especfica, purificacin, y su comercializacin
es cada vez mayor.
La ingeniera gentica se puede definir en forma simple con la capacidad para transferir
genes de un organismo a otro, para cruzar la barrera que no se podran mediante los
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mtodos genticos ordinarios. El avance de esta tcnica dependi de tres
descubrimientos independientes. El primero fue el descubrimiento de las enzimas de
restriccin, las cuales pueden cortar el ADN en sitios especficos para producir
fragmentos discretos. El segundo descubrimiento fue al presenciar, en las bacterias, de
ciertas molculas de DNA circular con reproduccin independiente (plsmidos), las
cuales se pueden cortar con enzimas de restriccin y posteriormente repararse (reunirse)
para incluir otros fragmentos de DNA. El tercer descubrimiento fue el mtodo de tratar
las bacterias para que puedan captar el DNA de un plsmido y, por tanto, contener
nuevos genes (transformados). Estos tres descubrimientos han permitido la evolucin
de la ingeniera gentica, la cual ha mostrado tan rpido crecimiento que ha formado la
base de muchas compaas nuevas.
Tabla 1.3 Eventos principales en la comercializacin de nuevas biotecnologas.
1973 Primer gen clonado
1974 Primera exposicin de un gen clonado en diferentes especies de bacterias.
1975 Anticuerpos monoclonales.
1976 Primera firma (Genetech) en explotar la tecnologa del DNA recombinante
(rDNA)
1980 Informe sobre biotecnologa en el Reino Unido (Spink)
1981 Primer paquete de diagnostico con anticuerpos monoclonales aprobado en
los Estados Unidos.
1982 Primera vacuna de origen animal producida por rDNA (colibacilosis)
aprobada en Europa. Primer producto farmacutico del rDNA, insulina
humana.
Tabla 1.4 Nuevas tcnicas en el avance de la biotecnologa (segn Dunnhill y
Rudd1984)
Cultivo de tejidos, clulas vegetales y animales.
Fusin de protoplastos.
Modificacin estructural de protenas (ingeniera de protenas).
Clulas y enzimas inmovilizadas.
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Biosensores.
Uso de las computadoras en fermentaciones.
Nuevos diseos de biorreactores.
La tcnica ha mostrado aplicacin en el campo de la medicina en la generacin de
muchos sistemas diagnsticos, la produccin de insulina humana y la hormona de
crecimiento por bacterias y la produccin de diversas vacunas. La ingeniera gentica
tambin ha tenido influencia en la agricultura y en la industria alimentaria. En la tabla
1.3 se muestra algunos conceptos de los principales sucesos que ha tenido lugar en la
comercializacin de la ingeniera gentica.
En la figura 1.4 se muestran otras tcnicas que se estn investigando en reas
importantes de la biotecnologa. Estas incluyen: el cultivo de clulas vegetales y
animales, las clulas o enzimas inmovilizadas , los sensores biolgicos, un sensor que
detecta materiales biolgicos o una sonda que contiene materiales biolgicos, la
modificacin estructural de protenas (ingeniera de protenas), el uso de computadoras
en las fermentaciones y nuevos biorreactores.
Este libro est
impartido en el wolfson institute of biotechnology (instituto de biotecnologa de
Wolfson). El curso intenta, en una semana, presentar a los ingenieros, directores y a
otros profesionales no-bilogos, la caracterizacin principal de la biologa y como se
relaciona con la biotecnologa, e incluso con otras prcticas y conferencias de personas
eminentes que trabajan en la industria. No se debe esperar que el libro cubra la
biotecnologa en su totalidad, por ejemplo, no incluye una seccin sobre anticuerpos
monoclonales, pero debe servir como una introduccin a un rea fascinante y excitante
como lo es la biotecnologa.
BIBLIOGRAFIA
Brown, C. M. Campbell, I., and Priest, F. G. (1987). Introduction to biotechnology.
Blackwell Scientific Publications, Oxford.
Bu`Cock, J. and Kristiansen, B. (1987). Basic Biotechnology. Academic Press, London.
Cooney, C. L. (1983).Bioreactors desing and operation. Science, 219,728.
-
Higgins, I. J., Best, D.J,. and Jones, J. (1985). Biotechnology. Blackwell Scientific
Publications. Oxford.
Dunnill.P. And Rudd, M. (1984). Biotecnology and British Industry. A report to the
Biotechnology Directorate, SERC, London.
Houwink (1984). A realistic view on biotechnology. European Federation of
Biotechnology. Dechema, Frankfurt.
Prave, p., Faust, U., SIttig, W., and Sukatsch, D. A. (1987). Basic Biotechnology. VCH,
Weinheim.
Smith, J. E. (1985). Biotechnology Principles. Van Nostrand Reinhold, England.
2.- ESTRUCTURA Y FUNCION CELULAR
2.1.- INTRODUCCION:
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Todos los organismos vivientes, ya sean bacterias, levaduras, animales o vegetales,
comparten muchas caractersticas comunes. Todos los organismos con la posible excepcin
de los virus, tienen una composicin comn que consisten en cidos desoxirribonucleicos
(DNA), cidos ribonucleicos (RNA) y protenas.la molcula de DNA es la que
constityelos genes, los que a su vez contienen toda la informacin requerida para formar y
controlar el organismo. La informacin contenida en el DNA se transfiere al resto del
organismo para ejercer su funcin de la manera como la informacin almacenada en un
disco de computadora necesita ser leda. El flujo de informacin desde el DNA hacia el
resto de la clula esta mediada por molculas de RNA, las cuales finalmente dirigen la
sntesis de protenas que, como componentes estructurales o como enzimas, dirigen y
controlan muchas de las funciones del organismo. El proceso de transferir la informacin
gentica del DNA a las molculas de RNA se conoce como transcripcin: la transferencia
de informacin desde la molcula de RNA a las protenas se conoce como traduccin.
Adems de contener estos tres tipos de molculas, los organismos realizan ciertas
reacciones qumicas comunes conocidas colectivamente como metabolismo. Para crecer y
dividirse, se necesita un organismo para sintetizar sus propios constituyentes celulares a
partir de substancias qumicas externas y, para lograr esto, a menudo organismos diferentes
tienen vas enzimticas similares y una estructura celular bsica.
2.2.- LOS COMIENZOS DE LA MICROBIOLOGA
La microbiologa es el estudio de los organismos que son demasiado pequeos para verlos a
simple vista (menores de 0.1 mm) y que fueron descubiertos en el siglo XVII por Robert.
ESTRUCTURA Y FUNCION CELULAR.
ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO, DNA.
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Transcripcin
ACIDO RIBONUCLEICO, RNA.
Traduccin
Protenas
Tabla 2.1. Evolucin de la microbiologa
Hook publica la micrographia, en la cual describe e ilustra la estructura celular del cerebro.
Leeuwenhoek mejora las lentes del microscopio y descubre diversas formas de vida
unicelular.
Lzaro Spallanzani aporta evidencias de que los microorganismos no surgen
espontneamente.
Wohler sintetiza la urea desmintiendo el punto de vista de que los compuestos orgnicos
solo pueden ser sintetizados por organismos vivos.
C. Cagniard-latour, th. Schwann y F. Kutzinzing proponen de manera independiente que las
levaduras que aparecen durante la fermentacion son plantas microscpicas y son las
causantes de esta.
Schileiden y Schwann dan argumentos convincentes para la doctrina celular.
Pasteur propone que todos los procesos fermentativos son el resultado de actividad
microbiana y descubre los organismos anaerobios.
Tyndall cre un mtodo de esterilizacin por calentamiento discontinuo.
Roberto Koch demuestra la causa bacteriolgica o etiologa del ntrax.
Roberto Koch y su grupo introducen las tcnicas de cultivo puro, incluyendo la caja de petri
inventadas por Ricardo Petri.
TIPOS DE ORGANIZACIN CELULAR
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Hooke y Antony Van Leeuwenhock (tabla 2.1). Con el uso de microscopio simples.
Leeuwenhoek describi diversos microorganismos, incluyendo las bacterias, con
extraordinaria exactitud. Sin embargo, no fue sino hasta la mitad del siglo XVIII que
Spatlanzani concluyo que dichos organismos eran llevados por el aire hacia las infusiones y
que no se originaban espontneamente. Pasteur demostr ms tarde la presencia de
microorganismo en el aire y que al excluirlo, las infusiones podan mantenerse estriles por
periodos considerables. Antes de esto, Schwann y otros investigadores haban propuesto
que los organismos estn constituidos por clulas y que la fermentacin alcohlica era
causada por la presencia de clulas de levadura. Unos 20 aos despus, al estudiar un
nmero considerable de fermentaciones, Pasteur propuso que todos los procesos
fermentativos eran el resultado de la actividad microbiana y que podan proceder sin
oxigeno.
Mientras tanto, en Inglaterra, Tyndall haba confirmado que los organismos provenientes
del aire eran las causantes de las infecciones microbianas y que estas no se formaban por
generacin espontanea. Alrededor de 1876, Roberto Koch fundo la microbiologa medico,
quien mostro la causa bacteriana o etiologa del ntrax. Esto fue confirmado despus por
Pasteur de manera independiente. Estos experimentos no solo demostraron que las bacterias
eran la causa de ciertas enfermedades, sino que cada tipo produca una enfermedad
especfica, es decir, que existe especificidad biolgica. El trabajo de kosh estableci
muchos de los fundamentos de las tcnicas de esterilidad que son la base de la
microbiologa moderna. La inoculacin de bacterias sobre un medio solido, de modo que
cada colonia formada que se hubiese originado de una bacteria individual, permitindose el
uso y estudio de cultivos puros. Al principio el medio se solidificaba mediante la adicin de
gelatina, pero ms tarde esta substituyo por agar, un extracto por polisacridos obtenido de
algas marinas. El medio solido de coloco entonces e una caja de petri, inventada por el
italiano Petri y que ahora es de uso universal.
2.3.- TIPOS DE ORGANIZACIN CELULAR
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Los organismos vivos se pueden dividir en dos reinos, los vegetales y animales
multicelulares y los protistas y los virus (tabla 2.289). La estructura celular de ambos reinos
ha permitido la divisin de los tipos celulares en dos grupos (sin incluir los virus).
Tabla 2.2. Grupos componentes de los reinos de organismos
Plantas Animales
Multicelulares que muestran
amplias diferencias.
Semillas de plantas
Helechos
Musgos y hepticas
Protistas
Vertebrados
invertebrados
Unicelulares, cenocticos o
multicelulares sin diferencian.
Algas
Protozoarios
Hongos (levaduras)
Bacterias y virus
Tabla 2.3. Diferencias entre clulas procariotas y eucariotas.
PROCARIOTAS EUCARIOTAS
ESTRUCTURAS GENETICAS
Numero de cromosomas
Membrana nuclear
DNA nuclear unido a histonas
DNA en organeros
ESTRUCTURAS
CITOPLASMATICAS
1
-
-
-
>1
+
+
+
-
Naturaleza de los ribosomas
citoplasmticos.
Naturaleza de los ribosomas de los
organelos.
Mitocondrias
CANTIDADES RELATIVAS DE DNA.
70s
Ninguna
-
-
-5x10-15
g (1)
80s
70s
+
+
3x1012
o 0.5 x 10 12
Estos grupos son los eucariotas y procariotas; la diferencia entre ellos depende
principalmente si los cromosomas (DNA) estn contenidos en un ncleo bien definido. En
la tabla 2.3 se listan las principales diferencias entre los procariotas y los eucariotas en
trminos de su estructura celular y de contenido de DNA. Los procariotas contienen un solo
cromosoma, en tanto que los eucariotas contienen muchos cromosomas, en tanto que los
eucariotas contienen muchos cromosomas en una estructura unida a una membrana. El
ncleo, en los eucariotas, el DNA contenido en los cromosomas esta unido a historias,
protenas bsicas ausentes en los procariotas. El DNA del ncleo en los eucariotas no es el
nico DNA presente en la clula, puesto que otras estructuras unidas a membranas, los
mitocondrias y los cloroplastos, tambin contienen DNA, en estructuras rodeadas de
membrana, conocidas como organelos, no se encuentran en procariotas. Los organelos
tambin contienen a las estructuras capaces de sintetizar protenas. Las cuales incluyen a
los ribosomas de los procariotas (70 s), en tanto que los ribosomas toplasmicos miden 80 s
(son unidades Svedberg). Los virus se incluyen con frecuencia en el grupo de los protistas.
Los virus fueron detectados en 1892 por Iwanowski, quien demostr que el virus del
mosaico de tabaco pasaba atreves de un filtro a prueba de bacterias y no poda ser cultivado
por la gentica, pero dependen de las clulas husped preexistentes para su reproduccin.
En incapacidad para existir sin usar otras clulas, ha originado muchos argumentos cuanto
as los virus son o no organismos vivos. Los virus afectan vegetales, animales y bacterias.
2.4.- PROCARIOTAS
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Los procariotas representas las clulas ms pequeas del reino protista, el cual consiste en
bacterias y algas verde- azules. El resto, algas, levaduras, hongos y protozoarios, son:
PROCARIOTAS
Tabla 2.4. Caractersticas fsicas y qumicas de las clulas bacterianas.
caractersticas bacterias levaduras mohos
Forma de las
clulas
Tamao de las
clulas
Presencia de
esporas
COMPOSICION
Protena(N x
6.25)(nitrgeno
total)
Acido nucledo
(RNA y DNA)
Carbohidratos y
li8pidos 1um=10-3
mm
Bastn, esferas y
espirales.
0.5-3 um
Por ejemplo
bacillus(aerobio)
Por ejemplo,
clostridium(anaerbico)
65-75%
15-25%
5-30%
Elipsoides, esferas,
micelios, cadenas.
1-5%
En algunas
45-55%
5-12%
10-50%
Micelios, esferas.
5-15um, de dimetro;
50-5000um de largo.
En algunos.
25-55%
5-10%
10-50%
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Eucariotas. En la tabla 2.4. Se comparan los protistas, las bacterias, los mohos y las
levaduras, en cuanto a su forma, tamao y composicin. Las clulas bacterianas se
presentan como bastones, esferas, cadenas y espirales (figura 2.2), que en general son ms
pequeas que las levaduras y los mohos. Los tres grupos contienen organismos que pueden
formar esporas cuando las condiciones son desfavorables. La composicin de las bacterias
nos muestra que contienen ms protenas y menos lpidos o carbohidratos que las levaduras
o los mohos.
Las diferentes formas de las bacterias se usan en las primeras etapas de la identificacin,
pero debido a la falta de otras caractersticas, se usan las nutricionales para una
identificacin ms detallada. Segn su fuente de energa, las bacterias y las algas verde-
azules se pueden clasificar en cuatro categoras:
1) Organismos fotoautotrofos, los cuales dependen de la luz como fuente de energa y
utilizan dixido de carbono como una fuente de carbono. Este grupo incluye las
algas verde-azules, pero tambin ciertas algas fotosintticas (bacterias sulfurosas
purpuras y verdes), as como plantas superiores y algas verdes eucarsticas.
2) Organismos foto hetertrofos, los cuales dependen de la luz como fuente de energa,
pero usan compuestos orgnicos como fuentes de carbono. Estos son las bacterias
purpuras no sulfurosas.
3) Organismos quimioautotrofos, que dependen de varios compuestos qumicos para
obtener su energa, pero usan dixido de carbono como una fuente de carbono. Esta
capacidad se asocia con la de usar compuestos inorgnicos reducidos como H2S o
HN3 para producir energa y est restringida a las bacterias.
4) Organismos quimiheterotrofos, que dependen y obtienen su energa su energa y
molculas de carbono de fuentes orgnicas. Estos representan el grupo ms grande
de bacterias y eucariotas y es muy diverso.
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ESTRUCTURA Y FUNCION CELULAR
COCO DOS COCOS
Por ejemplo, Micrococcus Diplococcus cocos en cadena
Neisseria
-
Bacilo bacilo en cadena Espiroqueta
Flagelos
Escherichia coli Bacillus megatrium Rhodospinllum
Desulfovibrio
Bacteria anclada Flagelo polar Flagelo multiple
Caulobacter Pseudomona fluorescencia Proteus vulgaris
Si se combinan las caractersticas estructurales, la forma de movimiento y los grupos
nutricionales, los procariotas se pueden dividir en cuatro grupos principales (tabla 2.5). De
estos, las eubacterias son el ms grande y de mayor inters en la biotecnologa. En la figura
2.3. Se muestra un diagrama representativo de las clulas procarioticas.
2.4.1.- PARED CELULAR
El citoplasma bacteriano est encerrado por una pared celular rgida altamente
Estructurada que determina la forma de la clula. La eliminacin de esta pared provoca,
Tabla 2.5. Los cuatro grupos de procariotas.
Algas verde-azules mixobacterias Bacterias Eubacterias
-
espiroquetas
Movimiento
Pared celular
CELULAR
Organizacin
unicelular
filamentos micelio
FORMA DE LAS
CLULAS
Bastones.
Esferas
Espirales
Clulas en reposo
nutricional
Grupo
Fotoautotrofo
Fotoheterotrofos
Quimioautotrofo
Quimiheterotrofos.
Por desplazamiento
o ninguno gruesa,
rgida
+
+
-
+
+
-
Acinetas
+
-
+
+
Desplazamiento
delgada, flexible
+
-
-
+
-
-
Microquistes
-
-
-
+
Filamento
axial delgado,
flexible.
+
-
-
-
-
+
Ninguno
-
-
-
+
Mediante
flagelos o
rgida.
+
+
+
+
+
+
Endosporas
+
+
+
+
-
Que la clula adquiera una forma esfrica conocida como protoplasto cuando la membrana
celular tiene poca resistencia intrnseca. Si el protoplasma se coloca en un medio
hipertnico, una solucin ms diluida que el citoplasma, se provoca una rpita captacin de
agua y, finalmente, la ruptura de la membrada.
En las algas verde-azules, la pared celular se compone bsicamente de celulosa, en tanto
que en las bacterias la pared est formada por un polmero nico de amino-azcar,
peptidoglucano o murena. La composicin qumica y la estructura del peptidoglicano, se
muestran variaciones considerables entre diferentes organismos, aunque su estructura
bsica es la misma.
detincin que divida a las bacterias en los grupos Gram-negativas. La composicin general
de la pared de las Gram positiva y gran negativa se muestra en la figura 2.5. Las bacterias
Gram Positiva tienen una estructura bsica de peptidoglucano unida a cido teicoico, en
tanto que las bacterias gran negativas tienen una membrana fuera de la capa de
peptidoglunano que consiste en una bicapa de fosfolpidos con lipoplisacaridos y protenas.
La difencia entre las bacterias gram negativa y gram positiva detectadas por la
tIntacinGram, se puede correlacionar con otras caractersticas (tabla 2.7) como la
-
sensibilidad a la penicilina y a la digestin con lisozima. La penicilina es de muchos
antibiticos que se sabe inhiben la sntesis te peptidoglucano al unirse a la enzima
responsable del cruzamiento de las cadenas. Puesto que ninguna otra actividad biocintica
es afectada, el crecimiento de las clulas continua, pero son incapaces de producir paredes
celulares adecuadas y, por lo tanto, producen formas anormales y finalmente se lisan. Las
clulas humanas y animales no contienen peptidoglucano por lo que son afectadas. La
enzima lisozomaticas encontradas en la clara de huevo, las lgrimas y otras secreciones,
rompen el enlace entre las unidades de cido N-acetilmurnico y N-acetilglucosamina
(figura 2.4).
En la parte exterior de la pared celular de algunas bacterias, se encuentran polisacridos de
alto peso molecular formando un gel hidrofilico, conocido como capsula (figura 2.3).El
espesor de la capsula puede variar enormemente desde 10 nm hasta 1.o um, y puede varias
de acuerdo con el aspecto fisiolgico de la clula. La capsula no tienen una funcin bien
definida, sin embargo muchos patgenos estn encapsulados y os componentes de la
capsula pueden ser antignicos.
N-acetilmurnico
N-acetilglucosamina lisozima
-
Figura 2.4
Table 2.6 Tintcion de Gram
Procedimeinto Tiempo Gram +
Gram
*color cristal violeta y lavar 30s purpura purpura
con agua
*colocsr yoduro de gran y lavar 30s purpura
purpura
con agua, secar con papel secante
*aplicarle etanol al 95% y lavar con 20s purpura sin color
agua, secar con papel secante
*contrateir con un color contraste, 15s purpura amarillo
por ejemplo amarillo
-
Tabla 2.7 Correlacionn de la tintacion de Gram con otras propiedades
Gram positiva Gram negativa
Sensibilidad a la penicilina +
Digetsion por lisozima + -
Espesor de la pared 20-80nm 10nm
Contenido de lpidos de la pared 0-3% 11-22%
Acidoteicoico + -
Gram variedad de aminocidos en la pared - +
Ejemplo Bacillus
Escherichiacoli
-
(1nm = 10-6
mm)
2.4.2 Membrana citoplsmatica
Debajo de la pared celular bacteriana esta una membrana de unos 40-80 A de espesor.
La membrana acta como una barrera semipermeable que controla la captacin y la
liberacin de materiales, ayudando a determinar la composicin del citoplasma.
Alrededor del ao 1990 se descubri el primer indicio de que los lpidos, molculas
orgnicas pequeas insolubles en agua que incluyen a las grasas y aceites puedan ser un
constituyente de las membranas biolgicas. En las dcadas de los aos cincuenta, J.D
Robertson propuso que la membranaconsista en una capa externa de polisacridos, una
capa interna de protenas, entre estas, una bicapa de lpidos conocida como unidad de
membrana. La bicapa lpido consista en fosfolpidos, molculas de glicerol con extremo
hidrfilo ( el fosfato) y un extremo hidrofilico (tallo de cidos grasos), arreglados como una
capa doble (figura 2.6).
Hidrofilico (fosfatos)
BICAPA
LIPIDICA
Hidrofo
bic
-
FIGURA 2.6
Sin embargo, los adelantos de la microscopia electrnica (crio-fractura) revelaron un
cuadro ms complejo con protenas asociadas a la membrana. Adems, aparentemente las
protenas no estn fijas en la capa de lpidos, sino que estn libres para moverse en la forma
lateral. Estos descubrimientos surgieron el modelo actual para al membranas, el mosaicos
fluido (figura2.7), el cual se aplica a membranas de todos los tipos.
Figura 2.7.Modelo del mosaico fluido para la membrana celular
-
En las bacterias, las membranas citoplasmticas es la nica estructura membranosa real,
aunque existen una membrana similar en los eucariotas alrededor de estructuras como el
ncleo, las mitocondrias y los cloroplastos.
2.4.3 Flagelos
Las bacterias pueden moverse en respuesta a varios estmulos o a compuestos qumicos al
alejarse de los estmulos o al acercarse a ellos. Se ha demostrado que muchos nutrientes
simples, como los azucares y los aminocidos provocan respuesta en las bacterias. El medio
de locomocin principal de las bacterias es el flagelo. ste es un cuerpo basal embebido en
las membranas citoplasmtica, una regin en forma de gancho que se conecta a la base con
un eje flexible y delgado (figura 2.8).El flagelo se compone de hebras de una protena
llamada flagelina. El ordenamiento de los flagelos en las bacterias determina s tipo de
movimiento, a menudo se puede usase en su clasificacin.
Figura 2.8
Cuando son vistos en el microscopio electrnico, pueden observarse otros apndices sobre
la bacteria, que consiste en delgados flagelos filamentosos conocidos como fimbrias o pilis,
los cuales participan en la transferencia de material gentico.
2.4.4 Esporas
-
El citoplasma de las bacterias contiene muy poca estructura separadas de uno o dos
agregados de material nuclear. Sin embrago, se puede hallar una estructura que solo est en
las bacterias Gram-negativa, la endoesporas. Cuando la condiciones son difciles, o bien, en
alguna etapa de l ciclo de desarrollo, las bacteria forman una espora refractiva a partir de
una invaginacin de la membrana citoplasmticas. La gruesa pared de las esporas les
confiere resistencia al calor i a la desecacin (figura 2.9).
Figura 2.9 Endoespora bacteriana
2.5 EUCARIOTAS
.La clulaeucarsticaest representada por plantas, animales, levaduras, algas y hongos. A
pesar de la gran diversidad entre estas clulas, hay muchas caractersticas comunes a
ellas(figura 2.10), lo cual incluye un alto grado de complejidad interna. Las principales
carteristasson :
2.5.1 Pared celular
En los hongos, las levaduras y las algas. La celular est encerrada en una pared celular
rgida que consiste principalmente en polisacridos, los cuales le confieren una forma fija y
la protegen del dalo mecnico y osmtico. La pared estabiliza la estructura celular y , en
cuanto a los procariotas, pueden usarse como una caracterstica taxonoma. Las levaduras
-
pueden tener forma casi esfrica u oblonga y se divide pro gemacin o fisin ( figura 2.11) ,
en tanto que el crecimiento micelial se realiza por elongacin, el cual puede incluir
ramificacin.
2.5.2 Estructuras de la membrana
Las eucariotas estn limitadas por una membrana de estructura similar a las de los
procariotas. En cuanto a los eucariotas varan mucho en tamao de las estructuras que
rodena la membrana dentro de la clula (tabla 2.8).
2.5.3 Ncleo
Las caractersticas mas sobresalientes de las clulas eucariotas es el ncleo, el cual contiene
el DNA de la celular y esta limitado por la membrana. Dentro del ncleo se pueden ver
reas ms densas, ricas en RNA, conocidas como nuclolos.
Figura 2.10 Estructura general de lsd clulas eucariotas.
2.5.4 Mitocondrias
-
La clula eucariota contiene estas estructuras, las cuales, a menudo son grandes, cilndricas,
encerradas por una membrana doble y contiene invaginaciones numerosas conocidas como
crestas. La mitocondrias es le sitios principal de generacin de energa y contiene su propio
sistema sintetizado de protenas y su propio DNA (figura 2.12)
2.5.5 Cloroplasto
El cloroplasto tambin es una estructura rodeada por una membrana y , al igual que las
mitocondrias. Contiene un sistema separado para la sntesis de pretinas y su propio
DNA. Como su nombre lo indica, los cloroplastos contiene el pigmento clorofila y en ellos
se lleva a cabo la fotosntesis.
-
2.5.6 Otras estructuras membranosas
En la tabla 2.8. se describe un amplia variedad de otras estructuras membranosas, descritas
en la misma, seencuentra en asl eucariotas: su origen se describeen la figura 2.13.
El retculo endoplasma tico es una compleja de membranas que participan ne le
almacenamiento y transporte intracelular de varios productos. El retculo endoplasma tico
tambin puede tener muchos ribosomas unidos a su superficie y ser participe en la sntesis y
secrecin de protenas.
La mayora de eucariotas contiene un complejo de membranas denominadas aparato o
cuerpo de Golgi, algunas veces nombrado dictiosoma. Al igual que el retculo
endoplasmtico
Tabla 2.8 Estructuras membranosas en eucariotas
-
el aparato de Golgi participa en la secrecin de substancias de la clula en partculas
enzimas.
Las vacuolas se encuentran en muchos tipos de clulas, especialmente en plastas. A
menudo se usan para almacenar enzimas o productos que podran se disruptivos o txicos
para la clula (las vacuolas pueden llegar a ocupar de 80 a 90% del volumen celular total).
Muchas de las estructuras citoplsmicas descritas estn en equilibrio dinmico y son
sintetizadas y degradadas segn sea requerido. Las diferentes estructuras parecen derivarse,
ya sea directa o indirectamente, del retculo endoplasmtico de acuerdo con el esquema
mostrado en la figura 2.13.
Estructura Funcin
Ncleo Contiene la informacin gentica de la clula (DNA)
Retculo endoplasmtico Una red complicada de membranas que funciona como sitio de
la sntesis de protenas.
Aparato de Golgi Complejo de vesculas y membranas. Algunas veces llamado
dictiosoma, responsable de la secrecin desde la clula.
Lisosoma Sacos membranosos que contienen enzimas digestivas.
Peroxisoma Vesculas limitadas por membranas que contienen catalasa
Mitocondrias Sitio de generacin de energa, contiene su propio DNA
Cloroplastos Sitio de fotosntesis, se presentan solo en las plantas verdes,
contiene su propio DNA
Plastidios Las estructuras membranosas de plantas pueden contener
aceites o pigmentos
-
Envoltura
nuclear
Retculo
endoplasmtico
Aparato de
Golgi
Membrana
plasmatica
Peroxisomas
Lisosomas
Vesculas
endociticas
Figura 2.13 Origen de algunas estructuras membranosas
Figura 2.12 Mitocondria
-
PROCESOS QUIMICOS DE LA CELULA
3.1 Introduccin
En el capitulo anterior se considero la estructura de los sistemas celulares y los diferentes
tipos de clulas que se encuentran en la naturaleza. Ahora es necesario considerar la
constitucin qumica de los componentes celulares principales, y como se sintetizan las
unidades bsicas de construccin de las estructuras a partir de los nutrientes disponibles en
un medio de crecimiento adecuado. En este captulo se examinara la qumica de las clulas
vivas y se sentarn las bases para la comprensin de los captulos posteriores, as como las
rutas para la generacin de la energa por estas reacciones biosintticas.
3.2 Composicin elemental
Todas las clulas vivas, incluyendo los microorganismos, requieren ciertos nutrientes para
su crecimiento y desarrollo. Los nutrientes deben contener los elementos qumicos que
constituyen los materiales y estructuras celulares, as como aquellos elementos que son
requeridos para el transporte a travs de la membrana, la actividad enzimtica y la
generacin de la energa necesaria para los procesos biosintticos.
El agua constituye el 80 y 90% del peso total. El resto de la clula se compone de carbono,
hidrogeno, oxigeno, nitrgeno, azufre y fosfato (en concentraciones mayores de 10-4
M),
adems de unos 18 elementos ms que con frecuencia se presentan en cantidades mnimas.
La tabla 3.1 lista lo diez elementos principales encontrados en las clulas microbianas con
detalles sobre su origen y requerimiento de la clula.
El carbono, hidrogeno, oxigeno, nitrgeno, azufre y fosfato, constituyen la base de los
componentes celulares como protenas, lpidos, estructuras de membrana y cidos
-
nucleicos. Sin embargo, estos elementos forman parte de componente relativamente
estables y solo reaccionan lentamente con algun otro. Las reacciones qumicas entre estos
compuestos necesitan catalizadores biolgicos denominados enzimas. Estas son protenas
que a menudo requieren de ciertos iones o elementos traza como componentes estructurales
para ser catalticamente activo (tabla3.2) las enzimas se mencionan con un sufijo despus
de la reaccin o del sustrato.
La mayor parte de los elementos se presentan como sales en los medios naturales como el
suelo y el agua. Sin embargo, con frecuencia se necesita aadir fuentes solubles de estos
elementos a los medios de cultivo de laboratorio o industriales. Algunos microorganismos,
como por ejemplo Escherichia coli, pueden crecer en mezclas simples de estas sales junto
con una fuente de carbono y energa, mientras que otros, como Lactobacilli, necesitan otros
compuestos que no pueden sintetizar por s mismo. Los constituyentes inorgnicos de
varios microorganismos se muestran en la tabla 3.3.
Los microorganismos muestran cierta diversidad en cuanto a los componentes que pueden
usar como fuentes de C, H, O, N y S. As el azufre generalmente es tomado por las clulas
como sulfato y residuos de sulfuro para propsitos biosintticos. Sin embargo, algunas
bacterias como Thiobacilli pueden crecer en compuestos con azufre reducidos como
sulfuro, azufre elemental o tiosulfato que las usan como donadores de electrones, en tanto
que los metangenos crecen solamente en presencia de sulfuro de hidrogeno.
El nitrgeno se presenta en la naturaleza en muchas formas como el amoniaco (NH3),
nitrato (NO3-), nitrito (NO2
-), compuestos orgnicos que contienen nitrgeno y nitrgeno
molecular. La mayora de los microorganismos pueden utilizar NH4+, el cual con frecuencia
es el substrato preferido. Algunos organismos pueden usar NO3- el cual primero debe ser
reducido a NH4+
antes de incorporarlo al material celular. El NO2-, un producto de la
respiracin anaerobia, que utiliza NO3- como aceptor de electrones (Nitrosomonas sp.),
pueden ser reducidos a NH4+
o a N2 por algunas bacterias desnitrificantes, o bien oxidado a
NO3- por Nitrobacter
molecular como fuente de nitrgeno (Rhizobium sp.), mientras que muchos
microorganismos pueden utilizar complejos, fuentes orgnicas de nitrgenos, entre las que
estn los aminocidos, cidos nucleicos y aminas metiladas.
-
Los microorganismos pueden usar C, H y O, ya sea en forma de compuestos orgnicos o
inorgnicos, incluyendo CO2, H2, H2S, NH4+, NO3
-, NO2
-, SO4
2-, etc. Con la posible
excepcin de liginica y ciertos polmeros orgnicos hechos por el hombre, casi todos los
componentes con carbono son substratos potenciales para el crecimiento de
microorganismos.
Elemento Fuente Funcin metablica
C Compuestos orgnicos, Co2
Componentes principales del material
celular
O O2, H2O, compuestos orgnicos, CO2
H H2, H2O, compuestos orgnicos
N NH4+, NO3, N2, compuestos orgnicos
S SO42-
, HS, S, S203, compuestos
orgnicos
Componentes de la cistena,
metionica, pirofosfato de tiamina,
-lipoico.
P HPO42-
Componentes de los cidos nucleicos,
ATP y otros nucletidos, y
fosfolipidos
K K+ Principal catin orgnico dentro de la
clula, cofactor de algunas enzimas.
Mg Mg2+
Cofactor de muchas enzimas
(particularmente cinasas), presente en
paredes y membranas celulares
Ca Ca2+
Cofactor de enzimas; presente en
exoenzimas importantes, por ejemplo,
amilasas, proteasas; componente
importante de las endosporas
Fe Fe2+
, Fe3+
Componente de los citocromos;
protenas fierro-azufres, por ejemplo,
ferredoxinas; cofactor de muchas
enzimas (por ejemplo, hidratasas)
-
Elemento Fuente Funcin metablica
Zn Zn2+
Componentes de la alcohol deshidrogenasa, fosfatasa alcalina,
aldolasa, RNA y NA polimerasa.
Mn Mn2+
Componente de la superxido dismutasa bacteriana, PEP,
carboxicinasa, citrato sintasa.
Na Na+
Requerido por bacterias haloflicas Cl Cl
-
Mo MoO42-
Componentes de la nitrato reductasa, nitrogenasa, formato
deshidrogenasa.
Se SeO32-
Componente de la glicina reductasa, formato deshidrogenasa.
Co Co2+
Componente de la vitamina B12 y enzimas con vitamina B12
(glutamato mutasa, metilmalonil CoA mutasa)
Cu Cu2+
Componente del citocromo oxidasa y oxigenasas
Cr CrO42+
Componente de algunas formato deshidrogenasas
Ni Ni2+
Componente de la ureasa y del crecimiento auttrofo de bacterias que
oxidan hidrogeno.
Elemento Bacterias Hongo (g/100Gg
de esp seco)
Levadura
P 2.0-3.0 0.4-4.5 0.8-2.6
S 0.2-1.0 0.1-0.5 0.01-0.24
Tabla 3.1 Elementos principales requeridos por las clulas microbianas
Tabla 3.2 Elementos trazas requeridos por las clulas microbianas
-
K 1.0-4.5 0.2-2.5 1.0-4.0
Mg 0.1-0.5 0.1-0.3 0.1-0.5
Na 0.5-1.0 0.02-0.5 0.01-0.1
Ca 0.01-1.1 0.1-1.4 0.1-0.3
Fe 0.02-0.2 0.1-0.2 0.01-0.5
Cu 0.01-0.02 - 0.002-0.01
Mn 0.001-0.01 - 0.0005-0.007
Mo 0.001-0.01 - 0.0001-0.0002
Total de cenizas 7-12 2-8 5-10
3.3 Los nutrientes como fuentes de energa:
Los nutrientes requeridos por microorganismos no son para reacciones biosintticas que
dan lugar al crecimiento celular, sino tambin funcionan como fuentes de energa para
microorganismos se pueden clasificar por la naturaleza de las fuentes de carbono y energa
que pueden utilizar.
Los organismos que utilizan luz como fuente de energa se denominan fottrofos, mientras
que aquellos que obtienen su energa de reacciones qumicas se denominan quimitrofos.
3.3.1 Fottrofos:
Tabla 3.3 Constituyentes inorgnicos de varios microorganismos
-
Es comn que los fottrofos utilicen CO2 como fuente celular de carbono, en cuyo caso se
materia celular usando donadores de electrones que con frecuencia son inorgnicos, tales
como el hidrogeno molecular o compuestos de azufre reducidos. Cuando los organismos
crecen de esta manera se denominan fotolittrofos (tabla 3.4).
Alternativamente, algunos fottrofos (tabla3.4) pueden usar la luz como fuente de energa
para su crecimiento y fuentes de carbono orgnicas como succinato o acetato. En este caso,
el substrato orgnico aporta los electrones para las reacciones de reduccin y el organismo
crece como fotoorgantrofo. El substrato orgnico aporta tambin carbono celular en lugar
de CO2. En consecuencia, los organismos crecen como hetertrofos.
As, la autotrofa y la heterotrofa reflejan la naturaleza de la fuente de carbono, en tanto
que el littrofo y el organtrofo reflejan la naturaleza del aceptor de electrones.
Tipo Donador de
electrones
Fuente de
carbono
Organismo
Fotolitotrofa H2O, H2S, S, H2 CO2 Plantas, algas verde
azules, Chromatiaceae,
Chlorobiaceae
Fotoorganotrofa Orgnico CO2 Rhodospirillaceae
3.3.2 Quimitrofos:
Muchos microorganismos obtienen energa (ATP) para su crecimiento mediante reacciones
de xido reduccin de la forma:
Tabla 3.4 Crecimiento fototrfico
-
Xred + Aox Xox + Ared
Donde un substrato se reduce a expensas del otro. La mayora de las levaduras, hongos y
organismos superiores utilizan donadores de electrones orgnicos (Xred) y O2 como aceptor
de electrones. Las bacterias, sin embargo, pueden usar NO3-, SO4
2- o CO3
2- como aceptor de
electrones en lo que se denomina respiracin anaerobia, compuestos orgnicos
(fermentacin anaerobia) u O2 (respiracin). El donador de electrones, Xred, puede ser
orgnico o inorgnico (por ejemplo H2, H2S, Fe2+
, NO2- o NH4
+).
Los organismos que utilizan un donador de electrones orgnico se conocen como
quimioorgantrofos, en tanto que los que utilizan donadores inorgnicos se llaman
quimiolittrofos (tabla 3.5).
Los quimiolittrofos tambin son quimioautotrofos, ya que generalmente usan CO2 como
fuente de carbono y no metabolizan un compuesto organico. Sin embargo, tambin puede
crecer en forma aerbica como quimioorgantrofos (por ejemplo las bacterias que oxidan
hidrogeno y algunos thiobacilli), mientras que Nitrosomonas y Thiobacillus Thiooxidans
son quimiolittrofos obligados.
Tipo Donador de
electrones
Aceptores de
electrones
Organismo
Quimiolitotrofa H2S, S, H2, Fe2+
CO2,O2, NO3- Bacterias oxidantes del
hidrogeno, tiobacilos,
Th. Desnitrificantes,
Ntrosomas, metanogeno.
Quimioorganotrofa Orgnico O2, NO3-, SO4
2-,
Organico
Pseudomonads, bacillin
levaduras, bacillus
lincheniformis, bacterias
-
reductoras del sulfato,
bacilos del acido lactico
3.4 Otros requerimientos para el crecimiento:
La mayora de las levaduras y las algas pueden sintetizar los componentes orgnicos
necesarios para su crecimiento a partir de la fuente de carbono. Muchas bacterias no pueden
hacer esto y necesitan la presencia de factores de crecimiento especficos en el medio,
adems de una fuente de carbono y energa.
El requerimiento ms comn son las vitaminas, las cuales se necesitan en cantidades
extremadamente pequeas como cofactores para varias enzimas. As, Clostridium kluyveri
requiere un medio complementado con biotina y acido p-aminobenzoico. Ciertas bacterias lcticas
tienen necesidades muy estrictas de prcticamente todos sus aminocidos, purinas, pirimidinas y
vitaminas. En consecuencia, estos organismos realmente pueden crecer en un medio en el que no
se conoce la concentracin de uno de estos nutrientes necesarios para el crecimiento. El grado de
crecimiento esta relacionado directamente con la concentracin del nutriente esencial. Esto
constituye la base del ensayo microbiolgico.
En la tabla 3.6 se listan algunas vitaminas y compuestos relacionados que a menudo se necesitan
para el crecimiento.
Tabla 3.6 Vitaminas y compuestos relacionados requeridos para el crecimiento
Compuesto Funcin metablica
Acido p-aminobenzoico Precursor del Tetrahidrofolato, utilizado en la transferencia de unidades de un
carbono.
Biotina Coenzima que participa en las reacciones de carboxilacion.
Acido flico Tetrahidrofolato necesario en la transferencia de unidades de carbono.
Tabla 3.5 Crecimiento quimiotrfico
-
Acido nicotnico Precursor de NAD y NADP.
Acido pantotnico Precursor de coenzima A(portador de grupos acilo)
Piridoxina (vit. B ) Fosfato de piridoxal usado en reacciones de transaminacin y decarboxilacin.
Riboflavina (vit. B ) Componente de los grupos prostticos FMN y FAD de las flavoprotenas.
Tiamina (vit. B ) Componente del pirofosfato de tiamina en descarboxilasas, transaminasas y
transcetolasas.
Cianocobalamina (vit. B ) Coenzima que interviene en reacciones de rearreglo(glutamato mutasa).
Vitamina K Precursor de la menaquinona un portador de electrones (por ejemplo,
fumarato reductasa).
Coenzima M Interviene en la metanognesis.
3.5 COMPONENTES ESTRUCTURALES BSICOS DE LA CLULA
Las clulas microbianas, como todos los sistemas vivos con excepcin de los virus, se componen
de carbohidratos, grasas, lpidos y cidos nucleicos. Estos materiales se forman a partir de las
unidades bsicas de construccin o productos metablicos primarios, a saber, monohidratos,
cidos grasos, aminocidos y nucletidos (o nuclesidos) y, por otras reacciones metablicas, se
convierten en los componentes estructurales principales de clulas, como paredes celulares,
membranas, enzimas, protenas estructurales y DNA o RNA.
3.51 Carbohidratos
Son compuestos orgnicos con frmula general (CH O)n, donde n>3. Existen dos formas
principales de carbohidratos, los monosacridos y los polisacridos. Los monosacridos o azcares
simples, son los carbohidratos ms pequeos que contienen entre 3 y 9 tomos de carbono y son
las unidades de construccin de los polisacridos. La D-glucosa (hace girar la luz polarizada en el
plano de la direccin +) es el monosacrido mas comn. Se compone de 6 tomos de carbono y, al
igual que otros azcares, es un derivado polihidroxialcohol (figura 3.1)
-
CHO
COH
CH2OH
Aldolasas
CH2OH
C=O
CH2OH
Cetosas
Dihidroxiacetona
CH2OH
C=O
COH
HOC
CH2OH
D-ribosa D-ribulosa
CHO
COH
HOC
COH
COH
CH2OH
HOC
CHO
HOC
COH
COH
CH2OH
COH
CHO
HOC
HOC
COH
CH2OH
C=O
CH2OH
HOC
COH
COH
CH2OH
D-glucosa D-manosa D-galactosa D-fructuosa
H
H
CHO
COH
COH
COH
CH2OH
H
H H
H
H
H
H
H
H
H
H
TRIOSA
PENTOSA
HEXOSA
H
H
H
H
H
H
H
H
Para muchos microorganismos la D-glucosa es el compuesto base que se metaboliza para formar
los dems componentes celulares. La mayora de los microrganismos (particularmente las
levaduras), pueden crecer en glucosa, la cual se transporta a travs de la membrana hacia la clula
de difusin pasiva, transporte activo o translocacin de grupo. Cuando hay polisacridos en el
medio, es comn que sean hidrolizados a unidades de glucosa por enzimas extracelulares
(invertasas, celulasas, amilasas, aminoglucosidasas) antes de ser transportados hacia la clula.
Los monosacridos se clasifican como aldosas o cetosas (figura 3.1). As, la glucosa es una
aldohexosa (aldo=azcar aldehdo; hexosa=6 tomos de carbono). Hay dos formas de glucosa (y
otros azucares) llamadas formas D- y L- (figura 3.2 (a)),
-
CHO
C
C
C
C
CH2OH
OH
HO
OH
OH
H
H
H
H
C
CH2OH
C
C
C
CH2OH
H
H
H
HHO
CH3
HO
HO
D-glucosa L-glucosa
a) formas de cadena recta
-D- -D-glucosa
b) formas en anillo (piranosas)
Figura 3.2 Formas estructurales d e la glucosa
que son imgenes especulares entre si. Los azucares de origen natural por lo general son de la
forma D-. La D-glucosa se presenta principalmente como una estructura de anillo, denominada la
- - representan la posicin del grupo OH del tomo
de carbono 1.
La unin de otros grupos qumicos a la estructura bsica, da lugar a una variedad de derivados de
azcar que incluye alcoholes (glicerol, sorbitol, etc.), cidos (acido glucnico, acido glucornico),
fosfatos (glucosa-1-fosfato, glucosa-6-fosfato), desoxiazcares (desoxirribosa, figura 3.3) y
aminoazcares (glucosamina, galactosamina, acido N-acetilmurmico). Estos son componentes
importantes comunes de la estructura de la clula microbiana.
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O H
OHOH
HOCH
H OHHH
O
OH
HOCH
H
H
H
H
H
OH
D-ribosa D-desoxirribosa
Bajo la influencia de enzimas, los monosacridos se pueden condensar entre si para formar
polisacridos. El grupo OH sujeto al tomo de carbono en la posicin 1 de la molcula de
glucosa, es relativamente reactivo y se puede condensar con el grupo OH en la posicin 4 6 de
- -) 1,4 glucosdico (figura 3.4)
-D- -D- -maltosa
Figura 3.4 -1, 4) glucosdicos
-1, 4-
glucosdicos se obtiene un polmero de cadena recta con un peso molecular de hasta 500.000,
denominado amilosa (un componente del almidn: figura 3.5). La amilopectina (el componente
-D- -1, 6-
glucosdicos. La molcula completa de almidn (un polisacrido comn de almacenamiento) es
una combinacin de amilosa y amilopectina (figura 3.5).
El glicgeno, un polmero comn de almacenamiento en bacterias y levadura, tiene una
composicin similar al almidn, excepto que esta mucho mas ramificado que la amilopectina, con
-1, 6 que aparecen cada 8-10 residuos de glucosa.
El dextrano es otro polisacrido importante de almacenamiento microbiano, similar al almidn y
al glucgeno, que esta formado de unidades de D- -1,
6-glucosidicos. Sin embargo, los puntos de ramificacin son caractersticos de las especies y
-
- - -1, 4. Los dextranos forman soluciones viscosas que tienen
aplicaciones amplias en la industria como lubricantes, en la separacin de molculas orgnicas por
filtracin y cromatografa de intercambio inico, etc.
Un polisacrido estructural importante es la celulosa, la cual contiene ms del 50% del carbono
orgnico total de la biosfera. La madera contiene aproximadamente 50% de celulosa, en tanto que
el algodn es casi celulosa pura. Se compone de unidades de D- -1, 4
(figura 3.6) y es el componente principal de las clulas
-
Figura 3.6 Estructura de la celulosa.
vegetales y las algas. El potencial de la hidrolisis fsica o enzimtica de la celulosa (papel de
desecho, peridico, viruta, residuos de cosecha) seguidas de una fermentacin posterior para la
produccin de biomasa o alcohol, representa uno de los mayores desafos a la industria
biotecnolgica.
Las paredes celulares bacterianas estn formadas de un pptido polisacrido complejo llamado
peptidoglicano o murena (figura 2.7). Esteconsiste en cadenas paralelas de polisacrido
compuestas de un disacrido de N-acetil-D-glucosamina y acido N-acetilmurmico unidos por
-1, 4-glucosidicos. En el grupo hidroxilo del acido lctico unido al cido murmico, se
encuentra una cadena lateral de tetrapptido compuesta de L-alanina, D-alanina, acido D-
glutmico y acido diaminopimlico o L-lisina (figura 3.7. La D-alanina terminal de la cadena
pptida lateral de un polisacrido
-
Figura 3.7 Componente peptidoglicano de las paredes celulares bacterianas.
puede unirse con la cadena peptdica de otra cadena de polisacrido, ya sea directamente o a travs
de otra cadena polipetdica corta (en Staphylococcus aureus, esta cadena de polipptido se
compone de 5 unidades de glicina).
Por lo tanto, el peptidoglicano consiste en cadenas de polisacridos paralelas con muchas uniones
entre las cadena que le confiere fuerza y rigidez a al pared celular.
-1, 4 del peptidoglicano para producir disacridos de N-
acetil-D-glucosamina y acido N-acetilmurmico a los cuales estn unidos los pptidos (figura 3.7).
Este es uno de los mtodos usados para obtener protoplastos de bacterias gram +.
La penicilina, un antibitico importante, inhibe la formacin de los entrecruzamientos peptdicos
de las cadenas de polisacridos, formando as paredes celulares dbiles.
3.52 Grasas y lpidos
Los lpidos son compuestos orgnicos insoluble en agua localizados en todas las clulas vivientes,
pero son solubles en solventes no polares como el benceno y el ter.
-
Tienen cuatro funciones principales: 1)como componentes estructurales de las membranas: 2)
como materiales de almacenamiento intracelular cuya oxidacin produce energa para el
crecimiento; 3) como fuente de combustible (energa) transportable; 4) como componente
protector de paredes celulares de las bacterias, las hojas de las plantas y la piel de los vertebrados.
Las grasas y lpidos se componen de cidos grasos de los cuales se han aislado ms de 70 tipos
diferentes. Los cidos grasos se componen de una cadena larga de hidrocarburo con un grupo de
carboxilo terminal con la forma general mostrada en la figura3.8, donde n esta, por lo general,
entre 12 y 20. La cadena de hidrocarburo puede
CH3 (CH2)n
O
C
OH
Figura 3.8 Frmula general de los cidos grasos.
ser saturada (sin enlaces dobles) o insaturada (uno o mas enlaces dobles). Los cidos grasos
difieren principalmente en la longitud de la cadena y en el nmero y en la posicin de los dobles
enlaces. Algunos de los cidos grasos ms importantes y comunes se muestran en la tabla 3.7.
Casi todos los cidos grasos naturales tienen un numero par de tomos de carbono y se llaman
saturados si no tienen dobles en laces. Los cidos grasos insaturados presentan uno o ms dobles
enlaces (tabla 3.7). Si bien las plantas y animales superiores tienen predominantemente cidos
grasos insaturados de 14 a 22 tomos de carbono; los microorganismos, y en particular las
bacterias tienen tipos ms simples de 12 a 18 tomos de carbono y cidos grasos insaturados C o
C . En las bacterias no se han encontrado cidos grasos con ms de un enlace doble.
Los cidos grasos solo se encuentran en pequeas cantidades en forma libre. Se localizan en
materiales estructurales y de almacenamiento como esteres de glicerol (glicridos o acilgliceroles)
o como fosfosteres de glicerol (fosfoglicridos o fosfolpidos).
Los glicridos son la forma de almacenaje principal de grasas en los microorganismos, plantas y
animales.
Tabla 3.7 Algunos de los cidos grasos naturales comunes.
-
Estructura de tomos de carbono Nombre comn Temperatura de ebullicin (C)
Saturado
12 CH (CH ) COOH Acido lurico 44.2
14 CH (CH ) COOH Acido mirstico 53.9
16 CH (CH ) COOH Acido palmtico 63.1
18 CH (CH ) COOH Acido esterico 69.6
20 CH (CH ) COOH Acido araqudico 76.5
24 CH (CH ) COOH Acido lignocrico 86.0
Insaturados
16 CH (CH ) CH=
CH (CH ) COOH
Palmitoleico -0.5
18 CH (CH ) CH=
CH (CH ) COOH
Oleioco 13.4
18 CH (CH ) CH=
CHCH CH=CH(CH ) COOH
Linoleico -0.5
18 CH CH CH=CHCH
CH=CHCH CH=CH
(CH ) COOH
Linolnico -11.0
20 CH (CH ) CH=CH
CH CH=CHCH CH=
CHCH CH=CH(CH )
COOH
Araquidnico -49.5
Hay tres clases de glicridos, dependiendo del nmero de cidos grasos (o grupos acilo)
esterificados en la molcula de glicerol (figura 3.9):
1-monoacilglicerol (monoglicrido);
1, 2-diacilglicerol (diacilglicrido);
1, 2, 3-triacilglicerol (triglicrido).
-
Los ms comunes en la naturaleza son los triacilgliceroles. La clase de triacilglicerol depende del
tipo y posicin de los cidos grasos esterificados en relacin con el glicerol, por ejemplo,
triesteroilglicerol.
Los fosfoglicridos se encuentran casi exclusivamente en las membranas celulares, siendo escaso
en grasas de almacenamiento. Son similares en estructura a los glicridos excepto que uno de los
grupos alcoholes primarios del glicerol esta fosforilado mas que esterificado con un acido graso.
As, el componente bsico de los fosfolpidos es el glicerol-1-fosfato o el glicerol-3-fosfato, al
cual estn unidos dos cidos grasos.
Los fosfoglicridos (figura 3.10) poseen una cabeza polar (hidroflica) y otras dos cabezas
hidrocarbonadas no polares (hidrofbicas) y, por tanto, se denominan lpidos antipticos. As, en
solucin acuosa, es fcil que formen micelas con las regiones polares de un grupo de
fosfoglicridos en contacto con el agua, en tanto que las cadenas
-
Procesos qumicos de la clula
Laterales no polares se agrupan entre s (figura 3.11.). En interfases aire-agua, los
fosfogliceridos formaran monocapas, mientras que en solucin, particularmente en
aperturas que separan dos compartimentos acuosos, forman con facilidad bicapas de
aproximadamente 70 de espesor (figura 3.11). Estas bicapas son muy similares a las de
las membranas celulares, las cuales permiten el paso libre de agua pero son impermeables a
varios iones. En la tabla 3.8 se listan algunos de los fosfogliceridos ms comunes de los
microorganismos.
3.5.3 Esteroides
Los lpidos complejos, los cuales no son saponificables, incluyen a la clase
bioqumicamente importante de los esteroides. Los esteroides se obtienen de una estructura
bsica (figura 3.12). Los animales sintetizan un gran nmero de esteroides, los cuales tienen
-
diversos papeles fisiolgicos y bioqumicos, incluyendo a su funcin como hormonas.
Algunos ejemplos son: colesterol, cortisona y testosterona.
3.5.4 Protenas
Las protenas son las molculas orgnicas mas abundantes de las clulas vivas,
comprendiendo entre el 30% y el 70% del peso seco total de las clulas. Son componentes
celulares muy importantes puesto que son copiados de la informacin gentica de la clula
y, posteriormente, dirigen la maquinaria metablica de ella.
Componentes estructurales bsicos de la clula
-
Las protenas se componen invariablemente de carbono, oxigeno y nitrgeno; casi todos
contienen azufre. Adems, algunas protenas contienen otros elementos como fierro,
fosforo, zinc y cobre.
El peso molecular de las protenas vara desde 5000 hasta ms de 40 millones. Sin
embargo, ciertas cadenas peptdicas, como las que se asocian con el peptidoglucano,
-
constan de pocos aminocidos con pesos moleculares tan bajos como 240. Las protenas y
-aminocidos, los cuales representan las unidades de
construccin de las protenas. Exi -aminocidos comunes (tabla 3.9) unidos entre si
mediante enlaces peptdicos (figura 3.13) para formar polmeros grandes, no ramificados o
cadenas polipetdicas. Los enlaces peptdicos se forman por una reaccin de condensacin
entre el grupo carboxilo de un aminocido y el grupo amino de un segundo aminocido
(figura 3.13). El numero y secuencia de los residuos aminocidos en una cadena
polipeptdica (protena) determinan la funcin y la actividad cataltica (si existe). El peso
molecular promedio de un aminocido es 138. Sin embargo, puesto que se pierde una
molcula de agua en la formacin de un enlace peptdico, el peso molecular promedio de un
residuo de aminocido en una protena es de 120.
Las protenas se dividen en dos categoras principales: protenas simples y conjugadas.
Las protenas simples se componen solamente de aminocidos con aproximadamente 50%
de carbono, 7% de hidrogeno, 23% de oxigeno, 16% de nitrgeno y ms de 3% de azufre.
Las protenas conjugadas contienen, adems de los aminocidos, otro material orgnico o
inorgnico llamado el grupo prosttico de la protena. Estas protenas conjugadas se
clasifican de acuerdo a la composicin qumica del grupo prosttico.
As, las nucleoprotenas contienen acido nucleico; las lipoprotenas contienen lpido o
fosfolpido; las glicoprotenas contienen carbohidratos; las hemoprotenas contienen una
estructura de porfirina asociada con fierro; las flavoprotenas contienen grupos flavin y las
metaloprotenas contienen iones metlicos.
La estructura y, en consecuencia, la funcin de una molcula de protena, est gobernada no
solo por su composicin de aminocidos, sino tambin por su forma tridimensional
caracterstica o conformacin. Muchos de los aminocidos tienen cadenas laterales ya sea
hidrofbicas (no polares) o hidroflicas (polares), que determina la manera en la cual se
dobla una molcula de protena. Adems, el aminocido cistena contiene un grupo
sulfhidrilo (- SH) que puede reaccionar con otra cistena para formar un enlace sulfhidril
covalente (figura 3.14). estos enlaces, junto con fuerzas de van der waals, puentes de
-
hidrogeno e interacciones polares, son los causantes de la conformacin tridimensional de
una protena.
Existen dos conformaciones principales de las protenas (figura 3.15):
1) Fibrosas
2) Globulares
Las protenas fibrosas son ms fuertes fsicamente y son insolubles en agua o soluciones
acuosas diluidas. Se componen de cadenas polipetdicas arregladas en paralelo a lo largo de
un solo eje para formar fibras grandes o laminas (figura 3.15).
Representan los componentes estructurales bsicos del pelo (queratina), cuero, uas,
colgeno y tendones de los animales superiores, as como de los flagelos, cilios y pilis de
los microorganismos.
Las protenas globulares consisten en cadenas polipetdicas estrechamente empaquetadas
dobladas en formas esfricas o globulares (figura 3.15). Por lo general, son solubles en
solucin acuosa y se difunden con rapidez. En consecuencia, son bastante mviles en el
citoplasma celular y, a menudo, tienen una funcin cataltica (enzimas). Por lo tanto, la
mayora de las enzimas y protenas de transporte son protenas globulares.
Se observa que hay tres niveles diferentes de estructura protenica, las cuales se pueden
resumir como sigue:
-
Componentes estructurales bsicos de la clula
1) estructura primaria. Secuencia de los residuos de aminocidos unidos por medio de
enlaces peptdicos.
2) Estructura secundaria. Se refiere a la forma de la extensin o del enrollamiento
helicoidal de la cadena polipeptdica, en particular en las protenas fibrosas, la cual
es resultado principalmente del establecimiento de puentes de hidrogeno entre los
aminocidos.
3) Estructura terciaria. Se refiere al doblamiento y curvatura de la cadena para formar
protenas globulares inducidas por enlaces disulfuro covalentes, puentes de
hidrogeno o enlaces salinos e interacciones hidrofbicas e hidroflicas.
-
4) Estructura cuaternaria. Es la manera en la que las cadenas polipetdicas individuales
se renen para formar una protena multimrica. Los enlaces responsables del
establecimiento de la estructura cuaternaria son similares a los mencionados en 3).
Las protenas que tienen ms de una cadena polipeptdica se denominan protenas
multimricas u oligomtricas, y cada polipptido se conoce como subunidad o protmero.
-
Procesos qumicos de la clula
En general, la mayora de las protenas grandes tienen dos o ms subunidades que pueden
o no poseer ningn enlace covalente entre ellas. Ejemplo de protenas oligomricas son
las enzimas, hexocinasa de las levaduras (4 subunidades), triptfano sintetasa (4
subunidades), lactato deshidrogenasa (4subunidades) y la sintetasa de cidos grasos (21
subunidades), aunque la ribonucleasa y la lisozima poseen una sola subunidad. De
ordinario, las subunidades estn asociadas estrechamente, aunque puede no haber enlaces
-
covalentes. En consecuencia, la protena acta como una sola molcula y, de hecho, casi
siempre se requieren todas las subunidades para el funcionamiento ptimo de la protena.
En la tabla 3.10 se listan algunas de las protenas que se encuentran ms comnmente en
la naturaleza y su funcin.
Una de las clases principales de protenas son las enzimas, las cuales funcionan como
catalizadores biolgicos. Esta clase de protenas se considerara con ms detalle en el
captulo sobre
3.5.5 cidos nucleicos
Los cidos nucleicos se componen de nucletidos y participan en el almacenamiento,
replicacin, transcripcin y transferencia de la informacin gentica. Los nucletidos
tambin tienen funciones importantes en el metabolismo, particularmente en reacciones
de transformacin de energa. Los nucletidos sirven como enzimas portadoras de
energa, como coenzimas en la transferencia de acido actico, azucares, aminas y otras
molculas y como enzimas en reacciones de oxido reduccin.
Los mononucletidos se componen de una base nitrogenada, un azcar de 5 carbonos y
acido fosfrico. Hay dos clases de bases nitrogenadas: las pirimidinas y las purinas.
En los nucletidos se encuentran comnmente tres bases pirimdicas: uracilo, timina y
citocina (figura 3.16) y, en una cantidad menor 5-metilcitocina y 5-hidroximetilcitocina.
Hay dos bases pricas principales, a saber: adenina y guanina (figura 3.16) y formas
menores como 2-metiladenina y 1-metilguanina.
Los nuclesidos son similares a los nucletidos excepto que carecen del grupo fosfato
unido en la posicin 5 del anillo de la ribosa (azcar de 5 carbonos). Hay dos tipos de
nuclesidos: los ribonuclesidos que contienen D-ribosa como el componente azcar y
los 2-desoxirribonucleosidos, que contienen 2-desoxi-D-ribosa (figura 3.17). los cuatro
ribonuclesidos principales son la 2-desoxiadenosina, 2-desoxiaguanosina, 2-
desoxicitidina y 2-desoxitimidina. Estos nuclesidos no se encuentran en cantidades
apreciables en forma libre dentro de las clulas.
-
Los nucletidos son steres de nuclesido con acido fosfrico y, otra vez, son de dos
tipos, a saber: los ribonucletidos, que contienen D-ribosa y los desoxirribonucletidos,
los cuales contienen 2-desoxi-D-ribosa. Es comn encontrar a los nucletidos en forma
libre en el interior de las clulas. Los ribonucletidos son los constituyentes principales
cidos ribonucleicos (RNA) y los desoxirribonucletidos
de los cidos desoxirribonucleicos (DNA). El grupo de acido fosfrico, en general, se
encuentra unido en la posicin 5 de la D-ribosa o de la 2-desoxi-D-ribosa, pero puede
asociarse con las posiciones 2o 3e incluso formar grupos de acido fosfrico cclicos, en
forma notable, la adenosina-3, 5-monofosfato (AMP cclico), la cual es un compuesto
importante en la regulacin del metabolismo (figura 3.18).
Los ribonuclesidos y desoxirribonuclesidos pueden existir dentro de la clula como 5-
monofosfatos (nucletidos), 5-difosfatos y 5-trifosfatos (figura 3.19). Estos grupos
fosfato forman complejos con Mg2+
y Ca2+
dentro de la clula y tiene funciones muy
importantes. La ATP (adenosina-5-trifosfato) es el portador primario de energa en la
clula, que transfiere energa desde reacciones catablicas (oxidativas) a reacciones
anablicas (biosintticas) (ver capitulo 6).
Los nuclesidos di- y tri- fosfatos sirven tambin como portadores de molculas
especificas. As, la UDP (uridina difosfato) es un portador especfico de residuos azcar
en la sntesis de polisacridos, esto es, como UDP-glucosa para la biosntesis de
glucgeno.
Los nuclesidos trifosfato funcionan tambin como precursores de unidades de
mononucletidos para la sntesis de DNA y RNA.
Existe gran cantidad de otros mononucletidos importantes que contienen bases que no se
encuentran en los cidos nucleicos. La nicotinamida adenina dinucletido (NAD) y su
forma fosforilada (NADP), as como la flavina mononucletido (FMN) y la flavina
adenina dinucletido (FAD) (figura 3.20 y 3.21), son compuesto cuya funcin
Protena Localizacin o funcin
Enzimas
Ribonucleasa
Hidroliza RNA
-
Citocromo C
Tripsina
Hexocinasa
Amilasa
Protenas de almacenamiento
Ovoalbmina
Lactoalbmina (casena)
Protenas de transporte
Hemoglobina
Mioglobina
Albumina de suero
Protenas contrctiles
Miosina
Actina
Dinena (flagelina)
Protenas protectoras
Anticuerpos
trombina
Toxinas
toxina de clostridiumbotulinum
toxina diftrica
venenos de serpiente
Hormonas
Transfiere electrones
Hidroliza algunas protenas
Fosforila glucosa y azucares relacionados
Hidroliza almidn y glucgeno
Protena de la clara de huevo
Protena de la leche
Transporta O2 en la sangre
Transporta O2 en el msculo
Transporta cidos grasos en la sangre
Filamentos estacionarios en las miofibrillas
Filamentos mviles en las miofibrillas
Cilios y flagelos
Forman complejos con protenas extraas
Componente del mecanismo de coagulacin
de la sangre.
Causas de envenenamiento de alimentos por
bacterias
Causa de la difteria
Enzimas que hidrolizan a fosfoglicridos
-
Insulina
Hormona de crecimiento
Protenas estructurales
Glicoprotenas
Protenas de la estructura de la
membrana
queratina
esclerotina
protenas de la cubierta viral
colgeno
Regula el metabolismo de la glucosa
Estimula el crecimiento seo
Paredes y cubiertas celulares
Componente de las membranas
Piel, plumas, uas, pezuas, etc.
Exoesqueletos de insectos
Cubierta alrededor del cromosoma
Tejido conectivo fibroso (tendones, hueso,
cartlago)
Tabla 3.10 algunas protenas comunes y su funcin.
-
Principal es actuar como cofactores o enzimas en reacciones de xido reduccin en el
interior de la clula.
Otro mononucletido importante es la coenzima A (CoA-SH) (figura 3.22), la cual contiene
adenina y la vitamina cido pantotnico. La CoA interviene en la transferencia de grupos
acetato y cidos grasos en relaciones celulares, por ejemplo, en la formacin de citrato
catalizada por la enzima citrato sintasa:
-
El DNA (cido desoxirribonucleico) es un biopolmero no repetitivo que contiene toda la
informacin gentica celular (en ciertos virus esta funcin la tiene el RNA). Durante la
divisin celular, cada clula hija recibe una copia exacta y completa de DNA parental. En
los procariotas (bateras, algas verde azules) hay una molcula de DNA nica que forma un
solo cromosoma, el cual tiene un peso molecular superior a 2 x 109 y constituye
-
aproximadamente el 1% del peso seco de la clula. En los eucariotas (levaduras, hongos,
animales y plantas superiores) generalmente existen algunos cromosomas (molculas de
DNA) los cuales, en clulas diploides, se presentan en el ncleo en forma combinada con
protenas bsicas llamadas histonas. Adems del DNA nuclear, las clulas eucariotas
contienen DNA satlite, especialmente en las mitocondrias y en los
cloroplastos, el cual es diferente del DNA nuclear. El DNA procaritico de ordinario est
unido a un pliegue o invaginacin de la membrana celular llamado mesosoma en la regin
nuclear (los procariotas no poseen un ncleo verdadero). No hay protenas asociadas con
DNA. Los procariotas tambin pueden tener material extracrosomal denominado plasmidos
o episomas, de los cuales se tratar en captulos posteriores sobre biologa molecular.
Todas las molculas de DNA estn formadas en cuatro unidades de mononucletidos
fosfodister (figura 3.23) para formar una
cadena de polinucletido larga y sin ramificaciones. Dos de tales cadenas, las cuales son
-
complementarias una de la otra, se combinan para formar una estructura de doble hlice en
la que las dos cadenas permanecen juntas por la formacin de puentes de hidrogeno entre
pares de bases complementarias. As, la adenina de una cadena siempre est unida por
puentes de hidrogeno con la timidina de la segunda cadena y la citosina se une por puentes
de hidrogeno a la guanina. Los enlaces de hidrogeno estabilizan a la molcula de doble
hlice del DNA y, puesto que las bases G-C se unen por tres de tales enlaces en
comparacin con dos entre las bases A-T, mientras mayor es la cantidad de pares de bases
guanosina-citocina (G-C), la molcula de DNA es ms estable (figura 3.24).
Dentro de la clula el RNA (cido ribonucleico) existe en tres formas, a saber: RNA
mensajero (mRNA), RNA de transferencia (tRNA) y RNA ribosomal (rRNA). Todas
consisten en una cadena
-
individual de polirribonucletido compuesta en cuatro ribonucletidos principales (aunque
el tRNA contiene adems algunos ribonucletidos inusuales que incluyen a los cidos
pseudouridlico y ribotimidlico). En los procariotas todos los RNAs se encuentran en el
citoplasma, en tanto que en los eucariotas el rRNA se localiza en el citoplasma (en los
ribosomas) y el mRNA y el tRNA se encuentran en el ncleo, mitocondrias, cloroplastos y
citoplasma.
El mRNA se sintetiza por transcripcin enzimtica de una hebra de la molcula de DNA.
Las bases que constituyen la hebra individual de mRNA son complementarias a dicha hebra
-
(excepto que el uracilo reemplaza a la timina). Despus de la transcripcin, el mRNA pasa
a los ribosomas donde sirve como molde para el ordenamiento secuencial de los
aminocidos durante la sntesis de protenas. Los tripletes de nucletidos (codones) a lo
largo de la hebra de mRNA determinan un aminocido especfico.
Los tRNAs son molculas pequeas (23000 30000 de peso molecular) que actan como
portadores de aminocidos especficos. Durante la sntesis de protenas, cada uno de los 20
aminocidos ms comunes tiene al menos un tRNA especfico que lo conduce hasta el
-
mRNA que se encuentra unido al ribosoma. Una vez all, el tRNA transfiere el aminocido
correspondiente a la cadena polipeptdica en crecimiento.
El rRNA constituye hasta el 65% del peso de los ribosomas y se divide en tres tipos, a
saber: rRNA 23S, 16S y 5S, dependiendo de su capacidad para sedimentar en la
centrifugacin. Durante la sntesis de protenas, el mRNA se une al ribosoma, y un tRNA se
adhiere al mRNA y transfiere su aminocido a la cadena polipeptdica en crecimiento; el
ribosoma se mueve entonces a lo largo
delmRNA hasta el codn prximo que da la informacin para el aminocido siguiente. La
sntesis de protenas se explicara con ms detalle ms adelante, sin embargo, la verdadera
funcin de los diferentes tipos de rRNA se desconoce an.
-
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-
BIOLOGA MOLECULAR
4.1 LOCALIZACION Y ESTRUCTURA DEL MATERIAL HEREDITARIO
4.1.1. Introduccin
El DNA es la ubicacin de la informacin hereditaria y est contenido en estructuras
conocidas como cromosomas. Las clulas contienen cromosomas que se duplican antes de
la divisin celular. En este captulo se a