Teknologi DNA Rekombinan.ppt

download Teknologi DNA Rekombinan.ppt

of 25

Transcript of Teknologi DNA Rekombinan.ppt

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    1/25

    Rencana Perkuliahan

    Aliran Informasi Genetik

    Teknologi DNA Rekombinan

    PCR & Diagnosis Molekuler (Aplikasi PCR)

    Teknik Biologi Molekuler (UTS)

    Produksi Biopharmaceutical & Vaccine 1X

    Teknologi Fermentasi Senyawa Obat 1 X

    Produksi Metabolit Sekunder senyawa Obat 2 X

    Presentasi Kelompok Topik (Aplikasi PCR, ProduksiProtein terapetik, Fermentasi senyawa obat/pangan,

    produksi met. Sekunder via kultur jaringan dan tanaman

    transgeni, prod met sekunder via combinatorial

    biosinthesis 3X.

    BIOTEKNOLOGI

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    2/25

    Teknologi DNA Rekombinan

    Restriksi Endonuklease

    Ligasi & Ligasi DNA

    Vektor Kloning & Rekombinan DNA

    Isolasi DNA & RNA

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    3/25

    Goal..

    Pemanfaatan Manipulasi Gen dalam Pengobatan

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    4/25

    DNA Rekombinan

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    5/25

    Nucleases

    Nukleotida

    IK. Hidrogen

    Phospodiester

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    6/25

    ExonucleaseVS Endonuclease

    Nuclease dapat memotong/degradasi

    molekul DNA dengan membelah IK.

    Phosfodiester yang menghubungkan

    nukleotida

    Exonucleasemenghilangkan nukleotida

    pada posisi ujung molekul DNA

    Endonucleasememotong ikatan dalam

    phosfodiester molekul DNA

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    7/25

    Restriction Endonuclease (RE)

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    8/25

    Enzim Restriksi

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    9/25

    Ligasi

    Ligase : Enzim yang mensintesis

    pembentukan ikatan phosfodiester yang

    menghubungkan nukleotida satu dengan

    yang lainnya

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    10/25

    Ligasi

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    11/25

    Restriksi

    & Ligasi

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    12/25

    DNA VEKTOR

    Vektor kloning berfungsi untuk

    memperbanyak fragmen DNA yang

    disisipkan, sehingga fragmen DNA hanya

    di replikasi, tidak di transkripsi.

    Vektor ekspresi digunakan untuk produksi

    protein.

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    13/25

    Vektor (Biotranspor)

    Plasmid

    Virus lambda bacteriophaga

    Cosmid

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    14/25

    Plasmid

    DNA untai ganda

    Berbentuk lingkaran

    Bersalinan tinggi (high copy number) Berukuran kecil (mudah dimanipulasi)

    Dapat bereplikasi sendiri

    Dapat disisipi DNA asing Memiliki 2 gen marker : untuk mendeteksi

    adanya vektor dan DNA sisipan

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    15/25

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    16/25

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    17/25

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    18/25

    Tahapan kloning

    Isolasi/preparasi DNA sisipan dan DNA

    Vektor

    Pemotongan molekul DNA

    Penggabungan fragmen DNA sisipan ke

    DNA vektor

    Transformasi Identifikasi

    Isolasi DNA rekombinan

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    19/25

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    20/25

    Transfromasi

    Sel kompeten : sel mampu menerima

    DNA asing.

    Sel diberi lar. CaCl2

    agar sel menjadi

    permeabel dan bermuatan + (DNA-).

    Cara Heat Shock dan Kejutan listrik.

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    21/25

    Kemungkinan dalam

    transformasi? Sel kompeten tidak kemasukan DNA

    apapun

    Sel kompeten kemasukan DNA vektor

    tetapi tidak membawa gen X

    Sel kompeten kemasukan DNA vektor dan

    membawa gen X (DNA rekombinan)

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    22/25

    Seleksi putihbiru

    Jika ada tiga cawan yang diisi media

    padat, masing-masing diberi label media

    A, B dan C

    A hanya media padat

    B media yang ditambah antibiotik (mis

    Pinicilin)

    C media padat ditambah antibiotik, X-gal

    dan IPTG

    Apa yang terjadi dalam media A, B dan C

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    23/25

    Seleksi putihbiru

    Media A, semua sel kompeten hidup

    Media B, lebih sedikit sel kompeten hidup

    dari media A karena sel kompeten yang

    membawa DNA resisten antibiotik.

    Media C, sama dengan media B tetapi

    pada media tersebut ada dua warna Biru

    dan Putih

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    24/25

    Seleksi putihbiru

  • 5/19/2018 Teknologi DNA Rekombinan.ppt

    25/25

    Next...

    Konfirmasi DNA rekombinan

    PCR