1 1 Summer Camp, 2013. 2 Constructive Learning & Graphic Organizers [email protected] (0332-3799529)
Online Appendix 1 - Diabetesdiabetes.diabetesjournals.org/content/suppl/2008/05/23/db08-0332... ·...
Transcript of Online Appendix 1 - Diabetesdiabetes.diabetesjournals.org/content/suppl/2008/05/23/db08-0332... ·...
Online Appendix 1
Abbreviation Description Unit Availability SOM inputAdipon adiponectin mg/l 58% yesAHT anti-hypertensive treatment - 100% -ApoAI serum apolipoprotein A-I mg/dl 93% yesApoAII serum apolipoprotein A-II mg/dl 89% noApoB serum apolipoprotein B mg/dl 93% yesChol total cholesterol mmol/l 97% yesCPept C-peptide pmol/l 76% noCRP C-reactive protein mg/l 82% yesDBP diastolic blood pressure mmHg 98% -DKD diabetic kidney disease∗ - 90% -DMDur duration of type 1 diabetes years 100% -DRP diabetic retinal disease - 99% -A1C glycosylated hemoglobin A1c % 95% yesHDL2C high-density lipoprotein 2 cholesterolmmol/l 92% yesHDL3C high-density lipoprotein 3 cholesterolmmol/l 92% noLDLC LDL cholesterol (Friedewald) mmol/l 96% noMBL mannan binding lectin mg/l 59% yesMetS metabolic syndrome - 94% -SBP systolic blood pressure mmHg 98% -sCreat serum creatinine µmol/l 96% yessK serum potassium mmol/l 55% yessNa serum sodium mmol/l 55% yesTG triglyceride concentration mmol/l 97% yes24h-uAlb 24h-urine albumin excretion mg 80% yes24h-uCreat 24h-urine creatinine excretion mmol 66% yes24h-uK 24h-urine potassium excretion mmol 62% no24h-uNa 24h-urine sodium excretion mmol 62% no24h-uUrea 24h-urine urea excretion mmol 61% no
Only biochemical variables were included in the SOM input data. Furthermore, variablesthat were derived mathematically (Friedewald LDLC) or werestrongly collinear with theother inputs (HDL3C, ApoAII, 24h-uK, 24h-uNa, 24h-uUrea) were excluded (the low avail-ability of the urine data caused additional artifacts in theanalyses). C-peptide was close tothe detection limit for almost all patients and was also excluded. SOM models that includedall the biochemical variables were nevertheless tested to ensure that the model pruning didnot reduce statistical sensitivity. Before analysis, the input data was rank-transformed formen and women separately.
The robustness of the analyses was tested by removing patients with low availability ofdata; the results for the more complete subsets were consistent with the full dataset (notshown). In theory, the SOM algorithm is able to automatically ignore any missing values,but due to the PCA initialization (illustrated in Online Appendix 2), the preprocessed datawas imputed by least-squares linear regression; this also ensured that the missing valuesdid not cause any non-linear artifacts.
∗All patients were reviewed for DKD status, but 10% of the individuals could not be clas-sified due to inconclusive clinical data.
Online Appendix 7
The Finnish Diabetic Nephropathy Study Centers
Anjalankoski health care center Sirpa KoivulaTarja Uggeldahl
Espoo health care center, Espoonlahti Anita NikkolaEila Ritola
Espoo health care center, Samaria Eija Oukko-RuponenEspoo health care center, Tapiola Hanna Saarinen
Merja Kataja-TuomolaMarjatta Niska
Espoo health care center, Viherlaakso Anne LyytinenSatu Raumavirta-KoivistoMarjo Kovanen
Etelä-Karjala Central Hospital Tuula EnsalaEsko HussiJukka ToivonenTuula MatikainenRaimo VanamoHelga Hasu
Heinola health care center Päivi HentunenJukka Lagerstam
Helsinki health care center, Puistola Kari PohjolaHeli SilvennoinenTiina SimonenHannele Kari
Helsinki health care center, Suutarila Anja KaprioBirgitta Rantaeskola
Helsinki health care center, Töölö Jari HaagaPirjo KääriäinenAnna-Liisa Pietiläinen
Helsinki Herttoniemi Hospital Markku SaraheimoKerstin Wickström
Helsinki University Central Hospital Paula NikkanenPirkko Salmi
Hyvinkää health care center Sisko KlemettiTeija NyandotoEija RontuSusanna Satuli-Autere
Iisalmi Hospital Eija ToivanenJaana Hyytiäinen
Jokilaakso Hospital Tuula LaitinenJukka Lagerstam
Jorvi Hospital Suvimarja ArankoTarmo LeppäläSuvi ErvastiRitva Kauppinen-MäkelinArto KuusistoKatriina NikkiläLeena Pekkonen
Jyväskylä health care center Kirsti NuorvaMarja Tiihonen
Järvenpää health care center Tuula KinnunenLiisa NikulainenTuula Salokangas
Kainuu Central Hospital Silja JokelainenPaula KemppainenAnna-Maria MankinenMarja Sankari
Online Appendix 7 2
Tuula MyllykangasKanta-Häme Central Hospital Pirjo Kinnunen
Anja OrvolaTapani SalonenAnnukka Vähänen
Kerava health care center Helene StuckeyPaula Suominen
Keski-Pohjanmaa Central Hospital Stefan AndersonBeatrice AsplundUlrika ByskataIngvor ByskataToini VirkkalaPäivi Liedes
Keski-Suomi Central Hospital Terje ForslundPirkko KoskiahoMarianne LaukkanenJuha SaltevoMarja TiihonenPirkko KoskiahoAnne HalonenArvo KoistinenEsa LeppänenAnna-Mari Koski
Kirkkonummi health care center Anja LappalainenMaisa LiimatainenJaana Santaholma
Kivelä Hospital, Helsinki Ari AimolahtiMaarit Kärki
Koskela Hospital, Helsinki Maija LehtimäkiNina UhleniusEeva HuovinenVeikko Ilkka
Kotka health care center Eeva Pälikkö-KontinenAnnika Vanhanen
Kouvola health care center Erkki KoskinenAnna BorgmanTaimi Siitonen
Kuopio University Central Hospital Erja HuttunenRisto IkäheimoPäivi KiljanderMarkku LaaksoTimo LakkaLeena MoilanenLeo NiskanenUlla TuovinenIlkka VauhkonenErkki VoutilainenPauli KarhapääPäivi KekäläinenErkki Lampainen
Kuusamo health care center Erja IsopoussuTapio KääriäinenEero Vierimaa
Kuusankoski Hospital Esa KilkkiLiisa Riihelä
Kymenlaakso Central Hospital Mare RiiheläLeena RyysyReino Paldanius
Laakso Hospital, Helsinki Taina MeriläinenPaula PoukkaTuula TikkanenRiitta Savolainen
Lahti City Hospital Aulikki MäkeläMarjukka TannerEija Behm
Länsi-Pohja Central Hospital Pirkko NyländenHilkka LaukkanenPirjo Myllykoski
Länsi-Uusimaa Hospital Inge-Maj JousmaaJukka Rinne
Lappeenranta health care center, Pirjo LinkolaArmila Hospital Irja Pulli
Lappi Central Hospital Sirkka SeverinkangasTimo Tulokas
Online Appendix 7 3
Liisa HyvärinenLohja Hospital Tuula Granlund
Mikko SaariTuula SalonenReija Tähtinen
Loimaa health care center Pirjo ElorantaArja Mäkelä
Lounais-Häme Hospital Tarja KalliomäkiJuha KoskelainenRiitta NikkanenVesa SalonenNiilo SavolainenHannu SulonenEija Valtonen
Malmi Hospital, Helsinki Helena LankiSeija MoilanenMarju Tilly-Kiesi
Mänttä Hospital Anne-Mirjami HänninenIsmo Pirttiniemi
Mikkeli Central Hospital Anita GyntherMaarit SalminenTuomo Vänttinen
Nurmijärvi health care center Mikko HonkasaloMarko MiettinenPäivi Nurminen
Oulaskangas Hospital Elina JokelainenPirkko-Liisa JylkkäElsi KaarlelaJari Vuolaspuro
Oulu health care center Rauni HäkkinenLiisa HiltunenSirkka Keinänen-Kiukaanniemi
Päijät-Häme Central Hospital Hannu HaapamäkiSatu HämäläinenAntero HelanteräVesa IlvesmäkiHilkka Miettinen
Tarja Tick-SinkkiläPalokka health care center, Palokka Leena WellingPalokka health care center, Vaajakoski Kirsti Mäkinen
Päivi SopanenPieksämäki Hospital Mari Tamminen
Markku TaskinenPietarsaari Hospital Maj-Len Holmbäck
Bo IsomaaLeena Sarelin
Pohjois-Karjala Central Hospital Laura HyttinenPäivi KekäläinenMaija PietarinenAnneli RissanenRisto LaitinenHannu TurtolaUlla Maija Henttula
Pori City Hospital Pirjo MerensaloKirsi SäveläTerttu ViitalaPäivi Ahonen
Porvoo Hospital Heidi JohanssonSirkka RämöBjarne RaskMarjatta Kallion
Raahe Hospital Anne HolmaMatti HonkalaAino TuomivaaraRiitta Vainionpää
Rauma Hospital Kaisa LaineTaru SalminenPaula KetolaKaisa Saarinen
Riihimäki Hospital Pirkko AaltoMarja LanniIrmeli LaitaharjuEija ImmonenLeena Juurinen
Online Appendix 7 4
Salo Hospital Jouni LapinleimuPirkko RautioMerja VirtanenAnita Alanko
Satakunta Central Hospital Markku AsolaPaavo PääkkönenMarjo PenttiMarja RautavirtaPertti KuneliusSirkku Mannila
Savonlinna Central Hospital Tuula PulliPäivi SallinenEija ToivanenHelena ValtonenAarne Vartia
Seinäjoki Central Hospital Eeva Korpi-HyövältiTerhikki LatvalaEsko LeijalaTarja Nyrhilä
Tammisaari Hospital Jukka RinneInge-Maj Jousma
Tampere health care center Pekka AlarotuLiisa CaloniusSeppo GummerusPaula HelinTarja KaitalaHelena Kirkkopelto-JokinenEila KujansuuTaru NiskanenAtte VadénTimo SaaristoMarjo KuorttiArja Kallio
Tampere University Central Hospital Ilpo Ala-HouhalaTuula KuningasPaula LampinenMarita Määttä
Heikki OksalaTuija OksanenKristiina SalonenSirkku TulokasHilkka Tauriainen
Tiirismaa health care center Leena PetlinLiisa SavolainenTiina Kivelä
Turku health care center Anne ArtukkaIrmeli HämäläinenPäivi KokkilaLea SorvariMarkku VähätaloHille Virtamo
Turku University Central Hospital Kaija BreitholzRaija EskolaKaj MetsärinneRiikka NevaUlla PietiläPirjo SaarinenRiitta TuominenMarkku AsolaSari Äyräpää
Vaajakoski health care center Päivi SopanenKirsti Mäkinen
Vaasa Central Hospital Stig BergkullaUlla HautamäkiVivi-Ann MyllyniemiIrma Rusk
Valkeakoski Hospital Terhi ImmonenSeppo OjanenMaisa RautiainenEija ValtonenHannu Ylönen
Vammala Hospital Irma IsomäkiLeena MustaniemiMerja Tapiolinna-Mäkela
Online Appendix 7 5
Riitta KroneldVantaa health care center, Korso Jaana Vahtola
Riitta ToivonenVantaa health care center, Länsimäki Raila Ahonen
Marja Ivaska-SuomelaAnu JauhiainenSari KulttiPirjo Kiviniemi
Vantaa health care center, Martinlaakso Merja LaineTiina PellonpääRiitta Puranen
Vantaa health care center, Myyrmäki Anne AirasJukka Laakso
Vantaa health care center, Rekola Matti EerolaEeva Jatkola
Vantaa health care center, Tikkurila Riitta LönnbladJari MäkeläAnita MalmElli Rautamo
Åland Central Hospital Hans GranlundAnn-Christin JohnssonMonica Forsen
Äänekoski health care center Satu SavolainenTapani Marjanen