Discovery of novel IgM binding PfEMP1 variants in Plasmodium falciparum line NF54
description
Transcript of Discovery of novel IgM binding PfEMP1 variants in Plasmodium falciparum line NF54
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
Centre for Medical Parasitology
2nd Kilimanjaro International PhD Symposium, KCMC November 28th 2013
Discovery of novel IgM binding PfEMP1 variants in Plasmodium falciparum line NF54
Anine E JeppesenPhD-studentCentre for Medical Parasitology, University of Copenhagen and Copenhagen University Hospital (Rigshospitalet), Copenhagen, Denmark
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
PfEMP1 variants
• Plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein 1 (PfEMP1)
- Mediate adhesion to host receptors- Build up of DBL and CIDR domains
Dias 2
Centre for Medical Parasitology
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
PfEMP1 variants
• PfEMP1 proteins are encoded by var genes- 60 different copies pr. genome- Variation between genomes huge PfEMP1 variant repertoire
- Mutually exclusive expression- Epigenetic memory
Dias 3
Centre for Medical Parasitology
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
PfEMP1 and non-immune IgM binding
• PfEMP1 variants binding non-immune IgM binding:- VAR2CSA variants (Creasey et al. 2003. Infection and
Immunity, Rasti et al. 2006. PNAS)- Some rosetting variants (Rowe et al. 2002, Am. J. Trop.
Med. Hyg.)
Dias 4
Centre for Medical Parasitology
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
PfEMP1 and non-immune IgM binding
• Role of non-immune IgM binding- Immune evasion by masking IgG epitopes (VAR2CSA)
(Barfod et al. 2011, PNAS)
- Role in rosette formation(Clough et al. 1998, Exp. Parasit.)
• Questions:- Other roles of non-immune IgM binding? - Other non-immune IgM binding variants?
Dias 5
Centre for Medical Parasitology
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
Selecting IE for non-immune IgM binding PfEMP1 variants
Dias 6
Centre for Medical Parasitology
• Problems:- In vitro cultures tend to express the same PfEMP1
variants and have a low switching rate towards other variants
• Solution:- Using the var transcription memory reset parasite G6 of
the NF54 line.
IgM
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
The NF54 G6 parasite line
Dias 7
Centre for Medical Parasitology
• NF54 (3D7) line transfected with the VBH plasmid (Dzikowski et al. 2007. EMBO reports)
• VBH resets the epigenetic memory of what var genes was being transcribed (Dzikowski and Deitsch. 2008. J. Mol. Biol.)
Dzikowski et al. 2007 EMBO reports
Fastman et al. 2012. PLoS One
Heterogenous population expressing a vast variety of var genes
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
Method
Dias 8
Centre for Medical Parasitology
Fastman et al. 2012. PLoS One
IgM
Test for IE by Ethidium Bromide staining in flow cytometry
Transfer to 25 ml flask culture, test for non-immune IgM binding and var transcription
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
Results – IgM binding in flow cytometry
Dias 9
Centre for Medical Parasitology
IgM
Positive (5 clones) Mix (13 clones) Negative (1 clone)
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
Results - var gene transcription
Dias 10
Centre for Medical Parasitology
PF07_0139 MAL6P1.316(3 clones) (2 clones)
PFL0030c (VAR2CSA) PFL0020w (/MAL6P1.4) (2 clones) (4 clones)
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
MAL6P1.4 binds to non-immune IgM antibodies
Dias 11
Centre for Medical Parasitology
• 3D7 line selected by MAL6P1.4 specific antiserum- Not rosetting
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
MAL6P1.4 binds to IgM at the C-terminal end
Dias 12
Centre for Medical Parasitology
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
PFL0020w binds to non-immune IgM antibodies
Dias 13
Centre for Medical Parasitology
• NF54 line transcribing PFL0020w
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
PFL0020w binds IgM at the C-terminal end
Dias 14
Centre for Medical Parasitology
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
MAL6P1.316 binds to non-immune IgM antibodies
Dias 15
Centre for Medical Parasitology
• 3D7 line selected by MAL6P1.316 specific antiserum
10 nM IgMControl
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod
Discussion
Dias 16
Centre for Medical Parasitology
• 5 predicted non-immune IgM binding variants in NF54• MAL6P1.4, PFL0020w and MAL6P1.316 bind non-immune IgM• Indication of binding via the C-terminal end
HB3VAR06
VAR2CSA
MAL6P1.4
PFL0020w
PF07_0139
• Ongoing work: Characterization of remaining variants, Determination of binding site What role does non-immune IgM binding play?
MAL6P1.316
For at ændre ”Enhedens navn” og ”Sted og dato”:
Klik i menulinjen, vælg ”Indsæt” > ”Sidehoved / Sidefod”.Indføj ”Sted og dato” i feltet for dato og ”Enhedens navn” i Sidefod 17
A special thank to:Christian WangMichele KreutzerErik LaursenLisbeth Stolpe
Thank you for your attention!
Centre for Medical Parasitology
Financial support:University of CopenhagenEviMalaRThe Danish Research CouncilRigshospitaletThe Novo foundationThe Lundbeck foundation
Liz Stevenson,CMP
Ron DzikowskiHebrew University, Jerusalem
Louise Turner,CMP
Supervisors:
Lea Barfod,CMP
Lars Hviid,CMP