¿Cómo aprender a leer ¿Cómo aprender a leer un artículo científico? un artículo científico?

Unidad mixta

CSIC/UAH

Alfredo Prieto MartínProfessor in Immunology at Alcalá University Coordinator of Post grade program in ImmunologyConsultant in the field of Problem Based LearningAdministrator of: Web site on PBL http://www2.uah.es/problembasedlearningWebBlog site on PBL: http://www.e-pbl-es.tkContact me at : alfredo.prieto@uah.es or http://www.alfredoprieto.tk

Plan de la clase Plan de la clase

• Metodología para la asimilación de la información primariaMetodología para la asimilación de la información primaria

1.1. Cómo comprender el significado de un texto científico.Cómo comprender el significado de un texto científico.

• Proceso de Proceso de lectura sistemáticalectura sistemática

• ¿¿CómoCómo leer para entender el significado de un texto complejo? leer para entender el significado de un texto complejo?

• Búsqueda orientadaBúsqueda orientada de información de información

• ¿¿Qué Qué información hay que buscar en cada sección?información hay que buscar en cada sección?

2. Comprender e interpretar la iconografía (resultados).2. Comprender e interpretar la iconografía (resultados).

Método del paréntesis ().Método del paréntesis ().

3. Escribir un esquema, redactar un resumen de cada sección y una lista de dudas.3. Escribir un esquema, redactar un resumen de cada sección y una lista de dudas.

– Métodos de representación grafica de ideasMétodos de representación grafica de ideas

1.1. Dividir la dificultad en partes y abordarlas Dividir la dificultad en partes y abordarlas

sucesivamente. sucesivamente.

2. 2. Localizar lo que no se entiende y aclararlo:Localizar lo que no se entiende y aclararlo:

Usar diccionario, libro de consulta e Internet para Usar diccionario, libro de consulta e Internet para

descifrarlo y comprenderlo. descifrarlo y comprenderlo.

3.3. Registrar lo más relevante:Registrar lo más relevante:

Apuntar los significados descifrados e ideas Apuntar los significados descifrados e ideas

principales.principales.

4.4. Recapitular para integrar:Recapitular para integrar:

Releer, resumir y esquematizar para integrar la Releer, resumir y esquematizar para integrar la

información.información.

I.I. Comprensión del texto:Comprensión del texto: PrincipiosPrincipios de lectura sistemática de lectura sistemática

Primera lectura Primera lectura (descifrar palabras para comprender (descifrar palabras para comprender

oraciones)oraciones):: buscar (diccionario, google) y apuntar significado buscar (diccionario, google) y apuntar significado

palabras y hallar relación entre ellas. Dpalabras y hallar relación entre ellas. Descifrado el significado escifrado el significado

de los de los términostérminos se comprende el mensaje de la se comprende el mensaje de la oración.oración.

Segunda lectura Segunda lectura (recapitulación oraciones para comprender (recapitulación oraciones para comprender

párrafo)párrafo):: relee y relaciona las oraciones y apuntar al margen el relee y relaciona las oraciones y apuntar al margen el

tema principal de cada párrafo. tema principal de cada párrafo.

Tercera lectura Tercera lectura (releer párrafos para comprender sección)(releer párrafos para comprender sección):: se se

lee de un tirón para relacionar temas de distintos párrafos.lee de un tirón para relacionar temas de distintos párrafos.

Elaboración de listas de ideas principales y glosario.Elaboración de listas de ideas principales y glosario.

1.1. Práctica de la lectura sistemática:Práctica de la lectura sistemática: leer , releer y volver a releer leer , releer y volver a releer

Estructura lógica del artículoEstructura lógica del artículoA + (I M R D)A + (I M R D)

Cuestionario para lectura crítica del artículoCuestionario para lectura crítica del artículo¿Qué mensajes principales hay que buscar en cada ¿Qué mensajes principales hay que buscar en cada sección?sección?Introducción ¿Introducción ¿Por quéPor qué lo hicieron? lo hicieron?Materiales y métodos ¿Qué Materiales y métodos ¿Qué hicieronhicieron??Resultados ¿Qué Resultados ¿Qué encontraronencontraron??Discusión ¿Qué Discusión ¿Qué significasignifica??Abstract resumen de todoAbstract resumen de todo

I. Comprensión del texto: Búsqueda orientada de informaciónBúsqueda orientada de información

El título El título identifica la idea principal del identifica la idea principal del

artículo, informa de los nuevos artículo, informa de los nuevos

hallazgos o conclusioneshallazgos o conclusiones. .

¿Qué se mide? ¿Qué se mide?

¿En qué modelo? ¿En qué modelo?

¿Se descubre su causa?¿Se descubre su causa?

ElEl títulotítulo

BackgroundBackground: Una : Una oración que introduce la oración que introduce la cuestión principal. Es cuestión principal. Es opcional opcional

Cuestión:Cuestión: objetivos o objetivos o propósito: ¿Qué quiere propósito: ¿Qué quiere contestar este trabajo? contestar este trabajo? Esa es la cuestión.Esa es la cuestión.

¿Qué ¿Qué métodosmétodos utilizan? utilizan? ¿Qué ¿Qué experimentosexperimentos hacen? hacen?

Abstract: Un resumen breveAbstract: Un resumen breveResultadosResultados: ¿Qué han : ¿Qué han

encontrado? ¿Cuáles son encontrado? ¿Cuáles son

los resultados y los resultados y hallazgoshallazgos

más importantes?más importantes?

Las respuestas: Cuales Las respuestas: Cuales

son las son las conclusionesconclusiones del del

estudio. estudio.

A vecesA veces al final se al final se

señalan señalan aplicacionesaplicaciones

potenciales, potenciales,

implicacionesimplicaciones e incluso e incluso

eespeculacionesspeculaciones..

• Sitúa el estado del Sitúa el estado del conocimiento actualconocimiento actual •Define los Define los conceptosconceptos claveclave y premisas y premisas asumidas.asumidas.•Justifica esas Justifica esas asunciones.asunciones.•Explica Explica por quépor qué los los autores realizaron el autores realizaron el estudio y define los estudio y define los objetivosobjetivos del mismo. del mismo.•Establece la Establece la cuestióncuestión a la que responde el a la que responde el trabajo ¿trabajo ¿qué se qué se pretende encontrar?pretende encontrar?

IntroducciónIntroducción

Establece Establece hipótesishipótesis Proposición afirmativa de la Proposición afirmativa de la que se deducen que se deducen predicciones que serán predicciones que serán confirmadas o rechazadas confirmadas o rechazadas por los resultados por los resultados experimentalesexperimentales

Se relaciona la cuestión con Se relaciona la cuestión con la la aproximación aproximación experimentalexperimental y se y se establece establece estaesta A veces sA veces se e anticipa la anticipa la respuestarespuesta encontrada encontradaLa introducción esta dirigida a una audiencia de especialistas

PProporciona información (con detalles y roporciona información (con detalles y

referencias) para que otro científico pueda referencias) para que otro científico pueda

evaluar o reproducirevaluar o reproducir los experimentos. los experimentos.

-Para analizar críticamente un diseño -Para analizar críticamente un diseño

experimental debes comprender su experimental debes comprender su marco marco

conceptualconceptual y descubrir en qué y descubrir en qué premisas premisas

o asuncioneso asunciones se basa. se basa.

-Para comprender esta sección -Para comprender esta sección dibuja dibuja

esquemasesquemas de los protocolos explicados. de los protocolos explicados.

Material y MétodosMaterial y Métodos

La revista ahorra en iconografía, tu no debes hacerlo en una presentación

--El El textotexto expone los resultados de los expone los resultados de los experimentos experimentos

-Las -Las tablas y figurastablas y figuras representan los representan los

resultados principales. resultados principales.

-El orden del texto de los resultados es -El orden del texto de los resultados es

paralelo al de la presentación de datos en paralelo al de la presentación de datos en

ilustraciones. ilustraciones. -Cuando el texto te refiera a una -Cuando el texto te refiera a una tabla o tabla o figurafigura haz un paréntesis : haz un paréntesis : ( )( )((Con suma atención lee el Con suma atención lee el piepie de la figura y de la figura y tras ello intenta comprenderlatras ello intenta comprenderla))

ResultadosResultados

--Su función es responderSu función es responder

¿¿Qué significanQué significan los los

resultados, resultados, qué qué

trascendenciatrascendencia tienen? tienen?

Al principioAl principio se establece se establece

la la respuestarespuesta resaltando resaltando

los los hallazgos relevantes hallazgos relevantes

y aspectos más y aspectos más

novedososnovedosos..

DiscusiónDiscusión--A continuaciónA continuación se se defiende la validezdefiende la validez de los de los hallazgos, usando los hallazgos, usando los resultados del artículo y los resultados del artículo y los publicados por otros publicados por otros autores.autores.-Se -Se explicaexplica::-¿Cómo los resultados ¿Cómo los resultados soportansoportan la respuesta a la la respuesta a la cuestión?cuestión?- ¿Porqué la respuesta es ¿Porqué la respuesta es razonablerazonable??- ¿Cómo ¿Cómo ajusta ajusta en el en el contexto del conocimiento contexto del conocimiento actual (actual (paradigmasparadigmas y y modelos actuales)?modelos actuales)?

Se destaca el valor de la respuestaSe destaca el valor de la respuesta

- ¿Qué ¿Qué añadeañade la respuesta al conocimiento la respuesta al conocimiento

existente? existente? - Deducir Deducir aplicaciones o implicacionesaplicaciones o implicaciones de la de la

respuestarespuesta

FinalizaFinaliza restableciendo la respuesta, restableciendo la respuesta,

-Recuerda -Recuerda que añadeque añade al conocimiento al conocimiento actual actual

Establecen sus posibles Establecen sus posibles aplicacionesaplicaciones e e implicaciones. .

--Haz un paréntesis Haz un paréntesis () () al llegar:al llegar:1.1. --Lee elLee el texto texto que se refiera a la que se refiera a la

ilustración.ilustración.2.2. Lee el pieLee el pie buscando el significado de las buscando el significado de las

palabras y siglas que no entiendas.palabras y siglas que no entiendas.3.3. --Anota sobre la ilustraciónAnota sobre la ilustración lo que lo que

significa cada curva cada símbolo o cada significa cada curva cada símbolo o cada barra e intenta entender la figura.barra e intenta entender la figura.

4.4. Vuelve a empezar hasta que lo entiendasVuelve a empezar hasta que lo entiendas

2. Interpretar las ilustraciones2. Interpretar las ilustraciones

ILUSTRACIONESILUSTRACIONES

• Las ilustraciones son expresiones gráficas, Las ilustraciones son expresiones gráficas, transmiten visualmente mensajes clave transmiten visualmente mensajes clave difícilmente transmisibles mediante palabras.difícilmente transmisibles mediante palabras.

• Sólo hay dos tipos: tablas y figurasSólo hay dos tipos: tablas y figuras1.1. TablasTablas

– Representación alfanumérica con información Representación alfanumérica con información ordenada en filas y columnasordenada en filas y columnas

2.2. Figuras Figuras – Una ilustración que no es una tablaUna ilustración que no es una tabla

†Marcador LLC -B quiescente

(n=56) †

LLC -B no quiescente

(n=56) †

Controles

(n=47)†

‡Células

CD3CD56+(%)

12.5±4.7§Φ 5.4±2.7§Φ 8.6±3.4§

‡Células

CD3+CD57+(%)

15.6±6.1§Φ 7.8±2.6§Φ 12.5±2.9§

Este es el pie de la tabla. Se representan valores medios y desviaciones estándar de las poblaciones estudiadas. LLC-B leucemia linfática crónica de células B. # Número de la tabla (según orden de citación en texto). * Título. † Encabezamiento de la columna.‡ Encabezamiento de la fila. § Campo. ΦIndica diferencia significativa con los controles (student t test).

Tabla. 1Tabla. 1#. Componentes de una tabla*#. Componentes de una tabla*

• Cada Cada ejeeje representa los valores de una variable. representa los valores de una variable. – Eje Eje XX variable independiente. variable independiente.– Eje Eje Y Y variable dependiente.variable dependiente.

SímbolosSímbolos y y líneaslíneas muestran muestran como los cambios en la como los cambios en la variable independiente variable independiente (discreta o continua) afectan (discreta o continua) afectan a los valores que toma la a los valores que toma la variable dependiente.variable dependiente. % CD4+CD45RA+ cells

0 10 20 30 40 50 60cp

m x

100

00

50

100

150

200

B-CLL patientsr=0.48 p=0.001

Healthy controlsr=0.36 p=0.05

Estructura típica de un gráfico numéricoEstructura típica de un gráfico numérico

Ejercicio de interpretación de figurasEjercicio de interpretación de figuras

• ¿Cuales son las conclusiones que se pueden extraer ¿Cuales son las conclusiones que se pueden extraer

de los resultados presentados en la figura?de los resultados presentados en la figura?

• ¿Cual es el mensaje principal de la figura?¿Cual es el mensaje principal de la figura?

Relación hipertextual entre texto, pie y figuraRelación hipertextual entre texto, pie y figura

To assess whether cell loss and damage oc-curred under standard experimental conditions of an-nexin V binding (18), aliquots of cycloheximide-treated and untreated cells were exposed to varying wash cycles and analyzed by double-color stainings for annexin V-FITC binding and membrane permeability to 7-AAD. Wash cycles caused significant cell loss (Fig. 1A–C). This was cumulative (Fig. 1E,G) and affected the accuracy of the enumeration by decreasing the number of enumerated cells in both unstimulated and cycloheximide-treated cultures (P 0.001; Fig. 1E,G). The number of wash cycles also affected the precision of cell enumeration. The CV of the samples enumerated after four wash cycles was twice as high as that of samples washed only once (Fig. 1B,C). In addition, it should be noted that wash cycles not only caused cell loss but also affected the viability of the cells under analysis (Fig. 1). The increase in both the percentage of annexin V-positive and 7-AAD–positive permeable cells caused by the wash cycles was detected by both the proposed (Fig. 1E,G) and the traditional annexin V staining method (Fig. 1D,F). Minimal washing (one cycle) keeps both cell loss and artefactual decreases in cell viability to a minimum and reduces the time needed to process samples.

FIG. 1. Impact of the number of centrifugation-washing procedures on cell loss and viability of cultured cells. A: Representative dot plot analyses of viable fresh cells used to adjust the levels for 7-AAD and annexin V positivity. B,C: Analyses of cells cultured for 24 h in complete medium and acquired after one (B) or four wash procedures (C). The cell concen-tration (cells per milliliter) and the imprecision of replicated determina-tions (CV) are shown in each quadrant. The cell populations discrimi-nated in each quadrant are viable cells (annexin V negative/7-AAD negative) in the lower left quadrant, early apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD negative) in the lower right quadrant, late apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD positive) in the upper right quadrant, and early necrotic cells (annexin V negative/7-AAD positive) in the upper left quadrant. D–G: Percentages of cells after annexin V and antibody-labeling procedures, which employ different numbers of cycles of washing-cen-trifugation (from 1 to 4). Viable cells (annexin V negative/7-AAD negative; open bars), early apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD negative; very lightly shaded bars), late apoptotic cells (annexin V positive/7-AAD pos-itive; lightly shaded bars), and early necrotic cells (annexin V negative/ 7-AAD positive; dark gray bars). In panels E and G, the black bars represent the fraction of cells lost in the procedure. The PBMCs were cultured for 24 h in the presence (F,G) or absence (D,E) of cycloheximide (10 -3 M). Percentages of cells in relation to those that remain in the test tube (D,F) and in relation to the original number of cells in the sample (E,G). Data of one experiment representative of four are shown.

-A partir del esquema se redacta un -A partir del esquema se redacta un

resumen resumen de cada sección. de cada sección.

-Hacer una lista de -Hacer una lista de dudasdudas..

3. Escribir un esquema, redactar un resumen y una lista de dudas

apoptosisapoptosisinvolvesinvolves

Cell lessionsCell lessions

AllowAllow

Apoptotic cell Apoptotic cell IdentificationIdentification

Apoptotic cell Apoptotic cell quantificationquantification

Late apoptotic Late apoptotic cellscells

AllowAllow

RequiresRequires

Estimation of Estimation of fragmented cellsfragmented cells

biassesbiasses

vanishvanish

Técnicas para la relación esquemática de ideas:Técnicas para la relación esquemática de ideas: Mapa conceptualMapa conceptual

Sinvolvesinvolves

V Cell Cell fragmentationfragmentation

O

Técnicas para la relación esquemática de ideas:Técnicas para la relación esquemática de ideas: ÁÁrbol temáticorbol temático

Prognosis LLC-BPrognosis LLC-B

Sistemas de estadiaje Binet y RaiSistemas de estadiaje Binet y Rai

LLC-B QuiescenteLLC-B Quiescente Prognosis variablePrognosis variable

LLC-BLLC-BNo quiescenteNo quiescente

Mala prognosisMala prognosis

Bajo CD25 CD38 Bajo CD25 CD38 Buena prognosisBuena prognosis

Alto CD25 CD38Alto CD25 CD38Mala prognosisMala prognosis

Criterios de MonserratCriterios de Monserrat

Fenotipo de las células leucémicasFenotipo de las células leucémicas

Baja Masa tumoralBaja Masa tumoral Prognosis variablePrognosis variable Alta Masa Alta Masa

tumoral tumoral Mala prognosisMala prognosis

Técnicas para la relación esquemática de ideas:Técnicas para la relación esquemática de ideas: Diagrama de agrupamiento de ideasDiagrama de agrupamiento de ideas

Marcaje Marcaje con CSFEcon CSFE

analisis analisis

ProtocoloProtocoloExperimentalExperimental

AplicacionesAplicaciones

Diferenciación Diferenciación celularcelular

EstdioEstdioCiclo celularCiclo celular y apoptosisy apoptosis

AlicuotadoAlicuotado

MarcajeMarcaje

SortingSortingCultivoCultivo

Sugerencias para la Sugerencias para la preparación en equipo preparación en equipo

Reparto de la lectura de secciones, intercambio de resúmenes.Reparto de la lectura de secciones, intercambio de resúmenes.

Puesta en común de las dudasPuesta en común de las dudas Unos resolveréis las dudas de Unos resolveréis las dudas de

otros. otros.

Primera tutoría: Se plantean y resuelven las dudas pertinaces.Primera tutoría: Se plantean y resuelven las dudas pertinaces.

Preparación de la presentación .Preparación de la presentación .

Segunda tutoría: Revisión y Segunda tutoría: Revisión y Ensayo de presentaciónEnsayo de presentación (si (si

queréis) se resolverán las dudas pertinaces.queréis) se resolverán las dudas pertinaces.

Habéis aprendidoHabéis aprendido

• 1. Cómo abordar la lectura de un artículo.1. Cómo abordar la lectura de un artículo.

• 2. Qué buscar en cada lugar del articulo.2. Qué buscar en cada lugar del articulo.

• 3. Cómo descifrar una ilustración.3. Cómo descifrar una ilustración.

• 4. Distintas maneras de representar 4. Distintas maneras de representar

información en esquemas. información en esquemas.

Bibliografía y webgrafíaBibliografía y webgrafía

• McNeal, A (2000). How to read a scientific McNeal, A (2000). How to read a scientific research paper.research paper.

• Home page Problem based LearningHome page Problem based Learning• www2.uah.es/www2.uah.es/problembasedlearningproblembasedlearning//• www.alfredoprieto.tkwww.alfredoprieto.tk• Dirección donde te cuentan cómo hacer gráficos Dirección donde te cuentan cómo hacer gráficos

científicos de calidad: científicos de calidad: httphttp://://cpc.cadmus.comcpc.cadmus.com/da//da/

EjercicioEjercicio

• Buscar en Internet: Buscar en Internet:

• “ “ Cómo idear y realizar ilustraciones para Cómo idear y realizar ilustraciones para publicaciones.”publicaciones.”

• Encontrareis una presentación Sobre el Encontrareis una presentación Sobre el tematema

• Examinarlo y entregad las tres ideas mas Examinarlo y entregad las tres ideas mas interesantes que encontréisinteresantes que encontréis

Ejercicio lecturaEjercicio lectura• Introducción de un artículo.Introducción de un artículo.

• Marquen palabras y busquen significado.Marquen palabras y busquen significado.

• Anoten ideas principales. Anoten ideas principales.

• Hagan un esquema de la introducción. Hagan un esquema de la introducción.

Oración párrafo sección

Termino Oración párrafo