5044f3299865d Catlogo Bioarray Clinica 2012

' A '

B t O A R R A Y D i a g n s t i c o G e n b t i c o

1 . Microarrays CGH ..................................................... 2

1 . 1 . Cytoarray ........................................................... 2 1.2. Cytoarray Plus ................................................ 7 1.3. Cytoarray Prenatal ........................................... 14 1.4. DACrA ............................................................... 15 1.5. Microarray CGH 244K ................... ...... ........ 16

2 . Microarrays SNP ........................................................ 17

2.1. Sordera Sindrmica ............................................ 17 2.2. Sordera No Sindrrnica ................................ 19 2.3. Trombofilias ........................................................ 21 2.4. Craneosinostosis ............................................... 23 2.5. Displasias Oseas ........................ ... .............. 25 2.6. DPN Plus .......................................................... 27

3 . Secuenciacin ............................................................ 30

CYTOA RRAY

Es el microarray de hibridacin genmica comparativa de alta resolucin, diseado especificamente para gentica clinica y citogentica.

Detecta alteraciones en el nmero de copias de ADN, en pacientes con retraso mental idioptico, autismo y alteraciones congnitas. Permite definir si el paciente sufre una enfermedad o sndrome derivados de la presencia de de deleciones o amplificaciones en las regiones definidas (ver listado de sindromes que se adjunta).

de microdeleciones y microduplicaciones, superando asi a tcnicas como el FISH.

CYTOARRAY PERMITE DETECTAR

Aneuploidias.

Ms de 140 sindromes (una sonda cada 8 kb, 12 sondaslgen). 233 genes asociados con autismo, retraso mental, cardiopatias congnitas y enfermedades oculares.

Bandas subtelomricas (una sonda cada 75 kb).

Cytoarray, con sus ms de cuarenta y Endefinitiva una potente herramientadiagnstica cuatro mil sondas, ha sido especialmente que permite obtener mayor informacin que los desarrollado para dar cobertura a numerosos mtodos tradicionales para un diagnstico ms sindromes citogenticos y deteccin precisa preciso.

VFlA Haploinsufficiency jtickler syndrome 3trial fibrillation Thrombocyiopenia absent radius syndrome Short stature Van der Woude syndrome autism coverage 3iGeorge 2 Vebulette iirschsprung Disease Plus 10q22-23 deletion 10q22-23 deletion VI R jplthand foot malformation Schizencephaly Beckwith-Wiedemann long QT syndrome Beckwith-Wiedemann

2

Craniosynostosis Aniridia WAGR Syndrome probes Potocki-Shafler syndrome Potocki-Shafler syndrome Leukodystrophy Timothy syndrome Sticker 1 12q14 3 deletion Noonan 1 Retinoblastoma 13q21.32 del Protocadherin 9 brachydactyly brachydactyly Holopresencaphyl5 14q12 deletion Oligodontia Angelman 1 Prader Willi Angelman 1 Prader Willi Angelman 1 Prader Willi MR autism Oculocutaneous albinism 2 MARFAN SYNDROME Congenital diaphragmatic hernia Congenital diaphragmatic hernia IGF-1 resistance Mental retardation ascociated with Alpha thalaessamia TUBEROUS SCLEROSIS polycystic kidney disease RUBINSTEIN-TAYBI SYNDROME 16p13 2 del Gitleman retardation (XLMR) ~ i l l e r -~ ieke r Miller-Dieker Cystinosis Charcot-Marie Tooth Disease Smith-Magenis Neurofibromatosis 1 RENALCYSTS AND DIABETES SYNDROME

11 p15.1-p15.2 11~13-p14

l lp13 l l p l l l l p l l l lq13 12~13 12q13 12q14 12q24 13q14 13q2 1 13q3 1 13q3 1 13q32 14q12 14q13 15qll 15qll 15qll 15qll 15q12 15q13 15q21 15q26 15q26 15q25 16~13 16~13 16~13 16~13 16q13 16pll 17p13 17p13 17~13 17pll 17pll 17qll 17q12

Osteogenesis imperfecta Campomelic dysplasia Holopresencaphly 4 Dyggve-melchior~claussen disease PiU Hopkins CHROMOSOME 18q DELETION SYNDROME Feingold Pseudovaginal perineoscrotal hypospadias Holopresencaphly 2 autism 2p15p16.1 microdeletion Nephronophthsis 1 Holoprosencephaly 9 Mowat-Wilson syndrome autism Splithand foot malformation -5 Splithand foot malformation -5 Synpolydactyly Synpolydactyly Cleit pallet Waardenburg syndrome I 2q37 Alagille Syndrome Brachydactyl type C DOWN SYNDROME CRlTlCAL REGION Holoprosencephaly 1 diGeorge 1 diGeorge 1 autism autism spectrum disorder Loeys-Dietz syndrome MR Waardenburg syndrome IIA Blepharophimosis Dandy Walker Dandy Walker Microphtihalmia Optic Atrophy Wolf-Hirschhorn

Wolf-Hirschhorn Wolf-Hirschhorn cleft lip Rieger ornelia de Lange Gardner deafness Craniosynostosis SOTOS CHROMOSOME 6pter.p24 DELE-1-ION SYNDROME VEGFA disorders Cleidocranial dysplasia obesity severe Saethre-Chotzen GRElG CEPHALOPOLYSYN DACTYLY SYNDROME Williams-Beuren Williams-Beuren Williams-Beuren Ehlers - Danlos Splithand foot Verbal dyspraxia autism Holoprosencephaly 3 diGeorge CHARGE syndrome Branchio-Oto-Renal Syndrome Manic depressive psychosis Trischororhinophlange al Langer-Giedion Syndrome probes HOLOPROSENCEPH ALY 7 9q22 32-q22.33 1 Loeys-Dietz XY sex reversal Nail-Patella Syndrome Tuberous sclerosis 9q34.3 syndrome PAR1 SHOX Steroid sulfatase Kallmann

XLMR Orofaciodigital 1 Nance-Horan X linked spasrns X linked juvenille retinoschisis PLMR XLMR Adrenal hypoplasiacongenita Glycerol Kinase deficiency Muscular dystrophy Ornithine transcarbamylase deficiency Xp11.3 deletion X-linked Corneia de Lange syndrome Mental retardation X-linked syndromic Androgen insensitivity syndrorne MENTAL RETARDATION XmLINKED WlTH CEREBELLAR HYPOPL AND DlSTlNCTlVE FACIALAPPEARANCE Ectodermal dysplasia XIST deficiency ALPHATHALASSEMIANENTA L RETARDATION SYNDROME Menkes disease X linked agammaglobulinemia PELIZAEUS-MERZBACHER DISEASE Alpori syndrome (X) MR LYMPHOPROI-IFERATI VE SYNDROME X-LINKED 2 LYMPHOPROLIFERATI VE SYNDROME X-LINKED 1 Lesch-Nyhan syndrome X linked heterotaxy Mental retardation X linked Xq27.1 dup and del Fragile X (FMR1 and FMR2 deletion) Hunter syndrome Mucopolysaccharidosi S type II R ett S INCONTINENTIA PlGMENTl Hernophila PAR2 SRY deletion AZFa

Mas de 140 sindromes, una prueba cada 8kb por gen. 12 pruebas por gen Bandas Subtelomricas, una prueba cada 75kb Autismo/Cardiopatiacc congnitadRetraso MentalIEnfermedades del ojo. 233 genes, una prueba cada 8Kb, 12 pruebas por gen

CYTOARRAY PLUS CYTOARRAY PERMITE DETECTAR

Es el microarray de hibridacin genmica comparativa de alta resolucin, diseado especficamente para gentica clnica y citogentica.

Detecta alteraciones en el nmero de copias de ADN, en pacientes con retraso mental idioptico, autismo y alteraciones congnitas. Permite definir si el paciente sufre una enfermedad o sndrome derivados de la presencia de de deleciones o amplificaciones en las regiones definidas (ver listado de sndromes que se adjunta). Cytoarray Plus, con sus ms de cien mil sondas, ha sido especialmente desarrollado para dar cobertura a numerosos sndromes citogenticos y deteccin precisa de microdeleciones y microduplicaciones, superando as a tcnicas como el FISH.

Aneuploidias.

Ms de 200 sndromes (una sonda cada 3 kb, 33 sondaslgen). 410 genes asociados con autismo, retraso mental, cardiopatas congnitas y enfermedades oculares.

Bandas subtelomricas (una sonda cada 40 kb).

En definitiva una potente herramientadiagnstica que permite obtener mayor informacin que los mtodos tradicionales para un diagnstico ms preciso.

1 p36 Microdeletion 2q32.2 Micordeletion 2q37.3 Monosomy 3q29 Microdeletion 6p25.3 Microdeletion 8p23.1 Microdeletion 8p23.1 Microdeuplication 9~122.321122 33 1 Loeys-Dietz Microdeletion 9q34.3 Microdeletion 9q34.3 Microdeletion (severe) 10q22-23 Microdeletion l lq14 Microdeletion 11423 Jacobsen Deletion Syndrme 13q14 Deletion 14q22 Microdeletion 15q 13 3 Microdeletion 15q 15.3 lnfertility and Deafness 15424 Microdeletion 16p11.2 Deletion 16~11.2-p12.2 Microdeletion 16p13.1 Microdeletion predisposition to Autism 17q21.31 Microdeletion 17q21.31 Microduplication 22q11.2 Microduplication 22q13 Microdeletion (Phelan McDermid syndrome) Abnormal growth Adrenal hypoplasia congenita Adult-onset autosomal dominant leukodystrophy Alagille Syndrome Albright hereditary osteodystrophy Alpha thalassemia mental retardation Alport syndrome (X) Angelman Aniridia Atrial septal defect (ASD) with atrioventrcular conduction defects Autism genes AZFa AZFb (azoospermia factor b) AZFb + AZFc

Bariter 2 Bariter 3 Bariter 4 Beckwith-Wiedemann Bilateral frontoparietal polymicrogyria Blepharophismosis Branchio-Oto-Renal Syndrome CADASIL Campomelic dyplasia Canavan

Cerebral Carvernous Malformations (CCM) Cerebral Carvernous Malformations (CCM) Cerebral Carvernous Malformations (CCM) Charcot-Marie Toolh Disease CHARGE syndrome Cleidocranial dysplasia Congenital adrenal hyperplasia (CAH) Congenital diaphragmatic hernia Congental heart disease genes Cornelia de Lange Cowden Craniosynostosis SOX6 Craniosynoctosis type2 Cri-du-Chat Currarino Cystic Fibrosis Cystinosis Cystinuria with mitochondrial disease Cystinuria Dandy-Walker Syndrome DCX-Associated Lissencephaly/Subcurtical Band Helerotopia Deafness- Dystonis-Optic Neuronopathy DiGeorge l VCF DiGeorge Duplication DiGeorge 2 DMD Dopa resistant dystonia 1 Parkinsons Down Syndrome Critica1 Region Emery-Dreifuss muscular dystrophy

Eye disorder genes tanconi Anemia teingold FLNA-Related Disorders FMRl Microdeletion FMR2 Microdeletion tryns lq41 Gardner Glucose Transport defect Glycerol kinase Greig cephalopolysyndact)ly Hereditary hemorrhagic teangiectasia Hereditary non-polyposis colon cancer Hirschsprung Disease Plus HNPP Holoprosencephaly 1 Holoprosencephaly 2 Holoprosencephaly 3 Holoprosencephaly 4 Holoprosencephaly 5 Holoprosencephaly 7 Holoprosencephaly and preaxial polydactly Holt-Oram Hypocalcemia with Bamer Infantile hyperinulinism, enteropathy and deafness (Ushers disease) Joubert 5 Kallmann 1 Langer-Giedion Syndrome Lesch-Nyhan Syndrome LI-Fraumeni 1 Lssencephaly with cerebelar hypoplasia LMNA Lowe Maian 1 Maian 2 MECP2 1 Relts MENKES Mental retardat~on genes incl XLMR Mental retardation X linked Xq27.1 dup and del Microphthalmia with linear skin defects

Microphthalmia Miller-Dieker Muenke IAchondroplasia Muscle-Eye-Brain Disease Nail-Patella Nebulene Nephrolithiasis 1, X-linked, Den1 disease Nephronophthisis Neurofibromatoas 1 (NF1) NF1 Microduplication Neurofibromatosis 2 (NF2) NFlA Haploinsufficiency Noonan 1 Noonan 4 Norrie disease Obesity severe Okihiro Oligodontia opitz Opitz -Kaveggia syndrome Optic Atrophy Orofaciodigital 1 Osieopoikilosis OTC Pallistar-Killian Pelizaeus-Merzbacher disease Peters Plus Syndrome Peutz-Jeghers Syndrome Pin Hopkins Polycysiic kidney disease Potocki-Lupski Potocki-Shafler Prader-WiIIi Renal cysis and diabetes Retnoblastoma Rieger Rubinstein-Taybi Syndrome Saethre-Chotzen Schizencephaly

SCN1 A-related seizures Shorl stalure SHOX Smith-Lemli-Opitz Smith-Magenis Smith Magens Microduplication SOTOS Splithand foot Splithand foot malformation 3 Splithand foot malformation -5 SRY deletion Steroid sulfatase Stickler 1 STS Microduplication Synpolydactyly Thrombocyiopenia absent radius syndrome Townes Brocks Transient Neonatal diabetes Trischororhinophlangeal, Langer-Giedion Syndrome probes Tuberous sclerosis-1 Tuberous sclerosis-2 Ulnar-Mammary Van der Woude Syndrome VEGFA dicorders Verbal dyspraxia Von Hippel Lindau Waardenburg syndrome I Waardenburg syndrome 4 Waardenburg syndrome IIA WAGR Syndrome probes WalkerMlarburg Syndrome Williams-Beuren Williams Microduplication Wilsons disease Wolf-Hirschhorn X linked agammaglobulinemia X linked heterotaxy X linked juvenille relinoschisis X linked lymphoproliderative syndrome X linked spasmsl atypical Ren

Xp11.3 deletion Xp11.3 300578 XY sex reversal 9C133.3 184757

All Aneuploidies All Subtelomeres 200 + Syndromes*, Probe every 3Kb within gene, 33 probes per gene Subtelomeres probe every 40Kb Recornbination hotspots, Probe every 40Kb Autismmeart Disease/MR/Eye*. 41 0 genes, Probe every 3Kb, 33 probes per gene Genome backbone, Probe every 40Kb *Average figures for gene regions including 5Kb o1 flanking region

II

CYTOARRAY. DIAGNSTICO PRENATAL

Es un microarray desarrollado para el diagnstico prenatal que permite detectar 140 sndromes asociados a 233 genes. Cytoarray, con sus ms de cuarenta y cuatro mil sondas, ha sido especialmente desarrollado para dar cobertura a numerosos sindromes citogenticos y deteccin precisa de microdeleciones y microduplicaciones, superando as a tcnicas como el FISH.

Cariotipos con anomalas que requieren aclaracin Stillbirthlfetal loss or therapeutic termination En los casos de sospecha ecogrfica de fetos polimalformados Gestaciones previas con muerte fetal de causa no establecida o prdida recurrente de la gestacin (Dos o ms abortos espontneos) Ansiedad materna. Antecedentes de enfermedades genticas en hijos previos como; Sndrome de Down, Sndrome de Edwars, Malformaciones congnitas (Defectos del tubo neural, Hidrocefalia), Metablicas (Muerte neonatal temprana, Errores innatos del metabolismo), Hematolgicas (Anemias, hemopatas), Neurolgicas (Retardo mental, X frgil), Malformaciones mltiples (Sndromes genticos, genitales ambiguo)

IJEJEQ@N DE ANOMAL~S CROMOSMICAS EN RESTOS ABORTWOS (DA6R&) Aproximadamente el 15% de los embarazos acaban en aborto espontneo. En el 1% de las parejas, adems, estos abortos se producen de manera recurrente, es decir, se producen tres o ms prdidas consecutivas antes de los 24 meses. La causa de los abortos de repeticin puede ser variada (edad, patologa uterina, trombofilia hereditaria e incluso factores nutricionales y ambientales). Sin embargo, los factores genticos parecen jugar el papel ms importante. En muchas ocasiones, alguno de los miembros de la pareja tiene una anomala cromosmica, siendo las traslocaciones recprocas una de las ms frecuentes. Los portadores de traslocaciones recprocas no presentan un fenotipo particular, pero las parejas sufren de abortos espontneos porque producen un gran nmero de garnetos con traslocaciones no balanceadas.

Es muy comn que los estudios citogenticos de abortos de repeticin se realicen mediante cariotipo ylo FISH. Sin embargo, ambas tcnicas tienen diferentes limitaciones (requiere cultivo de clulas, crecimiento selectivo de clulas maternas, especificada de la prueba, etc.). El array DACrA ha sido especficamente diseado para identificar alteraciones de nmero de copia en abortos, multiplicando por 10 la resolucin del cariotipo y evitando la necesidad de cultivar clulas.

Abortos de repeticin de causa desconocida. Diagnstico gentico en abortos Consejo gentico en parejas con embarazos interrumpidos.

Poco material de partida Mayor resolucin No es necesario cultivar clulas Rpidez en el diagnstico

Decisin teraputica. Deteccin de aneuplodas.

t3J-

Perrin, A et al Fertil Steril 2010,93 2075 e3-6 Ralacan-Separovic, E et al Mol Hum Reprod 2010, 16 125-34 Dria, S et al Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol 2009, 147 144-50

La utilizacin de los arrays de CGH para la deteccin de ganancias o prdidas de material genmico es el mtodo recomendado para el diagnstico gentico en pacientes con retraso mental idioptico, autismo y10 sndromes polimalformativos as como para identificar o descartar la presencia de alteraciones genmicas que nos permitan realizar un Cariotipo Molecular que asegure un diagnstico clnico preciso.

El microarray 244k ( o 244.000 sondas de oligonucletidos) que cubren el genoma completo esta recomendado su uso en pacientes con:

Casos de oacientes con carioli~o alterado:

En pacientes con translocaciones aparentemente balanceadas con un fenotipo clnico anormal. El array-CGH puede detectar deleciones o duplicaciones crpticas en esas regiones. En presencia de duplicaciones o deleciones en el cariotipo para determinar los limites de las regin alterada. Cuando se identifiquen cromosornas marcadores, para determinar su origen.

Cariotipo normal y cuadro cllnico:

Retraso mental o del desarrollo no explicado Anomalas congnitas o rasgos dismrficos. Desordenes autistas o presentaciones clinicas que sugieran un sndrome cromosmico concreto.

MICROARRAY SORDERA CONGENITA SlNDROMlCA

Este microarray se ha desarrollado de forma que permita identificar las mutaciones ya descritas para los genes asociados a sordera congnita no sindrmica, utilizando la tecnologa innovadora de los microarrays.

Recin nacidos con sordera identificada en el programa de Cribado Auditivo Neonatal Universal. Estudio gentico molecular de la sordera congnita autosmica dominante en cualquier edad. Consejo genetico e identificacin de las opciones reproductivas en familias con individuos afectados.

- Diagnstico diferencial para ambas formas - sindrmica y no sinfrmica - de sordera congnita. Apoyo en la decisin teraputica (otociruga, implante coclear) y plan de rehabilitacin

El trmino sordera congnita se aplica siempre quesedetecteoseconcluyaindependientemente de la edad, que la sordera est presente desde el nacimiento del individuo, pudiendo ser de origen gentico o debida a otros factores (infecciosos, ambientales, teratgenos). La sordera congnita es el defecto de nacimiento ms comn, siendo tambin la patologa neurosensorial ms prevalente en los paises desarrollados (Hilgert et al., 2008). Se estima que 1 de cada 500 recin-nacidos padece sordera neurosensorial bilateral permanente 2 40dB, en la adolescencia la prevalencia aumenta para 1 :300 (Morton y Nance 2006). Se considera que ms del 50% de los casos de sordera congnita se deben a factores genticos El modo de transmisin hereditaria de sordera puede ser autosmico dominante (AD), autosmico recesivo (AR), ligado al cromosoma X o tambin debido a mutaciones en el genoma mitocondrial. El consejo gentico y la evaluacin del riesgo de recurrencia dependen, por lo tanto, de un diagnstico gentico cuidadoso

auditiva

Transmisibn hereditaria en la sordera aing8nita (in Genereviews)

Este microarray est constituido por un panel de 192 mutaciones puntuales, identificadas en los 14 genes principales asociados a sordera congnita sindrmica

LISTADO DE S/NDROMES

Sndrome de Walfrm

y QT largo 50% de los individuos afectados tienen manifestaciones cardacas antes de los 3 aos

MICROARRAY SORDERA CONGENITA NO SINDRMICA Este microarray se ha desarrollado de forma que permita identificar las mutaciones ya descritas para los genes asociados a sordera congnita no sindrmica, utilizando la tecnologa innovadora de los microarrays.

Recin nacidos con sordera identificada en el programa de Cribado Auditivo Neonatal Universal. Diagnstico gentico de sordera no sindrmica en cualquier edad; Consejo gentico e identificacin de las opciones reproductivas en familias con individuos afectados;

Diagnstico diferencial para ambas formas - sindrmica y no sindrbmica - de sordera congnita; Apoyo en la decisin teraputica (otociruga, implante coclear) y plan de rehabilitacin auditiva

El trmino sordera congnita se aplica siempre quesedetecteoseconcluya independientemente de la edad, que la sordera est presentedesde el nacimiento del individuo, pudiendo ser de origen gentico o debida a otros factores (infecciosos, ambientales, teratgenos). La sordera congnita es el defecto de nacimiento ms comn, siendo tambin la patologa neurosensorial ms prevalente en los pases desarrollados (Hilgert et al., 2008). Se estima que 1 de cada 500 recin-nacidos padece sordera neurosensorial bilateral permanente 2 40dB; en la adolescencia la prevalencia aumenta para 1 :300 (Morton y Nance 2006).

Se considera que ms del 50% de los casos de sordera congnita se deben a factores genticos. El modo de transmisin hereditariade sordera puede ser autosmico dominante (AD), autosbmico recesivo (AR), ligado al cromosoma X o tambin debido a mutaciones en el genoma mitocondrial. El consejo gentico y la evaluacin del riesgo de recurrencia dependen, por lo tanto, de undiagnstico gentico cuidadoso

itosrnica recesiva --. m - .

4utosmica dominante Mitocondrial

182 y GJE -,

Otros gel u Transmisibn hereditaria en la sordera congbnita (in Genereviews) Este microarray est constituido por un panel de 144 mutaciones puntuales, identificadas en los 22 genes principales asociados a sordera congnita no sindrmica:

El conjunto de mutaciones seleccionadas permite identificar la base rnolecular de la mayora de las formas ms frecuentes y graves de sordera congnita no sindrmica, tales como: Sndrome de Usher, Sndrome de Pendred, Sndrome de Waardenburg, Sndrome de QT Largo.

NOTA IMPORTANTE

Este conjunto de mutaciones ha sido delinido con el obletivo de mejorar la capacidad de identificacin de la base molecular de las principales formas de sordera gentica congnita no sindrmica. Sin embargo, un resultado negativo no excluye la posibilidad de ser portador de una mutacin no incluida en este panel.

Esta contribucin diagnstica del array CGC no pretende ser una alternativa, pero si un valioso complemento al diagnstico clnico de sordera, pudiendo asociarse al Cribado Auditivo Neonatal Universal. El diagnstico precoz es esen- cial para el desarrollo cognitivo adecuado del nio con sordera congnita prelingual.

Los resultados de este test deben ser cuidadosamente interpretados y presentados a la parejalpacienteiiamiliar en el mbito de la Consulta de Diagnstico y Consejo Gentico, como medio de identificacin del riesgo de recurrencia y apoyo en gestaciones futuras.

La trombofilia es una predisposicin para padecer trombosis, debida a causas genticas, adquiridas o ambas. En cerca del 40% de los casos hay una causa hereditaria que, por s sola puede no desembocar en un cuadro tromboemblico Sin embargo, cuando hay otros factores de riesgo combinados, como una inmovilizacin prolongada, una intervencin quirrgica, un embarazo, el uso de anticonceptivos orales o una terapia hormonal sustitutiva, existe un efecto aditivo que puede desencadenar un proceso trombtico o tromboemblico.

Los cuadros ms frecuentes son la trombosis venosa de los miembros inferiores y la tromboembolia pulmonar, pudiendo, sin embargo, producirse trombosis en otras localizaciones como la vena porta, la vena central de la retina o las venas cerebrales. La trombofilia se ha asociado a abortos de repeticin, por trombosis de la microvasculatura uteroplacentaria e hipoperfusin, a infertilidad y a diversas complicaciones obsttricas como preeclampsia, desprendimiento prematura de placenta o escaso desarrollo intrauterino del feto. Cerca del 30% de esas complicaciones obsttricas son debidas a una trombofilia hereditaria.

En muchos casos, despus de un episodio trombtico (tromboflebitis,tromboembolia pulmonar) est indicada una terapia con anticoagulantes orales del grupo de los Dicumarnicos. Esta terapia requiere una monitorizacin rigurosa para obtener y mantener la dosis teraputica adecuada y prevenir reacciones adversas, existiendo

diversos factores a tener en cuenta como la edad, el peso, u otros. Existe tambin una componente gentica, a travs de variantes que condicionan la metabolizacin del frmaco

Una trombofilia puede producir alteraciones en la coagulacin, fibrinlisis, o una lesin del endotelio y, puede ser causada por variaciones genticas, que alteran o modulan el comportamiento de los factores participantes en las varias etapas del proceso hemosttico.

La participacin de factores de variabilidad de causagentica, incluso losque tienen un bajo peso individual, puede determinar comporlamientos distintos. En esa perspectiva, una caracterizacin ms amplia de factores genticos que intervienen en la modulacin del comportamiento y de las interacciones de los diferentes factores de coagulacin y fibrinlisis, puede caracterizar mejor muchas situaciones, con implicaciones en la prevencin y en la teraputica.

Utilizando la tecnologa de microarrays, el Array CGC consiste en un panel que permite detectar simultneamente 9 mutaciones descritas en las trombofilias hereditarias: Factor V Leiden, Factor II G20210A, MTHFR C677T, MTHFR A1298C, PAI 4G/5G, PAI -844A>G, ACE lnsl Del, Fibringeno beta 455G>A, Factor Xlll Va134Leu; y 3 mutaciones para la componente gentica de la respuesta individual a una terapia anticoagulante con dicumarnicos (warfarina): CYP2C9 y VKORCI.

m m

APLICACIONES

Enfermos con una historia personal o familiar de trombosis y en familiares de enfermos con trombofilia hereditaria, principalmente'en situaciones que puedan ser dsencadenantes de un episodio trombtico como el uso de anticonceptivos orales, un embarazo, una intervencin quirrgica o una terapia hormonal substitutiva. Casos de abortos de repeticin

Complicaciones obsttricas como preeclampsia, desprendimiento prematuro de placenta o retraso de crecimiento intrauterino del feto. Evaluacin de una infertilidad. Mujeres con menos de 50 aos, fumadoras, con historia de infarto de rniocardio o accidente vascular cerebral. Nios con trombosis arteria1 Son debidas a una trombofilia hereditaria.

Con este panel se pretende mejorar la capacidad de identificacin de los principales factores genticos implicados en la trombofilia hereditaria en general y sus consecuencias obsttricas. Sin embargo, un resultado negativo, no excluye la posibilidad de que exista otra causa, no incluida en este panel. El estudio farmacogentico de la sensibilidad a los dicumarinicos (warfarina) no sustituye el control peribdico del laboratorio a travs del Tiempo de Protrombina y10 INR.

DIAGN~STICO MOLECULAR DE CRANEOSINOSTOSIS MEDIANTE ARRAYS

A continuacin se describen las ventajas de complementar los estudios clnicos (incluyendo el Diagnstico Prenatal) y radiolgicos con el estudio molecular de las Craneosinostosis ms frecuentes, utilizando la tecnologa de microarrays. Los textos han sido redactados por el equipo de CGC GeneticsICentro de Gentica Clnica en colaboracin con la Profesora Helosa G. Santos, genetista mdico y consultora clnica de CGC.

CRANEOSlNOSTOSlS

Se define como Craneosinostosis (CS) una situacin caracterizada por el cierre prematuro de una o ms suturas de los huesos del crneo, provocando alteraciones en la configuracin craneofacial. Eldesarrolloanmalode los huesos del crneo, al no acompaar adecuadamente a las restantes estructuras cerebrales, provoca frecuentemente retraso mental, retraso en el desarrollo y problemas de visin y audicin. Losdistintostiposde Craneosinostosis presentan una incidencia global en recin nacidos de 1 :2.000 - 1 :2.500 (French et al., 1990; Lajeunie et al., 1995). Aunque la mayora de los casos se diagnostican durante el periodo neonatal, muchos se detectan ms temprano a travs de ecografa, durante el periodo prenatal. Debido a la heterogeneidad de esta patologa, algunos portadores slo se

diagnostican durante la infancia o despus del nacimiento de un nio afectado.

La etiologa es variable, sabindose an muy poco sobre el papel de las interacciones gen- ambiente en su aparicin.

Puede constituir una anomala aislada o acompaarse de otras anomalas congnitas, estando incluida en ms de 100 sndromes genticos (OMIM, 2008). En estos sndromes, clnicamente heterogneos, existe muchas veces una superposicin de seales clnicas que hace su diagnstico preciso muy difcil.

Sin embargo, los ms frecuentes, como el Sindrome de Muenke, el Sindrome de Pfeifer, el Sndrome de Apert, el Sindrome de Crouzon, el Sndrome de Jackson-Weiss y el Sndromede Shaethre-Chotzen, corresponden a mutaciones especficas, identificadas y localizadas en los diferentes genes de los receptores para los factores de crecimiento de los fibroblastos 1, 2 y 3, lo que posibilita un diagnstico diferencial a travs de pruebas moleculares. El Sindrome de Carpenter, a pesar de tener muy escasa incidencia, tambin est incluido en el panel para aumentar las posibilidades de diagnstico diferencial de CS.

ARRAY CYE MF! A EL OIAflFYSftCW OF CRANEOSINOSTOSIS

La caracterizacin molecular de los genes asociados a formas sindrmicas de CS es importante pues permite hacer un diagnstico ms preciso, especialmente durante el periodo neonatal, ayudando a definir el tratamiento y su posible resultado (como la eficacia de una intervencin quirrgica craneana) y calcular el riesgo de recurrencia en la familia.

El panel de pruebas incluye 10 mutaciones puntuales en los 4 genes principales asociados a formas sindrmicas de CS: FGFRl (Pfeiffer), FGFR2 (Apert, Crouzon, Jackson-Weiss y Pfeiffer), FGFR3 (Muenke y Saethre- Chotzen) y RAB23 (Carpenter).

Con este panel de mutaciones es posible identificar la base molecular de las formas ms frecuentes y graves de los sndromes genticos de CS (Chun K. et al., 2003).

Diagnstico Prenatal, con hallazgos ecogrficos que sugiriera CS (forma aislada o sindrmica) o debido a riesgo aumentado de recurrencia.

Diagnstico diferencial de nacidos muertos

Diagnstico diferencial en recin-nacidos, adolescentes y adultos. Este Array se ha desarrollado para su aplicacin en varios tipos de muestras biolgicas. El ADN se puede obtener a partir de vellosidades corinicas, lquido amnitico, sangre o fibroblastos de biopsia fetal.

En diagnstico prenatal con muestras recogidas por tcnicas invasivas es necesario el envio simultneo de una muestra biolgica materna (clulas epiteliales de mucosa bucal, obtenidas por torunda o sangre perifrica) para excluir la posibilidad de contaminacin materna.

NOTA IMPORTANTE

Con este cribado se pretende mejorar la capacidad de identilicacin de las principales formas sindrmicas de Craneosinostosis. Sin embargo, un resultado negativo no excluye la posibilidad de ser portador de una mutacin no incluida en este panel.

Esta contribucin molecular no pretende ser una alternativa, pero si un valioso complemento a los examenes clnicos. Los resultados deben evaluarse cuidadosamente, debiendo aconsejarse al enfermo, pareja o familiares una Consulta de Diagnstico y Asesoramiento Genetico para evaluar con rigor el riesgo de repeticin y apoyo en gestaciones futuras

French LR, Jackson 1-r, MeltonLJ3rd. 1990.A population-based study of craniosynostosis. J Clin Epidemiol. 43(1):69-73. Lajeunie E, Le Merrer M, Bonaiti-Pellie C, Marchac D, Renier D. 1995. Genetic study of nonsyndromic corona1 craniosynostosis. Am J Med Genet. 55(4):500-4. Chun K, Teebi AS, Azimi C, Steele L, Ray PN. 2003. Screening of patients with craniosynostosis: Molecular Strategy. Am J. Med. Genet 120A: 470-473.

Rasmussen SA, Yazdy MM, Frias JL, Honein MA.2008. Priorities for Public Health Research on Craniosynostosis. Am J Med Genet Part A 146 A: 149-158.

A continuacin se describen las ventajas de complementar el Diagnstico Prenatal de las Displasias Esquelticas, en los casos en que los datos clnicos no permiten un diagnstico definitivo, con la realizacin de estudios moleculares utilizando la tecnologa de microarrays. Los textos han sido redactados por el equipo de CGC GeneticsICentro de Gentica Clnica en colaboracin con la Profesora Helosa G. Santos, genetista mdico y consultora clnica de CGC.

La Osteocondrodisplasia, tambin denom!nada por Displasia Esqueltica (DE) o Displasia Osea, est constituida por cerca de 350 enfermedades genticas del esqueleto. Su diagnstico es muchas veces muy difcil y su clasificacin est basada en las caractersticas del examen clnico, radiolgico, histopatolgico y molecular (Superti, Furga y Unger, 2007) Aunque raras, en su conjunto constituyen el 5% de las enfermedades genticas del periodo de recin nacido (Orioli et al., 1986) y son la causa de graves problemas, tanto a los familiares como a los enfermos, dada su morbilidad y elevada mortalidad que se puede manifestar desde el periodo prenatal

Frecuentemente, existe un importante riesgo de recurrencia en los hijos o en los hermanos de los casos identificados.

A pesar de ser enfermedades raras, las pruebas genticas pueden mejorar el diagnstico clnico, e influenciar, de forma determinante, un diagnstico diferencial ms precoz y preciso, particularmente durante el periodo prenatal.

Como es sabido, las DE pueden identificarse en el feto durante el 2OTrimestre y, con frecuencia, antes de las 20 semanas En la mayora de las situaciones, no existe historia familiar de DE y el diagnstico, basado esencialmente en las caractersticas ecogrficas del feto, es muy difcil, mantenindose desconocido en cerca del 60% de los casos (Krakow et al., 2008). Lamentablemente, tambin en las situaciones de muerte fetal, la realizacin de estudio radiolgico del esqueleto y estudios feto-patolgicos, tienen resultados lentos, muy onerosos, y, con frecuencia, tambin no concluyentes. Los diferentes estudios epidemiolgicos realizados en los ltimos aos, permitieron conocer las patologas ms prevalentes identificables en el feto, que son las siguientes: Displasia Tanatofrica, Osteognesis

Imperfecta (tipo recesivo), Acondrognesis Tipo IB e II, Displasia Campomlica y an, en algunos estudios, la Acondroplasia (Krakow et al., 2008; Orioli et al., 1986).

La caracterizacin molecular de los genes responsables de estas patologas esquelticas nos ir permitiendo aumentar la capacidad de diagnstico de las situaciones ms comunes diagnosticables durante el periodo prenatal.

El panel, especialmente desarrollado para el diagnstico de estas patologas ms frecuentes, est constituido por 26 mutaciones puntuales, presentes en 6 genes directamente implicados en estas DE: FGFR3 (Acondroplasia y Displasia Tanatofrica), COL2A1 (Acondrognesis tipo II), SLC26A2 (Acondrognesis tipo IB), CRTAP (Osteognesis Imperfecta, tipo recesivo), LEPREl (Osteognesis Imperfecta, tipo recesivo), y SOX9 (Displasia Campomlica).

DIAGNSTICO PRENATAL Witr+ (DPN Plus+) 1. DPN CONVENCIONAL

a Deteccin rpida de aneuploidas por QF- PCR en 24-48h.

b Cariotipo

2. DIAGN~STICO MOLECULAR DE TRASTORNOS METAB~LICOS POR ARRAY (94 MUTACIONES)

Enfermedades raras del metabolismo, incluyendo formas para las cuales existe tratamiento, que ser ms eficaz cuanto ms temprano sea implementado.

ACADM (MCAD) ARSA (Leucodistrofia Metacromatica) ATP7B (Enfermedad de Wilson) BTD (Deficiencia biotinidase) CLN2 (Enfermedad de Jansky-Bielschovsky) CLN5 (Lipofuscinosis Ceroide Neuronal-5) CLN8 (Lipofuscinosis Ceroide Neuronal-8) CPT2 (Deficiencia en CPT II) FAH (Tirosinemia) G6PC (GSD II) GAA (Enfermedad de Pompe o GSD II) GALC (Enfermedad de Krabbe) GALT (Galactosemia) GBA (Enfermedad de Gaucher) HADHA (LCHAD)

HEXA (Enfermedad de Tay- Sachs) HGD (Alcaptunuria) MAN2BI (Enfermedad en Alfa-Monosidase) NPCllNPC2 (Enfermedad de Niemann-Pick tipo C) PEXlIPEX26 (Enfermedad de Zellwegger) PPTl (Lipofuscinosis Ceroide Neuronal-1) PYGM (Enfermedad de McArdle o GSD V) SLC37A4 (GSD 1) TPPl (Lipofuscinosis Ceroide Neuronal)

3. PANEL DE S~NDROMES ASOCIADOS A RETRASO MENTAL

Enfermedades que comprometen significativamente el desarrollo psicomotor del nio.

Sndrome de delecin 1 p36 Microdelecin 9q22.3 Sndrome DiGeorge (22ql l) Sndrome DiGeorge regin 2 (10~15) Microdelecion NF1 Sndrome de Langer-Giedion (8q) Sndrome de Miller-Dieker (17p) Microdelecin 2p16 Sndrome de delecin 15q24 Sindrome de Cri du Chat (5p15) Sndrome de Rubinstein-Taybi Sndrome de Smith-Magenis Sindrome de Sotos (5q35.3) Sndrome de WAGR Microdelecin 17q21

Microdelecin 3q29 Duplicacin Xq28 (MECP2) Sndrome de Williams Sndrome de Wolf-Hirschhorn (4~16.3) Sndrome de Prader-Willi JAngelman Sndrome de Phelan-McDermid (22q13) DIAGNSTICO PRENATAL (DPN

La principal indicacin para la aplicacin de DPN sigue siendo el riesgo para cromosomopatas. Sin embargo, entre el 2 y 3% de los recin nacidos son portadores de una anomala congnita mayor y en ms del 50% de los casos estn asociadas a factores genticos.

Actualizado en Juno 2009

DPR + Plus

Con una nica muestra de material fetal, las nuevas metodo-logias para DPN gentico, Dermiten. actualmente. oDtar Dor la realizacin

. , ,

de un maior nrnerode tests para enfermedades congnitas.

Con este abordaje es posible obtener ms informacin sobre el feto, una vez recogida la muestra. Esta secuencia permite una gestin temprana de las opciones de diagnstico en el acompaamiento Prenatal. Este abordaje se puede efectuar a las 12 semanas (biopsia de vellosidades corinicas) o a las 14115 semanas (lquido amnitico).

4 Deteccin rpida de aneuploidas por QF- PCR

4 Sndrome de X Frgil 4 Cariotipo 4 Fibrosis quistica 4 Diagnostico Molecular de Trastornos

Metablicos por Array CGC J Panel de Sndromes asociados a Retraso 4 Mental

Embarazadas con riesgo aumentado para cromosomopatas Embarazadas con historia familiar de retraso mental, pero sin diagnstico gentico preciso Otras

DPN plus+ est indicado en:

Grvidas com risco aumentado para cromossomopatias.

El ADN fetal se obtiene a partir de vellosidades corinicas o liquido arnnitico. Es necesario el envi simultaneo de una muestra biolgica materna (clulas epiteliales de la mucosa bucal obtenidas por torunda o sangre periferica) para excluir la ~osibilidad de contaminacin materna.

Con este abordaje se pretende mejorar la capacidad de respuesta del diagnstico prenatal. Un resultado negativo no excluye la existencia de otras enfermedades o mutaciones no incluidas en este panel. Esta contribucin tcnica no pretende ser una alternativa, pero un complemento al examen clnico.

En las situaciones de historia familiar de enfermedad gentica, con etiologa ya caracterizada se debe hacer el DPN especifico de la patologa en cuestin. Los resultados de este panel de estudio se debern evaluar y comunicar en el mbito de una Consulta de Gentica Mdica.

ENFERMEDAD I A I S-~etiltransferasa ) #610460 ' *187680 metabolismo de la 6-mercaptopurina JU

1 PCCA 1 . - "232000 4u

Acidemia Propinica #606054 PCCB 1

'232050

Aciduria Glutrica tipo 1 #231670 GCDH '60880 1 30

Acondrognesis tipo ll#200610 COL2A1 120140 45

FGFR3 Deteccin mutaciones p.Gly375Cys (c.l123G>T), "134934 p.Gly380Arg (c 1138G>A y c.1138GrC) mediante 15

Acondroplasia #100800 secuenciacin FGFR3 a -

JAGl 601920 Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones mediante MLPA 25

Alagille Tipo 1, sndrome #118450 JAGl 601920 Secuenciacin de los exones 2 , 4 , 6 , 9 , 17,23, y 24 15 JAGl 601920 Secuenciacin completa 25

Alagille Tipo2, sndrome #610205 NOTCH2 *600275 Secuenciacin completa 45

Albinismo Ocular tipo 1 #300500 GPR143 *~nnnnn Secuenciacin completa 30

1 Aloin smo Oc, oc~tneo tipo 1 U703100 1 TYR 635333 1 Sec~enc acii competa 1 15

1 OCA2 1 '611409 Deteccin de la delecin de 2,7Kb mediante PCR 20

Albinismo Oculocutneo tipo 2 #203200 OCA2

'611409 Secuenciacin completa 40

a t n ~ i i v ~ i uereccion muraciones ~ ~ I U J ~ L L Y S (ale10 ri-L) y 107400 p.Glu246Val (aelo PI-S) 15 Alfa-1 -Antitripsina 107400

SERPlNAl 107400 Secuenciacin completa 15

Alfa-Talasemia #141750 HBA 141 800 Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones '1 41 850 mediante MLPA 25

COL4A3 *120070 Secuenciacin completa 50

Alport, sndrome #203780 #lo4200 COL4A4 '120131 Secuenciacin completa 45

ENFERMEDAD GEN MODALIDAD

Alzheimer, enfermedad #lo4300

ndermann, sindrome #218000

neurisma artico torcico familiar 11 788 %607086 #132900

Angelman, sindrome #lo5830

Aniridia #lo6210

Apert, sindrome #101200

Ataxia de Friedreich #229300

Ataxia de Friedreich #160120

g:f:mi!a PWSlAS

PAX6 "607108

PAX6 "607108 FGFR2 *176943

FXN '606829 FXN "606829

KCNAl *17C1Cn

Deteccin deleciones y disoma uniparental mediante estudio de microsatlites

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones mediante MLPA

Secuencacin completa

Deteccin mutaciones p.Ser252Trp y p.Pro253Arg mediante secuenciacin

Deteccin expansin GAA mediante PCR y TP-PCR Secuenciacin completa

Secuenciacin completa

25

25

35

15

20 30

30


Ataxia Espinocerebelosa (Paneles SCA)

Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 1 #164400 Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 12 #604326 Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 17 #E071 36 Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 2 #183090

Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 3 #lo9150 Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 6 #183086 Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 7 #164500 Ataxia Espinocerebelosa (SCA) tipo 8 #E08768 Ataxia Telangiectasia #208900 Atrofia Dentato-Rubro-Plido-Luysiana #125370 Atrofia Espinobulbar de Kennedy #313200

Atrofia Muscular Espinal Proximal (SMA) #253300

Atrofia dptica Dominante Tipo 1 #165500

Atrofia ptica Dominante Tipo 3 #165300

Baja estatura dioptica ligada al X #300582

ATXNI "601556 ATXN2 '601517 ATXN3 '607047

CACNAl A *601011 ATXN7 '607640 ATXNl "601556

PPP2R2B '604325

TBp .600075

ATXN2 %O151 7

ATXN3 '607047

CACNAlA "601011 ATXN7 '607640

ATXNBOS '603680

ATM %O7585 ATNl

"607462

AR "313700

SMNl

*~~~~

'601627

OPA1 '605290 OPA3

'606580 SHOX

'312865 SHOX

'312865

Deteccin de las expansiones SCA1, SCA2, SCA3, SCA6 y SCA7 mediante PCR

Deteccin expansin CAG mediante PCR











Deteccin de alteraciones en los genes SMNl y SMN2





20

20

20

20

20

20

20

20

20

60

40

40

30

A Consultar

30

25

30

ENFERMEDAD MODALIDAD

Bardet-Bield, sndrome

Bartter, sindrome tipo 4A #602522

BCR-ABL (Cromosoma Philadelphia)

BSND '606412 t(9'22)

(q34;qll)

Beckwith-Wiedemann, sndrome #130650

Beta-Talasemia #604131

Brugada, sindrome #601144

CADASIL (Arteriopata Cerebral con lnfartos

Subcorticales y Leucoencefaiopata) #125310

Array de genotipado (308 mutaciones) Secuencacin completa

Cuantificacin del reordenamiento BCR-ABL t(9;22) (q34;qll) mediante PCR a tiempo real

40

15

15

(11~15) BWSISRS

(11~15) CDKNlC

(P57) HBB 141900

SCN5A *600163 NOTCH3 '600276 NOTCH3 '600276 NOTCH3 *600276

Cncer Colorrectal Hereditario No Polipsico (HNPCC) #609310 #120435 #276300

MLPA Estudio de metilacin de la regin genmica BWSISRS

(11~15) Secuencacin completa


Secuenciacin competa

Secuenciacin de los exones 3 y 4

Secuenciacin de los exones 5,6 y 11


23

50

30

15

35

15

15

30

MLH1 '120436 MSH2

'609309 MLH1

"1 20436 MSH2

*609309




25

35

35


ncer de Mama Familiar #604370 2555#613399

Carcnoma Medular deTirodes miliar #155240

Charwt-Marie-Tooth tipo 1 A #118220

ENFERMEDAD I GEN I MODALIDAD 1 DlAS Charwt-Marie-Tooth tipo 2E #607684 NEFL

'1 62280 Secuencacin competa 30

GDAPl Charwt-Marie-Tooth tipo 2K #&O7831 "606598 Secuenciacin completa 15 1 Charmt-Marie-Tooth tiuo 4D #601455 1 E!?! 1 Deteccin mutacin D Aral48Stu Lom\ mediante PCR 1 15 1

1 CHARGE, sindrome #214800 1 *608892 CHD7 I Secuencacin competa 1 75 1

Charwt-Marie-Tooth tipo 4E #605253

Charwt-Marie-Tooth tipo 4F #145900 Charwt-Marie-Tooth ligada al X #302800

Cistinuria #220100

PMP22 '601 097

MPZ '1 59440 EGR2

"129010 PRX '605725

GJBl *304040

Cinca, sndrome (Enfermedad infiamatoria muitisistmica infantil) #E07115






NLRP3'CIAS1 %O6416

SLC3A1 '104614

15

15

30

35

30

CoVn-Lowry, Sindrome #303600

Corea de Huntington #143100

Cornellia de Lange, sindrome (CDSL1) U122470


1 Secuenciacin comoeta 1 35 Secuenciacin completa

Craneosinostosis tipo 11 #604757

Crigler-Najjar, sndrome #218800

1 1 *134934 1 secuenciacin 1 l 3 1

35

30

H5KZ *300075

HTT *613004 NlPBL

%O8667 SMClA "300040

Crouzon con Acantosis Nigricans, Sndrome #612247

1 Crouzon. sindrome #123500 FGFR2 1 1 Secuencacin comoeta

MSX2 '123101 UGTl A l '1 91 740


Deteccion expansin CAG mediante PCR



FGFR3 '134934

40

20

50

40



30

30

FGFR3 1 Deteccin mutacin u.Pro250Ara mediante . - Deteccin de a mutacin p.Ala39lGlu 20

I ENFERMEDAD I GEN I MODALIDAD 1 DlAS

1 '604566 ALG6 1 Secuenciacin completa 1 35 1

l

Defecto Congnito de la Glicosilacin, sindrome #212065 #603147 #602579

Deficiencia de la dihidropirimdina deshidrogenasa (Toxicidad a 5-Fluorouracilo) #274270

PMM2 '601785

MPI "154550

Deficienciade Plasmingeno

DPY D "612779 DPY D

*612779

Dejerne-Sonas, sindrome #145900

1 Diabetes MODYB #600496 Secuenciacin completa 1 35 1

Perfil de transferrinas sricas por HPLC


Secuenciacin comoleta

PA1l s173360

Diabetes MODYl #125850

30

30

30

Deteccin de la mutacin c.l740+1G>A mediante secuenciacin


PMP22 *601097

MPZ 759440

15

40

Genotipado del polimorfismo 5GI4G en la regin S'UTR mediante PCR a tiemoo real

Diabetes MODY2 #125851 1 GCK *138079 1 Secuenciacin comoleta 1 20

HNF4 *600281

Discondrosteosis de Leri-Weil (LWD) #127300

~ a , ~, ( OHH '605423 1 Secuenc!ac!n c~mp!eta

15



Disgenesia Gonadal (mujer XY) isindrome de Swaver) #400045

15

15


SHOX '312865

AMELX '300391

SRY '480000 1 Deteccin de la presencia o ausencia mediante PCR 1 15 SRY "480000 1 Secuenciacin comoleta 1 30

1 Displasia Craneometafisaria #118600 1 '605145 ANKH 1 Secuenc~acin de los exones 9 y 10 1 30 1

35

Disomia Uniparental del cromosoma 14 #6081 49

Displasia Arritmognica del Ventriculo Derecho #609040 M07450 #610193 #600996

Displasia Cleidocraneal #119600


Secuenciacin completa Determinacin de la dotacin cromosmica XY mediante

PCR

25

30

15

"309550 PKP2

'602861 DSP "125647

DSG2 '1 25671 RYR2

"1 80902 RUNX2 *600211

estudio ;ie microsatlites




Secuenciacin de los 30 exones principales


25

40

40

45

30

ENFERMEDAD I GEN I MODALIDAD 1 DlAS I Displasia Ectodrmica Hidrtica #129500 (Conexina 30) %O441 GJB6 8 1 Secuenciacin completa

Displasia Epifisaria Mltiple tipo 1 #132400

'OMP 1 Secuenciacin del exn 8 al exn 19 1 35 1 1 '600310 COMP

'60031 0 MATN3 '602109

Displasia Epifisaria Mltiple tipo 4 #226900 Displasia Metafisaria sin hipotricosis #250460

COL9A1 120210


Secuenciacin del exn 2

35

15


COL9A2 '1 20260 COL9A3 '1 20270

Displasia reno hepato pancretica - . . . . . . .. - - - - . .

NPHP3 Secuenciacin comoeta 79

30

SLC26A2 '606718 RMRP

*157660

Displasia Tanatofrica tipo I y tipo II #187600 #187601

Secuenciacn de los exones 2,3,y 4

Secuenciacn de los exones 2,3,y 4

1 Distonia deTorsin #128100

30

30

Deteccin de las mutaciones p.Arg279Trp, c.-26 2T>C y p.Cys653Ser mediante secuenciacin


Distona Mioclnica #159900

30

30

Distonia Tipo 5 #128230

Distrofia facio-escpulo-humeral #158900

enfermedad de Steiner #160900

FGFR3 '134934

FGFR3 '134934

DYTl '605204 SGCE

"6041 49 SGCE

'604149 GCHl

'600225 GCHl

"600225 Regin

genmica D4Z4 DMPK

*605377

Deteccin mutaciones p Arg248Cys. p Ser249Cys. p.Gly370Cys, p.Ser371Cys, p.Tyr373Cys, p.Lys650Gln y 15

las del codn 807 mediante secuenciacin

Secuenciacion completa 35

Deteccin de la deecn GAG mediante PCR 25

Secuenciacin de los exones 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 y 9 30

Secuenciacin completa 35

Secuenciacin completa 30

Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones 25 mediante MLPA

Deteccin del reordenamiento D4Z4 mediante Southern 60 blot

Deteccin expansin CTG mediante PCR y TP-PCR 20


istrofia Muscular de Duchenne-Becker

a Lentis Aislada Autosomica

Ehlers-Danlos, sndrome Tipo III

ecuenciacion competa

Epidermlisis Bulosa Simple #131960

Epidermlisis Bulosa Simple con Distrofia Muscular #226670

I ENFERMEDAD I GEN I MODALIDAD I ALDH7A1 Deteccin de la mutacin p.Glu399Arg mediante 1

Epilepsia dependiente de piridoxina U2661 O0

'1 07323 ALDH7A1 '1 n 7 1 ~ 2

secuenciacin


15

35

1

Esclerosis Tuberosa #191100

Exostosis Mltiple M33700 #133701

TSCl '605284 TSC2

*191092 TSCl

'605284 TSC2

'1 91 092 EXTl

*608177 E XT2

"608210 EXTl

*6081 77 EXT2

'608210

1








Secuencacin competa

Factor II (Protrombina) 176930

Factor V (Leiden) #188055 Factor XII #234000

Fenilcetonuria #261600

Fibrosis Quistica #219700

Fiebre Familiar de Hibernia (Fiebre peridica, autosmica dominante) U142680

25

25

25

30

25

25

35

35

F2 176930

F5 "612309

F12 "610619 PAH *612349

CFTR '602421 CFiR

'602421 CFTR

"602421 CFlR

*602421

TNFRSFIA '191190

Deteccin del polimorfismo 20210G>A mediante PCR a tiempo real

Deteccin del polirnorfisrno p.Arg506Gln mediante PCR a tiempo real

Deteccin mutacin p.C46Tmediante PCR a tiempo real Secuenciacin completa

Deteccin de la mutacin p.Phe508del mediante PCR a tiempo real

Deteccin de todas las mutaciones con una frecuencia superior al 1% en la poblacin espaola


Deteccin del polimorfismo poli-T,asociado a infertilidad masculina


20

20

20 35

15

20

25

15

30

ENFERMEDAD I OEN I MODALIDAD ebre Mediterrnea Familiar #249100

Hipercolesterolemia Familiar #144010

42


continentia Pigmenti #308300

ubert, slndrome Tipo4 #609583

ecuenciacion competa

Hiperplasia Adrenal Congnita por Dficit de la 21-Hidraxilasa 201910

Hipocondroplasia #146000

CYP21 A2 201910 FGFR3 '134934

Deteccin mutaciones frecuentes mediante secuenciacin y MLPA

Deteccinmutacin p.Asn540Lys mediante secuenciacin

30

15

ENFERMEDAD I GEN 1 MODALIDAD 1 DIAS

1 1

rsen, sndrome #150250

pard, sindrome 151100

Liddle, enfermedad #177200

Linforna del manto

44

Mocardiopata Hipertrfica #115196 #115195#115210 #115197#192600 #608758#608751 +lo2540

MYBPC3 "600958 TNNT2 *191045 TNN13

+191044 TPM1

*191010 TNNC

'1 50330 MYL2

"1 50330 MYL3

"1 60790 ACTC



Mocardiopata no Compacta #115197 #192600#115200#606617#601493

Mocardiopata no Compacta (neonatalj #300183 #606617 #601493

1 Miotonia Congnita #255700


LMNA '1 50330

DTNA '601239

LDB3 '605906


*300394

'601239 Secuenciacin completa

'605906 CLCNl 1

. 3 4 a ~ 7 ~ Secuenciacin completa 1 35

(~u~opolisacaridosis Tipo IVaj #253000

Mucke-Wells, sndrome #191900

Muenke, sindrome #602&49

bHLl'4b '612222 Secuenciacin completa

NLRPBlClASl '60641 6 Secuenciacin completa

FGFR3 Deteccin mutacin p Pro250Arg mediante '1 34934 secuenciacin

Nail Patella, sndrome #161200 LMX1 B '602575 Secuenciacin completa 30

ENFERMEDAD GEN MODALIDAD DlAS

Obesidad Mrbida #601665

1

Osteogenesis Imperfecta #166200 #166210#166220#259420

Osteogenesis lmperfecta tipo llB #610854 Osteogenesis lmperfecta tipo Vlll #610915

Pancreatitis Hereditaria #167800

Paraganglioma Familiar #115310 #168000 #605373

V - V 1 . - ' V Y'L"""1I Y 1 Ic.0 I I U L C ( u I V I I 1 o p-l Y-.L"I a m o , y . - lyuLVVI) I ,

lML4K '1 55541

120150

E4L7 b;l;;gl PRSSl 276000

?:jgo SDHD '602690 SDHB

Familiar #170400

Parapleja Espstica Familiar 4 #182601

Parkinson 1, enfermedad #168601

Parkinson 2, enfermedad #600116

Parkinson 6, enfermedad #605909 Parkinson 7, enfermedad #606324



~ecuenciacin completa





Secuenciacin del exn 3




Y14208

SPG4 "604277

?i:&n

I

30

30

25

30

30

35

30

15

15

30

30

30 p Arg1239His y p Arg1239Gly mediante secuenciacin

PARK2 '602544 PARK2 +602544 PlNKl DJ1 '602533

Partington. sndrome #309510

Peters, anomala #604229

Parapleja Espstica Familiar 3A #182600



35

30

Deteccion de grandes deleciones y10 duplicaciones mediante MLPA


Secuenciacin completa Secuenciacin completa

ARX .300382

ARX '300382 PAXG "607108


40

35

30 30

35

Deteccin de la duplicacin c.428451dup mediante secuenciacin Secuenciacin completa


30

30

40

ENFERMEDAD I GEN I MODALIDAD Peutz Jeghers, sindrome #175200

Policitemia Vera #263300

Poliposis Adenomatosa Colorrectal Autosmica Recesiva #608456

STK11 Deteccin de grandes deleciones ylo duplicaciones 25 '60221 6 mediante MLPA STKll e602216 Secuenciacin completa 35

Estudio de la mutacin p Val617Phe mediante PCR a JAK2 147796 tiempo real

MYH .604933 Deteccin de las mutaciones p.Tyrl65Cys y p Gly382Asp mediante secuenciacin 30

MYH '604933 1 Secuenciacin completa 135 1

Poliposis Adenomatosa Familiar #175100

Poliquistosis Renal #173900

Poliquistosis Renal Autosmica Recesiva #263200

Porfra Aguda Intermitente #176000

Porfra Variegata #176200

Poner 1, sindrome #191830

Prader-Willi. sindrome #176270

Pseudohipoaldosteronismo #264350

Pseudohipoparatiroidismo #lo3580 #603233#612462 Pseudopseudohipoparatiroidisrno

APC .611731 uerecclon oe las muiacones pu in IUWLA y p Glul309AspfsX mediante secuenciacin 15

APC '611731 Secuenciacin completa 25 PKD1 601313 Secuenciacin completa 120 PKD2 .,,..,. Secuenciacin completa 60

!:E7 1 Secuenciacin de los exones 3, 36 y 58 115 1 T6F:2 Secuenciacin completa 50

~ecuenciacin completa 30

PPOX ,600923 Secuenciacin completa 30

!=.A7 1 ~ecuenciacin completa 150 I Regin genmica Estudio de metilacin de la regin genmica PWSIAS 20 PWSIAS Regin Deteccin deleciones y dsomia uniparental mediante ",","::y estudio de microsatlites E 1 ~ecuenciacin completa 35

1 Secuenciacin completa 135 f:!:,? 1 ~ecuenciacin completa 35 GNAS +139320 Secuenciacin completa 30

G.?A:,_ 1 ~ecuenciacin completa 130 I

I ENFERMEDAD I GEN I MODALIDAD I "IAS

Pseudoxantoma Elstico #177850

QT largo, sindrome #192500 #609620 #609622 #603830

Queratodermia Palmoplantar de Thost- Unna #600962

'

Raquitismo Hipofosiatmico ligado al cromosorna X #307800

Rendu-Osler, sndrome #600376

SCN5A 1 ,,,,,,, 1 Secuenciacin completa 1 45 SCN5A *600163 KCNQl 1 "607542 KCNH2 +152427 KCNEl +176261 KCNE2 +603796 KCNJ2 "600681 KRTl '1 39350


1 Secuenciacin completa 1 30 1 Secuenciacin compieta 1 30

PHEX ,300550 Secuenciacin completa 40

g;ii ~ecuenciacin completa 30 Reordenamientos subtelomricos Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones 45

mediante MLPA

RB1 180200 Deteccin de grandes deleciones y10 duplicaciones mediante MLPA 25 Retinoblastoma 180200

RB1 180200 Secuenciacin completa 25 RPGR .31261 Secuenciacin del exn 1 al exn 15 35 Retinosis Pigmentaria ligada al

cromosorna X (RP3) #300029 RPGR +312610 Secuenciacin del exn ORF15 30

ARX *300382 Deteccin de la duplicacin c.428451dup mediante Retraso mental ligado al cromosoma X secuenciacin 30 #300419 An" *.3,-,n.30.? c : - - :A- N-... 9"

ENFERMEDAD GEN MODALIDAD DlAS

Rett, sndrome ?Y312750

Rubinstein-Taybi, sndrome #180849

Russell-Silver, sindrome #180860

Shwachman-Diamond. sndrome #260400 Sndrome de Insensibilidad a Andrqenos #300068

i v t L r z +300005 Secuenciacin completa 30

MECPP I Deteccin de arandes deeciones VIO duulicaciones l -- '300005 CDKLS 300203 CREBBP %O01 40 CREBBP

mediante MLPA

Deteccin de arandes deeciones VIO duulicaciones . .

'600140 mediante MLPA 23 Chr 7 Deteccin deleciones y dsoma uniparental mediante

estudio de microsatlites 25

BWSISRS Estudio de metilacin de la reain aenmica BWSISRS - -

(11~15) (11~15) 3U SBDS "607444 Secuenciacin completa del ARN mensajero 30

AR '313700 1 Secuenciacin completa 1 3 0 I Sordera Hereditaria Materna #580000

Sordera Neurosencorial no sindrmica

Autosomica Recesiva #220290 #601071

Sotos, sindrome #117550

Stickler, sndrome Tipo 1 #108300

IVI I niun i uereccion muracion m. 1 3 3 3 ~ ~ meaianre '561 000 secuenciacin 15

GJB2 (Conexina 26) 1 Deteccin mutacin c.35delG mediante secuenciacin 1 20

(Conexina 26) Secuenciacin completa 30 '121011 OTO F Deteccin de las mutacones p Gln829Ter y '603681 p Pro1 825Ala mediante secuenciacin 15

NSDl Deteccin de grandes deeciones y10 duplicaciones '606681 mediante MLPA 25

NSDl Secuenciacin del exn 6 30

NSDl *606681 Secuenciacin completa 45

1 ~ecuenciacin completa lb5 I

ENFERMEDAD MODALIDAD t

Trombofilia, panel

MTHFR '607093 FII 176930 FV "612309 PAI 173360 MTHFR '607093 FII 176930 FV "612309

zz3 FII 176930 FV *612309

unicaria por rrio ramiiiar iipoi n izu iuu .60641 " ~ C U ~ I I ~ ~ I ~ C I U I I ~wrr~ l~ le la 35

NLRP12 Urticaria por frio familiar tipo2 #U1762 *609648 Secuenciacin completa 35

AMELX Determinacin de la dotacin cromosmica XY mediante 15 '300391 PCR

Varn XX, sindrome #400045 #400044 Deteccin de la presencia o ausencia mediante PCR 15 SRY *480000 Secuenciacin completa 30

Von Gierke, enfermedad (Glucogenosis G6PC +232200 Secuenciacin completa 30 Heptica) +232200 VHL .608537 Defeccin de grandes deleciones y10 duplicaciones

mediante MLPA 25 Von Hippel Lindau, sindrome #193300 Secuenciacin completa 30

Anlisis simultneo de FII (20210G>A), FV (p.Arg506Gln). MTHFR (c 677hT) y 5G14G en la regin 5 i UTR del gen PAI

Anlisis simultneo de FII (20210G>A), FV (p.Arg506GIn) y MTHFR (c.677C>T)

Anlisis simultneo de FII (20210G>A), FV (p.Arg506Gln). MTHFR (c.677hT) y MTHFR (C 1298AzC)

Van Willebrand, enfermedad 193400

Williams-Beuren (WBS), sndrome #194050

Wilson, enfermedad 277900

Wolf-Hirschhorn, sindrome #194190

X-Frgil (FRAXA) %O0624

20

20

20

52

VWF 193400

Chr7qll

ATP7B '606882

2:; yp"::; FMRl *309550


Deteccin de deleciones en la regin genmica 7q11.2 mediante MLPA Secuenciacin de los exones 6,8, 13, 14, 15, 16, 17 y 20


Estudio de la delecin 4p16.3 mediante MLPA

Estudio de la delecin 4p16 3 mediante CGHarray 60K

Deteccin expansin CGG mediante PCR y TP-PCR. si orocede

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A Consultar

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