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Total Digital Pathology

TOTAL DIGITAL PATHOLOGY

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Sumario: Patología Digital Definición

Beneficios

3 Pasos hacia la Patología Digital Total

Tecnologías de adquisición Tipos de sensores

Escaneado en campo claro

Escaneado en inmunofluorescencia

Escaneado en FISH

Tecnologías de gestión de información Servidor de información web

Integración de servicios

Tecnologías de análisis Visualización de preparaciones digitales

Conferencias con preparaciones digitales

Análisis de inmunohistoquímica

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¿Qué es la patología digital?

La Patología Digital es un avance importante en el diagnóstico histopatológico. Se basa en la

digitalización de la muestra histológica, el almacenamiento electrónico y finalmente el acceso

y/o análisis de información digital desde diferentes dispositivos electrónicos.

Microscopía clásica

Visualización del especimen,

Anotación de los hallazgos

Microscopía Digital

Visualización del especimen,

Documentación de los hallazgos

Patología Digital

Acceso a los datos y análisis

usando redes de comunicación

3


¿Cuáles son los beneficios de la patología digital?

- Preserva las preparaciones a lo largo del tiempo, ya que se convierten en imágenes digitales

conservadas en servidores seguros.

- Ofrece un entorno de trabajo confortable, las preparaciones se visualizan mediante

dispositivos electrónicos donde la información se guarda en servidores corporativos.

- Visualización y comparación de varias preparaciones simultáneamente, ya sea por el uso de

diferentes tinciones o para ver la evolución en el tiempo

- Compartir conocimiento gracias a herramientas de conferencia "online" a la vez que se

visualiza e imagen, ideal para formación o para segundas opiniones.

- Análisis de las imágenes con programas de tratamiento de imágenes

- Encuentra y visualiza preparaciones históricas de forma ágil y segura

Internet

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Escanear Gestionar Analizar

Tres pasos para la Patología Digital Total

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Escanear

SCN400 Capacidad estandar

SCN400+SL801 Alta capacidad

Ariol DM6000 FISH, Alta resolución

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Tipos de sensores

Los sensores lineales ofrecen una alta resolución, alto rango dinámico y gran

transferencia de datos, lo que los convierte en los sensores ideales para los dispositivos

de escaneado

Los sensores matriciales son las más extendidos, se usan en cámaras de vídeo,

fotografía y son fácilmente adaptables a múltiples aplicaciones. Necesitan de técnicas de

stitching para generar imagen de alta resolución

Los sensores Time Delay and Integration (TDI) son sensores lineales especialmente

diseñados para digitalización en movimiento y de baja intensidad de luz.

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Escaneado en campo claro

El escáner SCN400 equipa un sensor tri-lineal de alta resolución

Utiliza bandejas portapreparaciones de diferentes formatos (estándar, doble y jumbo) que protegen la preparación de daños accidentales

Sistema de enfoque patentado Dynamic Focus

Sistema óptico exclusivo

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Un corte de una muestra ideal ...

... produce la siguiente sección

Porta muestra (ca. 1000 µm)

Muestra (ca. 5µm)

Cubre objeto (170µm)

Dynamic Focus

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Pero una muestra real es más parecido a:

Dynamic Focus

Con un sólo nivel de enfoque, el contorno de muchas muestras no será nítido y puede que tampoco esté enfocado

Para preparaciones enteras o muestras no planas se necesitan métodos adicionales de enfoque

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SCN400 – Dynamic Focus Método único de enfoque dinámico, que automáticamente

ajusta la posición en vivo de la lente por toda la muestra mientras escanea

Añade ultra-alta velocidad, excelente calidad de imagen y realiza pilas en z

Elimina el preenfoque o el premapeo de la muestra

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SCN400 – Óptica Leica

En SCN tiene una lente especial y exclusiva diseñada por Leica

El sensor lineal captura gran cantidad de datos

El diseño es perfecto para el “ojo digital” del sensor.

La amplitud del campo, el método de enfoque y el área de imagen han sido maximizadas para mejorar la velocidad del escaneado

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SCN400 225 segundos en digitalizar una muestra de 15 mm por 15

mm incluyendo la carga y descarga a 40x

100 segundos si la magnificación es de 10x

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SCN400 + SL801 = alto rendimiento Posibilidad de cargar y descargar sin pérdida de

información

Flexibilidad de programar de 1 a 8 lotes

Actualizable in situ

Interactividad: previsualización de 48 preparaciones simultáneamente y cargar los ajustes necesarios

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SL801

El SL801 tiene 4 caras

Cada cara tiene 2 hoteles

Cada hotel tiene 12 bandejas

Cada bandeja tiene 4 preparaciones simples

En total 384 preparaciones

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El SL801 funciona de dos formas distintas Modo lote

Para escaneado en grandes cantidades, diseñado para escanear de 1 a 8 hoteles con los mismos ajustes e.g. x40 y determinación automática de área

Modo interactivo Ajustes individuales definido por el usuario para 48 preparaciones,

como ajuste manual de área y nivel de prioridad

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SL801- Programa “Modo lote” Ajustes simples, amigables

Hotel

Cara activa

Cola de escaneo

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SL801- “Modo interactivo” El usuario actua con la vista previa y gestiona el escaneo

de cada preparación

Modo interactivo

Cara activa

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Living up to Life

Ariol DM6000B

Sistema matricial

Campo Claro

Fluorescencia

Dual Imaging

Platina 4 preparaciones

Platina 8 preparaciones

FDA Cleared

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Living up to Life

Ariol DM6000 B

Captura en campo claro Pre-escaneado a 1,25x

Autodetección de áreas a escanear o

ajuste manual

Escaneado a 5x, 10x, 20x o 40x

Marcaje de áreas a analizar

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Escaneado en inmunofluorescencia

El escáner SCN400F equipa un sensor tri-lineal de alta resolución para campo claro y un TDI para fluorescencia

Utiliza bandejas portapreparaciones de diferentes formatos (estándar, doble y jumbo) que permiten usar diferentes tipos de porta preparaciones

Sistema de enfoque patentado Dynamic Focus

Sistema óptico exclusivo

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SCN400F – Enfoque automático El modo de enfoque en fluorescencia selecciona dos

puntos en el primer carril de escaneado. En los siguientes selecciona un sólo punto además de la información adyacente para calcular el enfoque

El enfoque se realiza en el canal primario, el resto de canales usan la información gracias a la calidad óptica del sistema

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SCN400F – Óptica Leica

En SCN400F tiene un sistema óptico especial y exclusivo diseñado por Leica

El sensor TDI adquiere gran cantidad de datos en situaciones de baja iluminación

El diseño es perfecto para el “ojo digital” del sensor.

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Living up to Life

Ariol DM6000 B

Captura en fluorescencia Pre-escaneado 5x con DAPI

Ajuste manual de áreas

Escaneado a 5x, 10x, 20x o 63x

Marcaje de áreas a analizar

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Living up to Life

Ariol ha evolucionado sofisticados métodos para

asegurar la mejor calidad de imagen de fluorescencia

Multi-exposiciones y mezcla en un solo escaneado Permite que toda la información se adquiera en una sola pasada

Auto-exposición Diversas opciones para escanear automáticamente preparaciones de

flurorescencia sin preajustes o exposiciones

Autoexposición a través de la máscara DAPI (funciona con imágenes de alto

background autofluorescente)

Z-stack y mezclado Éxiste una manejo exclusivo para preparaciones con TMAs

Número de planos y espaciado definido por el usuario

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Living up to Life

Multiexposición y mezclado

Un solo tiempo de exposición hubiese escondido información vital

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Living up to Life

Autoexposición

Los algoritmos de autoexposición de Ariol visualizan toda la información necesaria

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Gestión:

DIH Gestión, acceso, visión

OpTMA Investigación en

biomarcadores

DSB Educación

Integración Clínica

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Gestión

Necesidades Segundas opiniones

Integración con LIMS

Discusión remota de varias

preparaciones

Seguridad en el sistema

Velocidad de acceso a las

preparaciones virtuales

Respuesta de Leica Digital Image Hub

Integración con LIMS

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Gestión

Seguridad Integración con sistemas LDAP

Desarrollo sobre HTTP o HTTPS

Visión de preparaciones

Mínimo tiempo desde escaneado hasta visión

Vista de varias preparaciones seriadas = características en contexto

Segunda opinión instantánea "online"

Flexibilidad Gestión de casos

Integración con sistemas de gestión LIMS

Visión de otros formatos DICOM (xray, CT, MRI)

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¿Qué es Digital Image Hub?

Una solución software avanzada y flexible

para el archivo, gestión, distribución y

visualización de preparaciones virtuales.

Componente central del concepto Total Digital

Pathology

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Digital Image Hub

Accesible por la Web

Flexible y escalable

Capacidad de integración

Soporte de múltiples formatos

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Accesible por la web

Acceso instantáneo usando un navegador Compatible con Windows, Apple, Linux

A cualquier hora, en cualquier sitio

Requiere Adobe Flash Player 10

Instalado en servidor web Un solo punto de instalación

No requiere instalación en PC de usuario

Instalable en servidores virtuales o físicos

Colaboración Colaboración sencilla con usuarios externos

Rápida segunda opinión

33

Total Digital Pathology 34


Vista

miniatura

Rotación y

Aumentos

Barra de

escala

Metadatos

Anotaciones

Controles

36


Information

on/off

Escala

on/off

Vista

previa

on/off

Ajustes de

visualización

Fotografía Anotaciones Análisis de

imagen

Nombre

Imagen

Aumentos /

Objetivo

Aumentos

visualizados

Aumentos (4,10,20,40 /

intermedios)

Giro vertical, Vista general, Giro

horizontal

Rotación

de imagen

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Flexibilidad y facilidad de uso

Estructura personalizable Creación de carpetas y datos anidados

Metadatos, diccionarios, atributos, código

Mover archivos y carpetas

Flujo de trabajo Mis casos, 1ª y 2ª revisión (definible)

Búsquedas flexibles

Administración Control de acceso de usuarios – imagenes, carpetas, acciones

Carga de diccionarios en formato TXT

Creación de usuarios / carpetas / estructura sin requerir de personal de IT

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Escalable

Sistema Plugins, OpTMA, Conf, Tissue IA

Control del HW adicional sin coste

Interfaz con terceras compañías

Almacenamiento

Soporta múltiples volumenes

En disco, SAN/NAS, almacenamiento en red

Usuarios Creación de nuevos usuarios / administradores

Sin límite de usuarios

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SCN400

Digital Image Hub

(on disk storage)

Internet

Escenario básico

40


SCN400

+SL801

Digital Image

Hub

Internet

SAN

LIMS

Ariol DM6000

Conferencias

Tissue IA (+ Her2)

Escenario corporativo

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Capacidad de integración

Comunicación XML, SOAP, HL7, webservices

Integración con LIMS Transferencia de datos con otros sistemas

Creación de casos desde LIMS

Transferencia de información bidireccional

Integración personalizable

42


Soporte multi-formato

Soporte en formato nativo Las imágenes no se cambian a formato “Leica”

Aprovecha el HW existente Usuarios de otros escáneres también se pueden

aprovechar de la solución Leica de Patología Digital sin

perder ninguna imagen o dato

Librería de imágenes centralizada Lee formatos de imagen de máquinas de rayos X,

microscopios confocales, microscopios electrónicos,

etc...

• Aperio SVS

• Ariol

• Bacus Bliss

• DICOM (frame based, radiology,

CT, xray, MRI)

• Hamamatsu NDPI and VMS

• Leica .SCN

• Nikon VSL

• Olympus web image format

• Zeiss Mirax

• JPEG

• Tiff

• BMP

• ZVI

• LAS Power mosaik TIFF Export

• Olympus TIFF + BTF export

(limited support)

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Soluciones de análisis flexibles

Conferencia

Discusión de casos Gateway

Análisis IHQ y iPAD

Ariol Review

Clinica, FISH, ImmunoFL

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Módulos de análisis Ariol

Módulo de inmunohistoquímica

•Nuclear, citoplasmática y membrama

Módulo de fluorescencia

•Immunofluorescencia, FISH (celular y tisular)

Módulo de eventos extraños

•Células tumorales circulantes

•Micrometástasis

Módulo de medidas

•Pliodía de ADN

•Densidad microvascular

•Medidas generales de tejido

45


Clasificador entrenable

46

Total Digital Pathology * 47

IHQ: marcadores nucleares

Núcleos

positivos

(marrón)

Imagen: Receptores de

progesterona en cáncer de mama

Análisis: contaje automático de

+ve:-ve

Núcleos

negativos

(negro)

Informe:

47


IHQ: membrana

Imagen: cáncer de mama teñido

para Her2/neu

Análisis: Cada color muestra la intensidad de la tinción

2+ (naranja)

1+ (amarillo)

Membrana (marrón)

Codificación de color según guías clínicas

Informe:

48


IHQ: citoplasma

Análisis: capas de tinción citoplasmástica. Imagen: cáncer de mama

teñido para stathmin

Núcleo Negativo (verde)

Nucleo Positivo (rojo)

Positividad citoplasma

La deconvolución de color determina si la

contratinción del núcleo está bajo la tinción

positiva citoplasmática Informe:

49


Fluorescencia: FISH celular, leucemia

Imagen: vista previa de leucemia

teñida con TEL/AML1

Análisis:

Fusion (TEL/AMl1)

Nº de

fusiones

Nº señales

verdes

Nº

señales

rojas

12p13 (TEL)

21q13 (AML1)

Informe:

50


Fluorescencia: FISH tisular, Cáncer de Mama

Análisis: contaje automático de señales

1. Las cajas verdes y las naranjas se cuentan

independientemente

2. Calcula el número de pruebas en un cluster

amplificado donde las cajas se agrupan

basándose en tamaño medio

Imagen: cáncer de mama teñido para

Her2/neu usando FISH

Informe:

51


Eventos extraños:

Análisis: identificación de citokeratina Imagen: citoespina de médula ósea

Informe:

52


Medidas generales:

Imagen: tejido teñido con H&E Análisis: 4 diferente colores para medir las

diferentes partes del tejido

Nucleo

(azul)

Citoplasma

(naranja)

Espacio vacío

(verde)

Tejido circundante

(amarillo) Informe:

53


Slidepath Gateway:

Acceso flexible via PC o iPAD

La versión de iPAD da acceso de sólo lectura al contenido del Digital Image Hub

La versión PC es una solución de alto rendimiento para la visualización local de

imágenes o con conexión al servidor Digital Image Hub

La versión PC, opcionalmente puede incorporar análisis de imagen validados para el

diagnóstico clínico (CE) y creación y gestión de informes de informes

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SCN400/SL801 Alto rendimiento

Ariol DM6000

FISH, ImmunoFL

DIH Gestión, acceso y

visualización

Conectividad Integración LIMS

DSB Educación


Ariol Review Clinical, FISH, ImmunoFL

Tissue IA BF Research

Conferencing Multi-manual discussion

SCN Viewer Free Client Viewer

Adquisición

Gestión

Análisis

SCN400 Bajo rendimiento

Gateway Visualización

móvil 55


? http://www.leica-microsystems.com/products/digital-pathology/

TOTAL DIGITAL PATHOLOGY

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