Dr. B. Ashokkumar M. Sc., Ph.D Assistant Professor...

22
Educational Qualifications : M. Sc., Ph.D Professional Experience : 23 FIELD OF SPECIALIZATION Molecular Genetics and Genomics Genetic Engineering RESEARCH SPECIALIZATION Congenital disorders associated with nutrient metabolism Microbial bioremediation of xenobiotics Probiotics to alleviate diabetes and hypertension C. elegans as an animal model for vitamin transport physiology Research Supervision: Program Completed Ongoing Ph.D Five Five M.Phil Seven One Dr. B. ASHOKKUMAR Assistant Professor Department of Genetic Engineering School of Biotechnology Mobile No: 9976147644 Email:[email protected]/ [email protected]

Transcript of Dr. B. Ashokkumar M. Sc., Ph.D Assistant Professor...

 

     Educational Qualifications                 : M. Sc., Ph.D 

Professional Experience : 23 

 

 

           FIELD OF SPECIALIZATION  

Molecular Genetics and Genomics 

Genetic Engineering 

 

 

               RESEARCH SPECIALIZATION 

  Congenital disorders associated with nutrient metabolism    

Microbial bioremediation of xenobiotics 

Probiotics to alleviate diabetes and hypertension

C. elegans as an animal model for vitamin transport physiology 

                      Research Supervision: 

 Program  Completed   Ongoing 

Ph.D  Five FiveM.Phil  Seven One

 

 

Dr. B. ASHOKKUMAR Assistant Professor 

Department of Genetic Engineering 

School of Biotechnology 

Mobile No: 9976147644 

Email:[email protected]

[email protected] 

                      PROFESSIONAL EXPERIENCE  

 No  Institution  Position  From (date) To (date)  Duration 

1.  School of Biotechnology, Madurai Kamaraj University, Madurai, India 

Assistant Professor 

2010 

 

Till date  7 years,  

3 months 

2.  Veterans Affairs Medical Center, Long Beach, CA, USA 

Research Scientist 

(Honorary position) 

2008  2009  1 year,  

9 months 

3.  Department  of  Medicine, University  of  California, Irvine, USA 

Postdoctoral Fellow 

2004 

 

2009  5 years 

 

4.  Department of Microbiology, Madurai Kamaraj University, Madurai, India 

CSIR‐Senior Research Fellow 

2002 

 

2003  1 year,  

4 months 

5.  Department of Microbiology, Madurai Kamaraj University, Madurai, India 

UGC‐ Project Fellow 

1998 

 

2001  3 years 

6.  Muthayammal College of Arts & Science, Rasipuram, India 

Lecturer Head 

1996 

 

1998  2 years 

 

7.  Kandasamy Kandar’s College, Velur, India 

Lecturer  1995  1996  1 year 

 

 

                      RESEARCH COLLABORATION (BOTH NATIONAL & INTERNATIONAL) 

 Name of the 

Collaborator 

Institute Collaboration Details Collaboration Output    

(Papers/Patents/ 

Research/Online) 

Prof. Henry Houlden 

University College London, UK 

Clinical whole‐exome sequencing for the diagnosis of Motor Neuron Diseases among 

Indian populations 

5 Papers

Prof. Hamid M Said 

University of California, Irvine, 

USA 

Trafficking and targeting of vitamin transporters 

2 Papers

Dr. Markus A. Keller 

Medical University Innsbruck, Austria 

Functional analysis of ALDH3A2 mutations in Sjogren‐Larsson 

syndrome 

Research Collaboration 

Dr. Vykunta K Raju 

Indira Gandhi Institute of Child Health, Bangalore 

Molecular diagnosis of congenital diseases associated 

with vitamin deficiency 

1 Paper 

Prof. John Abraham 

Centre for Nanoscience and Nanotechnology, Gandhigram Rural 

Institute, Gandhigram 

Metabolically versatile Paracoccus sp., for the 

bioremediation of toxic and harmful xenobiotics from waste water – a prospect of genomic 

exploitation 

Having joint collaborative research 

project from DBT 

Prof. A. Nalini  

NIMHANS, Bangalore 

Genetic and functional analysis of Motor Neuranopathies 

(Brown‐Vialetto‐Van Laere and Fazio‐Londe syndromes) in 

Indian populations 

Submitted a collaborative research 

Project to DBT 

Dr. K. Thangaraj  CCMB, Hyderabad  3′‐UTR SNP rs2229611 in G6PC1  1 Paper 

Dr. Saravanan Matheswaran 

Indian Institute of Technology, Kanpur

 

Biofilm engineering in Bacillus subtilis 

1 Paper 

 

 

                    COMPLETED RESEARCH PROJECT  

 No  Title of the Project  Funding Agency  Total Grant 

(in lakhs) 

Year 

1   Molecular  cloning  and  functional characterization  of  riboflavin transporters from C. elegans (PI) 

UGC, India  8.57  2011‐2014 

2   Thiamin  Responsive  Megaloblastic Anemia  (TRMA)  in  Indian  populations: Identification  and  Functional Characterization  of  SLC19A2 mutations and microRNAs (PI) 

DBT‐ RGYI, India  27.73  2011‐2014 

3   Phytohormones  from  Cyanobacteria:  a novel alternate strategy  for  the growth and  crop  production  for  sustainable agriculture (Co‐PI) 

UGC, India  9.79 

 

2011‐2014 

4  Dimethylformamide‐degrading bacteria: a novel approach for bioremediation of 

DST, SERB‐YS   22.70  2012‐2015 

industrial  effluents  with  bacterial biofilms (PI) 

5  Probiotics  in  shrimp  aquaculture: screening,  molecular  characterization and genetic  improvement of  lactic acid bacteria (Co‐PI) 

UGC, India  13.59  2012‐2015 

6  Investigation  of  self‐resistance  to daunorubicin  conferred  by  drrC  and drrD of Streptomyces peucetius (PI) 

DBT, India  31.00  2012‐2015 

7  Green  energy  from  oleaginous cyanobacteria: production, optimization and  overexpression  of  Acetyl  CoA Carboxylase  and  Thioesterase  for biodiesel production (Co‐PI) 

CSIR, India  22.00  2013‐2016 

 

8  Screening,  process  optimization  and biomass production of fresh water algae for pigments accumulation (PI) 

Bioextract, Bangalore 

8.73 

 

2016‐2017 

                      ON‐GOING RESEARCH PROJECT  

 No  Title of the Project  Funding Agency  Total Grant 

(in lakhs) 

Year 

1  Metabolically  versatile  Paracoccus  sp., for  the  bioremediation  of  toxic  and harmful xenobiotics from waste water – a prospect of genomic exploitation (PI) 

DBT, INDIA  56.46  2017‐2020 

2  Exploration  of  biological  potential  of phlorotannins:  a  lead  compound  from marine  brown  algae  for  non communicable diseases (Co‐PI) 

DBT, 

INDIA 

47.19  2017‐2020 

3  Probiotics with ACE and AGEs inhibitory activities  to  alleviate  diabetes  and associated complications (PI) 

ICMR, INDIA  31.58  2018‐2021 

 

               

 HONORS/AWARDS/RECOGNITIONS 

ICMR‐International Fellow Award for Young Biomedical Scientists (2016‐2017) 

Served as a Chair  for  Invited Lectures at “Symposium on  Inorganic Chemical Biology” at Madurai Kamaraj University, Madurai (March 18, 2017).  

Served  as  a Chair  for Oral/Poster  sessions  at  “National Conference on  Innovations  and New Horizons  in Algal Technology and Biotechnology at Kamaraj College, of Engineering, 

Virudhunagar (February 26, 2015).  

Served  as  a  Chair  for  Poster  sessions  at  “International  Conference  on  Industrial Biotechnology, Punjab. November 21‐23, 2012.  

Served as a Chair  for Oral sessions at “National Seminar on Future prospects  in OMICS” held at Department of Microbiology, SVN College, Madurai (March 08, 2012). 

Received Young Investigator Award at International Conference on ‘Environment, Genes, Health  and Disease‐2011’  organized  by  Bharathiar University,  Coimbatore,  Tamil Nadu [December 2011].

Served as a Chair  in  the Bio‐Process Technology  session at  International Conference on Genomic  Sciences  (ICGS  2010)  held  at  School  of  Biological  Sciences, Madurai  Kamaraj University, Madurai, India. (Nov 12‐14, 2010)

Research Scientist (Honorary Position) – Veterans Affairs Healthcare System, Long Beach, CA, USA. (01‐01‐2008 to 03‐09‐2009)

Received  ‘Poster  of  Distinction  Award’  for  a  paper  presentation  from  American Gastroenterologists Association at Digestive Disease Week, San Diego, CA [2008]. 

Received  ‘Best Presentation Award’  for  two posters  from American Gastroenterologists Association at Digestive Disease Week, Washington DC [2007]. 

CSIR Senior Research Fellow‐ Madurai Kamaraj University, Madurai, India [2002 ‐ 2003]. 

 

             PUBLICATIONS    

1. Gowda VK, Udhayabanu T, Varalakshmi P, Srinivasan VM and Ashokkumar B. Fazio‐Londe Syndrome in siblings from India with different phenotypes. Brain and Development, 2018 (in Press). (Impact Factor: 1.520) 

2. Salpietro V, Efthymiou S, Manole1 A, Maurya B, Wiethoff S, Ashokkumar B, Cutrupi MC, Dipasquale  V,  Manti  S,  Botia  JA,  Ryten  M,  Vandrovcova  J,  Bello  OD,  Bettencourt  C, Mankad  K, Mukherjee  A, Mutsuddi M  and  Houlden  H.  A  loss‐of‐function  homozygous mutation  in  DDX59  implicates  a  conserved  DEAD‐box  RNA  helicase  in  nervous  system development and function. Human Mutation, 39, 187‐192, 2018. (Impact Factor: 4.601) 

3. Udhayabanu T, Karthi S, Mahesh A, Varalakshmi P, Manole A, Houlden H and Ashokkumar B.  Adaptive  regulation  of  riboflavin  transport  in  heart:  effect  of  dietary  riboflavin deficiency in cardiovascular pathogenesis. Mol Cell Biochem, 440, 147–156, 2018. (Impact Factor: 2.669) 

4. Karpagam R,  Jawaharraj K, Ashokkumar B,  Sridhar  J and Varalakshmi P. Unraveling  the lipid  and  pigment  biosynthesis  in Coelastrella sp.  M‐60:  genomics‐enabled  transcript profiling. Algal research, 29, 277‐289, 2018. (Impact Factor: 3.994) 

5. Manole A, Jaunmuktane Z, Hargreaves I, Pandraud A, Salpietro V, Pope S, Ludtmann MHR, Horga  A, Renata  RS, Li  A, Ashokkumar  B, Lourenco  CM, Heales  S, Horvath  R, Chinnery PF, Toro  C, Singleton  AB, Jacques  TS, Abramov  AY, Muntoni  F, Hanna  MG, Reilly MM, Revesz  T, Kullmann  DM, Jepson  JEC  and Houlden  H.  Clinical,  pathological  and functional  characterization  of  riboflavin‐responsive  neuropathy.  140(11),  2820‐2837, 2017. (Impact Factor: 10.292) 

6. Jawaharraj K, Shivani K, Shakambari G, Sameer Kumar R, Ashokkumar B and Varalakshmi P. Agro‐industrial waste based Phycocyanin production from Oscillatoria sp. 50 A: daf‐16 

modulating effect  in Caenorhabditis elegans and p53 dependent apoptosis  in HeLa Cells. ChemistrySelect 2 (36), 11989‐11994, 2017. 

7. Shakambari G, Kumar RS, Ashokkumar B  and Varalakshmi P. Agro waste utilization  for cost‐effective  production  of  L‐asparaginase  by  Pseudomonas plecoglossicida  RS1  with anticancer and acrylamide mitigation potential. ACS Omega 2, 8108‐8117, 2017. 

8. Angelaalincy  M,  Senthilkumar  N,  Karpagam  R,  Gnana  Kumar  G,  Ashokkumar  B  and Varalakshmi  P.  Enhanced  extracellular  polysaccharide  production  and  self‐sustainable electricity  generation  for  PAMFCs  by  Scenedesmus  sp.  SB1. ACS Omega  2,  3754  ‐3765, 2017. 

9. Ramkumar SRS, Sivakumar N, Selvakumar G, Selvankumar T, Sudhakar C, Ashokkumar B and Karthi S. Green synthesized silver nanoparticles from Garcinia imberti bourd and their impact  on  root  canal  pathogens  and  HepG2  cell  lines.  RSC Advances  7,  34548,  2017. (Impact Factor: 3.108) 

10. Iswarya  A,  Vaseeharan  B,  Anjugam  M,  Ashokkumar  B,  Govindarajan  M,  Alharbi  NS, Kadaikunnan  S,  Khaled  JM  and  Benelli  G. Multipurpose  efficacy  of  ZnO  nanoparticles coated  by  the  crustacean  immune molecule    ‐1,  3‐glucan  binding  protein:  toxicity  on HepG2  liver  cancer  cells and bacterial pathogens. Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 158, 257‐269, 2017. (Impact Factor: 3.88) 

11. Karthi S, Rajeshwari M, Francis A, Saravanan M, Varalakshmi P, Houlden H, Thangaraj K, Ashokkumar B. 3′‐UTR  SNP  rs2229611  in G6PC1 affects mRNA  stability, expression and Glycogen Storage Disease type‐Ia risk. Clinica Chimica Acta 471, 46‐54, 2017. (ISSN: 0009‐8981; Impact Factor: 2.873) 

12. Vijayakumar  S,  Vaseeharan  B,  Malaikozhundan  B,  Gobi  N,  Ravichandran  S,  Karthi  S, Ashokkumar  B  and  Sivakumar  N.  A  novel  antimicrobial  therapy  for  the  control of Aeromonas hydrophila infection  in  aquaculture  using  marine  polysaccharide  coated gold nanoparticles. Microbial Pathogenesis, 110, 140‐151, 2017.  (Impact Factor: 2.009) 

13. Udhayabanu T, Manole A, Rajeshwari M, Varalakshmi P, Houlden H and Ashokkumar B. Riboflavin responsive mitochondrial dysfunction in neurodegenerative diseases. Journal of Clinical Medicine, 6(5), 52, 2017. (ISSN: 2077‐0383) 

14. Jawaharraj  K,  Karpagam  R,  Ashokkumar  B,  Kathiresan  S, Moorthy  IM,  Arumugam M, Varalakshmi  P.  Improved  biomass  and  lipid  production  in  Synechocystis  sp.  NN  using industrial wastes and nano‐catalyst coupled  transesterification  for biodiesel production. Bioresource Technology, 242, 128‐132, 2017. (ISSN: 0960‐8524; Impact Factor: 5.651) 

15. Maheshwaran  D,  Nagendraraj  T,  Manimaran  P,  Ashokkumar  B,  Kumar  M  and Mayilmurugan R. Highly  selective and efficient copper(II)‐‘turn‐on’  fluorescence  imaging probe  for  L‐cysteine.  European Journal of Inorganic Chemistry,  6,  1007‐1016,  2017. (ISSN: 1099‐0682; Impact Factor: 2.686) 

16. Udhayabanu T, Gandhimathi K, Varalakshmi P and Ashokkumar B. Functional genomics of riboflavin  transport:  genes  and  regulatory  mechanisms.  Current  Developments  in Biotechnology  and  Bioengineering,  Book  2:  Functional  Genomics  and  Metabolic Engineering,  edited  by  Santosh  Noronha,  P.  Gunasekaran  and  Ashok  Pandey.  Elsevier Publishers, 79‐102, 2017 (Book Chapter). (ISBN: 978‐0‐444‐63667‐6) 

17. Udhayabanu  T,  Subramanian VS, Teafatiller T, Gowda VK, Raghavan VS, Varalakshmi P, Said HM  and Ashokkumar B.  SLC52A2  [p.P141T]  and  SLC52A3  [p.N21S]  causing Brown‐Vialetto‐Van  Laere  Syndrome  in  an  Indian  patient:  First  genetically  proven  case  with mutations  in  two  riboflavin  transporters.  Clinica Chimica Acta  462,  210‐214,  2016. 

(ISSN: 0009‐8981; Impact Factor: 2.873) 

18. Pramanik  A,  Kole  AK,  Krishnaraj  RN,  Biswas  S,  Tiwary  CS,  Varalakshmi  P,  Rai  SK, Ashokkumar B  and  Kumbhakar  P. A  novel  technique of  synthesis of highly  fluorescent carbon  nanoparticles  from  broth  constituent  and  in-vivo  bioimaging  of  C. elegans.  J Fluores, 26(5), 1541‐8, 2016. (ISSN: 1053‐0509; Impact Factor: 1.601) 

19. Nisha  KN,  Sridhar  J,  Varalakshmi  P  and  Ashokkumar  B.  Draft  genome  sequence  of Paracoccus sp. MKU1,  a  new  bacterial  strain  isolated  from  an  industrial  effluent with potential for bioremediation. J Genomics 4, 13‐15, 2016. (ISSN: 1839‐9940) 

20. Jawaharraj  K,  Karpagam  R,  Ashokkumar  B,  Pratheeba  CN  and  Varalakshmi  P. Enhancement of biodiesel potential in cyanobacteria: using agro‐industrial wastes for fuel production,  properties  and  acetyl  CoA  carboxylase  D  (accD)  gene  expression  of Synechocystis  sp.  NN.  Renewable Energy  98,  72‐77,  2016.  (ISSN: 0960‐1481;  Impact Factor: 4.357) 

21. Shakambari  G,  Birendranarayan  AK,  Lincy  MJA,  Rai  SK,  Ahmad  QT,  Ashokkumar  B, Saravanan  M,  Mahesh  A  and  Varalakshmi  P.  Hemocompatible  glutaminase  free  L‐asparaginase from marine Bacillus tequilensis PV9W with anticancer potential modulating p53  expression.  RSC Advances  6,  25943‐25951,  2016.  (ISSN:2046‐2069;  Impact  Factor: 3.108) 

22. Manimaran  P,  Subramanian  VS,  Karthi  S,  Gandhimathi  K,  Varalakshmi  P,  Ganesh  R, Rathinavel A, Said HM and Ashokkumar B. Novel nonsense mutation (p.Ile411Metfs*12) in  the  SLC19A2  gene  causing  Thiamine  Responsive Megaloblastic  Anemia  in  an  Indian patient. Clinica Chimica Acta 452, 44‐49, 2016. (ISSN: 0009‐8981; Impact Factor: 2.873) 

23. Karthi  S, Manimaran  P,  Gandhimathi  K,  Ganesh  R,  Varalakshmi  P  and  Ashokkumar  B. Glucose‐6‐phosphatase  (G6PC1)  promoter  polymorphism  associated  with  Glycogen storage disease type 1a among  Indian population. RSC Advances 5, 65297‐ 65302, 2015. (ISSN: 2046‐2069; Impact Factor: 3.108) 

24. Jawaharraj  K,  Karpagam  R,  Ashokkumar  B,  Kathiresan  S  and  Varalakshmi  P.  Green renewable energy production  from Myxosarcina sp.: media optimization and assessment of  biodiesel  fuel  properties.  RSC Advances  5,  51149‐51157,  2015.  (ISSN:2046‐2069; Impact Factor: 3.108) 

25. Shakambari  G,  Sumi  BM,  Ashokkumar  B,  Palanivelu  P  and  Varalakshmi  P.  Industrial effluent as a substrate for glutaminase free L‐asparaginase production from Pseudomonas plecoglossicida  strain  RS1;  media  optimization,  enzyme  purification  and  its characterization.  RSC Advances  5,  48729‐38,  2015.  (ISSN:  2046‐2069;  Impact  Factor: 3.108) 

26. Shakambari  G,  Ashokkumar  B  and  Varalakshmi  P.  Phlorotannins  from  Brown  Algae: inhibition of advanced glycation end products (AGEs) formation in a high glucose induced Caenorhabditis elegans. Indian Journal of Experimental Biology 53, 371‐379, 2015.  (ISSN: 0975‐1009; Impact Factor: 0.835) 

27. Karpagam  R,  Preeti  R, Ashokkumar B, Varalakshmi  P.  Enhancement  of  lipid  production and  fatty acid profiling  in Chlamydomonas reinhardtii, CC1010  for biodiesel production. Ecotoxicol. Environ. Safety 121:253‐57, 2015. (ISSN: 0147‐6513; Impact Factor: 2.76) 

28. Gandhimathi  K,  Karthi  S, Manimaran  P,  Varalakshmi  P  and  Ashokkumar  B.  Riboflavin transporter‐2  (rft-2) of Caenorhabditis elegans: adaptive and developmental Regulation. Journal of Biosciences 40(2), 257‐268, 2015. (ISSN: 0973‐7138; Impact Factor: 2.06) 

29. Karuppasamy  K,  Ashokkumar  B  and  Ranjan  Prasad.  Partial  loss  of  self‐resistance  to 

daunorubicin  in drrD mutant of Streptomyces peucetius. Biochemical Engineering Journal 102, 98‐107, 2015. (Impact Factor: 2.892) 

30. Nisha  KN, Devi V, Varalakshmi  P  and Ashokkumar  B. Biodegradation  and  utilization  of dimethylformamide by biofilm forming Paracoccus sp. strains MKU1 & MKU2. Bioresource Technology 188, 9‐13, 2015. (ISSN: 0960‐8524; Impact Factor: 5.651) 

31. Karpagam  R, Raj  KJ, Ashokkumar B  and Varalakshmi P. Characterization  and  fatty  acid profiling  in  two  fresh  water  microalgae  for  biodiesel  production:  lipid  enhancement methods  and  media  optimization  using  response  surface  methodology.  Bioresource Technology 188, 177‐84, 2015. (ISSN: 0960‐8524; Impact Factor: 5.651) 

32. Lincy  MJA,  Ashokkumar  B,  Vasantha  M  and  Varalakshmi  P.  Microbial  fuel  cells:  a promising  alternative  energy  source.  Bioenergy:  Opportunities  and  Challenges.  Apple Academy Press, USA. 2015. Pp. 61‐85. (Book Chapter; ISBN: 13: 978‐1‐77188‐109‐8). 

33. Karpagam  R,  Preeti  R,  Raj  KJ,  Saranya  S, Ashokkumar  B  and Varalakshmi  P.  Fatty  acid biosynthesis  from  a  new  isolate Meyerella  sp. N4: molecular  characterization,  nutrient starvation, and  fatty acid profiling  for  lipid enhancement. Energy and Fuels 29, 143‐149, 2015. (ISSN: 0887‐0624; Impact Factor: 3.091) 

34. Saravanan N, Ashokkumar. B, Sivakumar N and Varalakshmi P, “Biosorption of Malachite Green (azo dye) by Oscillatoria chlorina: Kinetics, equilibrium  isotherm and FTIR studies. Plants and Microbes. SBW Publishers, New Delhi, India. 2014. Pp.134‐148. (Book Chapter; ISBN: 9788185708300). 

35. Agalya S, Dinakaran T, Vijayanand K, Dinesh Kumar S, Ashokkumar B, Sivakumar, N and Varalakshmi  P.  “Optimization  of  medium  for  the  production  of  inulinase  from Enterobacter aerogenes  by  response  surface methodology”.  Plants  and Microbes.  SBW Publishers, New Delhi, India. 2014. Pp. 203‐216 (Book Chapter; ISBN: 9788185708300). 

36. Babu  SV, Ashokkumar B, Sudhakarsamy P and Varalakshmi P.  Indole‐3‐acetic acid  from filamentous cyanobacteria: strain  identification, production and characterization. Journal of Scientific & Industrial Research  72,  581‐84,  2013.  (ISSN:  0022‐4456;  Impact  Factor: 0.557) 

37. Sivakumar N, Selvakumar G, Varalakshmi P and Ashokkumar B. Lactobacillus sp. a potent probiotic  for disease  free  shrimp  aquaculture.  International Journal of Recent Scientific Research 5, 1031‐1045, 2014. (ISSN: 0976‐3031) 

38. Vijavel K, Anbuselvam C and Ashokkumar B. Protective effect of Coleus aromaticus Benth (Lamiaceae) against naphthalene‐induced hepatotoxicity. Biomedical and Environmental Sciences 26(4): 295‐302, 2013. (ISSN: 0895‐3988; Impact Factor: 2.204) 

39. Ananda Priya K, Satheesh S, Ashokkumar B, Varalakshmi P, Selvakumar G and Sivakumar N. Antifouling activity of prodigiosin  from estuarine  isolate of Serratia marcescens CMST 07.  Microbiological  Research  in  Agroecosystem  Management.  Springer  Publishers, 2013, pp 11‐21. (ISBN: 978‐81‐322‐1087‐0; Book Chapter). 

40. Sivakumar  N,  Ashokkumar  B  and  Varalakshmi  P.  2013.  Cyanobacteria  in  diverse environment:  a  prolific  source  for  bioactive metabolites.  Biodiversity:  issues,  impacts, remediation  and  significances. VLMS  Publishers. New Delhi.    (ISBN:  978‐9380820‐17‐0. Book Chapter). 

41. Sivakumar  N,  Viji  V,  Satheesh  S,  Varalakshmi  P,  Ashokkumar  B  and  Pandi  M. Cyanobacterial abundance and diversity in coastal wetlands of Kanyakumari District, Tamil Nadu  (India). African Journal of Microbiology Research 6: 4409‐4416, 2012.  (ISSN: 1996‐0808; Impact Factor: 0.54) 

42. Krishnaraj NR, Babu SV, Ashokkumar B, Malliga P and Varalakshmi P. Antioxidant property of fresh and marine water cyanobacterial extracts  in Swiss mice. Journal of Biopesticides 5: 250‐254, 2012. (ISSN: 0974‐391X) 

43. Vimalarasan A, Pratheeba CN, Ashokkumar B, Sivakumar N, Varalakshmi P. Production of biodiesel  from  cyanobacteria  (Oscillatoria annae)  by  alkali  and  enzyme  mediated transesterification.  Journal of Scientific & Industrial Research  70:  959‐967,  2011.  (ISSN: 0022‐4456; Impact Factor: 0.50) 

44. Austin MU, Liau W, Balamurugan K, Ashokkumar B, Said HM, LaMunyon CW. Knockout of the  folate  transporter  folt‐1  causes  germline  and  somatic  defects  in  C. elegans.  BMC Developmental Biology. 10: 46, 2010. (ISSN: 1471‐213X; Impact Factor: 2.280) 

45. Said HM, Mee L, Sekar VT, Ashokkumar B, Pandol SJ. Mechanism and regulation of folate 

uptake  by  pancreatic  acinar  cells:  Effect  of  chronic  alcohol  consumption.  Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 298:G985‐93, 2010. (ISSN: 1522‐1547; Impact Factor: 3.80) 

46. Ashokkumar B, Kumar JS, Hecht GA, Said HM. Enteropathogenic Escherichia coli  inhibits intestinal  vitamin B1  (thiamin) uptake:  Studies with human‐derived  intestinal  epithelial Caco‐2  cells. Am J Physiol: Gastrointest Liver Physiol. 297, 825‐833  (2009).  (ISSN: 1522‐1547; Impact Factor: 3.80) 

47. Ashokkumar B, Nabokina SM and Said HM. Identification of dynein light chain road block‐1 (DYNLRB1) as a novel  interaction partner with the reduced folate carrier. Am J Physiol: Gastrointestinal and Liver Physiol. 297, 480‐87  (2009).  (ISSN: 1522‐1547;  Impact Factor: 3.80) 

48. Balamurugan K, Ashokkumar B*, Moussaif M, Sze JZ and Said HM Cloning and functional characterization of a folate transporter from the nematode, Caenorhabditis elegans. Am J Physiology: Cell Physiology 293,  670‐681  (2007).  *  Shares  equal  authorship  with  first author. (ISSN: 0363‐6143; Impact Factor: 3.78) 

49. Ashokkumar  B,  Mohammed  ZM,  Vaziri  ND  and  Said  HM.  Effect  of  folate  over‐supplementation  on  folate  uptake  by  human  intestinal  and  renal  epithelial  cells.  Am Journal of Clinical Nutrition 86, 159‐66 (2007). (ISSN: 1938‐3207; Impact Factor: 6.926) 

50. Ashokkumar  B,  Vaziri  ND  and  Said  HM.  Thiamin  uptake  by  the  human‐derived  renal epithelial HEK‐293 cells: cellular and molecular mechanisms. Am Journal of Physiol: renal Physiol. 291, 796‐805 (2006). (ISSN: 1931‐857X; Impact Factor: 3.25) 

51. Ashokkumar B, Senthilkumar SR and Gunasekaran P. Purification and Characterization of β‐fructofuranosidases from Aspergillus niger in Submerged and Solid‐state Fermentation.  Current Topic on Bioprocesses  in Food  Industry, 156‐170  (2005); Eds. Christian Lachore, Ashok  Pandey,  Claude‐Gilles  Dussap;  Asiatech  Publishers  (ISBN 10: 8187680148;  Book Chapter). 

52. Senthilkumar  SR,  Ashokkumar  B,  Chandra  Raj  K  and  Gunasekaran  P.  Optimization  of medium  composition  for  alkali‐stable  xylanase production by Aspergillus fischeri  Fxn1in solid‐state  fermentation using  central  composite  rotary design. Bioresource Technology 96, 1380‐86 (2005). (ISSN: 0960‐8524; Impact Factor: 5.651) 

53. Senthilkumar  SR,  Ashokkumar  B,  Chandra  Raj  K  and  Gunasekaran  P.  Purification  and characterization  of  a  low molecular weight  alkali  stable  endoxylanase  from  solid‐state cultures  of  Aspergillus fischeri Fxn1.  Biotechnology Letters  26,  1283‐87  (2004). (ISSN: 0141‐5492; Impact Factor: 1.59) 

54. Ashokkumar  B,  Senthilkumar  SR  and  Gunasekaran  P.  Derepressed  2‐deoxyglucose resistant  mutants  of  Aspergillus niger with  altered  hexokinase  and  acid  phosphatase 

activity  in  hyperproduction  of  ‐fructofuranosidase.  Applied  Biochemistry and Biotechnology 118 [1‐3]: 89‐96 (2004). (ISSN: 1559‐0291; Impact Factor: 1.74) 

55. Alagesan  P,  Ashokkumar  B,  Muthukrishnan  J  and  Gunasekaran  P.  Isolation  and characterization  of  gut  bacteria  from  millipede,  Xenobolus carnifex  (Fabricius).  Indian Journal of Microbiology 43(2): 111‐113 (2003). (ISSN: 0973‐7715; Impact Factor: 0.899) 

56. Rajendran P, Ashokkumar B, Muthukrishnan J and Gunasekaran P. Toxicity assessment of Nickel  using  Aspergillus niger  and  its  removal  from  an  industrial  effluent.  Applied Biochemistry and Biotechnology  102  (1‐3),  201‐206  (2002).  (ISSN: 1559‐0291; Impact Factor: 1.74) 

57. Ashokkumar  B  and Gunasekaran  P.  β‐fructofuranosidase  production  by  2‐deoxyglucose resistant mutants of Aspergillus niger  in submerged and solid state  fermentation.  Indian Journal of Experimental Biology 40, 1032‐1037  (2002).  (ISSN: 0975‐1009;  Impact Factor: 0.84) 

58. Ashokkumar  B,  Kayalvizhi  N  and  Gunasekaran  P.  Optimization  of  media  for  β‐fructofuranosidase  production  by  Aspergillus niger  in  submerged  and  solid  state fermentation. Process Biochemistry 37, 331‐338 (2001). (ISSN: 1359‐5113; Impact Factor: 2.52)

 

   PAPER PRESENTED IN CONFERENCE/SEMINAR/WORKSHOP 

 Name of the Conference  Date  Place  Title  Author(s) 

National Conference on Innovations in Biotechnology 

14th & 15th December 2017 

MKU, Madurai 

Biodegradation of Catechol by bacteria screened from industrial waste water 

Aravind MK, Rajeshwari M, Varalakshmi P, Abraham J and Ashokkumar B 

Women Scientist’s and Entrepreneur’s conclave organized by India International Science Festival  

13th‐16th October 2017 

Chennai  Mutational analysis of Sjögren‐Larsson syndrome (SLS) patient from Indian ethnicity  

Rajeshwari M, Apurwa , Aravind M K,  Varalakshmi P, Vykuntaraju K , Ashokkumar B 

National  Symposium  on Recent  Scenario  of Environmental Pollution  

 05th October 2017 

 

Vellore Quinalphos degrading soil bacterium Enterobacter sp.: Cloning and characterization of organophosphorous hydrolase gene 

Govindarajan D, Varalakshmi P and Ashokkumar B 

International Conference on Current Trends in Biosciences 

21st ‐23th August, 2017 

Cochin  Stress related gene responses and behavioral changes in Caenorhabditis elegans exposed to organophosphorous pesticide quinalphos 

Govindarajan D, Chatterjee C, Shakambari G, Varalakshmi P and Ashokkumar B   

International Conference on Current Trends in Biosciences 

 21st ‐23th

August 2017 Cochin Ferulic acid esterase 

from lactic acid bacteria isolated from milk and milk products for producing ferulic acid 

Muthurayar T, Kayalvizhi M, Ashokkumar B, Varalakshmi P and Sivakumar N 

National Conference on Waste to Energy, Carbon Capture and Storage at National Institute of Technology 

Rourkela. 3rd  ‐ 5thAugust 2017 

 

Rourkela  Bioenergy production and Bioremediation of heavy metal (As) by microalgae Coelastrella sp. M60 

Angelaalincy M.J , Nishtha , Senthilkumar N , Gnana Kumar G, Ashokkumar B and Varalakshmi P  

Winsconsin Science and Technology Symposium at University of Wisconsin 

24th‐  25th July 2017 

 

USA  Differential gene expression analysis of the triacylglycerol (TAG) biosynthetic pathway in Phaeodactylum tricornutum under two stage cultivation using lucrative options for nutrients 

Karpagam  R, Jawaharraj  K, Ashokkumar B, Toivo K and Varalakshmi P 

10th Annual Neuromuscular Translational Research Conference 

22nd – 23rd March 2017 

London  Functional validation of non‐coding variants of GJB1 in patients with CMTX1.  

Cortese A, Manole A, Ashokkumar B, Simone R,  Tomaselli PJ,  Rossor AM, Laurá M, Skorupinska M, Polke JM, Poh R, Houlden H and Reilly MM. 

National Conference on Bioresources: Conservation, Utilization and Future Prospects (NCBCUFP‐ 2017)  

16th & 17th February 2017 

Gandhigram 

Fucoxanthin from Padina pavonica Extraction, Purification, Characterization and its therapeutic Applications. 

Angelaa Lincy M, Nissy EJP, Shakambari G, Jawaharraj K, Ashokkumar B, 

Varalakshmi P. 

International conference on Modern Biology and Environmental Management. 

 

27‐28 January 2017 

Thiruchengode 

Novel compound heterozygous mutations in SLC52A3 gene of south Indian patient with BVVLS 

Udhayabanu T, Varalakshmi P, Vykunta Raju KN, and Ashokkumar B 

International Conference on Current trends in Biotechnology  

 

Dec‐8th to 10th 2016 

Vellore  Phycocyanin from Oscillatoria sp. 50A: production, purification, characterization and its therapeutic 

Jawaharraj K, Shivani K, Shakambari G, Ashokkumar B, and Varalakshmi P. 

application

International Conference on Current trends in Biotechnology (ICCB 2016) 

8th ‐10th December 2016 

Vellore  Microbial degradation of organophosphorus pesticide quinalphos 

Govindarajan D, Muthurayar T, Varalakshmi P, Ashokkumar B 

International Conference on Current trends in Biotechnology  Institute of Technology 

Dec‐8th to 10th 2016 

 

Vellore  Improved biomass and lipid production by Synechocystis sp. NN ‐ An industrial waste to bioenergy approach: nano‐catalyst mediated transesterification for biodiesel application 

Jawaharraj K, Karpagam R, Ashokkumar B, Kathiresan S and Varalakshmi P 

International Conference on Current trends in Biotechnology  

 Dec‐8th to 10th 2016 

 

Vellore  Production of exopolysaccharides (EPS) from freshwater green microalgae: EPS enhancement strategies using media optimization and its application in photosynthetic algal microbial fuel cells (PAMFCs) 

Angelaalincy MJ, Senthilkumar N, Gnana Kumar G, Ashokkumar B and Varalakshmi P 

International Conference on Current trends in Biotechnology  

Dec‐8th to 10th 2016 

Vellore  Phlorotannins from macro algae Padina pavonica‐ Investigating anti cancer and anti AGE potentials using C.elegans as an animal model 

Sameer Kumar R, Shakambari G, Ashokkumar B and Varalakshmi P 

International Conference on Cancer Biology: Drug discovery & novel therapeutics  

 

29th ‐ 30th 

September 2016 

Aruppukottai 

Single Nucleotide Polymorphism rs3746804 of SLC52A3 gene associated with esophageal squamous cell carcinoma in neurodegenerative disease patients  

Udhayabanu T, Ahmad H, Vykunta Raju KN, Varalakshmi P and Ashokkumar B 

National Conference on “Contemporary Trends in Bioenergy and Green Technology: Challenges and Opportunities  

Feb  25th‐26th, 2016 

Virudhunagar 

Inhibition of AGEs formation and Cyclooxygenase ‐2 by Sodium   9‐amino‐4‐

Sameer Kumar R, Shakambari G, Angelaa Lincy MJ, Manoharan P, Ashokkumar B and 

methoxyundecanoate (VS) from Lyngbya sp. 

Varalakshmi P

International Conference on New Horizons in Biotechnology (NHBT‐2015) 

November 22th‐25th, 2015 

Trivandrum 

IAA production from fresh water filamentous cyanobacterium  Oscillatoria sp 50a: characterization and media optimization using response surface methodology. 

Venkateshbabu S, Jawaharraj K, Ashokkumar B, Sudhakarsamy P and Varalakshmi P 

 International Conference on New Horizons in Biotechnology (NHBT‐2015) 

November 22th‐25th, 2015 

Trivandrum 

Glutaminase free L‐asparaginase from a marine isolate Bacillus tequilensis PV9W: production, purification, characterization and its application. 

Shakambari G, Anandakumar, Angelaa Lincy, Rai SK, Ashokkumar B and Varalakshmi P 

International Conference on New Horizons in Biotechnology (NHBT‐2015) 

 

November 22th‐25th, 2015 

Trivandrum 

Bioactive compounds from Lyngbya sp.: exploring the efficacy of anti oxidant and anti inflammatory potentials by in vitro and in vivo studies. 

Rai SK, Shakambari 

G, Angelaa Lincy,   

Ashokkumar B and  

Varalakshmi P 

International Conference on New Horizons in Biotechnology (NHBT‐2015) 

November 22th‐25th, 2015 

Trivandrum 

Screening, molecular characterization and fatty acid methyl ester (FAME) profiling of potential cyanobacteria for biodiesel application 

Jawahar Raj K, 

Ashokkumar B, 

Kathiresan S and 

Varalakshmi P 

5th Annual Conference on Mitochondria in Cancer & Neurodegerative disorders 

 

6th‐ 7th November, 2015 

AMRF, Madurai 

Riboflavin responsive mitochondrial dysfunction in ischemic cardiomyopathy 

Udhayabanu T and Ashokkumar B 

International Conference on Recent Developments in Chemical and Biochemical Engineering  

October 02‐04, 2015 

Durgapur  Molecular docking of Isocitrate dehydrogenase and its effect on biomass production and fatty acid profiling in fresh water cyanobacteria 

JawaharRaj K, Krishnaraj RN, Karpagam R, Ashokkumar B, Manoharan P, and Varalakshmi P 

(Myxosarcina sp.).

International Conference on Emerging Trends in Biotechnology (ICETB 2014) 

6th to 9th November 18, 2014 

 

New Delhi 

Characterization and fatty acid profiling in two fresh water microalgae for biodiesel production: Lipid enhancement methods and media optimization using response surface methodology 

Karpagam R, Ashokkumar B and Varalakshmi  P 

International Conference on Emerging Trends in Biotechnology (ICETB 2014) 

6th to 9th November 18, 2014 

New Delhi 

Screening, Molecular characterization and fatty acid methyl ester (FAME) profiling of potential cyanobacteria for biodiesel production 

Jawahar Raj K, Ashokkumar B, Kathiresan S and Varalakshmi  P 

International Conference on Green Technology for Environmental Pollution  

  Sep 27th‐29th 2014 

Trichy   Enhancement of lipid production and fatty acid profiling in Chlamydomonas reinhardtii for biodiesel production. 

Karpagam R, Preeti R, Ashokkumar B and Varalakshmi P. 

International Conference on Emerging Trends in Biotechnology (ICETB 2014) 

6th to 9th November 18, 2014 

New Delhi 

Phlorotannins from brown algae: inhibition of advanced glycation end products (AGE) formation in a high glucose induced Caenorhabditis elegans 

Shakambari G, Ashokkumar B and Varalakshmi  P 

National level Conference on “Industry ‐ Academia Initiatives in Biotechnology & Healthcare” 

 March 06th & 07th 2014 

Virudhunagar 

Molecular characterization and fatty acid profiling of fresh water Meyerella sp. N‐4 for lipid enhancement. 

Preeti R, Karpagam 

R, Saranya SS, 

Ashokkumar B and 

Varalakshmi P 

National level Conference on “Industry ‐ Academia Initiatives in Biotechnology & Healthcare”  

March 06th & 07th 2014 

Virudhunagar 

Media optimization using industrial effluent for the production of glutaminase free L‐asparaginase from Pseudomonas plecoglossicida. 

Shakambari G  Sumi Babu, M, Ashokkumar B and Varalakshmi P 

“National Conference on Recent Trends in Zoology 

March 25th‐26th, 2014 

Thrissur  Novel polymorphism in the promoter 

Karthi S, Manimaran P, 

Research”   region of G6PC from Indian patients with Glycogen Storage Diseases Type 1a 

Gandhimathi K, Ganesh R, Varalakshmi P and Ashokkumar B 

“National Conference on Industry‐Academia initiatives in Biotechnology and Healthcare” 

March 06th & 07th. 2014 

Virudhunagar 

A study on N,N‐dimethylformamide degradation efficiency of biofilm‐forming Paracoccus sp. MKU1 

Nisha KN, Varalakshmi P, Sivakumar N and Ashokkumar B. 

National Conference on Wonders of the small‐Exploring the microbial world  

April 03th‐04th 2014 

Pondicherry  

Glutaminase free L‐asparaginase from Pseudomonas plecoglossicida: Media optimization using agro wastes for enhanced production 

Shakambari G, Sumi Babu M, Ashokkumar B and Varalakshmi P. 

International Conference on Biotechnology and Human Welfare 

December 06th‐08th, 2013 

Thanjavur. 

Expression pattern of riboflavin transporter (cRFT2) in Caenorhabditis elegans at different larval stages 

Gandhimathi, Karthi S, Manimaran P, Varalakshmi P, Sivakumar N and Ashokkumar B 

Asian Congress on Biotechnology 

 Dec 15th – 19th, 2013. 

New Delhi 

Molecular characterization and fatty acid evaluation of potential microalgae for the production of biodiesel 

R. Karpagam, S. Venkatesh Babu, B. Ashokkumar, N. Sivakumar P. Varalakshmi 

International Conference on Biotechnology & Human Welfare  

December 06th‐08th, 2013 

Thanjavur. 

Isolation, Characterization and lipid profiling of Cyanobacteria – a promising source for biodiesel production 

Jawahar Raj. K, B. Ashokkumar, S. Kathiresan N. Sivakumar and P. Varalakshmi.   

International Conference on Biotechnology & Human Welfare  

December 06th‐08th, 2013 

Thanjavur. 

Molecular characterization and fatty acid assessment of potential unicellular oleaginous microalgae for biodiesel production 

R. Karpagam,         B. Ashokkumar, N. Sivakumar and P. Varalakshmi 

“Biological Conference 2013”  

March 11th‐13th, 2013 

Kerala  N,N‐dimethylformamide degradation by a biofilm‐forming Paracoccus 

Nisha KN, Varalakshmi P, Sivakumar N and Ashokkumar B 

pantotrophus MKU1 isolated from a dye industry effluent 

3rd International Symposium on Wellness, Helathy Lifestyle & Nutrition 2012”  

December 10th‐12th, 2012 

Malaysia  A novel G6PC gene splicing mutation IVS1 (‐2AG‐TG) in an Indian patient with Glycogen Storage Diseases Type 1a 

Manimaran P, Gandhimathi K, Varalakshmi P, Rathinavel A and Ashokkumar B 

“National Seminar on Future prospects in OMICS  

March 08, 2012 

Madurai  Mutational Analysis of SLC19A2 gene from Thiamin Responsive Megaloblastic Anemia patient from Tamil Nadu. 

Manimaran P, Gandhimathi K, Karthi S, Ganesh R, Varalakshmi P, Sivakumar N and Ashokkumar B 

“Proteins in Disease and Disorder”  

 December 10th‐12th, 2012 

Delhi  Thiamin Responsive Megaloblastic Anemia: novel mutations in the SLC19A2 gene in a south Indian sibling 

Manimaran P, Gandhimathi K, Vykunta Raju KN and Ashokkumar B 

International Conference on Medical Genetics and Genomics  

December 12th‐14th, 2011 

Tiruchirappalli 

Mutational Analysis of G6PC in patients with Glycogen Storage Diseases Type 1a from India 

Karthi S, Manimaran P, Gandhimathi K, Ganesh R, Varalakshmi P and Ashokkumar B 

International Conference on New Horizons in Biotechnology 

November 21th‐24th, 2011 

Trivandrum. 

Biosorption of Malachite Green (Azo Dye) by Oscillatoria chlorina: kinetics, equilibrium isotherm and FTIR studies 

Varalakshmi Perumal, Murugesan Saravanan, Nagarajan Pratheeba, Balasubramaniem Ashokkumar. 

National Conference on “Emerging trends in Biological Research” (NCEBR’11)  

21nd & 22nd February‐2011. 

Madras  Hypoglycemic activity of cyanobacteria in alloxan induced diabetic rats 

Navaneetha Krishnaraj, Balasubramaniem Ashokkumar, Natesan Sivakumar, Mohan Pandi and Perumal Varalakshmi 

National Seminar on Emerging trends in infectious and non infectious diseases  

MKU, Madurai 

15th February, 2013 

Prevalence of root canal infections in hospital reported cases at Kanyakumari District, Tamil nadu 

Ramkumar SR, Angelo MC, Ashokkumar B, Varalakshmi P and Sivakumar N 

National Conference on “Emerging trends in Biological Research” (NCEBR’11)  

21nd & 22nd February‐2011. 

Madras  Comparative hepatoprotective activity of cyanobacterial extracts on carbon tetrachloride induced liver damage in rats 

Navaneetha Krishnaraj, Balasubramaniem Ashokkumar, Natesan Sivakumar, Mohan Pandi and Perumal Varalakshmi 

Recent advances in mycological research and 37th annual meeting of the mycological society of India.  

8th & 9th February, 2011 

India  Production and partial characterization of α – amylase from Aspergillus sp isolated from estuarine soil by solid state fermentation 

Sivakumar, N, Kumaresan, V, Varalakshmi, P, Pandi, M, and Ashokkumar, B 

National Seminar on “Biodiversity conservation and management of Aquatic Resources 

09th &10th December 2010 

Thoothukudi 

Bioconversion of sugarcane leaves using Oscillatoria annae for the production of ethanol 

Jeevitha P, Jenifermercy J, Muthuselvi S, Rohini R, Pratheeba CN, Ashokkumar B, Sivakumar N, Pandi M and Varalakshmi P 

National Seminar on “Biodiversity conservation and management of Aquatic Resources” 

09th &10th December 2010 

Thoothukudi 

Pseudomonas reactans Cmst P1, a slightly halophilic pigmented bacterium isolated from Pantri estuary, Tamil Nadu 

Ajikumar AJ, Sivakumar N, Pandi M, Varalakshmi P and Ashokkumar B. 

National Seminar on “Biodiversity conservation and management of Aquatic Resources” 

09th &10th December 2010 

Thoothukudi 

Cyanobacterial abundancy and diversity in coastal wet lands of Kanyakumari District, Tamil Nadu (India) 

Viji V, Satheesh S, Sivakumar N, Varalakshmi P, Ashokkumar, B and Pandi, M 

International conference on genomic sciences – Recent trends 

2010  MKU, Madurai 

Production of biodiesel from cyanobacteria (Oscillatoria annae) by alkali and enzyme mediated transesterification 

Vimalarasan A, Ashokkumar B, Pratheeba CN, Sivakumar N, Varalakshmi P 

Caenorhabditis elegans Meeting 

2009  USA  Vitamin metabolism in a knockout mutant of the folate transporter folt-1. 

Rothman J, Liau W, Ashokkumar B, Said HM, LaMunyon CW. 

17th International 

DDW International conference

2008  USA  Enteropathogenic Escherichia coli inhibits vitamin B1 (Thiamin) transport in human intestinal epithelial cells.  

Ashokkumar B and Said HM 

DDW International conference 

2007  USA   Cloning and functional characterization of a folate transporter from the nematode, Caenorhabditis elegans 

Balamurugan K, Ashokkumar B, Moussaif M, Sze JZ and Said HM 

 

                      CONFERENCE/WORKSHOP/SEMINAR/TRAINING ORGANIZED 

 Type  Name  Date(s)  Place  Role Played  Funding 

Agency 

Workshop  International workshop on Rewiring anaerobic microbial 

Process for energy and environment 

03.01.2018  Madurai Kamaraj University, Madurai 

Co‐convenor  Madurai Kamaraj University, Madurai 

Refresher Course 

Science Academies Refresher Course on ‘Modern 

Biotechnology: concepts and practice 

May 15‐29, 2013 

Madurai Kamaraj University, Madurai 

Co‐ordinator  Indian Academy of Sceinces, Bangalore 

Lecture workshop 

Recent Advances in Biotechnology of Health and 

Disease 

October 7‐8, 2011 

Madurai Kamaraj University, Madurai 

Co‐ordinator  Indian Academy of Sceinces, Bangalore 

 

 

                      BOOK PUBLISHED 

 Title of the Book / 

Chapter 

Author  Publisher  Year  ISBN Number 

Functional genomics of riboflavin transport: genes and regulatory mechanisms. Current Developments in Biotechnology and Bioengineering  

Udhayabanu T, Gandhimathi K, Varalakshmi P and Ashokkumar B 

Elsevier Publishers  

2017  978‐0‐444‐63667‐6 

Microbial fuel cells: a promising alternative energy source 

Lincy MJA, Ashokkumar B, Vasantha M and Varalakshmi P 

Apple Academy Press, USA 

2015  978‐1‐77188‐109‐8 

Antifouling Activity of Prodigiosin from Estuarine Isolate of Serratia marcescens CMST 07 

Ananda Priya K, Satheesh S, Ashokkumar B, Varalakshmi P, Selvakumar G and Sivakumar N 

Springer, India 

2013   978‐81 ‐322‐1086‐2 

Cyanobacteria in diverse environment: A prolific source for bioactive metabolites 

Sivakumar N, Ashokkumar B and Varalakshmi P 

VL Media Solutions, India 

2013  978‐93 ‐80820‐17‐0 

Optimization of medium for the production of inulinase from Enterobacter aerogenes by response surface methodology 

Agalya S, Dinakaran T, Vijayanand K, Dinesh Kumar S, Ashokkumar B, Sivakumar, N and Varalakshmi P 

SBW Publishers, New Delhi, 

India 

2014  978‐81‐8570‐8300 

Biosorption of Malachite Green (azo dye) by Oscillatoria chlorina: Kinetics, equilibrium isotherm and FTIR studies 

Saravanan N, Ashokkumar. B, Sivakumar N and Varalakshmi P. 

SBW Publishers, New Delhi, 

India 

2014  978‐81‐8570‐8300 

Purification and Characterization of β‐fructofuranosidases from Aspergillus niger in Submerged and Solid‐state Fermentation   

Ashokkumar B, Senthilkumar SR and Gunasekaran P 

Asiatech Publishers,      New Delhi, 

India 

 

2005  10: 8187680148

  

 MEMBERSHIP IN  ACADEMIC BODIES  

Member,  Rashtriya  Ucchatar  Shiksha  Abhiyan  (RUSA), Madurai  Kamaraj  University  (since 2017)  

Member, Internal Quality Assurance Cell (IQAC), Madurai Kamaraj University (since 2017)  

Member, Centre for Intellectual Property Rights, MKU, Madurai (since 2017) 

Member, MOU action and follow‐up committee, MKU, Madurai (since 2017) 

Member, Hand Book committee, MKU, Madurai (since 2017) 

Editor, 52nd Annual Report‐2017, MKU, Madurai (since 2017) 

Member, Swachhta Pakhwada committee, MKU, Madurai (since 2017) 

Joint Co‐Ordinator, Solar Power Panel Committee, MKU, Madurai (since 2017) 

Member, University Public Nursery & Primary School Committee, MKU, Madurai (since 2017) 

Member, Board of Studies in UG/PG Biotechnology, Madurai Kamaraj University (Since 2017) 

Member, Board of Studies in UG/PG Microbiology, Madurai Kamaraj University (Since 2017) 

 

 

 

Tamil Nadu  State Council of Higher Education Advisory Committee Nominee, Vivekananda College, Agastheeswaram (Since 2016) 

Subject Expert, Board of Studies  in M. Sc Microbiology, Ayya Nadar  Janaki Ammal College, Sivakasi, India (Since 2015) 

Course Coordinator, DBT supported M. Sc Biotechnology teaching program (2014‐2015) 

Member, Board of Studies in M. Phil Botany, SN College, Madurai, India (Since 2015) 

Course Coordinator, M. Sc Computational Biology (since 2014) 

Member, Institutional Biosafety Committee, Madurai Kamaraj University (Since March 2016) 

Member, Patent Cell, MKU, Madurai (since 2013‐2016) 

Member, MKU Alumni Association (since 2013) 

Member, Purchase Committee, School of Biotechnology, MKU (2013‐2017) 

Member,  Rashtriya  Ucchatar  Shiksha  Abhiyan  (RUSA), Madurai  Kamaraj University  (2013‐2016)  

Member, Subject‐in charge, M. Sc Biotechnology, Madurai Kamaraj University P.G. Extension Centre, Virudhunagar (from 2013)  

Academic  Council  Nominee,  M.  Phil  Microbiology  Board  of  Studies,  VHNSN  College, Virudhunagar, India (2012 – 2014) 

Member, Board of  Studies  in M.  Sc Microbiology & Biotechnology,  SVN College, Madurai, India (Since 2012) 

                    MEMBERSHIP IN  PROFESSIONAL BODIES  

Life member, The Biotech Research Society (BRSI), India 

Life member, Society for Biological Chemists, Bangalore (since 2017) 

European Federation of Biotechnology, Spain (since 2005)  

Life member, Emerging Frontiers at the Interface of Chemistry and Biology (ICB), India 

Member, MKU Newsletter ‘Reflections’ 

Associate Editor‐MKU International Journal of Science and Technology 

Editorial board member‐Frontiers in Bioengineering and Biotechnology  

Editorial board member‐International Journal of Cancer Biology 

Editorial board member‐Journal of Neurology Forecast 

Editorial board member‐Annals of Medical Case Reports 

Editorial board member‐SM Journal of Genetic Syndromes and Gene therapy  

 

 

                       INTELLECTUAL PROPERTY RIGHTS (Patents)  

Varalakshmi  P,  Shakambari  G,  Ashokkumar  B.  2016.  Novel  compound  from  class  of phlorotannins extracted from Turbinaria ornata with potential to inhibits advanced glycation end products  (AGE’s) confirmed  in hyperglycemic C. elegans as animal model. DOCKET NO: 54297. (Application Number 201641043641). 

 

Varalakshmi  P,  Shakambari  G,  Ashokkumar  B.  2017  A  novel  compound  of  phlorotannins class,  extracted  from  Padina pavonica with  potential  to mitigate  advanced  glycation  end products (AGE’s) formation in hyperglycaemic C. elegans. DOCKET NO:59584. 

                    ADMINISTRATIVE EXPERIENCE 

 Role Played  Responsibilities

 Period  ( Month & Year)

Member, RUSA, MKU  Financial plan development and implementation, preparing and processing tenders  

Since 2013 

Member, IQAC, MKU  Planning, execution, supervision and documentation of  various activities that are necessary to increase the quality of the education in the University 

Since 2017 

Joint Co‐Ordinator, Solar Power Panel Committee, MKU, Madurai (since 2017 

Writing proposal for external funding and its implementation 

Since 2017 

Member, CIPR, MKU  Evaluation of submitted patents  Since 2017 

Member, University Public Nursery & Primary School Committee, MKU 

Monitoring overall functioning of the school 

Since 2017 

TANSCHE Advisory Committee Nominee, Vivekananda College, Agastheeswaram 

Progress evaluation of vocational courses and appointing teaching faculty 

Since 2016 

Course Co‐ordinator M. Sc Biotechnology 

Duties include course planning, class scheduling, selection of educational resources, assessment, students’ learning outcomes, course evaluation, financial management and auditing 

2014‐2015 

Course Co‐ordinator M.Sc Computational 

Duties include course planning, designing, class scheduling, selection of educational 

Since 2014 

 

 

Biology  resources, assessment, students’ learning outcomes, course evaluation,  financial management and auditing  

Member, School Purchase Committe 

Overseeing purchase of consumables and equipments   

2012‐2017 

  

                    CONTACT 

                       Name                      :  B. Ashokkumar                        Department           :  Genetic Engineering                        School                     :  Biotechnology                        Mobile No              :  +91 9976147644                        E‐Mail Id                 :  [email protected] / [email protected]                        Ext                           :  0452 2459115