Banche di informazioni genetiche Banche di informazioni genetiche relative all’uomorelative all’uomo: situazione in : situazione in

Italia e nelle altre nazioniItalia e nelle altre nazioni

Alberto PiazzaAlberto PiazzaDipartimento di Genetica, Biologia e BiochimicaDipartimento di Genetica, Biologia e Biochimica

Università di TorinoUniversità di Torinoalberto.piazza@unito.italberto.piazza@unito.it

La conoscenza come bene pubblico comune: software, dati, La conoscenza come bene pubblico comune: software, dati, saperi - Torino, 17-18 novembre 2003saperi - Torino, 17-18 novembre 2003

What is a genetic database?What is a genetic database?

• DEFINITION ( by The United Kingdom Parliament – House of Lords - Science and Technology Fourth Report, 2001)

• “Collections of genetic sequence information, or of human tissue from which such information might be derived, that are or could be linked to named individuals“

• We included in this definition not only genetic data but also human tissue - and this needs explicitly to include other biological samples (such as blood, saliva and other body fluids). For the foreseeable future, it is inevitable that only a very small proportion of each individual's genetic data will be available on databases. Recourse to the original sample will be required from time to time to obtain further genetic information, giving rise to ethical problems

Collections of genetic sequence information http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/

A Human Genome Diversity Cell Line PanelA Human Genome Diversity Cell Line PanelHoward M. Cann, Claudia de Toma, Lucien Cazes, Marie-Fernande Legrand, Valerie Morel, Laurence Howard M. Cann, Claudia de Toma, Lucien Cazes, Marie-Fernande Legrand, Valerie Morel, Laurence

Piouffre, Julia Bodmer, Walter F. Bodmer, Batsheva Bonne-Tamir, Anne Cambon-Thomsen, Zhu Piouffre, Julia Bodmer, Walter F. Bodmer, Batsheva Bonne-Tamir, Anne Cambon-Thomsen, Zhu Chen, Jiayou Chu, Carlo Carcassi, Licinio Contu, Ruofu Du, Laurent Excoffier, Jonathan S. Chen, Jiayou Chu, Carlo Carcassi, Licinio Contu, Ruofu Du, Laurent Excoffier, Jonathan S.

Friedlaender, Helena Groot, David Gurwitz, Rene J. Herrera, Xiaoyi Huang, Judith Kidd, Kenneth K. Friedlaender, Helena Groot, David Gurwitz, Rene J. Herrera, Xiaoyi Huang, Judith Kidd, Kenneth K. Kidd, Audre Langaney, Alice A. Lin, S. Qasim Mehdi, Peter Parham, Alberto Piazza, Maria Pia Pistillo, Kidd, Audre Langaney, Alice A. Lin, S. Qasim Mehdi, Peter Parham, Alberto Piazza, Maria Pia Pistillo, Yaping Qian, Qunfang Shu, Jiujin Xu, S. Zhu, James L. Weber, Henry T. Greely, Marcus W. Feldman, Yaping Qian, Qunfang Shu, Jiujin Xu, S. Zhu, James L. Weber, Henry T. Greely, Marcus W. Feldman,

Gilles Thomas, Jean Dausset, and L. Luca Cavalli-SforzaGilles Thomas, Jean Dausset, and L. Luca Cavalli-SforzaScienceScience 2002 296:261-262 2002 296:261-262

Principal features of existing databasesPrincipal features of existing databases

1. All the databases were medical, with the exception of the Forensic Science Service. 2. The databases were largely maintained by university medical researchers, usually

with funding from public agencies and medical research charities. Commercial pharmaceutical companies also maintained genetic databases.

3. The collections held tissue or biological samples (such as blood), sometimes with small amounts of sequenced DNA - no-one was yet collecting large databases of sequenced DNA data on individuals.

4. Any sequenced DNA data was restricted to narrow regions of particular chromosomes, especially genes.

5. The medical genetic databases had one of three main purposes: a)  to identify genes and genetic variations that were involved in a particular

disease; b)  to investigate gene/environment interactions; or c)  to evaluate medical treatments. 6. The collections were almost always from patients who suffered from the particular

disease of interest. Using such data for research into unrelated diseases would not usually be worthwhile: the sample populations were not representative of wider society or of other patient groups.

7. Studies of diseases with environmental and genetic factors tended to have wider potential applications. The wide range of diseases and factors that might be studied, and the inclusion of environmental information (and maybe more social identifiers), perhaps meant that consent and data protection had more prominence in these projects than in studies using small-scale, single disease databases.

THE EXPERIENCE OF ITALY - 1THE EXPERIENCE OF ITALY - 1

THE EXPERIENCE OF ITALY - 2THE EXPERIENCE OF ITALY - 2

THE EXPERIENCE OF OTHER COUNTRIESTHE EXPERIENCE OF OTHER COUNTRIES (J. Kaiser J. Kaiser ScienceScience 298:1158-1161, 2002 www.sciencemag.org) 298:1158-1161, 2002 www.sciencemag.org)

Caratteristiche di alcune banche Caratteristiche di alcune banche d’informazione geneticad’informazione genetica

(“biobanche”) (“biobanche”)

• Islanda: Health Sector Database

• Regno Unito: Biobank• Estonia: Estonian Genome

Project• Canada Québec: CART@GENE

Islanda: Islanda: Health Sector DatabaseHealth Sector Database

(http://brunnur.stjr.is; (http://brunnur.stjr.is; http://www.decode.com;http://www.decode.com;

http://www.mannvernd.is)http://www.mannvernd.is)• 1998 : Database Act approvato dal Parlamento islandese con un consenso di circa il 70% della popolazione

• 2000 : deCODE Genetics ha la licenza di archiviare le informazioni genetiche e mediche di 275.000 islandesi in un periodo di 12 anni.

• Consenso : presunto, facoltà di non partecipazione da esprimere entro sei mesi, non estesa alle persone decedute ed ai minori. Facoltà di ritirarsi non consentita una volta che i dati sono resi anonimi.

• Riservatezza dei dati : alberi genealogici, mancanza di protezione nei confronti degli utenti commerciali e governativi.

• Esclusività dei diritti di utilizzazione : monopolio della deCODE, difficoltà di competizione da parte di ricercatori indipendenti

Regno Unito: UK BiobankRegno Unito: UK Biobank(http://www.ukbiobank.ac.uk)(http://www.ukbiobank.ac.uk)

• In fase di attuazione, su iniziativa del Medical Research Council e del Wellcome Trust

• Scopo: esaminare il DNA di circa 500.000 volontari dai 45 ai 69 anni distribuiti a livello regionale per comprendere: a) l’influenza di geni particolari sul decorso o la gravità di una malattia; b) il numero di persone che hanno una specifica mutazione genetica e che perciò hanno un rischio più o meno grande di contrarre una malattia; e c) l’influenza della interazione tra geni e fattori esterni (ambientali?) sulle cause di malattia.

• Riservatezza: separazione delle informazioni anagrafiche e genetiche

• Consenso: scritto e informato sui diversi aspetti della ricerca; possibilità di ritirarsi in qualsiasi momento

• Possibilità di avere informazioni sul proprio stato di salute• Le assicurazioni private ed altri organismi non avranno accesso

alle informazioni• Divulgazione dei risultati sotto forma di articoli scientifici o su web

Estonia: Estonian Genome ProjectEstonia: Estonian Genome Project(http://www.geenivaramu.ee)(http://www.geenivaramu.ee)

• Giugno 2000 : Estonian Genome Foundation• Dicembre 2000 : Human Genes Research Act• Scopo: banca di informazione “fenotipica e genotipica” al fine di effettuare

ricerche sullo stato di salute e sui geni di circa 1 milione di Estoni (70% del totale) archiviando campioni dei loro tessuti per isolare i geni che causano o influenzano le malattie più diffuse.

• Responsabile del Progetto: Estonian Genome Foundation.• I diritti del trattamento delle informazioni sono delegati alla società pubblica a

responsabilità limitata EGeen autorizzata per contratto e su delega della Fondazione alle condizioni prescritte dalla legge.

• Consenso: Ogni individuo può scegliere se partecipare al Progetto. In qualsiasi momento può ritirarsi rinunciando alle informazioni genetiche che lo riguardano dal momento che viene distrutta l’ identificazione del suo campione.

• La banca dei dati genetici potrà servire sia per fini scientifici sia per fini personali: se lo desidera, il donatore ne riceverà gratuitamente le informazioni.

• La riservatezza dei partecipanti è assicurata separando le informazioni anagrafiche da quelle genetiche mediante un codice conosciuto solo all’interno della Fondazione ma permettendo – su richiesta del donatore o del suo medico – il loro linkage.

Canada Québec:Canada Québec:Il Progetto CART@GENEIl Progetto CART@GENE

(http://www.rmga.qc.ca)• Il progetto CART@GENE è stato elaborato da ricercatori del Réseau

de Médecine Génétique Appliquée (RMGA) nell’ottica di «aider les chercheurs à mieux comprendre l’influence du patrimoine génétique sur la santé et la susceptibilité aux maladies communes telles le cancer, les maladies du cœur et le diabète. »

• Il progetto intende elaborare la prima carta genetica del Québec in Canada. Secondo i promotori del progetto, i benefici per la scienza sarebbero i seguenti :

“ 1. Trouver l’origine génétique de maladies complexes comme les maladies de cœur, les problèmes de santé mentale, etc. 2. Identifier des gènes de protection contre les maladies courantes

3. Orienter la recherche vers de nouveaux traitements 4. Mieux affecter les ressources de soins de santé sur le territoire 5. Applications pour les historiens et sociologues afin de mieux

comprendre les mouvements et migrations de populations.”

• Il progetto conta sulla partecipazione volontaria di 50.000 abitanti del Québec di età compresa tra i 25 e i 74 anni, che costutuisce un campione rappresentativo di circa l’un per cento della popolazione generale.

http://www.ethique.gouv.qc.ca/fr/publications.html

BIOBANCHE GENETICHE PROPOSTA DI LINEE GUIDA

SOCIETA’ ITALIANA DI GENETICA UMANAGRUPPO DI LAVORO: “BIOBANCHE GENETICHE”

FONDAZIONE TELETHONSERVIZI ALLA RICERCA

INDICEINDICE1 PREMESSA1 PREMESSA 22BIOBANCHE GENETICHEBIOBANCHE GENETICHE 2.1 Definizione e caratteristiche 2.2 Finalità33BENEFICI PER LA COMUNITBENEFICI PER LA COMUNITÀÀ44ASPETTI ETICIASPETTI ETICI 4.1 Consenso informato 4.1.1 Modalità di richiesta del consenso 4.1.2 Modalità di utilizzo dei campioni, in assenza di consenso informato scritto 4.1.2.1 Campioni prelevati da individui non abili a dare il consenso 4.1.2.2 Campioni prelevati da aborti 4.1.2.3 Campioni provenienti dall’estero 4.2 Tutela e gestione della riservatezza 4.2.1 Registrazione del campione 4.2.2 Archiviazione dei dati 4.3 Implicazioni sulla proprietà e l’utilizzo dei campioni55ORGANIZZAZIONEORGANIZZAZIONE 5.1 Requisiti strutturali e tecnologici 5.2 Personale66TIPOLOGIA DI CAMPIONI CONSERVATITIPOLOGIA DI CAMPIONI CONSERVATI77SERVIZISERVIZI 7.1 Accesso al servizio 7.1.1 Scheda per la raccolta dei dati del paziente 7.1.2 Acquisizione dei campioni 7.2 Deposito del materiale biologico 7.3 Distribuzione 7.4 Procedure per assicurare la qualità dei campioni88APPENDICEAPPENDICE 8.1 Modulo di richiesta 8.2 Consenso informato per la conservazione di materiale biologico 8.3 Modulo di deposito