Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics...

47
Quality Control of scRNAseq data Åsa Björklund [email protected]

Transcript of Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics...

Page 1: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QualityControlofscRNAseqdata

ÅsaBjörklund [email protected]

Page 2: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Outline

•  Backgroundontranscriptionalbursting&drop-outs•  Experimentalsetup–whatcouldgowrong?•  Spike-inRNAs•  Qualitycontrol:

–  Filteringlowqualitycells–  Doubletcells–  AmbientRNAeffects–  Filteringofgenes

•  PCAforqualitycontrol

Page 3: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Transcriptionalbursting

•  BurstfrequencyandsizeiscorrelatedwithmRNAabundance•  ManyTFshavelowmeanexpression(andlowburstfrequency)andwillonlybe

detectedinafractionofthecells

(Suteretal.Science2011)

Page 4: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Gene 1Gene 2Gene 3Gene 4

DissociateBias due to cell type/state

Stochastic gene expression

BulkRNAseq

Reverse transcription“random” selection of 10-40% of mRNAs- Drop-outs

AmplificationMay have bias due to length, structure, gc-content

20% Gene 150% Gene 225% Gene 35% Gene 4

0% Gene 155% Gene 225% Gene 320% Gene 4

20% Gene 130% Gene 250% Gene 30% Gene 4

Bursting,drop-outsandamplificationbias

Page 5: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

ProblemscomparedtobulkRNA-seq

•  Amplificationbias•  Drop-outrates•  Transcriptionalbursting•  Backgroundnoise•  Biasduetocell-cycle,cellsizeandotherfactors•  Oftenclearbatcheffects

(Karchenkoetal.NatureMethods2014)

Page 6: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

scRNA-seqanalysisoverview

Mapping&Geneexpressionestimate

QC:RemovelowQcells

Removecontaminants

Data:Expressionprofiles

Rawdata:fastqfiles

Definingcelltypes/lineages

Genesignatures

Verificationexperiments

•  Clusteringmethods

•  Trajectoryassignment

•  Datanormalization•  Genesetselection•  Batcheffectremoval•  Removalofother

confounders

Visualization/Dimensionalityreduction

Page 7: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Experimentalsetup

Singlecellcapture

Singlecelllysis

Reversetranscription

Preamplification

Librarypreparationandsequencing

Celldissociation

Whatcouldgowrong?

Page 8: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Experimentalsetup

(Kolodziejczyketal.2015)

ItiscriticaltohavehealthywholecellswithnoRNAleakage.Shorttimefromdissociationtocell!Tissuesthatarehardtodissociate:

Lasercapturemicroscopy(LCM)Nucleisorting

PROBLEMS:•  Incompletedissociationcangivemultiplecellssticking

together.•  Toharshdissociationmaydamagecells->RNAdegradationand

RNAleakage.•  LeakageofRNA–backgroundsignal.

Singlecellcapture

Singlecelllysis

Reversetranscription

Preamplification

Librarypreparationandsequencing

Celldissociation

Page 9: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Dissociationartifacts

•  Dissociationmaybiasyourcellpopulations•  Dissociationprotocolsmayintroducetranscriptionalchanges.

(vandenBrinketal.Naturemethods2017)

Page 10: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

AmbientRNA

SamplefromDay3havedetectionofNeutrophilmarkersinallcells.PossiblycontaminationfromambientRNA.

Page 11: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

AmbientRNA

•  Usingemptydroplets,estimatebackgroundsignal–giveswarningincellrangerreport.

•  SoupX(YoungMD,BiorXiv2018)

Page 12: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Experimentalsetup

(Kolodziejczyketal.2015)

PROBMLEMS:•  Allthesemethodsmaygiverisetoemptywells/droplets,and

alsoduplicatesormultiplesofcells.•  Sizeselectionbiasformanyofthemethods– dropseqhas

upperlimitforcellsize.•  Biasedselectionofcertaincelltype(s)•  Longtimeforsortingmaydamagethecells

Singlecellcapture

Singlecelllysis

Reversetranscription

Preamplification

Librarypreparationandsequencing

Celldissociation

Single-cell transcriptomics protocols overview

Kolodziejczyk et al, 2013

Page 13: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

DoubletsinscRNAseq

Page 14: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Celldebrismaycausedoubletsignatures

Refrozensamples

Lowqualitysample

Percen

tdou

blets

Predicteddoubletsbasedoncelltypesignatures

Page 15: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

DoubletsinscRNAseq

•  Canbedistinctcluster•  Canbeastreakbetweenclusters.

(McGinnisetal.BioRxiv2018)

Page 16: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Detectingduplicate/multiplecells

•  HighnumberofdetectedgenesorUMIs–canbeasignofmultiples–  But,bewaresothatyoudonotremoveallcellsfromalargercelltype.

•  Afterclustering–checkifyouhavecellswithsignaturesfrommultipleclusters.

•  Acombinationofthose2featureswouldindicateduplicates.

•  With10Xyoushouldhaveafeelingforyourdoubletratebasedonhowmanycellswereloaded

Page 17: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Doubletdetectors

•  DoubletFinder-https://github.com/chris-mcginnis-ucsf/DoubletFinder

•  Scrublet-https://github.com/AllonKleinLab/scrublet•  DoubletDecon-https://github.com/EDePasquale/DoubletDecon

•  DoubletCluster/DoubletCellinScran

Page 18: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Experimentalsetup

(Kolodziejczyketal.2015)

Optimallysisconditionsmayvaryfromcelltypetocelltypeandfornucleivscells.PROBLEMS:•  Toharshlysisconditionsmayinterferewithlibraryprep.•  Differentlysisconditionsmay/maynotgivenuclearlysis.

Singlecellcapture

Singlecelllysis

Reversetranscription

Preamplification

Librarypreparationandsequencing

Celldissociation

Page 19: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Experimentalsetup

(Kolodziejczyketal.2015)

Efficiencyofreversetranscriptionisthekeytohighsensitivity.Drop-outrateisaround90-60%dependingonthemethodused.Twolibrarieswiththesamemethodusingthesamecelltypemayhaveverydifferentdrop-outrates.

Singlecellcapture

Singlecelllysis

Reversetranscription

Preamplification

Librarypreparationandsequencing

Celldissociation

Single-cell transcriptomics protocols overview

Kolodziejczyk et al, 2013

Page 20: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Experimentalsetup

(Kolodziejczyketal.2015)

Singlecellcapture

Singlecelllysis

Reversetranscription

Preamplification

Librarypreparationandsequencing

Celldissociation

Single-cell transcriptomics protocols overview

Kolodziejczyk et al, 2013

Anyamplificationstepwillintroduceabiasinthedata.MethodsthatusesUMIswillcontrolforthistoalargeextent,butthechanceofdetectingatranscriptthatisamplifiedmoreishigher.FulllengthmethodslikeSmartSeq2hasnoUMIs,sowecannotcontrolforamplificationbias.

Page 21: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Experimentalsetup

(Kolodziejczyketal.2015)

Singlecellcapture

Singlecelllysis

Reversetranscription

Preamplification

Librarypreparationandsequencing

Celldissociation

Multiplexingofsampleswillnotalwaysbeperfect,sothenumberofreadspercellmayvaryquitealot.Basecallsinthesequencingmaybeeffectedbyanumberoffactors:•  Lowcomplexityoflibrary–maybeanissuewheythereare

manyprimerdimers•  Basecallqualityscoresmaybeeffectedifthereare

contaminationsintheflowcellIndexswapping

Page 22: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Spike-inRNAs

(Vallejosetal.PLOSCompBiol2015)

Externalmoleculesaddedinaknownconcentration.•ERCC:–92bacterialRNAspecies,differentlengths,GCcontents–22abundancelevels,2mixesforfold-changeaccuracyassessment•SIRV:–69artificialtranscripts–Mimichumangenes–Usedforisoformsdetection

Page 23: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Spike-inRNAs

(Brenneckeetal.NatureMethods2013)(Tungetal.ScientificReports2017)

Spike-inscanbeusedtomodel:•  Technicalnoise•  Drop-outrates/captureefficiency•  StartingamountofRNAinthecell•  Datanormalization

Problems:•  Spike-insbehavedifferentlyto

endogenousgenes•  Cannotbeusedindrop-seqmethods

Page 24: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QC-metrics

– Mappingstatistics(%uniquelymapping)–  Fractionofexonmappingreads–  3’bias–forfulllengthmethodslikeSS2–  mRNA-mappingreads–  NumberofUMIs/reads–  Numberofdetectedgenes–  Spike-indetection– Mitochondrialreadfraction,ribosomalreadfraction–  rRNAreadfraction–  Pairwisecorrelationtoothercells

Page 25: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QC-metrics

–  Numberofreads– Mappingstatistics(%uniquelymapping)–  Fractionofexonmappingreads–  mRNA-mappingreads(vsothertypesofgeneslikerRNA,sRNA,noncoding,pseudogenesetc.)

Lownumberofreads–maynothaveenoughinformationforthatcell.Badmappingmaybeanindicationofafailedlibraryprep.LowcontentofmRNAswillleadtomoreprimerdimersandmorespuriousmappingandfewermappingreads.

Page 26: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QC-metrics

–  Spike-indetection–  Spike-inratio

Ifthenumberofspike-inmoleculesthataredetectedislow,thisisaclearlyfailedlibraryprep.Proportionofcelltospike-inreadsisanindicationofthestartingamountofRNAfromthecell.LowamountofcellRNAcanindicatebreakageorjustasmallercell.

Page 27: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QC-metrics

–  Numberofdetectedgenes

Numberofdetectedgenesclearlycorrelatestothesizeofthecells,sobecarefulifyouareworkingwithcellswithveryvaryingsizes.Highnumberofdetectedgenesmaybeanindicationofduplicate/multiplecells.Butcanalsobealargercelltype.

uniquemap 9 cells removed, cutoff 8.3711

05

1015

2025

30

3.5 16.5 31.5 46.5 61.5 76.5

mismatch/indel 26 cells removed, cutoff 0.7076

010

2030

4050

60

0.23 0.57 0.91 1.25 1.59

exonmap 20 cells removed, cutoff 0.6052

010

2030

4050

6070

0.015 0.225 0.435 0.645 0.855

3primemap 13 cells removed, cutoff 0.0856

050

100

150

200

250

300

0.0225 0.0925 0.1625 0.2325

normreads 16 cells removed, cutoff 100000.0000

010

2030

4050

50000 1750000 3650000 5550000

gene_detection 14 cells removed, cutoff 0.0949

010

2030

4050

60

0.035 0.175 0.315 0.455 0.595

total 48 samples failed QCTotal samples: 722

Failedlibraries Multiplecells

OK

Page 28: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QC-metrics

•  Cellsize,spike-inratioandnumberofdetectedgenesareclearlycorrelated

● ●

●●

●●●

●●

● ●

●●

●●●

●●

● ●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

● ●

●●

●●

●●●

●●

● ●

●●

●●

●●

●●

●●

●●●

●●

● ●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

2 4 6 8 10 12

50000

60000

70000

80000

ERCC−ratio vs FSCPearson=0.6133

Spearman=0.6365

ERCC−ratio

FSC

● ●

●●●

●●

● ●

●●

●●

●●

● ●●

●●

●●

●●●

● ●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

● ●

●●

● ●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

● ●

●●

●●

●●

● ●

●●

●●

●●

●●

●●●

● ●

●●

●● ●

●●

●●●

●●

●●

● ●

●●

●●●

●●

●●

●●

●●

●●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

●●

2 4 6 8 10 12

2000

3000

4000

ERCC−ratio vs nDetPearson=0.8203

Spearman=0.8407

ERCC−ratio

nDet

FCS–ForwardScatteringfromFACS

Page 29: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QC-metrics

– Mitochondrialreadfraction

Suggestedthatwhenthecellmembraneisbroken,cytoplasmicRNAwillbelost,butnotRNAsenclosedinthemitochondria.HighcontentofmitochondrialRNAmayindicateapoptosis.

Page 30: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QC-metrics

–  RibosomalRNAreadfraction–  Ribosomalproteinreadfraction

PossiblethatdegradationofRNAleadstomoretemplatingofrRNA-fragments.Proportionribosomalproteinsmaybeanartifactfromhandlingofsamplesforcellsofthesamecelltype.

Page 31: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QC-metrics

–  3’bias(degradedRNA)–forfulllengthmethodslikeSS2

Notdegraded Degraded

0 20 40 60 80 100

1e+0

52e

+05

3e+0

54e

+05

5e+0

56e

+05

percentile of gene body (5'−>3')

read

num

ber

0 20 40 60 80 100

5000

0010

0000

015

0000

020

0000

025

0000

030

0000

035

0000

0

percentile of gene body (5'−>3')

read

num

ber

Lookatproportionofreadsthatmapstothe10-20%most3’endofthetranscript

Page 32: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

QC-metrics

–  Numberofreads– Mappingstatistics(%uniquelymapping)–  Fractionofexonmappingreads–  mRNA-mappingreads–  3’bias–forfulllengthmethodslikeSS2–  mRNA-mappingreads–  Numberofdetectedgenes–  Spike-indetection– Mitochondrialreadfraction–  rRNAreadfraction–  Pairwisecorrelationtoothercells

Page 33: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Howtofiltercells

•  Normally,mostoftheseqc-metricswillshowthesametrends,soitcouldbesensibletouseacombinationofmeasures.

•  Lookatthedistributionsbeforedecidingoncutoffs.

Page 34: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Howtofiltercells

•  CanusePCAbasedonQC-metricstoidentifyoutliercells.(Scaterpackage)

Page 35: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

DropSeq-nUMIvsnGene

Page 36: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Decidingoncutoffsforfiltering

•  Doyouhaveahomogeneouspopulationofcellswithsimilarsizes?

•  Isitpossiblethatyouwillremovecellsfromasmallercelltype(e.g.redbloodcells)

•  ExaminePCA/tSNEbefore/afterfilteringandmakeajudgmentonwhethertoremovemore/lesscells.

Page 37: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Howtofiltergenes

•  Inmostcases,allgenesarenotusedindimensionalityreductionandclustering.

•  Genesetselectionbasedon:–  GenesexpressedinXcellsovercutoffY.–  Variablegenes–usingspike-insorwholedistribution.–  Filteroutgeneswithcorrelationtofewothergenes–  Priorknowledge/annotation–  DEgenesfrombulkexperiments–  TopPCAloadings

Page 38: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Lookattotalcontributiontoexpression

•  Sometimesindividualgenesmayhaveveryhighexpression–maybeproblematicfornormalization.

LookoutforMALAT1andothernuclearlincRNAs.Mitochonrialorribosomalgenes,actinandhemoglobin.

Page 39: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Lookattotalcontributiontoexpression

•  MALAT1clearlycorrelateswithpercentmitochondrialgenesinsomesamples.

LookoutforMALAT1andothernuclearlincRNAs.Mitochonrial,ribosomalgenes,actinandhemoglobin.

Page 40: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Removalofgenesbeforeanalysis

•  Mitochondrialencodedgenes–oftenmainlytechnicalbias.

•  Genessuspectedtobetechnicalbias•  Genesthatmaynotcontributetocelltypevariation(e.g.ribosomalgenes)

Page 41: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Batcheffects

•  Canbebatcheffectsper–  Experiment–  Animal/Patient/Batchofcells–  Sortplate–  Sequencinglane

•  CheckifQC-measuresdeviatesforanyofthosemeasures

•  CheckinPCAifanyPCcorrelatestobatches– Scatertutorial

Page 42: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Alsocheckifyourdifferentqc-measuresaredifferentbetweenbatches.

Page 43: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

PCAforQC

•  OneofthefirstPCswill(always)correlatewithnumberofdetectedgenes

Red–highnumberofdetectedgenesGreen-low

PC10.062

−100 0 50

*

*

* *

*

*

*

*

***

*

*

*** *

**

*

*

**

**

*

*

****

**

***

*

****

*

**

*

*

**

*

**

****

**

*

*

*

**

*

*

**

** *** *

** *

***

*

*

*

*

*

****

****

*

**

***

*

*

***

*

*

*

**

*

**

* **

** *

***

***

*

**

*

**

*

*

* **

*

**

**

*

*

**

*

*

**

*

*

** *

*

*

*

*

**

*

*

*

***

*

*

*

* *

*

*

**

*

*

*

**

**

*

*

*

*

**

*

*

**

***

*

*

***

*

*

**

**

*

*

***

***

*

***

*

***

*

*

**

*

*

*

*

*

*

**

**

*

*

*

* **

**

**

*

**

*

**

* *

*

**

*

*

**

*

*

*

* *

*

****

*

*

**

*

**

**

*

**

*

**

*

*

**

*

*

* **

*

*

**

*

** * *

*

*

*

**

*

**

**

*

**

*

**

**

*

* **

*

***

**

**

**

* *

*

****

*

*

*

**

*

* *

*

*

**

*

***

*

*

**

*

*

*

*

*

*

**

***

***

***

**

*

* **

** **

*

*

****

**

*

*

*

***

*

**

***

*

***

*

* **

*

* ****

****

**

** *

**

***

***

* **

******

**

**

* ** *

****

*

* ***

*

*

* ***

**

*

* * *

**

*

**

***

*

**

** *

*

*

*

***

***

**

****

** ***

*

*

*

*

**** ***

* *

** ** ***

**

*

*****

***

*

*

*

**

**

***

*

*

**

*** **

*

*

*

****

** **

**

**

*

*

**

*** *

* ****

***

*

** ** **

***

**

**

**

*

**** ** *

**

*

*

*

* *** **

*

****

*

* *

*

****

**** *

**

**

*

*

**

*

*

*

*

***

*

*

**

***

*

*

*

**

**

*

*

****

**

** *

*

*** *

*

**

*

*

* *

*

**

****

**

*

*

*

***

*

**

******

***

***

*

*

*

*

*

***** ** *

*

**

***

*

*

**

*

*

*

*

* *

*

**

* **

** *

** *

***

*

**

*

**

*

*

* **

*

**

* *

*

*

**

*

*

**

*

*

** *

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

*

**

*

*

**

*

*

*

**

* *

*

*

*

*

**

*

*

**

***

*

*

***

*

*

**

**

*

*

***

***

*

***

*

**

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

**

**

*

*

*

**** *

**

*

**

*

**

* *

*

**

*

*

**

*

*

*

* *

*

****

*

*

**

*

* *

**

*

**

*

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

** **

*

*

*

**

*

* *

**

*

**

*

**

* *

*

* **

*

***

**

**

**

* *

*

****

*

*

*

**

*

* *

*

*

**

*

* **

*

*

* *

*

*

*

*

*

*

**

** *

***

* **

**

*

***

****

*

*

*** *

***

*

*

**

*

*

**

**

*

*

* **

*

* ** *

* ****

****

**

***

**

** *

***

* **

*** *

**

**

**

****

***

*

*

* ** *

*

*

** **

**

*

***

* *

*

**

* **

*

**

* **

*

*

*

**

*

**

***

**

***

***

*

*

*

*

*

*******

**

***

*** *

**

*

* * ****

**

*

*

*

**

**

**

**

*

**

*** **

*

*

*

****

*** *

**

**

*

*

**

****

*** **

***

*

*** **

*

* **

*** *

**

*

**

* * ***

* *

*

*

*

* *** **

*

***

*

*

* *

*

**

***

*** ****

*

−150 −50 50

*

*

**

*

*

*

*

***

*

*

**

***

*

*

*

**

**

*

*

*** *

**

* * *

*

*** *

*

**

*

*

* *

*

**

* ***

**

*

*

*

**

*

*

**

** ****

* **

***

*

*

*

*

*

*** *** **

*

**

***

*

*

***

*

*

*

**

*

**

***

** *

***

** *

*

**

*

**

*

*

* **

*

**

**

*

*

**

*

*

**

*

*

***

*

*

*

*

***

*

*

**

*

*

*

*

**

*

*

* *

*

*

*

**

**

*

*

*

*

**

*

*

**

***

*

*

***

*

*

**

**

*

*

** *

***

*

** *

*

***

*

*

***

*

*

*

*

*

**

**

*

*

*

*****

**

*

**

*

**

* *

*

**

*

*

**

*

*

*

**

*

* ***

*

*

**

*

**

**

*

**

*

**

*

*

**

*

*

* **

*

*

**

*

** **

*

*

*

**

*

**

**

*

**

*

**

**

*

** *

*

* **

****

**

**

*

****

*

*

*

**

*

**

*

*

**

*

* **

*

*

* *

*

*

*

*

*

*

**

** *

**

***

***

*

* **

*** *

*

*

****

**

*

*

*

**

*

*

*****

*

***

*

****

* * ***

***

*

**

***

**

* * *

***

***

*****

***

**

** **

****

*

****

*

*

** * *

**

*

***

* *

*

**

****

* *

***

*

*

*

**

*

***

**

**

* **

***

*

*

*

*

*

**** **

*

**

***

******

*

* *** **

**

*

*

*

***

****

*

*

**

**** *

*

*

*

***

*

** **

**

**

*

*

**

*** *

****

*

***

*

** ** *

*

***

**

* *

**

*

*** **

****

*

*

*

*****

*

*

****

*

**

*

**

***

*****

**

*

−300

−100

100

*

*

* *

*

*

*

*

** *

*

*

*** *

**

*

*

**

***

*

* ** *

**

** *

*

* * **

*

**

*

*

**

*

**

* * **

**

*

*

*

**

*

*

**

****

* *

* **

***

*

*

*

*

*

********

*

**

***

*

*

***

*

*

*

**

*

*** *

**

**

***

***

*

**

*

**

*

*

***

*

**

**

*

*

**

*

*

**

*

*

***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

*

**

*

*

**

*

*

*

**

**

*

*

*

*

**

*

*

**

**

*

*

*

** *

*

*

**

**

*

*

***

***

*

***

*

***

*

*

**

*

*

*

*

*

*

**

**

*

*

*

* ****

***

**

*

**

* *

*

**

*

*

**

*

*

*

**

*

* ****

*

**

*

**

**

*

**

*

**

*

*

* *

*

*

* **

*

*

**

*

*** **

*

*

* *

*

**

**

*

**

*

**

**

*

* **

*

***

**

**

* *

**

*

* ***

*

*

*

**

*

**

*

*

**

*

* **

*

*

**

*

*

*

*

*

*

**

** *

***

* **

* *

*

***

*** *

*

*

*** *

**

*

*

*

***

*

**

**

*

*

** *

*

* **

*

** **

*

** **

**

***

**

* **

* **

* **

**

***

***

**

* ** *

***

*

*

****

*

*

* * **

**

*

***

* *

*

****

**

* *

** *

*

*

*

***

***

****

***

* ***

*

*

*

*

***

** **

**

** ** *

* ***

*

* *****

**

*

*

*

**

****

**

*

**

** ***

*

*

*

***

*

** **

**

**

*

*

**

* ***

*** **

***

*

*****

*

** *

**

* *

**

*

*****

* ** *

*

*

*

**** **

*

* **

*

*

**

*

****

** ***

**

**

−100

050

**

***

***

*

*

** *

* ***

*

*

*

***

**

* *** **

* ***

*

*

**

*

*

**

*

***

*

**

*

* *** * *

*

**

*

*

* **

*

**

***

*****

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

**

*

* *

**

*

*

**

**

*

**

*

*

*

*

**

**

* *

**

*

*

*

*

*

*

**

*

*

* *

* *

*

**

*

*

* *

**

*

*

* *

*

*

*

*

*

**

*

*

* *

**

**

* *

*

**

**

**

*

* *

*

**

*

**

*

** *

**

*

*

**

** *

*

*

**

*

*

**

*

**

*

***

*

*

**

*

**

* **

***

*

**

*

*

* *

*

*

**

*

*

* *

**

**

***

**

*

*

*

*

*

*

***

*

**

* *

**

*

**

**

*

**

*

*

* *

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

* *

*

*

*

*

* *

**

**

**

**

* *

**

*

***

* *

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

**

**

*

* ** **

**

*

*

** *

**

*

******

**

*

*

*

**

* *

* *

**

*

*

***

* *

**

*** *

* ******

****

* ****

*

*

*

****

*

**

* ***

*

****

*** *

*

** * ****

* **

**

*

*

*

*

** **

****

* **

**

* **

* ***

** **

*

***

*

** **

*

* *

** *** **

**

*** **

*

*

***

*

*

*

*** *** **

*

**

*

*

*

** **

* **** *

***

** ** *

**

**** ***

*

****

*

** * *

** **

* *

**

**

**

*

* **

*

* *

**

*

** **

* * *****

* *

*

*

*

*

*

**

*** *** **

*

*

***** **

**

* **

*** *

* *

*

* **

*

***

* ***

*

PC20.021 *

****

***

*

*

***

* ***

*

*

*

** *

**

**** **

* **

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

**

*

***

* * *

*

**

*

*

* **

*

**

* **

******

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

**

*

**

**

*

*

**

**

*

**

*

*

*

*

**

* *

**

**

*

*

*

*

*

*

**

*

*

**

**

*

**

*

*

* *

* *

*

*

* *

*

*

*

*

*

**

*

*

**

**

**

* *

*

**

**

**

*

* *

*

* *

*

**

*

** ***

*

*

*****

*

*

**

*

*

**

*

**

*

***

*

*

**

*

**

* **

***

*

**

*

*

* *

*

*

**

*

*

* *

**

**

* **

**

*

*

*

*

*

*

***

*

**

* *

**

*

**

**

*

**

*

*

* *

*

* *

*

*

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

*

* *

**

**

**

**

**

* *

*

**

*

* *

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

****

*

* ** **

* *

*

*

** *

***

** ****

* *

*

*

*

**

* *

* *

**

*

*

***

* *

**

*** *

* ***

***** **

*****

*

*

*

****

*

**

* ***

*

**

* *

****

*

** ** ** *

* **

**

*

*

*

*

** **

*** ** **

**

* **

* **

*** **

*

* **

*

** **

*

* *

* **** ****

*****

*

*

***

*

*

*

****** **

*

**

*

*

*

***

** *

** **

**

*

** ***

**

** ** *

***

****

*

** **** * *

* *

**

**

**

*

***

*

* *

**

*

** **

* * ***

* ** *

*

*

*

*

*

**

*** * * ***

*

*

***

** *

*

**

***

****

* *

*

* **

*

***

****

*

**

** *

** **

*

***

****

*

*

*

***

**

**** * *

* **

*

*

*

**

*

*

**

*

****

**

*

* **

** *

*

**

*

*

* **

*

**

* * *

******

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

**

*

**

**

*

*

* *

***

**

*

*

*

*

**

**

**

**

*

*

*

*

*

*

**

*

*

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

**

*

*

*

*

*

**

*

*

**

**

**

**

*

**

**

**

*

**

*

* *

*

**

*

***

**

*

*

***

**

*

*

**

*

*

**

*

**

*

***

*

*

**

*

**

***

***

*

**

*

*

**

*

*

**

*

*

**

**

**

***

**

*

*

*

*

*

*

***

*

**

* *

**

*

**

**

*

**

*

*

* *

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

*

**

**

**

**

**

**

**

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

**

**

*

* ** **

* *

*

*

** *

**

*

** ****

**

*

*

*

**

**

* *

**

*

*

***

* *

**

*** *

* ******

******

* **

*

*

*

****

*

**

* **

*

*

**

* *

****

*

** *** **

***

**

*

*

*

*

****

**

*** **

**

* *** *

*****

*

*

***

*

* ***

*

* *

** *****

**

*** **

*

*

***

*

*

*

********

*

**

*

*

*

****

* *****

**

*

** ***

**

**** *

***

**

* *

*

** *** ***

**

***

*

**

*

* **

*

* *

**

*

** *** ** ****

**

*

*

*

*

*

**

* ** * ** **

*

*

****

* **

**

* **

* ** *

* *

*

* **

*

***

* ***

*

**

***

***

*

*

***

*** *

*

*

*

***

**

*** ** ***

**

*

*

**

*

*

**

*

***

*

**

*

* **

* * *

*

**

*

*

***

*

**

***

*****

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

**

*

* *

**

*

*

**

**

*

**

*

*

*

*

**

**

**

**

*

*

*

*

*

*

**

*

*

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

* *

*

*

*

*

*

**

*

*

**

**

**

**

*

**

**

**

*

* *

*

**

*

**

*

***

**

*

*

***

* *

*

*

**

*

*

**

*

**

*

***

*

*

**

*

**

* **

***

*

**

*

*

* *

*

*

**

*

*

**

**

**

***

**

*

*

*

*

*

*

** **

**

**

**

*

**

**

*

**

*

*

* *

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

* *

*

*

*

*

**

**

**

**

**

**

**

*

**

*

* *

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

* ** **

**

*

*

** *

***

** ****

* *

*

*

*

**

* *

* *

**

*

*

***

* *

**

****

* ***

* ***** *****

*

*

*

*

****

*

**

***

*

*

**

**

*** *

*

** * ****

* **

**

*

*

*

*

****

***** **

**

* **

* **

****

*

*

***

*

* * **

*

* *

** * ****

*****

**

*

*

***

*

*

*

*** ** *

**

*

**

*

*

*

** **

* *** **

**

*

*** **

**

* *** ****

**

**

*

** **

*** *

**

**

**

**

*

* **

*

**

**

*

** **

* * *******

*

*

*

*

*

**

********

*

*

****

* **

**

***

*** *

* *

*

* **

*

***

* ***

*

****

*

*

*

*

*

*

**

*

**

** ****

*

*

*

** *

**

**

*

*****

*** *

*

**

*

*

**

** ** **

* **

** *

*

* *

*

**

***

**

*

* ***

*

*

* **

*

*

*

**

*

**

*

***

*

**

*

**

* *

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

* *

*

*

* *

* *

*

**

*

*

**

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

**

*

*

*

*

*

*

* *

*

*

*

*

*

* **

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

*

** ** *

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

***

*

**

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

***

*

**

*

*

**

* ***

*

**

*

**

*

***

*

* *

*

*

*

*

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** * *

**

***

*

**

*

*

*

**

*

**

*

*

****

*

*

*

*

**

***

****

*

* **

*

*

*

** *

*

**

*

**

*

**** *

**

* *

***

***

** *

** **

** **

*

*

*

***** *

**

*

* **

*

*

**

*

*

* ** *

***

*

*

** **

**

***

**

*

*

**

***

**

*

*

*

*

***

*

**

**

** **

*

***

*

**

* *

*

**

**

* **

*

*** ****

*

*

*

**

*

**

***

*

***

* **

*

***

** *

*

*

*

***

*

**

*****

*

*

*

**

** **

*

*

**

**

**

*

*

****

*

****

** *

*

*

*

****

**

*

*

* *

*

**

*

*

**

**

**

*

*

*

*

***

*

** ** ***

*

*

**

*

**

*

**

*

**

*** *

* *** *

*

*

*

*

*

*

* *

*

**

*** * *

*

*

*

*

** *

****

*

***

* *

****

*

**

*

*

**

* ** ***

***

* * *

*

* *

*

**

** *

**

*

** **

*

*

***

*

*

*

**

*

**

*

* **

*

**

*

**

* *

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

* *

*

*

**

**

*

**

*

*

**

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

**

*

*

*

*

*

*

* *

*

*

*

*

*

* **

*

*

*

*

*

*

*

* *

*

*

* ****

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

* **

*

**

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

* **

*

**

*

*

* *

*** *

*

* *

*

**

*

* ***

**

*

*

*

*

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

*

**

*

* *

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** **

**

* **

*

**

*

*

*

**

*

**

*

*

****

*

*

*

*

*** *

*

** *

*

*

* **

*

*

*

***

*

**

*

**

*

**** *

**

**

***

**

*

***

** **

*** *

*

*

*

** ****

**

*

***

*

*

**

*

*

* ** *

***

*

*

***

****

**

**

*

*

**

**

***

*

*

*

*

****

**

**

****

*

**

**

**

**

*

* *

*** *

*

*

** ** ****

*

*

* *

*

**

** *

*

***** *

*

***

***

*

*

*

**

*

*

**

* ****

*

*

*

**

****

*

*

**

**

**

*

*

*** *

*

**

**** *

*

*

*

****

**

*

*

* *

*

**

*

*

**

**

* *

*

*

*

*

** **

*** *****

*

**

*

**

*

**

*

**

****

*PC30.007

** **

*

*

*

*

*

*

**

*

**

** ** **

*

*

*

***

****

*

** *

**

*** *

*

***

*

**

** ** **

***

** *

*

**

*

**

** *

* *

*

* ***

*

*

***

*

*

*

**

*

**

*

* **

*

**

*

**

* *

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

**

**

*

**

*

*

**

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

***

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*****

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

* *

*

*

* **

*

**

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

***

*

**

*

*

**

* ** *

*

* *

*

**

*

* **

*

* *

*

*

*

*

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

***

*

*

*

*

*

*

**

*

* *

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*** *

**

***

*

**

*

*

*

**

*

* *

*

*

****

*

*

*

*

**

* **

****

*

* **

*

*

*

** *

*

**

*

**

*

**** *

**

**

* **

**

*

** *

****

** **

*

*

*

* *****

* *

*

***

*

*

**

*

*

*****

**

*

*

** *

**

**

**

**

*

*

**

*****

*

*

*

*

**

**

**

**** *

*

*

**

**

**

* *

*

**

**

***

*

**** ***

*

*

*

**

*

**

***

*

* **

* **

*

* **

***

*

*

*

**

*

*

**

***

* *

*

*

*

**

* ***

*

*

**

**

**

*

*

*** *

*

**

**

***

*

*

*

****

**

*

*

* *

*

* *

*

*

**

**

**

*

*

*

*

***

*

** ** **

**

*

**

*

**

*

**

*

**

****

*

−100

050

*** *

*

*

*

*

*

*

**

*

**

** * ***

*

*

*

***

**

**

*

***

**

** **

*

***

*

**

**** **

* **

***

*

* *

*

**

***

**

*

* ***

*

*

***

*

*

*

**

*

**

*

* **

*

**

*

**

* *

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

* *

*

*

**

**

*

**

*

*

**

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

**** *

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

* **

*

**

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

* **

*

**

*

*

* *

* ***

*

**

*

**

*

* **

*

**

*

*

*

*

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*

*

**

*

* *

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** * *

**

***

*

**

*

*

*

**

*

**

*

*

****

*

*

*

*

****

*

***

*

*

* **

*

*

*

** *

*

**

*

**

*

* ** *

*

**

**

***

***

** *

* ***

** **

*

*

*

*** ** *

**

*

* **

*

*

**

*

*

* ** **

**

*

*

** ***

**

**

**

*

*

**

****

*

*

*

*

*

***

*

**

**** * *

*

**

**

**

**

*

* *

**

* **

*

*** ** * **

*

*

* *

*

**

***

*

* *****

*

***

***

*

*

*

**

*

*

****

***

*

*

*

**

****

*

*

**

**

**

*

*

* * **

*

**

**

***

*

*

*

****

**

*

*

**

*

**

*

*

**

**

* *

*

*

*

*

****

***** **

*

*

**

*

**

*

* *

*

**

*** *

*

−150

−50

50

* *

*

*

*

**

*

*

*

**

*

**

** *

*

*

*

*

*

**

* *

*

***

**

**

*

*

*

**

*

*

*

**

***

*

*

** *

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

***

**

** ***

* *

*

*

**

*

*

*** *

*

*

**

* ** **

**

*

***

**

**

*

**

*

*

**

*

**

*

***

**

* ** **

*

*

*

** **

*

*

*

* *

*

**

** * **

*

*

*

**

*

*

* **

** *

*

*

* *** *

* *

**

*

* *

**

*

**

*

**

* **

*

** *

* ** *

***

**

**

* ** **

** *

**

** **

*

* ** **

*

**

*

***

***

*

*

***

**

* *

*

*

**

**** *

*

****

*

*

* **

**

*

*

*** **

*

***

***

*

** **

** * *

*** **

*

** ***

**

*

*

**

*

**

**

*

**

*

*

* **

*

* * *

*

*

*

*

**

***

*** *

**

*

**

****

*

**

*

***

*

***

** *

** **

*

**

*

*

*

* *

*

***

* **

**

**

*

*

*

** *

*

*

*

**

***

*

**

**

*** *

*

*** ** *

*

**** ****

*

*

****** *

*

*

**

*** *

**

*** *

*

*

*

* **

*** *

*

*

*

*

*

*

*

** **

*

***

*

**

**

*

*

**

*

**** ***

*

***** **

*

*

* *

*

**

****

*

*

*

*

**

*

*

**

*

*

**

**

* *** *

**

*

*

*

*

*

* * ***

******

*

*

*

*

** * **

****

**

*

***

**

*

**

* *

** *

*

* ****

**

*

*

***

*

****

*

*

*

* ** * **

**

** *

*

*

*

*

*

**

**

****

*

**

*

*

*

*

** **

*

*

*****

*

*

*

*

**

*

*

*

****

** *

*

* *

*

*

*

**

*

*

*

* *

*

*** **

*

*

*

*

*

**

* *

*

***

**

**

*

*

*

**

*

*

*

****

*

*

*

* **

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

*****

**

*

*

**

*

*

*** *

*

*

****

***

**

*

***

**

**

*

**

*

*

***

**

*

* **

**

*** **

*

*

*

*** **

*

*

**

*

**

* ****

*

*

*

**

*

*

* **

***

*

*

*** * *

**

**

*

* *

**

*

**

*

**

* **

*

***

****

***

***

*

* ** **

***

**

* ***

*

* ****

*

**

*

***

* **

*

*

***

****

*

*

**

*** **

*

***

**

*

***

* *

*

*

**

* **

*

* **

***

*

* * **

****

***

**

*

*** *

*

**

*

*

**

*

**

**

*

**

*

*

***

*

* **

*

*

*

*

***

* **

***

**

*

******

*

**

*

* **

*

***

** *

* ***

*

**

*

*

*

* *

*

***

* ***

*

**

*

*

*

***

*

*

*

**

***

*

**

**

*****

*** ** *

*

***** ** *

*

*

***

* ** *

*

*

**

* ** *

**

****

*

*

*

***** ***

*

*

*

*

*

*

*** *

*

***

*

**

**

*

*

**

*

* **** *

*

*

** *****

*

*

**

*

**

***

**

*

*

*

**

*

*

**

*

*

**

*******

**

*

*

*

*

*

*** **

****

* *

*

*

*

*

*** *

*

****

**

*

* **

**

*

**

**

***

*

***

***

*

*

*

***

*

**

**

*

*

*

* *****

* *

***

*

*

*

*

*

**

**

**

***

**

*

*

*

*

***

*

*

*

*****

*

*

*

*

**

*

*

*

****

***

*

**

*

*

*

**

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

*

*

**

**

*

**

**

*

**

*

*

*

**

*

*

*

**

***

*

*

***

*

*

*

*

***

*

*

*

*

*

*

***

**

*****

**

*

*

**

*

*

*** *

*

*

**

*****

**

*

***

* *

* *

*

**

*

*

**

*

**

*

***

**

*****

*

*

*

** **

*

*

*

* *

*

**

** ***

*

*

*

**

*

*

***

** *

*

*

*****

* *

**

*

**

**

*

**

*

**

***

*

***

*** *

***

**

**

* ** **

***

**

****

*

* ****

*

**

*

***

* **

*

*

***

**

**

*

*

**

*****

*

***

**

*

* **

* *

*

*

**

* **

*

***

** *

*

****

*** *

***

**

*

****

*

**

*

*

**

*

****

*

* *

*

*

***

*

***

*

*

*

*

**

** *

** **

**

*

**

***

*

*

**

*

***

*

****

* *** **

*

**

*

*

*

* *

*

***

****

*

**

*

*

*

** *

*

*

*

**

***

*

**

**

*** *

*

*** ***

*

* **** ** *

*

*

*******

*

*

**

*** *

**

****

*

*

*

***

*** *

*

*

*

*

*

*

*

** **

*

** *

*

**

**

*

*

**

*

*** * **

*

*

*** ** * *

*

*

* *

*

**

*****

*

*

*

**

*

*

**

*

*

**

****** *

**

*

*

*

*

*

* ****

** * *

**

*

*

*

*

*** *

*

** **

**

*

* **

**

*

**

**

** *

*

* ****

**

*

*

***

*

**

**

*

*

*

*** * **

**

** *

*

*

*

*

*

**

**

**

**

*

**

*

*

*

*

** *

*

*

*

***

**

*

*

*

*

**

*

*

*

****

***

*

PC40.007

* *

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*** * *

*

*

*

*

*

**

**

*

**

**

*

**

*

*

*

**

*

*

*

**

**

*

*

*

** *

*

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*

**

*

**

** ***

**

*

*

**

*

*

*** *

*

*

****

* **

**

*

***

**

**

*

**

*

*

**

*

**

*

* **

*** *

* **

*

*

*

*** *

*

*

*

**

*

**

** * **

*

*

*

**

*

*

***

** *

*

*

*** **

* *

**

*

**

**

*

**

*

**

****

***

* ***

***

***

*

* ****

***

**

** **

*

*****

*

**

*

***

* **

*

*

** *

*** *

*

*

**

**** *

*

****

*

*

*****

*

*

*** *

*

*

* **

***

*

* ***

*****

* **

*

*

*** * *

**

*

*

**

*

**

* *

*

**

*

*

***

*

** *

*

*

*

*

**

***

*** *

**

*

*** *

**

*

***

* **

*

***

***** **

*

**

*

*

*

**

*

**** *

**

*

**

*

*

*

** *

*

*

*

**

***

*

**

**

****

*

**** **

*

** *** ***

*

*

***

** **

*

*

**

****

**

* ** *

*

*

*

* **

** * **

*

*

*

*

*

*

****

*

***

*

**

**

*

*

**

*

*** ****

*

***** **

*

*

**

*

* *

***

**

*

*

*

**

*

*

**

*

*

**

**

* ** * *

**

*

*

*

*

*

* * ***

*** ***

*

*

*

*

*** **

* ***

**

*

** *

**

*

**

**

***

*

***

* **

*

*

*

** *

*

****

*

*

*

*** * **

**

***

*

*

*

*

*

****

***

**

**

*

*

*

*

** **

*

*

** *

**

*

*

*

*

**

*

*

*

* ***

** *

*

−300 −100 100

*

*

*

*

*

*

* **

*

*

**

* ****

*

* ***

*** * *

**

*

*

*

*

**

***

* *

**

* *

*

**

**

*

**

*

*

**

*

**

* *

* *

**

***

*** *

**** **

*

**

********

*

* *

****

**

*

*** *

*

** ****

** **

* **

*

**** **

*

*

* *

* ** *

**

*

*

*

**

*

*

**

* *

*** *

***

* **

*

*

**

**

*

** *

*

* *

*

*

*

** ***

*

*

*

*

* *

**

* *

** *

*

**

****

*

* *

*

*

*

* **** *

**

***

*** ** *

**

*

*

*

**

**

*

*

* ** *

*

*

***** * *

**** *

*

*

** *

*

*

* *

* **

**

* **

*

*

*

** *

*

**

*

**

**

* * *

*

*

**

*

**

*

***

*

*

*****

* ***

**

**

*

** * ***

**** **

**

**

* *

*****

*

** *

* ***

*

**

** **

** *

**

***

**** *

*

*

*

* *

**

*

**

*

**

**

*

*

*

**

*** *

*

**

****

*

*

*

*

* **

**

*** ***

**

*

** ****

*

**

*

*

*****

* *

**

** *

****

*

**

*

*

**

**

*

**

*

****

*

***

*

*

*

****

*

*

**

**

*

*

**

*** ** * *****

*

*

*

*

*

* ** **

*

***

* *** *

**

*

* *

*

*

**

**

*

*

**

*

***

*

*

*

*

**

**

*

***

* *

*

*

*

**

** **

**

*

*

**

** **

***

*

**

*

*

*

* **

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

* ***

*

*

** *

*

*****

*

**

*

*

*

**

**

*** **

* ***

**

**

**

*** *

* *

**

*

*

*

*

*

****

*

*

**

*

***

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

**

****

*

*

** **

* ** * *

**

*

*

*

*

**

***

**

**

* *

*

**

* *

*

**

*

*

**

*

**

**

* *

**

***

**

*** **

***

*

**

** ***

***

*

* *

* **

*

**

*

*** *

*

******

***

*

***

*

*** * **

*

*

**

** **

***

*

*

**

*

*

**

**

****

* **

***

*

*

* *

**

*

***

*

**

*

*

*

* * ***

*

*

*

*

**

**

**

* **

*

**

* **

*

*

* *

*

*

*

* *****

**

**

*

** * ***

* *

*

*

*

**

**

*

*

*** *

*

*

**** ** *

*** **

*

*

***

*

*

**

***

* *

* **

*

*

*

***

*

**

*

**

**

* **

*

*

**

*

**

*

** *

*

*

**

* **

** **

**

**

*

* **** *

*** **

*

****

**

**

**

*

*

***

* ***

*

**

* ** *

** *

**

** ***** *

*

*

*

* *

**

*

***

**

**

*

*

*

**

****

*

**

****

*

*

*

*

* **

* *

******

**

*

*****

*

*

**

*

*

* **

**

**

**

** *

***

*

*

**

*

*

**

***

**

*

**

**

*

***

*

*

*

*** *

*

*

**

**

*

*

* *

***** ***

* ***

*

*

*

*

******

***

* ** **

**

*

* *

*

*

**

**

*

*

**

*

* ***

*

*

*

*** *

*

*****

*

*

*

**

****

***

*

***** *

***

*

**

*

*

*

***

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

** **

*

*

** *

*

**** *

*

**

*

*

*

**

**

*** ** ****

* *

**

**

**

****

**

*

*

*

*

*

****

*

*

**

*

***

*

−100 0 50

*

*

*

*

*

*

* **

*

*

**

* ****

*

* ***

**** *

**

*

*

*

*

**

***

* *

**

* *

*

**

**

*

**

*

*

**

*

**

* *

* *

**

***

**

* ****

***

*

**

** ***

* **

*

* *

* **

*

**

*

*** *

*

* *****

****

***

*

*** * *

*

*

*

* *

** **

***

*

*

**

*

*

**

* *

****

***

* **

*

*

**

**

*

** *

*

**

*

*

*

*****

*

*

*

*

* *

**

* *

***

*

**

***

*

*

* *

*

*

*

* **** *

**

**

*

*** ***

**

*

*

*

**

**

*

*

* ** *

*

*

**** ** *

*****

*

*

***

*

*

* *

* **

* *

* **

*

*

*

** *

*

**

*

**

**

* **

*

*

**

*

**

*

***

*

*

**

* **

* ***

**

* *

*

*******

* ****

**

**

* *

**

**

*

*

** *

* ***

*

**

*** *

***

**

****** * *

*

*

*

* *

* *

*

**

*

**

**

*

*

*

**

*** *

*

**

****

*

*

*

*

* **

**

*****

***

*

******

*

**

*

*

*****

* *

**

** *

* ***

*

**

*

*

**

**

*

**

*

****

*

***

*

*

*

** **

*

*

* *

**

*

*

**

* ** *** * *

** **

*

*

*

*

* ****

*

**** ****

**

*

**

*

*

**

**

*

*

**

*

***

*

*

*

*

**

**

*

** *

**

*

*

*

**

****

**

*

*

**

** * *

**

*

*

**

*

*

*

* **

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

* ***

*

*

***

*

**

* **

*

**

*

*

*

**

**

*** * *

****

**

**

**

**

* ***

**

*

*

*

*

*

**

**

*

*

**

*

***

*

*

*

*

*

*

*

* **

*

*

**

*****

*

* ***

* *** *

**

*

*

*

*

**

***

* *

**

* *

*

**

**

*

**

*

*

**

*

**

* *

* *

**

***

**

* ****

** *

*

**

**** *

** *

*

**

* ***

**

*

* ***

*

***** *

** **

***

*

**** **

*

*

**

** **

**

*

*

*

**

*

*

****

*** *

* **

***

*

*

* *

**

*

***

*

* *

*

*

*

* ****

*

*

*

*

**

**

**

***

*

*** **

*

*

**

*

*

*

** ****

**

***

** ***** *

*

*

*

***

*

*

*

****

*

*

***

* ***

*****

*

*

****

*

* *

***

**

* ***

*

*

** *

*

**

*

***

*

* **

*

*

**

*

**

*

** **

*

**

* **

** **

**

**

*

* ** ** *

*****

*

**

* *

**

***

**

*

** *

* ***

*

**

****

***

**

****** **

*

*

*

* *

* *

*

***

**

**

*

*

*

**

*** *

*

**

****

*

*

*

*

* **

**

******

**

*

**** **

*

**

*

*

*****

* *

***

**

* ***

*

**

*

*

**

**

*

***

**

**

*

****

*

*

****

*

*

* *

**

*

*

**

* ***

** *****

*

*

*

*

*

* ** ***

***

* *** *

**

*

**

*

*

**

**

*

*

**

*

***

*

*

*

*

****

*

**** *

*

*

*

**

****

***

*

**

** **

***

*

**

*

*

*

***

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

* ***

*

*

***

*

**

** *

*

**

*

*

*

**

**

* ** * ** ** *

**

**

**

**

* ** *

**

*

*

*

*

*

**

**

*

*

**

*

***

*

−100 0 50

−100

050PC5

0.006

PCA 4413 genes, rpkm ,color by nDet

PC1

PC2

Page 44: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

CheckforbatcheffectsinPCA

Scaterpackage

Page 45: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

PCAforQC

•  PCAcanbeusedtoidentifycontaminantcellswhenyouaresortingforaspecificcelltype.

PC10.172

−100 0 100 200

** *

*

***

**

** *

*

* **

* ****

****

**

**

*

*

*

****

* ***

*

*** * ****

** *

**

*

*

*

**

**

*

***

*

****

** *

*

** **

*

*

* *

*

** ** ***

*

*

*

*

*

*

* *

*

** *

*

*

*** *

*

*

*

*

*

*

*

**

* **

*

**

*

*

*

* * *

*

*

**

* *****

*

* *

*

*

*

*

*

* **

***

*

*

*

** *

*

* **

*

**

***

*

* * **

*

*** ** **

*

***

*

*** **

*

* ***

*

*

** *

**

*

**

***

*

*

****

*

* **

*

*

*

*

*

*

**

**

***

**** *

**

**

** **

***

*

*

*

*

**

***** **

*

*** *

*

*

***

*

*

**

*

***

*

**

*

** * **

*

**** *

*

*

*

*

*

*

*

* *

**

*** ***

***

**

*

*

*

***

*

*

*

*

*

* **

*

*

*

** ** * * *

*

*

*

**

**

*

*****

*

*

*** *

**

* * ****

* **

**

*

*

*

*

*

*

****

**

**

*

*

*

* *** *

*

*

*

**

*** * *

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

****

*

*

*

*

**

*

**

*

*****

* *

*

*

*

*

*

** ***

*

*

****

*

* *

**

*

*

***

**

*

**** *** ****** ** ****

*

*** **

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** **

*** *

*

*

***** ** ** *

*

** **

*

*

* *** *

**

*

*

*****

*

*

** * **

*

**

*

**

***

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*** **

*

* *

*

***

**

*

**

*

*

*

**

*

** *

*

** ***

*

*

*

**

**

*****

** ** **

*

**

*

*

**

* *

*

****

*

*** ** **** * ***

**** ** *

* *

**

*

*

**

**

*

*

*** **

*

*

*

******* ** *** ** *** *

* * **

*

*****

** *

*

***

* ******* *

**

**

*

*

*

* ***

* ***

*

******* *

** **

*

*

*

*

**

* *

*

***

*

****

***

*

** ***

*

**

*

****** **

*

*

*

*

*

**

*

***

*

*

*** *

*

*

*

*

*

*

*

**

* **

*

**

*

*

*

* * *

*

*

**

* *****

*

* *

*

*

*

*

*

***

****

*

*

** *

*

* **

*

**

* * *

*

* ***

*

*** ***

*

*

***

*

* ****

*

****

*

*

***

**

*

**

****

*

****

*

* ***

*

*

*

*

*

**

**

** ******* *

**

*** *

****

*

*

*

**

****** *

*

* ***

*

*

****

*

**

*

***

*

**

*

*****

*

** * **

*

*

*

*

*

*

*

**

*********

**

**

*

*

*

* **

*

*

*

*

*

***

*

*

*

** *** *

**

*

*

**

* *

*

* ** **

*

*

*** *

**

* *****

***

**

*

*

*

*

*

*

*** *

**

**

*

*

*

* ****

*

*

*

**

** ** *

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

****

*

*

*

*

**

*

**

*

*** ****

*

*

*

*

*

* ****

*

*

****

*

* *

**

*

*

***

**

*

******* ****** * ******

** ***

*

*

*

*

*

*

*

*

*

****

****

*

*

** *** * *** *

*

*** *

*

*

* **** ***

*

* ** **

*

*

*****

*

**

*

**

** *

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

** ***

*

**

*

** *

**

*

**

*

*

*

**

*

** *

*

** ***

*

*

*

**

**

*** **

** ****

*

**

*

*

**

* *

*

*** *

*

*** *** *******

*****

**

* *

**

*

*

**

**

*

*

* ** **

*

*

*

** ******* ***** ** ***

−50 50 150

* **

*

****

*

***

*

***

** *****

* *

**

**

*

*

*

********

*

****** **

*****

*

*

*

**

**

*

***

*

*******

*

****

*

*

**

*

*** *****

*

*

*

*

*

**

*

* **

*

*

****

*

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

*

*

***

*

*

****** **

*

**

*

*

*

*

*

***

** **

*

*

***

*

***

*

**

* **

*

****

*

**** **

*

*

* **

*

* ****

*

****

*

*

***

* *

*

**

***

*

*

****

*

****

*

*

*

*

*

****

***

*******

* *

********

*

*

*

**

****** *

*

****

*

*

****

*

**

*

***

*

**

*

***

* *

*

* ** **

*

*

*

*

*

*

*

**

***

** ******

***

*

*

***

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*** ** ***

*

*

**

**

*

** ****

*

*****

*

**** **

***

**

*

*

*

*

*

*

****

**

**

*

*

*

* ****

*

*

*

**

*****

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

****

*

*

*

*

**

*

**

*

*** ****

*

*

*

*

*

*****

*

*

* ***

*

**

**

*

*

***

**

*

* *** ********** *****

*

*****

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** *

*

** **

*

*

** ********

*

* ***

*

*

*******

*

*

******

*

**** *

*

**

*

***

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

* * *

**

*

**

*

*

*

* *

*

***

*

*****

*

*

*

**

**

**** *

**** **

*

**

*

*

**

**

*

****

*

* ************

* ** ****

**

* *

*

*

* *

**

*

*

**** *

*

*

*

***** ***** *********

−100

100

300

***

*

** **

*

** *

*

**** ******

* *

**

**

*

*

*

* ***** **

*

*** **** *

** *

**

*

*

*

*** *

*

* **

*

****

***

*

** **

*

*

**

*

**** ** **

*

*

*

*

*

**

*

** *

*

*

*** *

*

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

*

*

* **

*

*

**

* **** *

*

**

*

*

*

*

*

*******

*

*

** *

*

* **

*

**

** *

*

* ***

*

*** ****

*

***

*

** ***

*

***

*

*

*

* **

**

*

**

***

*

*

*** *

*

* **

*

*

*

*

*

*

**

**

***

** *** **

* *

*** *** **

*

*

*

**

****

* **

*

* ***

*

*

* ***

*

**

*

***

*

**

*

*****

*

** ***

*

*

*

*

*

*

*

**

**** ** **

** *

**

*

*

*

* **

*

*

*

*

*

* **

*

*

*

** ****

**

*

*

**

* *

*

* ** **

*

*

*** ***

* **** *

* **

**

*

*

*

*

*

*

****

**

**

*

*

*

** ** *

*

*

*

**

**** *

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

** **

*

*

*

*

**

*

**

*

*****

* *

*

*

*

*

*

* ****

*

*

* ***

*

* *

**

*

*

***

**

*

***** ** ****** * *****

*

** ***

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** **

****

*

*

***** * *** *

*

****

*

*

********

*

*** ***

*

*** **

*

**

*

*****

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

** *

**

*

**

*

*

*

* *

*

** *

*

** ***

*

*

*

**

**

******

* ****

*

**

*

*

* *

* *

*

*** *

*

*** *** *** ****

*****

* *

* *

**

*

*

* *

**

*

*

* ** **

*

*

*

*** ****** *** ** ** ***

−100

0100

***

** **

***

**

****

****

*

**

**

* *

**

**

*

*

*

*

*

*

*

** ***

***

***

*

*

* *

*

****

*

** *

*

** *

**** ***

*

***

*

***

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

*

* ** *

*

*

* ***

**

****

**

*

*

***

*

*

**

*

*

*

* *

**

**

*

*

**

**

*

***

****

*

**

*** *

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

***

*

*

***

**

*

****

*

*** ***

***

**

**

*

**

*

*

**

* *

*

*

**

*

*

*

****

*

*

***

*

*

**

**

*

**

**

**

*

*

*

*** *

**

*

**

***

*

**

** *

**

**

***

*

*

*

*

*

*

* *

*

***

*

*

*

*

**

** **

*

**

**

* ***

*

**

**

* **

**

*

** **

**

*

*

*

*

* *

*

***

***

** **

**

*

***

*

*

*

****

**

*

******

**

* ***

*

*

**

* *****

*

*

*

* ***

**

**

*

*

* *****

** *

*

* **

*

*

**

*

* *

*

***

*

**

*

**

*

*

**

*****

**

*

* *

**

*****

** * ***

*

**

**

*

*

** *

**

*

*************

*

*

***

*

*

** *

** *

*

*

*

** * *

*

***

*

****

*******

***** *

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

*** ***

*

*

*

***

*

*

** ***

*

**

*

**

*

*

*

*

*

****

**

***

** **

*

****

*

*

**

*

****

* *

*

*

*

*

*

*

* *

****

***

***

*

*

*

* ***

***

**

*

*****

*

*

*

*

***

**

*****

*

************

*

***

*

* *

*

**

**

*

*

*

* **

**

*****

** **************** ****

PC20.063

**

**** *

***

**

****

* ***

*

**

**

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*****

***

** *

*

*

**

*

****

*

** *

*

** *

**** ***

*

** *

*

** *

*

*

*

*

*

*

** *

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

*

****

*

*

***

**

*

**

**

***

*

**

*

*

*

***

*

*

**

**

**

*

*

**

**

*

***

* ***

*

**

****

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

** *

*

*

***

***

****

*

******

***

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

**

*

*

*

* ***

*

*

***

*

*

**

* *

*

**

***

*

*

*

*

****

**

*

* *

***

*

**

***

**

**

****

*

*

*

*

*

**

*

** *

*

*

*

*

**

** **

*

**

**

****

*

**

**

* **

* *

*

** **

**

*

*

*

*

**

*

***

***

** **

* *

*

* **

*

*

*

****

**

*

* *****

**

*****

*

**

**** **

*

*

*

****

**

**

*

*

* **** *

* * *

*

* **

*

*

**

*

**

*

***

*

**

*

**

*

*

***

** **

**

*

**

**

* ****

******

*

**

**

*

*

***

**

*

****

****

*****

*

*

***

*

*

** *

** *

*

*

*

** **

*

* **

*

****

**** ***

***** *

*

*

*

**

*

* *

***

*

*

*

** ** **

*

*

*

***

*

*

* ****

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*** *

**

* **

** **

*

*** *

*

*

* *

*

******

*

*

*

*

*

*

**

***

**

**

**

*

*

*

*

****

***

**

*

**

***

*

*

*

*

***

**

**** *

*

*****

* ******

*

***

*

**

*

****

*

*

*

***

**

****

** **** ***

***

* *****

*****

**

**** *

***

**

****

** **

*

**

**

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*** **

***

* **

*

*

**

*

****

*

** *

*

***

*******

*

***

*

***

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

*

****

*

*

* ***

**

****

**

*

*

***

*

*

**

*

*

*

* *

**

**

*

*

* *

**

*

***

****

*

**

*** *

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

** *

*

*

** *

***

* ***

*

* * ** **

***

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

* *

*

*

*

****

*

*

***

*

*

**

**

*

**

**

**

*

*

*

*** *

**

*

**

***

*

**

***

**

**

***

*

*

*

*

*

*

* *

*

* **

*

*

*

*

**

** **

*

**

**

* ***

*

**

**

***

**

*

* * **

**

*

*

*

*

* *

*

***

***

* ***

**

*

** *

*

*

*

****

**

*

**** **

**

****

*

*

**

******

*

*

*

****

***

*

*

*

* *****

***

*

***

*

*

**

*

**

*

***

*

**

*

**

*

*

***** **

**

*

* *

**

******** ***

*

**

**

*

*

***

**

*

*************

*

*

***

*

*

***

** *

*

*

*

** **

*

***

*

****

**** ***

***** *

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

******

*

*

*

***

*

*

* ***

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

****

**

***

****

*

* ***

*

*

* *

*

******

*

*

*

*

*

*

* *

****

***

***

*

*

*

****

***

**

*

*****

*

*

*

*

***

**

*****

*

* ***********

*

***

*

**

*

**

**

*

*

*

***

**

***

**

* ** ********** *******

**

****

** *

***

**

***

*

* ***

*

**

**

**

**

***

*

*

*

*

*

*

*** **

* **

** *

*

*

**

*

* ***

*

***

*

** *

***

* **

*

*

** *

*

** *

*

*

*

*

*

*

** *

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

* **

*

*

****

*

*

* **

***

**

**

**

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

**

**

**

*

*

**

**

*

***

****

*

**

**

**

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

***

*

*

***

**

*

* ** *

*

*** ** *

***

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

**

*

*

*

****

*

*

* **

*

*

**

* *

*

* *

**

**

*

*

*

****

**

*

* *

***

*

* *

***

**

**

***

*

*

*

*

*

*

**

*

** *

*

*

*

*

**

* ***

*

**

**

** **

*

* *

**

***

* *

*

* ****

*

*

*

*

*

**

*

***

**

*

** **

* *

*

* **

*

*

*

****

**

*

* **** *

**

*****

*

**

******

*

*

*

** **

**

**

*

*

******* **

*

***

*

*

**

*

**

*

* **

*

**

*

**

*

*

*******

* *

*

* *

**

* ****

* ** ***

*

**

* *

*

*

***

**

*

****

* ***

*****

*

*

***

*

*

** *

***

*

*

*

** **

*

***

*

**

**

** *********

**

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

**** **

*

*

*

** *

*

*

* ***

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

****

**

***

****

*

****

*

*

* *

*

***

***

*

*

*

*

*

*

* *

* **

**

**

**

*

*

*

*

****

***

**

*

***

***

*

*

*

** *

**

**** *

*

****** **

* ***

*

***

*

**

*

***

*

*

*

*

** *

**

****

*********

***

* *******

***

***

***

* *** **

*** ******** *

*

* ***

*

***

*

**

***

* *********

*

*

***

** ** *

**

*

***

**

***

*

**

*

*** * * ** *

*******

* * **

**

*

** *

***

* ***** *

**

***

** *

*** ***

*

* **** *

***

*****

***

*** *

**

**

*

* ***

**

***

**** *** *

** *

**** ****

**** *

*** *****

**** **

**** * *** *

*

*** *

*

**** *

* ***

*

* ** *****

* ** ******* ******

* *** **

**

***** * **

***

**

**

****

****

*****

*****

* *

*****

* **

**

*

***

** *

******

*

****

**

* *

**

*

*

*

*

*

*** * ** ****** ** ** ****

*

****

**

***

** *

*******

*** *** *

*

*

* ****

*

*

*

***

**

* **** ***

**

***** *

*

**

**

* *

*

* * *

*

***

*

**

*

**

*

**

**

****

** **

*

* *

*****

** * **

*

*

** ** **

** *

***

**************

*

***

* ******

*

**

* **

*

** *

**

*** ** *

*

********

*

*

*

*****

*

*****

*

** *** ***

* ** **** *

**

*

* *

***

**

*

**

* **

*

**

**

**

**

*

*

*

*

******

*

*

*

**

** **

** *

* ** ** * *

* **

*

*****

*

** * *

**

******

*****

**

*

*

***

**

*

**** **************

****

* **

** **

** ** **

* *

****

**

*

*****************

** *

****

**

** ** *

** * * ** ***

*** *

*

****

*

** *

*

**

***

***** * **

**

*

*

***

*****

**

*

****

****

*

* *

*

*** * **

* *

*** ** *

** **

*

**

*

** *

** *

** ***

**

**

***

** *

**

***

*

*

* *** ****

**

****

****

* ***

** *

*

* ***

**

***

**** *

** **

**

* * *** ***** *

***** **

***

*** ***

**** ******

****

*

*****

* **

*

*

* * ** ***

** *

***** ***** **

*** *** *

**

*

****** *** *

*

**

**

****

****

**** *

** ** *

**

****

*

***

**

*

** *

** *

* *****

*

*** *

**

* *

**

*

*

*

*

*

* ** *** *

*** *

* ****** **

*

****

**

***

***** * ****

* ***** *

*

*

******

*

*

* **

*** *

** **

**

**

*** ***

*

**

* *

* *

*

***

*

***

*

**

*

**

*

**

**

****

* ** *

*

**

** ***

******

*

** *** ****

***

**** *******

***

*

***

* **** **

*

**

***

*

* **

**

****

***

*****

** *

*

*

*

** ***

*

* **

* *

*

***

*****

*** * * *****

*

* *

***

**

*

**

***

*

**

***

**

**

*

*

*

***** *

*

*

*

*****

** **

**** ***

***

*

****

*

*

* ***

**

******

**

* **

**

*

*

***

**

*

**** ***

******* * **

*

****

* * *

** **

** ****

**

*** *

**

*

***

***** ***** ****

* ** PC30.026

**

****

* ****

** ** *

********

*

****

*

** *

*

******* ********

*

*

***

** ** *

**

*

***

**

***

*

**

*

***** ***

**** ***** **

**

*

** *

***

****** *

**

** **

***** ***

*

* *****

* ****** ****

*** *

**

**

*

****

**

***

********

** *

***** **** **

*** ******

**

* ***** *

**** * ***

*** *

*

**** *****

*

***** ***

*** ******* * *******

* ***

**

** *** ** *

* **

**

**

*** *****

*** **

** **** *

*****

***

* *

*

********

****

*

*****

** *

**

*

*

*

*

*

****** *** ****** *** **

*

** **

**

***

**** **** **

** *****

*

*

* *****

*

*

***

**

* **** *

* *

**

*******

**

**

**

*

***

*

***

*

**

*

**

*

*****

***

** **

*

* *

*****

*** ***

*

***

** ****

***

* *** *********

*

*

***

*******

*

**

***

*

* * *

**

*** *

***

** ******

*

*

*

* ****

*

*****

*

** ******

* *********

*

**

***

**

*

**

***

*

**

***

***

*

*

*

*

** ****

*

*

*

**

* * **** *

*** ** * *

***

*

*****

*

** **

**

*****

*

*** **

**

*

*

***

**

*

**** ** ************

* ** ****

*** *

*** **** *

****

**

*

****** ***** ******** *

−250

−100

0****

**

* ****** ***

* *******

*

****

*

****

**** *** *** ***

* *

*

*

***

* * ***

**

*

* ***

****

*

**

*

**

** ****

** *** **

** **

**

*

** *

** *

*******

**

** *

****** **

*

*

* ********

******

**** **

**

**

*

*** *

**

***

*****

****

**

* ***** **

**********

* ******* ** *

* ***** **

*** *

*

*** **

* **

*

*

*** * ****

* **** *

** *** * *** ***

** ***

*

****** *****

**

**

* ******

** **

**

*** ****

**

***

* ****

*

** *

***

** ** **

*

* ** *

****

***

*

*

*

*

* ** ****

****

* ** ** ****

*

* ***

**

***

***

* * **** *

* ******

*

*

* *****

*

*

***

**

***

* ****

**

******

*

**

* *

* *

*

* **

*

* **

*

* *

*

**

*

**

*****

*

* ** *

*

* *

****

*

*** **

*

*

*** ** *

***

***

***** ******

***

*

***

****

***

*

**

* **

*

** *

**

*******

********

*

*

*

*****

*

***

**

*

***

****

*

* **** ***

**

*

**

****

*

*

**

* **

*

**

**

***

**

*

*

*

******

*

*

*

**

** *** **

* *** * **

***

*

****

*

*

* ***

**

*****

*

*****

**

*

*

** *

**

*

***** **

******* ***

*

****

** *

** **

*** ** ***

*** *

**

*

**** ********* ***

****

−50

50150

***

** **

**

* ***

*****

** ***

*** *** *

*

*

*** ** ***

*

*********** **

*

**

**

**

*

****

**** ***

**** *

*

** *

*

******* *

***

**

**

*

***

*

**

*****

*

*

**

*

* *****

**

*

*

*

*** *

*

***** ***

** *

**

*

*

*

***

* ***

*

*

***

**** *** *

* *

*

****

*

******

* *

***

**

***

*

*

** ***

*** *

**

**

** **

* *

* ****

*** *

** **

***

**

****

******

*

*

***** **

*

*

*

*

** **** *

**

*

****

*

*

** *****

**

***

* **

*****

*

*****

*

*

*

*

*

* **** * ****** *** ***

*

****

**

*

*

*

****

*

* ***** * **

*

*

**

**

*

***** *

*

**** * ******* *

****

**

***

*

****

****

*

*

** ** **

*

*

*

**

******

**

*

*

**

*

*

** *

*

*

**

*

*

**

**

* *****

***

***

*

**

*

******

*

***

**** *

**

*

** *

***

******************

* *** ***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

****

*

*

**********

*

**** *

*

*** ** ** **** *** **

* ***

*

**

* ** **

**

*

*** *

*

**

*

***

**

****

*

*

* * ***** *

*

**

**** * **

*

**

*

*

* **

* ***

***** *

*

** ***

*****

******

*

***

*

****

*

****

*

************* **

**

* ****

*

**

* *

*

*

*

*

*

*****

*

*

*

*************** *** * *

*****

**** * *

*

* *** *

** ****

******

*

*

*** ** ***

*

**** ****** * **

*

**

**

**

*

****

**** ** *

*** * *

*

** *

*

** ***** *

* **

**

* *

*

** *

*

**

** ***

*

*

***

* ** *****

*

*

*

* * **

*

*** ** ***

** ** *

*

*

*

* **

* ***

*

*

** *

** ** *** *

**

*

* * **

*

*** ** ***

***

**

***

*

*

* ****

*** *

**

**

** ****

* *****

** **

* * ** *

**

**

****** ***

*

*

** *

** ***

*

*

*

** *****

**

*

*** *

*

*

** ******

***

** *

*** * *

*

*

****

*

*

*

*

*

*

** * ** * *** *** *** ***

*

*** *

**

*

*

*

* ***

*

* ** ** * * **

*

*

**

**

*

***** *

*

*** **

** * **** *

****

**

** *

*

****

* ** *

*

*

** ** * **

*

*

**

*** * **

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

*

**

**

* *** **

***

* **

*

**

*

** *****

***

* ** * *

**

*

***

***

**** *** ****** *

****

* **** **

*

*

*

*

***

*

*

***

*

*** *

*

*

***** ** ** *

*

** ***

*

* *** * ***

* ***** **

* * **

*

**** * *

***

*

** **

*

* *

*

***

**

****

*

*

* ***** * *

*

**

**

****

*

*

**

*

*

***

** **

** *** *

*

*****

*****

** ****

*

***

*

*** *

*

****

*

*** ** **

** * ******

** * ** *

*

* *

* *

*

*

*

*

*

*** ***

*

*

*****

** ** *** ** *** ***

**

* *****

** **

**** *** ****

*******

*

* ** ** ***

*

******* *

** ***

*

**

**

* *

*

****

**** ****

** * **

***

*

********* *

*

**

**

*

***

*

**

** ***

*

*

**

*

*** ***

**

*

*

*

* * **

*

*** ** ***

** *

**

*

*

*

***

* ***

*

*

** *

** ******

* *

*

* ***

*

*** ***

* *

*****

****

*

*****

****

**

**

** **

* *

* ****

****

*******

**

** ******* **

*

***** **

*

*

*

*

** *****

***

* ***

*

*

** *****

****

** ***** **

*

** **

*

*

*

*

*

*

* ***** ***

*** *** *

**

*

**

***

*

*

*

*

*****

*** *** ***

*

*

**

**

*

* ** ** *

*

*** **** ***** *****

**

** *

*

*** *

****

*

*

** ** ***

*

*

**

** ** **

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

*

**

**

* *** **

******

*

**

*

* *****

*

***

*** **

***

***

***

******* ****** *

****

**** ***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*** *

*

*

** *** * *** *

*

*** **

*

* **** ***

** ** ** **

*****

**** **

** *

*

** * *

*

**

*

***

**

* ***

*

*

* **** ** *

*

**

**** ***

*

**

*

*

***

** **

** *** *

*

*****

*** **

** **

**

*

***

*

*** *

*

*** *

*

*** *** ******* **

**

**** *

*

* *

**

*

*

*

*

*

* ** **

*

*

*

** ***

**** ***** ** ***

PC40.016 *

****

***

*** **

*** * *

************

*

*

* ** *** **

*

******* *** ***

*

**

*** *

*

* ***

**** ****

** ***

***

*

* *** ** ****

*

**

**

*

** *

*

**

** ** *

*

*

***

** ****

**

*

*

*

* ***

*

*** ** ** **

*** *

*

*

*

*****

* *

*

*

** *

** *** ***

* *

*

* ***

*

*** *****

*****

* ***

*

*** **

****

**

**

** **

**

*** **

*****

**** **

**

***

** *** **

*

*

***

*** **

*

*

*

*******

***

* ***

*

*

* ******

**

***

* **

* ****

*

** ***

*

*

*

*

*

** ****** **** ** **

**

*

**

****

*

*

*

* ***

*

*** **** **

*

*

**

**

*

* ** ** *

*

*** **

** **** ** ****

*****

*

****

****

*

*

*** ** *

*

*

*

**

**** **

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

*

**

**

* **** *

***

* **

*

**

*

* *****

*

***

** * ***

**

***

***

***** ** ****** *

****** ** ***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

****

*

*

***** * *** *

*

*****

*

** **** **

**** ** **

****

*

**

** *****

*

*** *

*

* *

*

***

**

****

*

*

********

*

**

***

****

*

**

*

*

* **

** **

** ****

*

*** **

*****

** ****

*

***

*

* ** *

*

*** *

*

*** *** *

** ********

** ** *

*

* *

**

*

*

*

*

*

* ** **

*

*

*

*** ****** *** ** ** ***

−100 0 100 300

* ****

**

*

**** *

**

***** *** *

***

**** *

*** ** *** *** ****

*

* *** *

* **

***** *

*

*

**

*

***

*

**

*****

*

*

* * ******** *

*

*

*

**

**

*

*** ***

***

**

*

* *

* ** ****

*

*

* **

*

*** * **

*

*

****

**

* **

*

**

*

** ** **

**

****

****

***

**

****** **

***** *

*

***

******

*** ** **** * ***

*

** **

*

*

* ***

***

**

**

** *

**

* ****

*** ****

**

*

**** **

* ** *

** **** *** *

*

***

***

* ** ***

*

*

**

*

**

**

**** **

****

** ** ***

*** * ***

****

**

*

** **

*** *

* ** ***

**

****

*** *

*

*

**

****

*

***

*

**

*

**

*** *

******

*

**

*** ****

*

******

*

* * *

*

***

**

***

*******

*** *

*

**

* *

*

**

*

****

**

* **

*

**

****** *

**

**

* ******

*

*

***

****

*

**

*** *

***

***************

*** **

***** **

*

*

**

*

***

***

** ** **********

** *****

*

*

******

* * *** ****

*

* **

*

* **

**

*****

**

**

**

**

****

*

*

***

** ** * *****

**

*

**

***

* ** *

**

**

**

*

***

****** *

**

* ***

******

*****

*** *

***

*

*****

*

*

*************** **

**

*** *

***

*

**

**

*****

**

* ****************

*** *

** ***

**

*

* **

*** *

***** *** *

***

*** **

**

* ** **

**** ****

*

* **

* *

* **

*******

*

**

*

***

*

**

****

*

*

*

* ** **

** *** **

*

*

**

**

*

** **

* *

** *

**

*

* *

* * * ** **

*

*

* **

*

** ** *

*

*

*

**

**

**

* **

*

**

*

** ** *

*

**

***

*** **

***

**

*** * *** *

**

** **

*

***

***

* **** **

***** ****

*

** **

*

*

* ***

**

**

*

***

**

**

* **

**

*** * *

**

**

*

* *** **

* ***

** ********

*

***

***

* *****

*

*

**

*

**

**

** *

***

***

** * *****

* ** * * **

***

***

*

** **

** **

** ***

**

** *

***

* * **

*

**** *

*

*

***

*

**

*

**

**

* ** * ****

*

**

**** ** *

*

******

*

***

*

**

**

**

******* **

* ***

*

**

* *

*

**

*

***

*

**

* **

*

**

* ****

* **

*

**

**** ****

*

**** *

**

*

**

****

***

**** **********

*

*** **

*** ***

**

*

***

* *****

*** ** ****

***

* *

***

** **

*

*

* **

* **

* *******

*

*

* **

*

*****

****

**

**

**

**

*

****

*

*

***

*** * ***** * **

*

****

***

***

**

***

*

**

*

***

*** *

* *

****

******

*****

* ** *

***

*

** ****

*

***** ***

** **

*** **

**

*** **

**

*

**

**

*****

*********** *

* ******

** **

−250 −100 0

* *** **

**

*******

***** ****

***

*** ****

* ** **

**** ****

*

* **

**

* ****** * **

*

**

*

***

*

**

*****

*

*

** ******

****

*

*

**

**

*

*** ***

** *

**

*

**

** *** **

*

*

* **

*

** ***

*

*

*

****

**

* ***

**

*

** ** **

**

****

* * **

**** *

*** *****

***** *

*

******** *

***** *********

** **

*

*

* ***

***

**

*****

**

* *** *

*** *** *

**

*

**** **** * *** *****

* ***

**

*

***

* *****

*

*

**

*

**

**

** ** **

** *

** *** **

*

**** ***

***

***

*

** ***

** ** ** *******

***** **

*

******

*

***

*

**

*

**

****

* *****

*

**

**** ** *

*

*** * **

*

* **

*

**

****

****** **

*

* ** *

*

****

*

**

*

***

*

**

***

*

**

* *** *

* ***

**

*******

*

*

*****

**

*

***

***** *

**************

*

*** **

***** ***

*

**

*

* **

** **** ** *

** ******

** **** *

*

*

* **

***

* *** **

***

*

***

*

****

*******

**

**

**

*

*** **

*

* **

** ** **** **

**

*

**

*****

****

****

*

**

*

***

*** *

**

****

*** ***

***

***** *

***

*

*****

*

*

********

****

*** **

**

**

* ****

*

**

**** **

*

**

**** ******* ******

****

* *** **

**

*******

*** *********

*** *********** ** ****

*

* ****

* **

***** *

*

*

**

*

***

*

**

*****

*

*

** **** ******

*

*

**

**

*

* ** ***

***

**

*

**

** *****

*

*

* **

*

******

*

*

******

****

**

*

** ****

**

***

****

*

**** *

******* *

*** ** *

*

***

***** *

****** **

*** * **

****

*

*

* ***

**

***

*****

**

* **

**

*** ****

**

*

*** ***

*** **** *** *

* ***

***

***

** ****

*

*

**

*

**

**

**** **

** **

* ** * ***

**** ***

******

*

*** *

***** ** ****

** *

***** **

*

**

** **

*

** *

*

**

*

**

***********

* *

** ** ***

*

**** **

*

* **

*

****

**

* *******

*

* ***

*

**

* *

*

**

*

***

*

**

* **

*

**

**** ** ***

**

* *******

*

***

* ***

*

**

****

***

**** **********

*

********** **

*

*

**

*

* **

** *

** * ** *** ******

** ** ***

*

*

******** ******

*

*

***

*

******

* ***

**

***

***

****

*

*

***

*** *** *****

*

*

**

* ****

* **

**

***

*

***

*******

**

****

**** **

*****

*** *

****

*****

*

*

***

**********

* ** *

**

****

** *

*

**

**

*****

**

** ***** ***** *****

*** *

−100 0 100

−100

0100

PC50.011

PCA SC het genes (2451), color by Pitx3

PC10.172

−100 0 100 200

** *

*

***

**

** *

*

* **

* ****

****

**

**

*

*

*

****

* ***

*

*** * ****

** *

**

*

*

*

**

**

*

***

*

****

** *

*

** **

*

*

* *

*

** ** ***

*

*

*

*

*

*

* *

*

** *

*

*

*** *

*

*

*

*

*

*

*

**

* **

*

**

*

*

*

* * *

*

*

**

* *****

*

* *

*

*

*

*

*

* **

***

*

*

*

** *

*

* **

*

**

***

*

* * **

*

*** ** **

*

***

*

*** **

*

* ***

*

*

** *

**

*

**

***

*

*

****

*

* **

*

*

*

*

*

*

**

**

***

**** *

**

**

** **

***

*

*

*

*

**

***** **

*

*** *

*

*

***

*

*

**

*

***

*

**

*

** * **

*

**** *

*

*

*

*

*

*

*

* *

**

*** ***

***

**

*

*

*

***

*

*

*

*

*

* **

*

*

*

** ** * * *

*

*

*

**

**

*

*****

*

*

*** *

**

* * ****

* **

**

*

*

*

*

*

*

****

**

**

*

*

*

* *** *

*

*

*

**

*** * *

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

****

*

*

*

*

**

*

**

*

*****

* *

*

*

*

*

*

** ***

*

*

****

*

* *

**

*

*

***

**

*

**** *** ****** ** ****

*

*** **

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** **

*** *

*

*

***** ** ** *

*

** **

*

*

* *** *

**

*

*

*****

*

*

** * **

*

**

*

**

***

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*** **

*

* *

*

***

**

*

**

*

*

*

**

*

** *

*

** ***

*

*

*

**

**

*****

** ** **

*

**

*

*

**

* *

*

****

*

*** ** **** * ***

**** ** *

* *

**

*

*

**

**

*

*

*** **

*

*

*

******* ** *** ** *** *

* * **

*

*****

** *

*

***

* ******* *

**

**

*

*

*

* ***

* ***

*

******* *

** **

*

*

*

*

**

* *

*

***

*

****

***

*

** ***

*

**

*

****** **

*

*

*

*

*

**

*

***

*

*

*** *

*

*

*

*

*

*

*

**

* **

*

**

*

*

*

* * *

*

*

**

* *****

*

* *

*

*

*

*

*

***

****

*

*

** *

*

* **

*

**

* * *

*

* ***

*

*** ***

*

*

***

*

* ****

*

****

*

*

***

**

*

**

****

*

****

*

* ***

*

*

*

*

*

**

**

** ******* *

**

*** *

****

*

*

*

**

****** *

*

* ***

*

*

****

*

**

*

***

*

**

*

*****

*

** * **

*

*

*

*

*

*

*

**

*********

**

**

*

*

*

* **

*

*

*

*

*

***

*

*

*

** *** *

**

*

*

**

* *

*

* ** **

*

*

*** *

**

* *****

***

**

*

*

*

*

*

*

*** *

**

**

*

*

*

* ****

*

*

*

**

** ** *

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

****

*

*

*

*

**

*

**

*

*** ****

*

*

*

*

*

* ****

*

*

****

*

* *

**

*

*

***

**

*

******* ****** * ******

** ***

*

*

*

*

*

*

*

*

*

****

****

*

*

** *** * *** *

*

*** *

*

*

* **** ***

*

* ** **

*

*

*****

*

**

*

**

** *

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

** ***

*

**

*

** *

**

*

**

*

*

*

**

*

** *

*

** ***

*

*

*

**

**

*** **

** ****

*

**

*

*

**

* *

*

*** *

*

*** *** *******

*****

**

* *

**

*

*

**

**

*

*

* ** **

*

*

*

** ******* ***** ** ***

−50 50 150

* **

*

****

*

***

*

***

** *****

* *

**

**

*

*

*

********

*

****** **

*****

*

*

*

**

**

*

***

*

*******

*

****

*

*

**

*

*** *****

*

*

*

*

*

**

*

* **

*

*

****

*

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

*

*

***

*

*

****** **

*

**

*

*

*

*

*

***

** **

*

*

***

*

***

*

**

* **

*

****

*

**** **

*

*

* **

*

* ****

*

****

*

*

***

* *

*

**

***

*

*

****

*

****

*

*

*

*

*

****

***

*******

* *

********

*

*

*

**

****** *

*

****

*

*

****

*

**

*

***

*

**

*

***

* *

*

* ** **

*

*

*

*

*

*

*

**

***

** ******

***

*

*

***

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*** ** ***

*

*

**

**

*

** ****

*

*****

*

**** **

***

**

*

*

*

*

*

*

****

**

**

*

*

*

* ****

*

*

*

**

*****

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

****

*

*

*

*

**

*

**

*

*** ****

*

*

*

*

*

*****

*

*

* ***

*

**

**

*

*

***

**

*

* *** ********** *****

*

*****

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** *

*

** **

*

*

** ********

*

* ***

*

*

*******

*

*

******

*

**** *

*

**

*

***

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

* * *

**

*

**

*

*

*

* *

*

***

*

*****

*

*

*

**

**

**** *

**** **

*

**

*

*

**

**

*

****

*

* ************

* ** ****

**

* *

*

*

* *

**

*

*

**** *

*

*

*

***** ***** *********

−100

100

300

***

*

** **

*

** *

*

**** ******

* *

**

**

*

*

*

* ***** **

*

*** **** *

** *

**

*

*

*

*** *

*

* **

*

****

***

*

** **

*

*

**

*

**** ** **

*

*

*

*

*

**

*

** *

*

*

*** *

*

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

*

*

* **

*

*

**

* **** *

*

**

*

*

*

*

*

*******

*

*

** *

*

* **

*

**

** *

*

* ***

*

*** ****

*

***

*

** ***

*

***

*

*

*

* **

**

*

**

***

*

*

*** *

*

* **

*

*

*

*

*

*

**

**

***

** *** **

* *

*** *** **

*

*

*

**

****

* **

*

* ***

*

*

* ***

*

**

*

***

*

**

*

*****

*

** ***

*

*

*

*

*

*

*

**

**** ** **

** *

**

*

*

*

* **

*

*

*

*

*

* **

*

*

*

** ****

**

*

*

**

* *

*

* ** **

*

*

*** ***

* **** *

* **

**

*

*

*

*

*

*

****

**

**

*

*

*

** ** *

*

*

*

**

**** *

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

** **

*

*

*

*

**

*

**

*

*****

* *

*

*

*

*

*

* ****

*

*

* ***

*

* *

**

*

*

***

**

*

***** ** ****** * *****

*

** ***

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** **

****

*

*

***** * *** *

*

****

*

*

********

*

*** ***

*

*** **

*

**

*

*****

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

** *

**

*

**

*

*

*

* *

*

** *

*

** ***

*

*

*

**

**

******

* ****

*

**

*

*

* *

* *

*

*** *

*

*** *** *** ****

*****

* *

* *

**

*

*

* *

**

*

*

* ** **

*

*

*

*** ****** *** ** ** ***

−100

0100

***

** **

***

**

****

****

*

**

**

* *

**

**

*

*

*

*

*

*

*

** ***

***

***

*

*

* *

*

****

*

** *

*

** *

**** ***

*

***

*

***

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

*

* ** *

*

*

* ***

**

****

**

*

*

***

*

*

**

*

*

*

* *

**

**

*

*

**

**

*

***

****

*

**

*** *

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

***

*

*

***

**

*

****

*

*** ***

***

**

**

*

**

*

*

**

* *

*

*

**

*

*

*

****

*

*

***

*

*

**

**

*

**

**

**

*

*

*

*** *

**

*

**

***

*

**

** *

**

**

***

*

*

*

*

*

*

* *

*

***

*

*

*

*

**

** **

*

**

**

* ***

*

**

**

* **

**

*

** **

**

*

*

*

*

* *

*

***

***

** **

**

*

***

*

*

*

****

**

*

******

**

* ***

*

*

**

* *****

*

*

*

* ***

**

**

*

*

* *****

** *

*

* **

*

*

**

*

* *

*

***

*

**

*

**

*

*

**

*****

**

*

* *

**

*****

** * ***

*

**

**

*

*

** *

**

*

*************

*

*

***

*

*

** *

** *

*

*

*

** * *

*

***

*

****

*******

***** *

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

*** ***

*

*

*

***

*

*

** ***

*

**

*

**

*

*

*

*

*

****

**

***

** **

*

****

*

*

**

*

****

* *

*

*

*

*

*

*

* *

****

***

***

*

*

*

* ***

***

**

*

*****

*

*

*

*

***

**

*****

*

************

*

***

*

* *

*

**

**

*

*

*

* **

**

*****

** **************** ****

PC20.063

**

**** *

***

**

****

* ***

*

**

**

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*****

***

** *

*

*

**

*

****

*

** *

*

** *

**** ***

*

** *

*

** *

*

*

*

*

*

*

** *

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

*

****

*

*

***

**

*

**

**

***

*

**

*

*

*

***

*

*

**

**

**

*

*

**

**

*

***

* ***

*

**

****

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

** *

*

*

***

***

****

*

******

***

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

**

*

*

*

* ***

*

*

***

*

*

**

* *

*

**

***

*

*

*

*

****

**

*

* *

***

*

**

***

**

**

****

*

*

*

*

*

**

*

** *

*

*

*

*

**

** **

*

**

**

****

*

**

**

* **

* *

*

** **

**

*

*

*

*

**

*

***

***

** **

* *

*

* **

*

*

*

****

**

*

* *****

**

*****

*

**

**** **

*

*

*

****

**

**

*

*

* **** *

* * *

*

* **

*

*

**

*

**

*

***

*

**

*

**

*

*

***

** **

**

*

**

**

* ****

******

*

**

**

*

*

***

**

*

****

****

*****

*

*

***

*

*

** *

** *

*

*

*

** **

*

* **

*

****

**** ***

***** *

*

*

*

**

*

* *

***

*

*

*

** ** **

*

*

*

***

*

*

* ****

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*** *

**

* **

** **

*

*** *

*

*

* *

*

******

*

*

*

*

*

*

**

***

**

**

**

*

*

*

*

****

***

**

*

**

***

*

*

*

*

***

**

**** *

*

*****

* ******

*

***

*

**

*

****

*

*

*

***

**

****

** **** ***

***

* *****

*****

**

**** *

***

**

****

** **

*

**

**

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*** **

***

* **

*

*

**

*

****

*

** *

*

***

*******

*

***

*

***

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

*

****

*

*

* ***

**

****

**

*

*

***

*

*

**

*

*

*

* *

**

**

*

*

* *

**

*

***

****

*

**

*** *

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

** *

*

*

** *

***

* ***

*

* * ** **

***

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

* *

*

*

*

****

*

*

***

*

*

**

**

*

**

**

**

*

*

*

*** *

**

*

**

***

*

**

***

**

**

***

*

*

*

*

*

*

* *

*

* **

*

*

*

*

**

** **

*

**

**

* ***

*

**

**

***

**

*

* * **

**

*

*

*

*

* *

*

***

***

* ***

**

*

** *

*

*

*

****

**

*

**** **

**

****

*

*

**

******

*

*

*

****

***

*

*

*

* *****

***

*

***

*

*

**

*

**

*

***

*

**

*

**

*

*

***** **

**

*

* *

**

******** ***

*

**

**

*

*

***

**

*

*************

*

*

***

*

*

***

** *

*

*

*

** **

*

***

*

****

**** ***

***** *

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

******

*

*

*

***

*

*

* ***

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

****

**

***

****

*

* ***

*

*

* *

*

******

*

*

*

*

*

*

* *

****

***

***

*

*

*

****

***

**

*

*****

*

*

*

*

***

**

*****

*

* ***********

*

***

*

**

*

**

**

*

*

*

***

**

***

**

* ** ********** *******

**

****

** *

***

**

***

*

* ***

*

**

**

**

**

***

*

*

*

*

*

*

*** **

* **

** *

*

*

**

*

* ***

*

***

*

** *

***

* **

*

*

** *

*

** *

*

*

*

*

*

*

** *

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

* **

*

*

****

*

*

* **

***

**

**

**

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

**

**

**

*

*

**

**

*

***

****

*

**

**

**

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

***

*

*

***

**

*

* ** *

*

*** ** *

***

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

**

*

*

*

****

*

*

* **

*

*

**

* *

*

* *

**

**

*

*

*

****

**

*

* *

***

*

* *

***

**

**

***

*

*

*

*

*

*

**

*

** *

*

*

*

*

**

* ***

*

**

**

** **

*

* *

**

***

* *

*

* ****

*

*

*

*

*

**

*

***

**

*

** **

* *

*

* **

*

*

*

****

**

*

* **** *

**

*****

*

**

******

*

*

*

** **

**

**

*

*

******* **

*

***

*

*

**

*

**

*

* **

*

**

*

**

*

*

*******

* *

*

* *

**

* ****

* ** ***

*

**

* *

*

*

***

**

*

****

* ***

*****

*

*

***

*

*

** *

***

*

*

*

** **

*

***

*

**

**

** *********

**

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

**** **

*

*

*

** *

*

*

* ***

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

****

**

***

****

*

****

*

*

* *

*

***

***

*

*

*

*

*

*

* *

* **

**

**

**

*

*

*

*

****

***

**

*

***

***

*

*

*

** *

**

**** *

*

****** **

* ***

*

***

*

**

*

***

*

*

*

*

** *

**

****

*********

***

* *******

***

***

***

* *** **

*** ******** *

*

* ***

*

***

*

**

***

* *********

*

*

***

** ** *

**

*

***

**

***

*

**

*

*** * * ** *

*******

* * **

**

*

** *

***

* ***** *

**

***

** *

*** ***

*

* **** *

***

*****

***

*** *

**

**

*

* ***

**

***

**** *** *

** *

**** ****

**** *

*** *****

**** **

**** * *** *

*

*** *

*

**** *

* ***

*

* ** *****

* ** ******* ******

* *** **

**

***** * **

***

**

**

****

****

*****

*****

* *

*****

* **

**

*

***

** *

******

*

****

**

* *

**

*

*

*

*

*

*** * ** ****** ** ** ****

*

****

**

***

** *

*******

*** *** *

*

*

* ****

*

*

*

***

**

* **** ***

**

***** *

*

**

**

* *

*

* * *

*

***

*

**

*

**

*

**

**

****

** **

*

* *

*****

** * **

*

*

** ** **

** *

***

**************

*

***

* ******

*

**

* **

*

** *

**

*** ** *

*

********

*

*

*

*****

*

*****

*

** *** ***

* ** **** *

**

*

* *

***

**

*

**

* **

*

**

**

**

**

*

*

*

*

******

*

*

*

**

** **

** *

* ** ** * *

* **

*

*****

*

** * *

**

******

*****

**

*

*

***

**

*

**** **************

****

* **

** **

** ** **

* *

****

**

*

*****************

** *

****

**

** ** *

** * * ** ***

*** *

*

****

*

** *

*

**

***

***** * **

**

*

*

***

*****

**

*

****

****

*

* *

*

*** * **

* *

*** ** *

** **

*

**

*

** *

** *

** ***

**

**

***

** *

**

***

*

*

* *** ****

**

****

****

* ***

** *

*

* ***

**

***

**** *

** **

**

* * *** ***** *

***** **

***

*** ***

**** ******

****

*

*****

* **

*

*

* * ** ***

** *

***** ***** **

*** *** *

**

*

****** *** *

*

**

**

****

****

**** *

** ** *

**

****

*

***

**

*

** *

** *

* *****

*

*** *

**

* *

**

*

*

*

*

*

* ** *** *

*** *

* ****** **

*

****

**

***

***** * ****

* ***** *

*

*

******

*

*

* **

*** *

** **

**

**

*** ***

*

**

* *

* *

*

***

*

***

*

**

*

**

*

**

**

****

* ** *

*

**

** ***

******

*

** *** ****

***

**** *******

***

*

***

* **** **

*

**

***

*

* **

**

****

***

*****

** *

*

*

*

** ***

*

* **

* *

*

***

*****

*** * * *****

*

* *

***

**

*

**

***

*

**

***

**

**

*

*

*

***** *

*

*

*

*****

** **

**** ***

***

*

****

*

*

* ***

**

******

**

* **

**

*

*

***

**

*

**** ***

******* * **

*

****

* * *

** **

** ****

**

*** *

**

*

***

***** ***** ****

* ** PC30.026

**

****

* ****

** ** *

********

*

****

*

** *

*

******* ********

*

*

***

** ** *

**

*

***

**

***

*

**

*

***** ***

**** ***** **

**

*

** *

***

****** *

**

** **

***** ***

*

* *****

* ****** ****

*** *

**

**

*

****

**

***

********

** *

***** **** **

*** ******

**

* ***** *

**** * ***

*** *

*

**** *****

*

***** ***

*** ******* * *******

* ***

**

** *** ** *

* **

**

**

*** *****

*** **

** **** *

*****

***

* *

*

********

****

*

*****

** *

**

*

*

*

*

*

****** *** ****** *** **

*

** **

**

***

**** **** **

** *****

*

*

* *****

*

*

***

**

* **** *

* *

**

*******

**

**

**

*

***

*

***

*

**

*

**

*

*****

***

** **

*

* *

*****

*** ***

*

***

** ****

***

* *** *********

*

*

***

*******

*

**

***

*

* * *

**

*** *

***

** ******

*

*

*

* ****

*

*****

*

** ******

* *********

*

**

***

**

*

**

***

*

**

***

***

*

*

*

*

** ****

*

*

*

**

* * **** *

*** ** * *

***

*

*****

*

** **

**

*****

*

*** **

**

*

*

***

**

*

**** ** ************

* ** ****

*** *

*** **** *

****

**

*

****** ***** ******** *

−250

−100

0****

**

* ****** ***

* *******

*

****

*

****

**** *** *** ***

* *

*

*

***

* * ***

**

*

* ***

****

*

**

*

**

** ****

** *** **

** **

**

*

** *

** *

*******

**

** *

****** **

*

*

* ********

******

**** **

**

**

*

*** *

**

***

*****

****

**

* ***** **

**********

* ******* ** *

* ***** **

*** *

*

*** **

* **

*

*

*** * ****

* **** *

** *** * *** ***

** ***

*

****** *****

**

**

* ******

** **

**

*** ****

**

***

* ****

*

** *

***

** ** **

*

* ** *

****

***

*

*

*

*

* ** ****

****

* ** ** ****

*

* ***

**

***

***

* * **** *

* ******

*

*

* *****

*

*

***

**

***

* ****

**

******

*

**

* *

* *

*

* **

*

* **

*

* *

*

**

*

**

*****

*

* ** *

*

* *

****

*

*** **

*

*

*** ** *

***

***

***** ******

***

*

***

****

***

*

**

* **

*

** *

**

*******

********

*

*

*

*****

*

***

**

*

***

****

*

* **** ***

**

*

**

****

*

*

**

* **

*

**

**

***

**

*

*

*

******

*

*

*

**

** *** **

* *** * **

***

*

****

*

*

* ***

**

*****

*

*****

**

*

*

** *

**

*

***** **

******* ***

*

****

** *

** **

*** ** ***

*** *

**

*

**** ********* ***

****

−50

50150

***

** **

**

* ***

*****

** ***

*** *** *

*

*

*** ** ***

*

*********** **

*

**

**

**

*

****

**** ***

**** *

*

** *

*

******* *

***

**

**

*

***

*

**

*****

*

*

**

*

* *****

**

*

*

*

*** *

*

***** ***

** *

**

*

*

*

***

* ***

*

*

***

**** *** *

* *

*

****

*

******

* *

***

**

***

*

*

** ***

*** *

**

**

** **

* *

* ****

*** *

** **

***

**

****

******

*

*

***** **

*

*

*

*

** **** *

**

*

****

*

*

** *****

**

***

* **

*****

*

*****

*

*

*

*

*

* **** * ****** *** ***

*

****

**

*

*

*

****

*

* ***** * **

*

*

**

**

*

***** *

*

**** * ******* *

****

**

***

*

****

****

*

*

** ** **

*

*

*

**

******

**

*

*

**

*

*

** *

*

*

**

*

*

**

**

* *****

***

***

*

**

*

******

*

***

**** *

**

*

** *

***

******************

* *** ***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

****

*

*

**********

*

**** *

*

*** ** ** **** *** **

* ***

*

**

* ** **

**

*

*** *

*

**

*

***

**

****

*

*

* * ***** *

*

**

**** * **

*

**

*

*

* **

* ***

***** *

*

** ***

*****

******

*

***

*

****

*

****

*

************* **

**

* ****

*

**

* *

*

*

*

*

*

*****

*

*

*

*************** *** * *

*****

**** * *

*

* *** *

** ****

******

*

*

*** ** ***

*

**** ****** * **

*

**

**

**

*

****

**** ** *

*** * *

*

** *

*

** ***** *

* **

**

* *

*

** *

*

**

** ***

*

*

***

* ** *****

*

*

*

* * **

*

*** ** ***

** ** *

*

*

*

* **

* ***

*

*

** *

** ** *** *

**

*

* * **

*

*** ** ***

***

**

***

*

*

* ****

*** *

**

**

** ****

* *****

** **

* * ** *

**

**

****** ***

*

*

** *

** ***

*

*

*

** *****

**

*

*** *

*

*

** ******

***

** *

*** * *

*

*

****

*

*

*

*

*

*

** * ** * *** *** *** ***

*

*** *

**

*

*

*

* ***

*

* ** ** * * **

*

*

**

**

*

***** *

*

*** **

** * **** *

****

**

** *

*

****

* ** *

*

*

** ** * **

*

*

**

*** * **

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

*

**

**

* *** **

***

* **

*

**

*

** *****

***

* ** * *

**

*

***

***

**** *** ****** *

****

* **** **

*

*

*

*

***

*

*

***

*

*** *

*

*

***** ** ** *

*

** ***

*

* *** * ***

* ***** **

* * **

*

**** * *

***

*

** **

*

* *

*

***

**

****

*

*

* ***** * *

*

**

**

****

*

*

**

*

*

***

** **

** *** *

*

*****

*****

** ****

*

***

*

*** *

*

****

*

*** ** **

** * ******

** * ** *

*

* *

* *

*

*

*

*

*

*** ***

*

*

*****

** ** *** ** *** ***

**

* *****

** **

**** *** ****

*******

*

* ** ** ***

*

******* *

** ***

*

**

**

* *

*

****

**** ****

** * **

***

*

********* *

*

**

**

*

***

*

**

** ***

*

*

**

*

*** ***

**

*

*

*

* * **

*

*** ** ***

** *

**

*

*

*

***

* ***

*

*

** *

** ******

* *

*

* ***

*

*** ***

* *

*****

****

*

*****

****

**

**

** **

* *

* ****

****

*******

**

** ******* **

*

***** **

*

*

*

*

** *****

***

* ***

*

*

** *****

****

** ***** **

*

** **

*

*

*

*

*

*

* ***** ***

*** *** *

**

*

**

***

*

*

*

*

*****

*** *** ***

*

*

**

**

*

* ** ** *

*

*** **** ***** *****

**

** *

*

*** *

****

*

*

** ** ***

*

*

**

** ** **

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

*

**

**

* *** **

******

*

**

*

* *****

*

***

*** **

***

***

***

******* ****** *

****

**** ***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*** *

*

*

** *** * *** *

*

*** **

*

* **** ***

** ** ** **

*****

**** **

** *

*

** * *

*

**

*

***

**

* ***

*

*

* **** ** *

*

**

**** ***

*

**

*

*

***

** **

** *** *

*

*****

*** **

** **

**

*

***

*

*** *

*

*** *

*

*** *** ******* **

**

**** *

*

* *

**

*

*

*

*

*

* ** **

*

*

*

** ***

**** ***** ** ***

PC40.016 *

****

***

*** **

*** * *

************

*

*

* ** *** **

*

******* *** ***

*

**

*** *

*

* ***

**** ****

** ***

***

*

* *** ** ****

*

**

**

*

** *

*

**

** ** *

*

*

***

** ****

**

*

*

*

* ***

*

*** ** ** **

*** *

*

*

*

*****

* *

*

*

** *

** *** ***

* *

*

* ***

*

*** *****

*****

* ***

*

*** **

****

**

**

** **

**

*** **

*****

**** **

**

***

** *** **

*

*

***

*** **

*

*

*

*******

***

* ***

*

*

* ******

**

***

* **

* ****

*

** ***

*

*

*

*

*

** ****** **** ** **

**

*

**

****

*

*

*

* ***

*

*** **** **

*

*

**

**

*

* ** ** *

*

*** **

** **** ** ****

*****

*

****

****

*

*

*** ** *

*

*

*

**

**** **

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

*

**

**

* **** *

***

* **

*

**

*

* *****

*

***

** * ***

**

***

***

***** ** ****** *

****** ** ***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

****

*

*

***** * *** *

*

*****

*

** **** **

**** ** **

****

*

**

** *****

*

*** *

*

* *

*

***

**

****

*

*

********

*

**

***

****

*

**

*

*

* **

** **

** ****

*

*** **

*****

** ****

*

***

*

* ** *

*

*** *

*

*** *** *

** ********

** ** *

*

* *

**

*

*

*

*

*

* ** **

*

*

*

*** ****** *** ** ** ***

−100 0 100 300

* ****

**

*

**** *

**

***** *** *

***

**** *

*** ** *** *** ****

*

* *** *

* **

***** *

*

*

**

*

***

*

**

*****

*

*

* * ******** *

*

*

*

**

**

*

*** ***

***

**

*

* *

* ** ****

*

*

* **

*

*** * **

*

*

****

**

* **

*

**

*

** ** **

**

****

****

***

**

****** **

***** *

*

***

******

*** ** **** * ***

*

** **

*

*

* ***

***

**

**

** *

**

* ****

*** ****

**

*

**** **

* ** *

** **** *** *

*

***

***

* ** ***

*

*

**

*

**

**

**** **

****

** ** ***

*** * ***

****

**

*

** **

*** *

* ** ***

**

****

*** *

*

*

**

****

*

***

*

**

*

**

*** *

******

*

**

*** ****

*

******

*

* * *

*

***

**

***

*******

*** *

*

**

* *

*

**

*

****

**

* **

*

**

****** *

**

**

* ******

*

*

***

****

*

**

*** *

***

***************

*** **

***** **

*

*

**

*

***

***

** ** **********

** *****

*

*

******

* * *** ****

*

* **

*

* **

**

*****

**

**

**

**

****

*

*

***

** ** * *****

**

*

**

***

* ** *

**

**

**

*

***

****** *

**

* ***

******

*****

*** *

***

*

*****

*

*

*************** **

**

*** *

***

*

**

**

*****

**

* ****************

*** *

** ***

**

*

* **

*** *

***** *** *

***

*** **

**

* ** **

**** ****

*

* **

* *

* **

*******

*

**

*

***

*

**

****

*

*

*

* ** **

** *** **

*

*

**

**

*

** **

* *

** *

**

*

* *

* * * ** **

*

*

* **

*

** ** *

*

*

*

**

**

**

* **

*

**

*

** ** *

*

**

***

*** **

***

**

*** * *** *

**

** **

*

***

***

* **** **

***** ****

*

** **

*

*

* ***

**

**

*

***

**

**

* **

**

*** * *

**

**

*

* *** **

* ***

** ********

*

***

***

* *****

*

*

**

*

**

**

** *

***

***

** * *****

* ** * * **

***

***

*

** **

** **

** ***

**

** *

***

* * **

*

**** *

*

*

***

*

**

*

**

**

* ** * ****

*

**

**** ** *

*

******

*

***

*

**

**

**

******* **

* ***

*

**

* *

*

**

*

***

*

**

* **

*

**

* ****

* **

*

**

**** ****

*

**** *

**

*

**

****

***

**** **********

*

*** **

*** ***

**

*

***

* *****

*** ** ****

***

* *

***

** **

*

*

* **

* **

* *******

*

*

* **

*

*****

****

**

**

**

**

*

****

*

*

***

*** * ***** * **

*

****

***

***

**

***

*

**

*

***

*** *

* *

****

******

*****

* ** *

***

*

** ****

*

***** ***

** **

*** **

**

*** **

**

*

**

**

*****

*********** *

* ******

** **

−250 −100 0

* *** **

**

*******

***** ****

***

*** ****

* ** **

**** ****

*

* **

**

* ****** * **

*

**

*

***

*

**

*****

*

*

** ******

****

*

*

**

**

*

*** ***

** *

**

*

**

** *** **

*

*

* **

*

** ***

*

*

*

****

**

* ***

**

*

** ** **

**

****

* * **

**** *

*** *****

***** *

*

******** *

***** *********

** **

*

*

* ***

***

**

*****

**

* *** *

*** *** *

**

*

**** **** * *** *****

* ***

**

*

***

* *****

*

*

**

*

**

**

** ** **

** *

** *** **

*

**** ***

***

***

*

** ***

** ** ** *******

***** **

*

******

*

***

*

**

*

**

****

* *****

*

**

**** ** *

*

*** * **

*

* **

*

**

****

****** **

*

* ** *

*

****

*

**

*

***

*

**

***

*

**

* *** *

* ***

**

*******

*

*

*****

**

*

***

***** *

**************

*

*** **

***** ***

*

**

*

* **

** **** ** *

** ******

** **** *

*

*

* **

***

* *** **

***

*

***

*

****

*******

**

**

**

*

*** **

*

* **

** ** **** **

**

*

**

*****

****

****

*

**

*

***

*** *

**

****

*** ***

***

***** *

***

*

*****

*

*

********

****

*** **

**

**

* ****

*

**

**** **

*

**

**** ******* ******

****

* *** **

**

*******

*** *********

*** *********** ** ****

*

* ****

* **

***** *

*

*

**

*

***

*

**

*****

*

*

** **** ******

*

*

**

**

*

* ** ***

***

**

*

**

** *****

*

*

* **

*

******

*

*

******

****

**

*

** ****

**

***

****

*

**** *

******* *

*** ** *

*

***

***** *

****** **

*** * **

****

*

*

* ***

**

***

*****

**

* **

**

*** ****

**

*

*** ***

*** **** *** *

* ***

***

***

** ****

*

*

**

*

**

**

**** **

** **

* ** * ***

**** ***

******

*

*** *

***** ** ****

** *

***** **

*

**

** **

*

** *

*

**

*

**

***********

* *

** ** ***

*

**** **

*

* **

*

****

**

* *******

*

* ***

*

**

* *

*

**

*

***

*

**

* **

*

**

**** ** ***

**

* *******

*

***

* ***

*

**

****

***

**** **********

*

********** **

*

*

**

*

* **

** *

** * ** *** ******

** ** ***

*

*

******** ******

*

*

***

*

******

* ***

**

***

***

****

*

*

***

*** *** *****

*

*

**

* ****

* **

**

***

*

***

*******

**

****

**** **

*****

*** *

****

*****

*

*

***

**********

* ** *

**

****

** *

*

**

**

*****

**

** ***** ***** *****

*** *

−100 0 100

−100

0100

PC50.011

PCA SC het genes (2451), color by EGFP

PC10.172

−100 0 100 200

** *

*

***

**

** *

*

* **

* ****

****

**

**

*

*

*

****

* ***

*

*** * ****

** *

**

*

*

*

**

**

*

***

*

****

** *

*

** **

*

*

* *

*

** ** ***

*

*

*

*

*

*

* *

*

** *

*

*

*** *

*

*

*

*

*

*

*

**

* **

*

**

*

*

*

* * *

*

*

**

* *****

*

* *

*

*

*

*

*

* **

***

*

*

*

** *

*

* **

*

**

***

*

* * **

*

*** ** **

*

***

*

*** **

*

* ***

*

*

** *

**

*

**

***

*

*

****

*

* **

*

*

*

*

*

*

**

**

***

**** *

**

**

** **

***

*

*

*

*

**

***** **

*

*** *

*

*

***

*

*

**

*

***

*

**

*

** * **

*

**** *

*

*

*

*

*

*

*

* *

**

*** ***

***

**

*

*

*

***

*

*

*

*

*

* **

*

*

*

** ** * * *

*

*

*

**

**

*

*****

*

*

*** *

**

* * ****

* **

**

*

*

*

*

*

*

****

**

**

*

*

*

* *** *

*

*

*

**

*** * *

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

****

*

*

*

*

**

*

**

*

*****

* *

*

*

*

*

*

** ***

*

*

****

*

* *

**

*

*

***

**

*

**** *** ****** ** ****

*

*** **

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** **

*** *

*

*

***** ** ** *

*

** **

*

*

* *** *

**

*

*

*****

*

*

** * **

*

**

*

**

***

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*** **

*

* *

*

***

**

*

**

*

*

*

**

*

** *

*

** ***

*

*

*

**

**

*****

** ** **

*

**

*

*

**

* *

*

****

*

*** ** **** * ***

**** ** *

* *

**

*

*

**

**

*

*

*** **

*

*

*

******* ** *** ** *** *

* * **

*

*****

** *

*

***

* ******* *

**

**

*

*

*

* ***

* ***

*

******* *

** **

*

*

*

*

**

* *

*

***

*

****

***

*

** ***

*

**

*

****** **

*

*

*

*

*

**

*

***

*

*

*** *

*

*

*

*

*

*

*

**

* **

*

**

*

*

*

* * *

*

*

**

* *****

*

* *

*

*

*

*

*

***

****

*

*

** *

*

* **

*

**

* * *

*

* ***

*

*** ***

*

*

***

*

* ****

*

****

*

*

***

**

*

**

****

*

****

*

* ***

*

*

*

*

*

**

**

** ******* *

**

*** *

****

*

*

*

**

****** *

*

* ***

*

*

****

*

**

*

***

*

**

*

*****

*

** * **

*

*

*

*

*

*

*

**

*********

**

**

*

*

*

* **

*

*

*

*

*

***

*

*

*

** *** *

**

*

*

**

* *

*

* ** **

*

*

*** *

**

* *****

***

**

*

*

*

*

*

*

*** *

**

**

*

*

*

* ****

*

*

*

**

** ** *

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

****

*

*

*

*

**

*

**

*

*** ****

*

*

*

*

*

* ****

*

*

****

*

* *

**

*

*

***

**

*

******* ****** * ******

** ***

*

*

*

*

*

*

*

*

*

****

****

*

*

** *** * *** *

*

*** *

*

*

* **** ***

*

* ** **

*

*

*****

*

**

*

**

** *

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

** ***

*

**

*

** *

**

*

**

*

*

*

**

*

** *

*

** ***

*

*

*

**

**

*** **

** ****

*

**

*

*

**

* *

*

*** *

*

*** *** *******

*****

**

* *

**

*

*

**

**

*

*

* ** **

*

*

*

** ******* ***** ** ***

−50 50 150

* **

*

****

*

***

*

***

** *****

* *

**

**

*

*

*

********

*

****** **

*****

*

*

*

**

**

*

***

*

*******

*

****

*

*

**

*

*** *****

*

*

*

*

*

**

*

* **

*

*

****

*

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

*

*

***

*

*

****** **

*

**

*

*

*

*

*

***

** **

*

*

***

*

***

*

**

* **

*

****

*

**** **

*

*

* **

*

* ****

*

****

*

*

***

* *

*

**

***

*

*

****

*

****

*

*

*

*

*

****

***

*******

* *

********

*

*

*

**

****** *

*

****

*

*

****

*

**

*

***

*

**

*

***

* *

*

* ** **

*

*

*

*

*

*

*

**

***

** ******

***

*

*

***

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*** ** ***

*

*

**

**

*

** ****

*

*****

*

**** **

***

**

*

*

*

*

*

*

****

**

**

*

*

*

* ****

*

*

*

**

*****

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

****

*

*

*

*

**

*

**

*

*** ****

*

*

*

*

*

*****

*

*

* ***

*

**

**

*

*

***

**

*

* *** ********** *****

*

*****

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** *

*

** **

*

*

** ********

*

* ***

*

*

*******

*

*

******

*

**** *

*

**

*

***

**

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

* * *

**

*

**

*

*

*

* *

*

***

*

*****

*

*

*

**

**

**** *

**** **

*

**

*

*

**

**

*

****

*

* ************

* ** ****

**

* *

*

*

* *

**

*

*

**** *

*

*

*

***** ***** *********

−100

100

300

***

*

** **

*

** *

*

**** ******

* *

**

**

*

*

*

* ***** **

*

*** **** *

** *

**

*

*

*

*** *

*

* **

*

****

***

*

** **

*

*

**

*

**** ** **

*

*

*

*

*

**

*

** *

*

*

*** *

*

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

*

*

* **

*

*

**

* **** *

*

**

*

*

*

*

*

*******

*

*

** *

*

* **

*

**

** *

*

* ***

*

*** ****

*

***

*

** ***

*

***

*

*

*

* **

**

*

**

***

*

*

*** *

*

* **

*

*

*

*

*

*

**

**

***

** *** **

* *

*** *** **

*

*

*

**

****

* **

*

* ***

*

*

* ***

*

**

*

***

*

**

*

*****

*

** ***

*

*

*

*

*

*

*

**

**** ** **

** *

**

*

*

*

* **

*

*

*

*

*

* **

*

*

*

** ****

**

*

*

**

* *

*

* ** **

*

*

*** ***

* **** *

* **

**

*

*

*

*

*

*

****

**

**

*

*

*

** ** *

*

*

*

**

**** *

*

*

*

*

*

**

*

*

*

**

** **

*

*

*

*

**

*

**

*

*****

* *

*

*

*

*

*

* ****

*

*

* ***

*

* *

**

*

*

***

**

*

***** ** ****** * *****

*

** ***

*

*

*

*

*

*

*

*

*

** **

****

*

*

***** * *** *

*

****

*

*

********

*

*** ***

*

*** **

*

**

*

*****

*

*

*

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

*

*

*

*

*****

*

**

*

** *

**

*

**

*

*

*

* *

*

** *

*

** ***

*

*

*

**

**

******

* ****

*

**

*

*

* *

* *

*

*** *

*

*** *** *** ****

*****

* *

* *

**

*

*

* *

**

*

*

* ** **

*

*

*

*** ****** *** ** ** ***

−100

0100

***

** **

***

**

****

****

*

**

**

* *

**

**

*

*

*

*

*

*

*

** ***

***

***

*

*

* *

*

****

*

** *

*

** *

**** ***

*

***

*

***

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

*

* ** *

*

*

* ***

**

****

**

*

*

***

*

*

**

*

*

*

* *

**

**

*

*

**

**

*

***

****

*

**

*** *

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

***

*

*

***

**

*

****

*

*** ***

***

**

**

*

**

*

*

**

* *

*

*

**

*

*

*

****

*

*

***

*

*

**

**

*

**

**

**

*

*

*

*** *

**

*

**

***

*

**

** *

**

**

***

*

*

*

*

*

*

* *

*

***

*

*

*

*

**

** **

*

**

**

* ***

*

**

**

* **

**

*

** **

**

*

*

*

*

* *

*

***

***

** **

**

*

***

*

*

*

****

**

*

******

**

* ***

*

*

**

* *****

*

*

*

* ***

**

**

*

*

* *****

** *

*

* **

*

*

**

*

* *

*

***

*

**

*

**

*

*

**

*****

**

*

* *

**

*****

** * ***

*

**

**

*

*

** *

**

*

*************

*

*

***

*

*

** *

** *

*

*

*

** * *

*

***

*

****

*******

***** *

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

*** ***

*

*

*

***

*

*

** ***

*

**

*

**

*

*

*

*

*

****

**

***

** **

*

****

*

*

**

*

****

* *

*

*

*

*

*

*

* *

****

***

***

*

*

*

* ***

***

**

*

*****

*

*

*

*

***

**

*****

*

************

*

***

*

* *

*

**

**

*

*

*

* **

**

*****

** **************** ****

PC20.063

**

**** *

***

**

****

* ***

*

**

**

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*****

***

** *

*

*

**

*

****

*

** *

*

** *

**** ***

*

** *

*

** *

*

*

*

*

*

*

** *

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

*

****

*

*

***

**

*

**

**

***

*

**

*

*

*

***

*

*

**

**

**

*

*

**

**

*

***

* ***

*

**

****

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

** *

*

*

***

***

****

*

******

***

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

**

*

*

*

* ***

*

*

***

*

*

**

* *

*

**

***

*

*

*

*

****

**

*

* *

***

*

**

***

**

**

****

*

*

*

*

*

**

*

** *

*

*

*

*

**

** **

*

**

**

****

*

**

**

* **

* *

*

** **

**

*

*

*

*

**

*

***

***

** **

* *

*

* **

*

*

*

****

**

*

* *****

**

*****

*

**

**** **

*

*

*

****

**

**

*

*

* **** *

* * *

*

* **

*

*

**

*

**

*

***

*

**

*

**

*

*

***

** **

**

*

**

**

* ****

******

*

**

**

*

*

***

**

*

****

****

*****

*

*

***

*

*

** *

** *

*

*

*

** **

*

* **

*

****

**** ***

***** *

*

*

*

**

*

* *

***

*

*

*

** ** **

*

*

*

***

*

*

* ****

*

**

*

**

*

*

*

*

*

*** *

**

* **

** **

*

*** *

*

*

* *

*

******

*

*

*

*

*

*

**

***

**

**

**

*

*

*

*

****

***

**

*

**

***

*

*

*

*

***

**

**** *

*

*****

* ******

*

***

*

**

*

****

*

*

*

***

**

****

** **** ***

***

* *****

*****

**

**** *

***

**

****

** **

*

**

**

**

**

**

*

*

*

*

*

*

*

*** **

***

* **

*

*

**

*

****

*

** *

*

***

*******

*

***

*

***

*

*

*

*

*

*

***

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

***

*

*

****

*

*

* ***

**

****

**

*

*

***

*

*

**

*

*

*

* *

**

**

*

*

* *

**

*

***

****

*

**

*** *

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

** *

*

*

** *

***

* ***

*

* * ** **

***

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

* *

*

*

*

****

*

*

***

*

*

**

**

*

**

**

**

*

*

*

*** *

**

*

**

***

*

**

***

**

**

***

*

*

*

*

*

*

* *

*

* **

*

*

*

*

**

** **

*

**

**

* ***

*

**

**

***

**

*

* * **

**

*

*

*

*

* *

*

***

***

* ***

**

*

** *

*

*

*

****

**

*

**** **

**

****

*

*

**

******

*

*

*

****

***

*

*

*

* *****

***

*

***

*

*

**

*

**

*

***

*

**

*

**

*

*

***** **

**

*

* *

**

******** ***

*

**

**

*

*

***

**

*

*************

*

*

***

*

*

***

** *

*

*

*

** **

*

***

*

****

**** ***

***** *

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

******

*

*

*

***

*

*

* ***

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

****

**

***

****

*

* ***

*

*

* *

*

******

*

*

*

*

*

*

* *

****

***

***

*

*

*

****

***

**

*

*****

*

*

*

*

***

**

*****

*

* ***********

*

***

*

**

*

**

**

*

*

*

***

**

***

**

* ** ********** *******

**

****

** *

***

**

***

*

* ***

*

**

**

**

**

***

*

*

*

*

*

*

*** **

* **

** *

*

*

**

*

* ***

*

***

*

** *

***

* **

*

*

** *

*

** *

*

*

*

*

*

*

** *

*

*

*

*

*

***

*

*

*

**

*

*

**

*

* **

*

*

****

*

*

* **

***

**

**

**

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*

**

**

**

*

*

**

**

*

***

****

*

**

**

**

*

**

*

*

*

**

**

*

**

***

***

*

*

***

**

*

* ** *

*

*** ** *

***

**

**

*

**

*

*

**

**

*

*

**

*

*

*

****

*

*

* **

*

*

**

* *

*

* *

**

**

*

*

*

****

**

*

* *

***

*

* *

***

**

**

***

*

*

*

*

*

*

**

*

** *

*

*

*

*

**

* ***

*

**

**

** **

*

* *

**

***

* *

*

* ****

*

*

*

*

*

**

*

***

**

*

** **

* *

*

* **

*

*

*

****

**

*

* **** *

**

*****

*

**

******

*

*

*

** **

**

**

*

*

******* **

*

***

*

*

**

*

**

*

* **

*

**

*

**

*

*

*******

* *

*

* *

**

* ****

* ** ***

*

**

* *

*

*

***

**

*

****

* ***

*****

*

*

***

*

*

** *

***

*

*

*

** **

*

***

*

**

**

** *********

**

*

*

*

**

*

**

***

*

*

*

**** **

*

*

*

** *

*

*

* ***

*

*

**

*

**

*

*

*

*

*

****

**

***

****

*

****

*

*

* *

*

***

***

*

*

*

*

*

*

* *

* **

**

**

**

*

*

*

*

****

***

**

*

***

***

*

*

*

** *

**

**** *

*

****** **

* ***

*

***

*

**

*

***

*

*

*

*

** *

**

****

*********

***

* *******

***

***

***

* *** **

*** ******** *

*

* ***

*

***

*

**

***

* *********

*

*

***

** ** *

**

*

***

**

***

*

**

*

*** * * ** *

*******

* * **

**

*

** *

***

* ***** *

**

***

** *

*** ***

*

* **** *

***

*****

***

*** *

**

**

*

* ***

**

***

**** *** *

** *

**** ****

**** *

*** *****

**** **

**** * *** *

*

*** *

*

**** *

* ***

*

* ** *****

* ** ******* ******

* *** **

**

***** * **

***

**

**

****

****

*****

*****

* *

*****

* **

**

*

***

** *

******

*

****

**

* *

**

*

*

*

*

*

*** * ** ****** ** ** ****

*

****

**

***

** *

*******

*** *** *

*

*

* ****

*

*

*

***

**

* **** ***

**

***** *

*

**

**

* *

*

* * *

*

***

*

**

*

**

*

**

**

****

** **

*

* *

*****

** * **

*

*

** ** **

** *

***

**************

*

***

* ******

*

**

* **

*

** *

**

*** ** *

*

********

*

*

*

*****

*

*****

*

** *** ***

* ** **** *

**

*

* *

***

**

*

**

* **

*

**

**

**

**

*

*

*

*

******

*

*

*

**

** **

** *

* ** ** * *

* **

*

*****

*

** * *

**

******

*****

**

*

*

***

**

*

**** **************

****

* **

** **

** ** **

* *

****

**

*

*****************

** *

****

**

** ** *

** * * ** ***

*** *

*

****

*

** *

*

**

***

***** * **

**

*

*

***

*****

**

*

****

****

*

* *

*

*** * **

* *

*** ** *

** **

*

**

*

** *

** *

** ***

**

**

***

** *

**

***

*

*

* *** ****

**

****

****

* ***

** *

*

* ***

**

***

**** *

** **

**

* * *** ***** *

***** **

***

*** ***

**** ******

****

*

*****

* **

*

*

* * ** ***

** *

***** ***** **

*** *** *

**

*

****** *** *

*

**

**

****

****

**** *

** ** *

**

****

*

***

**

*

** *

** *

* *****

*

*** *

**

* *

**

*

*

*

*

*

* ** *** *

*** *

* ****** **

*

****

**

***

***** * ****

* ***** *

*

*

******

*

*

* **

*** *

** **

**

**

*** ***

*

**

* *

* *

*

***

*

***

*

**

*

**

*

**

**

****

* ** *

*

**

** ***

******

*

** *** ****

***

**** *******

***

*

***

* **** **

*

**

***

*

* **

**

****

***

*****

** *

*

*

*

** ***

*

* **

* *

*

***

*****

*** * * *****

*

* *

***

**

*

**

***

*

**

***

**

**

*

*

*

***** *

*

*

*

*****

** **

**** ***

***

*

****

*

*

* ***

**

******

**

* **

**

*

*

***

**

*

**** ***

******* * **

*

****

* * *

** **

** ****

**

*** *

**

*

***

***** ***** ****

* ** PC30.026

**

****

* ****

** ** *

********

*

****

*

** *

*

******* ********

*

*

***

** ** *

**

*

***

**

***

*

**

*

***** ***

**** ***** **

**

*

** *

***

****** *

**

** **

***** ***

*

* *****

* ****** ****

*** *

**

**

*

****

**

***

********

** *

***** **** **

*** ******

**

* ***** *

**** * ***

*** *

*

**** *****

*

***** ***

*** ******* * *******

* ***

**

** *** ** *

* **

**

**

*** *****

*** **

** **** *

*****

***

* *

*

********

****

*

*****

** *

**

*

*

*

*

*

****** *** ****** *** **

*

** **

**

***

**** **** **

** *****

*

*

* *****

*

*

***

**

* **** *

* *

**

*******

**

**

**

*

***

*

***

*

**

*

**

*

*****

***

** **

*

* *

*****

*** ***

*

***

** ****

***

* *** *********

*

*

***

*******

*

**

***

*

* * *

**

*** *

***

** ******

*

*

*

* ****

*

*****

*

** ******

* *********

*

**

***

**

*

**

***

*

**

***

***

*

*

*

*

** ****

*

*

*

**

* * **** *

*** ** * *

***

*

*****

*

** **

**

*****

*

*** **

**

*

*

***

**

*

**** ** ************

* ** ****

*** *

*** **** *

****

**

*

****** ***** ******** *

−250

−100

0****

**

* ****** ***

* *******

*

****

*

****

**** *** *** ***

* *

*

*

***

* * ***

**

*

* ***

****

*

**

*

**

** ****

** *** **

** **

**

*

** *

** *

*******

**

** *

****** **

*

*

* ********

******

**** **

**

**

*

*** *

**

***

*****

****

**

* ***** **

**********

* ******* ** *

* ***** **

*** *

*

*** **

* **

*

*

*** * ****

* **** *

** *** * *** ***

** ***

*

****** *****

**

**

* ******

** **

**

*** ****

**

***

* ****

*

** *

***

** ** **

*

* ** *

****

***

*

*

*

*

* ** ****

****

* ** ** ****

*

* ***

**

***

***

* * **** *

* ******

*

*

* *****

*

*

***

**

***

* ****

**

******

*

**

* *

* *

*

* **

*

* **

*

* *

*

**

*

**

*****

*

* ** *

*

* *

****

*

*** **

*

*

*** ** *

***

***

***** ******

***

*

***

****

***

*

**

* **

*

** *

**

*******

********

*

*

*

*****

*

***

**

*

***

****

*

* **** ***

**

*

**

****

*

*

**

* **

*

**

**

***

**

*

*

*

******

*

*

*

**

** *** **

* *** * **

***

*

****

*

*

* ***

**

*****

*

*****

**

*

*

** *

**

*

***** **

******* ***

*

****

** *

** **

*** ** ***

*** *

**

*

**** ********* ***

****

−50

50150

***

** **

**

* ***

*****

** ***

*** *** *

*

*

*** ** ***

*

*********** **

*

**

**

**

*

****

**** ***

**** *

*

** *

*

******* *

***

**

**

*

***

*

**

*****

*

*

**

*

* *****

**

*

*

*

*** *

*

***** ***

** *

**

*

*

*

***

* ***

*

*

***

**** *** *

* *

*

****

*

******

* *

***

**

***

*

*

** ***

*** *

**

**

** **

* *

* ****

*** *

** **

***

**

****

******

*

*

***** **

*

*

*

*

** **** *

**

*

****

*

*

** *****

**

***

* **

*****

*

*****

*

*

*

*

*

* **** * ****** *** ***

*

****

**

*

*

*

****

*

* ***** * **

*

*

**

**

*

***** *

*

**** * ******* *

****

**

***

*

****

****

*

*

** ** **

*

*

*

**

******

**

*

*

**

*

*

** *

*

*

**

*

*

**

**

* *****

***

***

*

**

*

******

*

***

**** *

**

*

** *

***

******************

* *** ***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

****

*

*

**********

*

**** *

*

*** ** ** **** *** **

* ***

*

**

* ** **

**

*

*** *

*

**

*

***

**

****

*

*

* * ***** *

*

**

**** * **

*

**

*

*

* **

* ***

***** *

*

** ***

*****

******

*

***

*

****

*

****

*

************* **

**

* ****

*

**

* *

*

*

*

*

*

*****

*

*

*

*************** *** * *

*****

**** * *

*

* *** *

** ****

******

*

*

*** ** ***

*

**** ****** * **

*

**

**

**

*

****

**** ** *

*** * *

*

** *

*

** ***** *

* **

**

* *

*

** *

*

**

** ***

*

*

***

* ** *****

*

*

*

* * **

*

*** ** ***

** ** *

*

*

*

* **

* ***

*

*

** *

** ** *** *

**

*

* * **

*

*** ** ***

***

**

***

*

*

* ****

*** *

**

**

** ****

* *****

** **

* * ** *

**

**

****** ***

*

*

** *

** ***

*

*

*

** *****

**

*

*** *

*

*

** ******

***

** *

*** * *

*

*

****

*

*

*

*

*

*

** * ** * *** *** *** ***

*

*** *

**

*

*

*

* ***

*

* ** ** * * **

*

*

**

**

*

***** *

*

*** **

** * **** *

****

**

** *

*

****

* ** *

*

*

** ** * **

*

*

**

*** * **

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

*

**

**

* *** **

***

* **

*

**

*

** *****

***

* ** * *

**

*

***

***

**** *** ****** *

****

* **** **

*

*

*

*

***

*

*

***

*

*** *

*

*

***** ** ** *

*

** ***

*

* *** * ***

* ***** **

* * **

*

**** * *

***

*

** **

*

* *

*

***

**

****

*

*

* ***** * *

*

**

**

****

*

*

**

*

*

***

** **

** *** *

*

*****

*****

** ****

*

***

*

*** *

*

****

*

*** ** **

** * ******

** * ** *

*

* *

* *

*

*

*

*

*

*** ***

*

*

*****

** ** *** ** *** ***

**

* *****

** **

**** *** ****

*******

*

* ** ** ***

*

******* *

** ***

*

**

**

* *

*

****

**** ****

** * **

***

*

********* *

*

**

**

*

***

*

**

** ***

*

*

**

*

*** ***

**

*

*

*

* * **

*

*** ** ***

** *

**

*

*

*

***

* ***

*

*

** *

** ******

* *

*

* ***

*

*** ***

* *

*****

****

*

*****

****

**

**

** **

* *

* ****

****

*******

**

** ******* **

*

***** **

*

*

*

*

** *****

***

* ***

*

*

** *****

****

** ***** **

*

** **

*

*

*

*

*

*

* ***** ***

*** *** *

**

*

**

***

*

*

*

*

*****

*** *** ***

*

*

**

**

*

* ** ** *

*

*** **** ***** *****

**

** *

*

*** *

****

*

*

** ** ***

*

*

**

** ** **

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

*

**

**

* *** **

******

*

**

*

* *****

*

***

*** **

***

***

***

******* ****** *

****

**** ***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

*** *

*

*

** *** * *** *

*

*** **

*

* **** ***

** ** ** **

*****

**** **

** *

*

** * *

*

**

*

***

**

* ***

*

*

* **** ** *

*

**

**** ***

*

**

*

*

***

** **

** *** *

*

*****

*** **

** **

**

*

***

*

*** *

*

*** *

*

*** *** ******* **

**

**** *

*

* *

**

*

*

*

*

*

* ** **

*

*

*

** ***

**** ***** ** ***

PC40.016 *

****

***

*** **

*** * *

************

*

*

* ** *** **

*

******* *** ***

*

**

*** *

*

* ***

**** ****

** ***

***

*

* *** ** ****

*

**

**

*

** *

*

**

** ** *

*

*

***

** ****

**

*

*

*

* ***

*

*** ** ** **

*** *

*

*

*

*****

* *

*

*

** *

** *** ***

* *

*

* ***

*

*** *****

*****

* ***

*

*** **

****

**

**

** **

**

*** **

*****

**** **

**

***

** *** **

*

*

***

*** **

*

*

*

*******

***

* ***

*

*

* ******

**

***

* **

* ****

*

** ***

*

*

*

*

*

** ****** **** ** **

**

*

**

****

*

*

*

* ***

*

*** **** **

*

*

**

**

*

* ** ** *

*

*** **

** **** ** ****

*****

*

****

****

*

*

*** ** *

*

*

*

**

**** **

**

*

*

**

*

*

***

*

*

**

*

*

**

**

* **** *

***

* **

*

**

*

* *****

*

***

** * ***

**

***

***

***** ** ****** *

****** ** ***

*

*

*

*

**

*

*

*

**

*

*

****

*

*

***** * *** *

*

*****

*

** **** **

**** ** **

****

*

**

** *****

*

*** *

*

* *

*

***

**

****

*

*

********

*

**

***

****

*

**

*

*

* **

** **

** ****

*

*** **

*****

** ****

*

***

*

* ** *

*

*** *

*

*** *** *

** ********

** ** *

*

* *

**

*

*

*

*

*

* ** **

*

*

*

*** ****** *** ** ** ***

−100 0 100 300

* ****

**

*

**** *

**

***** *** *

***

**** *

*** ** *** *** ****

*

* *** *

* **

***** *

*

*

**

*

***

*

**

*****

*

*

* * ******** *

*

*

*

**

**

*

*** ***

***

**

*

* *

* ** ****

*

*

* **

*

*** * **

*

*

****

**

* **

*

**

*

** ** **

**

****

****

***

**

****** **

***** *

*

***

******

*** ** **** * ***

*

** **

*

*

* ***

***

**

**

** *

**

* ****

*** ****

**

*

**** **

* ** *

** **** *** *

*

***

***

* ** ***

*

*

**

*

**

**

**** **

****

** ** ***

*** * ***

****

**

*

** **

*** *

* ** ***

**

****

*** *

*

*

**

****

*

***

*

**

*

**

*** *

******

*

**

*** ****

*

******

*

* * *

*

***

**

***

*******

*** *

*

**

* *

*

**

*

****

**

* **

*

**

****** *

**

**

* ******

*

*

***

****

*

**

*** *

***

***************

*** **

***** **

*

*

**

*

***

***

** ** **********

** *****

*

*

******

* * *** ****

*

* **

*

* **

**

*****

**

**

**

**

****

*

*

***

** ** * *****

**

*

**

***

* ** *

**

**

**

*

***

****** *

**

* ***

******

*****

*** *

***

*

*****

*

*

*************** **

**

*** *

***

*

**

**

*****

**

* ****************

*** *

** ***

**

*

* **

*** *

***** *** *

***

*** **

**

* ** **

**** ****

*

* **

* *

* **

*******

*

**

*

***

*

**

****

*

*

*

* ** **

** *** **

*

*

**

**

*

** **

* *

** *

**

*

* *

* * * ** **

*

*

* **

*

** ** *

*

*

*

**

**

**

* **

*

**

*

** ** *

*

**

***

*** **

***

**

*** * *** *

**

** **

*

***

***

* **** **

***** ****

*

** **

*

*

* ***

**

**

*

***

**

**

* **

**

*** * *

**

**

*

* *** **

* ***

** ********

*

***

***

* *****

*

*

**

*

**

**

** *

***

***

** * *****

* ** * * **

***

***

*

** **

** **

** ***

**

** *

***

* * **

*

**** *

*

*

***

*

**

*

**

**

* ** * ****

*

**

**** ** *

*

******

*

***

*

**

**

**

******* **

* ***

*

**

* *

*

**

*

***

*

**

* **

*

**

* ****

* **

*

**

**** ****

*

**** *

**

*

**

****

***

**** **********

*

*** **

*** ***

**

*

***

* *****

*** ** ****

***

* *

***

** **

*

*

* **

* **

* *******

*

*

* **

*

*****

****

**

**

**

**

*

****

*

*

***

*** * ***** * **

*

****

***

***

**

***

*

**

*

***

*** *

* *

****

******

*****

* ** *

***

*

** ****

*

***** ***

** **

*** **

**

*** **

**

*

**

**

*****

*********** *

* ******

** **

−250 −100 0

* *** **

**

*******

***** ****

***

*** ****

* ** **

**** ****

*

* **

**

* ****** * **

*

**

*

***

*

**

*****

*

*

** ******

****

*

*

**

**

*

*** ***

** *

**

*

**

** *** **

*

*

* **

*

** ***

*

*

*

****

**

* ***

**

*

** ** **

**

****

* * **

**** *

*** *****

***** *

*

******** *

***** *********

** **

*

*

* ***

***

**

*****

**

* *** *

*** *** *

**

*

**** **** * *** *****

* ***

**

*

***

* *****

*

*

**

*

**

**

** ** **

** *

** *** **

*

**** ***

***

***

*

** ***

** ** ** *******

***** **

*

******

*

***

*

**

*

**

****

* *****

*

**

**** ** *

*

*** * **

*

* **

*

**

****

****** **

*

* ** *

*

****

*

**

*

***

*

**

***

*

**

* *** *

* ***

**

*******

*

*

*****

**

*

***

***** *

**************

*

*** **

***** ***

*

**

*

* **

** **** ** *

** ******

** **** *

*

*

* **

***

* *** **

***

*

***

*

****

*******

**

**

**

*

*** **

*

* **

** ** **** **

**

*

**

*****

****

****

*

**

*

***

*** *

**

****

*** ***

***

***** *

***

*

*****

*

*

********

****

*** **

**

**

* ****

*

**

**** **

*

**

**** ******* ******

****

* *** **

**

*******

*** *********

*** *********** ** ****

*

* ****

* **

***** *

*

*

**

*

***

*

**

*****

*

*

** **** ******

*

*

**

**

*

* ** ***

***

**

*

**

** *****

*

*

* **

*

******

*

*

******

****

**

*

** ****

**

***

****

*

**** *

******* *

*** ** *

*

***

***** *

****** **

*** * **

****

*

*

* ***

**

***

*****

**

* **

**

*** ****

**

*

*** ***

*** **** *** *

* ***

***

***

** ****

*

*

**

*

**

**

**** **

** **

* ** * ***

**** ***

******

*

*** *

***** ** ****

** *

***** **

*

**

** **

*

** *

*

**

*

**

***********

* *

** ** ***

*

**** **

*

* **

*

****

**

* *******

*

* ***

*

**

* *

*

**

*

***

*

**

* **

*

**

**** ** ***

**

* *******

*

***

* ***

*

**

****

***

**** **********

*

********** **

*

*

**

*

* **

** *

** * ** *** ******

** ** ***

*

*

******** ******

*

*

***

*

******

* ***

**

***

***

****

*

*

***

*** *** *****

*

*

**

* ****

* **

**

***

*

***

*******

**

****

**** **

*****

*** *

****

*****

*

*

***

**********

* ** *

**

****

** *

*

**

**

*****

**

** ***** ***** *****

*** *

−100 0 100−100

0100

PC50.011

PCA SC het genes (2451), color by Olig1

Pitx3EGFPOlig1

Page 46: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

Conclusions

•  Trytoplanyourexperimentinawaysothatthebiologicalsignalyouarelookingforisnotconfoundedbytechnicalartifacts.

•  Thinkaboutwhatdistributionofcellsyouareexpectinginyourdatasetwhenlookingattheqc-measures.Whenyouhavehomogeneouscells–deviantcellswillbefailedlibrary.Otherwisebecarefulwhatyouremove.

•  Distinguishingduplicatecellsisveryhard,sometimesitwilltakesomeclustering

Page 47: Quality Control of scRNAseq data - GitHub Pages · 2020-04-02 · Single-cell transcriptomics protocols overview Kolodziejczyk et al, 2013. Doublets in scRNAseq Cell debris may cause

AlwaysgobacktoQC-statsafterdoingclustering/lineageanalysisetc.

-Youmayhaveclustersoflowqualitycells/doublets!