Ending Preventable Maternal Mortality: USAID Maternal Health ...
NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu...
Transcript of NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu...
![Page 1: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/1.jpg)
NIPT ve Maternal MaligniteAjlan TÜKÜN
![Page 2: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/2.jpg)
NIPTmetodoloji
Bianchi et al, Clin Chem. 2014 January ; 60(1): 78–87
![Page 3: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/3.jpg)
İlk OlguUniversity of North Carolina at Chapel Hill School of Medicine, 2013
• 13. hafta (37y, gravida 2 para 1)
o NCV 13 :+10,9 ve NCV 18: -10,7=> tri13, mono18
o NCV 13 : +8,8 ve NCV 18: -10,2 => tri13, mono18 (tekrar)
• Amniyosentezo İnterfaz FISH=> N
o Karyotip=> 46,XY
o whole genome oligonucleotide microarray=> N
• 17. haftao NCV 13: +17.6 ve NCV 18: -20.8 => tri13, mono18
• 31. haftao Vajinal kanama, servikal kitle
o Klinik tanı: prolabe leiomyoma
• 36. haftao Farklı laboratuvarda maternal serum çalışması: mono 13?, mono18? (Rapor edilememiş)
• Termo APGAR: 8/9, 3040g sağlıklı
o Plasenta biopsisi: ???
• Postpartumo İnferior ve superior ramusta multiple infitratif lezyon: metastatik nöroendokrin Ca
o 2 hafta sonra vajina ön duvarında kitle: high-grade nöroendokrin Ca, küçük hücreli
o FFPE FISH: Kromozom 13: 2-8 sinyal/hc, Kromozom 18: 1-3 sinyal/hc
Osborne et al, Prenatal Diagnosis 2013, 33, 609–611
![Page 4: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/4.jpg)
5974 olgu5 (%0.08) yalancı negatif: 2 tri21, 2 tri18, 1 mono X
14 (%0.2) yalancı pozitif
Futch et al, Prenat Diagn. 2013; 33:569–74
![Page 5: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/5.jpg)
2. Olgu• «irregularities in all three chromosomal z-scores»
• Uterine fibroid?
McCullough et al, October 7, 2014, http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0109173
![Page 6: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/6.jpg)
NIPT yanlış pozitiflik nedenleri
NIPT yanlış pozitiflik oranı: %0.1
• Diskordan pozitif sonuçların büyük bir bölümünde altta yatan biyolojik bir etyoloji vardır:
• Plasentaya sınırlı mozaiklik
• Maternal mozaiklik
• Co-twin kaybı
• Maternal malignite
Bianchi et al, Clin Chem. 2014 January ; 60(1): 78–87
![Page 7: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/7.jpg)
3. OlguUniversity of Leuven, 2015
• 12. hafta (27y, asemptomatik)
o Anormal genetik profilo Çoklu hiperdiploidi
• Maternal incelemeo Karyotip=> N
• Amniyosentezo Karyotip=> N
• Fetal USo Fetal malignite?=> N
• Maternal incelemeo Tüm vücut MRI: anterior mediastinal kitle, çoklu servikal ve retroklavikular LAPo CT eşliğinde anteriar mediastinal iğne biyopsi: Nodular sklerozan HL (evre IIA)
• Gebelikte tedavio doxorubicin, bleomycin, vinblastine ve dacarbazine (ABVD)o cfDNA profilinin 2–6 hafta içinde normalizasyonu
• Term
Vandenberghe et al, Lancet Haematol. 2015 Feb;2(2):e55-65
Ch 8Ch 9Ch 14
![Page 8: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/8.jpg)
İlk SeriUniversity of Leuven, 2015
• Rutin NIPT taramasına alınan 4000 gebe
• 3 olguda aberan genom profilio Maternal veya fetal genomik profil ile uyumsuz
• Maternal kanser şüphesi ile tüm vücut MRI o Hodgkin lenfoma
o Ovarian Ca
o Folliküler lenfoma
• Patoloji ve genetik inceleme ile konfirmasyon
• Tümör DNA’sı CNV’leri NIPT plazma profili ile uyumlu
Amant et al, JAMA Oncol 2015 doi:10.1001/jamaoncol.2015.1883
![Page 9: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/9.jpg)
Seri 1, Olgu 2: Ovarian Ca
Amant et al, JAMA Oncol 2015 doi:10.1001/jamaoncol.2015.1883
IRF4/6p24 (gained), TCRB/7q35 (gained), JAK2/9p24 (gained), BCL2/18q21 (lost),
![Page 10: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/10.jpg)
Seri 1, Olgu 3: Folliküler lenfoma
Amant et al, JAMA Oncol 2015 doi:10.1001/jamaoncol.2015.1883
%49 hücrede: IGH/BCL2 füzyonu+: FL’ya özgü t(14;18)
![Page 11: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/11.jpg)
İlk Meta-analizMother Infant Research Institute, Tufts Medical Center, Boston
Bianchi et al, JAMA. 2015;314(2):162-169
• Şubat, 2012- Eylül 2014 arası
• Asemotomatik gebeler
• 125.426 örnek
• Klinik prenatal anöploidi taraması amaçlı plazma
cfDNA dizileme
• 3757 (%3)olgu: 13,18,21,X veya Y’den en az birisi için
anöploidi• 10 olguda maternal Ca
o 8 olguda detaylı klinik ve dizileme verisi
• 1 olguda (kolorektal Ca) tedavi sonrası verilerin normalleşmesi
o 39olgu: multiple anöploidi
• 7 olguda maternal Ca
![Page 12: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/12.jpg)
Bianchi et al, JAMA. 2015;314(2):162-169
![Page 13: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/13.jpg)
Bianchi et al, JAMA. 2015;314(2):162-169
![Page 14: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/14.jpg)
Seri SonuçlarıKarşılaştırma
• Maternal kanser sıklığı o Amant ve ark: ~%0.1
o Bianchi ve ark: %0.008
• Çalışma tasarımlarıo Amant ve ark. izlemi: Fetusle ilişkilendirilemeyen aberran bulgusu olan
olguları whole-body diffusion-weighted MRI
o Bianchi ve ark. izlemi: Refere eden klinisyenin bu konudaki bildirimi
(çalışma süresinde tanı almamış olabilir)
Lo YMD, npj Genomic Medicine (2016)15002
![Page 15: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/15.jpg)
22 yayın: 206 diskordan bulgu
Prenatal Diagnosis 2017, 37, 527–539
With a high sensitivity and specificity, NIPT is an incomparable prenatal screening test
for trisomies 21, 18 and 13.
However, the test is not diagnostic, and discordant results occur.
Reasons for false positive and false negative cases are known, but not fully clarified.
![Page 16: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/16.jpg)
Clin Chem. 2018 Feb;64(2):329-335.
2018 Kohort Sonuçları
![Page 17: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/17.jpg)
Maternal Tümörler
Category Clinical diagnosis No. of casesMalign neoplasms Hodgkin lymphoma 4
Follicular lymphoma 1
Non-Hodgkin lymphoma 1
Cutaneous T-cell lymphoma 1Multiple myeloma 1Chronic myeloid leukemia 1Breast carcinoma 4Colon carcinoma 1
Epithelioid angiosarcoma of retroperitoneum 1
Uterine leiomyosarcoma 1
Small-cell carcinoma of anterior vaginal wall 1Esophageal carcinoma 1
Benign neoplasms Uterine leiomyoma 20Unclassified Fallopian tube mass 1
Ovarian teratoma (dermoid cyst) 1Total 40
Clin Chem. 2018 Feb;64(2):329-335.
![Page 18: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/18.jpg)
Plazmadaki DNA’nın kaynağı
Sun ve ark, Proc. Natl Acad. Sci. USA 112, E5503–E5512 (2015)
![Page 19: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/19.jpg)
Maternal malignite sıklıkları
Ji ve ark, Obstet Gynecol Sci. 2013 Sep; 56(5): 289–300.
![Page 20: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/20.jpg)
GENETİK DEĞİŞİKLİKLER• B hücre lenfoblastik lösemisi
• Yüksek hiperdiploidi
• Hipodiploidi
• t(12;21)(p13;q22)[ETV-RUNX1]
• t(1;19)(q23;p13)[TCF3–PBX1]
• t(9;22)(q34;q11)[BCR–ABL1]
• 11q23 yeniden düzenlenimleri
[MLL ]
• MYC yeniden düzenlenimleri
T hücre lenfoblastik lösemisi
• TAL1, TLX1, TLX3, LYL1
![Page 21: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/21.jpg)
Lenfositer malignitelerde sık etkilenen kromozomlar
![Page 22: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/22.jpg)
Bianchi et al, JAMA. 2015;314(2):162-169
![Page 23: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/23.jpg)
Maternal kanser sonuçları ile gündeme gelen sorunlar
• NIPT değerlendirmedeki güçlük
• İstenmeyen Ca tanısının etik ikilemi
![Page 24: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/24.jpg)
NIPT’den beklentiler• Tarama testi tanımı ile gelişmeler
o cFTS yerini alması
• Ulaşılabilirlik
• Tanı testine evrilmek???o Diğer otozomal kromozomların anöploidisi
o Mikrodelesyonlar
o Tek gen hastalıkları
![Page 25: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/25.jpg)
Teknik gelişmelerden beklenti ne olmalı?
Teknolojik gelişmeler ile ulaşılacak yeni nesil NIPT’nin;• kopya sayısını belirlemek için yeni yöntem?• daha fazla kromozom değerlendirmek?• daha fazla sayıda referans kullanmak?• biyoinformatik modelleme?• fetal orjini belirlemek ?
İdeal beklenti plazmadaki genetik değişikliğin doku orijinini belirlemeye olanak sağlaması
Lo YMD, npj Genomic Medicine (2016)15002
![Page 26: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/26.jpg)
Teknolojide Gelişme
• MATERYALo Total cfDNAo Fetal DNA’nın seçilmesio Fetal DNA’nın işaretlenmesi
• İNCELEME YÖNTEMİo Amplifikasyon +
• DNA tabanlı• miRNA tabanlı• RNA tabanlı• DNA Metilasyonu tabanlı
o Amplifikasyon -
• SONUÇLARIN DEĞERLENDİRİLMESİo BİYOİNFORMATİK
![Page 27: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/27.jpg)
microRNA Profil analizi• MicroRNA Profiling
Williams ve ark, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110 (2013) 4255–4260)
![Page 28: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/28.jpg)
Genom boyu RNA Profil analizi
Koh ve ark, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111 (2014) 7361–7366
![Page 29: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/29.jpg)
Genom boyu metilasyon dizilemesiTeknolojik gelişmeler ile ulaşılacak yeni nesil NIPT’ninplazmadaki genetik değişikliklerin doku orijinini belirlemeyeolanak sağlaması ideal beklentidir.
• DNA Doku haritalaması:o Bu hedefe yönelik olarak yeni geliştirilen teknoloji sonucunda dokuya özgü
metilasyon profili kullanılıyor. Bu yöntemle, cfDNA’nın genom boyu bisülfitdizilemesi yapıldıktan sonra, dokuya özgü metilasyon bilgisini sağlayan 5800DNA metilasyon belirteci ile cfDNA analizi sonunda elde edilen data üzerineuygulanan dekonvolusyon işlemi ile total DNA için doku kaynağı oranlarıhesaplanır.
o Yapılan çalışmalar; gebelerde beyaz kan hücreleri, karaciğer ve plasentanıncfDNA’nın 3 major kaynağı olduğunu gösterdi.
o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundakigenomik artma/azalmalar serum cfDNA’nın kanserin köken aldığı dokuya özgüolan kısmında proporsiyonel değişikliklere yol açacak.
o Sun ve ark. bu prensibi düzensiz NIPT sonucu veren bir gebe kadınınbulgularına uyguladı. Plazma DNA doku haritalaması ile, B hücrelerinden kökenalan DNA miktarının total cfDNA içinde çok artmış olduğunu ve düzensizliğin bucfDNA fraksiyonunu yansıttığını gösterdi. Bu hasta folliküler lenfoma tanısı almıştı.
Sun ve ark, Proc. Natl Acad. Sci. USA 112, E5503–E5512 (2015)
![Page 30: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/30.jpg)
Genom boyu metilasyon dizilemesi ile plazma DNA doku haritalaması(Şematik gösterim)
Sun ve ark, Proc. Natl Acad. Sci. USA 112, E5503–E5512 (2015)
![Page 31: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/31.jpg)
Gebelikte dokuların plazma DNA’sına katkılarındaki değişim(15 gebe)
Sun ve ark, Proc. Natl Acad. Sci. USA 112, E5503–E5512 (2015)
![Page 32: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/32.jpg)
Plazma DNA doku haritalaması ile cfDNA analizi(Şematik)
Sun ve ark, Proc. Natl Acad. Sci. USA 112, E5503–E5512 (2015)
![Page 33: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/33.jpg)
Düzensiz NIPT sonucu veren olguda uygulama
![Page 34: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/34.jpg)
Geliştirilen TeknolojiNanopore DNA Dizileme
DNA porun içerisinden geçerken iyon akımında değişikliğe neden oluyor.
Modifiye/işaretlenmiş bazlara ihtiyaç duymuyor.
![Page 35: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/35.jpg)
Geliştirilen Teknoloji
DNA nanoball sequencing
rolling circle replication to amplify small fragments of genomic DNA
combinatorial Probe-Anchor Ligation™ (cPAL™) chemistry
![Page 36: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/36.jpg)
Microarray tabanlı NIPT
![Page 37: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/37.jpg)
Tüm bunlar gerçekleştiğinde!
• CPM ?
• İkizler ?
• Tanı testine evrilmesi????
![Page 38: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/38.jpg)
Sonuçlar• NIPT, gebelerde asemptomatik kanseri ortaya
çıkarabilme kapasitesine sahiptir.
• Her 1000 gebe kadından 1 tanesinde kanserolacağı tahmin edilir. Dolayısı ile NIPT yaptırangebelerin istek dışı böyle bir sonuçla karşılaşmasımümkündür.
• NIPT ile ortaya çıkarılan maternal kanserler genellikleileri evre (III veIV)
• Bu bilginin, NIPT kullanıcısı klinisyen ve genetikdanışmanlar arasında yaygınlaştırılması gerekir.
• Bu bilginin, NIPT için hazırlanan bilgilendirilmiş onamformlarında yer alması gerekir.
Lo YMD, npj Genomic Medicine (2016)15002
![Page 39: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/39.jpg)
Bilgilendirilmiş onam formlarında yer alması önerilenler
Beklenmeyen bulgu: rastlantısal
• tahmini sıklık: 1/1000-10 000
• anneye fetüse ya da her ikisine bağlı olabiliro Fetal: segmental anöploidi veya cinsiyet kromozom anöploidileri tanısına yol açabilir.
o Maternal: segmental anöploidi, cinsiyet kromozom anöploidisi veya malignite
• Beklenmedik bulgunun doğrulanması ve doğrulanması için test
edilmesi gerekir.
Medikal önemi ve sağlık üzerindeki etkisi beklenmedik bulgunun türüne
bağlı olarak değiştiği için, hastadan bu tür rastlantısal bulgunun her biri
hakkında bilgi sahibi olmayı veya bu durumdan haberdar olmayı
istemesi
Prenatal Diagnosis. 2017;37:1257–1260. https://doi.org/10.1002/pd.5168
![Page 40: NIPT ve Maternal Malignityportal.citius.technology/images/45/Dosyalar/tmp/201852117407.pdf · o Bu yöntem ile, eğer maternal kanser söz konusu ise bu kanser dokusundaki genomik](https://reader033.fdocuments.in/reader033/viewer/2022041717/5e4c59120ed090050b30b40c/html5/thumbnails/40.jpg)
tesekkürler