Matakuliah Biologi Umum Jurusan Kimia Fakultas MIPA...

41
Matakuliah Biologi Umum Jurusan Kimia Fakultas MIPA Universitas Lampung [email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo The chemical context of life

Transcript of Matakuliah Biologi Umum Jurusan Kimia Fakultas MIPA...

Matakuliah Biologi Umum Jurusan Kimia Fakultas MIPA Universitas Lampung

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

The chemical

context of life

Hierarki tingkat organisasi kehidupan

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Kimia dan kehidupan

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Kimia dan kehidupan

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Kimia dan kehidupan

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Makhluk hidup terdiri atas zat-zat kimia,

baik dalam bentuk unsur murni maupun

senyawa atau campuran.

Kimia dan kehidupan

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Kimia dan kehidupan

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Makhluk hidup melakukan reaksi kimiawi

di dalam tubuhnya, dikenal dengan istilah

metabolisme.

• Reaksi kimia berlangsung untuk membuat

atau menguraikan ikatan kimia.

• Reaksi kimia berlangsung hingga

terbentuk suatu kondisi kesetimbangan.

Ikatan Kimia

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Ikatan ionik

• Ikatan hidrogen

• Interaksi van der waals

• Ikatan kovalen

Ikatan ionik

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Na+

Cl–

Ikatan hidrogen

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Water (H2O)

Ammonia (NH3)

O H

H

+

N

H H H

A hydrogen bond results from the attraction between the partial positive charge on the hydrogen atom of water and the partial negative charge on the nitrogen atom of ammonia. + +

– +

Interaksi van der waals

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Ikatan kovalen

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Water (H2O)

Methane (CH4)

4 komponen utama kehidupan

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Protein

• Karbohidrat

• Lipid

• Asam nukleat

Protein

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Protein merupakan polimer dari asam

amino

• Protein menjadi syarat mutlak kehidupan

karena merupakan komponen penyusun

protoplasma

• Protein merupakan penyusun utama enzim

Enzim

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Katalisator enzim

Transport darah, protein membran

Nutrien protein biji, ovalbumin, kasein

Kerangka kolagen, keratin, fibroin

Pertahanan imunoglobulin, fibrinogen, trombin

Pengatur hormon

Protein merupakan polimer dari monomer “asam amino”

Ikatan peptida

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Ikatan peptida

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Struktur Protein

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Struktur protein: Primer Sekunder Tersier Quaterner

Struktur Primer Distabilkan oleh ikatan peptida

Struktur Sekunder

Ada 2 macam: -heliks dan β-pleated sheet Distabilkan oleh ikatan hidrogen

Struktur Protein

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Struktur Tersier Distabilkan oleh empat macam ikatan:

Ikatan hidrogen

Ikatan ionik

Interaksi hidrofobik

Ikatan kovalen

Ditentukan oleh urutan/susunan asam amino pada polipeptida

Struktur Quaterner

Distabilkan oleh ikatan apa saja selain ikatan kovalen

Struktur Protein

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Struktur Protein

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Denaturasi Protein

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Denaturasi: definisi

Rusaknya struktur 3 dimensi karena putusnya sebagian/seluruh ikatan yang menstabilkan

struktur tersier

Pada proses denaturasi terjadi

Pemutusan ikatan sebagian atau seluruhnya kecualu ikatan peptida

Perubahan fisik, khemis dan aktivitas biologinya hilang

Denaturasi Protein

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Protein yang mengalami denaturasi

Berubah sifat fisik dan kimianya

Hilang fungsi biologinya

Agen yang menyebabkan denaturasi

Panas, asam dan basa mineral memutus ikatan garam

Aseton, alkohol, urea memutus ikatan hidrogen

pH ekstrem memutus ikatan ionik

Mekanik memutus ikatan

Sinar-UV dan sinar-X memutus semua ikatan

Pemisahan Protein

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Karbohidrat

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Biomolekul yang paling banyak ditemukan di alam

• Dari namanya molekul yang terdiri dari carbon (C) dan hydrate (air H2O)

• Mempunyai rumus molekul (CH2O)n untuk monosakarida

• Disintesis dari CO2 dan H2O dlm proses fotosintesis

• Dikenal juga sebagai sakarida

Klasifikasi Karbohidrat

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Berdasar kompleksitasnya,

dapat dibagi menjadi 3 golongan – Monosakarida

karbohidrat tunggal

– Oligosakarida karbohidrat yg tersusun dr bbrp monosakarida

– Polisakarida karbohidrat yang tersusun dr lebih dari 10 monosakarida

Karbohidrat - monosakarida

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Gula paling sederhana

• Rumus molekul (CH2O)n

• Terdapat dalam 2 bentuk – Aldosa

– Ketosa

• Monosakarida plg sederhana mempy jumlah karbon 3 gliseraldehid dan dihidroksiaseton

• Monosakarida yang paling umum adalah heksosa

• Di alam biasa terdapat dlm konformasi D

Karbohidrat

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Aldoses (e.g., glucose) have an aldehyde group at one end.

Ketoses (e.g., fructose) have a keton group, usually at C2.

C

C OHH

C HHO

C OHH

C OHH

CH2OH

D-glucose

OH

C HHO

C OHH

C OHH

CH2OH

CH2OH

C O

D-fructose

Karbohidrat - oligosakarida

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Ikatan glikosida antar monosakarida akan

membentuk oligosakarida dan polisakarida

Oligosakarida yg paling sederhana Disakarida

Ikatan alpha

Dlm proses

penggabungan 2

monomer tst

H2O akan

dibebaskan

C12H22O11 =

2 C6H12O6 − H2O

Karbohidrat - polisakarida

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Merupakan polimer unit monosakarida

• Unit monomer bisa :

• homopolisakarida

• heteropolisakarida

• Berbeda antara satu dgn yg lain pada unit penyusunnya, ikatan yg menghubungkan, rantai cabang yg terbentuk

Lipid

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Merupakan senyawa biomolekul yang susunan kimia dan fungsinya bervariasi

• Komponen utama lipid adalah senyawa hidrokarbon yang bersifat nonpolar hidrofobik (menolak air)

• Sifat utama lipid adalah ketidak larutannya dalam air tetapi larut dalam pelarut nonpolar atau pelarut organik (ethanol, kloroform,ether dll)

Fungsi lipid

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Sebagai cadangan energi pada hewan (lemak) dan pada tumbuhan (minyak)

• Sebagai komponen utama biomembran : fosfolipid dan sterol

• Berperan penting a.l : sebagai kofaktor enzim, pembawa elektron, pigmen-pigmen penyerap cahaya, agen pengemulsi dan hormon.

Monomer lipid

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Analisis lipid

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Asam nukleat

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Asam nukleat

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Nucleotide DNA RNA

Basa nitrogen

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

• Pirimidin C terdapat pada RNA dan DNA, tetapi

• T hanya ada pada DNA, dan

• U hanya ada pada RNA

• Basa tersebut disingkat dari huruf pertamannya (A, G, C, T, U).

• Purin (A, G) dimiliki oleh RNA dan DNA

Gula pentosa

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

DNA RNA

Fosfat

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Air

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Air

[email protected] staff.unila.ac.id/priyambodo

Hydrogen

bonds +

+

H

H +

+