Linkage Linkage ((PautanPautan) ) dandan Crossing Over Crossing Over ((PindahPindah SilangSilang))

T H M C l i B B id Alf d H St t t H J h M llT. H. Morgan Calvin B. Bridges          Alfred H. Sturtevant    Herman Joseph. MullerNobel Prize 1933 Nobel Prize 1946

Model Mendel

• Tanaman Ercis – Pisum sativum

• Yang dipelajari:– Warna bunga

– Panjang batang

– Bentuk buahBentuk buah

– Warna buah

HukumHukumMandel 1Mandel 1HukumHukumMandel 1Mandel 1

Alel terpisah padaTTTT tttt

– Alel terpisah pada waktu gametdiproduksi

– Alel terpisah secarabebas

TtTtTtTt

TTTT TtTt TtTt tttt

Pautan/LINKAGE/

• Beberapa gen pada k id kkromosom tidakmemisah bebas ataugen bertaut

• kombinasi baru dapatterjadi dengan adanyapindah silang (crossingpindah silang (crossing over)

chiasmachiasma

Chiasmata Between SynapsedHomologs During Meiosis Prophase IHomologs During Meiosis Prophase I

Contoh Linkage

Pada jagung, biji berwarnaberwarna CC dominan terhadap tidaktidakberwarnaberwarna cc. Biji tidaktidak keriputkeriput S S dominan terhadap bijibijikeriputkeriputkeriputkeriput.

Jagung yang mampunyai biji berwarna C dan tidakkeriput S disilangkan dengan varietas yang bijinya tidakberwarna dan keriput.  F1nya diujidiuji silang. F2 nya adalah:

Berwarna tidak keriput : 4 032 batangTidak berwarna keriput : 4 035 batangTidak berwarna keriput : 4 035 batangBerwarna keriput : 149     batangTidak berwarna, tidak keriput : 152     batang

CCSSCCSS x x ccssccss Biji berwarna dan tidak keriput x  bijinya tidak berwarna dan keriput

CcSsCcSs x                  x                  ccssccss

Berwarna tidak keriput : 4 032 batangT k b k i t 4 035 b tTak berwarna keriput : 4 035 batangBerwarna keriput : 149     batangTak berwarna, tak keriput : 152     batang

HasilHasil tidaktidak sesuaisesuai hukumhukumMendel.  Mendel.  AlasanAlasan: : GenaGena C C dandan S S terpautterpaut

CS Cs cS cs

CcSsCcSs x                  x                  ccssccss

Gamet csCS, Cs, cS, csGamet cs

CS

CS

cs

cs

Biji berwarna dan tidak keriput x  biji tidak berwarna dan keriputx

C

S

cs

Biji berwarna dan xTEST

cs

c

S stidak keriput TESTs s

Crossing Overc

CS

cs

Pembentukan Gamets

GametcSs

C cs

CS

csx

F2C c c

Scs

Rekombinasi

cs

cC

S

cs

Kombinasi Parental Induk

F2s s S s

149 Biji berwarna, keriput

152 Biji tak berwarna,  tidak keriput

s sS s

4032 Biji berwarna, tidak keriput

4035 Biji tak berwarna,  keriput

Berwarna tidak keriput : 4 032 batangTak berwarna keriput : 4 035 batangTak berwarna keriput : 4 035 batangBerwarna keriput : 149     batangTak berwarna, tak keriput : 152     batang

Total : 8 368 batangg

Kombinasi Parental Induk : ( 4032+4035)/8368   * 100% = 96.40%96.40%

k k b ( )/ *Anak Rekombinan: ( 149+152)/8368   * 100% = 3,60%3,60%

• Kombinasi Parental > 50% menunjukan gena C dan S berada pada kromosomsamasama

• 1% rekombinan menunjukan jarak gena 1 unit atau 1 centi morgan• Jadi 3,6% rekombinan menunjukan jarak gena C dan S adalah 3,6 centimorgan/satuan peta (s.p)

C S3,6 s.pC S

PEMETAAN GEN PADA KROMOSOMPEMETAAN GEN PADA KROMOSOM

• Nilai pindah silang dapatdigunakan untuk menentukandigunakan untuk menentukanjarak antara dua gen yang berdekatan

• 1 unit peta = 1% pindah silang

• Menentukan jarak gen‐gen pada kromosom yang samakromosom yang samamenggunakan trihibrida (three point cross)

• Tentukan urutan gen yang benar

• Tentukan frekuensi pindah silangantara dua gen yang berurutanantara dua gen yang berurutan

Menentukan Urutan Gen• Tipe tetua = paling banyak (n.c.o)

• Tipe crossing over ganda = paling sedikit (d.c.o)p g g p g ( )

• Dua gen pada tipe tetua = dua gen pada tipe d.co, yang tidaksama terletak di tengah

G

Tetua

V A Urutan tidaksama

g v a

g V A

d c o

G v a

d.c.o

G d c o tidak sama dengan tetua V G AG d.c.o tidak sama dengan tetua, jadi G seharusnya ditengah

V G A

PEMETAAN GEN PADA JAGUNG• G V A = normalG, V, A   normal• g = daun mengkilat, v = pucat, a = steril

G V A

g v a

g v a

g v a

x

g

Fenotipe Jumlah Genotipe Keterangan

Normal 235 G‐V‐A Parental

Mengkilat Steril Pucat 270 g v a ParentalMengkilat Steril Pucat 270 g‐v‐a Parental

Mengkilat Steril 62 g‐V‐a  s.c.o

Pucat 60 G‐v‐A s.c.o

M kil t P t 48 AMengkilat Pucat 48 g‐v‐A  s.c.o

Steril 40 G‐V‐a s.c.o

Steril Pucat 4 G‐v‐a d.c.o

M kil 7 V A dMengkilat 7 g‐V‐A d.c.o

Jumlah 726

Fenotipe Jumlah Genotipe KeteranganNormal 235 G‐V‐A ParentalMengkilat Steril Pucat 270 g‐v‐a ParentalMengkilat Steril 62 g‐V‐a  s.c.oPucat 60 G‐v‐A s.c.oMengkilat Pucat 48 g‐v‐A  s.c.oSteril 40 G‐V‐a s.c.oSteril Pucat 4 G‐v‐a d.c.oMengkilat 7 g‐V‐A d.c.oJumlah 726

G

Tetua

V A

g v a

g V A

d c o

G d c o tidak sama dengan tetua

G v a

d.c.o

V G AG d.c.o tidak sama dengan tetua, jadi G seharusnya ditengah

V G A

Fenotipe Jumlah Genotipe KeteranganNormal 235 G‐V‐A ParentalMengkilat Steril Pucat 270 g‐v‐a ParentalMengkilat Steril 62 g‐V‐a  s.c.oPucat 60 G‐v‐A s.c.oMengkilat Pucat 48 g‐v‐A  s.c.oSteril 40 G‐V‐a s.c.oSteril Pucat 4 G‐v‐a d.c.oMengkilat 7 g‐V‐A d.c.oJumlah 726

V G A

v g a

V g a

v G A

62

60%3,18%100

726116062

=++

= x

V G A V G a 40

48 %613%100114840=

++= x

v g a v g A48 %6,13%100

726== x

V G A

JarakJarak GenaGena18,3 13,6

JarakJarak GenaGena

Fenotipe JumlahGenotipeKeterangan %Normal 235 G‐V‐A Parental 32.37

69.56Mengkilat Steril Pucat 270 g‐v‐a Parental 37.19

Interferensi danKoinsidens

Mengkilat Steril 62 g‐V‐a  s.c.o 8.54

28.93Pucat 60 G‐v‐A s.c.o 8.26Mengkilat Pucat 48 g‐v‐A  s.c.o 6.61Steril 40 G‐V‐a s.c.o 5.51Steril Pucat 4 G‐v‐a d.c.o 0.55

2Steril Pucat 4 G v a d.c.o 0.55

1.52Mengkilat 7 g‐V‐A d.c.o 0.96Jumlah 726 100.00 100.00

V G AJarakJarak GenaGena

•• InterferensiInterferensi : pindah silang yang terjadi di suatu tempat mengurangi

18,3 13,6JarakJarak GenaGena

InterferensiInterferensi : pindah silang yang terjadi di suatu tempat mengurangikemungkinan terjadinya pindah silang pada daerah di dekatnya

•• KoefisienKoefisien koinsidenskoinsidens : ukuran kekuatan interferensi

• Frekuensi d c o yang teramati = (11/726) x 100% = 1 52 %• Frekuensi d.c.o yang teramati = (11/726) x 100% = 1,52 %

• Frekuensi d.c.o yang diharapkan (bila tidak ada pengaruh) = 0,183 x 0,136 = 2,5% (Dari jarak gena)

K f k i id 1 5% / 2 5% 0 6 t 60% t j di• Koef koinsidens = 1,5% / 2,5% = 0,6 atau 60% terjadi

• Interferensi = 1 – 0,6 = 0,4 atau 40 % terhambat

Selamat Belajar