FORMACIÓN ACADÉMICA

1994 – 1999 Quimicofarmacobiólogo

Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo

2000 – 2002 Maestría en Ciencias en Biotecnología

CINVESTAV-IPN

2002 – 2006 Doctorado en Ciencias en Biotecnología

CINVESTAV-IPN

2007 – 2010 Posdoctorado

University of California, Riverside. Center for Plant Cell Biology. USA.

EXPERIENCIA LABORAL

2010 a la fecha Profesor-Investigador de Tiempo Completo

Titular B Universidad del Papaloapan

ARTÍCULOS PUBLICADOS 2020. Sepúlveda-García EB, Pulido-Barajas JF, Huerta-Heredia AA, Peña-Castro JM, Liu R, Barrera-Figueroa BE. Differential expression of maize and teosinte microRNAs under submergence, drought, and alternated stress. Plants, 9 (10):1367. DOI: 10.3390/plants9101367 JCR, IF:2.762. 2020. Vázquez-Núñez E, Molina-Guerrero CM, Peña-Castro JM, Fernández-Luqueño F, de la Rosa-Álvarez M. Use of nanotechnology for the bioremediation of contaminants: a review. Processes, 8(7):826 DOI: 10.3390/pr8070826 . JCR, IF:2.753. 2019. Fukao T, Barrera-Figueroa BE, Juntawong P, Peña-Castro JM. Submergence and waterlogging stress in plants: a review highlighting research opportunities and understudied aspects. Frontiers in Plant Science 10:340. DOI: 10.3389/fpls.2019.00340 JCR, IF:4.402. 2019. Barrera-Figueroa BE, Peña-Castro JM. ¿Qué es la Biotecnología?. Ecofronteras 23(67):2-5. CRMCYT CONACyT. 2019. Peña-Castro JM. Los mutantes en mi mesa. Ecofronteras 23(67):12-15. CRMCYT CONACyT. 2019. Ojeda-Hernández F, Moral-Ventura S, Capataz-Tafur J, Peña-Castro JM, Abad-Zavaleta J, Chay-Canul A, Ramon-Ugalde J, Ungerfeld R, Meza-Villalvazo V. Vaginal microbiota in Pelibuey sheep treated with antimicrobials at the removal of intravaginal sponges impregnated with flurogestone acetate. Small Ruminant Research 170:116-119.

Julián Mario Peña Castro Doctorado en Biotecnología y Bioingeniería

SNI Nivel I Perfil deseable PRODEP ORCID ID 0000-0001-6057-5357

(287)8759240 Ext. 220

julianpc@unpa.edu.mx

DOI: 10.1016/j.smallrumres.2018.11.015. JCR, IF:1.201 2018. Vázquez-Núñez E, Peña-Castro JM, Fernández Lueño F, Cejudo E, Rosa-Álvarez MG, García-Castañeda MC. A review on genetically modified plants designed to phytoremediate polluted soils: biochemical responses and international regulations. Pedosphere 28(5):697-712. DOI: 10.1016/S1002-0160(18)60039-6 JCR, IF: 3.188 2017. Peña-Castro JM, del Moral S, Núñez-López L, Barrera-Figueroa BE, Amaya-Delgado L. Biotechnological strategies to improve plant biomass quality for bioethanol production. BioMed Research International 2017:7824076. DOI: https://doi.org/10.1155/2017/7824076 JCR, IF: 2.276 2017. Desgarennes-Alcalá CM, del Moral S, Meza-Villalvazo VM, Peña-Castro JM, Zárate-Martínez JP, Abad-Zavaleta J. Estimación de las frecuencias alélicas y genotípicas de los genes CAPN1 Y CAST asociados a la calidad de la carne en bovinos de la Cuenca del Papaloapan. Nova Scientia 9(19):211-228. CRMCYT CONACyT Q4. 2017. Hernández-Santos WJ, Barrera-Figueroa BE, Mendoza FN, Peña-Castro JM. Herramientas para la enseñanza de la visualización y diseño molecular de metabolitos y macromoléculas. Investigación y Ciencia de la UAA 71(3):44-50. CRMCYT CONACyT. 2017. Escobar-Chaparro RA, Guillén G, Espejo-Galicia LU, Meza-Villalvazo VM, Peña-Castro JM, Abad-Zavaleta J. qPCR and HRM-based diagnosis of SNPs on growth differentiation factor 9 (GDF9), a gene associated with sheep (Ovis aries) prolificacy. 3 Biotech 7(3):204. DOI: 10.1007/s13205-017-0837-z JCR, IF: 1.798 2016. Rivera-Contreras IK, Zamora-Hernández T, Huerta-Heredia AA, Capataz-Tafur J, Barrera-Figueroa BE, Juntawong P, Peña-Castro JM. Transcriptomic analysis of submergence-tolerant and sensitive Brachypodium distachyon ecotypes reveals oxidative stress as a major tolerance factor. Scientific Reports 6:27686. DOI: 10.1038/srep27686 JCR, IF: 4.011 2015. Núñez-López L, Aguirre-Cruz A, Barrera-

Figueroa BE, Peña-Castro JM, 2015. Improvement of enzymatic saccharification yield in Arabidopsis thaliana by ectopic expression of the rice SUB1A-1 transcription factor. PeerJ 3:e817. https://doi.org/10.7717/peerj.817 JCR, IF: 2.353 2014. Peña-Castro JM. La respuesta molecular de las plantas ante el estrés por inundación: lecciones aprendidas del gen SUB1A. Revista Fitotecnia Mexicana 37(4):325-337. JCR, IF: 0.325 2014. Cortés-López N., Montor-Antonio J., Olvera-Carranza C, Peña-Castro JM, del Moral-Ventura S. Metagenómica: una ventana de oportunidad a nuevos genes y genomas microbianos. Revista Iberoamericana de Ciencias 1(7):45-58. 2014. Zamora-Hernández T, Prado-Fuentes A, Capataz-Tafur J, Barrera-Figueroa BE, Peña-Castro JM. Demostraciones prácticas de los retos y oportunidades de la producción de bioetanol de primera y segunda generación a partir de cultivos tropicales. Educación Química 25(2):122-127. CRMCYT CONACyT Q4. 2013. Peña-Castro JM, Gregorio-Ramírez O., Barrera-Figueroa B.E, 2013. Los métodos experimentales que permiten el estudio de las macromoléculas de la vida: historia, fundamentos y perspectivas. Educación Química 24(2):237-246. CRMCYT CONACyT Q4. 2011. Peña-Castro JM, van Zanten M, Lee SC, Patel MR, Voesenek LACJ, Fukao T, Bailey-Serres J. Expression of rice SUB1A and SUB1C transcription factors in Arabidopsis uncovers flowering inhibition as a submergence tolerance mechanism. The Plant Journal 67(3):434-446. DOI: 10.1111/j.1365-313X.2011.04605.x JCR IF: 5.726 2007. Barrera-Figueroa BE, Peña-Castro JM, Acosta-Gallegos JA, Ruiz-Medrano R, Xoconostle-Cázares B. Isolation of dehydration-responsive genes in a drought-tolerant common bean cultivar and expression of a group of 3 LEA mRNA in tolerant and susceptible bean cultivars. Functional Plant Biology 34(4):368-381. DOI: 10.1071/fp06224 JCR IF: 2.491 2006. Perales-Vela HV, Peña-Castro JM, Cañizares-Villanueva, RO. Heavy metal detoxification in eukaryotic microalgae. Chemosphere 64(1):1-10. 10.1016/j.chemosphere.2005.11.024 JCR IF: 5.108

2006. Peña-Castro JM, Barrera-Figueroa BE, Ruiz-Medrano R, Xoconostle-Cázares B, 2006. Las bases moleculares de la fitorremediación de hidrocarburos del petróleo. Terra Latinoamerica 24:(4) 529-539. CRMCYT-CONACYT En competencia Nacional. 2006. Peña-Castro JM, Barrera-Figueroa BE, Fernández-Linares L, Ruiz-Medrano R, Xoconostle-Cázares B, 2006. Isolation and identification of up-regulated genes in bermudagrass roots (Cynodon dactylon L.) grown under petroleum hydrocarbon stress. Plant Science. 170(4):724-731. DOI: 10.1016/j.plantsci.2005.11.004 JCR, IF: 3.711 2004. Peña-Castro JM, Martínez-Jerónimo F, Esparza-García F, Cañizares-Villanueva RO, 2004. Phenotypic plasticity in Scenedesmus incrassatulus (Chlorophyceae) induced by heavy metals. Chemosphere. 57(11):1629-1636. https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2004.06.041 JCR IF: 5.108 2004. Peña-Castro JM, Martínez-Jerónimo F, Esparza-García F, Cañizares-Villanueva R. Heavy metals removal by the microalga Scenedesmus incrassatulus in continuous cultures. Bioresource Technology. 94(2):219-222. DOI: h10.1016/j.biortech.2003.12.005 . JCR IF: 5.807 2003. Contreras-Flores C, Peña-Castro JM, Flores-Cotera LB, Cañizares-Villanueva RO. Avances en el diseño conceptual de fotobiorreactores para el cultivo de microalgas. Interciencia- Journal of Science and Technology of the Americas. 28(8):450-456. JCR IF: 0.264

CAPÍTULO DE LIBRO 2018. Barrera-Figueroa BE, Peña-Castro JM. Oryza granulata Nees et Arn. ex Watt. En: Mondal T, Henry RJ (eds.) The Wild Oryza Genomes, Springer. Cham, Switzerland. p.145-149. 10.1007/978-3-319-71997-9_12 2018. Barrera-Figueroa BE, Peña-Castro JM. Oryza perennis. En: Mondal T, Henry RJ (eds.) The Wild Oryza Genomes, Springer, Cham, Switzerland. p. 259-262. 10.1007/978-3-319-71997-9_22

PATENTES EN TRÁMITE 2018. Peña-Castro JM. Moléculas de ADN útiles para el diagnóstico molecular de la prolificidad en animales. Solicitud de patente ante IMPI: MX/a/2017/016573. 2016. Peña-Castro JM. Uso de un factor de transcripción para aumentar la concentración de carbohidratos en la biomasa vegetal. Solicitud de patente ante IMPI: MX/a/2015/010996.

FORMACIÓN DE RECURSOS HUMANOS Tesis de licenciatura. María Fernanda García González (2020). Subclonación y expresión del antígeno recombinante TSA-1 de Trypanosoma cruzi fusionado al dominio de unión a maltosa. Ingeniero en Biotecnología. Titulado. Walter Josué Hernández Santos (2016). Caracterización funcional y estructural del dominio N-terminal del factor de transcripción SUB1A-1 de arroz (Oryza sativa) expresado en Arabidopsis thaliana. Ingeniero en Biotecnología. Titulado. Teresa Zamora Hernández (2016). Identificación y estudio de la expresión de los Factores de Respuesta al Etileno del Grupo VII en Brachypodium distachyon que participan en la respuesta al estrés por inundación. Ingeniero en Biotecnología. Titulado. Alyn Flores Herrerías (2016).. Análisis de expresión de microRNAs en Brachypodium distachyon bajo estrés hídrico mediante tres estrategias de PCR cuantitativa. Ingeniero en Biotecnología. Titulado. Oscar Gregorio Ramírez (2014). Diseño in silico y construcción in vivo de plásmidos binarios para construcciones para el análisis funcional del gen SUB1A. Universidad del Papaloapan. Ingeniero en Biotecnología. Titulado. José Francisco Pulido Barajas. (2013). Identificación y análisis de expresión de microRNAs de respuesta a sequía en plantas monocotiledóneas. Universidad

del Papaloapan. Ingeniero en Biotecnología. Titulado. Tesis de maestría. Raquel Anahí Escobar Chaparro (2019). Análisis de las frecuencias alélicas y genotípicas de los polimorfismos presentes en los genes BMP15 y GDF9 relacionados con la prolificidad en ovinos de pelo (Ovis aries). Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Laura Beatriz Santiago Tapia (2019). Diseño de sRNAs sintéticos como biofungicidas potenciales contra hongos patógenos de frutos tropicales. Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. María Guadalupe Solano Martínez (2018). Optimización del proceso de hidrólisis enzimática parcial (Acellerase 1500) para la obtención de nanofibras de celulosa a partir del raquis de plátano macho (Musa paradisiaca L.). Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Elías Abad Rodríguez (2018). Estudio filogenético de la familia Chitinase-Like Proteins en Beuaveria bassiana y determinación de la actividad quitinolítica en medio líquido. Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Jorge Arturo Martínez Rodríguez (2018). Análisis fenotípico y molecular de mutantes insercionales en genes sin identidad regulados positivamente durante el estrés por inundación en Brachypodium distachyon. Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Teresa Zamora Hernández (2018). Aislamiento y caracterización de mutantes de T-DNA en genes que codifican para factores de transcripción activos durante el estrés por inundación en Brachypodium distachyon. Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Sarahí del Carmen Hernández Heredia (2018). Co-asesor. Estudio del dominio C y de la región C-terminal de la α-amilasa de Bacillus amyloliquefaciens JJC33M. Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Irma Karla Rivera Contreras (2017). Búsqueda y

análisis molecular de ecotipos de Brachypodium distachyon tolerantes al estrés por inundación. Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Alejandro Cruz López (2015). Producción de limonoides en cultivos in vitro de Azadirachta indica. Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Mariana Esther Cesario Solis (2015). Caracterización fisiológica y molecular de la floración en Brachypodium distachyon bajo estrés por déficit hídrico. Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Lizeth Núñez López (2015). Análisis del potencial de sacarificación de plantas de Arabidopsis thaliana que expresan constitutivamente al gen SUB1A. Maestría en Ciencias en Biotecnología. Titulado. Tesis de doctorado. Humberto Rafael Bravo Delgado (2018). Co-asesor. Estudio de la cinética de expresión de los genes nprR-nprX,nprA y cry1AC en Bacillus thuringiensis variedad kurstaki HD-73. Doctorado en Ciencias en Biotecnología. Titulado.

PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN 2018. Responsable. Fondo UC-MEXUS CONACYT 2018. Proyecto CN-18-203. Circadian clock control and biotechnological potential of carbon-conservation regulators belonging to the bZIP transcription factors in plants. USD 25,000. Vigencia: 05/11/2018-05/11/2021. 2016. Responsable. Fondo Ciencia Básica CONACyT 2016. Proyecto 287137. El uso de los Genes Centrales de Hipoxia para mejorar en las plantas el contenido de almidón y la tolerancia a la inundación. $2,000,000. Vigencia: 05/09/2018-05/09/2021. 2012. Responsable. Fondo PIFI 2012. Proyecto DES841. Fortalecimiento Integral de la DES de Ciencias Químicas y Alimentos de la Universidad del Papaloapan. $300,000. Vigencia: 05/10/2012-05/10/2014. 2012. Colaborador. Fondo Infraestructura CONACyT 2012. Proyecto 188223. Ampliación de la

infraestructura de investigación y docencia del área de biotecnología agroalimentaria de la Universidad del Papaloapan. $1,000,000 Vigencia: 10/01/2012 -01/14/2013. 2012. Colaborador. Fondo PROMEP 2012. Proyecto 103.5/12/4664. Diseño e implementación de sistemas de cultivo in vitro de plantas de uso en la medicina tradicional del estado de Oaxaca. $350,000. Vigencia: 06/18/2012 - 06/17/2013. 2011. Colaborador. Fondo Ciencia Básica CONACyT 2011. Proyecto 169619. Análisis de los microRNAs expresados en respuesta al estrés por déficit hídrico durante la floración y el desarrollo de semillas en Brachypodium distachyon. $1,500,000. Vigencia: 01/07/2013 -01/11/2016. 2011. Responsable. Fondo Ciencia Básica CONACyT 2011. Proyecto 152643. Estudio de la respuesta molecular al estrés por inundación en Brachypodium distachyon (L.) y su aplicación en el aumento de reservas de carbohidratos. $1,500,000 Vigencia: 11/05/2012 -11/07/2016. 2011. Responsable. Fondo PROMEP 2011. Proyecto 103.5/12/6720. Aumento de la tolerancia al estrés por inundación en Arabidopsis thaliana (L.) mediante la expresión heteróloga inducible del gen SUB1A. $350,000. Vigencia: 01/04/2012 - 01/07/2013. 2011. Colaborador. Fondo PROMEP 2011. Proyecto 103.5/12/6720. Identificación y análisis de expresión de micrornas en de respuesta a sequía en plantas monocotiledóneas. $350,000. Vigencia: 01/04/2012 - 01/07/2013.