Scie

nces

2019 – 2020

Etudier en biologie

TABLE DES MATIERES SECTION DE BIOLOGIE PARTIE I : La Section Section de Biologie 1 Besoin d’un coup de main ? 2 - 4 AEB (Association des Etudiants en biologie) 5 Mobilité 6 PARTIE II : Le bachelor en biologie

Règlement et plan d’études 7 - 9 Grilles horaires & cours

- Grilles horaires de la 1ère année 13- 15 - Descriptifs des enseignements 1ère année 17 - 31

- Grilles horaires 2ème année 35 - 37 - Descriptifs des enseignements 2ème année 39 – 56 - Liste des cours à choix de 2ème année 57

- Grille horaire 3ème année 61 - Descriptifs des enseignements obligatoires 3ème année 63 - 65 - Liste des enseignements à choix restreint de 3ème année 67 - Dates des TP à choix restreint de 3ème année 69

Monographie du bachelor en biologie

- Règlement de la monographie 71 – 72 PARTIE III : Le bachelor en archéologie préhistorique Règlement et plan d’études 73 - 77 Grilles horaires & cours

- Grilles horaires de la 1ère année 79 - 81 Descriptifs des enseignements 1ère année 85 – 98

PARTIE IV : Le master

Orientations du master en biologie & Annexe 1 au règlement 99 - 104

- Orientation libre (OL) 105 - Biodiversité et systématique (BDS) 106 - Bioinformatique et analyse des données en biologie (BIADB) 107 - Génétique, développement et évolution (GDE) 108 - Sciences moléculaires du végétal (MPS) 109

Liste des cours réservés au master en biologie 111 - 112 PARTIE V : Les cours à choix Liste des enseignements à choix restreint et à choix libre 113-246 PARTIE VI : Les formations rattachées Autres masters ouverts aux titulaires du bachelor en biologie 247 - 249 Formation approfondie et formation continue 250 - 251 Ecoles et programmes doctoraux 252 - 254 PARTIE VII : L’index

Section de biologie

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• La Section de biologie

• Besoin d’un coup de main ?

• AEB (Association des Etudiants en Biologie)

• Mobilité

Partie I La Section

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Section de biologie

Présidence Président : Professeur Michel MILINKOVITCH

Sciences III – 4ème -­ bureau 4024B T. 022.3793338 + michel.milinkovitch@unige.ch

Vice-­présidente : Professeure Françoise STUTZ Sciences III – 1er -­ bureau 1031C T. 022.3796729 + francoise.stutz@unige.ch

Administration Administratrice : Madame Silvia BELLAY

Sciences III -­ 2ème -­ bureau 2004D T.022.3796664 + silvia.bellay@unige.ch

Secrétariat de l'administration : Madame Tania CADORET Sciences III -­ 2ème -­ bureau 2004A T. 022.3796666 F. 022.3796748 + tania.cadoret@unige.ch

Secrétariat des étudiants Secrétaire : Madame Sandra DIETHELM

Sciences III -­ 2ème -­ bureau 2004A T. 022.3796665 + sandra.diethelm@unige.ch

Conseillère aux études de la Section Docteure Audrey BELLIER

Sciences III -­ 2ème -­ bureau 2002 T. 022.3796656 + conseil-­etu-­biolo@unige.ch

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BESOIN D’UN COUP DE MAIN ?

S’inscrire à l’UNIGE

Service des admissions UNI DUFOUR – Bureau 222 (2ème étage) Le service des admissions est ouvert du lundi au vendredi de 9h à 13h, hors jours fériés et horaire d’été (juillet/août/septembre) Consulter le site internet du service des admissions pour plus d’information :

• Conditions générales d'admission : http://www.unige.ch/admissions/sinscrire/conditions-­admissions/ • Délai et formalités d'inscription à l'UNIGE : http://www.unige.ch/admissions/sinscrire/

Secrétariat des étudiants de la Section de biologie Madame Sandra DIETHELM Sciences III -­ 2ème -­ bureau 2004A T. 022.3796665 + sandra.diethelm@unige.ch Accueil -­ de lundi à jeudi : 8h à12h -­ lundi, mardi et jeudi après-­midi : 13h à 15h

Le secrétariat est fermé les vendredis

* Prises de rendez-­vous pour les étudiants avec la conseillère aux études. * Informations sur les études en biologie * Inscriptions aux travaux pratiques à choix restreint de 3ème année * Inscriptions à la monographie * Inscriptions au master et ses orientations * Programme des cours de la Section, renseignements Informations complètes sur le site de la Section de biologie : http://biologie.unige.ch Les questions spécifiques à un cours donné sont à adresser aux enseignants respectifs Conseil aux études & Coordination mobilité Pour toute question personnelle (orientations, équivalences, échecs, séjours mobilité, problèmes particuliers,…), veuillez contacter le secrétariat des étudiants de la Section de biologie pour prendre un rendez-­vous avec la conseillère aux études, en charge des étudiants de Biologie.

NE RECOIT QUE SUR RENDEZ-­VOUS LES LUNDIS

3

Conseiller aux études de la Faculté des sciences Le Dr Xavier CHILLIER reçoit toute l’année sur rendez-­vous (inscription sur sa porte) dans le bureau 0001 au rez-­de-­chaussée du bâtiment Sciences III. En outre, durant les périodes de cours, une permanence (sans rendez-­vous) est mise sur pied le lundi entre 17h à 18h et le mardi de 10h à12h. Le conseiller aux études propose une orientation personnalisée sur les voies de formation offertes par la Faculté des sciences, présente les plans d’études et les matières, discute d’une éventuelle réorientation. En cas de difficultés quelconques dans les études (scolaires, matérielles, de santé, de langue, de compréhension ou autre), il convient d’en informer sans délai le conseiller aux études. Pour plus de détails dans les cursus, l’étudiant peut s’adresser au conseiller aux études de sa propre section. T 022.3796715 – + Conseiller-­etudes-­sciences@unige.ch Secrétariat des étudiants de la Faculté des sciences Le secrétariat des étudiants de la Faculté des sciences se trouve au rez-­de-­chaussée du bâtiment Sciences III, bureau 0003. + Secretariat-­Etudiants-­sciences@unige.ch T 022 3796661/62/63 Il est ouvert tous les matins de 9h30 à 12h et les mardi et jeudi de 14h à 16h. Le Secrétariat des étudiants gère les dossiers des étudiants de la Faculté des Sciences. Il a pour missions de :

• Résoudre les problèmes liés aux inscriptions aux cours et aux examens via le portail.unige.ch • Organiser les examens • Saisir les notes et envoyer les procès-­verbaux en cours et finaux • Réceptionner les courriers destinés au Vice-­doyen en charge de l'enseignement (demandes

de congé, demande de prolongation de diplômes, opposition aux éliminations, divers), • Orienter et renseigner les étudiant

Plus d’info sur le site internet de la Faculté des sciences : www.unige.ch/sciences/EspaceEtudiant/SecretariatEtudiants.html Décanat de la Faculté des sciences

Doyen Professeur Jérôme LACOUR Sciences II -­ bureau 124 T. 022.3796062 + jerome.lacour@unige.ch Vice-­doyen en charge des étudiants Professeur Martin GANDER Acacias 2 (mathématiques) -­ bureau 611 2-­4 rue du Lièvre T. 022.3791165 + martin.gander@unige.ch

Service militaire Veuillez-­vous adresser à l’Office de liaison Armée-­Université pour toute question relative au service militaire.

http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/servicesauxetudiants/prestationsdelafaculte/armeeuni/

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Section de biologie

Site internet de la Section de biologie : http://biologie.unige.ch/ Sciences III, 30 quai Ernest-­Ansermet Enseignements pour l’obtention des titres suivants :

• Bachelor en biologie

• Bachelor en archéologie préhistorique

• Master en biologie (avec plusieurs orientations possibles)

• Masters et Certificats d’études avancées

• Doctorat ès sciences, mention biologie

• Doctorat ès sciences en sciences de la vie, Mentions : Biosciences moléculaires, Écologie et évolution, Génomique et santé numérique, Physique du vivant, Sciences biomédicales, Sciences pharmaceutiques

• Doctorat ès sciences, mention anthropologie

La liste complète des titres est affichée sur le site internet de la Section de biologie Les quatre départements de la Section :

Département de biologie moléculaire (BIMOL) (2ème et 3ème étages de Sciences III) Directeur : Professeur Robbie Loewith Secrétariat : 022 379 61 97 http://www.molbio.unige.ch Département de génétique et évolution (GENEV) (3ème et 4ème étages de Sciences III et 4ème étage de Sciences II) Directeur : Professeur Ivan Rodriguez Secrétariat : 022 379 67 85 http://genev.unige.ch Département de botanique et biologie végétale (BIVEG) (1er et 2ème étages de Sciences III) Directeur : Professeur Roman Ulm Secrétariat : 022 379 30 16 http://biveg.unige.ch Département de biologie cellulaire (BICEL) (1er et 2ème étages de Sciences III) Directrice : Professeure Françoise Stutz Secrétariat : 022 379 66 70 http://cellbio.unige.ch

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AEB (Association des Étudiants en Biologie)

L’Association des Étudiants en Biologie (AEB) est ouverte à tout(es) les étudiant(es) de la Section de Biologie de l’Université qui souhaitent prendre part à la vie estudiantine. Elle représente et défend les étudiant(es) auprès de la direction et elle offre un moyen d'expression, afin que tout(es) puissent construire un parcours universitaire agréable. L’AEB permet aussi aux étudiant(es) de se rencontrer dans un autre contexte que celui des cours et favorise l’échange de documents utiles pour la révision des examens (résumés de cours, anciennes questions d’examens, par exemple). Elle organise, entre autres, un système de parrainage pour les premières années, des soirées, des sorties, un weekend à la montagne en février et des visites de laboratoires. Le Comité invite, chaque semestre, l’ensemble des étudiant(es) en biologie à venir discuter des objectifs principaux de l’Association lors de son Assemblée générale. (Prochaine Assemblée générale début octobre 2019) Pour être au courant de tous les évènements et de toutes les informations, suis-­nous sur Instagram @aeb_unige et sur Facebook @AebUnige. Pour toutes questions, tu peux aussi nous écrire à aeb@unige.ch. Dans l’attente de te rencontrer prochainement, nous te souhaitons le meilleur dans l’accomplissement de tes études universitaires.

Le Comité Université de Genève, faculté des Sciences Quai Ernest-­Ansermet 30, 1205 Genève | Sciences III, local 1S083

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MOBILITE

Tout-­e étudiant-­e de la Section de biologie peut envisager d’effectuer une partie de ses études de bachelor ou de master dans une autre université, en Europe (séjours Swiss-­European Mobility Programmes -­ SEMP) ou hors d’Europe (autres accords de mobilité). La durée d’un séjour peut être de 2 à 12 mois, et des bourses de mobilité peuvent être offertes par l’Université. Les enseignements ou stages pratiques effectués dans l’université d’accueil sont validés par un transfert d’ECTS si les examens sont réussis. Les avantages d’un séjour de mobilité sont multiples : -­ apprendre à maîtriser une autre langue dans un pays non francophone -­ approcher certaines disciplines sous un angle différent -­ suivre certains enseignements non dispensés à l’Université de Genève -­ vivre une expérience personnelle hors-­murs, et cela sans interrompre les études de biologie à l’Université de Genève. C’est donc une expérience enrichissante aussi bien sur le plan des études que sur le plan humain.

Pour les étudiant-­e-­s en biologie, le moment le plus propice pour un séjour de mobilité est la 3ème année du bachelor. La 3ème année complète du bachelor peut être validée si le séjour de mobilité effectué est de 2 semestres et si un plan d’études adéquat a été préalablement validé par la conseillère aux études. Dans le cadre du master, tout séjour de mobilité (par exemple un stage SEMP) doit faire l’objet d’un accord avec le directeur et/ou le responsable du master au sein de la Section de biologie.

Délais Attention, un séjour de mobilité doit être organisé au moins un an à l’avance, soit au début de la 2ème année du bachelor pour une possibilité de séjour pendant la 3ème année, et au début de la 3ème année pour une possibilité de séjour pendant le master. Il y a deux sessions de demandes de place d'échange par année académique. Le délai principal est le 1er décembre correspondant ! http://www.unige.ch/international/fr/mobilite/sinscrire/mobilite-­europemonde/procedure-­dinscription/les-­delais/ Où se renseigner ? Au Guichet mobilité Uni Mail -­ Rez-­de-­chaussée, local R055 Tél. +41 22 379 80 86 Ouverture : 10h -­13h sans RDV (Le Guichet Mobilité est fermé durant les vacances universitaires d'été) https://www.unige.ch/international/fr/mobilite/sinformer/ou-­se-­renseigner/ Des informations détaillées concernant les séjours de mobilité peuvent être obtenues sur le site internet de l’UniGe INTERNATIONAL http://www.unige.ch/international/fr/ Démarches / Procédure d’inscription Un plan d’études doit être validé par la/le conseiller/ère aux études de la Section, de façon à ce que les crédits que vous aurez acquis à l’étranger soient reconnus dans le cadre de votre diplôme à Genève. Comment l’élaborer ? https://www.unige.ch/international/fr/mobilite/sinscrire/mobilite-­europemonde/procedure-­dinscription/validation-­academique/ Choisir 3 destinations par ordre de priorité. https://www.unige.ch/international/fr/mobilite/sinscrire/mobilite-­europemonde/procedure-­dinscription/choisir-­3-­destinations/ Test d'anglais Important, si vous postulez pour une destination où l'enseignement est donné en anglais, il est nécessaire de fournir une preuve de votre niveau d'anglais (TOEFL ou autre). Si vous n'avez pas une certification de votre niveau d'anglais, il sera alors nécessaire (mais attention, pas forcément suffisant !) de passer un test interne à l'UNIGE, attestant un niveau B2 ou C1. Attention, il y a un seul examen par an ! Une inscription sera ouverte en septembre et l'examen aura lieu en octobre. Test d'anglais http://mdl.unige.ch/testsetexamens/testanglaismobiliteout/

Section de biologie

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Règlement et plan d’études Grilles horaires, cours* et monographie

• Grilles horaires du bachelor en biologie • Liste et descriptifs des enseignements obligatoires • Liste des cours à choix de 2ème année • Liste des enseignements à choix restreint de 3ème année

• Dates des TP à choix restreint de 3ème année • Règlement de la monographie *Pour les cours à choix, voir Partie V

Partie II Le bachelor en biologie

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Baccalauréat universitaire (bachelor) en biologie CONDITIONS GENERALES Art. A 8 – Baccalauréat universitaire en biologie 1. La Faculté décerne un baccalauréat universitaire en biologie, premier cursus de la formation de base. 2. L’obtention du baccalauréat universitaire en biologie permet l’accès au deuxième cursus de la formation de base, les études de maîtrise

universitaire en biologie, ainsi qu’aux études de maîtrise universitaire bi-disciplinaire. ADMISSION Art A 8 bis 1. L’admission aux études de baccalauréat universitaire en biologie est régie par l’Art. 2 du Règlement général de la Faculté. 2. Les admissions conditionnelles sont régies par l’Art. 3 du Règlement général de la Faculté. 3. Les étudiants qui ont quitté les études de baccalauréat universitaire en biologie sans en avoir été éliminés peuvent être réadmis sous

certaines conditions déterminées également dans l’Art. 3 du Règlement général de la Faculté. 4. Les étudiants en médecine humaine de la Faculté de médecine de l'Université de Genève peuvent être directement admis en

deuxième année du bachelor en biologie avec une équivalence de 60 crédits ECTS en bloc aux conditions cumulatives suivantes: - qu'ils aient réussi la première année du bachelor en médecine humaine de la Faculté de médecine de l'Université de Genève. - qu'ils aient réussi le premier module de ce bachelor en médecine humaine en ayant obtenu au minimum 55% des points. - qu'ils réussissent séparément les examens de Biologie fondamentale IIm et IIIm à la session de rattrapage (août/septembre).

Une seule tentative par examen est admise.

Les étudiants qui échouent à l'un ou l'autre ou aux deux examens de Biologie fondamentale IIm et IIIm à la session de rattrapage peuvent toutefois être admis au bachelor en biologie. Cependant, dans ce cas, ils sont admis à titre conditionnel conformémement à l’Art. 3 par analogie du Règlement général de la Faculté, en première année du bachelor en biologie (sans redoublement possible de la première année).

5. Des équivalences peuvent être accordées selon l’Art. 4 du Règlement général de la Faculté. DUREE ET PROGRAMME D’ETUDES Art. A 8 ter – Durée des études, congé et crédits ECTS 1. La durée réglementaire et le nombre de crédits obtenus pour le baccalauréat universitaire en biologie sont précisés dans l’Art. 5 du

Règlement général de la Faculté, soit une durée réglementaire de six semestres et l’obtention de 180 crédits ECTS. 2. La durée maximale pour l’obtention du baccalauréat universitaire en biologie est précisée dans l’Art. 19 du Règlement général de la

Faculté, soit une durée de dix semestres. 3. Les congés sont régis par l’Art. 6 du Règlement général de la Faculté. Art. A 8 quater – Examens de la première année L’examen de la première année porte sur les branches spécifiées dans le plan d’études. Art. A 8 quinquies – Examens de deuxième et troisième années 1. Les examens des deuxième et troisième années portent sur les branches spécifiées dans le plan d’études. 2. Les cours et travaux pratiques à choix restreint de la troisième année doivent être choisis dans la liste publiée chaque année sur le site

web de la Section de biologie. Le choix des travaux pratiques à choix restreint peut être limité par le nombre de places disponibles. Certains travaux pratiques requièrent de suivre un cours à choix restreint particulier.

3. Les cours et travaux pratiques à choix libre de la troisième année doivent en principe être choisis dans le Guide de l'étudiant publié sur

le site web de la Section de biologie. 4. Le règlement de la monographie est publié sur le site web de la Section de biologie. 5. La monographie et les cours et travaux pratiques à choix libre peuvent déjà être présentés en deuxième année. Leur évaluation fait

cependant partie des examens de troisième année. CONTRÔLE DES CONNAISSANCES Art. A 8 sexies – Réussite et admission dans l'année supérieure 1. La réussite de la première année, dite propédeutique, donne droit à 60 crédits ECTS selon les modalités de l’Art. 9, al.2 du Règlement

général de la Faculté. Les crédits ECTS attachés à chaque enseignement sont spécifiés dans le plan d’études approuvé par le Conseil participatif de la Faculté.

2. La première année peut être répétée selon les dispositions des Art. 10 et 14 du Règlement général de la Faculté. 3. L'étudiant doit avoir réussi la première année pour pouvoir poursuivre ses études en deuxième année.

8

4. La réussite des examens de la deuxième et de la troisième années donne droit à un total de 60 crédits ECTS en bloc pour chacune des deux années, selon les modalités de l’Art. 9, al.2 du Règlement général de la Faculté. Les crédits ECTS attachés à chaque enseignement sont spécifiés dans le plan d’études.

5. L’obtention des 60 crédits ECTS de deuxième année est nécessaire à la poursuite des études en troisième année. Art. A 8 septies – Appréciation des examens 1. Les examens sont régis par les articles 8 et suivants du Règlement général de la Faculté.

2. Pour les branches comportant plusieurs parties (orale, écrite, pratique), une note séparée est attribuée pour chaque partie; la

moyenne, le cas échéant pondérée, de ces notes partielles constitue la note de la branche. Aucune note partielle en-dessous de 2 n’est admise.

3. Pour les cours, les jurys d'examens sont composés, au moins, d'un membre du corps professoral ou d’un MER, CC ou CE et d'un co-

examinateur (qui doit être un universitaire diplômé).

4. La première année est réussie si : - la note minimum de 4 est obtenue pour chacun des trois examens de Biologie Fondamentale I, II et III. - la moyenne des notes de toutes les autres branches atteint au minimum 4 et aucune note de branche n’est inférieure à 3.

5. La deuxième année est réussie si :

- la moyenne, pondérée en fonction du nombre d'ECTS, de toutes les branches, à l’exception des cours à choix, atteint au minimum 4. Deux notes de branche inférieures à 4, mais supérieures ou égales à 3 sont admises.

- un certificat est obtenu pour la formation documentaire de la deuxième année. - les cours à choix sont réussis avec une note d’au minimum 4 chacun.

6. La troisième année est réussie si :

- la moyenne des notes de tous les cours obligatoires et à choix restreint et de la monographie atteint au minimum 4. Une seule note de branche inférieure à 4, mais supérieure ou égale à 3 est admise, sauf pour la monographie et les cours à choix. Les notes de cours à choix restreint à 3 crédits ECTS ne comptent que pour moitié dans le calcul de la moyenne.

- un certificat est obtenu pour chacun des travaux pratiques. - un certificat est obtenu pour la formation documentaire associée à la monographie. - la note minimum de 4 est obtenue pour la monographie et pour chacun des cours à choix.

DISPOSITIONS FINALES Art A 8 octies – Procédures en cas d’échec 1. Est éliminé du titre l’étudiant qui se trouve dans une des situations précisées dans l’Art. 19 du Règlement général de la Faculté.

2. L’étudiant éliminé a la possibilité de faire opposition contre une décision de la Faculté, puis, si cette décision est confirmée après

l’opposition, de faire un recours, selon le règlement interne de l’Université du 16 mars 2009 relatif aux procédures d’opposition.

Art. A 8 novies – Entrée en vigueur et dispositions transitoires 1. Le présent règlement entre en vigueur avec effet au 17 septembre 2018. Il abroge le règlement d’étude du baccalauréat universitaire

en biologie du 14 septembre 2015.

2. Le nouveau règlement s'applique à tous les étudiants à l'exception des dispositions de l'Art. A 8 septies, alinéa 5, qui ne s'appliquent qu'aux étudiants qui commencent leur deuxième année à la rentrée 2018. Pour les étudiants ayant déjà commencé leur deuxième année avant la rentrée 2018, une seule note inférieure à 4 est admise selon l'Art. A 8 septies, alinéa 5, de l'ancien règlement du 14 septembre 2015.

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PLAN D'ETUDES DU BACCALAUREAT UNIVERSITAIRE EN BIOLOGIE

Automne Printemps CREDITS Première année (heures/semaine) (heures/semaine) ECTS Cours TP Cours TP Cours TP Biologie fondamentale I 5 4 6.5 3 Biologie fondamentale II * 4 4 5 2.5 Biologie fondamentale III ** 4.5 4 5.5 2.5 Biostatistiques I 2 2 3 1 Chimie générale 4 3 5 2 Chimie organique 3 3 8 Mathématiques générales 2 2 3 1 Physique générale 6 3 6 10 2 Total détaillé 20 12 19.5 10 46 14 Total cours et TP 32 29.5 60

*, ** Les examens de Biologie fondamentale IIm et IIIm pour les étudiants en médecine humaine, selon les conditions de l'Art. A 8 bis, alinéa 4, portent respectivement sur les contenus des cours de Biologie fondamentale II et III (sans les questions des travaux pratiques) et donnent 5 et 5.5 ECTS.

Automne Printemps CREDITS Deuxième année (heures/semaine) (heures/semaine) ECTS Cours TP Cours TP Cours TP Biochimie pour biologistes 3 1 5 Bioinformatique 1 1 1 0.5 Biologie et Société 2 2 5 Biologie végétale 2 1 3 0.5 Biostatistiques II 1 1 1.5 0.5 Développement animal 3 4 Développement végétal 2 3 Génétique 3 2 4 2 9 2 Physiologie animale 3 3 4 1.5 Programmation 1 3 1.5 2 Systématique et Biodiversité 3 3 3 3 8 3 Cours à choix 2 2 5 Total détaillé 18 12 20 7 50 10 Total cours et TP 30 27 60

Automne Printemps CREDITS Troisième année (heures/semaine) (heures/semaine) ECTS Cours TP Cours TP Cours TP Biologie moléculaire de la cellule 3 3 9 Evolution 2 2 6 Monographie 2 2 5 Cours à choix restreint 1 2 2 6 Cours à choix restreint 2 2 2 6 Cours à choix restreint 3 2 2 6 TP à choix restreint 1 1 1 3 TP à choix restreint 2 1 1 3 Cours à choix restreint 4* 2 2 6 ou Cours à choix restreint 5 et 6* (1+1) (1+1) (6) ou Cours à choix restreint 5 et TP à choix restreint 3* (1+ 1) (1+ 1) (6)

Cours à choix libre** 3 3 10 Total détaillé 16 4 16 4 49 11 Total cours et TP 20 20 60

* Ces 3 options sont à choix. Le cours à choix restreint 4 vaut 6 ECTS, les cours à choix restreint 5 et 6 valent 3 ECTS. ** Les cours à choix libre doivent être pris parmi les enseignements figurant dans le Guide de l’étudiant. Certains cours hors-Section, voire hors-Faculté, peuvent néanmoins être admis avec l’accord de la Section de biologie.

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Enseignements obligatoires Première année

Bachelor en biologie

Section de biologie

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13 8/19/19

SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-­Ansermet 30, GenèvePSI : Pavillon Sciences I, Bd d'Yvoy 16 au 3ème étage, GenèveEPA : Ecole de physique, Quai Ernest-­Ansermet 24, Genève

Colonne1 LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15 Chimie Générale 11C101

Chimie Organique 11C103

Mathématiques générales

11M000 TP intégrés

Biologie Fondamentale I 11B001

09:00SCII, salle A300 SCII, salle A300 SCII, salle A300 SCII, salle A150

09:15 Chimie Organique 11C103

10:00SCII, salle A300

10:15Biologie

Fondamentale I 11B001

Physique générale B 11P085

Chimie Générale 11C101

Mathématiques générales11M000

Physique générale B 11P085

11:00 SCII, salle A150EPA SCII, salle A300 SCII, salle A300 EPA

11:15

12:00

12:15 Physique générale B 11P085

13:00 Répétitoire EPA

13:15Biologie

Fondamentale I 11C003 Biochimie I

Biologie Fondamentale I

11B001Travaux pratiques

14:00 (méthodes)

SCII, salle A300Répétitoire

SCII, salle A100Chimie Générale

11C901

14:15 Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques(groupe II)

Travaux pratiques

15:00 Chimie Générale 11C901 (groupe I)

Physique générale B 11P985

Biologie Fondamentale I

11B001

SCII, labo E+F Physique générale B 11P985

15:15 SCII, labo E+FPSI SCIII, salle 5050 PSI

16:00(mardi ou vendredi) (vendredi ou mardi)

16:15

17:00

17:15

18:00

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES – 1ère année Semestre d'automne

14.

.

158/19/19

SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-­Ansermet 30, GenèvePSI : Pavillon Sciences I, Bd d'Yvoy 16 au 3ème étage, GenèveEPA : Ecole de physique, Quai Ernest-­Ansermet 24, Genève PA : Pavillon Ansermet, Quai Ernest-­Ansermet 24, Genève

Colonne1 LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15 Chimie Organique 11C103

Biostatistiques I : Applications

Biologie Fondamentale III 11B003

09:00 SCII, salle A300 11M904 SCII, salle A150

09:15 Chimie Organique 11C103

PA, salle 119 au 1er étage et

10:00 SCII, salle A300 SCII salle A100

10:15Biologie

Fondamentale II 11B002

Physique générale B 11P086

Biologie Fondamentale II

11B002

Biostastiques I 11M004 Physique générale B

11P086

11:00SCII, salle A150 EPA SCIII, salle 1S059 SCII, salle A300 EPA

11:15

12:00

12:15 Physique générale B 11P086

13:00 Répétitoire EPA

13:15Biologie

Fondamentale III 14B037P

Biotatistiques I répétitoire 11B800

14:00(Introduction à la Génétique) SCII, salle A300

SCII, salle A300

14:15Biologie

Fondamentale III 11B003

Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques

15:00SCII, salle A150 Biologie

Fondamentale II 11B002

Biologie Fondamentale II

11B002

Biologie Fondamentale II

11B002

15:15 et/ou et/ou Biologie Fondamentale III

11B903

et/ou

16:00 Biologie Fondamentale III

11B903

SCIII, salle 5050 Biologie Fondamentale III

11B00316:15 SCIII, salle 5050 SCIII, salle 5050

17:00

17:15

18:00

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES – 1ère année Semestre de printemps

16

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17

BIOLOGIE'FONDAMENTALE'I' 11B001'Cours&obligatoire&bachelor&en&archéologie&préhistorique'«'Module'1.1'Sciences'de'base'»''

Semestre'

automne& 5h/sem,&total&65h

ECTS'

9.5&(cours&&&TP&intégrés)

Jours'&'lieux lundi&10h15C12h&Sciences&II,&salle&A150&&lundi&13h15&–&14h&(11C003X1&Biochimie'I&–&méthodes*)'&Sciences&II,&salle&A300&&mardi&13h15&–&14h&Répétitoire&(4&séances&min.)&&Sciences&II,&salle&A100&&&vendredi&8h15C10h00&&Sciences&II,&salle&A150&

Mode'd’évaluation Questionnaire&à&choix&multiples&(QCM)&

Sessions'd'examens janvierCfévrier&+&rattrapage&aoûtCseptembre&

Responsable Monsieur&J.&C.&MARTINOU,&022.379.6443,&jeanCclaude.martinou@unige.ch&

Enseignant(e)s Mesdames&S.&CITI&(pas),&F.&STUTZ&(po)&Messieurs&J.CC.&MARTINOU&(po),&D.&PICARD&(po).&Pour&les&enseignants&du&cours&11C003X1&Biochimie'I,&voir&dans&le&programme&des&cours&sur&internet.&

Divers&*&le&cours&11C003X1&Biochimie'I&partie&méthodes&fait&partie&intégrante&du&cours&de&Biologie&Fondamentale&I&&Contenu'Origines&de&la&vie&a&cellule&unité&vivante&a&métabolisme&énergétique&(chloroplastes&et&mitochondries).&Biologie&moléculaire&:&ADN,&réplication,&transcription,&traduction.&Cellule& animale& :& noyau,&cytoplasme,&membranes,&compartiments,& transport& intracellulaire&et&sécrétion&des&protéines.&Organisation&des&tissus&et&cytosquelette&a&jonctions&cellulaires.&Cycle&cellulaire&a&mitose,&méiose&a&transmission&de&signal.&&Objectifs'1.&Distinguer&entre&“vivant”&et&"nonCvivant”a&décrire&les&différences&entre&l’organisation&(génomes&et&autres)&des&virus,&bactéries&et&eucaryotes.&&2.&Définir&les& termes&scientifiques&de&base&(ex.&gène,&protéine,&enzyme,&hormone,&etc).&Acquérir&les&définitions&du&vocabulaire&scientifique&abordé&dans&le&cours&et&listé&dans&un&glossaire&(ex:&p53,&actine,&DNA&polymérase,&oxytocine,&etc).&&&3.&Utiliser&et&décrire&les&concepts&et&processus&fondamentaux&de&biologie&moléculaire&et&cellulaire&(ex:&transcription,&traduction,&cycle&cellulaire,&mitose,&méiose,&métabolisme&énergétique,&sécrétion,&trafic,&endocytose,&exocytose,&motilité,&adhésion,&barrière,&signalisation,&etc).&&4.&Décrire& la&composition,&l’organisation,&les&propriétés,&la&fonction&et&les&relations&fonctionnelles&dynamiques& des& structures& cellulaires& (ex.& noyau,& chromosomes,& chromatine,& ADN,& ARN,&membrane&plasmique,& compartiments&membranaires,&mitochondries,&cytosquelette,& jonctions,&ribosomes,&etc).&&5.&Comprendre&et&expliquer&les&méthodes&de&purification&et&d’analyse&des&acides&nucléiques&(ADN,&ARN)&et&des&protéines.&

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!BIOLOGIE'FONDAMENTALE'I'.'Travaux'pratiques'intégrés' 11B001'Travaux!pratiques!obligatoires!bachelor!en!archéologie!préhistorique'«'Module'1.1'Sciences'de'base'»'Semestre' automne!! 4h/sem,!total!48h!' !Jours'&'Lieux' mercredi!14h15!–!18h00!

Sciences!III,!salle!TP!5050!!!

Mode'd’évaluation! Questions!intégrées!au!questionnaire!à!choix!multiples!(QCM)!du!cours!correspondant!!

' !Responsables/'Enseignant(e)s!

Madame!A.!BELLIER!et!Monsieur!V.!HUBER!:!formation!documentaire!T!!Madame!E.!DEMARSY!(cc)! :!responsable!de!la!salle!des!TP!5050.!!Madame!V.!HAMEL!(ma)!:!coordinatrice!des!travaux!pratiques!en!laboratoire!de!recherches!T!!F.!KARCH!(po)!et!J.!MONTOYA!(ce)!:!TP!en!salle!5050.!

!Contenu'Formation!documentaire!T!bases!de!biologie!moléculaire!et!cellulaire!en!laboratoire!de!rechercheT!analyse! informatique!de! séquences!d’ADN.!Microscopie!:! cellule! animale! et! végétale,!mitose,!méiose,!chromosomes!spéciaux.!!Objectifs'Chercher!et!localiser!des!documents!scientifiques!T!évaluer!leur!fiabilité!et!connaître!les!risques!liés!au!plagiat.!Utiliser!des!programmes!d’analyse!de!séquences!et!consultation!de!bases!de!données.!!Utiliser!un!microscope!et!observer!les!structures!cellulaires.!!Représenter!ces!observations!(dessins,!graphiques).!Utiliser!des!outils!de!bases!du!laboratoire!(micropipettes,!spectrophotomètre).!Appliquer!les!techniques!de!biologie!moléculaire!et!cellulaire!de!base.!!Synthétiser!et!présenter!un!sujet!de!recherche!oralement.!

!

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!BIOLOGIE'FONDAMENTALE'II' 11B002'!Semestre''

printemps!! 4h/sem,!total!56h!

ECTS''

7.5!(cours!&!TP!intégrés)!5!(cours!–!master!bi@disciplinaire,!mineure!biologie)!!

Jours'&'lieux' lundi!10h15!@!12h00!!Sciences!II,!salle!A150!!mercredi!10h15!@!12h00!Sciences!III,!salle!1S059!!

Mode'd’évaluation! Questionnaire!à!choix!multiples!(QCM)!!

Sessions'd'examens'' juin!+!rattrapage!août@septembre!Responsable! Madame!E.!DEMARSY!–!022!379!36!52!–!emilie.demarsy@unige.ch!

!Enseignant(e)s! Mesdames!S.!CITI!(pas),!E.!DEMARSY!(cc),!

Messieurs!D.!DUBOULE!(po),!X.!PERRET!(mer),! I.!RODRIGUEZ!(po).!!

Contenu'Microbiologie!:! diversité! des! microbes,! taxonomie,!structure! et! développement!des! bactéries,!génétique!bactérienne,!éléments!de!virologie!et!biotechnologies!microbiennes.!!Organisme! végétal!:! cycle! de! développement!et! alternance!de! générations! (gamétophyte!vs!sporophyte),!embryogenèse,! rôle! des! méristèmes,! croissance! et! organogenèse,!contrôle! du!développement!végétal!par!l’environnement.!Organisme!animal! :!gamétogenèse!et!fécondationf!embryologie!expérimentale,!des!oursins!aux!mammifèresf!biologie!des!tissus!(épithéliaux,!conjonctifs,!musculaires!et!nerveux),!des!organes!et!des!systèmes!chez!les!mammifères,!introduction!à!l’endocrinologie!et!l’immunologief!neurobiologie.!!Objectifs'Approcher!la!diversité!et!l’importance!des!microbes,!reconnaître!leurs!particularités!par!rapport!aux!cellules!eucaryotes.!!Connaître!et!distinguer!les!spécificités!du!développement!animal!et!végétal.!Décrire!la!structure!et!l’organisation!des!cellules!dans!les!tissus!et!l’assemblage!de!différents!types!de!tissus!dans!un!organe.!Expliquer!l’intégration!fonctionnelle!entre!différents!organes.!Maitriser!les!concepts!de!base!en!neurobiologie.!!

!

20

!

BIOLOGIE'FONDAMENTALE'II'–Travaux'pratiques'intégrés' 11B002'!Semestre' printemps!! 4h/sem,!total!56h!' !Jours'&'lieux' mardi!et/ou!mercredi!et/ou!jeudi!14h15!–!18h00!en!alternance!avec!les!

travaux!pratiques!de!Biologie!fondamentale!III!!Sciences!III,!salle!TP!5050!!!

Mode'd’évaluation! Questions!intégrées!au!questionnaire!à!choix!multiples!(QCM)!du!cours!correspondant!et/ou!rédaction!d’un!rapport!!

Sessions'd'examens''

juin!+!rattrapage!aoûtOseptembre!

Responsable'!

Madame!E.!DEMARSY!–!022!379!36!52!O!emilie.demarsy@unige.ch!

Enseignant(e)s! Mesdames!P.!SOULIE!(cs),!E.!DEMARSY!(cc),!Messieurs!J.!MONTOYA!(ce),!X.!PERRET!(mer),!J.!ZAKANY!(mer).!

!Divers!La!participation!aux!travaux!pratiques!est!obligatoire!pour!être!validés.!!Les!travaux!pratiques!enseignés!par!Monsieur!X.!Perret!sont!notés!en!contrôle!continu!(rapport).!!Les'étudiants'redoublants'ne'sont'pas'tenus'd’y'participer'à'condition'qu’ils'confirment'vouloir'garder'leur'note'de'l’année'précédente.!'Contenu'Culture!et!transformation!de!bactéries,!résistance!aux!antibiotiques!et!coloration!de!Gramh!histologie!et! physiologie!végétaleh!gamétogenèse,!développement!mosaïque!et! embryologieh!histologie!animale!générale,!anatomie!comparative.!!!Objectifs'Appliquer!les!techniques!de!base!en!bactériologie.!Consolider!les!notions!acquises!dans!les!différentes!parties!du!cours!par!des!observations!au!microscope,!des!dissections!et!diverses!manipulations.!Se!familiariser!à!la!rédaction!de!rapports!scientifiques.!

!!

21

BIOLOGIE'FONDAMENTALE'III' 11B003'Cours&obligatoire&bachelor&en&archéologie&préhistorique'«'Module'2.1'Sciences'de'la'vie'»'''Semestre' printemps&

&4.5h/sem,&total&56h&

ECTS' 8&(cours&&&TP&intégrés)&&

Jours'&'Lieux' lundi&13h15&–&14h00&&(14B037P&Introduction'à'la'Génétique&:&Partie&génomique*)&Sciences&II,&salle&A300&&lundi&14h15&–&16h00&&Sciences&II,&salle&A150&&vendredi&8h15M10h00&&Sciences&II,&salle&A150&&

Mode'd’évaluation& Examen&écrit&de&4&heures&comprenant&des&questions&théoriques&à&développer,&des&problèmes&à&résoudre&et/ou&des&questions&à&choix&multiples&(QCM)&&

Sessions'd'examens''

juin&+&rattrapage&aoûtMseptembre&

Coordinateur' Monsieur&D.&PAULI&–&022&379&67&55&–&daniel.pauli@unige.ch&' &Enseignant(e)s& Madame&A.&SANCHEZMMAZAS&(po),&

Messieurs&D.&PAULI&(ce),&J.&MONTOYA&(ce),&A.&LANGANEY&(ph),&&B.&IBELINGS&(po).&&

Cours&14B037P&Introduction'à'la'Génétique:&Partie&génomique:&&Monsieur&V.&OSSIPOW&(cc).&&

Divers&*&Le&cours&14B037P&Introduction'à'la'Génétique&:&Partie&génomique&(6&heures)&fait&partie&intégrante&du&cours&de&Biologie&Fondamentale&III&&&Contenu'1.&Génétique&des&eucaryotes.&M&La&transmission&des&gènes&individuels.&M&La&recombinaison&par&assortiment&indépendant.&M&La&recombinaison&par&crossingMover&et&la&cartographie&des&chromosomes.&M&La&complémentation.&M&Les&relations&génotypeMphénotype.&M&Introduction&aux&différents&types&de&mutations.&&

2.&Evolution&et&Phylogénie.&M&Découverte&des&mécanismes&de&l’évolution&:&historique.&M&Génétique&évolutive.&M&Spéciation.&M&Introduction&à&la&phylogénie.&M&Biodiversité.&Arbre&du&vivant.&M&Evolution&humaine.&M&Evolution&des&comportements.&&

3.&Ecologie.&M&Introduction&à&l’écologie.&M&Conditions&et&ressources.&M&Individus,&populations,&communautés&et&écosystèmes&M&Questions&appliquées&en&écologie.&Objectifs'Les&étudiants&devront&être&capables&de:&M&définir,&expliquer&et&utiliser&les&concepts&principaux.&M&à&partir&d’un&problème&ou&de&la&description&d’une&situation&expérimentale&simple,&identifier&les&informations&importantes&et&émettre&une&hypothèse&ou&effectuer&les&déductions.&Proposer&un&moyen&de&tester&cette&hypothèse&et&prédire&ce&qu’on&peut&attendre&de&ce&test.&

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!BIOLOGIE'FONDAMENTALE'III'–'Travaux'pratiques'intégrés' 11B003'!Semestre' printemps! 4h/sem,!total!56h!' !Jours'&'Lieux' mardi!ou!/et!mercredi!ou!/et!!jeudi!14h15!–!18h00!en!alternance!avec!les!

travaux!pratiques!de!Biologie!Fondamentale!II!!Sciences!III,!salle!TP!5050!!

Mode'd’évaluation! Questions!intégrées!dans!l’examen!du!cours!!' !Coordinateur''

Monsieur!D.!PAULI!–!022!379!67!55!–!daniel.pauli@unige.ch!

Enseignant(e)s! Mesdames!A.!TZIKA!(ma)!et!E.!DEMARSY!(cc).!Messieurs!D.!PAULI!(ce),!J.!MONTOYA!(ce).!

!Contenu'Génétique!Evolution!Biodiversité!Phylogénie!Génomique!comparative!!Objectifs'Introduire!les!étudiants!à!divers!aspects!expérimentaux!en!lien!avec!certains!chapitres!du!cours.!!!

23

!BIOSTATISTIQUES* I*:*Applications* 11M904*Cours!obligatoire!bachelor!en!archéologie!préhistorique*«*Module*1.1*Sciences*de*base*»**Semestre**

printemps!! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

1!(total*4*pour*11M004*+*11M904*)!

Jour**

jeudi!08h15!–!10h00!

Lieux* Pavillon!Ansermet,!salle!119!au!1er!étage!et!salle!A100!SCII!(et!salle!0019!SCIII,!en!fonction!du!nombre!d'étudiants)!!

Mode*d’évaluation*!

un!seul!examen!écrit!de!2h!pour!les!deux!enseignements!11M004!et!11M904!

Sessions*d'examens**

juin!+!rattrapage!aoûtNseptembre!

Responsable*!

Madame!E.!POLONI!N!022.379.6977!N!estella.poloni@unige.ch!

Enseignant(e)s! Madame!E.!POLONI!(cc),!Monsieur!M.!MOUTERDE!(ass),!et!collaborateurs.!

!Divers!**Le!cours!Biostatistiques!I!(11M004,!responsable!Monsieur!S.!SARDY!(pas),!doit!être!suivi!avec!les!travaux!pratiques!Biostatistiques!I!:!Applications!(11M904)!au!semestre!de!printemps!pour!l’obtention!des!4*crédits*ECTS.!!Contenu*En!coordination!avec!le!cours!de!Biostatistiques!I! (11M004),!les! séances!de!‘Biostatistiques!I!:!Applications’!proposent!une!application!des!conceptsNclés!en!probabilités!et!statistiques!à!la!biologie,!et! plus! généralement!à! tous! les! domaines! liés! aux! sciences! du! vivant.! Les! deux! heures!hebdomadaires!seront!dédiées!à!contextualiser!l’utilité!et!l’utilisation!de!ces!concepts!pour!aborder!des!connaissances!dans!le!domaine!des!sciences!du!vivant.!Ceci!s’effectuera!à!travers!la!résolution,!par! les! étudiantsNes,!de!problèmes!présentés!sous! forme! d’exercices! sur! des! exemples! tirés!exclusivement!du!domaine!des!sciences!du!vivant.!Des!corrections!interactives!(entre!enseignantsNes!et!étudiantsNes)!seront!proposées.!Le!recours!à!l’utilisation!du!logiciel!R!sera!aussi!inclus!dans!les!séances.!Le!programme!comprend!:!!1.! EDA:! visualisation!et! représentation!des!données,!échantillonnage(s)!dans! le! contexte!des!sciences!du!vivant!2.!Probabilités:!lois!de!probabilités!dans!la!génétique!des!familles!et!des!populations,!et!lois!de!probabilités!associées!aux!caractères!à!variation!continue!3.!Principes!de!l'inférence!statistique!de!paramètres!usuels!dans!les!sciences!du!vivant,!principe!d’un!test!d’hypothèse!et!introduction!aux!tests!usuels!dans!les!sciences!du!vivant!!Objectifs*Permettre!à!l'étudiantNe!d’acquérir!un!degré!d’autonomie!suffisant!pour!pouvoir,!à!la!fois!:!N!s’orienter!dans!le!choix!de!la!littérature!à!consulter!et!les!programmes!statistiques!à!utiliser!pour!répondre!à!une!question!scientifique!qu’elle/il!pourra!rencontrer!dans!le!cadre!de!ses!études!e!N!porter!un!regard!critique!sur!l’actualité!scientifique!dans!le!domaine!des!sciences!du!vivant,!à!savoir!être!capable!d’évaluer!l’adéquation!d'un!plan!expérimental!pour!répondre!à!une!question!scientifique!donnée,!la!robustesse!des!résultats!expérimentaux!et!la!pertinence!des!conclusions!qui!en!sont!tirées.!Ceci!implique!:!

N! d’identifier!des!types!de!variables,!leurs!distributions!de!probabilité!et!les!paramètres!de!ces!distributions!e!

N! d’estimer!des!paramètres!usuels!(médiane,!quartiles,!probabilité,!espérance,!variance,!covariance,!corrélation)!à!partir!de!données!expérimentales!e!

N! de!conduire!un!test!d’hypothèse!simple!avec!des!données!expérimentales!e!d’interpréter!les!résultats!des!estimations!ou!des!tests!dans!le!cadre!d’un!plan!expérimental,!et!d’en!tirer!des!conclusions.!!!

24

!

BIOSTATISTIQUES* I*:*Répétitoire* 11B800*

!

Semestre* printemps!! 2h/sem,!total!14h!

* !

Jour*

*

mardi!13h15614h00!

Lieu* Sciences!II,!salle!A300!!

* !

Enseignante! Madame!E.!POLONI!(cc)!

!

Contenu*

Ce*répétitoire*complémente*Biostatistiques*I*:*Applications*(11M904).*

!

Les!notions!abordées!sont!reprises!ici!avec!de!nouveaux!exemples!tirés!de!la!recherche!dans!les!

sciences!du!vivant.!

!

Objectifs*

Les!objectifs!restent!les!mêmes!:!

Permettre!à!l'étudiant6e!d’acquérir!un!degré!d’autonomie!suffisant!pour!pouvoir,!à!la!fois!:!

6!s’orienter!dans!le!choix!de!la!littérature!à!consulter!et!les!programmes!statistiques!à!utiliser!pour!

répondre!à!une!question!scientifique!qu’elle/il!pourra!rencontrer!dans!le!cadre!de!ses!études!S!

6!porter!un!regard!critique!sur!l’actualité!scientifique!dans!tous!les!domaines!des!sciences!du!vivant,!

à!savoir!être!capable!d’évaluer!l’adéquation!d'un!plan!expérimental!pour!répondre!à!une!question!

scientifique!donnée,!la!robustesse!des!résultats!expérimentaux!et!la!pertinence!des!conclusions!

qui!en!sont!tirées.!

Ceci!implique!:!

6! d’identifier!des! types!de!variables,! leurs! distributions!de!probabilité!et! les! paramètres!de!ces!

distributions!S!

6! d’estimer!des!paramètres!usuels!(médiane,!quartiles,!probabilité,!espérance,!variance,!covariance,!

corrélation)!à!partir!de!données!expérimentales!S!

6! de!conduire!un!test!d’hypothèse!simple!avec!des!données!expérimentales!S!

d’interpréter!les!résultats!des!estimations!ou!des!tests!dans!le!cadre!d’un!plan!expérimental,!et!

d’en!tirer!des!conclusions.!

!

!!

25

!BIOSTATISTIQUES* I* 11M004*Cours!obligatoire!bachelor!en!archéologie!préhistorique*«*Module*1.1*Sciences*de*base*»***Semestre**

printemps!! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!(total!4!pour!11M004!+!11M904*)!

Jour**

jeudi!10h15!–!12h00!!

Lieu**

Sciences!II,!salle!A300!

Mode*d’évaluation*!

un!seul!examen!écrit!de!2h!!pour!les!deux!enseignements!11M004!et!11M904!!

Sessions*d'examens**

juin!+!rattrapage!aoûtLseptembre!

Responsable*!

Monsieur!S.!SARDY!–!022.379.1142!–!sylvain.sardy@unige.ch!

Enseignant(e)s! Monsieur!S.!SARDY!(pas),!et!collaborateurs.!!Divers!*!Le*cours*Biostatistiques*I*(11M004)*doit*être*suivi*avec*les*travaux*pratiques*Biostatistiques*I*:*Applications*(11M904)*au*semestre*de*printemps*pour*l’obtention*des*4*crédits*ECTS.!!Contenu*1.! Analyse!exploratoire!(statistiques!simples!et!analyse!graphique)!et!utilisation!du!logiciel!

statistique!R.!2.! Calculs!élémentaires!de!probabilités.!3.! Variables!aléatoires!et!distributions!discrètes,!leur!espérance!et!variance.!En!particulier,!

distributions!Bernoulli,!Binomiale!et!Poisson.!4.! Variables!aléatoires!et!distributions!continues,!leur!espérance!et!variance.!En!particulier,!

distributions!Gaussienne!et!Student.!5.! Introduction!à!la!régression,!au!test!statistique!et!estimateur.!!Objectifs*Apprendre!les!conceptsLclefs!en!statistiques!et!probabilités.!!

26

!CHIMIE&GENERALE& 11C101&Cours!obligatoire!bachelor!en!archéologie!préhistorique&«&Module&1.1&Sciences&de&base&»&&&Semestre& automne!!

!4h/sem,!total!56h!

ECTS& 5!(pour!les!biologistes!&!les!archéologes)!!

Jour&&

lundi!8h15@10h00!&!mercredi!10h15@12h00!

Lieu&&

Sciences!II,!salle!A300!

Mode&d’évaluation&!

questionnaire!à!choix!multiples!(QCM)!!

Sessions&d'examens& janvier@février!+!rattrapage!août@septembre!!

Responsable&!

Monsieur!X.!CHILLIER!–!022.379.6715!–!xavier.chillier@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!X.!CHILLIER!(cc).!!Contenu&1.!Historique!et!concepts!de!base!2.!Equilibre!et!réactions!chimiques!3.!Cinétiques!des!réactions!4.!L’atome!et!l’électron!:!naissance!de!la!mécanique!quantique!5.!Molécules,!liaisons!et!états!de!la!matière!6.!Equilibres!physico@chimiques!7.!Chimie!nucléaire,!isotopes,!radiochimie!et!radioactivité!!Documentation&et&bibliographie!Polycopié!(sur!Moodle)!!Tro!N.J.!(2016)!Chimie!générale,!une!approche!moléculaire,!Pearson!Education,!(ISBN!978@2@7613@9075@0)!!Brown!et!al.!(2012)!Chemistry!:!the!central!science,!12th!Edition,!!(ISBN!978@0@321@74983@3)!!P.W.!Atkins,!L.!Jones!(1998).!Chimie!:!Molécules,!Matière,!Métamorphoses.!De!Boeck!Université.!ISBN!10@2@7445@0028@3.!!Hill!&!Petrucci,!Chimie!générale!(2002),!Pearson!Press,!!(ISBN!2@84211@199@0)!!EKlearning&:&https://chamilo.unige.ch/!!Objectifs&Dispenser!aux!étudiant@e@s!une!culture!de!base!en!chimie!et! les!connaissances!dont!ils/elles!auront!besoin!pour!suivre!ensuite!des!enseignements!plus!avancés.!!CHIMIE&GENERALE&exercices&:&intégrés&dans&le&cours&&!!!

27

!

CHIMIE&GENERALE&–&travaux&pratiques& 11C901&!

Semestre& automne!(semaines!6-14)! 4h/sem,!total!36h!

!

ECTS&&

2!(pour!les!biologistes)!

Jours&&

lundi!14h15-18h00!(groupe&I)!!jeudi!13h15-17h00!(groupe&II)!!

Lieu&&

Sciences!II,!laboratoires!E!+!F!

Mode&d’évaluation& contrôle!continu!

& !

Responsable&!

Monsieur!C.!PIGUET!–!022!379!60!34!-!claude.piguet@unige.ch!

Enseignants! Messieurs!H.!NOZARY!(Adj.!S.),!J.!JIMENEZ!(as),!!

!

Contenu&1.!Notions!de!base!

2.!La!réaction!chimique!

3.!Thermodynamique!et!équilibre!

4.!Structure!atomique!

5.!Propriétés!des!solutions!aqueuses!

6.!Réactions!de!transfert!d’électrons!

7.!Chimie!analytique!

!

Documentation&et&bibliographie&:!Polycopiés!de!Travaux!Pratiques.!

P.W.!Atkins,!L.!Jones!(2011).!Principes!de!Chimie.!!

De!Boeck!Université.!Bruxelles,!ISBN!978-2-8041-6317-4.!

!

EKlearning&:&https://chamilo.unige.ch/!!

Objectifs&Introduction!à!la!chimie!pour!les!sciences!de!la!vie!et!les!sciences!de!la!Terre.!

!

!!

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!

CHIMIE&ORGANIQUE& 11C103&!

Semestre& automne/printemps!

!

3h/sem,!total!84h!

ECTS& 9.5!!

!

Jours& mardi!9h15910h00!

mercredi!8h15910h00!

!

Lieu&

&

Sciences!II,!salle!A300!

Mode&d’évaluation! Questionnaire!à!choix!multiples!(QCM)!

!

Sessions&d'examens& Juin!+!rattrapage!août9septembre!

!

Responsables&

&

!

Monsieur!J.!LACOUR!–!022.379.6062!–!jerome.lacour@unige.ch!

Madame!A.!POBLADOR9BAHAMONDE!–!022.379.6155!

Amalia.PobladorBahamonde@unige.ch!

&

Enseignant(e)s!

!

Monsieur!J.!LACOUR!(po),!!

Madame!A.!POBLADOR9BAHAMONDE!(mer).!

!

Divers!

Documentation&et&bibliographie&:!

•! J.!McMurry!(2011).!Fundamentals!of!Organic!Chemistry,!7th!edition.!Belmont:!

Brooks/Cole,!2011.!ISBN!97894390949730.!

•! J.!McMurry,!E.!Simanek!(2007).!Chimie!Organique,!les!Grands!Principes,!!

2e!édition.!Dunod,!Paris.!ISBN!978921009505470.!

!

EOlearning&:&Ohttps://moodle.unige.ch/!!

Contenu&

Semestre!d’automne!(Prof.!J.!Lacour)!

9!Généralités!(la!liaison!chimique)!

9!Alcanes!et!cycloalcanes!(hydrocarbures!saturés)!

9!Alcènes!et!alcynes!(hydrocarbures!insaturés)!

9!Composés!aromatiques!(structure!et!réactivité)!

9!Stéréoisomérie,!chiralité,!activité!optique,!énantiomérie,!diastéréoisomérie!

9!Halogénoalcanes!(structure!et!réactivité)!

9!Alcools,!éthers!et!phénols!(structure!et!réactivité)!

9!Aldéhydes!et!cétones!(structure!et!réactivité)!

9!Acides!carboxyliques!et!dérivés!(esters,!amides,!nitriles)!(première(partie)!! ! !

Semestre!de!printemps!(Dr!A.!Poblador9Bahamonde)!

9!Acides!carboxyliques!et!dérivés!(esters,!amides,!nitriles)!(deuxième(partie)!9!Réactions!de!substitutions!en!!d’un!carbonyle!et!réactions!de!condensation!9!Amines!et!dérivés!azotés!

9!Hétérocycles!azotés!et!produits!naturels!apparentés!

9!Composés!difonctionnels!et!polyfonctionnels!

9!Glucides!9!!biomolécules!!naturelles,!mono9!et!polysaccharides!

9!Acides!aminés,!peptides!et!protéines!:!macromolécules!et!polymères!naturels!

9!Corps!gras,!stéroïdes,!phospholipides!et!acides!nucléiques!:!l’ADN!et!l’ARN!

9!Exercises(et(autoevaluation!!

!

Objectifs&

Cours!de!base!obligatoire!pour!les!étudiant9e9s!de!1e!année!du!Bsc!en!biologie!et!du!Bsc!en!

sciences!pharmaceutiques.!

!

!

&

29

!MATHEMATIQUES*GENERALES*** 11M000*

!Semestre*

*

automne!! 2h/sem,!total!28h!

ECTS* 4!(11M000!+!TP!8!exercices)!voir!«!Divers!»!!

Jours*

*

jeudi!10h15!8!12h00!

Lieu* Sciences!II,!salle!A300!!

Mode*d’évaluation! examen!écrit,!2h.!!!

Sessions*d'examens** janvier8février!+!rattrapage!août8septembre!!

Responsable*

!Monsieur!S.!SARDY!–!022.379.1142!–!sylvain.sardy@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!S.!SARDY!(pas).!!Divers!Le*cours*de*mathématiques*générales*automne*(11M000)*et*ses*exercices*doivent*être*

suivis*dans*leur*intégralité*pour*obtenir*les*4*ECTS.*

!Contenu*

1.!Analyse!de!fonctions!univariées!:!graphe,!limite,!continuité,!dérivation,!intégration,!Taylor.!2.!Fonctions!à!plusieurs!variables!:!graphes,!limite,!continuité,!gradient,!hessienne,!Taylor.!3.!Optimisation!:!concepts!clefs,!existence,!unicité,!convexité,!algorithmes.!4.!Algèbre!linéaire!:!espace!vectoriel,!partie!libre,!partie!génératrice,!base,!déterminant,!norme,!produit!scalaire,!produit!vectoriel,!matrice,!vecteurs/valeurs!propres.!5.!Equations!différentielles!simples.!!Objectifs*

Le!but!de!ce!cours!est!de!dégager!les!idées!du!calcul!différentiel!et!intégral!à!une!ou!plusieurs!variables!qui!sont!importantes!pour!la!pratique!scientifique.!On!introduira!également!des!éléments!de!base!d’algèbre!linéaire!et!d’équation!différentielle.!!Exercices*/*travaux*pratiques*intégrés* 11M000*

!Semestre* automne!! 2h/sem,!total!28h!* !Jours*

*

jeudi!8h00!8!10h00!

Lieu*

*

Sciences!II,!salle!A300!

Mode*

d’évaluation!examen!écrit,!2h.!!!

Sessions*

d'examen*offertes*

janvier8février!+!rattrapage!août8septembre!!

Responsable*

!Monsieur!S.!SARDY!–!022.379.1142!–!sylvain.sardy@unige.ch!

Enseignant(e)s! Monsieur!S.!SARDY!(pas).!!Contenu*

Initiation!au!logiciel!de!calcul!numérique!et!statistique!R!!!

30

PHYSIQUE)GENERALE)B) 11P085/086)Cours&obligatoire&bachelor&en&archéologie&préhistorique)«)Module)1.1)Sciences)de)base)»))

Semestre))

automne/printemps& 4h/sem,&total&112h&

ECTS))

10&(cours&+&répétitoire&pour&les&biologistes)&8&(cours&pour&les&archéologues)&&

Jours) mardi&10h15A12h00&vendredi&10h15A12h00&&

Lieu) EPA,&Ecole&de&physique&&

Mode)d’évaluation& examens&écrits&&

Sessions)d'examens) janvierAfévrier&/&juin&+&rattrapage&aoûtAseptembre&&

Responsabl(e)s)))))

(automne)&Monsieur&BONACINA&Luigi&–&022&379&0508&ALuigi.Bonacina@unige.ch&&&

(printemps)&Monsieur&GIANNINI&Enrico&–&022&379&6076&A&Enrico.Giannini@unige.ch&&&

Enseignant(e)s& Messieurs&L.&BONACINA&(mer),&E.&GIANNINI&(mer)&&

Divers&Le&cours&de&physique&générale&B&(11P085/11P086)&de&10&ECTS&doit&être&suivi&avec&les&travaux&pratiques&(11P985)&de&2&ECTS&pour&l’obtention&des&12&ECTS.&&&

Bien&que&pas&obligatoires,&les&séances&d’exercices&sont&indispensables&à&la&compréhension&du&cours&et&fortement&conseillées.&&

Les&laboratoires&qui&accompagnent&le&cours&doivent&permettre&à&l’étudiant&de&se&familiariser&avec&les&méthodes&de&mesures&utilisées&pour&déterminer&une&grandeur&physique.&Ils&font&partie&du&champ&d’examen.&&Contenu)Semestre)automne):)(11P085))Introduction&à&la&physique,&cinématique,&lois&de&Newton,&dynamique,&statique,&gravitation,&rotation,&énergie&mécanique,&les&solides,&les&fluides,&oscillations&et&ondes&mécaniques,&le&son,&propriétés&thermiques&de&la&matière,&chaleur&et&thermodynamique.&&

Semestre)printemps):)(11P086))Electrostatique,&courant& continu,& circuits,& magnétisme,& induction& électromagnétique,&courant&alternatif,&ondes&électromagnétiques,&propagation&de&la& lumière,& optique&géométrique,&optique&ondulatoire,&lasers,&applications&biomédicales,&relativité&restreinte,&origines&de&la&physique&moderne,&théorie&quantique.&&Moodle:&https://moodle.unige.ch/course/view.php?id=2556&&Objectifs)Le&but&du&cours&est&de&donner&à&l'étudiant&les&notions&de&base&nécessaires&à&la&compréhension&des&phénomènes&physiques&qui&se&passent&dans&la&nature&et&dans&le&corps&humain.&L'objectif&est&atteint&lorsque&l'étudiant&est&capable&de&prévoir&quantitativement&les&conséquences&de&ces&phénomènes&en&utilisant&aussi&des&outils&mathématiques&appropriés.&&&Ouvrages)de)référence):&A&Physique,&Eugène&Hecht,&DeBoeck&Université&ed.&A&J.&Kane&and&M&Sternheim,&“Physique”,&Dunod&ed.,&Paris&&A&Fundamentals&of&Physics,&D&Halliday,&3&vols,&R.&Resnick,&J.&Walker,&&&&John&Wiley&&&Sons,&Inc.&)&

31

!PHYSIQUE)GENERALE)B):)Répétitoire) 11P085/086)!Semestre) automne/printemps!

!2h/sem,!total!56h!

Jour)&)lieu) vendredi!12h15714h00!/!EPA,!Ecole!de!physique!! !Responsables) Madame! P.! PARUCH! 7! 022.379.3546! 7! patrycja.paruch@unige.ch!!

(automne)!Monsieur!GIANNINI!Enrico!–!022!379!35027!Enrico.Giannini@unige.ch!(printemps)!

!Divers!Les!séances!de!répétitoire!pendant!lesquelles!les!exercices!de!physique!distribués!au!cours!sont!corrigés!sont!fortement!recommandées.!!Contenu)Une!série!d’exercices!est!distribuée!chaque!semaine.!!!!!PHYSIQUE)GENERALE)B)0)Laboratoires)de)physique))) 11P985)Travaux!pratiques!!Semestre)

)

automne! total!36h!

ECTS) 2!!

Jour)

)

mardi!ou!vendredi!14h00!:!18h00!!

Lieu)

)

pavillon!Sciences!I,!Bd!d’Yvoy!16,!3ème!étage!

Mode)d’évaluation! certificat!(voir!ci:dessous)!) !Responsable) Madame!A.!TAMAI!–!022.379.6215!–!anna.tamai@unige.ch!!!!Divers!!Les!Laboratoires!de!physique!B,!qui!se!déroulent!en!parallèle!avec!le!premier!semestre!du!cours!de!Physique!générale!B,!doivent!permettre!aux!étudiants!de!première!année!en!biologie!d'acquérir!une!connaissance!de!base!des!lois!fondamentales!de!la!physique!et!des!méthodes!de!mesure!utilisées!pour!déterminer!une!grandeur!physique.!!Pour!cela,!il! est!essentiel!que!l'étudiant!apprenne!à!utiliser!les!instruments!de!mesure! les!plus!courants!et!à!analyser!les!résultats!avec!des!méthodes!de!calcul!modernes.!!Lors! de! ces! laboratoires,! les! étudiants! travaillent!en! duo.!Chaque!étudiant!doit! réaliser! les!!12)expériences)prévues!au!programme!pour!obtenir!le!certificat.!Aucun!rapport!n'est!à!restituer,!mais!un!résumé!du!travail!effectué!est!présenté!à!la!fin!de!la!séance!à!l’assistant!pour!l’obtention!de!la!signature.!!!!!!

32

33

!

!

Enseignements obligatoires Deuxième année

Bachelor en biologie

Section de biologie

34

35 8/19/19

SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-­Ansermet 30, GenèveBaud-­Bovy : salle informatique, passage Baud-­Bovy, GenèvePA : Pavillon Ansermet, Quai Ernest-­Ansermet 24, Genève

Colonne1 LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15Génétique

Génétique générale 12B017A

Physiologie animale12B014

GénétiqueGénétique générale

12B017A

Biochimie II 12C002A

09:00SCIII, salle 1S081 SCIII, salle 1S081 SCIII, salle 1S081 SCII, salle A300

09:15 Biochimie II 12C002A

Physiologie animale12B014

10:00SCII, salle A150 SCIII, salle 1S081

10:15Systématique et Biodiversité 12B018A

Travaux pratiques Programmation

12X020

Systématique et Biodiversité 12B018A

11:00SCIII, salle 1S081 (séance rattrapage)

Baud-­BovySCIII, salle 1S081

11:15

12:00

12:15Biologie et Société I

12B010 Programmation 12X020

Travaux pratiques Programmation

12X020

13:00SCII, salle A150 SCIII, salle A100 (séance rattrapage)

Baud-­Bovy

13:15

14:00

14:15 Travaux pratiques Travaux pratiquesBiostatistiques II

12B015 Travaux pratiques

15:00Systématique et Biodiversité 12B018A

Physiologie animale12B914

SCIII, salle 1S059 GénétiqueGénétique générale

12B017A

15:15SCIII, salle 5050 SCIII, salle 5050 Travaux pratiques SCIII, salle 5050

16:00 Biostatistiques II12B015

16:15PA, salle 119 au 1er

étage

17:00

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES – 2ème année Semestre d'automne

36

.

37 12.08.19

SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-­Ansermet 30, GenèvePA : Pavillon Ansermet, Quai Ernest-­Ansermet 24, Genève

Horaires LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15 Génétique -­ Génétique moléculaire 12B017P

Développement animal 12B016

Développement animal 12B016

Génétique -­ Génétique moléculaire 12B017P

Bioinformatique 12B012

09:00 SCIII, salle 1S081 SCIII, salle 1S081 SCIII, salle 1S081 8h15 -­ 9h00 exercices et 9h15 -­ 10h00 cours

PA, salle 119 au 1er étage

09:15Biochimie II Partie Méthodes

12C002P

Génétique -­ Génétique moléculaire 12B017P

SCIII, salle 1S081 Travaux pratiques Bioinformatique

10:00 SCII, salle A150 SCIII, salle 1S081PA, salle 119 au 1er

étage

10:15 Systématique et Biodiversité

Développement végétal

Formation documentaire 12B801

11:00 12B018P 12B019

4.3.2020, introduction en présentiel, SCIII salle 1S081 puis formation en ligne

11:15 SCIII, salle 1S081 SCIII, salle 1S059

12:00

12:15

13:00

13:15 Biologie et Société II 12B011

14:00 SCII, salle A150

14:15 Travaux pratiques Biologie végétale 12B013 Travaux pratiques Travaux pratiques

14:15 -­ 17:00

15:00 Systématique et Biodiversité SCIII, salle 1S059

Génétique -­ Génétique moléculaire

Biologie végétale 12B013

15:15 12B018P Travaux pratiques 12B017P SCIII, salle 0059 EN COORDINATION

16:00 SCIII, salle 5050 Biologie végétale SCIII, salle 0035(voir descriptif du

cours)

16:15 12B013Travaux pratiques 14:15 -­ 18:00

17:00 SCIII, salle 0059Génétique -­

Génétique moléculaire 12B017P

17:15 SCIII, salle 0035 EN COORDINATION

18:00 (voir descriptif du cours)

* Les travaux pratiques 12B016 Développement animal auront lieu fin mai, pour plus d'information voir le descriptif du cours.

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES – 2ème année Semestre de printemps

38

.

39

!Biochimie(pour(biologistes( (

!Pour!les!biologistes,!ce!cours!est!composé!de!2!parties!:!•!Le!cours!12C002A(«!Biochimie(II(»,(au!semestre!d’automne,!•!Le!cours!n°!12C002PX!«!Biochimie(II,(partie(Méthodes(»((inclus!dans!le!cours!Biochimie!II!printemps!suivi!par!les!chimistes!et!biochimistes),!au!semestre!de!printemps.!

!Ces!cours!doivent!êtres!suivis!dans!leur!intégralité!pour!obtenir!les!5(ECTS.!La(note(finale(est(la(moyenne(pondérée(de(deux(notes(:(1)(la(note(de(l’examen(de(Biochimie(

II(du(semestre(d’automne((qui(compte(pour(75%),(et(2)(la(note(de(l'examen(de(«!Biochimie(II,(partie(Méthodes(»(au(semestre(de(printemps((qui(compte(pour(25%).!

!!!BIOCHIMIE(II( 12C002A(

!Semestre( automne!! 3h/sem,!total!42h!( !Jours(&(lieux( lundi!!!!!!!9h15J10h!/!Sciences!II,!salle!A150!!

vendredi!8h15J10h!/!Sciences!II,!salle!A300!début!du!cours!vendredi!20!septembre!2019!!

( !Mode(d’évaluation(

!examen!écrit!

Sessions(d'examens(( janvierJfévrier!+!rattrapage!aoûtJseptembre!!

Responsable(

!Monsieur!Aurélien!ROUX!–!022!379!3532!–!aurelien.roux@unige.ch!!!

Enseignant(e)s! Messieurs!A.!ROUX!(pas),!O.!SCHAAD!(cc),!V.!OSSIPOW!(ce),!!Madame!E.!DEMARSY!(cc).!

!Contenu(

J! Enzymologie!J! Catabolisme!et!anabolisme!J! Photosynthèse!!J! Glycolyse!J! Respiration!cellulaire!

!Objectifs(

Ce!cours!introduit!les!principes!de!base!de!l'enzymologie!et!du!métabolisme!!Documentation(et(bibliographie(

J.!Berg,!J.L.!Tymoczko,!L.!Stryer!(2006).!Biochemistry,!6e!edition,!!W.H.!Freeman,!New!York.!ISBN!10J7167J6766X.!Compléments!par!des!chapitres!choisis.!!EYLearning(

https://chamilo.unige.ch/home/courses/12C002/!!!!

40

!BIOCHIMIE(II(–(partie(Méthodes( 12C002PX(!Semestre( printemps!! 1h/sem,!total!14h!( !Jour(&(lieu( lundi!9h15610h!/!Sciences!II,!salle!A150!( !Mode(d’évaluation(!

examen!écrit!

Sessions(d'examens( Juin6juillet!+!rattrapage!août6septembre!!

Responsable(!

Monsieur!A.!ROUX!–!022!379!3532!–!aurelien.roux@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Messieurs!Ch.!BAUER!(cc),!J6M.!MATTER!(mer),! I.!XENARIOS!(pt),!!T.!SOLDATI!(pas)!

!Contenu(6! Imagerie!cérébrale!6! Optogénétique!6! Microscopie!optique!!6! Microscopie!électronique!6! Fractionnement!cellulaire!6! Bioinformatique!

!Objectifs(Ce!cours!est!consacré!à!la!description!des!méthodes!utiles!pour!la!caractérisation!des!concepts!abordés!au!semestre!d'automne.!!EMLearning(https://chamilo.unige.ch/home/courses/12C002/!!

41

!BIOINFORMATIQUE- 12B012-!Semestre- printemps! 1h/sem,!total!14h!- !ECTS- 1.5!(cours!et!TP!intégrés)!

2!(pour!le!master!bi>disciplinaire,!mineure:!biologie)!- !Jour- vendredi!8h15!–!9h!Lieu- Pavillon!Ansermet,!salle!119!au!1er!étage!!- !Mode-d’évaluation-!

examen!écrit!

Sessions-d'examens- juin>juillet!+!rattrapage!août>septembre!!

Responsable-!

Madame!F.!LISACEK!–!022.379.0195!–!frederique.lisacek@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Madame!F.!LISACEK!(mer)!et!intervenants,!N.N!!Contenu-1.! La!place!de!la!bioinformatique!dans!la!biologie!moderne!et!le!rôle!central!de!la!notion!de!

séquence!(1h)!2.! Base!de!données!des!séquences!de!gènes!et!génomes!(2h)!3.! Séquences!protéiques!et!protéomes!(1h)!4.! Comparaison!et!recherche!dans!les!bases!de!données!(1h)!5.! Alignement!des!séquences!(1h)!6.! Comparaison!et!classification!(1h)!7.! Données!d’expression!et!de!transcriptomes!(2h)!8.! Données!métaboliques!(1h)!9.! Annotation!fonctionnelle!des!gènes!et!des!protéines!(2h)!10.!Données!structurales!et!tridimensionnelles!(2h)!

!Objectifs-Familiarisation!avec!les!outils!de!bioinformatique!les!plus!couramment!utilisés!en!biologie!moléculaire!et!leur!utilisation!raisonnée.!!!BIOINFORMATIQUE-–-Travaux-pratiques-intégrés- 12B012-!Semestre- printemps! 1h/sem,!total!14h!- !Jour- vendredi!9h15!–!10h!Lieu- Pavillon!Ansermet,!salle!119!au!1er!étage!!- !Responsable-!

Madame!F.!LISACEK!–!022.379!0195!–!frederique.lisacek@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Madame!F.!LISACEK!(mer)!et!intervenants,!N.N!!

Contenu-•! Navigation!dans!les!serveurs!génériques!:!NCBI,!EBI!•! Rechercher!des!informations!dans!les!bases!de!données!de!gènes!(par!ex!:!GenBank)!•! Utiliser!les!outils!de!visualisation!des!données!de!génomique!(par!ex!:!EnsEMBL)!•! Rechercher!des!informations!dans!UniProtKB!•! Rechercher/identifier!des!séquences!avec!BLAST!c!comprendre!et!interpréter!les!résultats!•! Utiliser!les!outils!d’alignement!de!séquences!(par!ex!:!ClustalW)!•! Utiliser!les!ressources!pour!la!classification!des!protéines!(par!ex!:!Pfam)!•! Rechercher!des!informations!dans!les!bases!de!données!d’expression!(par!ex!:!GEO)!•! Rechercher!des!informations!dans!les!bases!de!données!structurales!(par!ex!:!PDB)!•! Rechercher!des!informations!dans!les!bases!de!données!du!métabolisme!(par!ex!:!KEGG)!•! Utiliser!des!combinaisons!de!logiciels!et!bases!de!données!pour!analyser!des!données!de!

biologie!moléculaire!Objectifs-Compréhension!et!maîtrise!des!outils!de!bioinformatique!les!plus!couramment!utilisés!en!biologie!moléculaire.!!

42

!

BIOLOGIE'ET'SOCIETE'I':'Les!enjeux!actuels!des!sciences!de!la!vie'''''12B010'Cours'à'choix'Bachelor'en'archéologie'préhistorique'«'Module!2.8!»'!Semestre' automne! 2h/sem,!total!28h!

' !

ECTS' 2.5!

' !

Jour' mardi!12h15<13h45!/!début!du!cours!mardi!24!septembre!2019!

' !

Lieu' Sciences!II,!salle!A150!

' !

Mode'd’évaluation'!

examen!écrit!

Sessions'd'examens'' janvier<février!+!rattrapage!août<septembre!!

Responsables'!

!

Messieurs!B.!STRASSER!–!022.379.0712!<!bruno.strasser@unige.ch!&!

K.!KAMPOURAKIS!<!kostas.kampourakis@unige.ch!

Répondant(e)'''

scibiomed@unige.ch!

Bachelor!en!sciences!biomédicales!

Enseignant(e)s! Messieurs!B.!STRASSER!(po),!K.!KAMPOURAKIS!(ce),!et!autres!

intervenants!

!

Divers'Biologie!et!Société!I!(semestre!d’automne)!donne!accès!au!cours!Biologie!et!Société!II!(semestre!

de!printemps).!

!

Le!cours!12B010!Biologie!et!société!I!:!Les!enjeux!actuels!des!sciences!de!la!vie!du!semestre!

d’automne!et!le!cours!12B011!Biologie!et!Société!II:!Analyser!les!controverses!scientifiques!du!

semestre!de!printemps,!doivent!être!suivis!dans!leur!intégralité!pour!obtenir!5!ECTS.!

'La'note'finale'est'la'moyenne'des'deux'notes'des'semestres'd’automne'et'de'printemps.'!

Objectifs'!!Identifier!des!enjeux!de!société!posés!par!la!recherche!en!biologie!!!Argumenter!sur!des!enjeux!éthiques!et!sociaux!de!la!recherche!biomédicale!!!Analyser!des!éléments!clés!des!pratiques!de!recherche!en!biologie!!!

Contenu'La!biologie!soulève!nombre!d’enjeux!sociaux,!éthiques!et!politiques!qui!influencent!profondément!

le! développement!de! la!discipline.!Ce! cours! propose!une! réflexion!critique!et! une!mise! en!

perspective!de!ces!enjeux!pour!mieux!comprendre!leurs!effets!sur!la!biologie!contemporaine!et!le!

métier! de!biologiste.!Nous! aborderons!notamment!les! révolutions!intellectuelles!(darwinisme,!

génétique,!biologie! moléculaire),! les! concepts! clés! (l'individu,! la! population,! l'espèce),! les!

controverses!publiques!(les!races!humaines,!l'eugénisme,!la!biodiversité,!le!génie!génétique),!les!

questions! éthiques! (l'expérimentation!animaled! l'intégrité! scientifique),! et! les! pratiques! des!

biologistes!(la!publication!scientifique,!le!"DIY!Biology").!

!

!

43

BIOLOGIE'ET'SOCIETE'II':'Analyser)les)controverses)scientifiques'''''''''''12B011')Semestre' printemps) 2h/sem,)total)28h)' )ECTS' 2.5)' )Jour' mardi)13h15)>15h00)' )Lieu' Sciences)II,)salle)A150))' )Mode'd’évaluation')

travail)de)recherche)et)présentation)orale)et)écrite)d'une)analyse)de)controverse)publique))

Sessions'd'examens'' juin>juillet)+)rattrapage)août>septembre))

Responsables'))

Messieurs)B.)STRASSER)–)022.379.0712)>)bruno.strasser@unige.ch)&)K.)KAMPOURAKIS)>)kostas.kampourakis@unige.ch)

Répondant(e)'''

)scibiomed@unige.ch)Bachelor)en)sciences)biomédicales))

Enseignants) Messieurs)B.)STRASSER)(po),)K.)KAMPOURAKIS)(ce)))Divers'Biologie)et)Société)I)semestre)d’automne)est)un)prérequis)pour)Biologie)et)Société)II)semestre)de)printemps.))Le)cours)12B010)Biologie)et)Société)I:)Les)enjeux)actuels)des)sciences)de)la)vie)du)semestre)d’automne)et)le)cours)12B011)Biologie)et)Société)II):)Analyser)les)controverses)scientifiques)du)semestre)de)printemps,)doivent)être)suivis)dans)leur)intégralité)pour)obtenir)5)ECTS.)La'note'finale'est'la'moyenne'des'deux'notes'des'semestres'd’automne'et'de'printemps.))Objectifs'Analyser)des)enjeux)de)société)posés)par)la)recherche)en)biologie)!) Identifier)et)évaluer)des)sources)d'informations)sur)des)controverses)!) publiques)!) Mettre)en)relation)les)différents)arguments)avec)les)identités)des)acteurs)!) Produire)une)analyse)argumentée)originale)et)convaincante)pour)expliquer))!) l’enjeu)d’une)controverse)publique)!) Collaborer)en)groupe,)répartir)le)travail)et)arriver)à)une)conclusion)commune)!) Présenter)une)analyse)et)des)arguments)par)oral)et)par)écrit))Contenu'Les)résultats)scientifiques)donnent)souvent)lieu)à)des)controverses)publiques)impliquant)des)acteurs)très)divers.)Les)téléphones)portables)sont>ils)dommageables)pour)le)cerveau?)Les)OGM)présentent>ils)un)risque)pour)la)santé?)Les)analyses)génétiques)disponibles)sur)internet)sont>elles)fiables?)Dans)ce)cours,)nous)aborderons)les)différentes)méthodes)pour)analyser)ces)controverses)scientifiques)et)techniques.)Nous)discuterons)les)sources)de)l’incertitude)dans)ces)controverses)et)leur)place)dans)une)“société)du)risque”.)Les)étudiant(e)s)réaliseront)un)travail)de) recherche)sur)une)controverse,)l’analyseront)dans)un)travail)écrit)et)feront)une)présentation)orale.))

44

BIOLOGIE'VEGETALE' 12B013'Semestre' printemps) 2h/sem,)total)28h)' ) )

ECTS' 3.5)/)3)(pour)le)master)bi8disciplinaire,)mineure):)biologie))' )

Jour'&'lieu' mercredi)14h15816h)/)Sciences)III,)salle)1S059)' )

Mode'd’évaluation) examens)écrits)' )

Sessions'd'examens' juin8juillet)+)rattrapage)août8septembre)Responsables' Madame)T.B.)FITZPATRICK)(po))–)022.379.3016))

Teresa.Fitzpatrick@unige.ch)Monsieur)S.)LOUBÉRY)(cc))–)022.379.6568)–)sylvain.loubery@unige.ch)

Enseignant(e)s) Mesdames)T.B.)FITZPATRICK)(po),)É.)DEMARSY)(cc),))Monsieur)S.)LOUBÉRY)(cc))

Divers)Le)cours)de)biologie)végétale)est)structuré)en)deux)parties)(morphologie)et)anatomie)b)physiologie)et)biochimie).))

Le)cours)doit)être)suivi)avec)les)TPs)dans)leur)intégralité)pour)obtenir)3.5)ECTS.))

La'participation'aux'travaux'pratiques'intégrés'est'obligatoire'pour'valider'l’examen.'Contenu'Partie'morphologie'et'anatomie':)

•) les)parois)des)cellules)végétales)•) les)tissus)végétaux):)types)cellulaires,)organisations)et)fonctions)•) les)organes)végétatifs):)la)racine,)la)tige)et)la)feuille)•) croissance)secondaire):)le)bois)•) adaptations)morphologiques)des)plantes)à)leur)environnement)

)

Partie'physiologie'et'biochimie':)•) transport)de)l’eau)et)des)solutés)dans)les)végétaux)•) les)plastes):)structure,)fonctions)et)génomes)•) la)photosynthèse):)aspects)physiologiques)et)écologiques)•) perception)et)adaptation)aux)conditions)lumineuses)))•) les)hormones)végétales))•) stress)biotiques)et)abiotiques)•) nutrition)végétale)•) métabolismes)secondaires)

Objectifs'Le)but)de)ce)cours)est)de)permettre)aux)étudiant(e)s)d’acquérir)une)vue)d'ensemble)des)concepts)de)morphologie)et)de)physiologie)végétale.)La)première)partie)vise)à)comprendre)la)composition)et)les)caractéristiques)des)différents)tissus)végétaux.)La)seconde)partie)vise)l’assimilation)des)bases)de)la)physiologie)végétale)(notamment)les)principes)du)transport)de)l’eau,)le)métabolisme)des)plantes,)la)nature)et)les)principaux)rôles)des)hormones)végétales)et)la)réponse)des)plantes)aux)stress).)

)

BIOLOGIE'VÉGÉTALE'–'Travaux'pratiques'intégrés' 12B013'Semestre' printemps) 3h/sem,)total)15h)' )

Jour'&'lieu' mardi)15h15818h)et)vendredi)14h15817h)Salle)TP)0059)(Sciences)III)))

Morphologie):)21/04,)24/04,)28/04,)05/05,)08/05)et)12/05/2020)Physiologie):)15/05,)19/05,)22/05,)26/05)et)29/05/2020.))

Ces) séances)ont)lieu) en)coordination)avec) les) travaux)pratiques)de)Génétique)moléculaire)(12B017P))b)se) référer)aux)calendriers)et)aux)groupes)A)et)B)établis)lors)du)premier)semestre.)

) )

Responsables' Partie)morphologie)et)anatomie):)Monsieur)S.)LOUBÉRY)(cc))–)022.379.6568)8)sylvain.loubery@unige.ch)Partie)physiologie)et)biochimie):)Madame)É.)DEMARSY)(cc))–)022.379.3652)–)emilie.demarsy@unige.ch)

Divers)La)participation)à)ces)travaux)pratiques)est)obligatoire)pour)valider)l’examen.)Contenu'Morphologie)et)anatomie):)3)séances)en)rotation)/)Physiologie)et)biochimie):)2)séances)en)rotation)!

45

BIOSTATISTIQUES* II* 12B015*Semestre* automne(

(

2h/sem,(total(28h(

ECTS* 2((cours(et(TP(intégrés)(

(

Jour* mercredi,(cours(14h15=15h00((

(avec(TP(15h30=17h00,(une(semaine(sur(deux)(

début(du(cours(mercredi(18(septembre(2019(

(

Lieu**

Sciences(III(–(salle(1S059((et(TP(–(Pav.(Ansermet(119)(

Mode*d’évaluation*(

contrôle(continu((semestre(d'automne)((

examen(écrit(sur(ordinateur((session(de(rattrapage)((

(

Sessions*d'examens* janvier=février(+(rattrapage(août=septembre((

Responsable* Monsieur(J.M.(NUNES(–(022.379((3683)/(6967),(

jose.deabreununes@unige.ch(

(

Enseignant( Monsieur(J.M.(NUNES((ce)(

(

Divers(L’organisation(du(cours(et(le(processus(d’évaluation(seront(présentés(en(détail(lors(du(premier(

cours.(

(

Contenu(Une(approche(pratique(des(statistiques(où,(à(l'aide(de(R(et(dans(des(contextes(biologiques,(seront(

abordés(:(

+(Types(de(variables,(leurs(distributions,(leurs(représentations(et(leur(simulation(

+(Modèles(linéaires(:(variables(et(termes,(paramètres(et(coefficients,(ajustement(et(son(interprétation,(

coefficient(de(détermination((

+(Tests(d'hypothèses,(hypothèse(nulle,(taille(d'effet,(valeur(de(p(

+(Validation(du(modèle(et(transformations(de(variables(

+(Table(d'analyse(de(variance(

+(Tests(classiques(paramétriques(et(non(paramétriques(

+(Extension(du(modèle(linéaire(à(variables(binaires(((

*Objectifs*+(Identifier(les(principaux(types(de(variables(et(les(représenter(de(façon(appropriée(

+(Décrire(la(variabilité(d'une(variable,(identifier(des(distributions((lois(de(probabilité)(convenables(et(

les(simuler.(

+(Formuler(explicitement(des(modèles(décrivant(des(relations(entre(variables(et(des(hypothèses(de(

recherche(et(hypothèses(nulles(associées(

+(Valider(un(modèle(linéaire(

+(Rapporter(le(résultat(d'un(modèle(linéaire(et(l'interpréter(dans(le(contexte(de(l'analyse(

+(Identifier(et(utiliser(des(modèles(linéaires(équivalents(aux(tests(classiques(

+(Comparer(des(modèles(linéaires(

+(Distinguer(corrélation(et(causalité(

+(Identifier,(formuler,(estimer(et(décrire(un(modèle(logistique(

+(Présenter(et(commenter(une(analyse(statistique*(

BIOSTATISTIQUES* II*–*Travaux*pratiques*intégrés* *12B015*Semestre* automne( 1h/sem,(total(14h(

* (

Jour* mercredi(15h15=17h(

(une(semaine(sur(deux,(à(convenir(lors(du(1er(cours)(

* (

Lieu* Pavillon(Ansermet,(salle(119(au(1er(étage((

( (

Responsable*&*enseignent(e)s*

Monsieur(J.M.(NUNES((ce)((

Monsieur(J.M.(NUNES(et(assistants(

Contenu*Ces(sessions(de(travail(sur(ordinateur(sont(complètement(intégrées(au(cours(de(Biostatistiques(

II((12B015)(et(font(partie(de(l'évaluation.(

46

!DEVELOPPEMENT*ANIMAL* 12B016*!Semestre**

printemps! 3h/sem,!total!42h!

ECTS**

4!

Jours*&*lieu* mardi!8h15!–!10h!&!mercredi!8h15!–!9h!Sciences!III!–!salle!1S081!!

Mode*d’évaluation! examen!écrit!de!3!heures,!aucun!document!autorisé.!!!

Sessions*d'examens* juinCjuillet!+!rattrapage!aoûtCseptembre!!

Responsable* Monsieur!I.!RODRIGUEZ!C!022.379.3101!C!ivan.rodriguez@unige.ch!!

Enseignant*(e)s! Mesdames! W.! CHRISTA! BUZGARIU! (cs! sup),! B.! GALLIOT! (pas),!!M.!GOTTA!(pas),!E.!NAGOSHI!(pa)!Messieurs!J.!DAL!COL!(adj.!sci.),!P.!HERRERA!(pas),!F.!KARCH!(po),!I.!RODRIGUEZ!(po)!

* !Divers!!Programme*2020*des*travaux*pratiques.!!26.05.2020!8h15!C!10h00!cours!théorique!C!prof.!Brigitte!Galliot!à!la!salle!1S081.!!!!Puis!à!la!salle!TP!5050!au!5ème!étage,!!27.05.2020!14h15!C!17h00!TP!C!session!1,!!28.05.2020!10h15!C!13h00!TP!C!session!2,!29.05.2020!10h15!C!13h00!TP!C!session!3.!!!!Contenu!Les!grands!principes!dirigeant!le!développement!d’invertébrés!(mouche,!hydre,…)!et!de!vertébrés!(des!mammifères!en!particulier)!seront!discutés.!Le!cours!couvre! le!développement!précoce,!embryonnaire,!mais!également!celui!de!l’individu!après!la!naissance.!!Un!accent!est!mis!sur!les!similitudes!et!les!différences!entre!processus!développementaux!chez!diverses!espèces.!*Objectifs*En!dehors!de!l'intégration!des!données!brutes!du!cours,!il!est!attendu!que!les!étudiants!acquièrent!la!capacité!de!proposer!des!expériences!pour!répondre!à!des!questions!précises!liées!au!développement.*!!

47

!DEVELOPPEMENT*VEGETAL* 12B019*!Semestre**

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!

Jour* mardi!10h15!–!12h00!!

Lieu* Sciences!III!;!salle!1S059!!

Mode*d’évaluation! examen!écrit!de!4!heures,!aucun!document!autorisé.!!

Sessions*d'examens* juin;juillet!+!rattrapage!août;septembre!!

Responsable* Monsieur!L.!LOPEZ;MOLINA,!;!022.379.3206!;!Luis.LopezMolina@unige.ch!!!

Enseignant(e)s! Messieurs!L.!LOPEZ;MOLINA!(pas),!X.!PERRET!(mer),!* Madame!M.!BARBERON!(pas).!

!Contenu!Le!cours!suivra!le!cycle!de!vie!d’une!plante!:!germination!de!la!graine,!croissance!et!maturation!(racines,!feuilles,!plastes,!tiges!et!fleurs),!gamétogenèse,!fertilisation!et!embryogenèse,!menant!à!la!formation!d’une!nouvelle!graine.!*Objectifs*En!dehors!de!l'intégration!des!données!brutes!du!cours,!il!est!attendu!que!les!étudiants!acquièrent!la!capacité!de!proposer!des!expériences!pour!répondre!à!des!questions!précises!liées!au!développement.*!!!

48

!

FORMATION)DOCUMENTAIRE) 12B801)!

Semestre) printemps! total!5h!

) !

ECTS) certificat!

) !

Dates) introduction!en!présentiel!(salle!1S081)!:!!

mercredi)4)mars)2020)10h15@11h!Formation!en!ligne!:!4!mars!–!5!avril!2020!

!

Lieu) Formation!en!ligne!

) !

Mode)d’évaluation) QCM!en!ligne!:!6!–!8!avril!2020!

rattrapage!:!4!–!6!mai!2020!

!

Pré@requis) Réservé!aux!étudiant·e·s!inscrit·e·s!en!2ème!année!de!bachelor!en!biologie!

! !

Responsables)&)Enseignant(e)s)

BELLIER!A.!022.379.60.44!S!audrey.bellier@unige.ch!

HUBER!V.!022.379.61.15!S!vincent.huber@unige.ch!

!

Divers!La!participation!à!la!séance!d’introduction!est!indispensable!:!toutes!les!informations!pratiques!sur!

le!déroulement!de!la!formation!et!de!l’évaluation!en!ligne!seront!transmises!lors!de!cette!séance.!

)La)réussite)de)l’évaluation)octroie)un)certificat)nécessaire)pour)la)réussite)de)la)2e)année)de)bachelor)en)biologie.)!

Contenu)Cette!formation!en!ligne!permet!aux!étudiant·e·s!d’acquérir!les!compétences!informationnelles!

nécessaires!à!la!poursuite!de!leurs!études!universitaires!en!biologie.!Après!avoir!suivi!cette!

formation,!ils!devront!être!en!mesure!de!:!

-! Préparer!une!recherche!documentaire!

-! Identifier!les!ressources!disponibles!pour!mener!à!bien!leurs!recherches!documentaires!

-! Conduire!des!stratégies!de!recherche!documentaire!!

-! Accéder!à!l’information!

-! Evaluer!la!qualité!et!la!pertinence!de!l’information!

-! Organiser!ses!références!et!sa!documentation!

-! Communiquer!efficacement!

-! Eviter!le!plagiat!

-! Citer!ses!sources!et!créer!sa!bibliographie!

!

Objectif)-! Appliquer!une!méthode!pour!obtenir!des!informations!scientifiques!pertinentes!

-! Citer!des!références!selon!les!normes!et!sans!risque!de!plagiat!

!

!

49

GENETIQUE(–(Génétique(générale( 12B017A(!Semestre( automne! 3h/sem,!total!42h!( ! !ECTS( 11!(cours!+!TP!+!ex.),!voir!sous!«!Divers!»!!( !Jours( lundi!8h15!C9h!!

jeudi!8h15!C10h!/!début!du!cours!jeudi!19!septembre!2019!!

Lieu( Sciences!III,!salle!1S081!!

Mode(d’évaluation! examen!écrit!–!la!note!finale!est!la!moyenne!des!notes!des!examens!de!Génétique!automne!(12B017A)!et!Génétique!printemps!(12B017P)!examen!écrit!pour!les!deux!sessions!!

Sessions(d'examens( janvierCfévrier!+!rattrapage!aoûtCseptembre!!

Responsable( Monsieur!D.!PAULI!–!022!379!67!55!–!daniel.pauli@unige.ch!!

Enseignant! Monsieur!D.!PAULI!(ce).!!Divers!Le!cours!de!génétique!générale!(12B017A)!dispensé!au!semestre!d'automne!est!rattaché!au!cours!de!génétique!moléculaire!(12B017P)!dispensé!au!semestre!de!printemps.!Les(cours(12B017A,(12B017P,(les(exercices(et(les(TP(intégrés(doivent(être(suivis(dans(leur(intégralité(pour(obtenir(les(11(ECTS.!!Contenu(Approfondissement!de!l’analyse!mendélienne!!Relation!génotypeCphénotype.!Interaction!des!gènes!!Liaison!et!cartographie!des!chromosomes!eucaryotes!!Mécanisme!et!fonction!des!crossingCover!chez!les!eucaryotes!!Mutations!!Eléments!transposables!des!eucaryotes!!Effets!épigénétiques!!Détermination!du!sexe.!!Objectifs(Les!étudiants!devront!être!capables!de:!C!définir,!expliquer!et!utiliser!les!concepts!principaux.!C!à!partir!d’un!problème!ou!de!la!description!d’une!situation!expérimentale!simple,!identifier!les!informations!importantes!et!émettre!une!hypothèse!ou!effectuer!les!déductions.!Proposer!un!moyen!de!tester!cette!hypothèse!et!prédire!ce!qu’on!peut!attendre!de!ce!test.!!!GENETIQUE(–(Génétique(générale((Travaux(pratiques(intégrés(

12B017A(

!Semestre( automne! 3h/sem,!total!30h!( !Jour((

jeudi!14h15!C17h!

Lieu((

Sciences!III,!salle!de!TP!n°!5050!

Mode(d’évaluation( intégré!à!l’examen!du!cours!!! !Responsable(&(Enseignant(

Monsieur!D.!PAULI!(ce).!

!Contenu(Génétique!et!embryologie!de!la!mouche!Drosophila!melanogaster.!!!

50

!GENETIQUE(–(Génétique(moléculaire( 12B017P(!Semestre( printemps!

!3h/sem,!total!42h!

ECTS( 11!(cours!+!TP!+!ex.),!voir!sous!«!Divers!»!!!

Jours( lundi!8h15!D9h!mercredi!9h15!D10h!jeudi!9h15!D10h!!

Lieu( Sciences!III,!salle!1S081!!

Mode(d’évaluation! examen!écritD!la!note!finale!est!la!moyenne!des!notes!des!examens!de!Génétique!générale!(12B017A)!et!Génétique!moléculaire!(12B017P)!examen!oral!pour!la!session!de!rattrapage!!

Sessions(d'examens( juin!+!rattrapage!aoûtDseptembre!!

Responsabl(e)s( Monsieur!D.!SHORE!D!022.379.6183!D!david.shore@unige.ch!!Monsieur!F.!STEINER!(TP)!–!022!379!36!85!D!Florian.Steiner@unige.ch!

(Enseignants!

!Messieurs!D.!BELIN!(po),!D.!SHORE!(po),!R.!LOEWITH!(po),!!F.!STEINER!(past)!!

Divers!Le!cours!de!génétique!moléculaire!(12B017P)!dispensé!au!semestre!de!printemps!est!rattaché!au!cours!de!génétique!générale!(12B017A)!dispensé!au!semestre!d'automne.!!Les(cours(12B017A,(12B017P,(les(exercices(et(les(TP(intégrés(doivent(être(suivis(dans(leur(intégralité(pour(obtenir(les(11(ECTS.(!Contenu(Bactéries!et!virus!D!Mutation!D!Structure!fine!du!gène!D!Code!génétique!D!La!réplication!D!Les!plasmides!D!La!conjugaison!D!La!transduction!D!Génomes!(D.!Belin).!!Régulation!transcriptionnelle!chez!la!bactérie!D!Circuit!de!régulation!du!bactériophage!lambda!D!Les!levures!:!le!cycle!de!vie!et!la!génétique!D!La!recombinaison!–!GénieDgénétique!de!la!levure!D!Régulation!transcriptionnelle!des!gènes!GAL!et!du!type!conjuguant!chez!la!levure!!(D.!Shore).!Génétique!de!C.&elegans!–!Interactions!génétiques!–!Epistasie!(F.!Steiner)!!Objectifs(1.! Un! phénotype!observé!peut!être! déterminé!par! des! génotypes!différents!et!par! des!

environnements!cellulaires!différents.!!2.! Qu’estDce!qu’un!gène!?!Comment!le!définir!expérimentalement.!3.! Comprendre!la!nature!moléculaire,!l’origine!et!le!mécanisme!des!mutations.!4.! Une!mutation!peut!provoquer!une!perte!ou!un!gain!de!fonction.!5.! Les!organismes!modèles!sont!utiles!pour!planifier!des!expériences!qui!permettent!de!tester!

leurs!prédictions.!6.! Comprendre!les!mécanismes!qui!règlent!la!réplication!de!l’ADN.!7.! Les!propriétés!de!l’ADN!ne!sont!pas!uniformes!le!long!de!la!séquence.!8.! L’activité!d’une!séquence!d’ADN!est!réglée!par!des!facteurs!diffusibles!qui!agissent!en!trans!

et!par!séquences!régulatrices!qui!agissent!en!cis.!!

9.! Comment!passer!de!la!génétique!moléculaire!à!la!génomique.!!

51

!GENETIQUE(–(Génétique(moléculaire((Travaux(pratiques(intégrés(

12B017P(

!Semestre( printemps!(6!séances)! 4h/sem,!total!24h!( !Jour( Jeudi(ou(Vendredi(14h15(I18h(

(1ère!séance(((27(et(28(février(2020)(2ème!séance((5(et(6(mars(2020)(3ème!séance((12(et(13(mars(2020)(4ème!séance((19(et(20(mars(2020)(5ème!séance((26(et(27(avril(2020)(6ème!séance((2(et(3(avril(2020)(!

( Ces(séances(ont( lieu(en(coordination(avec(les(travaux(pratiques(de(Biologie(Végétale((12B013).(Se(référer(aux(calendriers(et(aux(groupes(A(et(B(établis(lors(du(premier(semestre.((

Lieu( Sciences!III!–!salle!de!TP!n°!0035!!

Mode(d’évaluation( examen!écrit!(avec!examen!écrit!du!cours)!!La(participation(aux(6(séances(de(TP(est(obligatoire.!Afin!d’obtenir!la!signature! nécessaire! pour! se! présenter! à! l’examen! de! Génétique!Moléculaire,!tous!les!rapports!exigés!doivent!être!rédigés!et!1!seul!rapport!insuffisant!est!toléré.!!Questions!intégrées!à!l’examen!écrit!de!Génétique!moléculaire!(12B017P)!!

Répondante(((

Madame!C.!GABUS!V!022!379!65!90!V!caroline.gabus@unige.ch!

Enseignant( Monsieur!F.!STEINER!(past)!!Contenu(Génétique!microbienne!et!eucaryotique.!!GENETIQUE(–(Génétique(moléculaire(–(Exercices( 12B017P(!Semestre( printemps!! 1h/sem,!total!14h!( !Jour( jeudi!8h15!V9h!chaque!semaine!( !Lieu( Sciences!III!–!salle!1S081!

!

!!

52

!PHYSIOLOGIE*ANIMALE* 12B014*!Semestre* automne!

!3h/sem,!total!42h!

ECTS* 4!!

Jours*&*lieux* mardi!8h15!710h!!/!Début!du!cours!mardi!17!septembre!2019!mercredi!9h15!710h!7!Sciences!III!–!salle!1S081!

* !Mode*d’évaluation*!

examen!écrit!–!la!note!finale!comprend!aussi!la!partie!sur!les!travaux!pratiques!!!

Sessions*d'examens***

janvier7février!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable**

Madame!M.!FRIEDEN!–!022.379.51987!maud.frieden@unige.ch!

Enseignante! Madame!M.!FRIEDEN!(mer)!* !Contenu!Etude!des!différents!systèmes!physiologiques!principalement!chez!l’Homme.!Les!systèmes!suivants!seront!étudiés!:!nerveux,!musculaire,!respiratoire,!cardiovasculaire,!digestif,!excréteur,!endocrinien.!Quelques!aspects!de!physiologie!comparée!seront!aussi!abordés.!*Objectifs*L’objectif!principal!de!ce!cours!est!de!donner!aux!étudiants!une!vue!d’ensemble!de!la!physiologie!animale,!essentiellement!humaine.!!Au!terme!de!ce!cours,!les!étudiants!doivent!être!capables!:!!!•! D’expliquer! le! fonctionnement! des! différents! systèmes! physiologiques! (respiration,!

circulation,!digestion,!excrétion…)!à!l’aide!d’un!vocabulaire!adéquat!et!précis.!•! D’expliquer!l’importance!des!mécanismes!du!transport!membranaire!et!de!l’activité!électrique!

des!cellules!dans!tous!les!systèmes!physiologiques.!!•! De!mettre!en!relation!le!fonctionnement!de!différents!organes!qui!participent!à!une!fonction!

commune!(ou!à!une!régulation!commune)!comme!par!exemple!la!régulation!de!la!pression!artérielle!ou!le!maintient!du!pH!sanguin.!!

•! D’expliquer!et!d’illustrer!par!des!exemples!concrets!la!notion!d’homéostasie.!*!!!

53

!PHYSIOLOGIE*ANIMALE*–*TRAVAUX*PRATIQUES********************************12B914*(HistologieBPhysiologie* animale)*!Semestre**

automne! 3h/sem,!total!42h!

ECTS**

1.5!

Jours*&*lieux* mardi!14h15717h!/!Sciences!III!7!salle!de!TP!5050!Début!des!travaux!pratiques,!mardi!24!septembre!2019!

* !Mode*d’évaluation*!

examen!oral!(qui!aura!lieu!à!la!fin!des!TP),!dont!la!note!comptera!dans!la!note!finale!de!l’examen!du!cours!de!physiologie!animale!!

Sessions*d'examens**

janvier7février!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable**

Madame!P.!SOULIE!–!022.379.5215!–!Priscilla.Soulie@unige.ch!

Enseignante! Madame!P.!SOULIE!(CS)!* !Contenu!Histologie!animale!et!physiologie!animale!:!14!séances,!dont!examen!oral.!Les!systèmes!étudiés!en! histologie!sont!:! la! peau!et! les! systèmes! respiratoire,! cardiovasculaire,!digestif,!urinaire,!endocrinien!et!génital.!Les!séances!de!physiologie!portent!sur!le!transport!membranaire!et!le!muscle!squelettique.!*Objectifs*L’objectif!principal!de!ces!TP!est!de!comprendre!l’organisation!et!la!composition!tissulaires!des!différents!organes,!pour!la!partie!«!histologie!»!et!d’illustrer!quelques!fonctions!physiologiques,!pour!la!partie!«!physiologie!».!Au!terme!de!ces!TP!les!étudiants!doivent!être!capables!de!:!!•! Faire&le&diagnostic&des&différents&organes!•! Intégrer&les&structures&histologiques&avec&les&fonctions!physiologiques*!!!

54

!PROGRAMMATION* 12X020*!Semestre**

automne! 1h/sem,!total!14h!

ECTS* 3.5!(cours!et!TP!intégrés)!!

Jour* mercredi!12h15>13h!

Lieu* Sciences!III!–!salle!A100!!

Mode*d’évaluation! examens!écrits!!

Sessions*d'examens* janvier>février!+!rattrapage!août>septembre!!

Responsable**

Monsieur!J.>L.!FALCONE!>!022.379.0204!–!jean>luc.falcone@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!J.>L.!FALCONE!(cs!2!et!ce)!!Divers!Les!évaluations!du!cours!se!déroulent!sur!machine!dans!les!mêmes!conditions!que!les!travaux!pratiques.!Tout!matériel,!papier!ou!informatique,!est!autorisé.!!Contenu*Ce!cours!offre!une!introduction!à!la!programmation,!en!utilisant!le!langage!Python!3.!L’accent!est!porté!sur!la!rédaction!de!petits!programmes!visant!à!automatiser!les!tâches!répétitives!liées!au!traitement!de!données!scientifiques.!!Objectifs*En!suivant!ce!cours,!les!étudiant>e>s!devront!acquérir!les!compétences!suivantes!:!(1)!Ecrire!de!petits!programmes!scientifiques!utiles!en!laboratoire! !(2)!Utiliser!les!structures!de!contrôles!et!les!structures!de!donnée!les!plus!courantes^!(3)!Interagir!et!collaborer!avec!des!informaticiens! !(4)!Apprendre!plus!rapidement!un!second!langage!de!programmation.!!!PROGRAMMATION*–*Travaux*pratiques*intégrés*

12X020*

!Semestre* automne! 3h/sem,!total!42h!* !Jours* jeudi!10h!>11h!(séance!de!rattrapage)!

vendredi!12h>14h!(séance!principale)!!

Lieu* salle!d’informatique!au!passage!Baud>Bovy!! !Responsable* Monsieur!J.>L.!FALCONE!>!022.379.0204!–!jean>luc.falcone@unige.ch!!Divers!Les!travaux!pratiques!ont!lieu!sur!les!ordinateurs!à!disposition!des!étudiant>e>s!et!sont!parfois!précédés!d'une!courte!introduction!orale!de!la!part!des!assistants.!!Les!exercices!consistent!en!une!mise!en!œuvre!des!concepts!vus!en!cours.!La!participation!aux!travaux!pratiques!n'est!pas!soumise!à!un!contrôle,!mais! est! très!vivement! recommandée,!la!programmation!ne!pouvant!réellement!être!acquise!que!par!la!pratique.!!!La!séance!principale!a!lieu!le!vendredi!de!12h00!à!14h00 !la!séance!du!jeudi!est!éventuellement!utilisée!pour!les!personnes!n'ayant!pas!pu!terminer!le!travail!pratique!le!vendredi.!!!

55

SYSTEMATIQUE*ET*BIODIVERSITE* 12B018A/12B018P**Semestre**

automne/printemps- 3h/sem,-total-84h-

ECTS* 11-(12B018A+12B018P+TP)--

Jours* semestre*d’automne*:--les-lundis-10h15A12h-et-vendredis-10h15-A11h--semestre*de*printemps*:--Début-du-cours-lundi-17-février-2020.*Les-lundis-10h15A13h.--

Lieu* Sciences-III,-salle-1S081--

Mode*d’évaluation- examen-écrit-–-la-note-finale-est-la-moyenne-des-notes-des-deux-cours-12B018A-et-12B018P-(parties-animale-et-végétale)--

Sessions*d'examens* janvierAfévrier-+-juinAjuillet-A- rattrapage-aoûtAseptembre--

Responsabl(e)s* Partie*automne*Monsieur-J.-MONTOYA-A-022.379.6786-A-juan.montoya@unige.ch--Partie*printemps*Madame-M.J.-PRICE-022.418.5148-–-michelle.price@unige.ch--

Enseignant(e)s- Partie*automne*Messieurs-J.-PAWLOWSKI-(pas),-J.-MARIAUX-(pt),-J.-MONTOYA-(ce),--L.-MONOD-(ce)-Madame-M.-HOLZMANN-(adj.-scientifique)--Partie*printemps*Madame-M.-PRICE-(pt),-Monsieur-Ph.-CLERC-(cc)-

-Divers-Participation-obligatoire-aux-travaux-pratiques.--Le-cours-de-systématique-et-biodiversité-est-structuré-en-deux-parties-(animale-et-végétale).--Le*cours*doit*être*suivi*dans*son*intégralité*(12B018A*+*12B018P)*avec*les*TP*pour*obtenir*11*ECTS.**Contenu*La-1ère-partie-(semestre*automne*–*12B018A)-comprend-:-Systématique-phylogénétique,-évolution-et-biodiversité-des-protistes-et-des-animaux.-Les-bases-de-leur-classification-phylogénétique,-présentation-des-caractères-diagnostiques-et-interprétation-de-l'évolution-de-certain-caractères.-Présentation-des-principes-expliquant-et-décrivant-la-biodiversité-(radiation,-extinction,-biogéographie,-indices-de-biodiversité).-Modes-d'évolution-et-de-diversification-impliquant-des-interactions-entre-organismes-comme-la-symbiose,-le-parasitisme,-la-coAévolution.-Introduction-à-la-biologie-de-la-conservation.--La-2ème-partie-(semestre*printemps*–*12B018P)-comprend-:-Systématique-phylogénétique,-évolution-et-biodiversité,-des- champignons,-des-bryophytes,-des-fougères,-des-gymnospermes-et-des-plantes-à- fleurs..-La-biodiversité-et- les- tendances-évolutifs-(coevolution,-convergence,…)-sera-expliquée-par-des-thèmes-transversaux.--Objectifs*1:-Connaître-les-fondamentaux-de-la-taxonomie.--2:-Identifier-les-grandes-lignées-phylogénétiques-des-eucaryotes.--3:-Interpréter-la-morphologie-de-ces-organismes.--4:-Interpréter-un-arbre-phylogénétique.--5:-Identifier-les-principaux-embranchements-des-animaux,-champignoms-et-familles-de-plantes.--6:-Expliquer-la-biodiversité-fongique,-végétale-et-animale-et-comprendre-son-organisation-dans-le-temps-et-dans-l'espace-(biogéographie).-

!

56

!

SYSTEMATIQUE*ET*BIODIVERSITE**Travaux*pratiques*intégrés*

12B018A/12B018P*

!

Semestre* automne/printemps! 3h/sem,!total!84h!

* !

Jour* lundi!14h15717h!!!

semestre*d’automne:**Début!des!travaux!pratiques!lundi!16!septembre!2019.**semestre*de*printemps:**Début!des!travaux!pratiques!lundi!17!février!2020.!

!

Lieu* Sciences!III!–!salle!de!TP!5050!au!5ème!étage!

* !

Mode*d’évaluation*

rapport!et!examen!de!détermination.!

! !

Répondant(e)s* Partie*automne*Monsieur!J.!MONTOYA!7!022.379.6786!7!juan.montoya@unige.ch!!

*Partie*printemps*Madame!M.J.!PRICE!022.418.5148!–!michelle.price@unige.ch!

*Enseignant(e)s*

*Semestre*d’automne*Madame!M.!HOLZMANN!(adj.!scientifique)!

Messieurs!J.!PAWLOWSKI!(pas),!J.!MARIAUX!(pt),!J.!MONTOYA!(ce),!!

L.!MONOD!(ce)!

!

Semestre*de*printemps*Madame!M.!PRICE!(pt),!

Monsieur!P.!CLERC!(cc)!

*Objectif!Reconnaître!les!caractères!diagnostiques!des!grands!groupes!de!protistes,!d'animaux!et!des!

plantes.!Savoir!utiliser!des!clés!de!détermination.!Connaître!les!principaux!arbres!(partie!

printemps).!

!

Contenu*Partie*automne*:!Observation!et!étude!des!protistes,!examen!et!dissection!d'animaux!des!principaux!embranchements,!morphologie!comparée,!utilisation!de!clés!de!détermination.!!

*Partie*printemps*:!Etude!de!quelques!exemples!choisis!de!lichens,!de!champignons!non!lichénisés,!de!bryophytes,!de!fougères,!de!gymnospermes!et!d’angiospermes.!Détermination!et!

études!des!organes!végétatifs,!floraux!et!fructifères!des!espèces!de!plantes!à!fleurs!appartenant!

aux!principales!familles!de!notre!flore.!

!

2!excursions!prévues.!

!

COURS A CHOIX

Les étudiants de 2ème année doivent obtenir un minimum de 5 ECTS de cours à choix. Dans le plan d’études, 2 heures par semestre sont consacrées à ces cours à choix mais la répartition des heures peut être adaptée selon les cours choisis.

57

Suggestions de cours à choix pour les étudiants de 2ème année

N° cours

Titre du cours

Semestres

ETCS

14B701 Anthropologie biologique et culturelle – séminaire automne 3

10A001 Astronomie générale

automne 2

13B003 Bioéthique

annuel 6

14B007 Biogéographie

printemps 3

12E050 DDI Développement durable I automne 3

14B008 Flore et végétation : Cartographie, analyse et indicateurs

printemps 2

14B009 Flore et végétation (stage de)

printemps 3

7414D CIVILISATIONS PREHISTORIQUES : Introduction aux civilisations préhistoriques

printemps 3

14B030 Evolution humaine : histoire des représentations…

printemps 3

14B033 Floristique : Chorologie. Histoire et connaissance de la flore

printemps 3

12T408 Géomatique I

automne 3

14B041 Hydrobiologie microbienne : Environnement naturel et construit, aspects écologiques, hygiéniques et sanitaires

printemps 3

14B641 Hydrobiologie microbienne -­ Ecologie microbienne et écologie alpine

printemps 4

14B043 Introduction à la biologie du comportement

annuel 3

14B053 Microbiologie moléculaire des milieux hydriques : Détection et typage des microorganismes

automne 3

14B651 Sciences citoyennes : des amateurs naturalistes aux bio-­hackers

automne 3

14B668 Stage de botanique et Biogéographie Alpines printemps 2

Remarque: Il ne s'agit ici que de quelques suggestions de cours adaptés à votre niveau et plus ou moins compatibles avec votre horaire.

Cependant, vous pouvez choisir librement parmi l'offre de l'ensemble de l'Université (toutes facultés confondues), pour autant que vous obteniez un total de ≥ 5 ECTS.

Pour consulter les informations relatives aux divers enseignements veuillez-­vous référer au Programme des cours sur internet.

58

59

!

!

Enseignements obligatoires Troisième année

Bachelor en biologie

Section de biologie

60

61 12.08.19

SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-­Ansermet 30, GenèveCMU : Centre Médical Universitaire, rue Michel-­Servet 1, GenèveBatelle : Route de Drize 9, Carouge(*) à choix restreint : 2 travaux pratiques obligatoires. Une liste vous êtes proposée.

LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15 Ecologie Biochimie III 13C008A/008P Evolution 13B002 Biochimie III 13C008A/008P

Génétique moléculaire du développement 13B010

09:0013B007A/007P

Cours à choix restreint

Cours obligatoire Cours à choix restreint SCII, salle 1S059 Cours à choix restreint

09:15 Cours à choix restreint automne : SCII, salle A50A SCIII, salle 1S059 Biologie moléculaire de la

cellule 13B001 automne : SCIII, salle 1S059

10:00 SCIII, salle 1S059 printemps SCII, salle A150 Cours obligatoire SCII, salle A150

printemps : SCIII, salle 1S081

10:15 Biologie moléculaire de la cellule 13B001

Microbiologie générale 13B011/14

Biologie humaine13B004/05

Physiologie végétale 13B012A/12P

10:30 Cours obligatoire Cours à choix restreint SCIII, salle 0019Cours à choix restreint

SCII, salle 457 Cours à choix restreint Le système immunitaire

13B013

11:00 SCIII, salle 1S059 automne : SCIII, salle 1S081 Cours à choix restreint

11:15 printemps : SCII, salle A50ACMU, salle D60

12:00 (10:30-­12:30)

12:15 Bioéthique 13B003 SCIII, salle 0019

Modélisation et simulation de phénomènes naturels

13:00 Cours à choix restrient et/ou

14X015 Cours à choix restreint

13:15 Eléments d'endocrinologie moléculaire 14C003 printemps :

14:00Cours à choix restrient

SCIII, salle 1S081Batelle, salle 404-­407

(12:00-­14:00)

14:15 Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques Travaux pratiques

15:00 à choix restreint (*) à choix restreint (*) à choix restreint (*) à choix restreint (*) à choix restreint (*)15:1516:0016:1517:0017:1518:00

18:15Understanding

Biological Complexity and Diversity

19:00 14B024

19:15Cours à choix restreint

SCIII, salle 4059

20:00

Bachelor en BIOLOGIECOURS OBLIGATOIRES ET A CHOIX RESTREINT – 3ème année Semestres d'automne et de printemps

62

.

63

!BIOLOGIE'MOLECULAIRE'DE'LA'CELLULE' 13B001'!Semestre' automne/printemps!

!3h/sem,!total!84h!

ECTS''

9!

Jours'&'lieux' lundi!10h15912h!/!Sciences!III,!salle!1S059!jeudi!09h15910h!/!Sciences!II,!salle!A150!Début!du!cours,!jeudi'19'septembre'2019'!

' !Mode'd’évaluation'!

examen!écrit!4h!!

Sessions'd'examens' juin!+!rattrapage!août9septembre!' !Responsable'!

Monsieur!T.!HALAZONETIS!9!022!379!6112!9!thanos.halazonetis@unige.ch!

' !Enseignant(e)s! Messieurs!T.!HALAZONETIS!(po),!R.!PILLAI!(po),!D.!PICARD!(po),!

J9C.!MARTINOU!(po),!R.!ULM!(po),!X.!PERRET!(mer).!!

Divers!Cours!en!français,!documentation!partiellement!en!anglais!!Contenu'Les! cours!BMC! ont!comme! objectif! l’acquisition!par! les! étudiants!des!bases!moléculaires!du!fonctionnement!de!la!cellule,!allant!de!la!réplication!et!l’expression!génétique,!à!la!traduction!et!la!transduction!de!signal.! Ces! concepts!de! base!seront! par! la! suite! appliqués!à! l’étude!de! la!carcinogenèse,!l’apoptose,!ainsi!que!la!biologie!des!plantes.!Les!thèmes!seront!traités!dans!l’ordre!suivant.!!T.'Halazonetis:'Structure'et'expression'du'génome,'réplication'et'réparation'de'l’ADN'Les!mécanismes!qui!régissent!la!réplication!et!la!transcription!procaryotes!et!eucaryotes,!la!réparation!de!l’ADN!endommagé,!les!points!de!contrôle,!les!conflits!entre!réplication!et!transcription!et!les!implications!cancérigènes!du!stress!réplicatif!et!de!l’endommagement!d’ADN.!'R.'Pillai:'Biologie'des'ARNs'et'Transduction'de'signaux'Les!mécanismes!qui!actionnent!et!régulent!l'expression!des!gènes!suivant!la!transcription!(la!structure!et!l’activité!enzymatique!des!ARN,!l’épissage,!la!maturation!et!les!étapes!de!la!traduction!et!la!dégradation!des!ARN).!Les!principes!de!base!de!la!transduction!de!signal!(les!récepteurs!et!ligands,!les!kinases,!les!seconds!messagers!et!les!effecteurs)!en!santé!et!pathologie.''D.'Picard:'Cycle'cellulaire'et'oncologie'moléculaire'L’épidémiologie!et!les!types!de!cancer,!les!bases!du!cycle!cellulaire!et!ses!points!de!contrôle,!les!oncogènes!et!suppresseurs!de!tumeurs,!l’instabilité!génomique,!l’invasion,!la!métastase,!les!cellules!souches!de!cancer,!l’épigénétique!et!le!cancer,!et!l’adaptation!métabolique.!'J.WC.'Martinou:'Mécanismes'moléculaires'de'l’apoptose'Mécanismes!moléculaires!qui!sous9tendent!la!mort!cellulaire!appelée!apoptose,!qui!implique!un!programme!d'autodestruction!sophistiqué,!bien!conservé!au!cours!de!l’évolution.!'R.'Ulm'/'X.'Perret:'Perception'de'W'et'réponse'à'W'la'lumière'chez'les'plantes'/'Bases'moléculaires'des'interactions'entre'plantes'et'bactéries'Les!mécanismes!moléculaires!permettant!de!distinguer!les!bactéries!«!ennemis!»!!des!«!!alliés!»!et!les!mécanismes!de!perception!de!9!et!réponse!à!9!la!lumière!chez!les!plantes.!!Objectifs'Connaissance!approfondie!des!mécanismes!moléculaires!impliqués!dans!divers!aspects!de!la!biologie!cellulaire!chez!les!animaux!et!les!plantes.!!!

64

!

BIOLOGIE'MOLECULAIRE'DE'LA'CELLULE' 13B901'Travaux'pratiques'à'choix'restreint'de'3ème'année'''Semestre' automne!–!3!semaines!

!

4h/sem,!total!60h!

ECTS''

3!

Jour' 11'novembre'au'29'novembre'2019'!

Lieu' Sciences!III,!salle!0035!de!14h15!–!18h00!

!

PreLrequis' participation!au!cours!de!biologie!moléculaire!de!la!cellule!

' !

Mode'd’évaluation'!

participation!active!et!présentation,!certificat!

Sessions'd'examens' juin!+!rattrapage!aoûtEseptembre!!

Responsables'!

Monsieur!T.!HALAZONETIS!E!022!379!6112!E!thanos.halazonetis@unige.ch!

!

Enseignants! Messieurs!T.!HALAZONETIS!(po),!R.!PILLAI!(po),!D.!PICARD!(po).!

!

Divers!!

Les!inscriptions!des!travaux!pratiques!à!choix!restreint!de!3ème!année!sont!obligatoires.!

!Les!inscriptions!s'effectueront!en'ligne!!!!'

1.' Vous!recevrez!pour!cela!des!informations!complémentaires!par!eEmail!du!secrétariat!de!la!Section!de!biologie!à!la!miLfévrier.!!

!

2.' Inscription!obligatoire!également!sur!«Moodle»!une!fois!la!validation!de!votre!inscription!en!ligne! par! le! secrétariat!de! la! Section!de! biologie,! indépendamment'de' l’inscription'officielle'en'octobre.''Attention!à!bien!s’inscrire!aux!travaux!pratiques!13B901!BMC'et'non'au'cours.!

'Cours!en!français,!documentation!partiellement!en!anglais!

!

Contenu'Analyse!moléculaire!de!différents!systèmes!expérimentaux!choisis!par!les!enseignants!

!

Objectifs'Réalisation!et!interprétation!d’expériences!de!biologie!moléculaire.!

!

!

!

65

!EVOLUTION) 13B002))Semestre) automne/printemps!

!2h/sem,!total!56h!

ECTS))

6!

Jour) mercredi!8h15!810h00!Début!du!cours!mercredi!18!septembre!2019.!!

Lieu) Sciences!III,!salle!1S059!) !Mode)d’évaluation)!

examen!écrit!de!4h!

Sessions)d'examens) juin!+!rattrapage!août8septembre!!

Responsable)!

Madame!A.!SANCHEZ8MAZAS!–!022.379.6984!!!alicia.sanchez8mazas@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Mesdames!S.!EKSTRÖM!(cs),!M.!HOLZMANN!(adj.sc),!E.!POLONI!(cc),!!A.!SANCHEZ8MAZAS!(po),!A.!TZIKA!(ma)!!Messieurs!J.!MONTOYA!(ce),!J.!PAWLOWSKI!(pas),!M.CURRAT!(mer),!M.!MILINKOVITCH!(po).!!

Divers!Cours!en!français,!documentation!partiellement!en!anglais!!Contenu)Le!cours!est!structuré!selon!le!plan!suivant:!!

•! Introduction!générale!!(A.Sanchez8Mazas!&!M.!Milinkovitch)!•! Les!racines!cosmiques!de!la!vie!(S.!Ekström)!•! Paléontologie!et! évolution! des! organismes! et! des! environnements! (J.! Pawlowski,!!

M.!Holzmann)!•! Evolution!et!développement!(A.!Tzika)!•! Modèles! et! mécanismes! de! l'évolution! génétique!des!espèces! et! des! populations!!

(A.!Sanchez8Mazas!&!M.!Currat)!•! Modèles!et!mécanismes!de!l’évolution!moléculaire,!évolution!des!génomes!(E.!Poloni)!•! Reconstruction!phylogénétique!(J.!Montoya)!

!Des!séances!d’exercices!et!des!discussions!sur!des!articles!d’actualité!en!lien!avec!les!thèmes!abordés!sont!intégrées!au!cours.!!Objectifs)Acquérir,! d’une! part,! les! connaissances!essentielles!sur! l'évolution!des! êtres! vivants! et! ses!mécanismes!et,!d’autre!part,!les!compétences!méthodologiques!nécessaires!à!la!compréhension,!à!l'analyse!des!données!et!à!la!modélisation!des!processus!évolutifs.!Les!diverses!parties!du!cours!aborderont!l’ensemble!des!phénomènes!naturels!liés!à!l'origine!de!la!vie!et!à!l'évolution!des!organismes!vivants,!et!permettront!à!l’étudiant8e!de!comprendre!de!manière!approfondie!les!multiples!mécanismes!gouvernant!l’évolution!des!espèces,!des!populations!au!sein!des!espèces!et!des!patrimoines!génétiques.!Dans!ce!but,!l'étudiant8e!apprendra!aussi!à!maîtriser!les!principales!méthodes!permettant!d'analyser!ces!mécanismes!et,!le!cas!échéant,!de!les!appliquer!dans!divers!domaines!fondamentaux!de!la!biologie.!!!

66

67

LISTE DES COURS ET TRAVAUX PRATIQUES

A CHOIX RESTREINT DE 3ème ANNEE DU BACHELOR EN BIOLOGIE

N° cours Titre du cours à choix restreint Semestres ECTS 13C008A/08P Biochimie III annuel 6 13B003 Bioéthique annuel 6 13B004/05 Biologie humaine I & II annuel 6 13B007A/07P Ecologie I & II annuel 6 14C003 Eléments d’endocrinologie moléculaire annuel 6 13B010 Génétique moléculaire du développement annuel 6 13B011/14 Microbiologie générale I & II annuel 6 14X015 Modélisation et simulation de phénomènes

naturels printemps 6

13B012A/12P Physiologie végétale annuel 6 13B013 Système immunitaire (le) annuel 6 14B024 Understanding Biological Complexity and

Diversity printemps 3

Note : une fois les quatre cours à choix restreint choisis, d’autres cours à choix restreint peuvent aussi être pris en choix libre. N° TP Titre des travaux pratiques à choix restreint Semestres ECTS 13C908X Biochimie III automne 3 13B901 Biologie moléculaire de la cellule automne 3 13B909 Génétique moléculaire du développement automne 3 13B911 Microbiologie générale printemps 3 13B907 Ecologie printemps 3 13B906 Physiologie végétale printemps 3 Les inscriptions aux travaux pratiques à choix restreint de 3ème année s'effectueront en ligne.

Vous recevrez des informations complémentaires par e-­mails à la mi-­février.

68

12.08.19

DATES DES TRAVAUX PRATIQUES

A CHOIX RESTREINT DE 3ème ANNEE

(après-­midi)

Travaux pratiques

Dates

lieu

Responsable

13C908X Biochimie III

du 30 septembre au 18 octobre 2019

Sciences II, 1

er étage, labo 104A

M. Thierry Soldati

thierry.soldati@

unige.ch

13B901 Biologie moléculaire de la

cellule

11 novembre au 29 novembre 2019

Sciences III, salle 0035

M. Thanos Halazonetis

Thanos.halazonetis@unige.ch

13B909 Génétique moléculaire

du développement

du 2 décembre au 20 décembre 2019

Sciences III, salle 0059

M. François Karch

francois.karch@

unige.ch

13B911 Microbiologie générale

du 17 février au 06 mars 2020

Sciences III, salle 0016

M. Karl Perron

karl.perron@

unige.ch

13B907 Ecologie

du 9 mars au 27 mars 2020

SCIII 0059

Atelier informatique, Batelle

bâtiment D, 2

ème étage.

M. Bastiaan Ibelings

bastiaan.ibelings@unige.ch

13B906 Physiologie végétale

du 20 avril au 8 mai 2020

Sciences III laboratoires

Mme Emilie Demarsy

emilie.demarsy@unige.ch

Veuillez, vous renseigner auprès des responsables au début des travaux pratiques susmentionnés pour obtenir des renseignements plus précis.

69

70

71

MONOGRAPHIE DU BACHELOR EN BIOLOGIE

La monographie du bachelor est un travail personnel écrit devant être effectué pendant la 3ème année (5 ECTS). Voir le règlement détaillé au verso. Le formulaire d’inscription de la monographie est à télécharger au format A4 et recto-­verso sur le site internet de la Section de biologie.

Il est à retourner au secrétariat des étudiants de la Section de biologie :

Sciences III -­ 2ème étage -­ bureau 2004A

au plus tard fin novembre de la troisième année du bachelor.

72

REGLEMENT DE LA MONOGRAPHIE DU

BACCALAUREAT UNIVERSITAIRE (BACHELOR) EN BIOLOGIE Direction de la monographie :

La monographie du baccalauréat universitaire en biologie se fait sous la direction d’un professeur, chargé de cours, maître d’enseignement et de recherche, chargé d’enseignement, biologiste, collaborateur scientifique ou maître-­assistant de la Section de biologie. C’est l’étudiant lui-­même qui prend contact avec des enseignants pour trouver un directeur de monographie selon son intérêt pour une discipline. Ces contacts se font dans le courant de la 2ème année ou au début de la 3ème année. L’inscription définitive se fait au plus tard fin novembre de la 3ème année. Le directeur supervisant le travail peut aussi être choisi hors-­Section, mais l'étudiant doit alors trouver un professeur responsable au sein de la Section. La direction de monographie inclut la validation ou la proposition d’un sujet (voir ci-­dessous), une discussion préalable, la suggestion de lectures (chapitres de livres, articles de revue), la supervision régulière du travail si nécessaire, des propositions de modifications et de corrections, et l’évaluation. L’évaluation (note sur 6) doit être validée par une attestation portant deux signatures (celles du directeur et d’un deuxième juré, titulaire au minimum d'un master, choisi par le directeur), et communiquée à la Section par le directeur de monographie. La note sera enregistrée et les 5 ECTS validés dès que l’étudiant aura envoyé une copie électronique (pdf) de son travail à l'adresse e-­mail secretariat-­biologie@unige.ch et remis le certificat de la formation documentaire (voir ci-­dessous) au secrétariat de la Section. Le dernier délai de remise de la monographie est le jour précédant la rentrée d’automne de manière à assurer sa validation pour l'année académique précédente.

Co-­requis (formation documentaire) : L’étudiant doit s’inscrire aux séances de « Formation documentaire » obligatoires à la Bibliothèque Ernst et Lucie Schmidheiny (BELS, Sciences II) qui ont lieu chaque année entre les mois d’octobre et de décembre. Cette formation est validée par un certificat que les étudiants devront obligatoirement joindre à leur travail de monographie au moment de rendre cette dernière au secrétariat de la Section de biologie.

Objectif et contenu de la monographie : La monographie du baccalauréat universitaire en biologie est un travail personnel basé sur une recherche bibliographique, sans travail pratique d'analyse ou d'expérimentation. Elle doit être présentée sous forme d'un mémoire écrit d’environ 4000 (minimum) à 6000 (maximum) mots (soit environ 12 à 20 pages) sans compter la page de titre, le résumé, la table des matières, les illustrations et la bibliographie. Elle représente un effort de 5 crédits ECTS, soit environ 150 heures de travail personnel, et peut être réalisée dès la 2ème année du baccalauréat universitaire en biologie.

Présentation de la monographie :

La monographie se fait sur un sujet choisi en concertation avec le directeur de monographie (et validé, le cas échéant, par le répondant). Elle introduit le sujet, fait un état documenté de la recherche de manière synthétique et se termine sur une conclusion dans laquelle seront également soulevées les questions non encore résolues dans le domaine considéré. Dans tous les cas, les citations bibliographiques seront intégrées au texte et les références complètes présentées dans une bibliographie soignée tant dans son actualité que dans sa présentation.

Critères d'évaluation de la monographie :

Indépendance dans la recherche bibliographique et dans le tri des sources consultées ;; compréhension du sujet ;; pertinence et actualité des thématiques présentées ;; qualité de la rédaction et de la présentation (format et contenu) ;; qualité des illustrations et de leur légende ;; qualité de la bibliographie (actualité des sources mais aussi références aux sources primaires, et présentation complète et correcte des références) ;; présentation des questions non encore résolues et des perspectives possibles.

Section de biologie

!

!

Règlement et plan d’études Grilles horaires, cours

• Grilles horaires du bachelor en archéologie préhistorique • Liste et descriptifs des enseignements 1er année obligatoires

Partie III Le bachelor en archéologie

préhistorique

73

Baccalauréat universitaire (bachelor) en archéologie préhistorique

CONDITIONS GÉNÉRALES Art. A 9 – Baccalauréat universitaire en archéologie préhistorique 1. La Faculté décerne un baccalauréat universitaire en archéologie préhistorique, premier cursus de la formation de base. 2. L’obtention du baccalauréat universitaire en archéologie préhistorique permet l’accès au deuxième cursus de la

formation de base : les études de maîtrise universitaire en archéologie préhistorique, les études de maîtrise universitaire bi-disciplinaire, ainsi que les études de maîtrise universitaire en sciences de l’environnement.

3. L’ancrage administratif de ce bachelor est en section de biologie. Cependant, la responsabilité académique et scientifique

pour le programme de ce cursus d'études de bachelor est confiée à un Comité de bachelor dont les membres sont nommés par le décanat. Il comprend 2 délégués du décanat et les 2 responsables des enseignements en archéologie préhistorique en section respectivement de biologie et des sciences de la Terre et de l'environnement. Les délégués du décanat sont nommés pour une période de 2 ans. Leur mandat est renouvelable. Les collèges des professeurs et les conseils de section des sections de biologie et des sciences de la Terre et de l'environnement sont consultés pour toute modification du règlement d’études et du plan d'études.

4. Le Comité du bachelor préavise les équivalences pour le doyen dans l’esprit de l’Art. 4 du Règlement général de la

Faculté. Si nécessaire, il peut consulter les commissions d'équivalence des sections concernées. ADMISSION Art. A 9 bis 1. L’admission aux études du baccalauréat universitaire en archéologie préhistorique est régie par l’Art. 2 du Règlement

général de la Faculté. 2. Les admissions conditionnelles sont régies par l’Art. 3 du Règlement général de la Faculté. 3. Les équivalences sont régies par l’Art. 4 du Règlement général de la Faculté. DURÉE ET PROGRAMME D’ÉTUDES Art. A 9 ter – Durée des études, congés et crédits ECTS 1. La durée réglementaire et le nombre de crédits obtenus pour le baccalauréat universitaire en archéologie préhistorique

sont précisés dans l’Art. 5 du Règlement général de la Faculté, soit une durée réglementaire moyenne de six semestres et l’obtention de 180 crédits ECTS.

2. La durée maximale pour l’obtention du baccalauréat universitaire en archéologie préhistorique est précisée dans l’Art. 19

du Règlement général de la Faculté. 3. Les congés sont régis par l’Art. 6 du Règlement général de la Faculté. Art. A 9 quater – Examens de la première année Les examens de la première année portent sur les branches suivantes. Ils correspondent à l’acquisition de 60 crédits ECTS :

- Module 1.1. : sciences de base - Module 1.2. : introduction à la préhistoire

Les enseignements des Modules 1.1. et 1.2. sont définis dans le plan d’études préavisé par le collège des professeurs de la Faculté et adopté par son conseil participatif. Art. A 9 quinquies – Examens de la deuxième et de la troisième années Les examens de la deuxième et de la troisième années portent sur les branches suivantes. Ils correspondent, pour chacune des années, à l’acquisition de 60 crédits ECTS :

- Module 2.1. : sciences de la vie - Module 2.2. : sciences de la Terre - Module 2.3. : méthodes de la recherche - Module 2.4.a : archéologie préhistorique – partie A - Module 2.4.b : archéologie préhistorique – partie B - Module 2.5. : anthropologie biologique et culturelle - Module 2.6. : ostéologie humaine et animale - Module 2.7. : monographie - Module 2.8. : cours à choix restreint

Les Modules 2.1. à 2.7. sont définis dans le plan d’études. Les cours à choix restreint du Module 2.8 sont listés dans le plan d’études.

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CONTRÔLE DES CONNAISSANCES Art. A 9 sexies – Réussite et admission dans l’année supérieure 1. La réussite de la première année donne droit à 60 crédits ECTS selon les modalités de l’Art. 9, al. 2 du Règlement

général de la Faculté. Les crédits ECTS attachés à chaque enseignement sont spécifiés dans le plan d’études. 2. L’étudiant doit avoir réussi la première année pour pouvoir poursuivre ses études en deuxième année. 3. La réussite des examens de la deuxième et de la troisième années donne droit à 60 crédits ECTS par année, selon les

modalités de l’Art. 9, al. 2 du Règlement général de la Faculté. Les crédits ECTS attachés à chaque enseignement sont spécifiés dans le plan d’études.

Art. A 9 septies – Appréciation des examens 1. Les examens sont régis par les articles 8 et suivants du Règlement général de la Faculté. 2. Un cours fait l’objet d’une épreuve orale ou écrite. La forme de l’examen est précisée par l’enseignant au début du

cours. Un contrôle continu peut être prévu par le responsable d’une unité d’enseignement. Dans ce cas, le contrôle continu sera annoncé aux étudiants au début de l’enseignement. Pour les travaux pratiques, les travaux de terrain, les stages et les séminaires, un certificat est attribué conformément à l’Art. 16 du Règlement général de la Faculté.

2. Les jurys d’examens sont composés, au moins, d’un membre du corps professoral ou d’un MER, d’un chargé de cours

ou d’un chargé d’enseignement et d’un co-examinateur (qui doit être un universitaire au moins d’un niveau master). 3. Les examens de la première année sont réussis lorsque :

- la moyenne des branches du Module 1.1. « sciences de base » est égale ou supérieure à 4. Aucune note inférieure à 3 n’est acceptée.

- la note de chacune des branches du Module 1.2. « introduction à la préhistoire » est égale ou supérieure à 4. - les certificats sanctionnant la réussite des travaux pratiques, des travaux de terrain et des séminaires ont été

obtenus. 4. Les examens de deuxième année et de troisième année sont réussis lorsque :

- La moyenne des branches des Modules 2.1. « sciences de la vie » et 2.2. « sciences de la Terre » est égale ou supérieure à 4. Aucune note inférieure à 3 n’est acceptée.

- La note de chacune des branches du Module 2.3. « méthodes de la recherche », du Module 2.4.a« archéologie préhistorique – partie A», du Module 2.4.b« archéologie préhistorique – partie B», du Module 2.5. « anthropologie biologique et culturelle », du Module 2.6. « ostéologie humaine et animale », du Module 2.7. « monographie », et du Module 2.8. « cours à choix restreint », est égale ou supérieure à 4.

- les certificats sanctionnant la réussite des travaux pratiques, des travaux de terrain et des séminaires ont été obtenus.

Art. A 9 octies – Fraude et plagiat Toute fraude, plagiat, tentative de fraude ou de plagiat est régi par l’Art. 18 du Règlement général de la Faculté. DISPOSITIONS FINALES Art. A 9 nonies – Procédures en cas d’échec Est éliminé du titre, l’étudiant qui se trouve dans une des situations précisées dans l’Art. 19 du Règlement général de la Faculté. Art. A 9 decies – Voies de recours Toute décision rendue en application du présent règlement peut faire l’objet d’une opposition, selon les procédures prévues dans le Règlement général de la Faculté. Art. A 9 undecies – Entrée en vigueur et champ d’application

1. Le présent règlement d’études entre en vigueur avec effet au 16 septembre 2019. 2. Il s’applique à tous les étudiants dès son entrée en vigueur.

75

PLAN D’ETUDES Abréviations : CR : cours EX : exercices TP : Travaux pratiques Première année Module 1.1. « Sciences de base »

Automne Heures par semaine

Printemps Heures par semaine

ECTS

Chimie générale (CR) 4 5 Physique générale B (CR) 4 4 Physique générale B (CR) 4 4 Biostatistique I (CR) 2 3 Biostatistique I (EX) 2 1 Biologie fondamentale I (CR) 5 9.5 Biologie fondamentale I (TP) 4 Géologie générale I (CR) 4 5 Géologie générale I (TP) 2 2 Géologie générale II (CR) 2 2.5 Géologie générale II (TP) 2 2 TOTAL 22 12 38

Module 1.2 : « Introduction à la préhistoire »

Automne Heures par semaine

Printemps Heures par semaine

ECTS

Préhistoire générale CR 2 2 6 Préhistoire générale TP 3 3 3 Introduction à l’archéologie africaine CR

4 6

Introduction à l’archéologie africaine SE

2 3

Civilisations préhistoriques (CR-SE)

3 4

TOTAL 11 8 22

76

Deuxième année Module 2.1 : Sciences de la vie

Nom cours Automne Heures par semaine

Printemps Heures par semaine

ECTS

Biologie fondamentale III (CR+TP) 6 8 Biologie humaine (CR) 2 3 TOTAL 0 8 11

Module 2.2 : Sciences de la Terre

Nom cours Automne Heures par semaine

Printemps Heures par semaine

ECTS

Principes de sédimentologie (TP) 3 2.5 Géomorphologie (CR+TP) 4 2.5 Géomorphologie (stage terrain) 1 (2 jours) 1 Paléoclimatologie du Quaternaire (CR) 1 1 Méthodes stratigraphiques (CR) 3 2.5 Levers stratigraphiques (stage terrain) 1 jour 0.5 TOTAL 3 8 10

Module 2.3 : Méthodes de la recherche

Nom cours Automne Heures par semaine

Printemps Heures par semaine

ECTS

Méthodes de la recherche I (CR) 2 2 6 Méthodes de la recherche I (TP) 4 4 6 Méthodes de la recherche II (CR) 4 6 Introduction à l’analyse des archéomatériaux (CR)

2 3

Technologie préhistorique (CR) 2 3 Technologie préhistorique (TP+SE) 3 3 TOTAL 17 6 27

Module 2.4.a : Archéologie préhistorique – partie A

Nom cours Automne Heures par semaine

Printemps Heures par semaine

ECTS

Introduction au Néolithique de l’Europe (CR)

2 3

Introduction aux Ages des métaux de l’Europe (CR)

2 3

Introduction au Paléolithique africain (CR+SE)

2 3

Introduction au Néolithique et âge des métaux africains (CR+SE)

2 3

TOTAL 10 12 12

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Troisième année Module 2.4.b : Archéologie préhistorique – partie B Nom cours Automne

Heures par semaine

Printemps Heures par semaine

ECTS

Séminaire du Cercle genevois d’archéologie 3 Préhistoire régionale (CR) 2 2 6 Préhistoire régionale (SE) 2 3 Préhistoire régionale (TP) 4 4 6 Fouilles archéologiques (stage) 6 TOTAL 10 12 24 Module 2.5 : Anthropologie biologique et culturelle Nom cours Automne

Heures par semaine

Printemps Heures par semaine

ECTS

Anthropologie biologique et culturelle (SE) 2 3 Evolution humaine : histoire des représentations scientifiques… (CR)

2 3

Ethnologie (CR) 2 3 TOTAL 4 2 9 Module 2.6 : Ostéologie humaine et animale Nom cours Automne

Heures par semaine

Printemps Heures par semaine

ECTS

Paléoanthropologie (TP) 4 4 6 Archéozoologie - La Chasse (CR) 2 3 Archéozoologie – ostéologie comparée (TP) 2 1.5 TOTAL 4 8 10.5 Module 2.7 : Monographie Monographie 6 ECTS Module 2.8 : Cours à choix (10.5 ECTS, dont 3 libres possibles) Nom cours ECTS Fouilles archéologiques (sur un autre site que le stage obligatoire)

6

Introduction au dessin archéologique (TP) 3 Stage pratique en archéologie 6 Ethnologie (SE) 3 Evolution (CR) 6 Biologie humaine A 3 Méthodologie de la recherche en biologie (SE) 3 Floristique (CR) 3 Systématique et biodiversité (CR+TP) 11 Biologie et société I (CR) 3 Biologie et société II (CR) 3 Biostatistiques II (CR+TP) 2 Statistiques appliquées (TP bloc) 1 Programmation (CR+TP) 3.5 Géomatique (CR) 2.5 Paléobiologie et paléontologie (CR) 5 Paléobiologie et paléontologie (TP) 2 Paléobiologie et paléontologie (stage) 1 Limnogéologie (CR) 2.5 Géobotanique (CR+TP) 1 Géologie régionale (CR) 2 Chimie et biochimie de l’environnement I 2 Cours à choix libre 3

78

79

SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-­Ansermet 30, GenèvePSI : Pavillon Sciences I, Bd d'Yvoy 16 au 3ème étage, GenèveEPA : Ecole de physique, Quai Ernest-­Ansermet 24, Genève Uni Carl Vogt : Boulevard Carl-­Vogt 66, Genève

Horaires LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15 Chimie Générale 11C101

Biologie Fondamentale I 11B001

09:00SCII, salle A300 SCII, salle A150

09:15

10:00

10:15Biologie Fondamentale I

11B001 Physique générale B

11P085 Chimie Générale

11C101 Introduction à l'archéologie

Africiane Physique générale B

11P085

11:00 SCII, salle A150EPA SCII, salle A300 14B002

SCII, salle 449EPA

11:15

12:00

12:15

13:00

13:15 Biologie Fondamentale I 11C003 Biochimie I

Biologie Fondamentale I 11B001

14:00 (méthodes)

SCII, salle A300Répétitoire

SCII, salle A100

14:15 Travaux pratiques Travaux pratiques Planète Terre I

15:00 Préhistoire générale 11T909

Biologie Fondamentale I11B001

* Géologie générale I 11T003

15:15Uni Carl Vogt

SCIII, salle 5050 Introduction à l'archéologie Africiane

Sciences de la Terre,

16:00 14B702 SCII, salle 449

13 ru des Maraîchers, salle 001

16:15

17:00 Préhistoire générale 11T009

17:15 Uni Carl Vogt

18:00

19:00

* 11T003 Planète Terre I conflit d'horaire les mardis 10h15-­12h avec la Physique générale B 11P085 !* 11T903 Planète Terre I A FIXER

* 11T003 Géologie générale I dans le plan d'études * 11T903 Géologie générale I dasn le plan d'études

Bachelor en archéologie préhistorique COURS OBLIGATOIRES – 1ère année

Semestre d'automne

Module 1.1 "Sciences de base" / Module 1.2 "Introducion à la préhistoire"

80

.

.

81

SC II & III : Sciences II & III, Quai Ernest-­Ansermet 30, GenèvePSI : Pavillon Sciences I, Bd d'Yvoy 16 au 3ème étage, GenèveEPA : Ecole de physique, Quai Ernest-­Ansermet 24, Genève PA : Pavillon Ansermet, Quai Ernest-­Ansermet 24, Genève Uni Carl Vogt : Boulevard Carl-­Vogt 66, Genève

Horaires LUNDI MARDI MERCREDI JEUDI VENDREDI

08:15Biostatistiques I : Applications 11M904

09:00 PA, salle 119 au 1er étage & SCII, salle A100

09:15

10:00

10:15 Physique générale B 11P086

Biostastiques I 11M004

Physique générale B 11P086

11:00 EPA SCII, salle A300 EPA

11:15

12:00

12:15

13:00

13:15 Biotatistiques I répétitoire 11B800

14:00 SCII, salle A100

14:15 Travaux pratiques

15:00 Préhistoire générale 11T909

15:15 Uni Carl Vogt

16:00

16:15

17:00 Préhistoire générale 11T009

17:15 Uni Carl Vogt

18:00

19:00

* 11T005 Planète Terre II, 2h ! A FIXER * 11T905 Planète Terre II TP 2h ! A FIXER 14T003 Civilisations préhistoriques ! A FIXER

* 11T005 Géologie générale II dans le plan d'études * 11T905 Géologie générale I dans le plan d'études

Bachelor en archéologie préhistorique COURS OBLIGATOIRES – 1ère année

Semestre de printemps

Module 1.1 "Sciences de base" / Module 1.2 "Introducion à la préhistoire"

82

.

83

!

!

Enseignements obligatoires Première année

• Module 1.1 « Sciences de base • Module 1.2 « Introduction à la préhistoire »

Bachelor en archéologie préhistorique

84

85

BIOLOGIE'FONDAMENTALE'I' 11B001'Cours&obligatoire&bachelor&en&archéologie&préhistorique'«'Module'1.1'Sciences'de'base'»''

Semestre'

automne& 5h/sem,&total&65h

ECTS'

9.5&(cours&&&TP&intégrés)

Jours'&'lieux lundi&10h15C12h&Sciences&II,&salle&A150&&lundi&13h15&–&14h&(11C003X1&Biochimie'I&–&méthodes*)'&Sciences&II,&salle&A300&&mardi&13h15&–&14h&Répétitoire&(4&séances&min.)&&Sciences&II,&salle&A100&&&vendredi&8h15C10h00&&Sciences&II,&salle&A150&

Mode'd’évaluation Questionnaire&à&choix&multiples&(QCM)&

Sessions'd'examens janvierCfévrier&+&rattrapage&aoûtCseptembre&

Responsable Monsieur&J.&C.&MARTINOU,&022.379.6443,&jeanCclaude.martinou@unige.ch&

Enseignant(e)s Mesdames&S.&CITI&(pas),&F.&STUTZ&(po)&Messieurs&J.CC.&MARTINOU&(po),&D.&PICARD&(po).&Pour&les&enseignants&du&cours&11C003X1&Biochimie'I,&voir&dans&le&programme&des&cours&sur&internet.

Divers&*&le&cours&11C003X1&Biochimie'I&partie&méthodes&fait&partie&intégrante&du&cours&de&Biologie&Fondamentale&I&&Contenu'Origines&de&la&vie&a&cellule&unité&vivante&a&métabolisme&énergétique&(chloroplastes&et&mitochondries).&Biologie&moléculaire&:&ADN,&réplication,&transcription,&traduction.&Cellule& animale& :& noyau,&cytoplasme,&membranes,&compartiments,& transport& intracellulaire&et&sécrétion&des&protéines.&Organisation&des&tissus&et&cytosquelette&a&jonctions&cellulaires.&Cycle&cellulaire&a&mitose,&méiose&a&transmission&de&signal.&&Objectifs'1.&Distinguer&entre&“vivant”&et&"nonCvivant”a&décrire&les&différences&entre&l’organisation&(génomes&et&autres)&des&virus,&bactéries&et&eucaryotes.&&2.&Définir&les& termes&scientifiques&de&base&(ex.&gène,&protéine,&enzyme,&hormone,&etc).&Acquérir&les&définitions&du&vocabulaire&scientifique&abordé&dans&le&cours&et&listé&dans&un&glossaire&(ex:&p53,&actine,&DNA&polymérase,&oxytocine,&etc).&&&3.&Utiliser&et&décrire&les&concepts&et&processus&fondamentaux&de&biologie&moléculaire&et&cellulaire&(ex:&transcription,&traduction,&cycle&cellulaire,&mitose,&méiose,&métabolisme&énergétique,&sécrétion,&trafic,&endocytose,&exocytose,&motilité,&adhésion,&barrière,&signalisation,&etc).&&4.&Décrire& la&composition,&l’organisation,&les&propriétés,&la&fonction&et&les&relations&fonctionnelles&dynamiques& des& structures& cellulaires& (ex.& noyau,& chromosomes,& chromatine,& ADN,& ARN,&membrane&plasmique,& compartiments&membranaires,&mitochondries,&cytosquelette,& jonctions,&ribosomes,&etc).&&5.&Comprendre&et&expliquer&les&méthodes&de&purification&et&d’analyse&des&acides&nucléiques&(ADN,&ARN)&et&des&protéines.&

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!BIOLOGIE'FONDAMENTALE'I'.'Travaux'pratiques'intégrés' 11B001'Travaux!pratiques!obligatoires!bachelor!en!archéologie!préhistorique'«'Module'1.1'Sciences'de'base'»'Semestre' automne!! 4h/sem,!total!48h!' !Jours'&'Lieux' mercredi!14h15!–!18h00!

Sciences!III,!salle!TP!5050!!!

Mode'd’évaluation! Questions!intégrées!au!questionnaire!à!choix!multiples!(QCM)!du!cours!correspondant!!

' !Responsables/'Enseignant(e)s!

Madame!A.!BELLIER!et!Monsieur!V.!HUBER!:!formation!documentaire!T!!Madame!E.!DEMARSY!(cc)! :!responsable!de!la!salle!des!TP!5050.!!Madame!V.!HAMEL!(ma)!:!coordinatrice!des!travaux!pratiques!en!laboratoire!de!recherches!T!!F.!KARCH!(po)!et!J.!MONTOYA!(ce)!:!TP!en!salle!5050.!

!Contenu'Formation!documentaire!T!bases!de!biologie!moléculaire!et!cellulaire!en!laboratoire!de!rechercheT!analyse! informatique!de! séquences!d’ADN.!Microscopie!:! cellule! animale! et! végétale,!mitose,!méiose,!chromosomes!spéciaux.!!Objectifs'Chercher!et!localiser!des!documents!scientifiques!T!évaluer!leur!fiabilité!et!connaître!les!risques!liés!au!plagiat.!Utiliser!des!programmes!d’analyse!de!séquences!et!consultation!de!bases!de!données.!!Utiliser!un!microscope!et!observer!les!structures!cellulaires.!!Représenter!ces!observations!(dessins,!graphiques).!Utiliser!des!outils!de!bases!du!laboratoire!(micropipettes,!spectrophotomètre).!Appliquer!les!techniques!de!biologie!moléculaire!et!cellulaire!de!base.!!Synthétiser!et!présenter!un!sujet!de!recherche!oralement.!

!

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!BIOSTATISTIQUES* I*:*Applications* 11M904*Cours!obligatoire!bachelor!en!archéologie!préhistorique*«*Module*1.1*Sciences*de*base*»**Semestre**

printemps!! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

1!(total*4*pour*11M004*+*11M904*)!

Jour**

jeudi!08h15!–!10h00!

Lieux* Pavillon!Ansermet,!salle!119!au!1er!étage!et!salle!A100!SCII!(et!salle!0019!SCIII,!en!fonction!du!nombre!d'étudiants)!!

Mode*d’évaluation*!

un!seul!examen!écrit!de!2h!pour!les!deux!enseignements!11M004!et!11M904!

Sessions*d'examens**

juin!+!rattrapage!aoûtNseptembre!

Responsable*!

Madame!E.!POLONI!N!022.379.6977!N!estella.poloni@unige.ch!

Enseignant(e)s! Madame!E.!POLONI!(cc),!Monsieur!M.!MOUTERDE!(ass),!et!collaborateurs.!

!Divers!**Le!cours!Biostatistiques!I!(11M004,!responsable!Monsieur!S.!SARDY!(pas),!doit!être!suivi!avec!les!travaux!pratiques!Biostatistiques!I!:!Applications!(11M904)!au!semestre!de!printemps!pour!l’obtention!des!4*crédits*ECTS.!!Contenu*En!coordination!avec!le!cours!de!Biostatistiques!I! (11M004),!les! séances!de!‘Biostatistiques!I!:!Applications’!proposent!une!application!des!conceptsNclés!en!probabilités!et!statistiques!à!la!biologie,!et! plus! généralement!à! tous! les! domaines! liés! aux! sciences! du! vivant.! Les! deux! heures!hebdomadaires!seront!dédiées!à!contextualiser!l’utilité!et!l’utilisation!de!ces!concepts!pour!aborder!des!connaissances!dans!le!domaine!des!sciences!du!vivant.!Ceci!s’effectuera!à!travers!la!résolution,!par! les! étudiantsNes,!de!problèmes!présentés!sous! forme! d’exercices! sur! des! exemples! tirés!exclusivement!du!domaine!des!sciences!du!vivant.!Des!corrections!interactives!(entre!enseignantsNes!et!étudiantsNes)!seront!proposées.!Le!recours!à!l’utilisation!du!logiciel!R!sera!aussi!inclus!dans!les!séances.!Le!programme!comprend!:!!1.! EDA:! visualisation!et! représentation!des!données,!échantillonnage(s)!dans! le! contexte!des!sciences!du!vivant!2.!Probabilités:!lois!de!probabilités!dans!la!génétique!des!familles!et!des!populations,!et!lois!de!probabilités!associées!aux!caractères!à!variation!continue!3.!Principes!de!l'inférence!statistique!de!paramètres!usuels!dans!les!sciences!du!vivant,!principe!d’un!test!d’hypothèse!et!introduction!aux!tests!usuels!dans!les!sciences!du!vivant!!Objectifs*Permettre!à!l'étudiantNe!d’acquérir!un!degré!d’autonomie!suffisant!pour!pouvoir,!à!la!fois!:!N!s’orienter!dans!le!choix!de!la!littérature!à!consulter!et!les!programmes!statistiques!à!utiliser!pour!répondre!à!une!question!scientifique!qu’elle/il!pourra!rencontrer!dans!le!cadre!de!ses!études!e!N!porter!un!regard!critique!sur!l’actualité!scientifique!dans!le!domaine!des!sciences!du!vivant,!à!savoir!être!capable!d’évaluer!l’adéquation!d'un!plan!expérimental!pour!répondre!à!une!question!scientifique!donnée,!la!robustesse!des!résultats!expérimentaux!et!la!pertinence!des!conclusions!qui!en!sont!tirées.!Ceci!implique!:!

N! d’identifier!des!types!de!variables,!leurs!distributions!de!probabilité!et!les!paramètres!de!ces!distributions!e!

N! d’estimer!des!paramètres!usuels!(médiane,!quartiles,!probabilité,!espérance,!variance,!covariance,!corrélation)!à!partir!de!données!expérimentales!e!

N! de!conduire!un!test!d’hypothèse!simple!avec!des!données!expérimentales!e!d’interpréter!les!résultats!des!estimations!ou!des!tests!dans!le!cadre!d’un!plan!expérimental,!et!d’en!tirer!des!conclusions.!!!

88

!BIOSTATISTIQUES* I* 11M004*Cours!obligatoire!bachelor!en!archéologie!préhistorique*«*Module*1.1*Sciences*de*base*»***Semestre**

printemps!! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!(total!4!pour!11M004!+!11M904*)!

Jour**

jeudi!10h15!–!12h00!!

Lieu**

Sciences!II,!salle!A300!

Mode*d’évaluation*!

un!seul!examen!écrit!de!2h!!pour!les!deux!enseignements!11M004!et!11M904!!

Sessions*d'examens**

juin!+!rattrapage!aoûtLseptembre!

Responsable*!

Monsieur!S.!SARDY!–!022.379.1142!–!sylvain.sardy@unige.ch!

Enseignant(e)s! Monsieur!S.!SARDY!(pas),!et!collaborateurs.!!Divers!*!Le*cours*Biostatistiques*I*(11M004)*doit*être*suivi*avec*les*travaux*pratiques*Biostatistiques*I*:*Applications*(11M904)*au*semestre*de*printemps*pour*l’obtention*des*4*crédits*ECTS.!!Contenu*1.! Analyse!exploratoire!(statistiques!simples!et!analyse!graphique)!et!utilisation!du!logiciel!

statistique!R.!2.! Calculs!élémentaires!de!probabilités.!3.! Variables!aléatoires!et!distributions!discrètes,!leur!espérance!et!variance.!En!particulier,!

distributions!Bernoulli,!Binomiale!et!Poisson.!4.! Variables!aléatoires!et!distributions!continues,!leur!espérance!et!variance.!En!particulier,!

distributions!Gaussienne!et!Student.!5.! Introduction!à!la!régression,!au!test!statistique!et!estimateur.!!Objectifs*Apprendre!les!conceptsLclefs!en!statistiques!et!probabilités.!!

89

!CHIMIE&GENERALE& 11C101&Cours!obligatoire!bachelor!en!archéologie!préhistorique&«&Module&1.1&Sciences&de&base&»&&&Semestre& automne!!

!4h/sem,!total!56h!

ECTS& 5!(pour!les!biologistes!&!les!archéologes)!!

Jour&&

lundi!8h15@10h00!&!mercredi!10h15@12h00!

Lieu&&

Sciences!II,!salle!A300!

Mode&d’évaluation&!

questionnaire!à!choix!multiples!(QCM)!!

Sessions&d'examens& janvier@février!+!rattrapage!août@septembre!!

Responsable&!

Monsieur!X.!CHILLIER!–!022.379.6715!–!xavier.chillier@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!X.!CHILLIER!(cc).!!Contenu&1.!Historique!et!concepts!de!base!2.!Equilibre!et!réactions!chimiques!3.!Cinétiques!des!réactions!4.!L’atome!et!l’électron!:!naissance!de!la!mécanique!quantique!5.!Molécules,!liaisons!et!états!de!la!matière!6.!Equilibres!physico@chimiques!7.!Chimie!nucléaire,!isotopes,!radiochimie!et!radioactivité!!Documentation&et&bibliographie!Polycopié!(sur!Moodle)!!Tro!N.J.!(2016)!Chimie!générale,!une!approche!moléculaire,!Pearson!Education,!(ISBN!978@2@7613@9075@0)!!Brown!et!al.!(2012)!Chemistry!:!the!central!science,!12th!Edition,!!(ISBN!978@0@321@74983@3)!!P.W.!Atkins,!L.!Jones!(1998).!Chimie!:!Molécules,!Matière,!Métamorphoses.!De!Boeck!Université.!ISBN!10@2@7445@0028@3.!!Hill!&!Petrucci,!Chimie!générale!(2002),!Pearson!Press,!!(ISBN!2@84211@199@0)!!EKlearning&:&https://chamilo.unige.ch/!!Objectifs&Dispenser!aux!étudiant@e@s!une!culture!de!base!en!chimie!et! les!connaissances!dont!ils/elles!auront!besoin!pour!suivre!ensuite!des!enseignements!plus!avancés.!!CHIMIE&GENERALE&exercices&:&intégrés&dans&le&cours&&!!!

90

PHYSIQUE)GENERALE)B) 11P085/086)Cours&obligatoire&bachelor&en&archéologie&préhistorique)«)Module)1.1)Sciences)de)base)»))

Semestre))

automne/printemps& 4h/sem,&total&112h&

ECTS))

10&(cours&+&répétitoire&pour&les&biologistes)&8&(cours&pour&les&archéologues)&&

Jours) mardi&10h15A12h00&vendredi&10h15A12h00&&

Lieu) EPA,&Ecole&de&physique&&

Mode)d’évaluation& examens&écrits&&

Sessions)d'examens) janvierAfévrier&/&juin&+&rattrapage&aoûtAseptembre&&

Responsabl(e)s)))))

(automne)&Monsieur&BONACINA&Luigi&–&022&379&0508&ALuigi.Bonacina@unige.ch&&&

(printemps)&Monsieur&GIANNINI&Enrico&–&022&379&6076&A&Enrico.Giannini@unige.ch&&&

Enseignant(e)s& Messieurs&L.&BONACINA&(mer),&E.&GIANNINI&(mer)&&

Divers&Le&cours&de&physique&générale&B&(11P085/11P086)&de&10&ECTS&doit&être&suivi&avec&les&travaux&pratiques&(11P985)&de&2&ECTS&pour&l’obtention&des&12&ECTS.&&&

Bien&que&pas&obligatoires,&les&séances&d’exercices&sont&indispensables&à&la&compréhension&du&cours&et&fortement&conseillées.&&

Les&laboratoires&qui&accompagnent&le&cours&doivent&permettre&à&l’étudiant&de&se&familiariser&avec&les&méthodes&de&mesures&utilisées&pour&déterminer&une&grandeur&physique.&Ils&font&partie&du&champ&d’examen.&&Contenu)Semestre)automne):)(11P085))Introduction&à&la&physique,&cinématique,&lois&de&Newton,&dynamique,&statique,&gravitation,&rotation,&énergie&mécanique,&les&solides,&les&fluides,&oscillations&et&ondes&mécaniques,&le&son,&propriétés&thermiques&de&la&matière,&chaleur&et&thermodynamique.&&

Semestre)printemps):)(11P086))Electrostatique,&courant& continu,& circuits,& magnétisme,& induction& électromagnétique,&courant&alternatif,&ondes&électromagnétiques,&propagation&de&la& lumière,& optique&géométrique,&optique&ondulatoire,&lasers,&applications&biomédicales,&relativité&restreinte,&origines&de&la&physique&moderne,&théorie&quantique.&&Moodle:&https://moodle.unige.ch/course/view.php?id=2556&&Objectifs)Le&but&du&cours&est&de&donner&à&l'étudiant&les&notions&de&base&nécessaires&à&la&compréhension&des&phénomènes&physiques&qui&se&passent&dans&la&nature&et&dans&le&corps&humain.&L'objectif&est&atteint&lorsque&l'étudiant&est&capable&de&prévoir&quantitativement&les&conséquences&de&ces&phénomènes&en&utilisant&aussi&des&outils&mathématiques&appropriés.&&&Ouvrages)de)référence):&A&Physique,&Eugène&Hecht,&DeBoeck&Université&ed.&A&J.&Kane&and&M&Sternheim,&“Physique”,&Dunod&ed.,&Paris&&A&Fundamentals&of&Physics,&D&Halliday,&3&vols,&R.&Resnick,&J.&Walker,&&&&John&Wiley&&&Sons,&Inc.&)&

91

!!!!PLANETE'TERRE'I' 11T003'

*'GEOLOGIE'GENERALE'I'dans'le'plan'd'études!!Cours!obligatoire!bachelor!en!archéologie!préhistorique'«'Module'1.1'Sciences'de'base'»''Semestre'

'

automne! 4h/sem,!total!56h!

ECTS'

'

5!

Jour'

'

mardi!10h15!=!12h!et!vendredi!14h15!–!16h!

Lieu'

'

salle!001,!Sciences!de!la!Terre,!13!rue!des!Maraîchers!

Mode'd’évaluation'

!examen!écrit!(examen!oral!ou!écrit!au!rattrapage)!

Sessions'd'examens'

'

janvier=février!+!rattrapage!août=septembre!

Responsable'

!Monsieur!A.!MOSCARIELLO!–!022.379.6610!andrea.moscariello@unige.ch!Section!des!sciences!de!la!Terre!et!de!l’environnement!!

Enseignant(e)s'

'

Monsieur!A.!MOSCARIELLO!(po).!

Contenu'

Le! système! Terre:! formation,! minéraux,! roches! ignées,! roches! sédimentaires! et! roches!métamorphiques.!!Processus!de!surface:!mouvements!de!terrain,!cycle!hydrologique,!eaux!souterraines,!rivières,!vent,!déserts,!glaciers,!océans!et!évolution!des!paysages.!Processus!internes!et!effets!externes:!volcanisme,!tremblements!de!terre,!tectonique!des!plaques,!déformations!de!la!croûte.!!!Préserver!le!système!Terre:!ressources!énergétiques!et!minérales,!systèmes!et!cycles!terrestres.!!Cours!en!polycopié!et!slides!en!format!digitale!disponibles!sur!Chamilo.!!!!

92

!!!!PLANETE'TERRE'I' 11T903'*'GEOLOGIE'GENERALE'I!dans!le!plan!d'études!!Travaux!pratiques!obligatoires!bachelor!en!archéologie!préhistorique'«'Module'1.1'Sciences'de'base'»''Semestre''

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS''

2!!

Jour'et'lieu'''

A!définir!

Mode'd’évaluation'!

examen!pratique/certificat!

Sessions'd'exames''

janvier@février!+!rattrapage!août@septembre!

Responsable'!

Monsieur!A.!MOSCARIELLO!–!022.379.6610!andrea.moscariello@unige.ch!Section!des!sciences!de!la!Terre!et!de!l’environnement!!

Enseignant''

Monsieur!M.!CHIARADIA!(mer).!

Contenu'Reconnaissance! à! vue! des! principaux! minéraux! et! roches! magmatiques,! sédimentaires! et!métamorphiques,!avec!références!au!cours!de!Géologie.!!!

93

PLANETE'TERRE'II' 11T005'

*'GEOLOGIE'GENERALE'II!dans!le!plan!d'études!!Cours!obligatoire!bachelor!en!archéologie!préhistorique'«'Module'1.1'Sciences'de'base'»''

Semestre'

'

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS'

'

2!2.5!archéologie!préhistorique!!!

Jour'

'

(le!jour!et!lieu!doivent!être!confirmés!par!leur!secrétariat.)!!

Lieu'

'

Maraîchers,!salle!102!

Mode'd’évaluation'

!examen!écrit!!

Sessions'd'examens'

'

juin!+!rattrapage!aoûtJseptembre!

Responsable'

!Monsieur!U.!SCHALTEGGER!J!022!379!66!38J!urs.schaltegger@unige.ch!!

Enseignant(e)s'

'

Monsieur!U.!SCHALTEGGER!(po).!

Contenu'

Nous!discutons!les!grands!défis!pour!le! futur!de!notre!société:!les! changements!climatiques,!les!ressources!dont!nous!aurons!besoin!pour!un!développement!durable!de!notre!planète,!les!sources!d'énergie!et!les!risques!géologiques.!Des!connaissances!de!base!et!une!bonne!compréhension!des!processus! du! système! Terre! sont! indispensables!pour! relever! ces! grands! défis.! Dans! cette!perspective,!ce!cours!donnera!une!introduction!à!la!formation!et!la!distribution!des!roches!et!leurs!minéraux!ainsi!que!des!gisements!métalliques!et!montrera!comment!desceller!les!informations!que!ces!roches!et!minéraux!contiennent.!!!!

94

!!!!CIVILISATIONS*PREHISTORIQUES* 14T003*Cours!obligatoire*bachelor!en!archéologie!préhistorique*«Module*1.2*Introduction*à*la*préhistoire»**Semestre**

printemps! Total!28h!

ECTS**

4!

Jour**

à!fixer!

Lieu**

à!Uni!Carl!Vogt!

Mode*d’évaluation*!

Participation!active!au!cours!et!présentation!orale!

Sessions*d'examens**

juin!+!rattrapage!aoûtCseptembre!

Responsable*!

Madame!M.!BESSE!C!022.379.6915!C!marie.besse@unige.ch!

Enseignante**

Madame!M.!BESSE!(pas)!

Divers*Enseignement!à! choix! pour! les! étudiantCeCs! intéresséCeCs! par! la! démarche! scientifique!en!archéologie.!!Objectif*Cet!enseignement!de!niveau!bachelor!vise!à!donner!une!introduction!générale!à!l'étude!de!sites!préhistoriques,!des!débuts!de!la!fouille!archéologique!à!sa!publication.!Ce!cours!s'inscrit!dans!les!projets!de!recherche!dirigés!par!la!Professeure!Marie!Besse!et!ses!collaborateurs!autour!de!plusieurs!fouilles! archéologiques.!Des! visites! de! sites! archéologiques!et! des! musées! sont! également!organisées.!!!!

95

!INTRODUCTION)A)L'ARCHEOLOGIE)AFRICAINE) 14B002)

Cours!obligatoire)bachelor!en!archéologie!préhistorique)«Module)1.2)Introduction)à)la)préhistoire»))

Semestre))

automne!! 4h/sem,!total!56h!

ECTS))

6!

Jour) jeudi!10h15!>!13h!!!

Lieu))

Sciences!II,!salle!449!

Mode)d’évaluation)!

exposé!oral!!

Sessions)d'examens) janvier>février!+!rattrapage!août>septembre!) !Responsables))

Monsieur!E.!HUYSECOM!>!022.379.6973/67!>!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s) Monsieur!E.!HUYSECOM!(pas),!et!collaborateurs.!! !Divers)

A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS.)A)LIEU)EN)AUTOMNE)2019.!

!Ce!cours!est!ouvert!au!public.!!Contenu)Ce!cours!est!une!introduction!générale!à!la!géographie,!à!l'histoire!et!à!la!pratique!de!la!recherche!archéologique!en!Afrique.!!!La!première!partie!traite!des!interactions!Homme!>!Nature,!soit!des!mécanismes!climatiques!et!des!principales!variations!environnementales!ayant!affecté!le!continent!africain!depuis!le!Pléistocène,!de!l’impact!du!climat!sur!le!peuplement!humain,!des!interventions!humaines!au!cours!de!l'histoire!visant!à!modifier!ou!maîtriser!l'environnement,!ainsi!que!des!types!économiques!actuels!tirant!parti!de!la!variété!des!milieux!naturels.!!!La! deuxième! partie! du! cours! est! consacrée!aux! sources! à! disposition!des! chercheurs! pour!reconstituer!le!passé!africain,!à!l’histoire!de!la!découverte!du!continent!africain!par!les!Européens!et!à!l’évolution!du!regard!et!des!relations!entre!Africains!et!Occidentaux,!de!l’Antiquité!classique!à!nos!jours.!Ce!volet!traite!également!de!la!question!du!pillage!archéologique,!du!marché!de!l’art!et!de!la!protection!du!patrimoine!culturel!en!Afrique.!!Objectifs)Acquisition!des!connaissances!élémentaires!dans!le!domaine!de!l’Archéologie!et!de!l’Histoire!de!l’Afrique.!!

96

!!!INTRODUCTION)A)L'ARCHEOLOGIE)AFRICAINE)–)séminaire)) 14B702)

Séminaire)obligatoire)pour)le)bachelor)ès)Lettres)mention)Archéologie)préhistorique)et)

anthropologie)

Bachelor!en!archéologie!préhistorique)«Module)1.2)Introduction)à)la)préhistoire»))

Semestre) automne!!!

2h/sem,!total!28h!

ECTS)

)

3!

Jour) jeudi!15h!=17h!!!

Lieu)

)

Sciences!II,!salle!449!

Mode)d’évaluation) travail!écrit!et!présentation!orale!) !Responsables)

)

Monsieur!E.!HUYSECOM!=!022.379.6973/67!=!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s) Messieurs!E.!HUYSECOM!(pas),!J.!AYMERIC!(as),!Madame!C.!CERVERA!(as).!!

Divers)

A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS)

A)LIEU)EN)AUTOMNE)2019!Contenu)

Sujets!en!relation!avec!le!cours!n°!14B002.!!Objectifs)

Acquisition!des!outils!nécessaires!à!la!conduite!d’une!recherche!personnelle!et!à!la!rédaction!d’une!monographie.!!!

97

!!PREHISTOIRE)GENERALE) 11T009)Cours)obligatoire)pour!le!bachelor!en!archéologie!préhistorique!et!anthropologie)&!bachelor!en!archéologie!préhistorique)«Module)1.2)Introduction)à)la)préhistoire»))Semestre))

automne/printemps! 2h/sem,!total!56h!

ECTS))

6!

Jour))

mardi!17h15!=!19h!

Lieu))

Uni!Carl!Vogt!

Mode)d’évaluation)!

examen!écrit!

Sessions)d'examens))

juin!+!rattrapage!août=septembre!

Responsable)!

Madame!M.!BESSE!=!022.379.6915!=!marie.besse@unige.ch!!

Enseignant(e)s))

Mesdames!M.!BESSE!(pas),!P.!CHIQUET!(cs),!J.!DESIDERI!(cc),!!L.!MARTIN!(post=doc),!A.!SANCHEZ=MAZAS!(po),!T.!STEIMER!(ce)!!Messieurs!A.!AL!QADI!(postdoc),!F.!COUSSEAU!(postdoc),!N.!HUBERT!VAN!BLYENBURGH!(cc),!E.!HUYSECOM!(pas),!P.=Y.!NICOD!(cs).!!

Contenu)Cet!enseignement!de!niveau!bachelor!présente!l’évolution!humaine!du!point!de!vue!de!son!mode!de!vie,!de!son!organisation!sociale,!de!ses!réalisations!techniques!et!de!ses!peuplements!sur!la!base!des!vestiges!archéologiques!découverts!dans!les!différents!continents.!L’aventure!culturelle!humaine!est!ainsi! racontée!depuis!ses!origines!jusqu’à!l’aube!de!l’urbanisation.!Ce!cours!se!propose!de!répondre!aux!questions!:!qui!sommes=nous!?!d’où!venons=nous!?!quelles!en!ont!été!les!étapes!et!à!quels!moments!?!comment!pouvons=nous!mettre!cela!en!évidence!?!Cet!enseignement!peut!être!complété!par!des!travaux!pratiques.!!!!

98

!PREHISTOIRE)GENERALE) 11T909)Travaux!pratiques!obligatoires!pour!le!bachelor!archéologie!préhistorique!et!anthropologie!&!bachelor!en!archéologie!préhistorique)«Module)1.2)Introduction)à)la)préhistoire»))Semestre))

automne/printemps! 3h/sem,!total!84h!

ECTS))

3!

Jour))

mardi!14h15!@!17h!

Lieu))

Uni!Carl!Vogt!

Mode)d’évaluation) examen!oral!) !Responsable)!

Madame!M.!BESSE!@!022.379.6915!@!marie.besse@unige.ch!!

Enseignant(e)s) Mesdames!E.!DERENNE!(ass.)!et!collab.!!Contenu)Ces! travaux!pratiques!de!niveau!bachelor!permettent!aux!étudiant.e.s!de!voir!et!de!manipuler!le!matériel!archéologique.!Il!s'agit!d'apprendre!à!reconnaître!les!matières!premières,!les!techniques!de!taille!et!de!façonnage!utilisées!dans!la!fabrication!des!objets!préhistoriques!en!céramique,!en!silex!ou!autres!roches,!en!bois!de!cerf,!en!bois!de!renne,!en!métal! (cuivre,!bronze,!fer).!Des!approches!environnementales! sont! également! au! programme! (environnements! géologique,! botanique,!faunique).!Des!visites!de!laboratoires,!de!musées!et!de!sites!archéologiques!sont!également!prévues.!!!!! !PLANETE'TERRE'II' 11T905'*'GEOLOGIE'GENERALE'II!dans!le!plan!d'études!!Travaux!pratiques!obligatoires!bachelor!en!archéologie!préhistorique'«'Module'1.1'Sciences'de'base'»''Semestre''

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS''

2!

Jour'et'lieu''

A!définir!

Mode'd’évaluation'!

Certificat!

Responsable!!

Monsieur!M.!CHIARADIA!F!022!379!66!34!F!Massimo.Chiaradia@unige.ch!!

Enseignants''

Messieurs!M.!CHIARADIA!(mer),!E.!GNOS!(pt).!

Contenu'Composition!minéralogique!des! roches! principales.!La!structure,! la! composition!et! les! propriétés!chimiques!et!physiques!des!minéraux!les!plus!importants!et!leur!stabilité!dans!différents!environnements!géologiques.!!!!

Section de biologie

!

!

Orientations du master en biologie :

• Orientation libre (OL) • Biodiversité et systématique (BDS) • Bioinformatique et analyse des données en biologie (BIADB) • Génétique, développement et évolution (GDE) • Sciences moléculaires du végétal (MPS)

Liste des cours réservés au master en biologie

Partie IV Le master

99

MASTER EN BIOLOGIE & ses orientations Voir l’Annexe 1 au règlement du master au verso. Les étudiants peuvent s'inscrire à l’une ou l’autre des 5 orientations de master suivantes :

- OL : Orientation Libre

- BDS : Biodiversité et Systématique

- BIADB : BioInformatique et Analyse des Données en Biologie

- GDE : Génétique, Développement et Evolution

- MPS : Sciences moléculaires du végétal / Molecular Plant Sciences

Les formulaires d’inscription au master en biologie & ses orientations sont à télécharger sur le site internet de la Section de biologie. Le formulaire d’inscription rempli est à retourner au secrétariat des étudiants de la Section de biologie (Sciences III -­ 2ème étage -­ bureau 2004A) au plus tard à la rentrée du semestre auquel le master débute. N’hésitez pas à consulter le site internet de la Section de biologie vous y trouverez des informations détaillées sur l’organisation, la rédaction et les délais du master.

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ANNEXE 1 AU REGLEMENT DE MASTER EN BIOLOGIE Inscription au master : L'inscription n'est possible qu'après avoir trouvé un directeur de travail de master. C’est l’étudiant lui-­même qui prend contact avec un potentiel directeur de master qui lui proposera un sujet selon son intérêt pour une discipline et les possibilités d’encadrement. Certaines places de master sont aussi proposées sur les sites web de la Section et des Départements. Le directeur du travail de master doit être un membre du corps professoral de la Section de biologie ou un MER. Les CC et CE titulaires d'un doctorat peuvent aussi être autorisés par le président de la Section de biologie à diriger des travaux de master ou à fonctionner en tant que répondants (voir ci-­dessous). Si le master se fait selon une orientation, le choix du directeur ou du répondant peut être restreint. La réalisation d’un travail de master en dehors de la Section de biologie est possible avec l’accord de la présidence de la Section. Elle requiert néanmoins la désignation d’un répondant, membre du corps professoral ou MER (ou CC/CE) de la Section de biologie, qui agit comme responsable. Le répondant de la Section s’assure du niveau académique de la structure d’accueil et de l’adéquation du sujet proposé aux exigences de la Section de biologie. Le répondant ou son département peuvent exiger la présentation d'un projet préalable par écrit. Le répondant vérifie et cosigne l’évaluation finale du travail de master. Le formulaire d'inscription au travail de master doit parvenir au secrétariat des étudiants de la Section de biologie avec toutes les signatures au plus tard à la rentrée du semestre auquel le master débute. Le formulaire est contrôlé au secrétariat des étudiants de la Section (crédits, cours en relation avec le travail de master, etc.) et signé par la conseillère aux études de la Section. Une copie sera retournée par e-­mail à l'étudiant qui en transmettra un exemplaire à son directeur et/ou son responsable du travail. Selon l'Art. 19 -­ alinéa 1c du "Règlement d'études général" de la Faculté des sciences, un minimum de 20 ECTS doivent être obtenus sur les deux premiers semestres du master. Si l'étudiant ne les a pas encore obtenus pour des cours, une attestation pourra être établie par le directeur du travail de master (et le responsable, s'il y a lieu) afin de valider une équivalence d'au moins 20 ECTS pour le travail de master pour cette période. Un formulaire ad hoc sera transmis à cette fin au terme de la 1ère année au directeur de travail par le Secrétariat des étudiants de la Section de biologie. But du travail de master : • Répondre à une question de biologie par l'expérimentation et/ou l’analyse de données.

• Se familiariser avec la démarche scientifique pratique et théorique.

• Acquérir des compétences expérimentales/analytiques par l'apprentissage d'un large éventail de techniques.

• Apprendre à rendre compte de résultats dans des séminaires de groupe et par écrit (mémoire de master).

Durée du travail de master : Le travail de master vaut 60 ECTS. Cela correspond à 45 semaines à plein temps (sans compter les vacances).

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Rédaction du mémoire de master : Le travail de master devra être présenté sous forme d’un mémoire de master écrit. Voir les consignes dans le guide "Etudier la biologie" sur le site de la Section (http://biologie.unige.ch). Obtention du master en biologie : délais et conditions Pour obtenir le master en biologie, l’étudiant doit acquérir un total de 90 crédits ECTS 60 ECTS pour le travail de master et 30 ECTS pour des cours de master. La durée réglementaire d’études est de 3 semestres, mais une prolongation est possible (maximum de 6 semestres au total). Pour plus d’information sur les délais et conditions, merci de consulter le site web de la Section de biologie, lien Master en Biologie. Évaluation et dépôt du mémoire de master : Le travail de master est noté par deux évaluateurs, le directeur du master et un juré, titulaire au minimum d'une thèse doctorale, selon les critères mentionnés ci-­après. Pour les travaux dirigés par un professeur ne faisant pas partie de la Section, le répondant au sein de la Section agit comme juré. Une soutenance orale, en présence des deux évaluateurs, peut être organisée en accord avec l'étudiant. La note est transmise par le directeur de master, avec les deux signatures, au moyen du formulaire officiel de la Section de biologie. La note peut aussi être attribuée par le collège des professeurs du département concerné. Critères d'évaluation : Réflexion personnelle / Compréhension / Indépendance, créativité / Engagement personnel / Compétences pratiques / Contenu du travail : état de la recherche, résultats, interprétation / Rédaction et présentation écrite du travail / Le cas échéant, qualité de la soutenance orale. Une fois que le travail de master a été accepté par le directeur du travail, le déroulement est le suivant : 1.) Une version pdf doit être transmise au secrétariat des étudiants de la Section de biologie

(p.ex. envoyée par e-­mail à secretariat-­biologie@unige.ch). 2.) Après validation du mémoire et réception de la note, le secrétariat enverra une confirmation

à l'étudiant par e-­mail. 3.) L'étudiant devra alors déposer le mémoire (en version électronique) dans l'Archive Ouverte

(http://archive-­ouverte.unige.ch) et envoyer la confirmation officielle (comprenant le lien) du dépôt dans l'Archive Ouverte au secrétariat des étudiants de la Section de biologie.

4.) Le secrétariat des étudiants de la Section de biologie transmettra la note à la Faculté. Pour que le master puisse être formellement accordé, il faut que ce processus aboutisse avant la fin de la session d'examens du dernier semestre du master. Selon les modalités du département concerné, des copies en version papier peuvent aussi être requises pour le directeur (et répondant s'il y a lieu) et/ou le département.

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MASTER IN BIOLOGY & its options

Please see below the Annex to the bylaws of the master. The students may enroll in one of the five following options:

- OL : Free option

- BDS : Biodiversity and Systematics

- BIADB : BioInformatics and Data Analysis in Biology

- GDE : Genetics, Development and Evolution

- MPS : Molecular Plant Sciences

Registration forms for the master in biology and its orientations are downloadable on the Section of Biology’s website. Once filled, the form must be returned to the "Secrétariat des étudiants" of Biology (Sciences III -­ 2nd floor -­ office 2004A) before the academic start of the first term of the master

Detailed information on the organization, writing and deadlines of the master is available on the website of the Section.

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ANNEX 1 TO THE REGULATIONS OF THE MASTER IN BIOLOGY

Registration to the master's program: Registration to a master's degree is only possible after having found a master's work adviser. The student has to get in touch him/herself with a potential adviser according to his/her interest for a given discipline and the possibilities of supervision. Some master’s positions are also proposed on the web sites of the Section of Biology and of its individual departments. The master’s work adviser must be a professor or MER of the Section of Biology. CC and CE with PhD degree can also be authorized by the president to supervise or sponsor (see below) a master’s work. If the master in biology is done with a particular option, the choice of the thesis adviser or sponsor may be restricted. Students are allowed to perform their master’s work in a laboratory outside the Section of Biology with the agreement of the president. In that case, a sponsor acting as responsible for the Section of Biology has to be found. This sponsor must be a professor or MER (or CC or CE as indicated above) of the Section of Biology. The sponsor of the Section of Biology ensures both that the academic environment of the host laboratory is appropriate and that the subject proposed to the student for his/her master’s work fulfills the criteria of the Section of Biology. The sponsor or his/her Department can request a written project description before accepting the sponsorship. The sponsor checks and cosigns the final evaluation of the master’s thesis. The registration form for the master’s work must be brought to the Secretariat for students of the Section of Biology with all signatures by the official start of the 1st semester of the master, at the latest. The registration form is checked by the Secretariat for students (credits, courses in relation to the master’s work, etc) and signed by the Study Adisor of the Section. One copy of the registration form will be returned to the student who will give another copy to his/her supervisor. According to the Art. 19-­1c of the "Règlement d'études général" of the Faculty of sciences, a minimum of 20 ECTS must be obtained for the first two semesters of the master. If the student has not successfully obtained them yet with courses, the master's thesis adviser (and the sponsor, if required) can provide a certificate attesting that the student's work on the master's thesis is equivalent to at least 20 ECTS for this period. To this end, an official form will be sent to the master's thesis adviser at the end of the first year by the Secretariat for students of the Section of Biology. Objectives of the master's work:

• To answer a question related to biology through experimentation.

• To become familiar with the practical and theoretical aspects of the scientific process.

• To acquire a wide range of experimental skills involving a variety of techniques.

• To learn how to present scientific results in group seminars and in a written form (e.g. master’s thesis).

Time investment for the master's work: The master’s work is credited 60 ECTS. This corresponds to 45 weeks of full-­time work (without counting vacation).

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Writing the master’s thesis: The master’s work must be presented in the form of a written master's thesis. See from the « Studying biology » guide on the website of the Section of Biology (http://biologie.unige.ch). Duration and conditions for obtaining a master's degree in Biology To obtain a master’s degree in Biology, students must obtain a total of 90 ECTS credits: 60 ECTS for the master’s work and 30 ECTS for master’s courses. The normal duration of the master’s studies is 3 semesters, but an extension can be obtained (maximum 6 semesters in total). For more information on deadlines and conditions, please visit the website of the Section of Biology, link Master in Biology. Evaluation and submission of the master’s thesis: The master’s thesis is evaluated by two examiners, the thesis supervisor and another member of the jury who holds at least a PhD, according to the criteria mentioned hereafter. If the master’s work is performed in a laboratory outside the Section of Biology, the sponsor from the Section acts as the second examiner. With the agreement of the student, an oral defense in the presence of the two examiners can be organized. The final grade is transmitted by the thesis director on the official form to the Secretariat for students of the Section of Biology, with the two signatures. The grade can also be given by the College of principal investigators of the corresponding Department. Evaluation criteria: Intellectual contribution / understanding / independence, creativity / personal commitment / practical skills / contents of the master's thesis: current state of research, results, interpretation / writing and presentation of the thesis / when applicable, quality of oral presentation. Once the master’s thesis has been accepted by the master’s supervisor, the procedure is as follows: 1) A pdf version must be sent to the Secretariat for students of the Section of Biology (e.g.

sent by e-­mail to secretariat-­biologie@unige.ch).

2) After validation of the thesis and receipt of the grade from the supervisor, the Secretariat will send a confirmation to the student by e-­mail.

3) The student then needs to file an electronic copy of the master’s thesis in the Open Archive (http://archive-­ouverte.unige.ch) and send the official confirmation (including the link) from the Open Archive to the Secretariat for students of the Section of Biology.

4) The Secretariat for students of the Section of Biology can then forward the grade to the Faculty. In order for the master’s to be formally granted, this process must be completed before the end of the exam session of the last semester of the master’s. According to the terms of the relevant department, paper copies may also be required for the director (and supervisor if applicable) and /or the department.

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Master en biologie Orientation Libre (OL) Master in Biology Free option

Responsable / Person in charge :

Françoise STUTZ (po) -­ francoise.stutz@unige.ch, vice-­présidente Descriptif : Ce type de master offre la possibilité d'intégrer n’importe quel domaine de la biologie sans l’imposition d’une spécialisation particulière. Il permet à l'étudiant de choisir sa propre spécialisation à la carte ou de maintenir une formation large. L’orientation libre reste ouverte sur tous les débouchés après le master, y compris le Doctorat ès sciences. D'entente avec le responsable du travail de master, tous les cours sont à choix (30 ECTS) parmi les enseignements proposés dans le Guide de l’étudiant de la Section de biologie. D’autres cours (hors-­Section ou hors-­Université de Genève) peuvent également être choisis avec l'accord de la présidence de la Section. Le travail de master (60 ECTS) peut se faire dans n'importe quel laboratoire de la Section de biologie, notamment les laboratoires non proposés comme laboratoires d'accueil par les masters avec orientation, ainsi que dans des laboratoires hors-­Section (par exemple un laboratoire de la Faculté de médecine). Notez qu’un même sujet de master peut faire l’objet d’un master avec orientation libre ou d’un master avec orientation spécifique, selon recommandation ou accord du directeur de master. Pour trouver un sujet et une place de master (que ce soit pour l’orientation libre ou une orientation spécialisée), l’étudiant devra s’adresser lui-­même directement aux enseignants / chefs de groupes de recherche selon son intérêt pour une discipline. Il pourra aussi consulter le site web de la Section de biologie et les sites des différents départements. Description : This type of master gives access to any field of biology without any particular specialization being imposed. It allows the student either to choose his/her own specialization or to follow a broad orientation. The free orientation still allows all options after the master, including a PhD in Science. In agreement with the master work adviser, all courses (30 ECTS) can be chosen among those proposed in the Guide for Students. Other courses (outside the Section or outside the University of Geneva) can also be chosen in agreement with the presidency of the Section of biology. The master work (60 ECTS) can be performed in any laboratory of the Section of biology including laboratories not proposed as host laboratories for specific master options, as well as other laboratories outside the Section (e.g. laboratories of the Faculty of Medicine). Note that one and the same research topic can be chosen for a master with free option or for a master with specialized option, depending on the recommendation or with the agreement of the master advisor. To find a research topic and position for a master (either with free or specialized option), the student must contact himself/herself a possible adviser according to his/her research interests. He/she can also consult the web site of the Section of biology and those of the different Departments.

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Master en Biologie : Orientation Biodiversité et Systématique (BDS) Master in Biology : Option Biodiversity and Systematics (BDS)

http://www.unige.ch/bds Responsables / Persons in charge : Juan Montoya (ce) -­ juan.montoya@unige.ch, Département de génétique et évolution Michelle Price (pt) -­ michelle.price@ville-­ge.ch, Conservatoire et Jardin Botaniques Ø Cours obligatoires / Compulsory courses (15 ECTS) : ECTS

14B013 Advanced studies in systematics 2 + Cycle de conférences en biodiversité (CJB, MHN, GENEV, AGP) 14B005 Biodiversité: origine et évolution 3 14B637 Génétique moléculaire des populations/ Molecular Population Genetics 5 14B657 Phylogénie et évolution moléculaire / Phylogeny and molecular evolution 5 Ø Cours à choix à restreint / Courses with restricted choice (9-­15 ECTS) : ECTS

14B701 Anthropologie biologique et culturelle 3 14B007 Biogéographie 3 14B016 Botanique tropicale 5 14E150 Climat et changement climatiques 3 14B672 Computer skills for biological research 4 14E159 Ecologie des systèmes fluviaux – stage 2 14F001 Elements of bioinformatics 5 14E142 Space-­Climate (CIG) 3 14B030 Evolution humaine -­ Histoire des représentations scientifiques des origines

et de la diversité des humains 3

14B021 Exploitation des collections botaniques 5 14B642 Faune genevoise 4 14B033 Floristique 3 14B008 Floristique et végétation : distribution, dynamique et analyses 2 12T408 Géomatique I 3 14E155 Menaces et conservation de la biodiversité 3 14F006 Programming for bioinformatics 7 14B012 Scientific writing and communication 4 14B667 Stage de biologie marine 6 14B668 Stage de botanique alpine 2 14B669 Stage de botanique tropicale 5 14B009 Stage de Floristique et végétation 3 14B951 Statistique appliquée 1 14B070 Systématique, phylogénie et écologie des lichens et des bryophytes 5

ØCours à choix libre / Courses with free choice (0-­6 ECTS) :

A choisir dans la liste des cours à choix du guide « Étudier la biologie » ou en dehors de l’UNIGE, avec l’accord du directeur du travail de master et d'un responsable de l’orientation BDS. To be chosen among the list of optional courses proposed in the “Studying biology” guide, or outside the University of Geneva, in agreement with the supervisor of the master's research project and one of the persons in charge of the option.

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Master en Biologie : Orientation BioInformatique et Analyse des Données en Biologie (BIADB) Master in Biology : Option BioInformatics and Data Analysis in Biology (BIADB)

http://biadb.unige.ch

Responsables / Academic contacts : Alicia Sanchez-­Mazas (po) – alicia.sanchez-­mazas@unige.ch, Département de génétique et évolution, Unité d’Anthropologie

Frédérique Lisacek (mer) – frederique.lisacek@sib.swiss, Centre Universitaire d’Informatique (CUI), Département d’Informatique. Ø Cours obligatoires / Compulsory courses (19 ECTS) : ECTS 14B672 Computer Skills in Biological Research 4 14F001 Elements of Bioinformatics 5 14B637 Molecular Population Genetics 5 14B057 Statistics and Probability 5 Ø Cours à choix à restreint / Courses with restricted choice (5-­11 ECTS) : ECTS 14F016 Data Mining for Protein Function Prediction 5 14F012 Elements of proteomics and metabolomics: Translation to human

diseases 5

14F018 Bioinformatics for interpreting functional -­ omics data 3 14B751 Méthodologie de la Recherche en Biologie 3 14B657 Phylogénie et évolution moléculaire / Phylogeny and molecular evolution 5 14F006 Programming for Bioinformatics 7 ØCours à choix libre / Courses with free choice (0-­6 ECTS) : A choisir dans la liste des cours à choix du guide « Étudier la biologie » ou en dehors de l’UNIGE, avec l’accord du directeur du travail de master et d'un responsable de l’orientation BDS. To be chosen among the list of optional courses proposed in the “Studying biology” guide, or outside the University of Geneva, in agreement with the supervisor of the master's research project and one of the persons in charge of the option.

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Master en Biologie : Orientation Génétique, Développement et Evolution (GDE) Master in Biology : Option Genetics, Development and Evolution (GDE)

http://gde.unige.ch Responsables / Academic contacts: Emi NAGOSHI (pas) – emi.nagoshi@unige.ch, Département de génétique et évolution Marcos Gonzalez (po) – marcos.gonzalez@unige.ch, Département de biochimie ØCours obligatoires / Compulsory courses (13 ECTS): ECTS 14B017 Master course in Genetics, Development and Evolution 9 & at least one course of the series « Selected Chapters » 4 ØCours à choix à restreint / Courses with restricted choice (11-­17 ECTS): ECTS

14B034 Landmark Papers in Yeast Biology « Selected Chapters » 4 14B023 Milestones in Plant Molecular Biology « Selected Chapters » 4 14B038 Molecular Genetics in Development and Evolution « Selected Chapters » 4 14B020 Classiques de la Génétique Moléculaire (les) 5 14CB01 Currrent Topics in Chemical Biology and Biochemistry 8 14F001 Elements of Bioinformatics 5 14C003 Elements of Molecular Endocrinology 6 13B010 Génétique Moléculaire du Développement – cours principal 6 13B909 Génétique Moléculaire du Développement – travaux pratiques 3 14B640 Histologie et imagerie des tissus 3 14B063 Microscopy and Imaging Course 3 14B637 Molecular Population Genetics/ Génétique moléculaire des populations 5 14B657 Phylogeny and Molecular Evolution / Phylogénie et évolution moléculaire 5 14B010 Principles of Cellular and Molecular Biology 8 14B951 Statistiques appliquées 1 14B044 Travaux pratiques Microscopie générale module B : Microscopie

électronique 5

14B024 Understanding Biological Complexity and Diversity 3

ØCours à choix libre / Courses with free choice (0-­6 ECTS):

A choisir dans la liste des cours à choix du guide « Étudier la biologie » ou en dehors de l’UNIGE, avec l’accord du directeur du travail de master et d'un responsable de l’orientation BDS. To be chosen among the list of optional courses proposed in the “Studying biology” guide, or outside the University of Geneva, in agreement with the supervisor of the master's research project and one of the persons in charge of the option

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Master en Biologie : Orientation Sciences moléculaires du végétal (MPS) Master in Biology : Option Molecular Plant Sciences (MPS)

http://biveg.unige.ch/teaching/master/ Responsables / Academic contacts: Département de botanique et biologie végétale Teresa B. Fitzpatrick (po) – theresa.fitzpatrick@unige.ch Roman Ulm (po) – roman.ulm@unige.ch

ØCours obligatoires / Compulsory courses (13 ECTS) : ECTS

Cours de base / Basic courses : 14B035 Molecular Plant Sciences – Basic Research -­ alternately 14B037 14B037 Molecular Plant Sciences – Applied Aspects -­ alternately 14B035

4 4

At least one of these « Selected Chapters » courses: 14B023 Milestones in plant Molecular Genetics « Selected Chapters »

4

14B045 Introduction à la recherche en biologie moléculaire des végétaux 4 Research seminars of the Department : 14B648 Plant Science Symposium and Geneva Plant Seminars

1

ØCours à choix à restreint / Courses with restricted choice (09-­17 ECTS) : ECTS

Biologie moléculaire et biologie cellulaire végétales / Plant Molecular and Cellular Biology : 14B045 Introduction à la recherche en biologie moléculaire des végétaux 4 14B023 Milestones in plant molecular genetics -­ Selected chapters 4

Cours à options du Bachelor en Biologie / Free choice from Bachelor in Biology 13B012 Physiologie végétale (Fr.+ Engl.) 6 13B906 Physiologie végétale, travaux pratiques (Fr.+ Engl.) 3

Systématique et biodiversité / Systematics and Biodiversity 14B005 Biodiversité : origine et évolution 3 14B007 Biogéographie 3 14B008 Flore et végétation : Cartographie, analyses et indicateurs 2 14B009 Flore et végétation (stage) 3

Cours à l’Université de Lausanne / Courses at the University of Lausanne (UNIL) See http://biveg.unige.ch/enseignement/master/program.html for the current list 1.5

Microscopie et imagerie / Microscopy and Imaging 14B640 Histologie et imagerie des tissus 3 14B063 Microscopy and imaging 3 14B044 Microscopie électronique 5

Bioinformatique et statistiques / Bioinformatics and Statistics 14B672 Computer skills for biological research 4 14F001 Elements of bioinformatics 5 14B057 Statistics and probability 5 14B951 Statistique appliquée 1

Autres aptitudes / Other Skills 14B012 Scientific writing and communication 4 ØCours à choix libre / Courses with free choice (0-­8 ECTS) : A choisir dans la liste des cours à choix du guide « Étudier la biologie » ou en dehors de l’UNIGE, avec l’accord du directeur du travail de master et d'un responsable de l’orientation BDS. To be chosen among the list of optional courses proposed in the “Studying biology” guide, or outside the University of Geneva, in agreement with the supervisor of the master's research project and one of the persons in charge of the option

110

Liste des cours réservés au MASTER EN BIOLOGIE * List of courses reserved for the MASTER IN BIOLOGY * (sous réserve de modifications / Subject to modifications)

* Ouverts à d'autres étudiants avec accord des responsables / Open to other students upon agreement with professor in charge

111

N° cours

Titre du cours

Semestres

ECTS

14B013 Advanced Studies in systematics Autumn 2

14B005 Biodiversité : origine et évolution automne 3

14B047 Cell Biology Journal Club Autumn/ Spring 3

14B020 Classiques de la génétique moléculaire (les) printemps 5

14B672 Computer Skills for Biological research : an introduction to GNU/Linux and bash scripting Autumn 4

14CB01 Current Topics in Chemical Biology and Biochemistry Autumn 8

14F016 Data mining for protein function prediction Spring 5

14F001 Elements of Bioinformatics Spring 5

14F012 Elements of Proteomics and Metabolomics : Translation to human Diseases Autumn 5

14B028 Ethnoarchéologie automne 3

14B642 Faune Genevoise printemps 4

14B637 Génétique moléculaire des populations - Molecular Population Genetics

janvier/ January 5

14B038 Génétique moléculaire du développement et de l'évolution - chapitres choisis

annuel tous les 15 jours 4

14B071 Introduction à l'Archéologie Islamique : Moyen-Orient et Afrique automne 2

14B771 Introduction à l'Archéologie Islamique : Moyen-Orient et Afrique - séminaire automne 1

14B045 Introduction à la recherche en biologie moléculaire des végétaux annuel 4

14B017 Master course in Genetics, Development and Evolution

Autumn/ Spring 9

14B063A Microscopy and imaging course Autumn 3

14B778 Molecular Biology journal club and progress reports

Autumn/ Spring 5

14B035 Molecular Plant Sciences - Basic Research Autumn 4

112

14B037 Molecular Plant Sciences - Applied Aspects Autumn 4

7312D Neurobiologie de la représentation spatiale (la) printemps 3

14N12 Neurosciences : Chemical senses Autumn 3

14B062 Paléolithique et Néolithique de l'Afrique : des premiers outils à la mise en place des sociétés complexes

automne 6

14B657 Phylogénie et évolution moléculaire - stage annuel 5

14B648 Plant Science Symposium and Geneva Plant Seminars

Autumn/ Spring 1

24N01 Principles of neurobiology I Autumn 3

14N11 Principles of neurobiology II Autumn 3

14F006 Programming for bioinformatics Autumn 7

14B010 Principles of cellular and molecular biology - Biologie cellulaire et moléculaire approfondie

Autumn/ Spring 8

14B773 Progress report in Cell Biology - seminar Autumn/ Spring 3

14B048 Protohistoire de l'Afrique : de l'apparition du métal à la mise en place des grands empires automne 6

14B748 Protohistoire de l'Afrique : de l'apparition du métal à la mise en place des grands empires - séminaire

automne 3

14B012 Scientific writing and communication Spring 2

14B669 Stage de botanique tropicale 2 semaines en

région tropicale

5

14B057 Statistics and probability Autumn 5

14B951 Statistiques appliquées - travaux pratiques printemps 1

14B067 Technologie préhistorique automne 3

14B767 Technologie préhistorique - séminaire automne 3

Pour consulter les informations relatives aux divers enseignements.

Veuillez, vous référer aux programmes des cours sur internet.

Section de biologie

!

!

• Liste des enseignements à choix libre & à choix restreint

Partie V Les cours à choix

113

!ADVANCED'STUDIES'IN'SYSTEMATICS' 14B013'Compulsory'Master'course'for'option'«'Biodiversity'and'Systematics'»'Cours'obligatoire'pour'l’orientation'«'Biodiversité'et'systématique'»'du'master!!Period' Autumn! !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!year!24h!ECTS' 2!

!Day' 30!&!31!October,!1st!November!2019!

8h<12h,!13h<17h!!

Place''

Conservatoire!et!Jardin!botaniques,!salle!de!séminaire!de!la!Console!!(192!rue!de!Lausanne,!1202)!&!Muséum!d’Histoire!Naturelle!!(1!Route!de!Malagnou,!1208)!!

Evaluation'mode! Written!report!/!rapport!écrit!!!

Exam'sessions' January/February!+!catch<up!August<September!!' !Person'in'charge'!!

NACIRI!Yamama!–!022!418!5165!–!yamama.naciri@ville<ge.ch!ou!yamama.naciri@unige.ch!

Teachers! Mrs!:!A.!CIBOIS!(chargée!de!recherche),!!Y.!NACIRI!(cc),!M.!PRICE!(pt),!!!

Mr!:!N.!ALVAREZ!(conservateur),!Ph.!CLERC!(cc),!P.!SCHUCHERT! (chargé!de!recherche),!M.!PERRET!(cc),!!A.!SCHMITZ!(chargé!de!recherche),!F.!STAUFFER!(cc).!

!Miscellaneous!This'course'is'taught'in'English.!!Please'register'with'Yamama'Naciri'in'early'September'2019.!!!The!course! is! based!on!both!theoretical! lectures!and!applied!exercises! (visits,! exercises,!article!reviews,!etc…).!Students!should!come!with!their!own!computers.!!Contents'This!course!covers!the!fundamentals!of!the!science!of!systematics!and!allows!students!to!familiarise!themselves!with!the!processes!of!and!tools!involved!in!modern!taxonomy.!The!importance!of!taxonomy!and! systematics! in! the! description! and!management!of! biodiversity! is! explored!alongside!new!approaches!to!the!description,!definition,!classification!and!understanding!of!life!on!Earth,!and!the!processes!that!shaped!it.!The!course!addresses!three!main!topics:!(1)!theoretical!and!practical!aspects!of! taxonomy,!systematics! and! nomenclature! in! plants,! fungi! and! animalsf! (2)! the! description,!delimitation!and!classification!of!species!with!a!special!focus!on!molecular!techniquesf!(3)!techniques!in!plant!and!animal!systematics.!!The!course!builds!on!frontal!and!interactive!modes!of!education.!The!last!afternoon!the!students!are!given!two!case!studies,!one!in!botany!and!one!in!zoology,!(data!to!analyse,!herbarium!specimens,!photos,!descriptions,!etc...)!and!are!asked!to!give!their!advice!on!the!way!species!have!been!described.!!!Objective'Upon!conclusion!of!the!course,!the!students!are!expected!to!be!able!to!!<understand!the!basics!of!naming!and!nomenclature!<use!an!identification!key!<explore!the!definition!of!species!and!species!concepts.!<have! a! critical! understanding!of!species! delimitation! and! be! able! to! analyse!species! from! a!morphological!and!molecular!perspective!<be!aware!of!and!explain!the!importance!of!modern!taxonomy!!!

114

!ANTHROPOLOGIE,BIOLOGIQUE,ET,CULTURELLE,,,Séminaire,

14B701,

Cours,à,choix,de,2ème,et,3ème,années,,Semestre,,

automne!! 2h/sem,!total!28h!

ECTS,,

3!

Jour, 1ère,séance,le,vendredi,20,septembre,2019,à,11h15.!Puis!horaire!à!déterminer!avec!les!étudiants!!

Lieu, Sciences!II,!salle!449!!

Mode,d’évaluation! exposé!oral!et!rapport!écrit!!

Responsables,et,Enseignant(e)s,!

Monsieur!N.!HUBERT!Van!BLYENBURGH!(cc)!N!022.379.6978/67!ninian.hubert@unige.ch!!Madame!N.!BORDESSOULE!GILLERON!(ce)!nadine.bordessoule@unige.ch!!Madame!A.!SANCHEZNMAZAS!(po)!alicia.sanchezNmazas@unige.ch!!!

Divers!Une!première!séance!d’information!et!d’organisation!du!séminaire!aura!lieu!le!vendredi,20,septembre,2019,à,11h15,dans,la,salle,449,,à,Sciences,II.!

!Ce! séminaire! s’articule! avec! le! cours! 14B030,«,Histoire, des, représentations,de, la,diversité,biologique,et,culturelle,des,humains,et,de,leurs,origines,».!Il!propose!de!revenir!plus!longuement!sur!les!textes!historiques!et!actuels!fondateurs!de!l’anthropologie!biologique!et!culturelle.!Il!s’adresse!aux! étudiantNeNs! l’ayant! suivi! comme! à! celles! et! ceux! intéresséNeNs! par! l’anthropologie!et! sa!construction.!,!Il!réunit!des!étudiantNeNs!de!la!faculté!des!Lettres!et!de!la!faculté!des!Sciences.!Les!étudiantNeNs!de!la!faculté!des!lettres!suivent!le!séminaire!«!Regards!sur!l’interculturalité!»!proposé!par!cette!faculté.!!!Contenu,

Comment!se! fabrique!le!regard!sur! l’Autre!?!Comment! la!science!aNtNelle!contribué!à!construire!la!culture!depuis!le!début!du!18e!siècle!?!Comment!s’est!élaborée!la!question!de!l’altérité,!à!travers!le!temps!comme!à!travers!l’espace!?!Quels!sont!les!enjeux!fondamentaux!articulés!dans!des!textes!ayant!pour!particularité!d’avoir!l’humain,!son!origine!et!sa!diversité!comme!objets!de!réflexion!?!Les!étudiantNeNs!participant!à!ce!séminaire!sont!invitéNeNs!à!choisir!un!ouvrage,!un!article!ou!un!film!dans!une!liste!d’auteurs!historiques!et!contemporains!importants!comme!Bensa,!Buffon,!Blumenbach,!Darwin,! Gobineau,!Kropotkine,!Latour,!Leach,!LéviNStrauss,!Mucchielli,! Rouch!ou!Rousseau.!Au!moyen!d’une!grille!d’analyse!proposée!par!les!enseignantNeNs,!le!texte!ou!le!document!est!analysé,!puis!présenté!à!l’ensemble!des!participantNeNs!au!séminaire.!!

Les!premières!séances!seront!consacrées!au!rappel!et!à!la!discussion!de!quelques!conceptsNclefs!en!anthropologie!biologique!et!culturelle.!Pour!développer!certaines!thématiques,!des!spécialistes!d’un!domaine!pourront!être!invités!à!intervenir.!!Par!l’appropriation!de!textes!fondateurs,!le!séminaire!d’anthropologie!biologique!et!culturelle!développe!une!meilleure!compréhension!des!enjeux!fondamentaux!de!cette!discipline.!!!Objectifs,Par! la!présentation!et!la!discussion!de!textes!scientifiques!historiques!importants!et!de!documents!représentatifs!de!l’évolution!de! la!pensée!dans!ce!champ!disciplinaire,!ce!séminaire!propose!de!développer!la! capacité!de! réflexion!et!d’analyse!des!participantNeNs!sur! les! thématiquesNclés!de!l’anthropologie!biologique!et!culturelle.!!!

115

!!!ARCHEOZOOLOGIE+ II+,+La+domestication+des+animaux+ 14T010+Cours+obligatoire+,+Master+en+archéologie+préhistorique++!Semestre+ printemps!! 2h/sem,!total!28h!+ ! !ECTS+ 3!+ !Jour+ lundi!13h615h!!

!Lieu+ Muséum!d’histoire!naturelle,!Malagnou!

!Mode+d’évaluation! examen!oral!!

!Sessions+d'examens+++

juin!+!rattrapage!août6septembre!

Responsable+!

NN!!

Enseignant(e)s! NN!!

!Divers!

+A+LIEU+TOUS+LES+DEUX+ANS.++

+Contenu+Histoire!des!premiers!élevages!et!présentation!des!processus!qui!ont!permis!à!certains!animaux!de!passer!du!statut!de!gibier!à!celui!d'animaux!domestiques.!!!

116

!

ARCHEOZOOLOGIE+ II+:+Étude+d’un+ensemble+faunique+préhistorique+

14T900+

Travaux+pratiques+II+obligatoire+I+Master+en+archéologie+préhistorique++!

Semestre+ automne/printemps!! 40h/sem,!total!40h!

+ ! !

ECTS+ 3!

+ !

Jour+ une!semaine!à!convenir!

!

Lieu+ Muséum!d’histoire!naturelle,!Malagnou!

!

Mode+d’évaluation! participation!active!aux!séances!et!remise!d’un!rapport!

!

PréIrequis+++

avoir!suivi!avec!succès!les!travaux!pratiques!I!:!ostéologie!comparée!

Responsable+!

NN!

!

Enseignant(e)s! NN!

!

!

Divers!+

A+LIEU+TOUS+LES+DEUX+ANS.+++

Contenu+Analyse!d'un!lot!d'ossements!provenant!d'un!site!préhistorique!(identifications,!traces,!mesures,!

rédaction).!

!

!!

ARCHEOZOOLOGIE+LA+CHASSE+ 14T014++Semestre++

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS++

3!

Jour++

lundi!de!13h00!–!15h00!

Lieu++

Museum!d’Histoire!Naturelle!

Mode+d’évaluation+!

Oral!

Responsable+!

NN!

!

Enseignant(e)s++

NN!

!

Divers+A+lieu+tous+les+deux+ans.++

+Contenu+Ce! cours! relate! la! chasse!lorsque! l'homme! était!encore!chasseurCcollecteur!ou!agriculteurC

éleveur,!avec!la!présentation!des!animaux!chassés!et!les!différentes!stratégies!développées.!

!

!

117

!ARCHEOZOOLOGIE+ :+OSTEOLOGIE+ COMPAREE+ 14T015+Travaux+pratiques++Semestre++

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS++

2!

Jour++

lundi!de!15h00!–!17h00!

Lieu++

Museum!d’Histoire!Naturelle!

Mode+d’évaluation+!

Certificat!

Responsable+!

NN!!

Enseignante++

NN!!

+ !Contenu!Cet!enseignement,!de!niveau!bachelor,!offre!l'apprentissage!des!critères!morphologiques!permettant!la!détermination!des!espèces!communes!de!la!faune!préhistorique.!+Divers+

A+lieu+tous+les+deux+ans.+++

+!!

118

!ASTRONOMIE*GENERALE* 10A001*Cours*à*choix*de*2ème*année*!

Semestre**

automne!! 1h/sem,!total!14h!

ECTS**

2!

Jour* mardi!17h45!!

Lieu**

Sciences!II,!salle!A300!

Mode*d’évaluation! Travail!de!recherche!examen!oral!!!

Sessions*d'examens* janvier/février!+!rattrapage!aoûtFseptembre!!

Responsable*!

Prof.!C.!CHARBONNEL!F!022!379!2454!F!Corinne.Charbonnel@unige.ch!

Enseignante! Prof.!C.!CHARBONNEL!(pas)!!Contenu*Lecture!astrophysique!du!tableau!de!Mendeleïev!!Objectifs*En!1869,!Mendeleïev!inventait!la!classification!périodique!des!éléments,!et!révolutionnait!la!chimie,!la!physique!et!la!biologie.!Depuis,!l’astrophysique!nucléaire!a!permis!de!décrypter! les!processus!de!production!des!éléments!chimiques!qui!composent!notre!Univers.!2019,!déclarée!"Année!internationale!du!tableau!périodique!des!éléments!chimiques!(IYPT2019)"!par!l'Assemblée!générale!des!Nations!Unies! et! l'UNESCO,! sera!pour!nous! l’occasion!de!parcourir! ces!150!ans!de!découvertes.!Nous!présenterons!les!méthodes!d’observation!qui!permettent!aux!astronomes!de!déterminer!la!composition!chimique!des! astres! célestes,!étoiles,!planètes,!comètes,!milieu! interstellaire,!et! galaxies.!Nous!décrirons!les!concepts!de!base!de!physique!et!d’astrophysique!nucléaire,!les!principaux!mécanismes!de!nucléosynthèse!dans!différents!sites!astrophysiques,!du!Big!Bang!aux!étoiles,!et!les!grandes!lignes!de!l’évolution!chimique!des!galaxies!et!de!l’Univers!dans!son!ensemble.!Le!cours!illustrera!également!les! aventures!humaines! et! les! révolutions! intellectuelles!et! technologiques!qui! ont! mené! aux!connaissances!actuelles.!!Le!cours!s’adresse!à!un!large!public!et!ne!requiert!pas!de!connaissances!préalables!en!astronomie.!Il!est!dispensé!par!Corinne!Charbonnel,!Professeure!au!Département!d’Astronomie!de!l’Université!de!Genève.!!!!!

119

!BES$MESURES$DE$LA$DIVERSITE$ 14E156$$Semestre$$

printemps!5!jours! total!28h!

ECTS$$

3!!

Jour$$

mardi!14h15718h!Cours!bloc,!semaine!1!à!7!7!séances!(dates!2019!à!préciser,!voir!planning!du!master!MUSE)!!

Lieu$$

Uni!Carl!Vogt!salle!CV004!

Mode$d’évaluation$!

Examen!pratique!sur!ordinateur.!

PréDrequis$$

Notions!de!base!en!écologie!des!communautés,!pratique!de!base!du!logiciel!R.!!

Responsable$!

Monsieur!E.!CASTELLA!7!022.379.0485!7!emmanuel.castella@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!E.!CASTELLA!(mer).!!

Contenu$Ce! cours!et! les!exercices! associés!abordent!l'analyse!de! la! diversité!biologique!et!des!notions!associées!à!partir!d'exemples!concrets!(jeux!de!données)!et!de!procédures!d'analyse.!Il!est!destiné!à!fournir!des!outils!de!description!et!de!mesure!de!la!diversité!des!communautés!vivantes.!Le!cours!est!construit!sur!un!certain!nombre!de!choix!préalables!:!7! C'est!la!diversité!spécifique!(diversité!des!espèces!au!sein!d'assemblages)!qui!est!abordée.!7! Le!logiciel!R!est!employé!comme!outil!de!base!dans!les!analyses.!!Objectif$7! Acquérir! la! pratique!de! techniques!d'exploration,!de!description!et!d'analyse!de! la!diversité!

d'assemblages!d'espèces!à!différentes!échelles!spatiales!(diversités!alpha,!beta,!gamma)!et!en!intégrant!la!notion!de!diversité!fonctionnelle.!

7! Utiliser!des!informations!relatives!à!la!biologie!et!l'écologie!des!espèces!afin!de!mener!une!analyse!fonctionnelle!de!la!diversité!

!!

120

!

BIOCHIMIE(III( 13C908X(Travaux(pratiques(à(choix(restreint(de(3ème(année!Semestre((

automne!! 4h/jour!sur!3!sem,!total!60h!

ECTS((

3!

Jours(&(lieu(( lundi!au!vendredi!13h30!8!17h30,!salle!104C8!Sciences!II!

!

du(30(septembre(au(18(octobre(2019((!

Sciences!II,!1er!étage,!labo!104C!

!

Mode(d’évaluation! rapports!d'expériences!8!certifiés!!

!

PréLrequis( Biochimie,!2ème!année!!

!

Responsable(!

Monsieur!Th.!SOLDATI!–!022.379.6496!8!thierry.soldati@unige.ch!

Enseignants! Assistants!du!département!de!biochimie!

!

Divers(!

Les!inscriptions!des!travaux!pratiques!à!choix!restreint!de!3ème!année!sont!obligatoires.!Les!inscriptions!s'effectueront!en(ligne!!!!

(Vous!recevrez!des!informations!complémentaires!par!e8mail!à!la!miLfévrier.!!!

IMPORTANT(:!Les!protocoles!de!Travaux!Pratiques!sont!disponibles!au!Secrétariat!du!Département!de!biochimie!(Mme!C.!Heymans,!Sciences!II,!bureau!347A,!3e!étage)!le!vendredi!avant!le!début!des!

Travaux!Pratiques.!

!

Objectifs(Ces!Travaux!Pratiques!mettent!l’accent!sur! la!découverte!et!l’application!de!techniques!de!base!

utilisées!dans!les!laboratoires!de!biologie!et!biochimie.!!

!

Contenu(1.!Isolation!de!l’ADN!génomique!de!Dictyostelium,discoideum!2.!Protéines!membranaires!I!

3.!Extraction!des!lipides!et!analyse!CCM!

4.!Protéines!membranaires!II!

5.!Chromatographie!d'affinité!

!

ELlearning(:(https://chamilo.unige.ch/home/courses/13C908X/!!

Documentation(et(bibliographie(:!Protocole!de!Travaux!Pratiques!!

(partiellement!en!anglaisc!disponible!sur!Chamilo).!

!

!

!

121

!BIOCHIMIE(III( 13C008A(Cours(à(choix(restreint(de(3ème(année( !Semestre((

automne!! 3h/sem,!total!42h!

ECTS((

*3!(en!choix!restreint)!**4.5!(en!choix!libre)!!

Jours(&(lieux(( mardi!8h15!>10h!Sciences!II,!salle!A50A!!jeudi!!8h15!>!9h!Sciences!II,!salle!1S059!!

Mode(d’évaluation! écritF!l'examen!de!janvier>février!porte!sur!la!partie!de!l'enseignement!dispensée!en!automne!!

PréGrequis( Biochimie!II!–!automne!(12C008A)!et!printemps!(12C008P)!!

Sessions(d'examens( février!+!rattrapage!août>septembre!!

Responsable(!

Monsieur!Th.!SOLDATI!–!022.379.6496!>!thierry.soldati@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!Th.!SOLDATI!(pas),!M.!KAKSONEN!(po),!C.!AUMEIER!(past),!!B.!WEHRLE>!HALLER!(pas),!J.!MONTOYA!(ce),!!Madame!M.>C.!BLATTER!(ce).!

!Divers(Préparation!pour!le!BSc!en!biochimie,!le!BSc!en!biologie!et!le!MSc!en!sciences!pharmaceutiques.!Cours!ex>cathedra.!!**Etudiants!en!chimie/biochimie:!9!ECTS,!acquis!lorsque!la!moyenne!des!!!!!examens!d'automne!(13C008A)!et!de!printemps!(13C008P)!est!égale!ou!supérieure!à!4.0!*!/!**!Etudiants(en(biologie:(6(ECTS!en!choix!restreint!et!9!ECTS!en!choix!libre,!acquis!lorsque!la!moyenne(des(examens(d'automne(et(de(printemps!est!égale!ou!supérieure!à!4.0.!!Objectifs(Ce! cours! met! l'accent! sur! les! processus! dynamiques! de! motilité,! morphogénèse,! traffic!intracellulaire,!communication!et!signalisation!cellulaireF!il! présente!les!concepts!fondamentaux!(cours!du!mardi)!et!les!techniques!associées!(cours!du!jeudi).!!Contenu(>!Cytosquelette!>!Adhésion!et!communication!cellulaires!>!Transport!cellulaire!>!Sécrétion!>!Endocytose!>!Techniques!de!biophysique!et!biologie!cellulaire!du!cytosquelette,!du!!!!!transport!cellulaire!et!de!bioinformatique.!!EGlearning(:(https://chamilo.unige.ch/home/courses/13C008A/!!Documentation(et(bibliographie(:!J.!Berg,!J.L.!Tymoczko,!L.!Stryer!(2006).!Biochemistry,!6e!édition,!!W.H.!Freeman,!New>York.!ISBN!10:!0>7167>8724>5:!!Alberts!et!al.!(2007).!Molecular!Biology!of!the!Cell,!5e!edition,!Garland!Press:!ISBN.10!0>8153>4106>7!!!

122

!

BIOCHIMIE(III( 13C008P(Cours(à(choix(restreint(de(3ème(année(!Semestre((

printemps!! 3h/sem,!total!42h!

ECTS((

*3!(en!choix!restreint)!**4.5!(en!choix!libre)!!

Jours(&(lieux(( mardi!8h15!>10h!Sciences!II,!salle!A50A!!jeudi!!8h15!>!9h!Sciences!II,!salle!1S059!!

Mode(d’évaluation! écritG!l'examen!de!juin!porte!sur!la!partie!de!l'enseignement!dispensée!au!printemps.!!

PréFrequis( Biochimie!III!–!automne!(13C008A)!!

Sessions(d'examens( Juin!+!rattrapage!août>septembre!!

Responsable(!

Monsieur!Th.!SOLDATI!–!022.379.6496!>!thierry.soldati@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!Th.!SOLDATI!(pas),!M.!BROCHET!(past),!!M.!GONZALEZ!GAITAN!(po),!R.!LOEWITH!(po),!J.>M.!MATTER!(mer),! !O.!SCHAAD!(ce),!P.!GUICHARD!(past).!

!Divers(Préparation!pour!le!BSc!en!biochimie,!le!BSc!en!biologie!et!le!MSc!en!sciences!pharmaceutiques.!Cours!ex>cathedraG!les!heures!d'enseignement!du!Prof.!R.!Loewith!seront!dispensées!en!anglais.!!**Etudiants!en!chimie/biochimie:!9!ECTS,!acquis!lorsque!la!moyenne!des!!!!!examens!d'automne!(13C008A)!et!de!printemps!(13C008P)!est!égale!ou!supérieure!à!4.0!*/**!Etudiants(en(biologie:(6(ECTS!en!choix!restreint!et!9!ECTS!en!choix!libre,!acquis!lorsque!la!moyenne(des(examens(d'automne(et(de(printemps!est!égale!ou!supérieure!à!4.0.!!Objectifs(Ce! cours! met! l'accent! sur! les! processus! dynamiques! de! motilité,! morphogénèse,! traffic!intracellulaire,!communication!et!signalisation!cellulaireG!il! présente!les!concepts!fondamentaux!(cours!du!mardi)!et!les!techniques!associées!(cours!du!jeudi).!!Contenu(>!Communication!cellulaire!>!Transduction!du!signal!>!Signalisation!intracellulaire!et!intercellulaire!>!Techniques!de!biologie!structurale!et!de!communication!cellulaire!!EFlearning(:(https://chamilo.unige.ch/home/courses/13C008P/!!Documentation(et(bibliographie(:!J.!Berg,!J.L.!Tymoczko,!L.!Stryer!(2006).!Biochemistry,!6e!édition,!W.H.!Freeman,!New>York.!ISBN!10:!0>7167>8724>5:!!Alberts!et!al.!(2007).!Molecular!Biology!of!the!Cell,!5e!edition,!Garland!Press:!ISBN.10!0>8153>4106>7!!!

!

123

!!BIODIVERSITE*DANS*LE*TEMPS*ET*L'ESPACE,*DES*SINGULARITES*DE*NOTRE*SYSTEME*SOLAIRE*A*L'ANTHROPOCENE*

14B078*

Semestre**

Printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!

Jour***

Jeudi!14h15!:16h00!

Lieu* Sciences!III!salle!1S081!!

Mode*d’évaluation*!

Rapport!écrit!et!examen!écrit!

Sessions*d'examens**

juin!+!rattrapage!août:septembre!

Responsable*!

Professeur!N.!ALVAREZ!–!022!418!64!56!:!nadir.alvarez@ville:ge.ch!/!nadir.alvarez@unige.ch!!

Enseignant(e)s**

ALVAREZ!N.!(pt),!à!moyen!terme,!intervention!de!collaborateurs!scientifiques!du!Muséum!d’Histoire!Naturelle!!

Divers*Ce!cours!optionnel!est!ouvert!à!tous!les!étudiants!de!la!Faculté!des!Sciences,!notammen t !dans!les!domaines!de!la!Biologie,!de!la!Médecine,!et!des!Sciences!de!l’Environnement.!!!Nombre!de!participants!au!minimum*5*!!!S'inscrire*avant*la*rentrée*du*semestre*de*printemps!auprès!du!responsable!:!nadir.alvarez@unige.ch!indépendamment!de!l'inscription!officielle!en!mars!!!!Contenu*A!travers!un!voyage!dans!le!temps!et!l’espace,!qui!nous!emmènera!des!origines!de!notre!planè te!à !la!6ème!extinction!de!masse,!nous!aborderons!les!processus!au!cœur!du!lien!entre!la!Terre!et!la !v ie . !Nous!traiterons!des!grandes!révolutions!biologiques!qui!ont!permis!l’extraordinaire!diversification!des!organismes!passés!et!actuels,!et!nous!focaliserons!également!sur!l’histoire!naturelle!de!l’Europe,!de !l’Amérique!du!Nord!et!de!l’Océanie,!depuis!l’ère!Tertiaire.!Nous!montrerons!comment!l’extraordinaire!richesse!des!collections!d’histoire!naturelle!nous!permet!non!seulement!de!cataloguer!le!vivant,!mais!également!de!l’utiliser!comme!matériel!de!base!pour!comprendre!l’évolution!biologique!à!tou tes!le s!époques! et! dans! tous! les!milieux,!notamment!au!vu!des!développements! récents!en!Museum&Genomics.!Enfin,!une!partie!importante!du!cours!sera!consacrée!à!l’interaction!entre!notre!espèce!et!le!reste!de!la!biosphère,!au!cours!de!l’Anthropocène,!que!nous!définissons!ici!dans!sa!forme!la !p lu s!large,!à!savoir!depuis!le!début!des!extinctions!de!la!mégafaune!causées!par!les!pressions!humaines.!Nous!verrons!notamment!qu’au!cours!de!cette!période,!l’Homme!a!contribué!à!la!diversification!de!la !biodiversité,!en!particulier!au!sein!du!compartiment!domestiqué,!et!en!parallèle,!a!catalysé!son!extinction!au!sein!de!nombreux!groupes!systématiques.!!Objectif*!

:! Replacer! la! crise! majeure! actuelle! de! la! biodiversité! dans! un! contexte! évolutif! et!historique,!en!appréhendant!le!lien!constant!entre!les!processus!vivants!et!notre!planète.!!

:! Comprendre!l’importance!de!la!systématique!et!du!Museum&Genomics!dans!le!champ!de !connaissance!de!la!biodiversité.!

:! Appréhender!le!rôle!des!muséums!comme!témoins!de!l’Anthropocène.!!!!

124

!BIODIVERSITE*:*origine*et*évolution* 14B005*Chapitres*choisis!Cours*obligatoire*pour*l’orientation*de*master*«*Biodiversité*et*systématique»*!Semestre**

automne!! 3*6h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!!

Jours** jeudi!14h15!*!17h,!en!novembre!&!décembre!mercredi!14h15!*!17h!en!décembre!!!

Lieu* Sciences!III,!salle!0019!!

Mode*d’évaluation!

examen!écrit,!rapports!!!

Sessions*d'examen*offertes*

janvier*février!+!rattrapage!août*septembre!

Responsables*!!

Monsieur!M.!PERRET!*!022.418.5195!–!mathieu.perret@ville*ge.ch!Monsieur!J.!MONTOYA!BURGOS!*!022.379.67.86!juan.montoya@unige.ch!

Enseignant(e)s! Mesdames!A.!CIBOIS!(cr),!Y.!NACIRI!(cc),!A.!SANCHEZ*MAZAS!(po),!!Messieurs!L.!CAVIN!(cons.),!J.!MONTOYA!BURGOS!(ce),!!M.!PERRET!(cons.),!X.!PERRET!(mer),!M.!RUEDI!(cons.).!

!

Divers*Inscription*par*eQmail*auprès*des*responsables*du*cours.!!Ce!cours!peut!être!suivi!quelle!que!soit!l'option!du!master!choisie.!Ce!cours!n'a!lieu!que!s'il!y!a!au!moins!3!étudiants!inscrits.!!!Objectifs*Ce!cours!a!pour!but!de!former!l'étudiant(e)!de!manière!théorique!et!pratique!aux!divers!thèmes!de!la!biodiversité!en!tant!que!discipline!des!sciences!biologiques.!Il!est!orienté!sur!la!compréhension!des!processus!et!mécanismes!à!l'origine!de!la!diversité!des!organismes.!Pour!mieux!appréhender!les!concepts!théoriques,!l'étudiant(e)!apprendra!à!utiliser!des!outils!bioinformatiques!d'analyse!au!moyen! d'exercices! pratiques.! Des! présentations! et! discussions! d'articles! compléteront!l'enseignement.!!Les!capacités!et!compétences!qui!devront!être!acquises!au!terme!de!ce!cours!sont:!

•! Connaître!les!changements!majeurs!de!biodiversité!dans!le!temps!géologique.!•! Expliquer!les!processus!menant!à! la! formation!des!espèces!et!à! la!diversification!des!

lignées.!•! Interpréter!des! données!de!répartition!des!espèces!dans!un! cadre!de!biogéographie!

historique.!•! Proposer!des!hypothèses!pouvant!expliquer!l'histoire!de! la!diversification!d'un!groupe!

taxonomique!au!vu!d'une!série!d'observations.!•! Identifier!le!type!et!la!quantité!de!données!nécessaires!pour!évaluer!la!vraisemblance!d'un!

processus!de!diversification!ou!de!répartition!spatiale.!Identifier!et!utiliser! la! méthode!d'analyse!ou!l'outil!bioinformatique!le!plus!approprié!à!un!cas!particulier.!Contenu**!Evolution!de!la!biodiversité,!vision!paléontologique!*!Processus!de!spéciation,!hybridation!*!Radiations!évolutives,!diversifications,!évolution!phénotypique!!*!Phylogéographie,!dynamique!spatiale,!refuges!climatiques!*!Biogéographie!historique,!dispersion,!vicariance!*!Mesure!de!biodiversité!phylogénétique,!hotspots!de!biodiversité!*!Biodiversité!microbienne:!coévolution,!intégrité*identité!génomique,!!!métagénomique!*!Menaces,!conservation!de!la!biodiversité.!!!

125

BIOETHIQUE) 13B003)Cours)à)choix)de)2ème)année)/)Cours)à)choix)restreint)de)3ème)année!!)Semestres) automne/printemps!

!2h/sem,!total!52h!

ECTS) 6!Jours)))

jeudi!12h30!9!14h!!

Lieu) Sciences!III,!salle!0019!!

Mode)d’évaluation! examen!écrit!!!

Sessions)d'examens) juin!+!rattrapage!août9septembre!!

Responsables)!!

Madame!S.!HURST!–!022!379.4601!–!samia.hurst@unige.ch!!!Madame!C.!CLAVIEN!9!022!379.46099!christine.clavien@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Mesdames!S.!HURST!(Prof!as),!C.!CLAVIEN!(mer),!C.!MORET!(as),!!A.!DALLE!AVE!(Cheffe!de!Clinique,!Unil)!Messieurs!Ph.!DUCOR!(Prof!as),!G.!HESS!(mer,!Unil),!!C.!FOPPA!(chargé!d’enseignement),!F.!COVA!(maître!as)!

Contenu)Semestre)automne)•! Origines!de!la!bioéthique!•! Bases!philosophiques!•! Objectivité!morale!•! Éthique!de!la!recherche!sur!l'être!humain!•! Déontologie!du!chercheur!•! Expérimentation!animale!•! Procréations!médicalement!assistées!•! Statut!de!l’embryon!et!de!la!personne!•! Génétique!médicale!•! Thérapie!cellulaire,!cellules!souches!!Semestre)printemps!•! Du!naturel!au!moral!•! Impact!des!données!scientifiques!sur!les!moralistes!!•! Altruisme!biologique!et!psychologique!•! Explications!évolutionnaires!de!nos!facultés!morales!•! Principe!de!précaution!•! Ethiques!environnementales!et!éthique!du!développement!durable!•! Tragédie!des!communs!•! Transplantation!•! Fin!de!vie!•! Biobanques!et!protections!des!données!•! Justice,!médicaments!et!allocation!des!ressources!•! Propriété!intellectuelle!•! Enhancement,!neuroenhancement,!dopage!

!!!!Introduction!à!la!bioéthique!:!https://moodle.unige.ch/course/view.php?id=2967!

!Objectifs)Ce!cours!a!pour!objectif!de!développer!une!réflexion!critique!sur!les!implications!éthiques!de!la!recherche!scientifique!et!des!pratiques!médicales.!On!y!enseigne!les!outils!conceptuels!nécessaires!pour!!

•! aborder!les!questions!de!déontologie!de!la!recherche!en!général!et!de!la!pratique!médicale!en!particulier.!

•! traiter!les!problèmes!éthiques!engendrés!par!les!progrès!scientifiques.!!•! évaluer!l’impact!des!données!scientifiques!(notamment!issues!de!la!biologie!évolutionnaire!

et!des!neurosciences)!pour!une!meilleure!compréhension!de!la!moralité!humaine.!!

126

!BIOGEOGRAPHIE* 14B007*Cours*à*choix*de*2ème*et*3ème*années!Semestre**

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!!

Jour* Mardi!12h15714h!!

Lieu* Sciences!III,!salle!0019!!

Mode*d’évaluation! examen!écrit!!!

PréKrequis* Notions!de!base!en!biologie.!!

Sessions*d'examens** juin!+!rattrapage!août7septembre!!

Responsable*!

Monsieur!M.!PERRET!–!022.7418.5195!–!mathieu.perret@ville7ge.ch!!

Enseignant(e)s! Monsieur!M.!PERRET!(cc)!!Conservatoire!et!Jardin!botaniques!de!la!Ville!de!Genève,!!192!Chemin!de!l’Impératrice!1292!Chambésy!!

Contenu*Facteurs!abiotiques!et!biotiques!déterminant!la!distribution!des!espèces.!Stratégies!et! adaptations!des!plantes!à! leur! environnements:! type!biologique,!convergence,!adaptation!au!stress!et!à!la!perturbation,!mode!de!dispersion.!Distribution!des!communautés:!biomes,!étages!de!végétation.!Paléogéographie!et!paléoclimat!de!la!terre!au!cours!du!Cénozoïque!et!son!impact!sur!l’évolution!de!la!végétation!(origines!des!angiospermes,!forêts!tropicales,!plantes!C4,!glaciation!et!refuges).!Tectonique!des!plaques!et!échanges!biotiques.!Processus!biogéographiques!à!l’origine!de!la!biodiversité:!vicariance,!dispersion!et!extinction.!Biogéographie!historique:!centre!d’origine,!méthodes!phylogénétiques.!Biogéographie!des!îles:!relation!espèces7aire,!théorie!de!l’équilibre.!Géographie!de!la!biodiversité:!le!gradient!de!biodiversité!latitudinal!et!ses!causes.!Conservation!et!conséquences!des!activités!humaines!sur! la!biodiversité! (hotspot!mondial!de!biodiversité,!modifications!climatiques,!déforestation,!eutrophisation,!invasions).!!Divers*Prière*de*s'inscrire*au*cours*également*par*email*:*mathieu.perret@ville7ge.ch!!Ce!cours!est!ouvert!au!public!!Objectifs*Comprendre!les!causes!de!la!distribution!actuelle!des!organismes,!en!particulier!des!végétaux.!Connaître!les!formes!de!la!biodiversité!terrestre!et!comprendre!leur!origine!et!déterminisme.!Connaître!les!méthodes!permettant!de!reconstruire!l’histoire!des!lignées.!Prévoir! les! conséquences!sur! la!biosphère!des!changements!globaux! résultant!des!activités!humaines.!!

127

!

BIOINFORMATICS,FOR,INTERPRETING,FUNCTIONAL,2,OMICS,DATA,

14F018,

Course,and,exercises,,Period,,

Spring! year!40h!

ECTS, 3!

!

Day,&,place, Monday!9h30311h30!

Information:!https://moodle.unige.ch/!

Please!contact!Frederique.Lisacek@unige.ch!for!further!details.!

!

Evaluation,mode! Oral!exam!!

!

Exam,sessions, June!+!catching!August3September!

, !

Person,in,charge,!

F.!LISACEK!–!022.379.0195!–!frederique.lisacek@unige.ch!

Teacher! F.!LISACEK!(mer)!

,Contents,1.Background!

3!The!3omics!landscape!

3!A!focus!on!proteomics!and!interactomics!!

!

2.Methods!and!tools!

3!Network!biology!!

3!Network!analysis!

3!Standards!for!data!representation!

3!Visualisation!tools!

3.!!

!

Mapping!protein!interactomes!

3!Methodology!

3!Protein3protein!interactions!

3!Interaction!with!other!biomolecules!

3!Interactome!databases!

3!Interaction!prediction!and!curation!

!

4.!Lipidome,!phosphorylome,!glycome,etc.!

3!Methodologies!

3!Data!integration!

!

5Towards!synthetic!biology!

!

Objective,This!course!gives!an!overview!of!bioinformatics!applied!to!the!analysis!and!integration!of!3omics!

data,!especially!in! the!context!of!understanding!the!biological!role!of!proteins.!! The!course!

includes!regular!hands3on!practise!of!relevant!bioinformatics!tools.!Practical!work!also!involves!

scientific!article!reading!and!presenting.!

!

!

!!

128

!BIOLOGIE'HUMAINE'I'

Diversité'biologique' et'moléculaire'des'populations'humaines'

actuelles'

13B004'

Cours'à'choix'restreint'de'3ème'année'(1er'semestre)'

!Semestre'

'

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS'

'

3!!

Jour' mercredi!10h15!8!12h00!Début!du!cours!mercredi!18!septembre!2019.!!

Lieu' Sciences!II,!salle!457!!

Mode'd’évaluation! examen!écrit!de!3h!!

Sessions'd'examens' février!+!rattrapage!août8septembre!!

Responsable'

!Madame!A.!SANCHEZ8MAZAS!8!022.379.6984/67!!alicia.sanchez8mazas@unige.ch!!

'

Enseignant(e)s!!Madame!A.!SANCHEZ8MAZAS!(po),!!Monsieur!T.!GOEURY!(as).!!

Divers'

Le'cours'de'biologie'humaine'est'structuré'en'deux'parties[!l'une!au!semestre!d'automne'(13B004!Diversité)biologique)et)moléculaire)des)populations)humaines)actuelles)!et!l'autre!au!semestre!de!printemps'(13B005!Evolution)du)genre)humain,)des)origines)à)nos)jours).!!Le!cours!pris!par!les!étudiant(e)s!en!biologie!comme!cours'à'choix'restreint'de'3ème'année!doit!être!suivi!dans!son!intégralité!(semestres!d’automne!et!de!printemps)!pour!obtenir!6!ECTS.'La'note'finale'est'alors'la'moyenne'des'deux'notes'des'semestres'd’automne'et'de'printemps.'

'

Chaque!semestre!peut!également!être!choisi!comme!cours!à!choix!libre!comptant!pour!3!ECTS.!!Contenu'

Caractéristiques! du! génome! humain! /! Diversité! des! caractères! moléculaires! (polymorphismes!génétiques)!/!Diversité!des!caractères!morphologiques!(stature,!etc..),!pigmentaires!(couleurs!de!peau,!etc..)!et!physiologiques!(taux!d’hémoglobine,!etc..)!/!Tolérances!ou!intolérances!à!certains!aliments!et!médicaments!/! Résistances!ou!susceptibilités!à!certaines!maladies! /!Adaptations!biologiques!aux!environnements!(ensoleillement,!altitude,!etc)!/!Similarités!et!différences!biologiques!entre!populations!/!Mécanismes!évolutifs!expliquant!la!diversité!biologique!humaine!/!Us!et!abus!du!profilage!génétique.!Aspects!méthodologiques!:!modèles!et!tests!d'hypothèses!en!génétique!des!populations!/!Introduction!à!la!génétique!quantitative!/!Modélisation!en!génétique!évolutive.!!Objectifs'

Ce!cours!aborde!la!diversité!biologique!des!humains!actuels!du!point!de!vue!des!divers!caractères!phénotypiques!et!moléculaires!qui! la! caractérisent!ainsi! que!des!mécanismes! évolutifs!qui! l’ont!façonnée.!Chaque!chapitre! inclut! une! partie! descriptive! (état! des! connaissances),!une! partie!méthodologique!(modes!actuels!d’analyse!des!données)!et!une!partie!pratique!(exercices,!y!compris!sur!ordinateur,!appliquant!les!connaissances!et!les!modes!d’analyse!sur!des!données!réelles).!Au!terme!de!cet!enseignement,!l’étudiant8e!aura!ainsi!acquis!les!bases!nécessaires!à!la!compréhension!et!à!l’étude!de!cette!discipline.!!!!

129

!BIOLOGIE'HUMAINE'II'Evolution'du'genre'humain,'des'origines'à'nos'jours'

13B005'

Cours'à'choix'restreint'de'3ème'année'(2ème'semestre)''Semestre''

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS''

3!!

Jour' mercredi!10h15!8!12h!Début!du!cours!mercredi!19!février!2020.!!

Lieu' Sciences!II,!salle!457!!

Mode'd’évaluation! examen!écrit!de!3h!!!

Sessions'd'examens' juin!+!rattrapage!août8septembre!!

Responsable'!

Madame!A.!SANCHEZ8MAZAS8022.379.6984/67!alicia.sanchez8mazas@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Madame!A.!SANCHEZ8MAZAS!(po),!Messieurs!N.!HUBERT!Van!BLYENBURGH!(cc),!M.!CURRAT! (mer).!!

Divers'

Le' cours'de' biologie'humaine' est'structuré' en'deux' parties^! l'une!au! semestre!d'automne'(13B004!Diversité) biologique)et)moléculaire) des) populations)humaines)actuelles)!et! l'autre! au!semestre!de!printemps'(13B005!Evolution)du)genre)humain,)des)origines)à)nos)jours).!!

Le!cours!pris!par!les!étudiant(e)s!en!biologie!comme!cours'à'choix'restreint'de'3ème'année!doit!être!suivi!dans!son!intégralité!(semestres!d’automne!et!de!printemps)!pour!obtenir!6!ECTS.'La'note'finale'est'alors'la'moyenne'des'deux'notes'des'semestres'd’automne'et'de'printemps.!Chaque!semestre!peut!également!être!choisi!comme!cours!à!choix!libre!comptant!pour!3!ECTS.!!Contenu'Place!de!l’humain!parmi! les!primates! /!Evolution!biologique!pré8humaine!et!humaine!d’après!les!données!de!la!paléontologie!(étude!des!fossiles,!avec!séance!de!TP)!/!Evolution!d’Homo)sapiens!et!ses!liens!avec!d’autres!humains!aujourd’hui!disparus!(Neandertal,!Denisova,!..)!d’après!les!données!de!l’ADN! actuel!et!ancien!/!Histoire!planétaire!des!peuplement!des!continents!par!les!populations!humaines!anatomiquement!modernes!d’après!des!hypothèses!basées!sur! l’étude!de! leurs! traits!biologiques!(diversité!phénotypique!et!moléculaire)!et!culturels!(diversité!linguistique,!diversité!des!modes!de!vie!déduits!des!vestiges!archéologiques)!et!sur!leurs!adaptations!à!divers!environnements!/! Discussion!:! que!peut8on!dire! aujourd’hui!sur! la! diversité! et! l’évolution!humaines!d’après! les!connaissances!scientifiques!?!!Objectifs'L’objectif! de! cet! enseignement!est! de! permettre! à! l’étudiant8e!d’acquérir! des! connaissances!fondamentales!sur!l’évolution!de!l’espèce!humaine!et!l’histoire!du!peuplement!des!divers!continents!par! les! humains! anatomiquement!modernes,!et!de! l’initier! à! quelques!autres! disciplines,! non!biologiques,!qui!s’intéressent!aussi!à!ces!questions.!Ces!thématiques!sont!abordées!par!une!approche!multi8disciplinaire!confrontant!les!résultats!des!diverses!disciplines!de!l’anthropologie!biologique!et!culturelle.!Au!terme!de!cet!enseignement,!l’étudiant8e!saura!lire!les!articles!et!ouvrages!spécialisés!dans!le!domaine!de!manière!éclairée,!tout!en!sachant!identifier!les!limites!de!chaque!approche!et!les!pièges!de!l’inter8disciplinarité.!!!!!!!

130

!BIOPHOTONIQUE+ 14P017+!Semestre++

printemps! 3h/sem,!total!42h!

ECTS++

4!!

Jours+ cours!mercredi!10h812h,!exercices!mercredi!9h810h!!!

Lieu+ Sciences!I,!salle!306!!

Mode+d’évaluation! examen!oral!!

Sessions+d'examens+ juin!+!rattrapage!août8septembre!!

Responsable+!

Monsieur!L.!BONACINA!8!022.379.0508!–!luigi.bonacina@unige.ch!

Enseignant+!

Monsieur!L.!BONACINA!(mer).!

Divers+L’enseignement!sera!donné!en!français!ou!en!anglais!selon!l’audience.!!Contenu+La!biophotonique!traite!des!interactions!entre!la!lumière!et!la!matière!biologique.!Ce!cours!est!ouvert!aux!étudiants!de!physique!et!de!biologie!qui!ont!un!intérêt!dans!l'état!de!l'art!de!la!photonique!et!ses!applications!aux!sciences!de! la! vie.!Après! une! courte! introduction!de! la! physique! moléculaire!(mouvements!électroniques,!vibrationnels!et!rotationnels,! l'approximation!de!Born8Oppenheimer,! le!principe!Frank8Condon)!la!réponse!optique!des!molécules!à!l'excitation!optique!dans!différentes!régions!spectrales! (ultraviolet,! visible,!infra8rouge,!therahertz)!seront!discutés.!Ces!bases!nous!permettront!d'aborder!différentes!techniques!d'imagerie!incluant!la! microscopie!en!champ!clair,! la! microscopie!confocale,! la!microscopie! non! linéaire,! les! techniques! de! super! résolution! (PALM,!STED,!etc.),!l'imagerie!vibrationnelle!(Raman),!la!tomographie!en!cohérence!optique,!etc.!Le!cours!parcourra!ensuite!le!champ!de!la!nano8photonique!dans!les!sciences!de!la!vie!en!décrivant!des!approches!telles!que! les! boites! quantiques!(quantum! dots),! les! nanoparticules! plasmoniques! ainsi! que!leurs!applications!dans!l'imagerie!et!la!bio8détection.!Dans!la!dernière!partie,!après!une!présentation!approfondie!des!propriétés!optiques!des!tissus!(absorption,!diffusion,!propriétés!de!polarisation)!une!sélection!de!techniques!optiques!biomédicales!sera!discutée.!Les!travaux!dirigés!prendront!la!forme!d'un! "journal!club"!sur! la! littérature!spécialisée.!Ainsi,! les!présentations!réalisées!par! les!étudiants!seront!suivies!d'une!discussion!critique.!!!Objectifs+Connaissance!approfondie!des! techniques!actuelles!d’imagerie,! détection!et! diagnostic!optique.!Développement!des!instruments!pour!la!compréhension!et!la!lecture!critique!des!écrits!scientifiques!dans!ces!domaines.!!!

131

!BOTANIQUE*TROPICALE* 14B016*!Semestre**

printemps! 5!jours,!+!1!répétitoire!facultatif,!total!40h!

ECTS**

5!!

Jour* Une!semaine!pleine,!début!juillet!(la!semaine!qui!suit!les!examens).!En!2020!:!du!29!juin!au!3!juillet!!

Lieu* Conservatoire!et!Jardin!Botaniques!!

Mode*d’évaluation! examen!écrit!L'examen!écrit!porte!pour!2/3!sur!la!partie!systématique!:!les!étudiants!doivent!reconnaître!les!familles!tropicales!enseignées!sur!la!base!d'imagesP!ils!ont!droit!à!une!documentation!sommaire!(une!feuille!A4).!Le!1/3!restant!est!une!question!à!développer!qui!porte!sur!la!partie!végétation!ou!sur!les!conférences!données!dans!le!cadre!du!cours.!!

PréErequis* Systématique!et!Biodiversité!de!2ème!année!ou!équivalent!!

Sessions*d'examens* aoûtVseptembre!+!rattrapage!janvier!!

Responsable*!

Monsieur!L.!GAUTIER!V!022.418.5147!–!laurent.gautier@villeVge.ch!

Enseignant(e)s! Monsieur!L.!GAUTIER!(cc)!et!collaborateur(trice)s.!!

Contenu*Etude!des!familles!de!plantes!tropicales!les!plus!importantes!avec!effort!principal!sur!l’identification!dans!le!terrain.!Présentation!des!principaux!types!de!végétation!de!la!zone!intertropicale,!illustrés!par!des!conférences!données!par!des!spécialistes.!Un!travail!pratique!en!botanique!tropicale!peut!être!effectué!en!complément,!par!le!biais!du!cours!«!exploitation!des!collections!botaniques!(14B021)!».!!Objectifs*Etre!à!même!de!déterminer!les! familles!des!plantes!de!la!zone!tropicale!et!de! reconnaître!les!principaux!types!de!végétation.!!!!

132

!

BOTANIQUE*SYSTEMATIQUE*ET*PHARMACEUTIQUE* 14B015*!

Semestre**

automne! 3h/sem,!total!42h!

ECTS**

4!(3!pour!pharmaciens)!

Jours*&*lieux* lundi!10h15!;!12h!

Sciences!II,!salle!A100!

!

vendredi!8h15!;!10h!

Sciences!III,!salle!1S081!un!vendredi!sur!deux!

!

Mode*d’évaluation! examen!écrit!!

!

Sessions*d'examens* juin!+!rattrapage!août;septembre!!

Responsable*!

Monsieur!F.!STAUFFER!–!022.418.5100!;!fred.stauffer@unige.ch,!

fred.stauffer@ville;ge.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!F.!STAUFFER!(cc)!,P.;A.!LOIZEAU!(cc),!!

M.!RUCHE!(ass).!

!

Divers*Ce!cours!est!destiné!aux!étudiant(e)s!en!pharmacie!et!biologie.!

!

Contenu*Les!grandes!étapes!évolutives!sont!présentées!comme!cadre!d'une!systématique!moderne!des!

plantes!angiospermes.!Une!première!partie!s'attache!à!la!morphologie!des!organes!végétatifs!et!

reproducteurs!avant!de!développer!plus!longuement!la!systématique!des!familles! présentant!un!

intérêt!pharmaceutique!par!le!nombre!ou!l’importance!de!leurs!représentants!fournissant!la!matière!

médicinale!:!plantes!sources!de!médicaments!et!plantes!médicinales.!Les!familles!tropicales!sont!

mentionnées,!mais!une!place!particulière!est!donnée!aux!plantes!de!notre!région.!Ce!cours!est!

complémentaire!aux!TP!14B915!(printemps).!

!

Ouvrage!de!référence!:!SPICHIGER,!R.!&!al.!(2016)!:!Botanique!systématique!des!plantes!à!fleurs!

(éd.!4).!Ed.!PPUR,!Lausanne.!

!

Objectifs*Donner! les! bases! de! la! classification! phylogénétique!des! végétaux!et! des! plantes! à! fleurs.!

Comprendre!la!systématique!de!ces!dernières!et!permettre!la!reconnaissance!des!grandes!familles!

de!plantes,!notamment!celles!renfermant!des!plantes!médicinales!importantes.!Savoir!utiliser!des!

clés!de!détermination!afin!d’être!capable!d’identifier!des!spécimens.!

!

133

!BOTANIQUE*SYSTEMATIQUE*ET*PHARMACEUTIQUE* 14B915*Travaux*pratiques*/*excursion**Semestre**

printemps! 4h/sem,!total!36h!!+2!excursions!dont!une!d’une!journée!(8h)!

ECTS**

2!

Jour* vendredi!14h!A!18h!sur!la!deuxième!moitié!du!semestre!!

Lieu* Sciences!III,!salle!TP!5050!* !Mode*d’évaluation! Attestation!de!présence!et!évaluation!des!rapports!de!travaux!pratiques!

!Responsable*!

Monsieur!F.!STAUFFER!–!022.418.5100!fred.stauffer@unige.ch,!fred.stauffer@villeAge.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!F.!STAUFFER!(cc),!P.AA.!LOIZEAU!(cc),!!M.!RUCHE!(ass).!!

Divers*Ces!travaux!pratiques!sont!obligatoires!pour!les!étudiant(e)s!en!pharmacie.!!Plus!2!excursions!dont!une!d’une!journée!(8h).!!!Objectifs*Compléter! les! connaissances!de!botanique!du!cours! par! l'observation!et! l'analyse!de!plantes!fraîches,!par!des!exercices!de!détermination!et!par!des!excursions!sur!le!terrain.!!!!!CAMP%DE%GEOLOGIE% 13T513%Stage%terrain%%Semestre%%

printemps! !

ECTS%%

5!(3!ECTS!pour!les!biologistes)!!

Jour% 12!jours!!!

Lieu% Le!stage!a!lieu!alternativement!dans!le!bassin!de!Sorbas!(Sud!Espagne),!dans!les!Apennins!et!Elbe!(Italie),!et!dans!le!bassin!de!TrempAGraus!(Nord!Espagne).!Contacter!le!responsable!pour!plus!d’informations.!!

Mode%d’évaluation! rapport!!!

Responsable%!

Monsieur!S.!CASTELLTORT!–!022!379!6616!sebastien.castelltort@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Messieurs!S.!CASTELLTORT!(pas),!K.!KOUZMANOV!(cc),!!A.!MOSCARIELLO!(po),!L.!CARICCHI!(pas).!!

Contenu%Le!camp!a! lieu!chaque!année!au!semestre!de!printemps!dans!une!zone!d’intérêt!géologique!fondamental!et!appliqué,!et!qui!est!étudiée!à!travers!les!différentes!disciplines!abordées!pendant!les! cours! de! Bachelor!STE! (ressources! minérales,! minéralogie,! pétrologie,!sédimentologie,!stratigraphie,!etc…),!permettant!aux!participants!d’avoir!une!vision! globale!sur! les! processus!géologiques!fondamentaux.!Les!lieux!habituellement!visités!incluent!la!chaîne!des!Apennins!(Italie),!les!Pyrénées!(Espagne),!la!zone!d’Almeria!et!le!bassin!de!Sorbas!(Espagne).!!!

134

!

CELL$BIOLOGY$JOURNAL$CLUB$ 14B047$Seminar$Period$ Autumn/Spring! 1h/week,!year!28h!

ECTS$ 3!!

Day$ Thursdays!9h!!!

Place$$

Sciences!III,!room!2024!

Evaluation$mode! presentation!of!a!publication!and!questions!for!department!membersE!presentation!of!a!publication!with!questions!or!oral!exam!for!external!students!!

Exam$sessions$ June!$ !Person$in$charge$!

S.!CITI!J!022.379.6182!–!sandra.citi@unige.ch!

Teachers! S.!CITI!(pas),!J.JC.!MARTINOU!(po),!D.!PICARD!(po),!F.!STUTZ!(po),!!P.!GUICHARD!(past).!

!Miscellaneous!This!course!is!intended!for!fourthJyear!Master!students,!graduate!students!and!postdocs!in!the!Cell!Biology!Department.!Others!interested!please!contact!Prof.!S.!Citi.!!The!course!consists! of!presentations!and!discussion!of!publications!by! Master!and!graduate!students,!postJdocs!and!other!members!of!the!department.!!The$course$is$given$in$English.$!Contents$Current!subjects!of!the!literature!in!cell!biology.!!!Objective$The$objective$of$the$course$is$to$develop$and$demonstrate$the$ability$to$read,$understand,$critically$analyze$and$present$journal$articles$published$in$the$field$of$cell$biology.!!

!

135

!CLASSIQUES)DE)LA)GENETIQUE)MOLECULAIRE)(LES))CLASSICAL)PAPERS)IN)MOLECULAR)GENETICS)

14B020)

)Semestre))

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS))

5!!

Jour) jeudi,!horaire!à!préciser,!2h!pleines!entre!14!et!20!heures!!

Lieu))

CMU,!salle!D02.1754!

Mode)d’évaluation)!

participation!continue!et!exercices,!ou!examen!oral!

Sessions)d'examens) juin!+!rattrapage!aoûtFseptembre!!

Répondant)!

Département!de!biologie!moléculaire!F!022.379.6197!

Enseignant! Monsieur!D.!BELIN!(ph)!–!079!664!43!46!!

Divers)Ce!cours!est!principalement!destiné!aux!étudiant(e)s!en!biologie!et!en!biochimie!de!master,!aux!étudiant(e)s!du!master!de!neurosciences!et!aux!étudiant(e)s!en!médecine!(options!du!bachelor).!!!Le!cours!est!donné!en!français,!ou!en!anglais!si!les!participants!le!désirent!(étudiants!Erasmus/!étrangers).!!The!course!“classical!papers!in!molecular!genetics”!has!been!given!in!English!in!the!last!few!years!to!allow!Erasmus!and!foreign!students!to!participate!)Inscription)avant)la)rentrée)de)printemps:)dominique.belin@unige.ch)Please!send!an!email!to!register!before!the!beginnin!of!the!spring!semester!!Un!sondage!Doodle!sera!organisé!avant!la!rentrée!pour!choisir!la!tranche!horaire!qui!convient!au!plus!grand!nombre.!!Contenu)La!relation!gènesFenzymes!!L'ADN!comme!matériel!génétique!!Origine!des!mutations!!Les!mutants!conditionnels!!Définition!moléculaire!du!gène!!Le!code!génétique!!Mutations!et!suppresseurs!!Mutations!conditionnelles!:!génomes!et!développement!!Régulations!négative!(opéron!lactose)!et!positive!(régulon!arabinose)!de!l'expression!des!gènes.!!Les$PDF$des$articles$sont$sur$le$site$Chamilo$du$cours$!Objectifs)Découvrir!des!articles!classiques!qui!ont!fondé!la!biologie!moléculaire.!!Exercices)liés)au)cours)!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!1h/sem,!total!14h!!!!

136

!CLIMAT'CHANGE' 14E150''Period' Autumn! 9h/week,!year!28h!ECTS' 3!

!Day' Tuesdays!9714!weeks!from!8:15!7!10:00!and!Wednesday!12:15!7!14:00!

(First!course!November!12,!2019)!Thursday!19!December!2019!from!8:15!am!to!12!pm!Uni!Carl!Vogt,!salle!CV001!!

Pré;requis''

good!foundations!in!mathematics!and!physics!are!needed!!

Evaluation'mode! written!examination!7!2!hours,!no!material!/!books!/!documents!available!!

Exam'sessions' February!+!August7September!' !Person'in'charge'!

Catherine!CORNUT!7!022.379.0797!7!catherine.cornut@unige.ch!

Responsable''

M.!STOFFEL!7!022.379.0689!–!markus.stoffel@unige.ch!

Teacher! M.!STOFFEL(po)!!Miscellaneous!Good!basic!background!in!physics!and!mathematics,!although!the!course!is!in!principal!accessible!to!non7specialists.!This!course!is!given!in!English!only!!Contents'The'course'will'cover'the'following'topics':!!•! Governing!mechanisms!of!the!climate!system!•! Natural!causes!of!climatic!change,!including!internal!modes!of!variability!(e.g.,!El!Niño)!•! Anthropogenic!causes!of!climatic!change:!the!enhanced!greenhouse!effect.!•! Paleoclimate:!indicators!of!natural!climate!variability!•! Observed!climate,!from!the!global!to!the!regional!scales!•! Introduction!to!climate!models:!functioning,!possibilities!and!limits!•! Climate!projections!into!the!future!as!a!function!of!greenhouse!gas!emissions!•! Problems!of!regional!climate!predictions!and!solutions!

!Objective'This!course!will!enter!into!one!of!the!major!environmental!topics!of!the!21st!century.!Issues!of!climatic!change!will!be!addressed!through!a!survey!of!natural!climate!variability!and!global!warming!resulting!from!the!enhanced!greenhouse!effect.!Different!types!of!models!capable!of!simulating!the!evolution!of!the!climate!system!at!various!spatial!and!time!scales!will!be!introduced.!!!!!

137

!COGNITION'COMPARÉE:'AUX'ORIGINES'DE'L'ESPRIT' 7414D'Cours'dispensé'par'la'Faculté'de'psychologie'et'des'sciences'de'l'éducation'Cours'à'choix'de'2ème'et'3ème'années''Semestre''

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS''

3!!

Jour''

mercredi!8h1579h45!

Lieu''

Uni!Mail,!salle!R150!(sous!réserve!:!voir!site!du!cours,!indiqué!ci7dessous)!

Mode'd’évaluation'!

examen!oral!

Sessions'd'examens' juin!+!rattrapage!août7septembre!!

Responsable'!

Monsieur!R.!MAURER!7!022.379.9120!7!roland.maurer@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!R.!MAURER!(mer).!!

Divers'La!page!web!http://ethologie.unige.ch!donne!accès!aux!ressources!du!cours!et!aux!informations!pratiques.!!Contenu'Le!cours!explorera!les!similitudes!et!différences!entre!la!cognition!des!êtres!humains!et!celle!des!autres!animaux.!!Pour!cela,!une!première!partie!du!cours!résumera!l'évolution!des!cerveaux!depuis!les!débuts!de!l'évolution!jusqu'à!nos!jours.!!La!seconde!partie!du!cours!montrera,!au!travers!de!compétences!de!base!en!orientation!spatiale,!l'analogie!de!traitement!qui!existe!même!entre!arthropodes!(notamment!insectes!hyménoptères)!et!vertébrés!(dont!l'être!humain)Y!chez!les!uns!et!les!autres,!le!traitement!du!mouvement!propre,!lors!des!trajets!d'exploration,!est!un!élément!crucial!de!la!construction!des!représentations!spatiales.!!La!troisième!partie!du!cours,!la!plus! importante,!mettra!l'accent!sur!la!comparaison!entre!l'être!humain!et!les!primates!non!humains!(avec!des!incursions!chez!les!corvidés,!les!cétacés,!mais!aussi!les!céphalopodes!ou!les!chiens),!que!ce!soit!en!ce!qui!concerne!la!compréhension!du!monde!physique!(théorie!de!la!causalité!physique),!la!compréhension!du!monde!social!(théorie!de!l'esprit),!et!même! la!conscience,!considérée!comme!un!phénomène!biologique:!une!adaptation!à!la!vie!sociale.!L'évolution!des!hominidés!et!de!leurs!compétences!cognitives,!telles!que!l'on!peut!se!les!représenter,!sera!également!abordée!dans!le!même!chapitre.!!Objectif'Pouvoir!situer!le! traitement!de!l'information!chez!l'humain!dans!la!continuité!de!ce!qu'il!est!chez!l'animal.!Mieux!comprendre!les!mécanismes!cognitifs!humains!et!leur!évolution,!à!la!lumière!de!ce!qu'ils!sont!chez!l'animal.!!!!

138

!

COMMUNICATION)SCIENTIFIQUE)ET)MEDICALE):)acteurs)et)moyens)

10S010)

Cours)obligatoire)ou)à)choix)selon)la)filière,)pour)la)Biologie)et)pour)le)bachelor)en)archéologie)préhistorique)et)anthropologie))Semestre))

printemps! 3h/sem,!total!28h!

ECTS))

3!

!Jour) mardi!8h15!6!10h!!

!Lieu))

Uni!Mail,!salle!3220!

Mode)d’évaluation)!

examen!oral!

PréQrequis)))

2ème!année!universitaire!

Responsable)!

Madame!B.!PELLEGRINI!6!079.201.83.50!!Beatrice.pellegrini@ville6ge.ch!

!Enseignant(e)s! Madame!B.!PELLEGRINI!(cc).!

!Contenu)L’objectif!du!cours!est!de!familiariser!les!étudiants!aux!enjeux!et!à!la!pratique!de!la!communication!

scientifique!et!médicale.!!!

L’essentiel!du!cours!sera!basé!sur!une!description!concrète!des!interactions!qui!lient!6!ou!séparent!6!les!différents!acteurs!de!la!communication!scientifique,!les!trois!principaux!étant!:!les!chercheurs,!le!

médiateurs!et!les!publics.!!!

Les!canaux!de!diffusion!de!la!communication!scientifique!seront!ensuite!détaillés!:!l’écrit,!le!parler,!l’image,!ainsi! que!des!combinaisons!de!ces! trois! moyens! (médias,!musées,! Internet,!méthodes!

participatives,!événementiels,!etc.).!Enfin,!nous!choisirons!des!thèmes!qui!ont!été!traités!par!différents!canaux!pour!comparer!les!approches!et!les!influences!des!acteurs.!!

!Objectif)Le!but!de!ce!cours!est!de!favoriser!soit!une!entrée!sur!un!terrain!d’étude!(futurs!chercheurs!dans!

ce!domaine),!soit!une!entrée!dans!le!monde!professionnel!de!la!communication!scientifique.!!

!!

139

!COMPUTER)SKILLS)FOR)BIOLOGICAL)RESEARCH):))an)introduction) to)GNU/Linux)and)bash)scripting))

14B672)

Compulsory)cours)for)the)option)«)BioInformatics)and)Data)Analysis)in)Biology»)of)the)master)!Period) Spring!

!30h/week,!year!30h!

ECTS) 4!!!

Day) June!29!to!July!3,!2020!!

Place))

Anthropology!Unit,!Sciences!II,!room!4@419,!!30!quai!Ernest!Ansermet,!1205!Genève!

) !Evaluation)mode) Written!report!+!oral!examination!on!the!basis!of!the!report.!) !Persons)in)charge)!!

M.!CURRAT!(mer)! @!022.379.69.79/67,!mathias.currat@unige.ch!J.M.!NUNES!(ce)!–!022.379.36.83/!67,!jose.deabreununes@unige.ch!

Teachers! M.!CURRAT!(mer),! J.M.!NUNES!(ce)!et!assistants.!!Miscellaneous!This)course)is)given)in)english.)!The!number!of!places!is!limited!(max.!18,!priority!is!given!to!master!and!PhD!students)!This!course!is!part!of!the!CUSO!Inter@University!doctoral!program!in!Ecology!and!Evolution.)Please)register)by)sending)an)eTmail)to:!mathias.currat@unige.ch!!Contents)This!course!intends!to!present!useful!computer!tools!and!techniques!for!young!researchers!in!biology!that!substantially!extend!basic!computer!knowledge!acquired!at!undergraduate!levels.!The!course!concentrates!on!GNU/Linux!environment!and!tools!because!it!is!powerful,!free!and!easy!to!install!in!any!kind!of!computer.!Moreover,!most!of!the!computer!clusters!available!for!scientists!run!Linux.!

The!course!is!intended!for!beginners!and!for!more!advanced!people,!its!level!of!complexity!increasing!through!the!five!days.!Basic!knowledge!in!computing!and!programming!is!a!plus!but!is!not!mandatory.!The! first! part!of! the!course!will! consist! in! learning! the!basic! of!GNU/Linux:! installation!of! the!environment,!useful!shell!commands!to!work!with!text!files,!simple!command!lines!and!the!use!of!regular!expressions,!pipes,!and!short! scripts.!The!second!part!will! consist! in!developing!more!complex!scripts,!as!well!as!exercises!using!a!computer!cluster.!

The! training!will! provide!a! minimal! theoretical!basis! in! each!of! the! topics! listed! below! and!concentrate!on!practical!aspects!through!numerous!applications.!It!will!confer!a!working!autonomy!to!solve!problems!while!handling!data!and!conducting!data!analyses!pertinent!to!the!researcher!in!biology.)

Topics:)!1.GNU/Linux!workstation,!shell!and!command!line!utilities!!2.!Programming!in!the!shell!!3.!Regular!expressions!4.!Working!with!computer!clusters!!Objective)Upon!conclusion!of!the!course!the!attendees!are!expected!to!be!able!to:!!@!use!comfortably!GNU/Linux!workstations!environments!@!work!with!shells!and!write!shell!scripts,!!@!manipulate!data!files!and!perform!file!format!conversions,!@!be!able!to!read!and!write!simple!regular!expressions,!!@!use!GNU/Linux!computer!clusters.!!

140

!CURRENT'TOPICS'IN'CHEMICAL'BIOLOGY'AND'BIOCHEMISTRY'

14CB01'

Compulsory'lecture'and'article'discussion'course'for'the'master'in'Chemical'Biology''!Period' Autumn! 6h/week,!year!84h!ECTS' 8!

!Day'&'place' Monday!13:15!:15:00!–!Sciences!II,!salle!3:352!

Wednesday!13:15!:!15:00!:!Sciences!II,!salle!449!!

Evaluation'mode! Oral!exam!in!Geneva.!Grades!will!be!assessed!based!on!the!quality!of!the!oral!paper!presentations!as!well!as!the!discussion!related!to!the!papers.!!

Coordinator' Ph.!SIMITSEK!–!022!379!64!07!:!!Phaedra.Simitsek@unige.ch!' !Persons'in'charge'!

R.!LOEWITH!–!022!379!61!16!:!robbie.Loewith@unige.ch!M.!GONZALEZ!GAITAN!:!022!379!6461!:!marcos.gonzalez@unige.ch!!

Teachers! Experts!in!Chemical!Biology!and!Biochemistry!from!the!Lemanic!area!!Contents':!Biochemistry!of!biological!membranes!:!Membrane!biogenesis!and!composition!:!Small!molecule!and!other!library!screening!approaches!:!Quantitative!mass!spectrometry!:!Quantitative!and!Physical!Cell!Biology!:!Chemical!Probes!and!tags!:!Super!resolution!microscopy!!The!courses!are!given!in!English!E:Learning:!!https://chamilo.unige.ch/home/courses/14CB01!!Objective'In!this!lecture!and!article!discussion!course,!lecturers!will! share!with!students!the!cutting:edge!ideas!and!technologies!being!developed!in!the!fields!of!Chemical!Biology!and!Biochemistry.!!!!!!

141

!DATA$MINING$FOR$PROTEIN$FUNCTION$PREDICTION$$ 14F016$Training$course$+$practical$work$!Period$ Spring! !ECTS$ 5!

!Day/place$$

Please!contact!lydie.lane@sib.swiss!

Evaluation$mode! Written!exam!!The!students!will!write!a!report!detailing!what!they!did!in!terms!of!analysis!tools!and!resources!mined,!and!summarizing!their!findings!on!their!assigned!protein.!Due!date!of!the!report:!end!of!May.!

$ !Person$in$charge$!!

A.!BAIROCH!J!022.379.5860!–!amos.bairoch@unige.ch!L.!LANE!–!022.379.58.41!J!lydie.lane@sib.swiss!

Teachers! A.!BAIROCH!(po),!!L.!LANE!(suppl.!collab.!Sc.)!

!Contents$J!Use!of!a!wide!palette!of!sequence!analysis!tools!to!predict!!!!sequence!features!as!well!as!secondary!and!3D!structure!elements.!J!Use!of!data!mining!predictive!tools!(coJexpression!analysis,!STRING,!etc).!J!Extraction!of!information!from!repositories!(microJarray,!proteomics,!!!!!!protein/protein!interaction,!etc).!J!As!we!will! select!proteins!that!are!conserved!more!or!less!deeply!in!!!!!evolution,!it!will!also!be!useful!to!look!up!different!model!organism!!!databases!(MODs)!to!find!information!pertinent!to!the!orthologs!or!!!!paralogs!of!these!proteins.!!Objective$The!students!will! be! each!assigned!a! human!protein!sequence!entry! from! neXtProt!with! no!functional!characterization!and!no!trivial!way!to!predict!its! function!from!its!sequence.!The!goal!of!the!assignment!is!to!use!both!sequence!analysis!tools!and!onJline!resources!to!predict!and!extract!as!much!clues!as!possible!that!could!help!unravel!the!function!of!these!proteins.!!!!

142

!DDI##$#DEVELOPPEMENT#DURABLE#I# 12E050#Cours#à#choix#de#2ème#année#Semestre##

automne!! 2h/sem,!total!14h!

ECTS##

3!

Jour# lundi!18h15!–!20h00!!

Lieu##

UniMail!–!salle!vous!sera!communiquer!lors!de!la!séance!d'information!voir!sous!divers.!

Mode#d’évaluation! Quizzes!en!ligne!à!effectuer!avant!les!cours!(30%),!activité!en!ateliers!(40%,!dont!la!moitié!pour!un!policy!brief)!et!un!examen!final!(QCM!et!réponses!courtes,!30%).!!

Sessions#d'examens# janvier/février!+!rattrapage!aoûtQseptembre!!

Responsable# Monsieur!Martin!SCHLAEPFER!Q!022!379!0801!Q!martin.schlaepfer@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Monsieur!M.!SCHLAEPFER!(cc),!Madame!J.!KRISHNAKUMAR!(po)!et!invités.!

!Divers#Séance#d'information#et#pré$inscription!!lundi!17!septembre!2018,!UniMail,!MR080!de!18h15!–!20h00!!Contenu#DDI!sert!d'introduction!aux!concepts!de!base!du!Développement!Durable!(DD)!à!travers!une!alternance!de!cours!magistraux!et!d'activités!participatives.!Ces!dernières!permettent!par!ailleurs!de!développer!des!compétences!et!des!notions!civiques,!intellectuelles!et!éthiques!qui!sont!nécessaires!pour!la!transition!vers!une!société!durable.!!Ce!cours!abordera!les!thématiques!suivantes!:!!Qu'estQce!que!le!développement!durable!?!Quelle!vision!pour!l'avenir!?!!Comment!mesurer!le!développement!?!Comment!varieQtQil!autour!du!monde!?!Importance!de!réduire!les!inégalités.!Quelles!sont!les!composantes!essentielles!du!bienQêtre!?!Quelles!sont!les!fondations!éthiques!du!DD!?!Droits!hmains!et!égalité!des!genres!Que!sont!les!limites!planétaires!?!Quels!rôles!pour!les!changements!climatique,!la!biodiversité,!et!les!villes!?!Le!rôle!des!organisations!internationales!:!Agenda!21,!Millenium!Devlopment!Goals,!Aichi!Biodiversity!targets,!Sustainable!Development!Goals.!!Objectifs#Se!servir!d'outils!de!manière!interactive!(Compétences!disciplinaires!et!méthodologiques)!Q! Rapport!aux!savoirs! :!Construire!des!savoirs! interdisciplinaires!prenant!en!compte!différentes!perspectives!!Q!Systèmes!:!Penser!en!systèmes!!Q!Anticipation!:!Penser!et!agir!avec!prévoyance!!Q!Pensée!créatrice!:!Penser!de!manière!critique!et!constructive!!!Interagir!dans!des!groupes!hétérogènes!(Compétences!sociales)!Q!Perspectives!:!Changer!de!perspective!!Q!Collaboration!:!Aborder!ensemble!des!questions!en!lien!avec!la!soutenabilité!!Q!Participation!:!Contribuer!à!des!processus!collectifs!#

143

!ECO$ETHOLOGIE* :**EVOLUTION*PHYLOGENETIQUE*DES*COMPORTEMENTS*

74144*

Cours*dispensé*par*la*Faculté*de*psychologie*et*des*sciences*de*l'éducation**Semestre**

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!!

Jour**

mercredi!8h15!7!9h45!

Lieu**

Uni!Dufour,!U600!(sous!réserve!:!voir!site!du!cours,!indiqué!ci7dessous)!

Mode*d’évaluation*!

examen!oral!

Sessions*d'examens**

janvier!+!rattrapage!août7septembre!!(et!juin!si!le!règlement!d'études!de!l'étudiant!le!permet)!!

Responsable*!

Monsieur!R.!MAURER!7!022.379.9120!7!roland.maurer@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!R.!MAURER!(mer).!!

Divers*La!page!web!http://ethologie.unige.ch!donne!accès!aux!ressources!du!cours!et!aux!informations!pratiques.!!Contenu*D'où!viennent!nos!comportements!?!Sont7ils!uniquement!dus!aux!influences!socioculturelles!à!l'œuvre!durant!le!développement!de!l'individu!?!Ou!sont7ils!aussi!colorés!par!la!biologie!de!l'être!humain!?!Le!cours! apporte!en! réponse!des!éléments!généraux!de!biologie!du!comportement!(animal! et!humain),!mais! son!accent!principal!porte!sur! l'éco7éthologie!(étude!de! l'influence!du! milieu,! en!particulier!du!milieu!social,!sur!l'évolution!du!comportement).!Il!y!sera!question!de!sélection!naturelle,!de!sélection!sexuelle!(pourquoi!certains!oiseaux!ont7ils!des!comportements!de!cour!si!complexes!?!et!quel!lien!avec!certaines!préférences!des!humains!lorsqu'il!s'agit!de!trouver!un!partenaire?),!de!stratégies!reproductrices!(certains!singes!pratiquent!l'infanticide:!est7ce! une! pathologie?!et! quel! lien! avec! la! maltraitance! dans! nos! sociétés?),!d'égoïsme! et!d'altruisme…!On!y!verra!donc!quels!sont!les!mécanismes!qui!ont!agi!sur! les!comportements!lors!de!l'évolution!(darwinienne)!des!espèces,!mécanismes!dont!les!effets!persistent!à!ce!jour,!colorant!le!comportement!même!chez!l'être!humain.!La!compréhension!de!ces!mécanismes!chez!l'animal!nous!donnera!au!passage!les!clés!nécessaires!pour!aborder,!chez!l'humain,!les!mécanismes!qui!sont!l'objet!d'étude!de!la!psychologie!évolutionniste.!!Objectif*Comprendre!d'où! viennent! les! comportements!et! les! cerveaux! qui! les! permettent.!Maîtriser!suffisamment!les!concepts!de!base!de!l'évolution!biologique!pour!comprendre!la!raison!d'être!de!certains! comportements!chez! l'animal! et! l'humain.! Comprendre! l'interaction! complexe! entre!influences!génétiques!et!influences!du!milieu!aboutissant!en!fin!de!compte!au!comportement.!!!!

144

!ECOLOGIE' I' 13B007A'Cours'à'choix'restreint'de'3ème'année''Semestre''

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS''

3!(3ème!année!bachelor!en!biologie)!

Jour'&'lieu''

lundi!8h15!–!10h!/!Sciences!III,!salle!1S059!

Mode'd’évaluation'!

examen!écrit!

Sessions'd'examens' JanvierEfévrier!+!rattrapage!aoûtEseptembre!!

Responsable'!

Monsieur!B.!IBELINGS!–022.379.0313!–!bastiaan.ibelings@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Messieurs!B.!IBELINGS!(po),!E.!CASTELLA!(mer),!A.!LEHMANN!(pas),!!P.!VENAIL!(ma)!!

Divers'Etudiants!en!biologie.!Egalement!pour!les!étudiants!en!sciences!de!la!Terre!et!de!l’environnement!bachelor!3e!année.!!Le!cours!pris!par!les!étudiants!en!biologie!comme!cours'à'choix'restreint!de!3ème!année,!doit!être!suivi!dans!son!intégralité!(semestre!d’automne!et!de!printemps)!pour!obtenir!6!ECTS.!La'note'finale'est'alors'la'moyenne'des'deux'notes'des'semestres'd’automne'et'de'printemps.!!Contenu'Introduction'! E!!Qu’estEce!que!l’écologie!?!(écologie!=!écologisme)!!! E!!Concepts!clés:!niche,!habitat,!écosystème!etc.!!'

Conditions'et'ressources''! E!!Disponibilité!des!ressources!!! E!!Compétition!!! E!!Espace!géographique,!distribution!des!espèces!!!

Individus,'populations,'communautés'et'écosystèmes!!! E!!Naissance!et!mort,!reproduction!!! E!!Compétition!interspécifique!!! E!!Prédation,!broutage!et!parasitisme!!! E!!Dynamique!des!populations!!! E!!Succession!!! E!!Réseau!trophique!!! E!!Biodiversité!(gènes,!espèces,!traits,!écosystèmes)!!!

Questions'appliquées'en'écologie!!! E!!Développement!durable!!! E!!Transitions!critiques!!! E!!Pertes!de!diversité!!! E!!Changements!globaux!!! E!!Dégradation!des!habitats!!! E!!Services!écosystémiques!!! E!!Conservation!de!la!nature!!!Objectif'Le!but!de!ce!cours!est!l’enseignement!des!bases!théoriques!de!l’écologie.!!!

145

!ECOLOGIE' II' 13B007P'Cours'à'choix'restreint'de'3ème'année''Semestre''

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS''

3!!(3ème!année!bachelor!en!biologie)!

Jour'&'lieu' lundi!8h15!–!10h!Sciences!III,!salle!1S059!!

Mode'd’évaluation! examen!écrit!!

Sessions'd'examens' juin!+!rattrapage!aoûtGseptembre!!

Responsable'!

Monsieur!B.!IBELINGS!–022.379.0313!–!bastiaan.ibelings@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Messieurs!B.!IBELINGS!(po),!E.!CASTELLA!(mer),!A.!LEHMANN!(pas),!!P.VENAIL!(ma)!

Divers'Le!cours!pris!par!les!étudiants!en!biologie!comme!cours'à'choix'restreint!de!3ème!année,!doit!être!suivi!dans!son!intégralité!(semestre!d’automne!et!de!printemps)!pour!obtenir!6!ECTS.!La'note'finale'est'alors'la'moyenne'des'deux'notes'des'semestres'd’automne'et'de'printemps.!!Contenu'Conditions,'ressources'et'les'communautés'du'monde'

G! Biomes!terrestres!G! Environnements!aquatiques!

Naissance,'mort'et'mouvement'G! Cycles!de!vie!G! Compétition!intraspécifique!G! Migration!et!dispersions!G! Connectivité!dans!la!nature!

Compétition'interspécifique'G! Principe!d`exclusion!compétitive!G! Coexistence!G! Niche!fondamental!vs!réalisée!G! Lotka!Volterra!!G! Structure!spatiale!

Prédation'G! Consommateurs!G! Symbiose!G! Prédateurs,!brouteurs,!parasites!G! Largeur!du!régime!alimentaire!G! Cycles!prédateurs!G!proies!G! Metapopulations!

!Objectif'Le!but!de!ce!cours!est!l’enseignement!des!bases!théoriques!de!l’écologie,!avancé!par!rapport!à!Ecologie!1!!!!

146

!

ECOLOGIE' ' 13B907'Travaux'pratiques'à'choix'restreint'de'3ème'année''Semestre''

Printemps!3!semaines! 4h/sem,!total!60h!

ECTS''

3!

!

Jour''

9'mars'au'27'mars'2020!!

Lieu' Sciences!III,!salle!0059!et!Atelier!informatique!!

Bâtiment!Carl!Vogt,!66!Blvd!Carl!Vogt,!Genève!

!

Mode'd’évaluation'!

Présentations!orales!durant!les!TP!et/ou!rapport!de!stage!écrit!

PréJrequis''

Suivre!le!cours!d’écologie!(13B007)!

Responsable'!

Monsieur!B.!IBELINGS!S!022!379!0313!!Bastiaan.Ibelings@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!B.!IBELINGS!(po),!A.!LEHMANN!(pa),!!

E.!CASTELLA!(mer),!D.!McCRAE!(att!rec),!P.!MARLE!(ass),!!

Madame!E.!HONECK!(ma)!

!

Divers'!

Les!inscriptions!des!travaux!pratiques!à!choix!restreint!de!3ème!année!sont!obligatoires.!Les!inscriptions!s'effectueront!en'ligne!!!!

'Vous!recevrez!des!informations!complémentaires!par!eSmail!à!la!miJfévrier.!!!

!

Contenu'Chacune!des!trois!semaines!correspond!à!une!thématique!différente,!permettant!de!prolonger!par!la!

pratique!certains!aspects!développés!dans!le!cours:!!!

!

Thème'1'(responsable'B'Ibelings)':'Evolution'et'diversité'biologique.'Ce!thème!comporte!trois!activités.!1)!Radiation!adaptative,!2)!Mesures!de!biodiversité!et!applications!

en!conservation,!3)!La!sélection!naturelle,!les!ingrédients!nécessaires.!En!1)!nous!explorerons!la!

capacité!de!l'évolution!à!engendrer!de!la!diversité!biologique!à!partir!d'un!point!de!départ!homogène.!

L'évolution!en!action!devant!vos!yeux!!!Des!expériences!d'évolution!expérimentale!seront!menées!à!

partir!de!la!bactérie!Pseudomonas*fluorescens.!Ces!expériences!permettent!de!visualiser!le!rôle!de!concepts!clefs!(niche,!exclusion!compétitive,!hétérogénéité!environnementale)!dans!le!maintien!de!la!

diversité.!Elles!permettent!également!d'enseigner!aux!étudiants!les!bases!d'études!microbiologiques.!

En!2)!les!étudiants!calculeront!des!indices!de!diversité!basés!sur!des!communautés!virtuelles.!En!3)!

nous!explorerons!les!ingrédients!nécessaires!pour!l’évolution!par!sélection!naturelle.!!

!

Thème'2'(responsables'A.'Lehmann)':'L'écologie'et'la'modélisation'sur'ordinateurs'Nous!nous!pencherons!sur!l'analyse!spatiale!des!données!écologiques!qui!permet!d'appréhender!sous!

forme!de!cartes!les!grands!enjeux!de!l'écologie.!Nous!explorons!la!source!et!les!enjeux!autour!des!

données!biotiques!et!abiotiques!à!différentes!échelles,!puis!comment!nous!pouvons!modéliser!la!

distribution!potentielle!des!espèces,!pour!enfin!informer!les!décideurs!sur!les!meilleurs!sites!à!mettre!

en!protection!pour!préserver!la!biodiversité.!

!

Thème'3'(responsable'E.'Castella)':'Des'relevés'de'terrain'à'l'évaluation'écologique'Ce!thème!sert!à!illustrer!la!diversité!des!mesures!de!diversité!en!écologie:!richesse,!indice!de!diversité,!

diversité!fonctionnelle.Les!communautés!d’invertébrés!aquatiques!de!deux!stations!appartenant!à!deux!cours!d’eau!du!bassin!genevois!sont!utilisées!comme!exemples.!Quelques!techniques!d’analyse!

de!données!appliquées!à!l'écologie!sont!également!introduites.!

!

!

147

!ECOLOGIE'MOLECULAIRE'MICROBIENNE' 14B026'Chapitres'choisis'Semestre''

printemps! Nbre!d’heures!par!année!40h!

ECTS''

4!!

Jour' 5!jours!à!fixer!!

Lieu''

Centre!de!Biologie!Alpine!de!Piora!

Mode'd’évaluation'!

rapport!de!stage!!

Responsable'!!

Monsieur!M.!TONOLLA!E!058!666!62!69!mauro.tonolla@unige.ch!et!mauro.tonolla@supsi.ch!!Ecologie!microbienne,!Unité!de!microbiologie,!Dép.!Biologie!végétale,!Université!de!Genève,!30!Quai!ErnestEAnsermet,!1211!Genève!4,!Suisse,!et!Laboratory!of!applied!microbiology,!University!of!Applied!Sciences!Southern!Switzerland!(SUPSI),!Via!Mirasole!22A,!6500!Bellinzona!!

Enseignant(e)s! A.!BRUDER!(coll.),!M.!TONOLLA!(cc)!!

Divers'Le!cours!sera!donné!par!des!experts!d’universités!Suisses!et!internationales.!!Inscription!auprès!du!secrétariat!des!étudiants!de!la!faculté!des!sciences!!Contenu'Les! progrès! des! connaissances! et! techniques! en! microbiologie! permettent! d’étudier! les!communautés!microbiennes!d’une!manière!détaillée!sans!précédent.!Cela!donne!l’opportunité!de!mieux!comprendre!les!effets!des!changements!de!l’environnement!sur!les!écosystèmes!des!cours!d’eau!alpins.!Ce!programme!couvre!l’écologie!des!microorganismes!autotrophes!et!hétérotrophes!(algues,!champignons,!certaines!groupes!d’invertébrés)!des!divers!types!de!petits!cours!d’eau!alpins.!Le!cours!est!focalisé!sur!les!travaux!pratiques!pour!étudier!et!décrire!ces!groups!d’organismes,!soit!l’échantillonnage!et!l’identification!par!microscopie!optique.!Les!méthodes!d’extraction!et!analyse!de!l’ADN!ne!font!pas!partie!du!cours.!Des!séminaires!par!les!enseignants!expliquent!l’état!actuel!des!approches!moléculaires!pour!la!description!de!ces!groupes!d’organismes,!ainsi!que!leur!sensibilité!aux!changements!de!l’environnement!avec!des!études!de!cas!de!la!recherche.!!Objectif'Le!programme!apporte!une!connaissance!de!base!théorétique!et!pratique!pour!étudier,!interpréter!et!comprendre!les!communautés!principales!des!algues,!champignons!et!invertébrés!et!leurs!rôles!fonctionnels!dans!les!écosystèmes!des!cours!d’eau!alpins.!!!

148

!ECOSYSTEMS(SERVICES(:(A(NEW(TOOL(FOR(SUSTAINABLE(DEVELOPMENT(

14E187(

(Semestre((

Autumn! 2h/week,!year!28h!

ECTS((

3!!

Day(((

Thursday!14h15!–!16h!

Place((

Sciences!II,!room!457!

Evaluation(mode!!!

Many!small!quizzes,!works,!presentations.!!

Person(in(charge(!

M.!SCHLAEPFER!–!022!379!0801!–!martin.schlaepfer@unige.ch!

Teachers! A.!LEHMANN!(pas),!M.!SCHLAEPFER!(cc),!J.!FALL!(po)!!

Contents(Ecosystem!Services:!a!tool!for!sustainable!development!is!a!MasterZlevel!course!open!to!all!students!of!the!University!of!Geneva.!Ecosystem!services!are!a!way!of!thinking!about!Z!and!evaluating!Z!the!goods!and!services!provided!by!nature!that!contribute!to!the!wellZbeing!of!humans.!Examples!include!marketable!goods!such!as!timber!and!fish,!as!well!as!nonZmarket!services!like!the!natural!purification!of!water!by!wetlands,!the!inherent!value!of!species,!and!cultural!value!of!traditional!landscapes.!In!the!last!decade!there!has!been!a!surge!of!interest!in!managing!natural!resources!according!to!what!is!now!called!the!ecosystem!services!approach.!Two!significant!benefits!of!this!approach!include!the!ability!to!formally!integrate!nonZmarket!values!into!costZbenefit!analyses,!and!to!predict!how!services!will! be!affected!under!future!management.!Numerous!organizations!and!governments!(including!Switzerland's)!are!exploring!this!approach!as!a!way!to!reduce!negative!externalities!and!promote!intraZ!and!intergenerational!fairness.!This!course!seeks!to!provide!an!introduction!of!the!ecosystem!services!method!through!a!mixture!of!theory!and!applied!caseZstudies.!!!Objective(Students!who!diligently!read!assigned!articles,!complete!assignments,!and!participate!in!laboratory!exercises!will!be!able!to:!1.!Put!into!practice!the!ecosystem!services!approach,!including!the!ability!to!identify!and!value!the!ecosystem!services!associated!with!a!given!perimeter_!2.!Appreciate!the!socioZhistoric!context!from!which!this!method!emerged,!as!well!as!the!strengths!and!limitations!of!the!method_!and!3.!Identify!situations!in!which!the!ecosystem!services!method!is!likely!to!provide!addedZvalue!to!current!management!approaches.!!!!

149

ELECTRON(MICROSCOPY( 14B044(Courses(and(practical(training((Semestre((

spring'–'9'days' 54h/'2weeks,'total'54h'

ECTS((

4'

Day((

Workshop'over'nine'days'(6'hours'per'day)'

Place(Dates((

Sciences'III,'salle'TP'0016'24th'of'March'to'3rd'of'April'2020'

Requirements( This'course'is'open'students'with'an'interest'in'electron'microscopy'either'in'their'3rd'year'of'bachelor'or'in'a'master/PhD'program''

Exam('

Written'exam'of'two'hours'

Exam(sessions( June/July'+'catching'AugustPSeptember'( 'Responsable('

Christoph'BAUER'P'022.379.66.32'P'christoph.bauer@unige.ch''

Teachers((

Ch.'BAUER'(cc),'J.'BOSSET'(adj'sc),'S.'LOUBERY'(cc),''A.'MARTIGNIER'(adj'sc),'Y.'SADIAN'(cs),'R.'MARTINI'(pas)''

Miscellaneous(Course'given'in'English,'«'cours'à'choix'»'open'to'3rd'year'Biology'or'Biochemistry'or'Pharmacy'students.'In'order'to'be'accepted'students'interested'to'take'this'course'need'to'send'a'letter'of'motivation'(by'ePmail:'Christoph.bauer@unige.ch)'at'least'six'weeks'before'its'start.''Contents(

a)' Physical'basis'of'electron'microscopy''b)' Transmission'electron'microscopy'(TEM)':'Theory'and'practical'sessions'c)' Specimen'prepration'for'TEM:'Theory'and'practical'session'using'test'samples'and'selected'

student'samples'd)' Ultramicrotome:'introduction'and'sectioning''e)' Scanning'electron'microscopy'(SEM)':'Theory'and'practical'session'f)' 3D'electron'microscopy'g)' ImmunoPlabeling'procedures'for'electron'microscopy'h)' Negative'staining:'Theory'and'practical'session'i)' CryoPTEM:'Theory'and'practical'session'j)' Image'analysis'and'reconstruction'basics'

'Objective(The'objective'of'this'course'combining'theory'and'handsPon'is'to'give'students'a'theoretical'and'practical'introduction'into'different'electron'microscopes'including'specimen'preparation'and'image'analysis.'At'the'end'of'this'course,'students'should'have'an'overview'and'broadened'knowledge'on'using'electron'microscopy'for'their'research'projects.''!

150

ELEMENTS'D’ENDOCRINOLOGIE'MOLECULAIRE'' 14C003'Cours'à'choix'restreint'de'3ème'année''Semestre''

automne/printemps- 2h/sem,-total-50h-

ECTS''

6-

-

Jour''

jeudi-12h30-9-14h-

Lieu''

Sciences-III,-salle-1S081-

Mode'd’évaluation'-

examen-oral-

Niveau' cours-à-option-pour-biochimistes-de-3ème-année-et-de-master-

cours-à-choix-restreint-pour-biologistes-de-3ème-année-et-de-master-

cours-à-option-pour-médecins-de-2ème-et-3ème-années-

-

Sessions'd'examens' juin-+-rattrapage-août9septembre--

Responsables'-

M.-Michel-ROSSIER-9-027.603.48.20-–-michel.rossier@hopitalvs.ch--

(Fac.-Sciences)-

Mme-Ariane-DE-AGOSTINI-–-022.372.49.10-

Ariane.Deagostini@unige.ch--

(Fac.-Médecine)-

-

Enseignant(e)s- Mesdames-Ariane-DE-AGOSTINI-(pd),-Valérie-SCHWITZGEBEL-(pas),--

Laurence-BAYER-(ma),-Charna-DIBNER-(ma),-Marie-COHEN-(pas),---

Messieurs-Michel-ROSSIER-(pd),-Serge-NEF-(pas),-Serge-FERRARI-

(pas),-Cyril-SOBOLEWSKI-(ma),-Serge-RUDAZ-(pas),-Bernhard-

WEHRLE9HALLER-(pas)-

-

Contenu'Les-chapitres-suivants-sont-traités-dans-le-cours-:-

9- Les-bases-générales-de-l’endocrinologie-et-de-l’hormonologie-

9- Les-récepteurs-hormonaux-et-la-signalisation-intracellulaire-

9- La-structure-et-la-biosynthèse-des-hormones-stéroïdes-et-peptidiques-

9- Le-contrôle-hormonal-de-la-reproduction-et-la-différentiation-sexuelle-

9- La-fonction-thyroïdienne-

9- Les-surrénales-et-l’homéostasie-de-l’eau-et-des-électrolytes-

9- Le-contrôle-hormonal-du-métabolisme-phosphocalcique-

9- Le-contrôle-hormonal-du-métabolisme-du-glucose-et-des-lipides-

9- Les-tumeurs-endocriniennes-

9- Les-perturbateurs-endocriniens-

9- La-chronobiologie-des-hormones-et-le-comportement-

9- Le-contrôle-du-dopage--

Documentation'and'bibliography:-Syllabus.-

-

EQlearning':'https://chamilo.unige.ch/--

Objectif'Ce-cours- traite-de- la-biochimie-des-hormones,-de-leur-biosynthèse,-de-leur-métabolisme,-de-leur-

régulation-et-de-leur-mode-d’action-au-niveau-des-récepteurs-et-des-messagers-intracellulaires.-Si-

l’accent-est-mis-sur-les-aspects-biochimiques-et-moléculaires-de-l’action-des-hormones,-ce-cours-traite-

également-des-aspects-généraux-de-l’endocrinologie-et-des-techniques-couramment-utilisées-en-

hormonologie.-

Les- divers- systèmes- endocriniens- sont- présentés- systématiquement,- et- différents- contextes-

physiologiques-et-physiopathologiques-sont-discutés.-Par-exemple,-les-conséquences-de-certaines-

mutations-génétiques-responsables-de-pathologies-endocriniennes-sont-traitées-et-les-phénotypes-

associés-chez-l’homme-ou-l’animal-sont-discutés.-

-

!!

151

!ELEMENTS'OF'BIOINFORMATICS' 14F001'Compulsory'course'for'the'option'«'Bioinformatics'and'Data'Analysis'in'Biology»'of'the'master'''Period' Autumn! 3h/week,!+!1h!exercises,!

year!24h!ECTS' 5!

!Day' Monday!8:15!–!12:00!

!Place''

CMU!–!room!>!please!see!the!website!to!get!information:!!https://chamilo.unige.ch/home/courses/14F001/!!!

Evaluation'mode! Oral!exam!!

Exam'sessions' JanuaryMFebruary,!June!+!AugustMSeptember!' !Persons'in'charge'!

A.!BAIROCH!M!022.379.5860!–!amos.bairoch@unige.ch!M.MC.!BLATTER!M!022.379.4931!M!marieMclaude.blatter@sib.swiss!!

Teachers! M.MC.!BLATTER!(coll.!scientifique),!!A.!BAIROCH!(po),!and!collab.!

!Miscellaneous!Course'given'in'English.!The!purpose!of!this!course!is!to!give!an!overview!of!the!principal!bioinformatic!tools!and!databases!which!are!used!in!genomics,!transcriptomics!and!proteomics.!A!special!emphasis!will! be!given!to!biological!databases!and!in!silico!protein!sequence!analysis!(theory!and!practical!work).!!Contents'Biological!databases.!Introduction!to!genomics!and!transcriptomics.!Gene!prediction.!Protein!primary!sequence!analysis.!Domain!detection:!patterns!and!profiles.!PostMtranslational!modifications:!description!and!prediction.!Similarity!searches!(pairwise!alignment,!BLAST).!Multiple!sequence!alignments.!Introduction!to!3D!structure!analysis.!Introduction!to!system!biology.!!!

152

!!ELEMENTS'OF'PROTEOMICS'AND'METABOLOMICS:'

Translation'to'human'diseases'

14F012'

'

Period'

'

Spring! 4h/week,!year!56h!

ECTS' 5!!

Day'

'

Thursday!14:15!–!18:00!

Place'

'

CMU!–!room!B09.2125A!

Evaluation'mode'

!Oral!exam!

Exam'sessions' June!+!catching!AugustMSeptember!' !Persons'in'charge'

!J.MC.!SANCHEZ!M!022.379.5486!–!JeanMCharles.Sanchez@unige.ch!S.!RUDAZ!–!022.379.6572!–!Serge.Rudaz@unige.ch!!

Teachers! J.MC.!SANCHEZ!(pas),!S.!RUDAZ!(pas)!and!collaborators.!!Miscellaneous!Course'given'in'English.'

!The!purpose!of!this!course!is!to!give!an!overview!of!the!principal!tools,!which!are!used!in!proteomics!and!metabolomics.!A!special!emphasis!will!be!given!to!methods!to!discover!new!disease!biomarkers!as!well!as!applications!of!proteomics!and!metabolomics!to!unravel!multifactorial!diseases.!!Contents'

Electrophoretic!separation!(SDSMPAGE,!IEF,!2MDE,!CE)!Chromatographic!separation!coupled!to!mass!spectrometry!(MS)!MSMbased!detection!and!quantitation!methods!!MS!profiling!and!identification!methods!Statistics!and!bioinformatics!Different!diseases!will!illustrate!the!analytical!strategy!(Diabetes,!Neurodegenerative!Diseases,!Stroke).!!!!!

153

!ETHNOARCHEOLOGIE,-,séminaire, 14B728,Séminaire,obligatoire,pour,le,master,en,archéologie,préhistorique,,,Semestre,,

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS,,

3!!

Jour,,

lundi!12h00!–!13h00!+!1h!consacrée!à!du!travail!personnel!

Lieu,,

Sciences!II,!salle!457!

Responsable,!

Madame!A.!MAYOR!–!022!379!69!49!–!anne.mayor@unige.ch!

Enseignant(e)s! Madame!A.!MAYOR!(mer)!et!collab.!!!

,,

A,LIEU,TOUS,LES,DEUX,ANS.,,

A,LIEU,AU,SEMESTRE,D’AUTOMNE,2019,!

Contenu,Les!sujets!sont!en!relation!avec!le!cours!n°14B028!et!font!l’objet!de!travaux!personnels!à!présenter.!!Objectif,L’objectif!est! de!mettre!en!pratique!les! bases!méthodologiques!présentées!au!cours!par! l’étude!d’objets,!de!documentation!de!terrain!ou!de!données!bibliographiques.!Les!thèmes!proposés!varient!d’une!année!à!l’autre.!!!!

154

!ETHNOARCHEOLOGIE, 14B028,Cours,obligatoire,pour,le,master,en,archéologie,préhistorique,,,Semestre,,

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS,,

3!!

Jour,,

lundi!10h!–!12h!

Lieu,,

Sciences!II,!salle!457!

Mode,d’évaluation,!

examen!oral!

Sessions,d'examens,,

janvier@février!+!rattrapage!août@septembre!

Responsable,!

Madame!A.!MAYOR!–!022!379!69!49!–!anne.mayor@unige.ch!

Enseignante! Madame!A.!MAYOR!(mer).!!

Divers,,

A,LIEU,TOUS,LES,DEUX,ANS.,,

A,LIEU,AU,SEMESTRE,D’AUTOMNE,2019,!

Contenu,L’ethnoarchéologie!est!une!stratégie!expérimentale!de!compréhension!des!faits!archéologiques!qui!repose!sur! l’analyse!de!ces! faits!dans!des!cultures!vivantes!et!qui! permet,!grâce!au!concept!d’analogie!comportementale,!de!résoudre!certains!problèmes!d’interprétation.!!!Ce! cours! comprend!une! première! partie! théorique!présentant!un!historique!du!comparatisme!ethnographique!et!l'évolution!de!la! démarche!interprétative!en!archéologie,!les!mécanismes!de!l'interprétation!et! l'opposition!entre!scénarios,!mécanismes!et! régularités! permettant!d’articuler!l’approche!du!général!et!du!particulier.!!!La!seconde!partie!présente!des!études!de!cas!illustrant!la!méthode,!tels!que!l'interprétation!de!la!métallurgie!du!fer,!des!habitats!palafittiques,!de!la!céramique!tournée!ou!de!l'art!rupestre.!!!La!dernière!partie!détaille!à! titre!d'exemple!les!recherches!de!l'équipe!africaniste!du!Laboratoire!Archéologie!et!Peuplement!de!l’Afrique!(APA)!sur!les!relations!entre!traditions!artisanales!et!identités!au!Mali!et!au!Sénégal.!!Objectif,L’objectif!du!cours!vise!à!familiariser!les!étudiants!à!la!démarche!ethnoarchéologique!et!à!la!question!de! l’interprétation!en!archéologie,!à! l’aide! de! présentations! théoriques!et!méthodologiques!et!d’illustrations!à!l’aide!d’études!exemplaires!dans!le!domaine.!!!!

155

!

ETHNOLOGIE) *)séminaire) 14B729)Bachelor)Sciences)Archéologie)préhistorique)et))Bachelor)Lettres)orientation)archéologie)préhistorique)et)anthropologie))Semestre))

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS))

3!!

Mode)d’évaluation))

travail!personnel!

Responsable)!

Madame!A.!MAYOR!–!022!379!69!49!–!anne.mayor@unige.ch!

Enseignant(e)s! Madame!A.!MAYOR!(mer),!et!collaborateurs.!!

Divers)Contacter!la!responsable!pour!définir!un!sujet.!!

A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS.)N’A)PAS)LIEU)AU)SEMESTRE)D’AUTOMNE)2019)

!Contenu)Travail!personnel!sur!un!sujet!en!relation!avec!le!cours.!!Objectif)L’objectif!du!séminaire!est!d’offrir!la!possibilité!aux!étudiants!d’approfondir!un!sujet!choisi!en!accord!avec!les!enseignants!par!un!travail!personnel.!!

!!

156

!ETHNOLOGIE) 14B029)))Bachelor)Sciences)Archéologie)préhistorique)et))Bachelor)Lettres)orientation)archéologie)préhistorique)et)anthropologie))Semestre))

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS))

3!!

Jour))

lundi!10h15!–!12h!

Lieu))

Sciences!II,!salle!457!

Mode)d’évaluation)!

examen!oral!

Sessions)d'examens)) janvier@février!+!rattrapage!août@septembre!!

Responsable)!

Madame!A.!MAYOR!–!022!379!69!49!–!anne.mayor@unige.ch!

Enseignant(e)s! Mesdames!A.!MAYOR!(mer),!Elizabeth!REICHEL!(coll.!Ext.),!Monsieur!N.!HUBERT!Van!BLYENBURGH!(cc).!!

Divers)Ce! cours! est! principalement! destiné! aux! étudiants!en! bachelor! de! biologie,! d'archéologie!préhistorique!et!de!Lettres,!et!ouvert!aux!étudiants!d’autres!facultés.!!

A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS.)N’A)PAS)LIEU)AU)SEMESTRE)D’AUTOMNE)2019)

!Contenu)Cet!enseignement!constitue!une!introduction!à!l'anthropologie!culturelle.!Il!présente!les!divers!modes!de!subsistance!et!organisation!socio@politique!des!sociétés!humaines,!puis!introduit!les!courants!généraux!de! l’anthropologie!culturelle,! l’histoire! de! leur! élaboration,!ainsi! que! ses!principaux!acteurs!et!domaines!d’étude.!Il!propose!une!analyse!critique!de!concepts!tels!que!la!race!et!l’ethnie!et!développe!la!relation!entre!cultures!matérielles!et!identités.!Il!introduit!enfin!l’enquête!de!terrain,!qu’il!illustre!à!l’aide!de!plusieurs!exemples!concrets.!!Objectif)L’objectif!du!cours!est! d’offrir!aux!étudiants!de!tous!horizons!une!initiation!aux!concepts,!aux!courants!de!pensée!et!aux!grands!domaines!de!l’ethnologie.!!!!

157

!EXPLOITATION*DES*COLLECTIONS*BOTANIQUES* 14B021**Semestre**

automne/printemps! 4h/sem,!total!80h!

ECTS**

5!!

Jour**

travail!individuel,!horaire!à!fixer!avec!l’étudiant(e)!

Lieu**

Conservatoire!et!jardin!botaniques!

Mode*d’évaluation*!

rapport!

PréFrequis**

Systématique!de!2ème!année!

Responsables*!

Messieurs!Ph.!CLERC!(cryptogames)!N!022!418!51!28!N!philippe.clerc@cjb.villeNge.ch!et!!L.!GAUTIER!(phanérogames)!N!022!418!51!47!N!laurent.gautier@cjb.villeNge.ch!

*Enseignant(e)s!

!Madame!M.!PRICE!(cc),!!Messieurs!Ph.!CLERC!(cc),!L.!GAUTIER!(cc),!F.!STAUFFER!(cc).!!

Contenu*Identification,!détermination!et! gestion!des! plantes!et! des! champignons!conservés!en! herbier.!Approche!pratique!dans!le!domaine!de!la!flore!suisse,!méditerranéenne!et!tropicale,!à!déterminer!en!accord!avec!les!enseignants.!!Objectif*Apprendre!à!extraire!et!utiliser!les!données!contenues!dans!un!herbier.!!!

158

!FAUNE&GENEVOISE&& 14B642&&Semestre&&

automne! 45h/sem,!total!45h!

ECTS&&

4!!

Jour&&

bloc,!du!23!au!27!septembre!2019!(y!compris!une!nuit)!!!

Lieu&&

Muséum!d’histoire!naturelle!et!extérieur!

Mode&d’évaluation&!

rapport!écrit!!

PréFrequis&&

cours!«!14B005!Biodiversité!»!(recommandé)!

Responsables&!!

Monsieur!M.!RUEDI!M!022!418!6320!–!manuel.ruedi@villeMge.ch!

Enseignant(e)s&!

M.!RUEDI!(cc)!et!collaborateurs!du!Muséum!!

Divers&Inscription!par!email!auprès!des!enseignants!requise!la!semaine!avant!le!début!du!cours.!!

Le&nombre&de&places&est&limité&à&10.!!La! priorité! sera! donnée!aux! étudiants! qui! sont! inscrits! en! Master! orientation! Biodiversité! et!Systématique!et!qui!ont!suivi!le!cours!14B005!Biodiversité.!!!Contenu&Introduction!à!la!biodiversité!régionale!M!des!méthodes!d’échantillonnage!et!la!détermination!jusqu’à!l’incorporation!de!spécimens!dans!les!collections!du!Muséum!M!à!travers!l’étude!de!quelques!grands!groupes! zoologiques! représentatifs!de! la! faune! locale! qui! correspondent!aux! spécialités! des!enseignants!(p.ex.!arachnides,!hémiptères,!papillons!de!nuits,!coléoptères,!micromammifères).!Une!importante!partie!du!cours!sera!donnée!sur!le!terrain.!L’enseignement!sera!donné!en!français!ou!en!anglais.!!Objectif&Initiation!à!la!systématique!de!la!faune!locale.!Initiation!à!la!rédaction!d’un!article!scientifique.!!!!

159

!

FLORE&ET&VEGETATION&(STAGE&DE)& 14B009&Stage&à&choix&de&2ème&et&3ème&années,&master&

!Semestre&

&

printemps! 5!jours!!

ECTS&

&

3!!

Jour& Stage!en!mai!2!juin!(dates!à!convenir)!!

Lieu& Région!genevoise!!

Mode&d’évaluation! rapport!de!stage!!

PréRrequis& cours!14B008!!

Responsable&

!Madame!M.!PRICE!(pt)!–!022.418.41.48,!michelle.price@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!P.!MARTIN!(adj!sc)!–!022.418.52.322,!pascal.martin@ville2ge.ch!!Conservatoire!et!Jardin!botaniques!de!la!Ville!de!Genève,!!192!Chemin!de!l’Impératrice!1292!Chambésy!!

Divers&

Le!stage!est!ouvert!au!public.!!Contenu&

Inventaires!de!terrain!(lichens,!bryophytes,!plantes!vasculaires)!Y!Notions!espèces!indicatrices!et!espèces!envahissantes!(expérience!du!terrain!2!relevés!en!présence,!en!abondance!ou!en!fréquence)!Y!Outils!et!techniques!(relevés!de!la!végétation,!facteurs!biotiques!/!abiotiques,!cartographique)!Y!Analyses!et!synthèse!de!la!biodiversité!et!des!paysages.!!Objectifs&

Apprendre!à!:!-! réaliser!des!inventaires!de!terrain!-! choisir!les!techniques!de!mesures!et!d’analyses!de!données!-! synthétiser!et!mettre!en!valeur!ces!résultats!

!

!

!!

160

!

FLORE&ET&VÉGÉTATION&:&Cartographie,&analyses&et&indicateurs& 14B008&Cours&à&choix&de&2ème&et&3ème&années&&Semestre&&

printemps! 3h/sem,!total!23h!

ECTS&&

2!!

Jours&&

Cinq!cours!de!3h!entre!mai!et!juin,!dates!et!horaires!à!convenir.!Une!journée!d'excursion!entre!mai!et!juin,!date!à!convenir.!!!

Lieu&&

Conservatoire!et!Jardin!botaniques!de!la! Ville! de!Genève,!salle!de!séminaire!de!la!Console!(192!rue!de!Lausanne!à!Genève)!!

Mode&d’évaluation&!

rendu!de!travaux!écrits!+!évaluation!continue!

Responsable&!

Madame!M.!PRICE!–!022.418.41.48!(CJB),!michelle.price@unige.ch!

&Enseignant!

!Monsieur!P.!MARTIN!(Adj!sc)!–!022.418.52.322!(CJB),!pascal.martin@villeZge.ch!!Conservatoire!et!Jardin!botaniques!de!la!Ville!de!Genève,!!192!Chemin!de!l’Impératrice!1292!Chambésy!!

Divers&Prière&de&s'inscrire&au&cours&également&par&email&:&pascal.martin@villeZge.ch!!Ce!cours!est!ouvert!au!public.!!Contenu&Concepts!clefs!en!écologie!spatiale!!

!! patrons!et!modèles!de!distributions!!! notions!d’échelles!et!gradients!!! niches!fonctionnelles!et!niches!réalisées!

Structure!et!dynamique!des!formations!végétales!!! évolution!spatioZtemporelle!!! relation!solZvégétationZenvironnement!

Analyses!de!la!végétation,!de!la!biodiversité!et!des!paysages!!!! outils!quantitatifs!et!qualitatifs!!! outils!cartographiques!!! richesse!et!diversité!!! espèces!indicatrices,!espèces!invasives!!! indicateurs!et!monitorings!

Outils!scientifiques!de!suivi!et!d’expertise!pour!la!conservation!et!l’aménagement!des!espaces!naturels!et!semiZnaturels!!Objectif&Comprendre!l'organisation!spatioZtemporelle!des!communautés!végétales,!leur!agencement!et!leur!dynamique.!!Utiliser! des!outils!d’analyses,!de!suivi!et!de!cartographie!de!la!végétation!pour!répondre!à!des!questions!d’aménagement!de!conservation.!!!!

161

!FLORISTIQUE+ :+chorologie,+histoire+et+connaissance+de+la+flore+ 14B033+Cours+à+choix+de+2ème+et+3ème+années++Semestre++

printemps! Nbre!d’heures!par!semaine!3.5!Nbre!d’heures!par!année!69!

ECTS++

4!!

Jour++

les!lundis!11,!18!et!25!novembre,!2,!9!et!16!décembre!2019!de!13h30!à!17h00,!potentiellement!modifiable,!en!accord!avec!les!participants.!!

Lieu++

Conservatoire!et!Jardin!botaniques,!!salle!de!séminaire!de!La!Console!(192!rue!de!Lausanne!1202)!!

Mode+d’évaluation+!

Examen!oral!et!présentation!d’articles!

Sessions+d'examens++

juin!+!rattrapage!aoûtPseptembre!

Responsable+!!

Madame!Y.!NACIRI!P!022.418.5165!–!yamama.naciri@unige.ch!et!yamama.naciri@villePge.ch!

Enseignant(e)s! Monsieur!L.!NUSBAUMER!(cc)!Madame!Y.!NACIRI!(cc).!!

Divers+Inscription+obligatoire+par!email+auprès+de+la+responsable+Madame!Yamama!NACIRI!

avant!le!10!octobre,+indépendamment+de+l’inscription+officielle.++Cinq!excursions!d’une!journée!et!une!journée!de!travaux!pratiques!d’identification!sont!prévus!en!dehors!des!dates!de!cours! listées!ciPdessus,!durant!le! semestre!de!printemps.!Les!dates!des!excursions,! de! travaux! pratiques!d’identification!et! d’examen! sont! fixées! d’entente!avec! les!étudiant(e)s.!!Contenu+Ce!cours!comprend!les!bases!théoriques!de!la!floristique.!Il!aborde!les!thèmes!suivants!:!!

Paires,!cortèges!floristiques,!histoire!de!la!flore!!Péléments!de!floristique!suisse!et!alpine!Pproblématique!des!néophytes!en!Suisse!Pnotions!de!spéciation!Papports!de!la!caryogéographie!et!la!phylogéographie!pour!l’histoire!de!la!flore!!

Ce!cours!illustre!les!éléments!théoriques!au!moyen!d’exemples!pratiques!généralement!tirés!de!la!flore!suisse!(présentation!d’articles,!excursions!et!travaux!pratiques!de!reconnaissance!d’espèces).!!Objectif+Savoir! reconnaître!les!principales!espèces!de!la! flore! régionale!et!comprendre!leur!signification!écologique!et!historique.!!!

162

FOUILLES(ARCHEOLOGIQUES,(stage(d’initiation( 13T601(Stage&obligatoire&pour&le&bachelor&en&Archéologie&préhistorique&et&anthropologie&(Semestre((

Printemps&(4&semaines)& &

ECTS((

6&&

Mode(d’évaluation(&

participation&active&et&rapport&de&stage&

Responsable(&

Madame&M.&BESSE&A&022.379.6915&A&marie.besse@unige.ch&

Enseignant(e)s& Mesdames&M.&BESSE&(pas)&et&collab.&&

Contenu(Cet&enseignement,&de&niveau&bachelor,&se&déroule&pendant&4&semaines&dans&une&«&fouilleAécole&»&où&un&encadrement&spécifique&est&destiné&aux&étudiants&débutants.&Il&s'agit&en&effet&de&les&initier&à&la&pratique&de&la&fouille&archéologique&:&comprendre&les&différentes&étapes&à&mener&sur&le&terrain,&les&techniques&de&fouilles&et&d'enregistrement&des&données,&le&traitement&des&objets,&des&sédiments&et&de&la&documentation&(fiches,&dessins,&photographies).&Il&est&demandé&à&l'étudiant&un&rapport&de&stage&présentant&le&site&archéologique,&les&raisons&de&la&fouille&et&les&activités&qu'il&a&effectuées.&Il&s'agit&d'une&phase&d'apprentissage&de&la&fouille&archéologique&sur&un&site&en&cours&d'étude.&&

!!!FOUILLES(ARCHEOLOGIQUES( 14B635(Stage(9(obligatoire((Bachelor(en(archéologie(préhistorique("Module(2.4(Archéologie(préhistorique(Master(en(archéologie(préhistorique(((Semestre((

printemps!(4!semaines)! !

ECTS((

6!!

Jour(&(lieu((

janvier1mars!/!Afrique!(Sénégal,!Ghana,!Côte!d’Ivoire)!

Mode(d’évaluation(!

Rapport!de!stage!

Responsable(!

Monsieur!E.!HUYSECOM!1!022.379.6973/67!!eric.huysecom@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Monsieur!E.!HUYSECOM!(pas)!!Mesdames!A.!MAYOR!(mer)!et!K.!DOUZE!(AdjSc3)!

( !Divers(*!Stage!à!choix!de!2ème!et!3ème!année!Bachelor!en!archéologie!préhistorique!«!Module!2.8!»,!ce!stage!se!fera!sur!un!autre!site!que!le!stage!obligatoire,!du!Module!2.4!!Contenu(Fouilles!archéologiques!sur!un!site!africain!en!cours!d’étude!et!/ou!participation!à!des!recherches!ethnoarchéologiques!!!Objectif(Apprentissage!du!terrain!africain.!!!!

163

!GENETIQUE(MOLECULAIRE(DU(DEVELOPPEMENT( 13B909(Travaux(pratiques(à(choix(restreint(de(3ème(année!(

Semestre(

(

Automne!3!semaines! 4h/sem,!total!60h!

ECTS(

(

3!!

Jours(

(

2(décembre(au(20(décembre(2019!(

Lieu(

(

Sciences!III!–!salle!0059!

PréOrequis(

(

suivre!en!parallèle!le!cours!Génétique!moléculaire!du!développement!(13B010)!

Mode(d’évaluation(

!obtention!d’un!certificat!

Responsable(

!Monsieur!F.!KARCH!P!022.379.6331!P!francois.karch@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!F.!KARCH!(po),!R.!MAEDA!(coll.!sci).!!

Divers(

!Les!inscriptions!des!travaux!pratiques!à!choix!restreint!de!3ème!année!sont!obligatoires.!

Les!inscriptions!s'effectueront!en(ligne!!!!(

Vous!recevrez!des!informations!complémentaires!par!ePmail!à!la!miOfévrier.!!!!Contenu(

L'analyse!d'individus!mosaïques,!c'estPàPdire!formés!de!cellules!génétiquement!différentes!est!une!méthode!très!performante!pour!l'étude!du!développement!d'un!organisme.!!!Ces!travaux!pratiques!abordent!les!techniques!de!génétique!moléculaire!qui!permettent!de!produire!des! individus!mosaïques!chez! la! drosophile,!soit!en! éliminant!soit!en! activant!l'expression!de!différents!gènes!d'identité!cellulaire!(gènes!sélecteurs)!ou!de!signalisation!intercellulaire!dans!un!petit!nombre!de!cellules!("analyse!clonale").!!!Les!clones!de!cellules!mutantes!seront!induits!à!différents!stades!du!développement!et!leurs!effets!sur! la! morphogenèse! (ailes,!pattes,!segments!etc)!seront!ensuite!évalués!par! inspection!des!drosophiles!adultes.!!Les!effets!sur!l'expression!au!cours!du!développement!de!différents!gènes!seront!également!mis!en!évidence!par!immunohistologie!et!observation!au!microscope!(en!fonds!clair!et!fluorescence).!!!

164

!GENETIQUE(MOLECULAIRE(DU(DEVELOPPEMENT( 13B010(Cours(à(choix(restreint(de(3ème(année!(Semestre((

automne/printemps! 2h/sem,!total!56h!

ECTS((

6!!

Jours(&(lieux(((

vendredi!8h15!8!10h!8!Sciences!III,!salle!1S059!automne!!vendredi!8h15!8!10h!8!Sciences!III,!auditoire!1S081!printemps!!!

séminaire!de!groupe!–!vendredi!12h15!–!13h00,!Sciences!III!salle!1S059!!

Mode(d’évaluation(!

examen!écrit!de!4h!/!contrôles!continus!

Sessions(d'examens((

juin!+!rattrapage!août8septembre!

Responsable(!

Monsieur!F.!KARCH!8!022.379.6331!8!francois.karch@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Madame!B.!GALLIOT!(pas),!W.!BUZGARIU!(scs),!Messieurs,!F.!KARCH!(po),!J.!ZAKANY!(mer).!!

Contenu(Comme!son!nom!l’indique,!la!Génétique!Moléculaire!du!Développement!(GMD)!étudie!les!processus!complexes!qui!gouvernent!le!développement!des!organismes!multicellulaires!en!associant!intimement!trois!disciplines!:!l’embryologie,!la!génétique!et!la!biologie!moléculaire.!La!GMD!a!pris!son!envol!à!partir! du!milieu! des!années!70,! lors! de! l’émergence!des! techniques!de! l’ADN! recombinant.!La!drosophile!a! joué! un! rôle! prépondérant!dans!cet!essor!car! non!seulement!son!développement!embryonnaire!est!bien!connu!mais!en!plus!les!généticiens,!depuis!le!début!du!20ème!siècle,!ont!identifié!de!nombreuses!mutations!qui!interrompent!ou!perturbent!ce!développement.!Grâce!à!la! biologie!moléculaire,!il!est!devenu!possible!d’isoler!les!gènes!du!développement!et!d’identifier!les!processus!moléculaires!qu’ils!contrôlent.!Vers!le!début!des!années!80,!l’observation!selon!laquelle!bon!nombre!de!ces!gènes!du!développement!sont!conservés!au!cours!de!l’évolution,!a!donné!un!point!d’entrée!pour!étudier! les! processus!similaires! chez!d'autres! invertébrés!ainsi! que!chez! les! vertébrés!et!mammifères.!Cette!conservation!des!molécules!(mais!pas!nécessairement!des!processus)!permet!également!de!corréler!l’évolution!et!le!développement,!une!nouvelle!discipline!intitulée!«!évo8dévo!».!!La!première!partie!du!cours!sera!consacrée!à!la!drosophile!avec!François!Karch.!!Dans!la!deuxième!partie,!Brigitte!Galliot!abordera!les!méthodes!moléculaires!utilisées!en!évo8dévo!et!les!bases!moléculaires!et!cellulaires!de!la!régénération,!en!prenant!l'hydre,!la!planaire,!le!triton!et!le!poisson8zèbre!comme!modèles.!!Finalement!dans!la!troisième!partie,!Jozsef!Zakany!abordera!la!biologie!du!développement!chez!la!souris! avec! l’exposé! des! techniques! qui! permettent! d’inactiver! des! gènes! spécifiques! par!recombinaison!homologue.!!Objectif(Le!but!du!cours!est!de!faire!comprendre!aux!étudiants!les!mécanismes!moléculaires!et!cellulaires!qui!permettent!à!un!organisme!de!se!développer!harmonieusement.!Pour!atteindre!ce!but,! les!étudiants!doivent! connaître!et! comprendre! les!principales!techniques!de!biologie! cellulaire! et!moléculaire! appliquées!aux!processus!de! développement.! ! La!pédagogie!et! l’évaluation!sont!centrées! sur! l’analyse! et! la! compréhension!de! contextes! expérimentaux.! A! partir! d’une!situation!expérimentale!donnée,!les!étudiants!doivent!être! capables!d’identifier!et!d’analyser!les!informations!importantes,!d’effectuer!des!déductions!sur!les!mécanismes!impliqués!dans!le!ou!les!processus!biologiques!en!cause,!éventuellement!de!proposer!une!stratégie!pour!confirmer! ou!compléter!la!compréhension!du!processus!en!cause.!!!

165

!GENETIQUE(MOLECULAIRE(DU(DEVELOPPEMENT(ET(DE(L’EVOLUTION( :(CHAPITRES(CHOISIS(

14B038(

(Semestre( automne/printemps!!

tous!les!15!jours!2h/sem,!total!28h!+!2h!travaux!à!la!maison!

ECTS((

4!!

Jour((

mercredi!17h15!–!19h!(une!semaine!sur!deux)!

Lieu((

Sciences!III,!salle!4059!

Mode(d’évaluation(!

examen!oral!/!contrôles!continu!

PréKrequis((

bachelor!en!biologie!ou!biochimie!

Sessions(d'examens((

juin!+!rattrapage!aoûtIseptembre!

Responsable(!

Monsieur!J.!ZAKANY!I!022.379.6788!I!jozsef.zakany@unige.ch!

Enseignant(e)s! B.!GALLIOT!(po)!/!M.!VOGG!(postdoc),!F.!KARCH!(po),!R.!KOCH!(cs),!!D.!PAULI!(ce),!I.!RODRIGUEZ!(po),!E.!RODRIGUEZICARBALLO!(postdoc),!A.!TZIKA!(ma),!J.!ZAKANY!(mer)!

!Divers(Ce! cours! traite! de! chapitres! spécialisés! dans! le! domaine! de! la! génétique!moléculaire! du!développement!appliquée!à!une!série!de!modèles!tels!que!l’hydre,!la!mouche!du!vinaigre,!les!reptiles,!les!mammifères.!!!Il! est!réservé!aux!étudiant(e)s!de!master!en!biologie!ou!en!biochimie!et!est!basé!sur! l'étude!de!publications!récentes!dans!ce!domaine.!!!Ce! cours,! donné!en!anglais,! est! l’occasion! pour! les! étudiantIeIs!d’analyser!puis! de!présenter!oralement!et!de!discuter!des!articles!scientifiques.!Ce!cours!nécessite!donc!une!bonne!connaissance!de!l'anglais.!Par!ailleurs!ce!cours!est!l’occasion!pour!les!étudiantIeIs!de!développer!leurs!talents!de!communicateurs!scientifiques.!!!

166

GENETIQUE(MOLECULAIRE(DES(POPULATIONS(2(MOLECULAR(POPULATION(GENETICS(

14B637(

Cours(obligatoire(pour( le(master(en(biologie(orientations(«(bioinformatique(et(analyse(des(données(en(biologie»(et(«(biodiversité(et(systématique(»(Compulsory*course*for*the*master*in*biology*options*«*bioinformatics*and*data*analysis*in*biology*»*and*«**biodiversity*and*systematics*»*Semestre/Period(( automne(/(Autumn(

((

ECTS((

5((3(pour(les(doctorants(/(3"for"PhD"students)(

Jour/Day(( une(semaine(à(plein(temps,(du(jeudi(9(au(mercredi(15(janvier(2020(inclus(One"week"full"time,"from"Thursday"9"to"Wednesday"15"January"2020"inclusive"(

Lieu/Place((

Sciences(II,(4ème(étage,(Unité(d’anthropologie(salle(419(

Mode(d’évaluation(Evaluation(mode((

rapport(de(stage(écrit(et(présentation(orale((training"course"report"and"oral"presentation(

Pré2requis(Prerequisite((

3ème(année(de(biologie(acquise(/(3rd"year"of"bachelor"acquired(Stage(ouvert(aux(doctorants,(notamment(dans(le(cadre(du(programme(doctoral(en(Ecologie(et(Biologie(évolutive(de(la(CUSO.(Training"course"open"to"PhD"students,"namely"students"following"the"doctoral"program"in"ecology"and"evolution"of"the"CUSO."(

Responsable(Person(in(charge((

Madame(A.(SANCHEZRMAZAS(–(022.379.6984/67(alicia.sanchezRmazas@unige.ch(

Enseignants(Teachers(

Mesdames(E.(POLONI((cc),(A.(SANCHEZRMAZAS((po),((Messieurs(M.(CURRAT( (mer),(D.DI((ma),(T.(GOEURY((as),((M.(MOUTERDE((as),(J.M.(NUNES((ce),(A.(TSOUPAS((as)(

Divers(Miscellaneous(Cours(donné(en(anglais(/(Course"given"in"English"("

Pré2inscription(par(e2mail(à(alicia.sanchezRmazas@unige.ch(avant(Noël(2019(Please*register*to(alicia.sanchezRmazas@unige.ch(before(Christmas(break(2019(Contenu(Contents(Ce( stage( permet( aux( étudiant(e)s(d’acquérir( les( connaissances(de( base( en( génétique(des(populations(par(l’analyse(sur(ordinateur(de(jeux(de(données(moléculaires(fournis(par(les(enseignants.(Le(travail(pratique(consiste(à(effectuer(les(diverses(étapes(d’une(étude(de(la(structure(génétique(des(populations:(manipulation(des(données,(analyses(à( l'aide(des( logiciels( couramment(utilisés(en(génétique(des(populations,(représentations(graphiques,(interprétation(des(résultats.(Les(notions(théoriques(sont(introduites(au(début(de(chaque(séance(et(approfondies(au(cours(du(travail(pratique.(Une(ou(plusieurs(conférences(sont(également(données(pendant(le(stage(par(des(chercheurs(invités.(Le(stage(est(destiné(aux(étudiants(du(master(en(biologie(et(aux(doctorants((cet(enseignement(est(inscrit( au(programme(doctoral( interRuniversitaire(en(Ecologie(et(Biologie(évolutive(de( la(CUSO(http://biologie.cuso.ch/ecologieRevolution).((

This" training" course" provides" students"with" basic" knowledge" in" population"genetics" through"computerLassisted"analyses"of"different"molecular"datasets"provided"by"the"teachers."The"practical"work"consists"in"carrying"out"the"different"steps"of"a"study"aiming"at"defining"the"genetic"structure"of"populations:"data"management,"data"analysis"using"usual"computer"programs"in"population"genetics,"graphical"representations,"interpretation"of"the"results."The"theoretical"concepts"are"introduced"at"the"beginning"of"each"course"and" trained"during" the"practical" sessions."One" or" several" scientific"conferences"are"also"given"by"invited"speakers."This"training"course"is"for"students"following"the"master"in"biology"but"also"for"PhD"students"(it"is"part" of" the" doctoral" program" in" Ecology" and" Evolution" of" the" CUSO" L""http://biologie.cuso.ch/ecologieLevolution)."

!

167

GEOMATIQUE*I* 12T408*

Cours*à*choix*de*2ème*et*3ème*années*

Cours*à*choix*Bachelor*en*archéologie*préhistorique*«*Module'2.8'»***

Semestre*

*

automne' 3h/sem,'total'40h'

ECTS*

*

2'(cours'+'TP'intégrés)'3'(biologistes)'2.5'(Bachelor'en'archéologie'préhistorique)'''

Jour*

*

vendredi'aprèsFmidi'(10x)'(Semaines'5'à'14)''

Lieu*

*

13h15F14h'Cours':'Sc.'III,'salle'1S059'14h15F17h'TP':'Carl'Vogt,'salles'info''

Mode*d’évaluation*

'examen'écrit'

Sessions*d'examens*

*

janvierFfévrier'+'rattrapage'aoûtFseptembre'

Responsable*

'Monsieur'A.'LEHMANN'–'anthony.lehmann@unige.ch'Uni'Carl'Vogt''

Enseignant(e)s' Messieurs'A.'LEHMANN'(pas),'Y.'GUIGOZ'(CE)''

Contenu*

Le'cours's’articule'autour'des'chapitres'suivants':'1.'Introduction':'de'l'Erudit'de'Séville,'au'Capitaine'Cook,''à'Google'Earth''2.'Modéliser'notre'monde':'mode'vecteur'ou'raster'?''3.'Analyses'en'mode'vecteur':'base'de'données'et'réseaux''4.'Analyses'en'mode'raster':'analyses'locales,'focales,'zonales'et'globales''5.'Introduction'à'la'télédétection':'la'Terre'vue'de'l'espace'!''6.'Type'et'qualité'des'données,'topologie'7.'Sources'de'données,'géoréférençage'et'projection'8.'Métainformation':'l’information'sur'la'donnée'9.'Software''Objectif*

Introduction'aux' systèmes' d’information'géographique' (SIG)' en' tant' qu’outils' d’analyse'de'l’environnement'à'diverses'échelles,'du'bassin'versant'à'la'planète'entière.''Contenu*X*Travaux*pratiques*intégrés*

Le'cours'et'les'travaux'pratiques'associés'visent'à'transmettre'les'bases'théoriques'et'pratiques'aux'étudiants'en'suscitant'leur'curiosité'afin'qu’ils'puissent'commencer'à'utiliser'les'SIG'et/ou'la'télédétection'dans'leurs'travaux'de'diplôme'et'de'thèse.'Les'travaux'pratiques'sont'réalisés'avec'ArcGIS'10.3'de'ESRI'(www.esri.com).''!

168

!HISTOIRE(DES(REPRESENTATIONS(DE(LA(DIVERSITE(

BIOLOGIQUE(ET(CULTURELLE(DES(HUMAINS(ET(DE(LEURS(

ORIGINES((

14B030(

Cours(à(choix(de(2ème(et(3ème(année(

!Semestre(

(

printemps! 3h/sem,!total!28h!

ECTS(

(

3!!

Jour(

(

vendredi!10h15!812h!

Lieu(

(

Sciences!III,!salle!1S081!

Mode(d’évaluation! examen!oral,!répondre!de!manière!structurée!et!synthétique!à!une!question!d’ordre!général!portant!sur!des!aspects!conceptuels!fondamentaux!de!l’ensemble!du!cours.!!

Sessions(d'examens(

(

juin!+!rattrapage!août8septembre!

Responsable(

!!

Monsieur!N.!HUBERT!Van!BLYENBURGH!8!022.379.6978!ninian.hubert@unige.ch!

Enseignant(

!Monsieur!N.!HUBERT!Van!BLYENBURGH!(cc).!

Divers(

Ce!cours!ne!nécessite!pas!de!niveau!préalable!en!biologie!ou!mathématiques.!!Il(est(ouvert(au(public.!!Contenu(

Cet!enseignement!propose!un!parcours!à!travers! l’histoire!de!la! construction!de!la!connaissance!scientifique!sur!notre!espèce.!Il!discute!les!obstacles!épistémologiques,!les!préceptes!«!moraux!»!et!les!préjugés!qu’il!a!fallu!dépasser!pour!parvenir!aux!représentations!scientifiques!actuelles!sur!notre!propre!espèce.!!!Organisé!en!«!7!Leçons!»,!il!explore!l’élaboration!des!savoirs!dans!des!disciplines!comme!l’histoire!naturelle,!la!paléontologie,!la!préhistoire,!la!génétique!des!populations,!la!neurobiologie,!la!linguistique,!la!démographie,!la!psychologie!sociale!et!l’anthropologie!culturelle!afin!de!montrer!comment,!avec!le!temps,!les!sciences!humaines!et!de!la!nature!ont!progressivement!élaboré!un!corpus!de!connaissance!essentiel!pour!comprendre!l’origine! de!notre!espèce,!sa! spécificité,!sa!variabilité! biologique,!sa!diversité!culturelle!et!l’organisation!de!sa!vie!en!société.!Formant!un!ensemble!de!connaissances!de!bases!sur!notre!propre!espèce,!ce!corpus!est!essentiel!pour!structurer!notre!pensée!sur!nous8mêmes,!nos!semblables!et!sur! les! relations!que!nous!entretenons!les!uns!avec! les! autres.!Il! permet!de!substituer!un!savoir!construit!à!l’ignorance,!les!préjugés,!les!stéréotypes!et!les!idées!fausses.!Le!fait!que!ce!corpus!devrait!faire!l’objet!d’un!enseignement!systématique,!autrement!dit,!de!toute!«!culture!générale!»,!est!également!discuté.!!Ce!parcours!à!travers! l’histoire!des! représentations!de!nos!semblables!permet!encore!de!prendre!conscience!que!de!tous!les!sujets!qui!ont!fait!l’objet!d’un!questionnement!scientifique,!celui!de!l’étude!de!notre!propre!espèce!est!le!sujets!qui!a!connu!les!controverses!les!plus!dures!et!les!dérives!les!plus!terrifiantes.!A!ce!titre,!il!est!également!démonstratif!de!la!manière!dont!la!pensée!scientifique!peut!être!soumise!aux!préjugés,!aux!dogmes!et!aux!mythes,!anciens!ou!récents.!C’est!pourquoi!ce!cours!se!veut!aussi!instructif!de!la!manière!dont!le!savoir!scientifique!se!construit.!!Objectif(

Comprendre! la!construction!des!connaissances!scientifiques!actuelles!sur! l’origine! et! la! diversité!biologique!et!culturelle!de!notre!espèce.!Identifier!les!conceptions8clé!de!l’anthropologie!biologique!et!culturelle.!Comprendre!la!place!des!conceptions!scientifiques,!et!plus!particulièrement!celles!de!la!biologie,!dans!l’élaboration!des!connaissances!de!base!sur!notre!propre!espèce.!Comprendre!les!enjeux!de! société!de! ces! connaissances!et! leur! influence!sur! l’élaboration!des! représentations!collectives!à!propos!de!notre!espèce.!!!!

169

!HISTOLOGIE)ET)IMAGERIE)DES)TISSUS) 14B640)Cours)et)stage)pratique)))Semestre))

printemps! 40h!au!total!

ECTS))

3!!

Dates))

Plusieurs!créneaux!(40h!de!cours!au!total)!!répartis!entre!le!29!juin!et!le!10!juillet!2020!!

Lieu))

Sciences!III,!Salle!TP!0016!!

Mode)d’évaluation)!

rapport!noté!

PréHrequis))

Ce!cours!est!destiné!aux!étudiants!de!troisième!année!de!bachelor!et!de!master.!

Responsable)!

Monsieur!S.!LOUBÉRY!(cc)!N!022.379.65.68!N!sylvain.loubery@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!S.!LOUBÉRY!(cc)!!

Divers)Modalités)et)date)limite)d’inscription):)par)eHmail)à)l’adresse)sylvain.loubery@unige.ch,)

avant)le)15)avril)2020.))Le!nombre!de!participants!étant!limité!à!10,!il!est!demandé!de!joindre!une!lettre!de!motivation!à!la!demande!d’inscription.!!S’il! y!a!des!participants!non!francophones!au!cours,!la!partie! théorique!du!cours!pourra!être!donnée!en!anglais![!la!partie!pratique,!elle,!sera!principalement!donnée!en!français.!!Contenu)Avec!quelles!méthodes!peutNon!analyser!l’organisation!d’un!tissu!?!Comment!peutNon!étudier!la!localisation!d’une!protéine!ou!d’un!ARN!dans!un!organe,!voire!dans!un!organisme!entier!?!En!se!basant!sur!quelques!exemples!concrets,!le!cours!présente!des!techniques!couramment!utilisées!en!biologie!pour!l’imagerie!des!tissus.!!Le!cours!est!centré!autour!des!méthodes!d’histologie!classiques!:!préparation!des!échantillons!en!vue! de! la! réalisation!de! coupes,!microtomie,! colorations!histochimiques,! immunoNlocalisation,!observation.!L’histologie!classique!sera!comparée!aux!autres!moyens!usuels!permettant!l’imagerie!des!tissus!(microscopie!à! fluorescence!à!champ!large!et!microscopie!confocale).!Pour!chacun!de!ces!types!d’imagerie!les!étudiants!vont!recevoir!des!rappels!théoriques,!préparer!des!échantillons!et!les!observer!en!petits!groupes!au!microscope.!!Par!ailleurs,!les!techniques!d’histologie!modernes!seront!discutées!pendant!le!cours!(microscopie!à!feuille!de!lumière,!clearing,!etc.).!Enfin,!le!cours!donnera!aussi!des!outils!(théoriques!et!pratiques)!pour!manipuler!et!analyser!des!images!de!microscopie.!!Objectif)Les!objectifs!sont!les!suivants!:!

•! connaître!les! différentes!méthodes!de!préparation!et! de!coupe!des!échantillons!en!histologie!et!expliquer!leurs!caractéristiques![!

•! apprécier! les! avantages!et! les! limites! de!chaque!méthode,!ainsi!que! les! difficultés!relatives!à!leur!mise!en!œuvre!en!pratique![!

•! comparer!les!avantages!de!coupes!histologiques!classiques!et!de!coupes!optiques!issues!de!diverses!méthodes!de!microscopie!à!fluorescence![!

•! étant! donné! un! nouvel! échantillon! à! étudier,! pouvoir! proposer! un! projet!d’histologie/imagerie!adapté!en!fonction!des!caractéristiques!du!tissu!d’intérêt.!

!!!!

170

!HYDROBIOLOGIE+MICROBIENNE+:++Environnement+naturel+et+construit,+aspects+écologiques,+hygiéniques+et+sanitaires+

14B041+

Cours+à+choix+de+2ème+et+3ème+années++Semestre++

printemps!3!jours! Nbe!d’heures!par!année!28!

ECTS++

3!!

Jour++

fin!semaine!début!juillet!(3!jours!consécutifs!avant!le!stage!14B641)!

Lieu++

Centre!de!Biologie!Alpine!de!Piora!

Mode+d’évaluation+!

Rapport!et!présentation!orale!

Responsable+!

M.!TONOLLA!–!058.666.62.69!–!mobile!079.380.69.96!mauro.tonolla@unige.ch!et!mauro.tonolla@supsi.ch!!Ecologie!microbienne,!Unité! de!microbiologie,!Dép.!Biologie!végétale,!Université!de!Genève,!30!Quai!ErnestXAnsermet,!1211!Genève!4,!Suisse!!et!Laboratory! of! applied! microbiology,! University! of! Applied! Sciences!Southern!Switzerland!(SUPSI),!Via!Mirasole!22A,6500!Bellinzona!!!

Enseignant(e)s! N.!STORELLI!(coll),!M.!TONOLLA!(cc),!A.!BRUDER!(coll),!A.!DEMARTA!(coll),!R.!PEDUZZI!(pas)!Xretraité).!!!

Divers+Ce!cours!sera!donné!en!annexe!au!stage14B641!au!Centre!de!Biologie!Alpine!du!val!Piora!dans!le!Massif! du!SaintXGothard!aux!bords!du!Lac!de!Cadagno!(www.cadagno.ch).!Enseignement!en!français!et!anglais.!Inscription!auprès!du!secrétariat!des!étudiants!de!la!faculté!des!sciences!!Contenu+Le!cours! traite!les!microbes,! l'eau!et!la!santé!dans!une!perspective!globale,!depuis!les!agents!pathogènes!d'origine!hydrique! (Legionella,!Aeromonas,!Yersinia,!Pseudomonas,..)! jusqu’à! la!problématique!des!résistances!aux!antibiotiques!induite!par!la!présence!de!micropolluants.!Des!sujets! réels! liés! à! l'hygiène!de! l'eau,!au! traitement!des!eaux!usées!et!à! la!biosécurité!dans!l'environnement!naturel!et!construit!seront!traités!ainsi!que!la!problématique!de!l'eau!en!milieu!urbain! et! la! présence!de! vecteurs! d'agents!pathogènes.!En! particulier,! le! problème! de! la!transmission!de!virus!dangereux!(Dengue,!Chikungunya,!West!Nile!ou!Zika)!par!les!moustiques!(par!exemple!moustique!tigre)!vivant!dans!l'eau!des!zones!urbanisées,!ainsi!que!leur!monitorage!et!contrôle!en!utilisant!d’agents!biologiques,!sera!discuté!sur!la!base!des!expériences!concrètes!acquises!pendant!30!ans!d’activité!en!Suisse.!!!Objectif+Transmettre! les! bases! pour! la! compréhension! des! connexions! entre! environnement,!microorganismes!et!santé!sur!la!bases!d’examples!concrets.!!!!

171

!HYDROBIOLOGIE+MICROBIENNE+:++Ecologie+microbienne+et+écologie+alpine+

14B641+

Stage+à+choix+de+2ème+et+3ème+années++Semestre++

printemps!5!jours! Nbe!d’heures!par!année!40h!

ECTS++

4!!

Jour++

2ème!semaine!de!juillet!

Lieu+!

ce!stage!a!lieu!en!été!au!Centre!de!Biologie!Alpine!du!val!Piora!dans!le!massif!du!SaintCGothard!au!bord!du!lac!de!Cadagno!(www.cadagno.ch).!!

Mode+d’évaluation+!

rapport!de!stage!

Responsable+!

M.!TONOLLA!C!058!666!62!69!mauro.tonolla@unige.ch!et!mauro.tonolla@supsi.ch!!Ecologie!microbienne,!Unité!de!microbiologie,!Dép.!Biologie!végétale,!Université!de!Genève,!30!Quai!ErnestCAnsermet,!1211!Genève!4,!Suisse,!et!Laboratory!of!applied!microbiology,!University!of!Applied!Sciences!Southern!Switzerland!(SUPSI),!Via!Mirasole!22A,!6500!Bellinzona!!

Enseignant(e)s! M.!TONOLLA!(cc),!N.!STORELLI!(coll.),!A.!BRUDER!(coll.),!!M.!BUECHE!(coll.),!D.!BOUFFARD!(coll.),!S.!ROMAN!(coll.),!!X.!PERRET!(mer),!A.!DEMARTA!(coll)!!

Divers+Enseignement!en!français/anglais.!!Inscription!auprès!du!secrétariat!des!étudiants!de!la!faculté!des!sciences!!Contenu+Excursions!sur!le!terrain!et!prélèvements!d’échantillons!de!divers!écosystèmes!alpins!(lacs,!marais,!sols).!Analyses!physicoCchimiques!et!application!de!méthodes!classiques!et!moléculaires!pour!la!détection!et!le!typage!des!microorganismes.!!Ecologie!microbienne!(anaerobic!sulfur!bacteria)!et!physique!de!l’eau!(basinCscale!internal!waves)!du!lac!de!Cadagno!:!Relations!chimisme!de!l’eau!et!populations!microbiennes,!pollutions,!écologie,!biodiversité!microbienne,!symbioses.!Travail!sur!le!lac!et!analyse!des!échantillons.!Le!cours!donne!un!aperçu!sur!les!mécanismes!de!base!soutenant!la!vie!des!microbes!dans!des!environnements!hydriques!(les!lacs,!les!cours!d'eau,!la!neige,!...),!en!particulier!dans!la!zone!alpine.!!Les!exemples!sont!choisis!sur!le!site.!!Objectif+Acquisition!des!techniques!de!travail!sur!le!terrain,!échantillonnages!dans!des!milieux!hydriques!et!terrestres.!!Compréhension!des!approches!moléculaires!pour! l’analyse!de!la! structure!de! la! communauté!microbienne!et!de!sa!fonction.!!Compréhension!du!rôle!de!la!vie!microbienne!dans!les!cycles!biogéochimiques.!Etude!des!dynamiques!des!populations!microbiennes!lacustres!des! interactions!abiotiques!et!biotiques!au!sein!des!communautés!microbiennes.!!!!!

172

!!!INTRODUCTION)A)L'ARCHEOLOGIE)AFRICAINE)–)séminaire)) 14B702)

Séminaire)obligatoire)pour)le)bachelor)ès)Lettres)mention)Archéologie)préhistorique)et)

anthropologie)

Bachelor!en!archéologie!préhistorique)«Module)1.2)Introduction)à)la)préhistoire»))

Semestre) automne!!!

2h/sem,!total!28h!

ECTS)

)

3!

Jour) jeudi!15h!=17h!!!

Lieu)

)

Sciences!II,!salle!449!

Mode)d’évaluation) travail!écrit!et!présentation!orale!) !Responsables)

)

Monsieur!E.!HUYSECOM!=!022.379.6973/67!=!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s) Messieurs!E.!HUYSECOM!(pas),!J.!AYMERIC!(as),!Madame!C.!CERVERA!(as).!!

Divers)

A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS)

A)LIEU)EN)AUTOMNE)2019!Contenu)

Sujets!en!relation!avec!le!cours!n°!14B002.!!Objectifs)

Acquisition!des!outils!nécessaires!à!la!conduite!d’une!recherche!personnelle!et!à!la!rédaction!d’une!monographie.!!!

173

!INTRODUCTION)A)LA)BIOINFORMATIQUE)POUR)BIOLOGISTES) 12C902X)Travaux)pratiques)Semestre))

printemps! 20h/sem!

ECTS))

1!!

Jour))

13h30!017h30!!du!29!avril!2019!au!3!mai!2019!!!

Lieu))

salle!définie!selon!disponibilité!(annonce!dans!le!fascicule!de!protocoles!des!TP)!

Mode)d’évaluation)!

rapport!d’expériences,!certifié!

Responsable)!

Monsieur!Th.!SOLDATI!–!022.379.6496!0!thierry.soldati@unige.ch!

Enseignante! Madame!M.0C.!BLATTER!(ce)!!

Divers)Liaison!avec!d'autres!cours!:!Biochimie!II!(12C002)!!Préparation!pour!Biochimie!III!(13C008)!et!les!Travaux!Pratiques!de!Biochimie!III!pour!biologistes!(13C908X),!ainsi!que!pour!le!BSc!en!biologie.!!Remarques!:!!L'inscription!à!ces!Travaux!Pratiques!à!option!est!à!effectuer!obligatoirement!avant!fin!février,!auprès!du!responsable!(thierry.soldati@unige.ch),!de!l’enseignante!(Marie0Claude.Blatter@sib.swiss)!et!du!Secrétariat!du!Département!de!biochimie!(cecile.heymans@unige.ch).!!!Le!nombre!de!participants!pour!ces!Travaux!Pratiques!est!limité.!!Contenu)La!semaine!de!Travaux!Pratiques!est!dédiée!à!l'introduction!aux!banques!de!données!et!aux!outils!bioinformatiques^!elle!est!dispensée!dans! le! cadre!des!Travaux!Pratiques!de!biochimie!pour!biochimistes!de!2ème!année.!!Protocole)de)Travaux)Pratiques!!(partiellement!en!anglais^!disponible!sur!Chamilo!https://chamilo.unige.ch/home/courses/12C902X/ou!auprès!de!l'enseignant!(Marie0Claude.Blatter@isb0sib.ch))!!Objectif)Ces!Travaux!Pratiques!permettent!de!découvrir!les!principales!banques!de!données!et!outils!de!prédiction!bioinformatiques!disponibles!en!ligne,!utilisés!dans!les!laboratoires!de!biochimie!et!de!biologie.!!!!!

174

!INTRODUCTION)A)LA)BIOLOGIE)DU)COMPORTEMENT) 14B043)Cours)à)choix)de)2ème)et)3ème)années))Semestres))

automne/printemps!!!(13!séances!le!jeudi,!selon!calendrier!donné!à!la!rentrée!+!mémoire!écrit)!!

2h/sem.,!total!28h!

ECTS))

3!!

Jour))

jeudi!10h15!@!11h50!dès!le!jeudi!19!septembre!2019!(puis,!5!dates!de!septembre!à!décembre!2019!et!7!dates!de!février!à!juin!2020,!calendriers!donnés!à!la!rentrée!et!à!la!fin!du!semestre!d’automne).!!

Lieux))

Semestre)automne):!Sciences!III,!salle!1S059!Semestre)printemps):!Sciences!III,!salle!1S081!!

Mode)d’évaluation)!

examen!écrit,!2h!+!mémoire!interactif.!

Sessions)d'examens))

juin!+!rattrapage!août@septembre!

Responsable)!

Monsieur!A.!LANGANEY!@!022.379.69.68!/67!@!andre.langaney@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!A.!LANGANEY!(ph),!D.!ROESSLI!(coll.!sci.).!!

Divers)Ce!cours!d'initiation!destiné!aux!étudiant(e)s!en!Biologie!et!en!Psychologie!est!ouvert!aux!étudiants!des!autres!Facultés!et!au!public.!!Contenu)Ce! cours! a! pour! objectif! de! comprendre! les! principaux! mécanismes! qui! déterminent! les!comportements!animaux!(humains!compris)!et!de!reconstituer!les!étapes!de!leur!apparition!et!de!leur!différenciation!au!cours!de!l’histoire!du!monde!vivant.!Un!intérêt!particulier!est!porté!aux!interactions!entre!des! facteurs!génétiques!et!la!mise!en!œuvre!physiologique!du!comportement,!ainsi!qu’aux!apprentissages!éventuels.!L’émergence! des! comportements! humains! et! les! limites! de! leurs!spécificités!sont!évoquées!ou!abordées!au!cours!des!chapitres!successifs.!

1.! Les!comportements!animaux!dans!l’histoire!du!monde!vivant,!!2.! Les!mécanismes!de!l’évolution!animale,!implications!pour!les!comportements!d!!3.! Genèse!d’un!comportement!animal!d!!4.! Génétique,!sexe!et!comportement!d!5.! La!mise!en!œuvre!physiologique!des!comportements!:!!6.! Les!comportements!dits!«!innés!»!d!!7.! L’apprentissage,!dans!la!nature!et!en!expérimentation!d!!8.! Comportement,!territoires,!structures!sociales!d!!9.! Les!comportements!des!primates!d!10.!Conditionnements,!traditions,!cultures!11.!Les!spécificités!humaines!!12.!Biologie!du!comportement!humain!13.!Répétitoire.!

!Objectif)Sensibiliser! les! étudiants!en!biologie,!en! psychologie!et! les!autres!auditeurs!à! l’importance!des!comportements!dans!l’histoire!de!la!vie!et!à!celle!de!la!biologie,!dans!leur!histoire!comme!dans!leur!réalisation.!Montrer!comment!la!plupart!des!comportements!humains!sont!issus!d’une!longue!histoire!du!vivant!et!non!des!seules!particularités!de!notre!espèce.!Mettre!en!valeur!ce!que!l’histoire!du!monde!animal!nous!apprend!sur!notre!vie!et!notre!quotidien.!!

175

!INTRODUTION(A(LA(GENETIQUE( 14B037P((Semestre((

printemps! 3h/sem,!total!42h!

ECTS((

*8!ECTS!(chimistes!+!biochimistes)!*5!ECTS!(pharmaciens)!!

Jours((

lundi!13h15!B14h!mardi!14h15!B16h!!

Lieu((

Sciences!II,!A300!

Mode(d’évaluation(!

examen!écrit!(4h)!

Sessions(d'examens((

juin!+!rattrapage!aoûtBseptembre!

Responsable(!

Monsieur!D.!PAULI!B!022.379!67!55!–!daniel.pauli@unige.ch!!

Enseignant(e)s! Monsieur!D.!PAULI!(ce),!V.!OSSIPOW!(ce)!!

Divers(*!Etudiants!en!chimie/biochimie:!8!ECTS,!acquis!lorsque!la!moyenne!des!enseignements!11C003!(Biochimie!I!B!Automne)!et!14B037P!(Introduction!à!la!génétique!/!Biochimie!I!B!Printemps)!est!égale!ou!supérieure!à!4.0.!!*!Etudiants!en!sciences!pharmaceutiques:!5!ECTS,!acquis!lorsque!la!moyenne!des!enseignements!11C003!et!14B037P!est!égale!ou!supérieure!à!4.0.!!Contenu(La!génétique!:!!B!Introduction!et!historique!!B!Cycle!cellulaire,!mitose,!méiose!!B!Génétique!mendélienne!!B!Recombinaison!!B!Interaction!des!gènes!!B!Types!et!mécanismes!de!mutations!!B!Régulation!de!l'expression!génique!!B!Régulation!de!la!prolifération!cellulaire!et!cancer!!B!Les!bases!génétiques!du!développement!!B!Génétique!des!populations!et!évolution!!Objectif(Griffiths,!Gelbart,!Miller,!Lewontin!(2001).!Analyse!génétique!moderne.!De!Boeck!Université.!!

176

!INTRODUCTION)A)L’HISTOIRE)ET)A)LA)PHILOSOPHIE)DES)SCIENCES)

10S003)

)Semestre))

automne/printemps! 2h/sem,!total!56h!

ECTS))

6!!

Jour))

jeudi!16h15!7!18h!

Lieu))

Sciences!III!–!salle!1S059!

Mode)d’évaluation)!

examen!oral!

Sessions)d'examens))

juin!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable)!

Monsieur!J.!LACKI!–!022.379.6385!–!jan.lacki@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!J.!LACKI!(pt).!!

Contenu)La!nécessité!de!préciser! les! cadres! théoriques!et!pratiques!de! l’activité!scientifique!a!attiré!l’attention!des!savants!de!toutes!les!périodes.!Depuis!l’avènement!de!la!science!moderne!au!XVIIe!siècle,!jusqu’aux!révolutions!de!la!théorie!de!la!relativité!et!de!la!théorie!quantique!du!XXe!siècle,!en!passant!par!la!théorie!de!l’évolution!et!les!problèmes!spécifiques!posés!pas!les!sciences!de!la!vie,!on!examinera!comment!la!science!s’est!constituée!pour!devenir!cette!grande!aventure!de!l’humanité!que!nous!connaissons!aujourd’hui.!Le!cours! discutera!aussi! comment,!tout!en!se!construisant,!la! Science!a! modifié! nos!conceptions!philosophiques!de!ce!qu’est! la! réalité!et!comment!l’homme!peut!la!connaître.!S’appuyant!sur!des!épisodes!remarquables!de!l’histoire!des!sciences,!il!servira!ainsi!d’introduction!aux!grands!problèmes!de!la!philosophie!des!sciences!en!montrant!comment!ces!derniers!trouvent!leur!racine!directement!dans!la!pratique!scientifique.!!Le!cours,!qui!évoque!aussi!bien!les!problèmes!internes!à!la!science,!que!ceux!touchant!sa!place!dans!la! société!et!dans! la!culture,!s’adresse!non!seulement!aux!étudiants!de! la!Faculté!des!Sciences!mais!aussi!à!ceux!de!la!Faculté!des!Lettres,!de!Sciences!Economique!et!Sociales,!de!Droit,!etc.!Le!matériel!didactique!épaulant!chaque!séance!est!disponible!sous!forme!électronique!sur!la!plateforme!Chamilo!de!l’Université.!!!

177

!

INTRODUCTION)AUX)METHODES)DE)RECHERCHE))EN)DIGITAL)HUMANITIES)

14B779)

)Semestre))

printemps! 2h/sem,!total!

28h!

ECTS))

3!

!

Mode)d’évaluation)!

Compte4rendu!écrit!d’un!travail!de!recherche!publié!sur!un!carnet!de!

recherche!en!ligne!ouvert!spécialement!pour!le!cours!

!

Sessions)d'examens)))

juin!+!rattrapage!août4septembre!

Responsables)!

Messieurs!!

B.!STRASSER!–!022.379.0712!4!bruno.strasser@unige.ch!

J.!BAUDRY!–!022.379.3375!4!jerome.baudry@unige.ch!

!

Madame!E.!TANCOIGNE!–!022.379.3390!4!elise.tancoigne@unige.ch!!

!

)Enseignant(e)s!

!

Madame!E.!TANCOIGNE!(postdoc),!!

Messieurs!J.!BAUDRY!(postdoc)Z!B.!J.!STRASSER!(po)Z!!

intervenants!externes!!

Divers))

N’AURA)PAS)LIEU)EN)2018Q2019)!

Ce!cours!s’adresse!principalement!aux!étudiants!en!master!ou!en!doctorat!en!sciences!naturelles,!

humaines!ou!sociales,!ainsi!qu’aux!chercheurs!

!

Contenu)&)objectif)L’objectif!de!ce!séminaire!est!d’explorer!les!nouvelles!méthodes!de!recherche!en!“Digital!Humanities”,!

en!particulier!pour! la! recherche!sociologique!et!historique.!La!production!croissante!de!sources!

numériques!(blogs,!tweets,!forums,!emails)!et!la!numérisation!extensive!de!corpus!anciens!(Gallica,!

Digital! Public!Library!of!America,!Venice!Time! Machine)!présente!des!opportunités!et!des!défis!

nouveaux!pour!les!chercheurs.!L’analyse!thématique!de!larges!corpus!de!textes!(“topic!modeling”),!

l’utilisation!de!médias!sociaux!comme!sources!historiques,!le!recours!aux!infographies!géolocalisées,!

ou!la!production!collective!de!textes!représentent!autant!de!pratiques!susceptibles!de!transformer!le!

métier!de!chercheur.!

!

!

!

178

!!!!INTRODUCTION)AU)NEOLITHIQUE)ET)AGE)DES)METAUX)AFRICAINS)

12B021)

Cours!/séminaire!obligatoire)bachelor!en!archéologie!préhistorique)"Module)2.4a)Archéologie)préhistorique)–)partie)A"))Semestre))

automne!! 2h/sem,!total!28h!

ECTS))

3!

Jour))

mercredi!15h15!=!17h!!

Lieu))

Sciences!II,!salle!449!

Mode)d’évaluation)!

examen!oral,!travail!écrit!et!présentation!orale!

Sessions)d'examens))

février!+!rattrapage!août=septembre!

Responsable)!

Monsieur!E.!HUYSECOM!=!022.379.6973/67!=!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s))

Monsieur!E.!HUYSECOM!(pas)!et!collaborateurs.!

Divers)A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS)A)LIEU)EN)AUTOMNE)2021)

)Contenu)La!richesse!culturelle!de!l'Afrique!n'est!plus!à!démontrer.!On!y!trouve!non!seulement!parmi!les!plus!anciens!foyers!d'invention!de!la!céramique!et!de!la!métallurgie!du!fer!connus!à!ce!jour,!mais!aussi!de!nombreux!royaumes!prestigieux!qui!ont,!pour!certains,!changé!le!cours!de!l'Histoire!bien!au=delà!du!continent.!La!très! grande!diversité!que! l'on!observe!aujourd'hui!en!Afrique,!autant!génétique!que!culturelle,!est!en!grande!partie! issue!de!vastes!mouvements!de!populations,!qu'ils!soient! liés!aux!variations!climatiques!ou!à!des!échanges!commerciaux!à!longue!distance!résultant!directement!de!cette!histoire!originale!et!complexe.!!Ce!cours!est!conçu!comme!une!introduction!générale!à!la!Préhistoire!et!à!l'Histoire!de!l'Afrique,!ainsi!qu'à!sa!grande!diversité!humaine.!Il!sera!enrichi!de!séances!de!séminaire!au!cours!desquelles!les!étudiants!pourront!manipuler!des!vestiges!archéologiques!originaux.!!Objectif)Acquisition!des!connaissances!élémentaires!dans!le!domaine!de!la!Préhistoire!et!de!l'Histoire!de!l'Afrique.!!!!

179

!!!!INTRODUCTION)AU)PALEOLITHIQUE)AFRICAIN) 12B020)Cours!/séminaire!obligatoire)bachelor!en!archéologie!préhistorique)"Module)2.4a)Archéologie)préhistorique)–)partie)A"))Semestre))

automne!! 2h/sem,!total!28h!

ECTS))

3!

Jour))

mercredi!15h15!=!17h!!

Lieu))

Sciences!II,!salle!449!

Mode)d’évaluation)!

examen!oral,!travail!écrit!et!présentation!orale!

Sessions)d'examens))

février!+!rattrapage!août=septembre!

Responsable)!

Madame!K.!DOUZE!=!022.379.6962!=!katja.douze@unige.ch!!

Enseignant(e)s))

Madame!K.!DOUZE!(AdjSc3)!et!collab.!

Divers!A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS.)A)LIEU)EN)AUTOMNE)2020)

)Contenu)L'Afrique!est!aujourd'hui!unanimement!considérée!comme!le!berceau!de!l'humanité,!là!où!les!premiers!hominidés!se!sont!développés!et!où!les!premiers!outils!en!pierre!ont!été!inventés.!Le!Paléolithique!africain!est!donc!l'un!des!plus!diversifié!et!des!plus!riches!connus!à!ce!jour,!même!si!la!connaissance!des!périodes!qui!le!compose!est!souvent!incomplète!et!en!constante!évolution.!!Ce!cours!introduira!les!bases!de!notre!connaissance!actuelle!sur!le!Paléolithique!africain!en!présentant!les!principaux!ensembles!culturels!qui!se!sont!succédés!dans!les!différents!endroits!du!continent,!ainsi!qu’un!aperçu!sur!les!différentes!formes!d'hominidés!qui!en!sont!les!auteurs.!Le!cours!sera!enrichi!de!séances!de!séminaire!pendant!lesquelles!les!étudiants!pourront!manipuler!et!apprendre!à!analyser!les!outils!en!pierre!typiques!de!ces!périodes,!et!développer!un!travail!écrit!sur!un!thème!choisi.!!Objectif)Acquisition!des!connaissances!élémentaires!sur!le!Paléolithique!de!l’Afrique.!!!!

180

!INTRODUCTION)A)LA)RECHERCHE)EN)BIOLOGIE)MOLECULAIRE)DES)VEGETAUX)

14B045)

Cours)à)choix)pour)le)bachelor)en)archéologie)préhistorique)et)anthropologie))Semestre))

automne/printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS))

4!!

Jour)&)lieu))

Ce!cours!sera!donné!une!semaine!sur!deux!!Une!séance!d’information!sera!fixée!à!la!rentrée,!!contacter!:!michael.hothorn@unige.ch!!

Mode)d’évaluation)!

examen!oral!

Sessions)d'examens))

juin!+!rattrapage!aoûtDseptembre!

Responsable)!

M.!HOTHORN!D!022!37!93013!D!michael.hothorn@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!R.!ULM!(po),!M.!HOTHORN!(po),!L.!LOPEZ!MOLINA!(pas),!!Madame!M.!BARBERON!(past).!!

Divers)

Ce!cours!est!destiné!aux!étudiant(e)s!en!biologie!et!en!biochimie!de!3ème!ou!4ème!année!et!en!master!de!biologie.!!Cours!en!français!et!en!anglais!\!documentation!en!anglais.!!Contenu)Ce!cours!à!choix!propose!des!lectures!et!discussions!en!rapport!avec!des!problèmes!actuels!en!biologie!moléculaire!végétale.!!Objectif)Exercer!une!lecture!critique!de!la!littérature!scientifique!contemporaine.!Étudier! des! développements! récents!dans! le! domaine! de! la! biologie!moléculaire! végétale.!Comprendre!des!nouvelles!technologies!et!méthodes!expérimentales.!!Apprendre!comment!concevoir!un!projet!de!recherche.!Développer!des!aptitudes!pour!la!présentation!orale!de!sujets!scientifiques.!!!!!

181

!INTRODUCTION)AU)DESSIN)ARCHOLOGIE) 14T019)

Travaux)pratiques)à)choix)pour)le)bachelor)en)Archéologie)préhistorique)et)anthropologie)

)

Semestre)

)

printemps! 4h/sem,!total!56h!

ECTS)

)

3!!

Jour)

)

mardi!8h15!–!12h!

Lieu)

)

Uni!Carl!Vogt!

Mode)d’évaluation)

!travail!personnel!

Responsable)

!Madame!M.!BESSE!C!022.379.6915!C!marie.besse@unige.ch!

Enseignant(e)s! Mesdames!M.!BESSE!(pas),!E.!GUTSCHER!(dess.).!!

Divers)

Ce)cours)a)lieu)tous)les)ans.)))

!Contenu)

Cet!enseignement!a!pour!objectif!un!apprentissage!des!bases!pratiques!et!théoriques!du!dessin!archéologique!:!dessins!d’objets!et!dessins!de!structure,!plans/stratigraphies!avec!les!outils!adaptés.!!Le!cours!permettra!à! l’étudiant(e)!d’apprendre!et!de!faire!l’expérience!du!dessin!archéologique.!Mise!en!pratique!de!l’illustration!traditionnelle!:!relevé!et!mise!au!net!de!dessins!d’objets!ainsi!que!la!réalisation!de!dessins!plans/stratigraphies!avec!l’apprentissage!du!logiciel!Illustrator.!

!!

182

!LA#GENETIQUE#DANS#LA#PRATIQUE#MEDICALE#AU#QUOTIDIEN#:#DU#LABORATOIRE#AU#CHEVET#DU#PATIENT#

223O305#

#Semestre##

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS##

3!!

Jour##

jeudi!14h!6!16h!!!

Lieu##

CMU,!salle!à!confirmer!

Mode#d’évaluation#!

examen!écrit!

Sessions#d'examens##

décembre!

Responsables#!

Monsieur!J.6L.!BLOUIN!6!022!379.5692!6!jean6louis.blouin@hcuge.ch!Madame!F.!SLOAN6BENA!6!079!553!4172!6!frederique.bena@hcuge.ch!Monsieur!M.!GUIPPONI!6!022!379!5809!6!michel.guipponi@unige.ch!!Département!de!Médecine!Génétique!et!Développement,!CMU! (9ème!étage)!!

Enseignant(e)s! Monsieur!J.6L.!BLOUIN!(PhD,!privat6docent,!FAMH!génétique!médicale),!Madame!F.!SLOAN6BENA!(PhD,!privat6docent,!FAMH!génétique!médicale),!Monsieur!M.!GUIPPONI!(PhD,!Privat6docent)!et!collaborateur(trice)s.!!

Divers#Inscription#auprès#du#secrétariat#des#étudiants#de#la#Faculté#de#Médecine.!!Contenu#Proposé#dans#les#cours#à#option#des#la#Faculté#de#médecine,#ce#cours#est#également#ouvert#aux#étudiants#de#la#Faculté#des#sciences#et#des#autres#facultés.#

La!médecine!génétique!(génétique!humaine!et!médicale)!et!ses!outils!technologiques!connaissent!un! développement! fulgurant!ces! dernières! années.!Les!nouvelles! possibilités! diagnostiques!transportent!désormais!les!biologistes,!les!médecins!et!les!patients!vers!les!nouveaux!défis!de!la!médecine!personnalisée.!!

La!médecine!génétique!interagit!avec!toutes!les!spécialités!médicales!pour!aider!au!diagnostic!de!maladies!fréquentes!ou!rares!permettant!d’améliorer!la!surveillance!médicale!et!le!traitement!des!patients.!!

Ce!cours!à!option!se!propose!de!fournir!les!outils! indispensables!pour!la!compréhension!de!la!médecine!génétique!au!quotidien.!Les!diverses!approches!cliniques!et!analytiques!illustrant!la!pratique!courante!seront!ainsi!présentées!à!travers!de!situations!concrètes!!

Des! spécialistes! dans!différents!domaines! (oncologie,!neurologie,!cardiologie!et!hémostase)!viendront!présenter!leur!expérience!et!l’apport!grandissant!de!la!génétique!dans!la!prise!en!charge!de!leur!patient!!!

183

!LA#GENETIQUE#DANS#LA#PRATIQUE#MEDICALE#DE#DEMAIN:#DE# LA# RECHERCHE#VERS# LES# NOUVEAUX#CONCEPTS# DE#DIAGNOSTIC#niveau#avancé#

223O321#

#Semestre##

printemps! 2h/sem,!total!14h!

ECTS##

2!!

Jour##

jeudi!14h!6!16h!!!

Lieu##

CMU,!salle!à!confirmer!

Mode#d’évaluation#!

examen!écrit!

Sessions#d'examen##

juin!

Responsables#!

Monsieur!J.6L.!BLOUIN!6!022!379.5692!6!jean6louis.blouin@hcuge.ch!Madame!F.!SLOAN6BENA!6!079!553!4172!6!frederique.bena@hcuge.ch!Monsieur!M.!GUIPPONI!6!022!379!5809!6!michel.guipponi@unige.ch!!

Département!de!Médecine!Génétique!et!Développement,!CMU! (9ème!étage)!!

Enseignant(e)s! Monsieur!J.6L.!BLOUIN!(PhD,!privat6docent,!FAMH!génétique!médicale),!Madame!F.!SLOAN6BENA!(PhD,!privat6docent,!FAMH!génétique!médicale),!Monsieur!M.!GUIPPONI!(PhD,!Privat6docent)!et!collaborateur(trice)s.!!

Divers#Inscription#auprès#du#secrétariat#des#étudiants#de#la#Faculté#de#médecine.!Pour!des!raisons!d’organisation!le!cours!ne!sera!pas!donné!si!le!nombre!d’inscriptions!est!inférieur!à!10!étudiants!(date!limite!d’inscription!15!décembre).!!!Contenu#Proposé#dans#les#cours#à#option#de#la#Faculté#de#médecine,#ce#cours#est#également#ouvert#aux#étudiants#de#la#faculté#des#Sciences#et#des#autres#facultés.#

Ce!cours,!qui!suit!et!complète!le!cours!de!médecine!génétique!proposé!lors!de!la!session!d’automne!(223O305,!La!génétique!dans!la!pratique!médicale!de!demain!:!de!laboratoire!au!chevet!du!patient)!propose!une!revue!des!concepts!les!plus!avancés!dans!le!décryptage!de!l’exome,!du!génome,!et!des!mécanismes!liés!à!sa!régulation!ou!au!maintien!de!son!intégrité.!!Les!dernières!stratégies!et!leurs!applications!en!diagnostic!pour!isoler!les!mutations!pathogènes!à!partir!des!données!de!séquençage!massif,!les!mécanismes!épigénétiques,!et!de!réparation!de!l’ADN!y!seront!aussi!discutés.!Quelques!cours!spécifiques!seront!dispensés!en!langue!anglaise.!

!!

184

!MASTER'COURSE'IN'GENETICS,'DEVELOPMENT'AND'EVOLUTION'

14B017'

Period''

Autumn/Spring! 3h/week,!year!84h!

ECTS' 9!!

Day' Thursdays,!from!9.15!to!12.00!!

Place''

Sciences!III,!Room!4059!

Evaluation'mode'!

Written!exam!

Exam'sessions' June!+!catching!AugustISeptember!' !Persons'in'charge'!

E.!NAGOSHI!–!022!379!6346!–!emi.nagoshi@unige.ch!M.!GONZALEZ!GAITAN!–!022!379!64!61!–!marcos.gonzalez@unige.ch!

Teachers! M.#GONZALEZ!GAITAN!(po),!R.!LOEWITH!(po),!!R.!MAEDA,!M.!MILINKOVITCH!(po),!!!E.!NAGOSHI!(pas),!R.!PILLAI!(po),!I.!RODRIGUEZ!(po),!!A.!SANCHEZIMAZAS!(po),!D.!SHORE!(po),!F.!STEINER!(past),!!T.!HALAZONETIS!(po),!M.!VOGG!(ma),!!E.!POLONI!(biol,cc),!M.!CURRAT! (mer).!!

Miscellaneous!Course!given!in!English,!open!to!3rd!year!Biology!or!Biochemistry!students!(«!cours!à!choix!»),!master!students!and!graduate!students.!!Contents'The!research!group!leaders!(PI)!offering!master!projects!in!the!Genetics,!Development!and!Evolution!Master!program!give!6!hours!teaching!in!two!successive!sessions.!In!the!first!session!each!of!them!provides!an!introduction!to!his/her!field!of!research!and!in!the!second!the!students!will!organize!a!miniIsymposium! to!discuss!a!central!paper!of!the!field.!For!the!written!exam!students!will!have!to!answer!a!series!of!short!questions!related!to!the!reference!document!given!by!each!PI.!!!!!

Compulsory'course'for'the'master'in'biology'option'«Genetics,'Development'and'Evolution»'''

185

!MEDECINS(ET(SCIENTIFIQUES(AU(CINEMA( 223O122((Semestre((

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS((

3!!

Jour((

jeudi!14h15!–!16h!!(exceptionnellement!jusqu’à!18h!selon!projections!de!films)!!

Lieu((

CMU!

Mode(d’évaluation(!

rédaction!d’un!dossier!de!présentation!d’un!film!(données!factuelles,!synopsis,!analyse!thématique!et!formelle,!appréciation!personnelle)!!

Responsables(!!

Monsieur!A.!WENGER!–!022.379.4602!–!alexandre.wenger@unige.ch!Monsieur!B.!STRASSER!–!022.379.0712!X!bruno.strasser@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!A.!WENGER!(pas),!Bruno!J.!STRASSER!(po)!et!intervenants!invités.!!

Divers((

N’EST(PAS(DONNE(EN(2018/2019((

Ce!séminaire!est!ouvert!aux!étudiants!de!2ème!et!3ème!années.!!Important:!le!nombre!de!places!pour!le!séminaire!étant!limité,!une(préNinscription(par(eNmail(est!demandée!:!alexandre.wenger@unige.ch!!Contenu(Ce!séminaire!propose!une!réflexion!sur!la!représentation!des!figures!du!médecin!et!du!scientifique!dans!le!cinéma!de!fiction.!L'évolution!des!représentations!du!scientifique!et!du!médecin!reflète!le!changement!des!conditions!dans!lesquelles!s’exercent!leurs!activités.!Elle!témoigne!également!des!espoirs!et!des!craintes!associées!au!progrès!scientifique!et!médical.!Au!cours!du!20e!siècle,!le!cinéma!a!étoffé!le!répertoire!identitaire!à!partir!duquel!s'est!construit!l’image!du!médecin!et!du!scientifique!contemporains.!C’est!en! repérant!les! différentes!figures!de!ce! répertoire,!dans! leurs! contextes!historiques,!que!l’on! peut!comprendre!la! recomposition!actuelle!des! identités!du!médecin!et!du!scientifique!dans!la!société.!!Thèmes!abordés!:!Figures!du!médecin!(le!médecin!humanitaire!a!le!grand!patron!a!l’expérimentateur!fou!a!etc.).!Figures!du!scientifique!(scientifique!fou,!diabolique,!génial,!sacrifié,!etc.)!Genres!cinématographiques!(fiction,!documentaire,!caricature,!pamphlet,!etc.)!Modalités!des!représentations!cinématographiques!du!progrès!des!connaissances!scientifiques!et!médicales!au!long!du!20e!siècle.!Liens!entre!les!représentations!cinématographiques!et!le!contexte!historique!(progrès,!découvertes!et/ou!émergence!de!nouvelles!disciplines!scientifiques!a!période!de!guerre!a!etc.)!Construction!d’une! mémoire! collective! des! disciplines! médicales! et! scientifiques!à! travers! la!biographie!de!grands!hommes!ou!de!figures!emblématiques.!!Objectif(Savoir!analyser!une!séquence!de!film.!!Savoir!identifier!les!différents!composants!des!figures!de!scientifiques!et!du!médecin.!Savoir! remettre! les! représentations! cinématographiques! dans! leurs! contextes! historiques,!scientifiques!et!médicaux.!!!

186

!!MENACES'ET'CONSERVATION'DE'LA'BIODIVERSITE' 14E155''Semestre''

printemps! total!7X4!28h!

ECTS''

3!!

Jour''

Cours!bloc,!7!demi:journées!Dates!à!confirmer!au!printemps!2020!!

Lieu''

Uni!Carl!Vogt,!salle!CV001!

Mode'd’évaluation'!

examen!écrit!

PréDrequis''

aucun!

Sessions'd'examens''

juin!+!rattrapage!août:septembre!

Responsable'!

Monsieur!A.!LEHMANN!:!022.379.0021!–!anthony.lehmann@unige.ch!

Enseignant! Monsieur!A.!LEHMANN!(pas).!!

Contenu'Sept!thèmes!principaux!sont!abordés!:!!:!Impacts!des!changements!climatiques!sur!la!biodiversité!:!Fragmentation!du!territoire!et!réseaux!écologiques!:!Espèces!envahissantes!:!Relation!entre!agriculture!et!biodiversité!:!Pollutions!et!surexploitation!:!Renaturation!des!écosystèmes!et!réintroduction!d’espèces!:!Politique!de!la!conservation!!Finalement,!des!lectures!d'articles!scientifiques!sont!proposées!afin!d'accompagner!le!cours.!!Objectif'Ce!cours!est!organisé!autour!de!présentations!d'intervenants!externes!pour!illustrer!les!menaces!et!les!mesures!de!conservations!à!différentes!échelles!(UNEP,!IUCN,!WWF,!Pro!Natura,!Services!cantonaux,!Services!Fédéraux,...).!!!!!

187

METHODOLOGIE*DE*LA*RECHERCHE*EN*ARCHEOLOGIE*PREHISTORIQUE**Travaux*pratiques*

14T005*

Travaux*pratiques*obligatoire*pour*le*bachelor*en*archéologie*préhistorique*et*anthropologie**

*

Semestre**

automne/printemps- 4h/sem,-total-112h-

ECTS**

6--

Jour**

vendredi-8h00-9-12h00-

Lieu**

Uni-Carl-Vogt-

Mode*d’évaluation*-

recherche-personnelle-et-rapport-écrit-

Sessions*d'examens**

juin-+-rattrapage-août9septembre-et-février-

Responsable*-

Madame-M.-BESSE-9-022.379.6915-9-marie.besse@unige.ch.-

Enseignant- Monsieur-F.-COUSSEAU-(postdoc).--

Divers*A*LIEU*TOUS*LES*DEUX*ANS.----

Cet*enseignement*a*lieu*en*2019R2020.*Il*n’aura*pas*lieu*en*2020R2021.*

-Contenu*Cet-enseignement-de-niveau-bachelor-offre-aux-étudiant.e.s-l'opportunité-d'analyser-une-collection-d'objets-préhistoriques-et-de-les-interpréter-dans-leur-contexte-archéologique,-ou-de-participer-à-l’organisation-d’un-événement-autour-de-la-préhistoire-(exposition-notamment).-

!

188

!METHODOLOGIE*DE*LA*RECHERCHE*EN*ARCHEOLOGIE*PREHISTORIQUE*II:*CARTOGRAPHIE,*TOPOGRAPHIE*ET*STATISTIQUE*

14B068*

Obligatoire*pour*le*bachelor*ès*Lettres*mention*archéologie*préhistorique*et*anthropologie*Bachelor*en*archéologie*préhistorique*"Module*2.3*:*Méthodes*de*la*recherche"*!Semestre**

automne! 4!h/sem,!total!56h!

ECTS**

6!!

Jour**

à!fixer!(cours!bloc)!

Lieu**

Sciences!II,!salle!449!

Mode*d’évaluation*!

examen!oral!

Sessions*d'examens**

janvier/février!+!rattrapage!aoûtDseptembre!

Responsable*!

Monsieur!E.!HUYSECOM!D!022.379.6973/67!D!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!E.!HUYSECOM!(pas),!J.DM.!NUNES!(ce),!Madame!A.!SANCHEZDMAZAS!(po),!et!collaborateurs.!!

Divers**

A*LIEU*TOUS*LES*DEUX*ANS.*A*LIEU*AU*SEMESTRE*D’AUTOMNE*2020*

!Contenu*Méthodes!de!cartographie!en!archéologie,!éléments!de!topographie!et!de!planimétrie,!introduction!aux!méthodes!statistiques!en!Préhistoire.!!Objectif*Acquisition!des!notions!élémentaires!de!cartographie,!de!topographie!et!de!statistique!dans!le!domaine!de!la!Préhistoire!Z!maîtrise!du!maniement!des!instruments!topographiques!!!

189

METHODOLOGIE*DE*LA*RECHERCHE*EN*ARCHEOLOGIE*PREHISTORIQUE*

14T004*

Cours*obligatoire*pour*le*bachelor*en*archéologie*préhistorique*et*anthropologie**

*

Semestre**

automne/printemps- 2h/sem,-total-56h-

ECTS**

6-

-

Jour**

mardi-8h15-–-10h-

Lieu**

Uni-Carl-Vogt-

Mode*d’évaluation*-

examen-oral-

Sessions*d'examens**

juin-+-rattrapage-aoûtAseptembre-et-février-

Responsable*-

Madame-T.-STEIMER-A-022.379.6915-A-tara.steimer@unige.ch.-

Enseignant(e)s- T.-STEIMER-(ce)-et-collab.-

-

Divers*A*LIEU*TOUS*LES*DEUX*ANS.---

Ce*cours*n’a*pas*lieu*en*2019S2020.*Il*aura*lieu*en*2020S2021.*-

Contenu*Cet- enseignement-de-niveau-bachelor-présente-les- procédés-de- l'analyse-archéologique,-de-la-

planification-d'une-fouille-à-la-publication-des-résultats-scientifiques-à-travers-la-mise-en-forme-de-

l'information-recueillie.-Nous-présentons-un-tour-d'horizon-des-domaines-de-recherches-(sciences-

naturelles,-physiques-et-chimiques)-mis-à-contribution-à-différents-moments-et-niveaux-de-la-démarche-

(stratigraphique,-étude-spatiale,-sériation-typologique,-environnement,-sédimentologie,-etc.).-Le-cours-

est-largement-illustré-par-des-cas-concrets.-

-

!!

190

!METHODOLOGIE*DE*LA*RECHERCHE*EN*BIOLOGIE* 14B751**Semestre**

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!!

Jour**

jeudi!10h!8!12h!

Lieu**

Sciences!II,!salle!449!

Mode*d’évaluation*!

exposés!oraux!

PréFrequis**

niveau!minimum!3ème!année!de!biologie!acquise.!!

Responsable*en*2019F2020*!

Monsieur!M.!CURRAT!–!022.379.6979/67!8!mathias.currat@unige.ch!

Enseignant(e)s! E.!POLONI!(cc),!A.!SANCHEZ8MAZAS!(po),!M.!CURRAT!(mer),!D.!DI!(ma)!et!collaborateurs.!!

Divers*Important:!le!nombre!de!places!pour!le!séminaire!étant!limité,!

une*préFinscription*par*eFmail*est!demandée!:!mathias.currat@unige.ch,!!Lectures!d’articles!en!anglais.!Enseignement!en!français!(étudiants!:!possibilité!de!présentations!en!anglais)!!Objectif*F*contenu*Ce!séminaire!consiste!en!une!présentation!critique!par!les!étudiant(e)s!de!travaux!de!recherche!publiés!dans!la!littérature!scientifique.!Les!étudiants!doivent!se!mettre!dans!la!peau!des!experts!scientifiques!qui!évaluent!les!articles!soumis!pour!publication!!!Les!exemples!sont!choisis!par!les!enseignants!de!manière!à!illustrer!toutes!les!démarches!qui!conduisent!de!l’idée!d’une!recherche!à!sa!publication,!à!savoir! :! construction!d'hypothèses,!plan!d'expérience,!analyse!de!données,!rédaction!et!mise!en!forme.!Les!domaines!de!recherches!abordés!concernent!la!biologie!générale!et!humaine,!l'évolution,!la!biologie! du! comportement! et! d'autres! sujets! d’intérêt! choisis! en! concertation! avec! les!participant(e)s.!Ce!séminaire!est!une!initiation!fondamentale!à!la!lecture!scientifique!et!au!développement!d’un!esprit!critique,!indispensables!à!la!recherche!(déjà!au!niveau!du!travail!de!monographie!de!bachelor!et!du!travail!de!master).!!!!!

191

!MICROBIOLOGIE*GENERALE*I*–*automne** 13B011*

Cours*à*choix*restreint*de*3ème*année*(1er*semestre)*

*

Semestre*

*

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS*

*

3!!

Jour*

*

mardi!10h15712h!

Lieu*

*

Sciences!III,!salle!0019!

Mode*d’évaluation*

!Examen!écrit!de!4h!!

Sessions*d'examens*

*

janvier7février!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable*

!Monsieur!Karl!PERRON!7!022.379.3127!–!karl.perron@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!M.!TONOLLA!(cc),!S.!SCHNEE!(Agroscope),!!O.!SCHUMPP!(Agroscope)!Mesdames!C.!TAPPAREL!(pa),!K.!GINDRO!(Agroscope)!!

Divers*

Le*cours*de*microbiologie*générale!est*structuré*en*deux*parties!]!l'une!au!semestre!d'automne!(13B011)!et!l’autre!au!semestre!de!printemps!(13B014).!La!note!annuelle!est!la!moyenne!des!2!notes!obtenues.!!Le!cours!doit!être!suivi!dans!son!intégralité!(semestres!d’automne!et!de!printemps)!pour!obtenir!6!ECTS.*Il!n’est!pas!possible!de!prendre!uniquement!un!semestre!comme!cours!à!choix!libre.!!Contenu*

Présentation!des!micro7organismes!du!point!de!vue!de!leur!structure,!physiologie,!écologie,!fonctions!et!applications.!Bactéries!(physiologie!et!fonctions).!!Pathogènes!et!vecteurs.!Phytopathologie!(champignons,!virus!et!bactéries)!et!relations!hôtes7pathogènes!Symbioses!végétales!Mycologie!(moisissures,!levures,!champignons!filamenteux!et!oomycètes).!!Les!virus,!leurs!particularités!et!leurs!fonctions.!!Objectifs*

•! Décrire! la! biologie! des! microorganismes! (bactéries,! champignons,!virus).! Distinguer! et!comparer!les!différents!microorganismes.!Décrire!les!cycles!de!vie!et! le!développement!des!microorganismes!et!l’importance!des!paramètres!physico7chimiques!

•! Décrire!et!expliquer!les!agents!vecteurs!de!maladies!et!leurs!importances.!•! Décrire! les!pathogènes!végétaux!et!expliquer!les! interactions!avec! leur!hôte!ainsi!que! les!mécanismes!de!pathogénèses!en!jeu.!

•! Acquérir! les! notions! de! base! en! virologie! afin! de! pouvoir! expliquer! et! définir! à! l’aide!d’exemples!les!concepts!suivants!:!diversité!des!virus,!cycle!de!réplication,!variabilité,!défense!innée!contre!les!infections!et!stratégies!virales!d’échappement!aux!défenses!immunitaires.!!!

!!!

192

MICROBIOLOGIE*GENERALE*II*–*printemps* 13B014*Cours*à*choix*restreint*de*3ème*année*(2ème*semestre)**Semestre**

printemps) 2h/sem,)total)28h)

ECTS**

3))

Jour**

mardi)10h15712h)

Lieu**

Sciences)III,)salle)0019)

Mode*d’évaluation*)

Examen)écrit)de)4)heures))

Sessions*d'examens**

juin)+)rattrapage)août7septembre)

Responsable*)

Monsieur)Karl)PERRON)7)022.379.3127)–)karl.perron@unige.ch)

Enseignant(e)s) Mesdames)F.)STUTZ)(po),)V.)DUCRET)(lab),)Messieurs)P.)VIOLLIER)(po),)M.)BROCHET)(pa),)K.)PERRON)(ce).))

Divers*Le*cours*de*microbiologie*générale)est*structuré*en*deux*parties])l'une)au)semestre)d'automne)(13B011))et)l’autre)au)semestre)de)printemps)(13B014).)La)note)annuelle)est)la)moyenne)des)2)notes)obtenues.))Le)cours)doit)être)suivi)dans)son)intégralité)(semestres)d’automne)et)de)printemps))pour)obtenir)6)ECTS.*Il)n’est)pas)possible)de)prendre)uniquement)un)semestre)comme)cours)à)choix)libre.))Contenu*Mécanismes)moléculaires)de)la)croissance)et)reproduction)des)levures)utiles)et)pathogènes.)Bactéries)(antibiotiques,)bactériophage,)communication)bactérienne,)bactériologie)médicale).)Principaux)parasites)pathogènes)Bases)de)bactériologie)moléculaire)(division,)polarité,)motilité)et)persistance)))Objectif*•) Enumérer,) illustrer) et) comparer) les) modèles) théoriques)de) mécanismes) moléculaires)de)

croissance)et)de)reproduction)des)levures,)des)bactéries)et)de)certains)parasites)•) Décrire)et)argumenter)l’importance)de)la)microbiologie)dans)les)secteurs):)environnementaux,)

médicaux,)humains.))

)!!

193

!MICROBIOLOGIE*GENERALE** 13B911*Travaux*pratiques*à*choix*restreint*de*3ème*année**Semestre**

printemps!–!3!semaines! 4h/sem,!total!60h!

ECTS**

3!!

Jour**

17*février*au*6*mars*2020!de!14h00!718h00!!!

Lieu**

Sciences!III!–!salle!0016!

Mode*d’évaluation*!

Présence!obligatoire!avec!une!participation!active!aux!séances.!Rapports!notés!(exposé!oral!ou!rapport!écrit).!!

CoNrequis**

Suivre!en!parallèle!le!cours!de!Microbiologie!générale!(13B011!semestre!d'automne!et!13B014!semestre!de!printemps).!!

Responsable*!

Monsieur!Karl!PERRON!7!022.379.3127!–!karl.perron@unige.ch!

Enseignant(e)s! Mesdames!F.!STUTZ!(po),!V.!DUCRET!(lab)!Messieurs!!P.!VIOLLIER!(po)!K.!PERRON!(ce)!et!collaborateur(trice)s.!!

Divers*Nombre!de!participants!:!minimum!5!7!maximum!25.!!

!Les!inscriptions!des!travaux!pratiques!à!choix!restreint!de!3ème!année!sont!obligatoires.!

Les!inscriptions!s'effectueront!en*ligne!!!!*

Vous!recevrez!des!informations!complémentaires!par!e7mail!à!la!miNfévrier.!!!Contenu*Yeast!two7hybrid,!une!méthode!pour!chercher!des!partenaires!moléculaires.!Analyse!microbiologique!de!l’eau,!antibiogramme,!détermination!de!bactéries!et!phagothérapie.!Bactériologie!moléculaire!sur!Caulobacter!:!isolement!de!différents!mutants,!recherche!et!analyses!de!phages.!!Objectif*•!Réaliser! des! protocoles!expérimentaux!en! recourant!à! différentes!méthodes!moléculaires!et!d’analyses!microbiologiques.!!

!!!!

194

!

MICROBIOLOGIE*MOLECULAIRE*DES*MILIEUX*HYDRIQUES*:*Détection*et*typage*des*microorganismes*

14B053*

Cours*à*choix*de*2ème*et*3ème*années**Semestre**

automne! total!28h!

ECTS**

3!

!

Jour**

3!jours!consécutifs!pause!inter6semestres!

à!définir!avec!les!participants!(en!février)!

Lieu**

A!déterminer!!

Mode*d’évaluation*!

Rapport!et!présentation!orale!

Responsable*!

M.!TONOLLA!6!058!666!62!69–!mauro.tonolla@unige.ch!

mauro.tonolla@supsi.ch!

!

Ecologie! microbienne,! Unité! de! microbiologie,! Dép.! Biologie! végétale,!

Université!de!Genève,!30!Quai!Ernest6Ansermet,!1211!Genève!4,!Suisse!!

et!

Laboratory!of!applied!microbiology,!University!of!Applied!Sciences!Southern!

Switzerland!(SUPSI),!Via!Mirasole!22A,!6500!Bellinzona!

!

Enseignant! Monsieur!M.!TONOLLA!(cc).!

!

Divers*Enseignement!en!français/anglais.!

!

Contenu*Utilisation!des!méthodes!moléculaires!pour!la!détection!et!le!typage!des!microorganismes,!applications!

dans!les!domaines!de!l’écologie!microbienne,!microbiologie!médicale!et!biosécurité.!Phylogénie!et!

étude!de! la! biodiversité!microbienne,!structure!et!dynamique!des!populations!microbiennes!dans!

l'environnement,!des!activités!biologiques!et!des!interactions.!Caractéristiques!et!dynamiques!des!

écosystèmes!hydriques!stratifiés!en!relation!avec!les!communautés!microbiennes.!Interactions!entre!

conditions!physico6chimiques!du!milieu!et!les!populations!microbiennes!et!entre!ces!dernières!et!les!

autres!organismes.!

!

Site!internet!:!https://chamilo.unige.ch/!

!

La!page!internet!permet!l'accès!au!polycopié!de!base!du!cours!et!de!communiquer!avec!l'enseignant.!

Lors!des!leçons,!des!commentaires!complémentaires!seront!donnés!ainsi!que!d’articles!scientifiques!

actuels.!

!

Objectif*Compréhension!du!rôle!de!la!vie!microbienne!dans!l'évolution!et!l'écologie!de!la!biosphère.!

Application!des!concepts!écologiques!classiques!aux!populations!et!communautés!microbiennes.!

Principes!sous6jacents!qui!conduisent!à!la!structure!de!la!population!microbienne.!

La!dynamique!de!la!communauté!à!la!fois!au!niveau!moléculaire!et!de!l’organismique.!

Interactions!abiotiques!et!biotiques!au!sein!des!communautés!microbiennes.!

Métabolismes!microbiens!et!cycles!biogéochimiques.!

Approches!moléculaires!pour!examiner!la!structure!de!la!communauté!microbienne!et!sa!fonction.!

!

!

!

195

!MICROBIOLOGIE* 22H002**

Semestre*

*

automne/printemps! 4h/puis!2!sem,!total!56h!

ECTS*

*

5!!

Jours*&*lieux*

*

début!du!cours!le!vendredi*19*octobre*2018*!Enseignement!le!vendredi!et!le!lundi!du!19!octobre!au!16!novembre!2018!!pendant!4!semaines!puis!uniquement!le!vendredi!à!partir!du!23!novembre!2018.!!lundi!15h15!D!17h00–!CMU!vendredi!14h15!D!16h00!–!CMU!!Semestre*de*printemps!:!le!vendredi,!du!22!février!au!1er!juin!2019.!!

Mode*d’évaluation*

!examen!écrit!(pour!les!étudiants!en!sciences!pharmaceutiques:!examen!conjoint!avec!le!cours!de!bactériologie!14B004)!!

Sessions*d'examens*

*

juin!+!rattrapage!aoûtDseptembre!

Responsable*

!Professeur!P.!LINDER!D!022!379!5484!–!patrick.linder@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!P.!LINDER!(po),!L.!FANTAO,!L.!KAISER!(po)!Mesdames!C.!TAPPAREL!(past),!M!BROCHET!(PAST),!C.DA.!SIEGRIST!(po).!!

Divers*

Cours!obligatoire!pour!le!baccalauréat!universitaire!en!sciences!pharmaceutiques!2ème!année.!!Acquérir!des!connaissances!de!base!des!principaux!agents!infectieux,!de! leurs! mécanismes!de!pathogénicité!et!de!moyens!de!lutte!à!disposition!(antibiotiques,!agents!chimiothérapeutiques,!vaccin,!etc.)!!Contenu*

Microbiologie!générale!:!structure!de!la!cellule!bactérienne,!des!champignons!et!des!virus!e!génétique,!génie! génétique,! thérapie!génique!e! antibiotiques,!antifongiques,!antiviraux! (modes! d’action! et!résistance).!Microbiologie!médicale!:!relations!hôteDparasite!bactéries,!virus,!champignons,!parasites.!!Bibliographie*

•! Brock:!Biologie!des!microDorganismese!M.!Madigan!et!J.!Martinko,!11ème!édition!•! Fundamentals!of!Molecular!Virology,!N.H.!Acheson!•! Virology!Molecular!Biology!and!Pathogenesis,!L.C.!Norkin!•! Flint!Principles!of!Virology!3rd!ed!2009!•! Polycopié,!diapositives!et!articles!de!référence!sur!Chamilo!!!

196

!MICROSCOPY)AND)IMAGING)COURSE) 14B063A)Intermediate)level)course)with)priority)for)master)and)PhD)students))Period) Autumn!–!9!days!

!36h/!2weeks,!total!36h!

ECTS) 3!(2!for!PhD!students)!!

Day) Workshop!over!nine!days!(4!hours!per!day)!!

Place)Dates))

Sciences!II,!room!245!01.!J!11.!October!2019!!

Requirements)))

This!course!is!open!students!with!an!interest!in!light!microscopy!either!in!their!3rd!year!of!bachelor!or!in!a!master/!PhD!program!

Exam))

Written!exam!of!two!hours!

Examen)sessions) February!+!catching!AugustJSeptember!) !Person)in)charge)!

Christoph!BAUER!J!022.379.66.32!–!christoph.bauer@unige.ch!

Teachers! Ch.!BAUER!(cc),!J.!BOSSET!(Adj!sc),!S.!LOUBERY!(cc),!!D.!MOREAU!(scs)!

Miscellaneous!Course!given!in!English,!«!cours!à!choix!»!open!to!3rd!year!Biology!or!Biochemistry!or!Pharmacy!students.!In!order!to!be!accepted!students!interested!to!take!this!course!need!to!send!a!letter!of!motivation!(by!eJmail:!Christoph.bauer@unige.ch)!at!least!six!weeks!before!its!start.!!!Contents)a)! Physical!basis!of!microscopy!!b)! Bright!field!microscopy!c)! Fluorescence!microscopy!d)! Confocal!microscopy!e)! Imaging!of!live!samples,!f)! High!content!microscopy!g)! Advanced!methods!(FRAP,!FRET,!superJresolution)!h)! Qualitative!and!quantitative!image!analysis.!i)! ImageJ!theoretical!and!practical!(handsJon)!sessions!!Objective)The!objective!of!this!course!combining!theory!and!handsJon!is!to!give!students!a!theoretical!and!practical!introduction!into!different!microscopes!and!microscopical!techniques.!At!the!end!of!this!course!students!should!have!an!overview!and!broadened!knowledge!on!using!microscopy!for!their!research!projects.!!!!

197

!MILESTONES)IN)PLANT)MOLECULAR)GENETICS)SELECTED)CHAPTERS))

14B023)

Open)to)3rd)year)Biology)and)Biochemistry)students,)and)to)Master)students.))!Period))

Autumn/Spring! 2h/week,!year!28h!

ECTS) 4!!

Time) The!course!is!scheduled!every!other!week!An! initial! meeting!will! be!scheduled!at! the!beginning!of! the!autumn!semester,!!please)contact):!michael.hothorn@unige.ch!!

Place))

Sciences!III,!room!2063!

Evaluation)mode! Certificate,!continuous!evaluation,!active!participation!in!the!course!) !Person)in)charge)!

M.!HOTHORN!M!022!37!93013!M!michael.hothorn@unige.ch!

Teachers! M.!HOTHORN!(po),!L.!LOPEZ!MOLINA!(pas),!R.!ULM!(po).!!Miscellaneous!Course!given!in!English,!open!to!3rd!year!Biology!or!Biochemistry!students!(cours!à!choix),!master!students!and!graduate!students!!Contents)Students!read,!present!and!discuss!important!classical!papers!describing!significant!breakthroughs!in!plant!genetics!and!plant!molecular!biology.!!Objective)Understand!how!different!fields!of!plant!biological!research!have!developed!and!evolved.!Exercise!critical!reading!of!the!scientific!literature.!!Understand!experimental!methods!and!the!importance!of!technical!innovations.!Develop!oral!presentation!skills.!!!!

198

!MODELISATION+ET+SIMULATION+DE+PHENOMENES+NATURELS+ 14X015+Cours+à+choix+restreint+de+biologie+3ème+année++Semestre++

printemps! 4h/sem,!total!56h!

ECTS++

4!(6!pour!les!biologistes)!!

Jour++

vendredi!12h!<!16h!

Lieu++

Batelle!405<407,!Carouge!

Mode+d’évaluation+!

examen!oral!+!travaux!pratiques!

PréNrequis++

Systématique!de!2ème!année!Une!connaissance!du!langage!de!programmation!python!est!souhaitable!!!!

Responsable+!

Monsieur!B.!CHOPARD!–!022!379!02!19!–!bastien.chopard@unige.ch!

Enseignant(e)s! Messieurs!B.!CHOPARD!(po),!J.<L!FALCONE!(col.!Scientifique!I!&!II),!!J.!LATT!(mer).!!

Contenu+Concepts!de!modélisation!informatique!de!processus!naturels!Les!systèmes!dynamiques!La!dynamique!moléculaire!et!méthode!de!Monte<Carlo!Les!simulations!à!événements!discrets!Systèmes!multi<agents!Les!Automates!Cellulaires!La!méthode!de!Boltzmann!sur!réseau!Les!réseaux!complexes!!Objectif+Introduction!à!des!méthodes!de!modélisation!et!de!simulations!de!phénomènes!naturels!et!de!systèmes!complexes.!Mise!en!oeuvre!informatique!de!modèles!qui!illustrent!le!cours!en!utilisant!le!langage!python.!!!!

199

!

MOLECULAR)BIOLOGY)JOURNAL)CLUB)AND)PROGRESS)REPORTS)

14B778)

Seminar)for)PhD)students)and)postdocs)!

Period))

Autumn/Spring! 1h/week,!year!32h!

ECTS) 5!

!

Day))

Friday!11:00!–!12:00!

Place))

Sciences!III,!room!3079!

Prerequisites! Master!in!Biology!or!equivalent!

) !

Person)in)charge)!

HALAZONETIS!Thanos!–!022.379.6112!–!thanos.halazonetis@unige.ch!

!

Coordinator! HALAZONETIS!Thanos!(po)!and!PILLAI!Ramesh!(po)!

!

Miscellaneous!The!language!of!the!seminars!is!English.!

!

Contents)This!course!consists!of!a!series!of!seminars!presented!by!the!PhD!students!and!postZdoctoral!fellows!

of!the!Department!of!Molecular!Biology!

)In)the)Autumn)semester,!each!PhD)student!presents!a!research!paper,!chosen!in!agreement!with!one!of!the!course!coordinators.!

)In)the)Spring)semester,!the!PhD)students!present!a!progress!report!on!their!research!project.)Once)per)year,)the)postdoctoral)fellows)present!a!progress!report.!!

!

200

!MOLECULAR)PLANT)SCIENCES)/)Basic)Research) 14B035)!Period) Autumn! 2h/week,!year!28h!ECTS) 4!

!Day) Friday!11:15!–!13:00!Place))

Sciences!III,!room!0019!

Evaluation)mode! Oral!exam!!

Exam)sessions) February!+!catchGup/repeat!AugustGSeptember!) !Persons)in)charge)!!

FITZPATRICK!Teresa!G!022.379.3016!G!theresa.fitzpatrick@unige.ch!ULM!Roman!–!022.379.3650!G!roman.ulm@unige.ch!

Teachers! M.!BARBERON!(past),!T.!FITZPATRICK!(po),!Y.!NACIRI!(cc),!!M.!HOTHORN!(po),!L.!LOPEZGMOLINA!(pas),!M.!PERRET!(cc),! !X.!PERRET!(mer),!R.!ULM!(po).!

!Miscellaneous!

Course)taught) in)English)(will)take)place)in)2019)!)The) course) Molecular)Plant) Sciences) is) taught) every)Autumn) alternating)between) Basic)Research)(this) course)) in)one) year)and) Applied)Aspects) (14B037))the) other) year.!Detailed!information!on!the!program!can!be!found!under:!http://biveg.unige.ch/teaching/master/program/.)!Contents)All!life!on!earth!depends!on!plants.!The!courses!being!offered!in!“Molecular!Plant!Sciences!–!Basic!Research”!and! “Molecular! Plant!Sciences!–! Applied!Aspects”!are! designed!to!provide!a! broad!understanding!into!the!rapid!advances!that!are!occurring!in!the!field!of!plant!biology!at!the!molecular!level.!The!individual!courses!are!taught!on!alternating!years.!!!“Molecular! Plant! Sciences”!will! showcase!selected!basic! research!programmes! currently! being!conducted! in! the!Department!of!Botany!and!Plant!Biology.!Topics! include! light! perception!and!signalling,!root!development!and!plant!nutrition,!signal!perception!and!transduction!by!membraneGintegral!receptor!proteins,!vitamin!metabolism!and!environmental!stress!responses,!control!of!seed!germination,!and!symbiotic!nitrogen!fixation.!!!In!the!first!of!two!sessions,!each!research!group!leader!provides!an!introduction!to!his/her!field!of!research.!In!the!second!session,!the!research!group!leader!discusses!in!more!detail!his/her!current!research!and!the!students!present!papers!related!to!the!field.!!Objective)Understand!plant!science!at!the!molecular!level!through!an!integrative!approach!combining!developmental!processes,!genetics,!cell!biology,!biochemistry,!physiology!and!the!response!to!environmental!factors!as!well!as!learn!how!to!orally!present!research!findings.!Leads!to!improvement!of!fundamental!skills!for!scientific!work!in!the!modern!field!of!plant!science!and!its!related!areas.!!!!!

201

!MOLECULAR)PLANT)SCIENCES)–)Applied)Aspects))) 14B037)Compulsory)course)for)the)option)«)Molecular)Plant)Sciences»)of)the)master))!Period) Autumn! 2h/week,!+!readings!+!visits!!

year!28h!ECTS) 4!

!Day))

Friday!11:15!–!13:00!

Place))

Sciences!III,!room!0019!

Evaluation)mode)!

Research!work!

Exam)sessions) February!+!catchGup/repeat!AugustGSeptember!) !Persons)in)charge)!!

FITZPATRICK!Teresa!G!022.379.3016!G!theresa.fitzpatrick@unige.ch!ULM!Roman!–!022.379.3650!G!roman.ulm@unige.ch!

Teachers! T.!FITZPATRICK!(po),!!J.GL.!WOLFENDER!(po),!invited!speakers!from!industry.!

!Miscellaneous!

Course)taught) in)English)(will)take)place)in)2020)!)The)course)Molecular)Plant)Sciences)is)taught)every)Autumn)alternating)between)Basic)Research)(14B035))in)one)year)and)Applied)Aspects)(this)course))the)other)year.!Detailed!information!on!the!programme!can!be!found!under!:!!http://biveg.unige.ch/teaching/master/program/.)!Contents)All!life!on!earth!depends!on!plants.!The!courses!being!offered!in!“Molecular!Plant!Sciences!–!Basic!Research”!and! “Molecular!Plant!Sciences!–! Applied!Aspects”!are!designed!to!provide!a! broad!understanding!into!the!rapid!advances!that!are!occurring!in!the!field!of!plant!biology!at!the!molecular!level.!The!individual!courses!are!taught!on!alternating!years.!!“Molecular!Plant!Sciences!–!Applied!Aspects”!is!designed!to!highlight!current!applied!aspects!of!plant!biology,!agronomy!and!biotechnology.!Lectures!will!be!presented!by!members!of!Swiss!agricultural!research!stations!as!well!as!major!players!from!the!industrial!sector.!Site!visits!to!research!stations!or!companies!will! also! form!part!of! the!program.!The!course!also! includes!presentations!by!the!students!of!current!topics!in!applied!plant!sciences.!Objective)Understand!the!application!of!molecular!aspects!of!different!agronomical!and!biotechnological!plant!science!research.!Examples!and!emphasis!is!placed!on!players!from!the!Swiss!industrial!sector!and!agricultural!research!stations!and!provides!insight!into!the!real!working!requirements!of!applied!research.!!!!

202

!NEUROSCIENCES):)CHEMICAL)SENSES) 14N12)!Period) Autumn!

!2h/week,!year!28h!

ECTS) 3!!

Day) Tuesday!17!:15!–!19!:00!!!

Place))

Sciences!III,!room!4059!

Evaluation)mode! Written!exam!!) !Person)in)charge)!

I.!RODRIGUEZ!–!022.379.3101!–!ivan.rodriguez@unige.ch!

Teachers! M.C.!BROILLET!(mer),!A.!CARLETON!(pas),!S.!LACROIX!(pas),!B.!LANDIS!(phd),!!J.!DAL!COL!(adj.!Sci),!C.!MARGOT!(cc),!R.!MAURER!(mer),!I.!RODRIGUEZ!(po).!!

!Miscellaneous!

)N’aura)pas)lieu)en)2019/2020)

!Course)taught) in)english.)!Contents)\!odors!and!pheromones!\!mammalian!olfactory!subsystems!\!taste!\!chemosensory!signal!transduction!\!integration!of!olfactory!signals!\!from!chemistry!to!perfumery!\!smell!versus!sight!in!rodents!\!olfaction!and!reproduction!\!olfaction!in!insects!\!parosmias,!phantosmias,!anosmias...!human!olfactory!pathologies!!!

203

!NEUROBIOLOGIE*DE*LA*REPRESENTATION*SPATIALE*(LA)* 7312D*Cours*dispensé*par*la*Faculté*de*psychologie*et*des*sciences*de*l’éducation.**Semestre**

printemps! 2h/sem,!total!26h!

ECTS**

3!

Jour**

lundi!12h15!–!13h45!!

Lieu**

Uni!Mail,!salle!R070!(sous!réserve!:!voir!site!du!cours,!indiqué!ciDdessous)!

Mode*d’évaluation*!

travaux!évalués!en!cours!de!semestre!

Sessions*d'examens**

juin!+!rattrapage!aoûtDseptembre!

Responsable*!

Monsieur!R.!MAURER!–!022.379.9120!–!roland.maurer@unige.ch!

Enseignant**

Monsieur!R.!MAURER!(mer).!

Divers*A*lieu*tous*les*deux*ans**

Aura*lieu*cette*année*(2019T2020)U*n'aura*pas*lieu*en*2020T2021.**La!page!web!http://ethologie.unige.ch!donne!accès!aux!ressources!du!cours!et!aux!informations!pratiques.!Suivant!le!nombre!d'étudiants,!le!cours!peut!prendre!la!forme!d'un!séminaire!certaines!semaines.!!Contenu*

En!1971,!on!découvrait!dans!l'hippocampe!du!rat!(une!structure!du!lobe!temporal!profond!impliquée!dans!la!mémoire)!des!cellules!de!lieu!:!des!neurones!qui!déchargent!quand!l'animal!est!en!un!certain!point!de!sa!surface!de!locomotion,!indépendamment!de!l'orientation!dans!laquelle!il!se!trouveW!en!1984,!on!découvrait!près!de!l'hippocampe!des!cellules!de!direction!de!la!tête,!qui!déchargent!en!fonction!de!l'orientation!de!l'animal!dans!le!plan,!indépendamment!de!sa!position!sur!celuiDci.!Position!et!orientation!sont!les!primitives!de!la!représentation!spatiale!:!on!avait!donc!identifié,!au!niveau!neuronal,!des!éléments!constitutifs!de!cette!représentation.!Plus!récemment,!les!cellules!"de!grille"!du!cortex!entorhinal!sont!venues!compléter!ce!tableau,!en!y!ajoutant!les!mécanismes!liés!à!la!prise!en!compte!des!déplacements.!Ces!découvertes!ont!généré!une!fructueuse!ligne!de!recherche!en!neurosciences!cognitives,!chez!le! rat!(cf.!prix!Nobel!de!physiologie!ou!médecine!2014)!mais!aussi!chez!d'autres!espèces!(p.ex.!chauvesDsouris,!primates!non!humains,!mais!aussi!drosophiles!et!abeilles,!et!l'humain),!qui!a!permis!une!analyse!à!tous!les!niveaux,!du!comportemental!(au!travers!des!paradigmes!spatiaux!actuels!les!plus!importants!comme!l'openDfield,!le!labyrinthe!radial!ou!la!"piscine"!de!Morris)!au!neuronal!(par!des!méthodes!d'électrophysiologie!et!d'imagerie!cérébrale),!d'une!fonction!cognitive!essentielle!et!complexe.!Le!cours!passe!ces!travaux!en!revue,!jusqu'aux!plus!récents,!et!abordera!la!question!plus!générale!des!mécanismes!neuronaux!de!la!mémoire!et!du!lien!entre!mémoire!spatiale!et!mémoire!épisodique.!!!Objectif*Comprendre! les! mécanismes! et! représentations! (jusqu'au! niveau! neuronal)! sousDjacents! à!l'orientation!spatiale,!une! fonction!cognitive!de!première! importance!présente!chez! toutes! les!espèces!mobiles!et!cruciale!pour!les!humains,!bien!que!peu!décrite!dans!les!manuels!de!psychologie!cognitive.!!!!

204

!OPTIQUE(ET(LASER( 14P021((Semestre((

automne! 2h/sem,!total!42h!+!1heure!d'exercice!

ECTS((

5!

Jour((

jeudi!14h!:!17h!

Lieu((

salle!306!à!Sciences!I!

Mode(d’évaluation(!

examen!oral!

Sessions(d'examens((

janvier:février!+!rattrapage!août:septembre!!

Responsable(!

Monsieur!H.!ZBINDEN!:!022.379.0504!–!hugo.zbinden@unige.ch!

Enseignant((

Monsieur!H.!ZBINDEN!(pas).!

Contenu(L'optique!est!appliquée!aujourd'hui!dans!presque! tous! les! laboratoires!scientifiques.!Ce! cours!s'adresse!aux!étudiants!de!3ème!et!4ème!années,!qui!souhaitent!apprendre!les!bases!de!l'optique.!!Le!cours!devrait!aider!l'étudiant!à!appliquer!l'optique!et!les!instruments!d'optique!au!laboratoire.!Il!y!a!une!heure!d’exercices!et!de!démonstrations!dans!le!laboratoire.!A!la!fin!du!cours!des!examens!oraux!auront!lieu.!!·!Polarisation,!biréfringence,!sphère!de!Poincaré!·!Interférence,!cohérence,!interféromètre!de!Mach:Zehnder,!Sagnac!!!!et!Fabry:Perot!·!Diffraction!de!Frauenhofer,!diffraction!de!Fresnel,!monochromateur!à!!!!réseau.!·!Le!mode,!loi!de!Planck,!amplification!optique!·!Le!résonateur,!le!faisceau!gaussien!·!Le!laser!·!Les!fibres!optiques!·!Quelques!expériences!de!l'optique!quantique!!!

205

!PALEOANTHROPOLOGIE, I, 14T018,Travaux,pratiques,,,Semestre,,

automne/printemps! 4h/sem,!total!112h!

ECTS,,

6!

Jour,,

vendredi!13h15!9!17h00!

Lieu,,

Uni!Carl!Vogt!

Mode,d’évaluation,!

évaluation!écrite!en!cours!d’année!et!rapport!écrit!

Responsable,!

Madame!J.!DESIDERI!(cc)! 9!022.379.69.47!9!jocelyne.desideri@unige.ch!

Enseignante,,

Madame!J.!DESIDERI!(cc).!

Contenu,Cet!enseignement!de!niveau!bachelor!vise!!9!un!apprentissage!approfondi!de!l’ostéologie!humaine!(adultes!et!immatures)!

9!une!acquisition!des!méthodes!de!détermination!de!l’identité!biologique!(diagnose!sexuelle!et!estimation!de!l’âge9au9décès!des!adultes!et!estimation!de!l’âge9au9décès!des!immatures)!

9!une!introduction!à!l’étude!des!populations!(recrutement!funéraire,!NMI,!morphoscopie,!morphométrie)!

Une!application!concrète!à!travers!l’étude!d’une!série!archéologique!sera!réalisée!au!cours!des!TP!!!!!

206

!

PALEOBIOLOGIE)ET)PALEONTOLOGIE) 11T007)Cours à choix Bachelor en archéologie préhistorique « Module 2.8 » )Semestre))

automne/printemps! 2h/sem,!total!56h!

ECTS))

5!

Jours))

automne:!mercredi!13h15!9!15h!printemps:!jeudi!13h15!9!15h!!!

Lieu))

Sciences!de!la!Terre!et!de!l’environnement,!!13!rue!des!Maraîchers,!salle!203!!

Mode)d’évaluation)!

examen!oral!

Sessions)d'examens))

juin!+!rattrapage!août9septembre!

Responsable)!

Madame!R.!MARTINI!9!022.379.6612!–!rossana.martini@unige.ch!

Enseignante))

Madame!R.!MARTINI!(pas).!

Contenu)Le!but!de!ce!cours!est!de!mettre!en!évidence!que!l’étude!de!l’histoire!géologique!et!paléontologique!de!la!Terre!ne!peut,!en!aucun!cas,!faire!abstraction!de!la!compréhension!des!milieux!actuels.!C’est!en!se!basant!sur!l’observation!et!l’étude!des!communautés!vivantes!que!nous!pouvons,!dans!le!cadre!de!la!paléobiologie,!expliquer!le!mode!de!vie!des!invertébrés!marins!du!passé!et!comprendre!leur!évolution.!Le!cours!se!propose!également!de!souligner!le!rôle!géologique!du!fossile!dans!les!datations!des! roches! (biostratigraphie),! ainsi! que! dans! les! reconstitutions! paléoenvironnementales! et!paléoclimatiques.!Le!cours!s’articule!en!deux!parties!:!!!

1.! La)Paléobiologie!:!Principales!subdivisions!du!monde!organique,!systématique!et!taxonomie,!Théorie!de!l’évolution,!Biostratigraphie,!Modes!de!vie!des!divers!organismes,!Traces!fossiles.!!

2.! La) Paléontologie) systématique):! Étude! des! phyla! suivants!:! Eponges,!Archaeocyathes,!Cnidaires,!Brachiopodes,!Bryozoaires,!Arthropodes,!Mollusques,!Gastéropodes,!Céphalopodes,!Echinodermes.! De! chaque! groupe! seront! examinées!:! l’anatomie,! les! caractéristiques!morphologiques,! les!stratégies!évolutives,! la!distribution!stratigraphique!et! leur!signification!paléoécologique.!!

!

207

!

PALEOBIOLOGIE)ET)PALEONTOLOGIE) 11T507)Camp)Cours à choix Bachelor en archéologie préhistorique « Module 2.8 » )Semestre))

Printemps!–!2!jours! !

ECTS))

0.5)(1!pour!le!bachelor!en!archéologie!préhistorique)!!

Mode)d’évaluation)!

certificat!

Responsable)!

Madame!R.!MARTINI!B!022.379.6612!–!rossana.martini@unige.ch!

Enseignante))

Madame!R.!MARTINI!(pas).!

Contenu)Ces!travaux!auront!pour!but!d’apprendre!aux!étudiants!les!bases!du!travail!sur!le!terrain,!depuis!les!observations!géologiques,!sédimentologistes!et!biostratigraphiques,!jusqu’à!l’échantillonnage!des!roches.!Des!affleurements!remarquables!du!point!de!vue!de!la!fossilisation!seront!également!visités.!!

!!PALEOBIOLOGIE)ET)PALEONTOLOGIE) 11T907)Travaux)pratiques)Cours à choix Bachelor en archéologie préhistorique « Module 2.8 » )Semestre))

automne/printemps! 2h/sem,!total!56h!

ECTS))

2!

Jours))

automne:!mercredi!15h15!8!17h!!printemps:!jeudi!15h15!8!17h!!

Lieu))

Sciences!de!la!Terre!et!de!l’environnement,!!13!rue!des!Maraîchers,!salle!203!!

Mode)d’évaluation)!

contrôles!oraux!(à!la!fin!de!chaque!semestre)!

Sessions)d'examens))

en!décembre!et!en!mai,!dans!le!cadre!du!cours!

Responsable)!

Madame!R.!MARTINI!8!022.379.6612!–!rossana.martini@unige.ch!

Enseignante))

Madame!R.!MARTINI!(pas).!

Contenu)Les!travaux!pratiques!seront!consacrés!à!la!description!et!à!la!reconnaissance!des!restes!fossiles,!des!phyla!traités!dans!le!cours,!c’est8à8dire!:!Eponges,!Archaeocyathes,!Cnidaires,!Brachiopodes,!Bryozoaires,!Arthropodes,!Mollusques,!Gastéropodes,!Céphalopodes,!Echinodermes.!!!

208

!PALEOLITHIQUE+ET+NEOLITHIQUE+DE+L'AFRIQUE+:+des+premiers+outils+à+la+mise+en+place+des+sociétés+complexes+

14B762+

Séminaire++Semestre++

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS++

3!

Jour++

mercredi!15h!7!17h!

Lieu++

Sciences!II,!salle!449!

Mode+d’évaluation+!

présentation!orale!et!travail!écrit!

Responsable+!

Monsieur!E.!HUYSECOM!7!022.379.6973/67!7!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s++

Monsieur!E.!HUYSECOM!(pas),!et!!Madame!K.!DOUZE!(AdjSc3).!!

Divers++

A+LIEU+TOUS+LES+DEUX+ANS.+A+LIEU+EN+AUTOMNE+2019+

!Contenu+Sujets!en!relation!avec!le!cours!n°!14B062.!!Objectif+Approfondir!certains!sujets!abordés!dans! le!cours! n°!14B062,!notamment!au!travers!d’un! travail!personnel.!!!

209

!

PALEOLITHIQUE+ET+NEOLITHIQUE+DE+L'AFRIQUE+:+des+premiers+outils+à+la+mise+en+place+des+sociétés+complexes+

14B062+

Cours+obligatoire+du+master+en+archéologie+préhistorique+++Semestre++

automne! 4h/sem,!total!56h!

ECTS++

6!

Jour++

mercredi!10h!7!13h!

Lieu++

Sciences!II,!salle!449!

Mode+d’évaluation+!

examen!oral!

Sessions+d'examens++

janvier7février!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable+!

Monsieur!E.!HUYSECOM!7!022.379.6973/67!7!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s++

Monsieur!E.!HUYSECOM!(pas),!et!

Madame!K.!DOUZE!(AdjSc3).!

!

Divers++

A+LIEU+TOUS+LES+DEUX+ANS.+A+LIEU+EN+AUTOMNE+2019+

+Ce!cours!est!ouvert!au!public.!

!

Contenu+Ce!cours!aborde!les!grands!mouvements!de!populations!liés!aux!variations!climatiques!pléistocènes!

et!holocènes,!et!les!interactions!entre!l’Homme!et!son!environnement.!Dans!une!première!partie,!nous!

exposerons!l’état!actuel!de!nos!connaissances!concernant!les!origines!du!peuplement!sur!le!continent!

africain!et!régions!avoisinantes,!la!naissance!de!l’outil,!et!les!principales!industries!du!Paléolithique.!

Dans!une!seconde!partie,!nous!discuterons!du!concept!de!«néolithisation!africaine»!et!de!l’apparition!

de!l’élevage!et!de!l’agriculture,!et!présenterons!un!panorama!des!différentes!cultures!néolithiques!

africaines! à! la! lueur! des! découvertes! récentes.!Les! recherches!archéologiques!de! l’équipe!du!

Laboratoire!Archéologie!et!Peuplement!de!l’Afrique!(APA)!sur!le!gisement!d’Ounjougou,!au!Mali,!et!

dans!la!vallée!de!la!Falémé,!au!Sénégal,!seront!détaillées!à!titre!d’illustration.!

!

Objectif+Acquisition!des!principales!connaissances!dans!le!domaine!concerné.!

!

!

210

!PARASITOLOGIE+ /+PARASITOLOGY+ 14B056++Semestre++

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS++

3!

Jour++

mercredi!14h15!8!16h00!

Lieu++

Sciences!II,!2ème!étage,!salle!229!

Mode+d’évaluation+!

examen!écrit!(60%),!présentation!et!direction!des!discussions!(30%),!participation!aux!discussions!(10%)!

Sessions+d'examens++

juin!+!rattrapage!août8septembre!

Responsable+!

Madame!I.!BLASCO8COSTA!–!022!418!63!87!!Isabel.Blasco8Costa@ville8ge.ch!!

Enseignant(e)s++

Madame!I.!BLASCO8COSTA!(cc).!

Divers+Une+inscription+par+email+est+souhaitée!dès!le!semestre!d’automne!si!possible!et!!jusqu’au+14+février+2020!au!plus!tard.!Le+cours+est+donné+à+partir+de+5+participants+et+sera+limité+à+14+participants.!!!Cours!en!français!(examen!en!anglais!possible)!14h!excathedra!(Français)!et!14h!presentations,!analyses!d'articles!scientifiques!(en!Anglais)!et!discussions.!!!Contenu+Les!grands!principes!du!parasitisme,!la!diversité!de!ce!mode!de!vie!et!l'écologie!et!évolution!des!organismes!parasites!seront!présentés.!Le!cours!couvre!les!aspects!généraux!de!l'interaction!parasite8hôte!et!parasite8écosystème!au!travers!de!la!discussion!d'articles!scientifiques!sur!la!dynamique!de!la!reine!rouge,!la!manipulation!du!comportement!des!hôtes,!les!invasions!biologiques!ou!le!changement!climatique,!entre!autres.!!1)! Introduction!à!la!parasitologie.!2)! Groupes!protozoaires!:!flagellés,!amibozoaires,!ciliés,!apicomplexés!(agent!du!paludisme).!3)! Plathelminthes!:!monogènes,!trématodes,!cestodes.!4)! Nématodes.!5)! Acantocéphales,!arthropodes,!mollusques!et!autres.!6)! Écologie!des!interactions!hôte8parasite.!7)! Évolution!des!interactions!hôte8parasite!:!micro8!et!macro8évolution.!8)! Adaptation!locale!et!théorie!de!la!Reine!Rouge.!9)! Coévolution!et!évolution!de!la!virulence.!!10)! Parasite!versus!hôte:!effets!sur!l’écologie!et!l’évolution!de!l’hôte.!11)! Thérapies!avec!helminthes!pour!améliorer!la!santé!humaine!?!12)! Les!invasions!biologiques!et!le!parasitisme.!13)! Les!réseaux!trophiques!et!les!parasites.!14)! Conservation!des!interactions!interspécifiques.!!Objectif+Acquérir!une!connaissance!générale!sur!la!diversité,!l’écologie!et!l’évolution!des!organismes!parasites,!leur!rôle!dans!les!écosystèmes!et!les!interactions!avec!leurs!hôtes.!De!plus,!il!est!attendu!que!les!étudiants!acquièrent!un!regard!critique!sur!la!recherche!scientifique!et!développent!leurs!compétences!de!communication.!!!!!

211

!PENSER&LES&SCIENCES&:&&Nouvelles&Perspectives&de&la&Recherche&

14B650&

&Semestre&&

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS&&

3!

Jour&&

jeudi!12h15!–!14h!

Lieu&&

Uni!Carl<Vogt,!C308!

Mode&d’évaluation&!

examen!oral!ou!travail!de!recherche!écrit!/!!Oral!exam!or!written!research!paper!!

Sessions&d'examens&&

juin!+!rattrapage!août<septembre!

Responsable&!

Monsieur!B.!STRASSER!<!bruno.strasser@unige.ch!

Enseignant&&

Monsieur!B.!STRASSER!(po).!

Divers&Ce! séminaire! de! recherche! est! en! principe!enseigné!en! français!sauf! demande!contraire!des!participants.!Il!s’adresse!aussi!bien!aux!étudiants!avancés!en!sciences!naturelles,!qu’en!sciences!humaines!et!sociales,!et!à! toute!personne!intéressée,!notamment!doctorants!et!chercheurs.!Il!ne!requiert!aucune!connaissance!préalable!en!science,!en!histoire,!en!sociologie!ou!en!anthropologie,!mais!la!lecture!de!l’anglais!est!nécessaire.!!

**************!!

This!course!is!open!to!all!advanced!students!in!the!natural,!social,!and!human!sciences,!as!well!as!any!interested!person,!such!as! doctoral!students!and! researchers.! It! does!not! require!any! specific!knowledge!in!science,!history,!sociology,!or!anthropology,!but!reading!skills!in!English!are!necessary.!!Contenu&L‘objectif!de!ce!séminaire!est!d’identifier!les!nouvelles!perspectives!de!recherche!dans!l’étude!des!sciences!(“science!studies”).!Ces!dernières!années,!de!nouveaux!thèmes!de!recherches!ont!émergé,!notamment!dans!le! champ!de! l'histoire!de! l'environnement,!de!l'histoire!globale,!de!l'histoire!des!catégories!épistémologiques,!de! la! sociologie!de! l'expertise,!de! la! sociologie!de! la! participation!publique,!et!de!l'anthropologie!des!sciences!de!la!vie.!Pour!identifier!et!développer!un!regard!critique!sur!ces!développements,!les!participants!discuteront!plusieurs!ouvrages!récents!en!histoire,!sociologie!et!anthropologie!des!sciences,!ainsi!que!les!dernières!publications!des!revues!dans!le!domaine.!Le!programme!des!lectures!sera!déterminé!en!fonction!des!intérêts!spécifiques!des!participants.!!!

**************!!The!purpose!of!this!course!is!to!identify!new!research!perspectives!in!science!studies.!In!the!last!few!years,!new! research!themes!have!emerged,!for!example! in!environmental!history,!global!history,!historical!epistemology,!the!sociology!of!expertise!and!public!participation,!and!the!anthropology!of!the!life!sciences.!In!order!to!identify!and!gain!a!critical!understanding!of!these!themes,!participants!will!discuss!several!recent!books!and!survey!the!current!literature!in!the!field.!The!exact!readings!list!will!be!determined!depending!on!the!specific!interests!of!the!participants.!!!!

212

!PHYLOGENIE*ET*EVOLUTION*MOLECULAIRE*/**PHYLOGENY*AND*MOLECULAR*EVOLUTION*

14B657*

Stage*(cours*+*travaux*pratiques)*Cours*obligatoire*pour*l’orientation*«*Biodiversité*et*systématique»*du*master**Semestre**

automne/printemps! 40h/sem,!total!40h!

ECTS**

5!(doctorants!3)!

Jour*&*lieu**

contacter!le!responsable!

Mode*d’évaluation*!

rapport!

Sessions*d'examens**

juin!+!rattrapage!août>septembre!

Responsable*!

Monsieur!J.!MONTOYA!–!022.379.6786–!!!juan.montoya@unige.ch!

Enseignant(e)s**

Messieurs!J.!MONTOYA!et!collaborateur(trice)s.!

Divers*Inscription!par!e>mail!à!Juan!MONTOYA!:!juan.montoya@unige.ch.!

Les*places*sont*limitées.*!Ce*cours*est*donné*en*anglais!et!a!pour!objectif!de!comprendre!comment!évoluent!l’ADN!et!les!protéines!et!comment!cette!information!est!utilisée!pour! reconstruire!les! relations!phylogénétiques!entre!organismes.!Le!cours!comporte!une!partie!théorique!et!une!partie!pratique!destinée!à!familiariser!les!étudiants!avec! les!programmes!d’analyses!phylogénétiques!ainsi!qu'à!apprendre!à!utiliser! un!serveur!de!calcul!distant.!!Contenu*Modèles! d’évolution! de! l’ADN.! Modes! de! sélection! moléculaire.! Taux! d’évolution! et! horloge!moléculaire.!Méthodes!de!reconstruction!phylogénétique:!distance!et!probabiliste.!Application!des!phylogénies!moléculaires!dans!la!reconstruction!de!l’arbre!du!vivant,!l’étude!de!la!biodiversité,!l’étude!de! la! spéciation!et! la! phylogéographie.!Phylogénies!multigéniques!et!phylogénomiques.!Test!de!comparaison!d'hypothèses!évolutives!alternatives.!!!La!partie!pratique!comporte!une!présentation!des!bases!de!données,!alignement!des!séquences!nucléotidiques!et!protéiques,!utilisation!des! programmes! d’analyses!phylogénétiques! (MrBayes,!RaxML,! Paml,! BEAST,...),! tests! statistiques! appliqués! aux! reconstructions! phylogénétiques,!estimations!des!temps!de!divergence.!!!

213

!PHYSIOLOGIE*VEGETALE*.*automne*Perception*moléculaire*de*l’environnement*chez*les*plantes**

13B012A*

Cours*à*choix*restreint*de*3ème*année**Semestre**

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!

Jour**

jeudi!10h15!7!12h!!

Lieu**

Sciences!III,!salle!1S081!

Mode*d’évaluation*!

examen!écrit!(3h)!

Pré.requis* notions!de!biologie!végétale!acquises!durant!les!deux!premières!années!(en!particulier!:!12B013!Biologie!végétale!et!12B019!Développement!végétal).!!

Sessions*d'examens**

janvier7février!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable*!

Madame!T.!FITZPATRICK!–!022.379.3016!!theresa.fitzpatrick@unige.ch!!

Enseignant(e)s**

Mesdames!T.!FITZPATRICK!(po),!M.!BARBERON!(past).!Messieurs!R.!ULM!(po),!L.!LOPEZ7MOLINA!(pas).!!

Divers*Le*cours*de*physiologie*végétale!est*structuré*en*deux*partiesb!l'une!au!semestre!d'automne!(13B012A)!et!l’autre!au!semestre!de!printemps!(13B012P).!A!noter,!le!cours!commencera!le!26!septembre!en!2019.!!!La*note*annuelle*est*la*moyenne*des*2*notes*obtenues.*Le!cours!doit!être!suivi! dans!son! intégralité!(semestres!d’automne!et!de!printemps)!pour!obtenir!!6!ECTS.**Cours*en*français*et*en*anglais.**!Contenu*Méthodes!expérimentales!(Exemple!de!I’utilisation!d’Agrobacterium-tumefaciens)!(R.!Ulm).!Les!hormones!des!plantes!(R.!Ulm,!M.!Barberon!et!L.!Lopez7Molina).!Les!stress!abiotiques!II!(salinité,!sécheresse,!inondation,!température)!(T.!Fitzpatrick).!La!nutrition!des!plantes!II!(T.!Fitzpatrick)!Les!rythmes!des!plantes,!par!exemple!l'horloge!circadienne!(T.!Fitzpatrick)!!Objectif*En! tant!qu’organismes!sessiles,! les! plantes!doivent!être! en!mesure! de!percevoir! les! conditions!environnementales!défavorables!pour! leur! survie! et! d’y! apporter!une! réponse! appropriée.!La!compréhension!de!ces!processus!a!des!implications!importantes!pour!améliorer!la!croissance!et!le!rendement!des!plantes!cultivées.!Dans!ce!cours,!vous!allez!développer!une!connaissance!approfondie!des!mécanismes!moléculaires!impliqués!dans!divers!aspects!de!la!perception!de!l’environnement!par!les!plantes.!

!!!

214

!PHYSIOLOGIE*VEGETALE*.*printemps*Perception*moléculaire*de*l’environnement*chez*les*plantes**

13B012P*

Cours*à*choix*restreint*de*3ème*année*!Semestre**

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!

Jour**

jeudi!10h15!9!12h!

Lieu**

Sciences!II,!salle!A50A!

Mode*d’évaluation*!

examen!écrit!(3h)!

Pré.requis* notions!de!biologie!végétale!acquises!durant!les!deux!premières!années!(en!particulier!:!12B013!Biologie!végétale!et!12B019!Développement!végétal).!!

Sessions*d'examens**

juin!+!rattrapage!août9septembre!

Responsable*!

Madame!T.!FITZPATRICK!–!022.379.3016!theresa.fitzpatrick@unige.ch!

Enseignant(e)s**

Messieurs!R.!ULM!(po),!M.!HOTHORN!(pas),!T.!TURLINGS!Université!de!Neuchâtel!(po),!P.!REYMOND!Université!de!Lausanne!(po),!!Madame!T.!FITZPATRICK!(po).!!

Divers*Le*cours*de*physiologie*végétale!est*structuré*en*deux*partiesf!l'une!au!semestre!d'automne!(13B012A)!et!l’autre!au!semestre!de!printemps!(13B012P).!!La*note*annuelle*est*la*moyenne*des*2*notes*obtenues.*Le!cours!doit!être!suivi!dans!son!intégralité!(semestres!d’automne!et!de!printemps)!pour!obtenir!!6!ECTS.**Cours*en*français*et*en*anglais.**!Contenu*Interactions!plantes9plantes!(R.!Ulm).!Les!réponses!aux!insectes!(P.!Reymond).!Interactions!tritrophiques!(T.!Turlings).!Le!système!immunitaire!de!la!plante,!les!hormones!peptidiques!des!plantes!(M.!Hothorn).!!Objectif*En!tant!qu’organismes!sessiles,!les!plantes!doivent!être!en!mesure!de!percevoir! les!conditions!environnementales!défavorables!pour!leur! survie! et!d’y! apporter!une! réponse!appropriée.!La!compréhension!de!ces!processus!a!des!implications!importantes!pour!améliorer!la!croissance!et!le!rendement!des! plantes!cultivées.! Dans! ce! cours,! vous! allez! développer!une!connaissance!approfondie!des!mécanismes!moléculaires! impliqués!dans!divers! aspects!de!la! perception!de!l’environnement!par!les!plantes.!!!!

215

!PHYSIOLOGIE*VEGETALE* 13B906*Travaux*pratiques*à*choix*restreint*de*3ème*année*

*

Semestre*

*

Printemps!–!3!semaines! 4h/jour,!total!60h!

ECTS*

*

3!

Jour*

*

20*avril*au*8*mai*2020!!

Lieu*

*

Sciences!III,!laboratoires!

Mode*d’évaluation*

!participation!active!et!présentation!orale,!certificat!

PréOrequis* Avoir!suivi!ou!suivre!en!parallèle!le!cours!de!Physiologie!végétale!(13B012A!&!13B012P)!!

Responsable*

!Madame!E.!DEMARSY!–!022!379!36!52!emilie.demarsy@unige.ch!!

Enseignant(e)s*

*

Mesdames!T.!FITZPATRICK!(po),!M.!BARBERON!(pa)!Messieurs!M.!HOTHORN!(pas),!LOPEZ!MOLINA!(pas),!!R.!ULM!(po)!et!assistant(e)s.!!

Divers!!

Les!inscriptions!des!travaux!pratiques!à!choix!restreint!de!3ème!année!sont!obligatoires.!Les!inscriptions!s'effectueront!en*ligne!!!!

*

Vous!recevrez!des!informations!complémentaires!par!eemail!à!la!miOfévrier.!!!!Contenu*

Les!étudiants,!par!groupes!de!2!et! sous! la! direction!d’un!assistant,!mènent!au!sein!d’un!des!5!laboratoires!du! département!un!projet!de! recherche!actuelle! liée!à! la! thématique!du! laboratoire!d’accueil.!Les!thèmes!de!recherche!des!différents!laboratoires!sont!décrits!sur!les!sites!web!respectifs!présentés!sur!le!site!du!département!de!Botanique!et!Biologie!végétale!:!!http://www.unige.ch/sciences/biologie/biveg/labs.html!!Objectif*

Se! familiariser! en!situation!réelle!avec! les! techniques!et!les! outils!utilisés! dans!un! laboratoire!de!recherche.!Décrire!le!projet!et!les!résultats!obtenus!dans!une!présentation!orale.!!

216

!PLANT&SCIENCE&SYMPOSIUM&(PSS)&AND&GENEVA&PLANT&SEMINARS&(GPS)&

14B648&

&

Compulsory&course&for&the&option&«&Molecular&Plant&Sciences»&of&the&master!!Periods& Autumn/Spring! year!60h!& ! !ECTS& 1!

!Language& English!

!Day&&&place& Autumn&semester&

PSS:!Every!Monday!13:15!–!14:00!/!Sciences!III,!room!A50B!GPS:!Wednesdays!11:15!–!13:00!/!Sciences!III,!room!1S059!!(see!bioseminars.unige.ch!for!schedule!and!content)!!Spring&semester&PSS:!Every!Monday!13:15!–!14:00!/!Sciences!III,!room!A50A!GPS:!Wednesdays!12:15!–!14:00!/!Sciences!III,!room!1S059!!(see!bioseminars.unige.ch!for!schedule!and!content)!!

Evaluation&mode! No!examination.!Participation!is!mandatory!for!students!of!the!Master!in!Biology,!option!Molecular!Plant!Sciences.!!

Prerequisite& Bachelor!in!Biology!or!Biochemistry!or!equivalent!& !Persons&in&charge&!!

T.!FITZPATRICK!–!022!379!3016!X!theresa.fitzpatrick@unige.ch!R.!ULM!–!022!379!3650!X!roman.ulm@unige.ch!

Teachers! M.!BARBERON!(past),!T.!FITZPATRICK!(po),!M.!HOTHORN!(po),!!L.!LOPEZXMOLINA!(pas),!X.!PERRET!(mer),!R.!ULM!(po),!MSc!students,!PhD!students!and!postdocs,!invited!researchers.!

!Contents&The!Plant&Science&Symposium!seminars!(PSS)!are!presented!by!the!MSc!students,!PhD!students!and!postdocs!of!the!Department!of!Botany!and!Plant!Biology,!who!give!progress!reports!on!their!own!research!activities.!The!PSS!are!organized!on!a!weekly!basis!(Mondays!at!13:15).!!The!Geneva&Plant&Seminars!(GPS)!feature!invited!speakers!and!cover!all!aspects!of!current!research!in!Plant!Biology.!They!are!organized!on!a!caseXbyXcase!basis,!usually!on!Wednesday!at!either!11.15!or!12:15!(please!refer!to!the!announcements!on!bioseminars.unige.ch!for!schedule!and!content).!!!Please!note!some!are!in!the!context!of!the!Life!Science!Seminar!Series!(LSSS)!and!take!place!!on!Tuesdays!11:00.!!Objective&Learn!about!the!mostXupXtoXdate!scientific!questions!and!methods!in!Plant!Biology.!Be!able!to!transfer!this!knowledge!to!the!benefit!of!your!own!research,!if!appropriate.!!!!

217

!PREHISTOIRE)REGIONALE) 14T017)

Séminaire)obligatoire)bachelor)en)archéologie)préhistorique)et)anthropologie)

)

Semestre)

)

Automne!et!printemps! 28h!réparties!sur!les!deux!semestres!

ECTS)

)

3!

Jour)

)

à!fixer!

Lieu)

)

Uni!Carl!Vogt!

Mode)d’évaluation)

)

présentation!orale!

Responsables)

!!

Monsieur!Lionel!PERNET!(cc)!F!!Lionel.Pernet@unige.ch!!

Contact:!Marie!BESSE!F!022.379.6915!F!marie.besse@unige.ch!Enseignant)

)

Monsieur!Lionel!PERNET!(cc)!

Divers)

A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS)

Cet)enseignement)a)lieu)en)2019O2020.)Il)n’aura)pas)lieu)en)2020O2021.)

!Contenu)

Cet!enseignement!de!niveau!bachelor!offre!à!l'étudiant!la!possibilité!d'étudier!un!site!préhistorique!du!Plateau!suisse!et!des! régions!avoisinantes.!Il!s'agit!d'analyser!le!contexte!de!sa! découverte,!les!méthodes!de!fouilles!mobilisées!et!les!résultats!interprétatifs!proposés.!Le!thème!choisi!pour!2019F2020!concerne! les!pratiques! funéraires!du!Bronze! final! à! la! fin! de! l’âge!du! fer,! entre!Sud!de!l’Allemagne,!est!de!la!France!et!Plateau!suisse.!Les!horaires!précis!du!séminaire!seront!donnés!lors!du!premier!cours.!!!!

218

!PREHISTOIRE)REGIONALE) 14T016)Travaux!pratiques!obligatoire!bachelor!en!archéologie!préhistorique!)Semestre))

automne/printemps! 4h/sem,!total!112h!

ECTS))

6!

Jour))

vendredi!8h15!–!12h00!+!une!semaine!de!voyage!d'études!!!

Lieu))

Uni!Carl!Vogt!

Responsable)!

Madame!M.!BESSE!M!022.379.6915!M!marie.besse@unige.ch!

Enseignant(e)s))

Madame!Delia!CARLONI!(ass.)!!!

Divers))A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS))Cet)enseignement)a)lieu)en)2019J2020.)Il)n’aura)pas)lieu)en)2020J2021.)!Contenu)Pendant!cet!enseignement!de!niveau!bachelor,!les! étudiantes!et!les! étudiants!mèneront!une!recherche!sur!une!thématique!de!la!préhistoire!régionale.!Un!voyage!d'étude!sera!organisé!par!les!étudiant.e.s.!Toutes!les!contributions!seront!rassemblées!dans!un!volume!qui!servira! de!guide!scientifique!pendant!le!voyage!d'étude.!Le!voyage!d’études!se!déroulera!pendant!une!semaine!au!printemps!2020,!en!Italie,!dans!la!région!de!Naples.!!!!

219

!PREHISTOIRE)REGIONALE) 14T006)Cours)obligatoire)bachelor)en)archéologie)préhistorique)et)anthropologie))Semestre))

automne/printemps! 2h/sem,!total!56h!

ECTS))

6!

Jour))

jeudi!15h!7!17h!

Lieu))

Uni!Carl!Vogt!

Mode)d’évaluation)!

examen!oral!

Sessions)d'examens))

juin!+!rattrapage!août7septembre!et!février!

Responsable)!

Madame!T.!STEIMER!7!022.379.6915!7!tara.steimer@unige.ch!!

Enseignant(e)s))

Madame!T.!STEIMER!(ce)!et!collab.!

Divers)A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS))Ce)cours)a)lieu)en)2019S2020.)Il)n’aura)pas)lieu)en)2020S2021.)!Contenu)Cet! enseignement!de!niveau!bachelor!présente!la! préhistoire!du!Plateau!suisse! et!des! régions!avoisinantes,!des!derniers!chasseurs!à!l'aube!de!l'histoire.!Plusieurs!aspects!sont!abordés!:!paléo7environnements,! peuplements,! habitats,! économie,! technologie,! typologie! et! chronologie! des!productions!matérielles.!Il!s'agit!ici!d'offrir!une!vision!diachronique!de!l'évolution!des!sociétés!humaines!préhistoriques!d'une!région!singulière.!!!$$

220

!PRINCIPLES)OF)CELLULAR)AND)MOLECULAR)BIOLOGY)Biologie)cellulaire)et)moléculaire)approfondie)

14B010)

!Period) Autumn/Spring!(2h!class!+!1h!exercise)! 3h/week,!year!84h!ECTS) 8!

!Time) Wednesday!10:15!E!12:00!

!Place))

Sciences!III,!room!0019!

Evaluation)mode! Oral! exam:! Presentation!of! a! publication! selected! by! the! teachers!!(10!min)! followed!by!questions!(2! x!15!min).! The!publications!will! be!communicated!three!weeks!before!the!exam.!Note:!Active!participation!is!compulsory!for!this!class.!To!obtain!the!credits,!students!have!to!present!a!minimal!number!of!publications!as!set!by!the!course!organizer!(usually!3E4).!Attendance!for!1!semester:!minimal!number!of!publications:!2!!

Requirements) No!mandatory!requirements.!However,!a!basic!knowledge!in!molecular!and!cellular!biology!is!necessary!to!follow!the!course.!For!local!students:!Biologie!moléculaire!de!la!cellule!(13B001)!and/or!Biochimie!II!(13C008)!are!highly!recommended.!!

Exam)sessions) Primary!session:!JuneY!secondary!session:!AugustESeptember.!!An!additional!session!in!February!is!possible!for!Erasmus!students.!

) !Person)in)charge)!

F.!STUTZ!E!022.379.6729!–!Francoise.Stutz@unige.ch!

Teachers! S.!CITI!(pas),!P.!GUICHARD!(past),!M.!KAKSONEN!(po),!!J.!C.!MARTINOU!(po),!D.!PICARD!(po),!T.!SOLDATI!(pas),!!F.!STUTZ!(po).!

!Miscellaneous!The)course)is)intended)for)students)preparing)a)master)in)biology)or)biochemistry.)))The!aim!of! this!course! is! to!acquire!a!deeper!knowledge!of!the!molecular!mechanisms!governing!cellular!functions.!The!teachers!will!give!short!overviews!on!recent!developments!in!the!fields!specified!below.!!The!students!will!present!and!discuss!selected!publications!chosen!by!the!teachers.!!The!class!includes!two!hours!of!teaching/presentation!and!1!hour!of!individual!reading!and!preparation!of!publications!by!the!students!per!week.!!!Contents)Cell!structure!and!function:!Membrane!biogenesis!and!vesicular!transportY!intracellular!pathogen!interference!with!membrane!trafficking!pathways.!Signaling!mechanisms:!CellEcell!junctions!in!tissue!physiology,!differentiation!and!signalingY!cellular!stress!responses.!Cell!division,!centrosome!and!cilia.!Mechanisms!of!regulation!of!gene!expression:!Chromatin!biology!and!epigeneticsY!mRNA!biogenesis!and!quality!controlY!small!RNAs,!mitochondrial!RNA!metabolism.!!Objective)Learn!how!to!read,!interpret!and!present!scientific!publications.!Learn!how!to!ask!questions!and!discuss!science!with!colleagues!and!teachers.!Acquire!inEdepth!understanding!of!molecular!mechanisms!controlling!cell!function!as!well!as!of!the!experimental!approaches!used!to!study!these!fundamental!processes.!!!!

221

!

PRINCIPLES)OF)NEUROBIOLOGY)I) 24N01)!

Period))

Autumn! 2h/week,!year!28h!

ECTS) 3!(lectures)!

!

Day) Tuesday!16:15!–!18:00!!

!

Place))

Auditorium!C150,!CMU!

Evaluation)mode! Written!test!!

!

Exam)sessions) January!2019.!Resit!examination!in!September!2019!

) !

Person)in)charge)!

J.NM.!MATTER!–!022!379.6195!–!jeanNmarc.matter@unige.ch!

Teachers! J.NM.!MATTER!(mer)!and!other!teachers!of!the!Medical!School.!!

!

Contents)This!course!covers!the!principles!of!the!central!nervous!system!organization,!the!mechanisms!involved!

in!the!development!of!cortical!circuits!and!functional!specificities!of!the!major!anatomical!regions!of!

the!brain.!Basic!knowledge!in!neurobiology!is!required!to!attend!this!course.!Students!are!advised!to!

take!the!joint!course!“Principles!of!Neurobiology!II”.!Supplementary!information!on!the!module!can!be!

found! in! the! courses! program! of! the! University! of! Geneva! or! on! Dokeos!

https://dokeos.unige.ch/home/courses/24N01/.!

!

!

!!PRINCIPLES)OF)NEUROBIOLOGY)II) 14N11)!Period) Autumn! 2h/week,!year!28h!ECTS) 3!(lectures)!

!Day) Wednesday!16:15!–!18:00!!

!Place))

Auditorium!C150,!CMU!

Evaluation)mode)!

Written!test!

Exam)sessions) January!2017.!Resit!examination!in!September!2018!) !Person)in)charge)!

D.!HUBER!–!022!379.5347!–!daniel.huber@unige.ch!

Teachers! D.!HUBER!(prof)!and!other!teachers!of!the!Medical!School.!!Contents)This!course!addresses!the!main!aspects!of!the!functioning!of!a!neuron!and!ion!channels,!the!synaptic!transmission!and!the!network!activity,!and!puts!into!perspective!the!role!of!these!properties!as!part!of!the!major!functions!of!our!brain.!Basic!knowledge!in!neurobiology!is!required!to!attend!this!course.!Students!are!advised!to!take!the!joint!course!“Principles!of!Neurobiology!I”.!Supplementary!information!on! the!module!can!be!found!in! the!courses!program!of! the!University! of!Geneva!or!on!Dokeos!https://dokeos.unige.ch/home/courses/24N01/.!!!

222

!PROGRAMMING)FOR)BIOINFORMATICS) 14F006)Course)8)Practicals!!Period) Autumn!

!2+4h/week,!year!28+56h!

ECTS) 6!(7!for!biologists)!!

Evaluation)mode! Written!exam!+!Pratical!works!!

Exam)sessions) JanuaryEFebruary,!June!+!AugustESeptember!) !Person)in)charge)!

B.!CHOPARD!–!022!379!02!19!–!bastien.chopard@unige.ch!

Teacher! B.!CHOPARD!(po).!!Miscellaneous!

)NE)SERA)PAS)DONNEE)EN)2019/2020)

!Contents)Practical!works!and!exercises!will!consist!of!implementing!in!Python!programs!which!illustrate!the!notions!seen!in!the!course.!!Objective)To!present!the!basic!concepts!of!programming!and!algorithms!through!the!Python!language.!Python!is!frequently!used!in!bioinformatics!and!allows!implementing!important!data!structure!and!algorithms.!!!!

223

!PROGRESS'REPORT'IN'CELL'BIOLOGY' 14B773'Seminar'!Periods' Autumn/Spring! 1h/week,!year!28h!ECTS' 3!

!Day' Thursdays!10:00!!

!Place''

Sciences!III,!room!2024!

Evaluation'mode! Oral!presentation!!

Exam'sessions' June!' !Person'in'charge'!

S.!CITI!F!022.379.6182!–!sandra.citi@unige.ch!!

Teachers! S.!CITI!(pas),!J.FC.!MARTINOU!(po),!D.!PICARD!(po),!F.!STUTZ!(po),!!P.!GUICHARD!(past).!

!Miscellaneous!This!course!is!intended!for!fourthFyear!Master!students!and!graduate!students!in!the!Department!of!Cell!Biology.!Other!interested!students!please!contact!Prof.!S.!Citi.!!The!course!consists!of!presentations!of!current!research!(Progress!Report)!by!Master!and!graduate!students,!postFdocs!and!other!members!of!the!Department.!!The'course'is'given'in'English.'!Objective'The!objective!of!the!course!is!to!develop!and!demonstrate!the!ability!of!students!to!present!the!results!of!their!own!experimental!work!clearly,!logically!and!critically,!in!an!oral!presentation.!!!

224

!

PROTOHISTOIRE)DE)L’AFRIQUE):)de)l’apparition)du)métal)à)la)mise)en)place)des)grands)empires)

14B048)

Cours)obligatoire)du)master)en)archéologie)préhistorique))Semestre))

automne! 4h/sem,!total!56h!

ECTS))

6!

Jour))

mercredi!10h!7!13h!!

Lieu))

Sciences!II,!salle!449!

Mode)d’évaluation)!

examen!oral!

Sessions)d'examens))

janvier7février!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable)!

Monsieur!E.!HUYSECOM!7!022.379.6973/67!7!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s))

Monsieur!E.!HUYSECOM!(pas),!!

Madame!A.!MAYOR!(mer)!et!collaborateurs.!

!

Divers))

A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS.)AURA)LIEU)AU)SEMESTRE)D’AUTOMNE)2020)

!

Contenu)Ce!cours!est!consacré,!dans!une!première!partie,!au!développement!de!la!métallurgie.!Il!aborde!les!

questions!historiques,!telles!que!l’apparition!des!métaux!dans!la!vallée!du!Nil!et!les!relations!avec!le!

Proche7Orient,!les! contacts!entre!l’Afrique!du! nord!et! la!péninsule!Ibérique,!et! l’invention!de! la!

métallurgie!du!fer!en!Afrique!subsaharienne.!La!seconde!partie!du!cours!présente!le!développement!

des!grands!royaumes!ouest7africains,!les!échanges!commerciaux!à!longue!distance,!notamment!le!

commerce!entre! l’Afrique!et! l’Asie! et!l’essor! des!cités!swahili!ou!de!Great!Zimbabwe,!ainsi!que!

l’émergence!de!l’islam!et!ses!conséquences!socio7économiques!à!l’époque!précoloniale.!Certaines!

recherches!archéologiques!de!l’équipe!du!Laboratoire!Archéologie!et!Peuplement!de!l’Afrique!(APA),!

menées!en!Afrique!de!l’Ouest,!seront!détaillées!à!titre!d’illustration.!

!

Objectif)Acquisition!des!principales!connaissances!dans!le!domaine!concerné.!

!

!

225

!PROTOHISTOIRE)DE)L’AFRIQUE):)de)l’apparition)du)métal)à)la)mise)en)place)des)grands)empires)

14B748)

Séminaire))Semestre))

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS))

3!

Jour))

mercredi!15h!7!17h!

Lieu))

Sciences!II,!salle!449!

Mode)d’évaluation)!

présentation!orale!et!travail!écrit!

Responsable)!

Monsieur!E.!HUYSECOM!7!022.379.6973/67!7!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s))

Messieurs!E.!HUYSECOM!(pas),!J.!AYMERIC!(as),!Madame!C.!CERVERA!(as)!et!collaborateurs.!!

Divers))

A)LIEU)TOUS)LES)DEUX)ANS.!AURA)LIEU)AU)SEMESTRE)D’AUTOMNE)2020)

)Le!séminaire!est!ouvert!au!public.!!Contenu)Sujets!en!relation!avec!le!cours!n°!14B048.!!Objectif)Approfondir!certains!sujets!abordés!dans!le!cours!n°!14B048,!notamment!au!travers!d’un! travail!personnel!!!

226

!

RESSOURCES'NATURELLES' 14T080''Semestre''

printemps! 2h/sem,!total!28h!

ECTS''

3!

Jour''

lundi!14h15!8!16h,!début!des!cours!24!février!2020!

Lieu''

Sciences!de!la!Terre,!salle!001!

Rue!des!Maraîchers!13!

!

Mode'd’évaluation'!

examen!écrit!et!présentation!d’un!séminaire!

Sessions'd'examens''

juin!+!rattrapage!août8septembre!

Responsable'!

Monsieur!R.!MORITZ!–!022!379!6633!–!robert.moritz@unige.ch!!

Département!des!sciences!de!la!Terre!

!

Enseignant(e)s''

Monsieur!R.!MORITZ!(pas)!et!collaborateur(trice)s.!

Contenu'Inventaire!des!principales!ressources!naturelles,!problèmes!posés!par!leur!exploration,!exploitation!

et! leur! traitement!:! cycles!de!vie! et!écobilan,!ressources!énergétiques!et!minérales,!matériaux!

industriels,!ressources!en!eau!et!en!espace.!

!

!

227

!SCIENCES&DE&L’ATMOSPHERE& 14E139&&Semestre&&

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS&&

3!

Jour&&&lieu&&

jeudis!de!10h15!–!12h8!ISE!–!Carl>Vogt!>!salle!B003!

Langue(s)&&

Français!et/ou!anglais!

Mode&d’évaluation&!

examen!écrit!

PréHrequis&&

de!bonnes!bases!en!mathématiques!et!en!physique!sont!nécessaires!

Sessions&d'examens&&

février!+!rattrapage!août>septembre!

Responsable&!

Monsieur!S.!GOYETTE!–!022.379.0757!–!stephane.goyette@unige.ch!

Enseignant&&

Monsieur!S.!GOYETTE!(mer).!

Contenu&Ce! cours! est!une!approche!scientifique!nécessaire!à! la! compréhension,!à! l’analyse!et! à! la!modélisation!des!phénomènes!dynamiques!et!physiques!se!manifestant!dans!l’atmosphère!de!notre!planète.!!Le&cours&aborde&les&sujets&suivants&:&>!Structure!de!l'atmosphère!>!Dynamique!de!l'atmosphère!>!La!thermodynamique!en!air!sec!et!en!présence!d'humidité!>!La!turbulence!>!Les!échanges!entre!la!surface!et!l’atmosphère!>!La!circulation!atmosphérique!à!différentes!échelles!spatio>temporelle!>!Techniques!de!prévisions!numériques!du!temps!et!du!climat!!Objectif&Poser! les! bases! scientifiques!de! la! mécanique! des! fluides,! de! la! thermodynamique,!des!changements!de!phase!de! l’eau,!et! des!échanges!radiatifs!qui!explique!un! bon!nombre! de!processus!atmosphériques.!On!y! analyse!plusieurs!éléments!de! l'atmosphère!à!des!échelles!spatio>temporelles!variables,!depuis!la!turbulence!jusqu'à!la!circulation!générale!planétaire.!On!aborde!aussi!quelques!notions!de!la!prévision!numérique!du!temps!et!du!climat.!!

228

SCIENCES&CITOYENNES:DES&AMATEURS&NATURALISTES&AUX&BIO3HACKERS&

14B651&

Cours&à&choix&de&2ème&et&3ème&années&&Semestre&&

automne( 2h/sem,(total(28h(

ECTS&&

3(

Jour&&

Jeudi(12h15(–(14h(

Lieu&&

Uni(Carl(Vogt,(salle(C308(

Mode&d’évaluation&(

Travail(de(recherche(écrit(et(présentation(orale.(Les(étudiant(e)s(seront(évalués(sur(leur(capacité(à(analyser(des(projets(de(science(citoyenne(contemporains,(à(les(replacer(dans(leurs(contextes(scientifiques(et(historiques,(et(à(utiliser(la(littérature(sur(le(sujet.((

Sessions&d'examens&&

janvierMfévrier(+(rattrapage(aoûtMseptembre(

Responsable&(

Monsieur(B.(STRASSER(–(022.379.0712(M(bruno.strasser@unige.ch(

Enseignant&&

Monsieur(B.(STRASSER((po).(

Divers&Ce( séminaire( de( recherche(est( en( principe(enseigné(en( français( sauf( demande(contraire(des(participants.(((Ce(séminaire(de(recherche(s’adresse(aux(étudiants(en(bachelor(et(en(master(en(sciences(naturelles,(humaines(ou(sociales,(ainsi(qu’aux(doctorants(et(aux(chercheurs.((Il(ne(requiert(aucune(connaissance(préalable(en(science(ou(en(histoire.(Contenu&L’essor(des(“sciences(citoyennes”(à(la(fin(du(XXe(siècle(constitue(une(transformation(majeure(dans(les(relations(entre(les(sciences(et(le(public.(De(la(biologie(de(garage((“DIYMbio”)(à(l’analyse(de(signaux(extraterrestres(sur(des(ordinateurs(personnels((“crowdsourcing”)(ou(la(création(de(cartes(urbaines(de(qualité(de(l’air,(les(sciences(citoyennes(offrent(des(possibilités(variées(aux(amateurs(de(contribuer(à(des(projets(scientifiques.(Alors(que(les(amateurs(ont(été(longtemps(associés(à(des(délibérations(sur(l’impact(des(connaissances(scientifiques(et(technologiques,(les(sciences(citoyennes(promettent(de(les(associer(à(la(production(de(nouvelles(connaissances.(Ce(séminaire(explore(l’histoire(de(la(participation(publique(aux(sciences,(des(amateurs(naturalistes(victoriens(aux(bioMhackers(contemporains,(afin(de(mieux( comprendre( l’originalité( des( sciences(citoyennes.(Nous( tenterons(de(situer( les( sciences(citoyennes(dans(un(mouvement(historique(plus(large:(l’importance(croissante(des(amateurs(dans(la(production(culturelle(et(intellectuelle.(Nous(examinerons(également(le(rôle(des(technologies((internet,(smartphones,( et( médias( sociaux)( dans( la( participation( publique( à( la( recherche( scientifique.(Finalement,(nous(interrogerons(les(notions(d’(“amateur”(et(d’(“expert”,(de(“scientifique”(et(de(“citoyen”,(et(évaluerons(ce(que(les(sciences(citoyennes(peuvent(apporter(à(la(démocratisation(des(sciences.((Objectif&•(Analyser(les(enjeux(de(société(posés(par(les(sciences(citoyennes.(•(Situer(les(sciences(citoyennes(dans(leur(contexte(historique(de(la(participation(publique.(•(Identifier(et(évaluer(des(sources(d'informations(et(les(mettre(en(relation(avec(la(littérature.(Produire(une(analyse(argumentée(originale(et(convaincante(pour(situer(un(projet(actuel(de(science(citoyenne(dans(son(contexte(scientifique(et(historique.((!

229

!

SCIENTIFIC(WRITING(AND(COMMUNICATION( 14B012(!Period( Spring!

!4h/week,!20h/year!

ECTS( 4!!

Day( Thursday!afternoon:!5,!12,!19,!26!March,!2!April!2020!!

Place((

Conservatoire!et!Jardin!botaniques!(192!Rue!de!Lausanne)!

Evaluation(mode! Evaluation!of!the!exercises!completed.!!

Exam(sessions( June.!( !Person(in(charge(!

M.!PRICE!R!022.418.5148!R!michelle.price@villeRge.ch!

Lecturer! M.!PRICE!(pti).!!Miscellaneous!Course!given!in!English.!!Number!of!participants:!minimum!5!R!maximum!12.!Register!via!the!University!system!and!contact!the!lecturer!directly!by!email.!!

!

Contents(This!course!provides!an!introduction!to!the!practices!and!processes!involved!in!scientific!writing!and!communication!in! biology.!It! is! aimed!at!motivated!thirdRyear!Bachelors,!Masters! or! early!PhD!students.!The!course!will! cover! the! following! topics:!1)! the!planning,!structuring!and!writing!of!scientific!articles!and!scientific!works!(thesis,!project!reports),!2)!the!preparation!of!scientific!posters,!3)!giving!talks!at!conferences,!and!4)!the!preparation!and!submission!of!scientific!research!proposals.!Students!will!participate!in!a!poster!session,!a!proposal!review!panel!and!a!conference!during!the!course!as!well!as!in!group!activities!and/or!discussions!on!each!of!the!topics!covered.!!Objective(Acquisition!of!fundamental!skills!in!scientific!writing!and!communication!in!the!biological!sciences.!!

!!

230

!!!!SEMINAIRE(DU(CERCLE(GENEVOIS(D'ARCHEOLOGIE( 13B706(Séminaire!obligatoire(bachelor!en!archéologie!préhistorique("Module(2.4b(Archéologie(préhistorique(–(partie(B"((Semestre((

automne/printemps!! total!28h!

ECTS((

3!

Jour((

A!convenir!!

Lieu((

Sciences!II,!salle!449!et!Uni@Mail!

Mode(d’évaluation(!

travail!écrit!et!présentation!orale!

Sessions(d'examens((

juin!+!rattrapage!août@septembre!

Responsable(!

Monsieur!E.!HUYSECOM!@!022.379.6973/67!@!eric.huysecom@unige.ch!

Enseignant(e)s((

Monsieur!E.!HUYSECOM!(pas),!!Mesdames!A.!MAYOR!(mer),!K.!Douze!(AdjScIII),!et!collaborateurs.!!

Divers!A(LIEU(TOUS(LES(ANS.(

(Contenu(Le!Cercle! genevois!d’archéologie!(CGA)!a!été!fondé!dans!le!cadre!de!la!Faculté!des!Sciences!de!l'Université!de!Genève!suite!à!un!souhait!d’instaurer!des!associations!cantonales!chargées!de!diffuser!auprès! des! citoyens! les! résultats! des! recherches! archéologiques.! L’Unité! d’anthropologie! du!Département!de!Génétique!et!Évolution!héberge!le!siège!du!CGA.!Ce! cercle!organise!annuellement!une!dizaine!de!séances!où!alternent!des!exposés!d’archéologie!régionale!et!des!conférences!d’intérêt!large,!présentées!par!des!scientifiques!suisses!et!étrangers!de!renom.! Le! programme! comprend! également,!selon! les! circonstances,!des! visites! de! chantiers!archéologiques!et!d’expositions.!Après!une!séance!d'introduction,!les!étudiants!devront!suivre!le!cycle!de!conférences,!et!pourront,!soit!choisir! cinq!exposés!pour!en!présenter!une!synthèse!critique,!soit!développer!un!thème!abordé!et!rédiger!un!dossier!approfondi!en!faisant!référence!à!la!conférence!concernée.!!Objectif(Acquisition!de!connaissances!de!base!dans!le!cadre!d'une!archéologie!élargie!à!d'autres!domaines!que!celui!de! la! Préhistoire,!à!d’autres!régions!que!l’Europe!et! l’Afrique,!et!à!des!disciplines!ou!thématiques!qui!ne!sont!pas!directement!enseignées!dans!le!cadre!du!Bachelor!en!archéologie!préhistorique.!Familiarisation!à!la!rédaction!de!compte@rendus!critiques!de!conférences!scientifiques.!!!!

231

!SEMIOLOGIE(GRAPHIQUE(EN(ARCHEOLOGIE( 14T020(Travaux(pratiques(à(choix(pour(le(master(en(archéologie(préhistorique(et(anthropologie((Semestre((

automne! 3!jours,!total!18h!

ECTS((

1!

Jour((

à!fixer!(3!jours)!

Lieu((

Uni!Carl!Vogt!

Mode(d’évaluation(!

travail!personnel!

PréMrequis( connaissances!de!bases!en!Illustrator.!Pour!celles!et!ceux!qui!n’ont!aucune!connaissance!d’Illustrator,!une!mise!à!niveau!est!exigée.!!Contacter!Eva!Gutscher!(eva.gutscher@unige.ch)!!

Responsable(!

Madame!M.!BESSE!M!022.379.6915!M!marie.besse@unige.ch!

Enseignant(e)s((

Mesdames!E.!GUTSCHER!(dess.)!

Contenu(Cet!enseignement!destiné!aux!étudiant.e.s!en!master!en!archéologie!préhistorique!a!pour!objectif!un!apprentissage!des!bases!pratiques!et!théoriques!de!la!sémiologie!graphique.!!Durant!ces!Travaux!pratiques,!l’étudiant.e.!créera!différentes!variantes,!conceptions!et!réalisations!d’illustrations,!ainsi!qu’un!travail!de!mise!en!pages!en!lien!avec!la!communication!(mise!en!scène!graphique,!hiérarchisation!des! informations,! introduction! théorique!pour! la! construction!et! la!réalisation!d’illustrations!avec!des!thématiques!différentes).!!!!

232

!

SPACE&CLIMATE+(CIG)+ 14E142++Semestre++

printemps! 4X8h/sem,!total!32h!

ECTS++

3!

Jour++

4!cours7bloc!journaliers!9h!717h!

dates!à!confirmer!

!

Lieu++

Uni!Carl!Vogt,!salle!informatique!

!

Mode+d’évaluation+!

examen!écrit,!exercices!associés!aux!4!thèmes!proposés.!

Pré&requis+++

Connaissances!géomatique!et!statistique!bienvenues!

Sessions+d'examens++

juin!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable+!

Monsieur!!G.!GIULIANI!(ce)!–!gregory.giuliani@unige.ch!

Enseignants++

Messieurs!!G.!GIULIANI!(ce),!A.!LEHMANN!(pas),!S.!GOYETTE!(mer).!

Contenu+Introduction!aux!Analyses!Spatiales!des!Environnements!Complexes!:!

7!Pyramide!de!l'information!

7!Changements!globaux!

!

Analyse!de!données!météorologiques!:!

7!Extraction!de!données!des!stations!météo!

7!Analyse!de!séries!temporelles!

7!Représentations!graphiques!des!tendances!moyennes!et!des!extrêmes!

!

Interpolation!spatiale:!

7!Inverse!distance!weighting!

7!Trends!

7!Krieging!

!

Analyse!des!données!des!modèles!climatiques!globaux!et!régionaux!:!

7!Le!format!NetCDF!

7!Outils!de!visualisation!et!d'extraction!des!données!

7!Le!NetCDF!dans!les!SIG!

!

Analyses!de!bassins!versants!avec!SWAT!:!

7!Délimitation!des!bassins!versants!

7!Définition!des!«!Hydrological!Response!Units!»!

7!Insertion!des!données!climatiques!

7!Modélisation!de!la!quantité!et!de!la!qualité!des!eaux!des!rivières!

!

Variables!Essentielles!du!Climat!et!Services!Climatiques!

!

Objectif+Le!cours!et!les! travaux!pratiques!associés!visent!à!transmettre!les!idées!générales!derrière!les!

méthodes!modernes!utilisées!pour!l'analyse!spatiale!de!l'environnement.!Ils!visent!à!susciter!la!

curiosité!des!étudiants!afin!qu'ils!puissent!commencer!à!utiliser!les!analyses!spatiales!dans!leurs!

travaux!de!diplôme!et!de!thèse.!

!

!

233

!SPACE&ECOLOGY+:+ANALYSES+SPATIALES+EN+ECOLOGIE+ 14E075++Semestre++

printemps! 4X8h/sem,!total!32h!

ECTS++

3!

Jour++

cours7bloc,!jeudi!9h717h!dates!à!confirmer!!

Lieu++

Uni!Carl!Vogt!

Mode+d’évaluation+!

examen!écrit,!exercices!associés!aux!4!thèmes!proposés.!

Pré&requis+ Connaissances!géomatique!et!statistique!bienvenues!!

Sessions+d'examens++

juin!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable+!

Monsieur!A.!LEHMANN!7!anthony.lehmann@unige.ch!

Enseignants++

Messieurs!A.!LEHMANN!(pas),!N.!RAY!(ce).!!

Contenu+7!Introduction!aux!Analyses!Spatiales!des!Environnements!Complexes!7!GRASP!:!Generalized!Regression!Analyses!and!Spatial!Predictions!7!!!!!prédire!la!distribution!potentielle!des!espèces!7!DOMAINS!:!Classification!du!territoire!en!domaines!environnementaux!par!!!analyse!de!clustering!7!SWAT!:!Soil!and!Water!Assessment!Tool!7!modélisation!hydrologique!de!!!!bassins!versants!7!CORRIDOR!:!Analyse!des!corridors!écologiques!pour!le!déplacement!de!!!!la!faune.!!Objectif+Introduction!aux!analyses!spatiales!en!tant!qu'outils!d'étude!et!de!représentation!de!la!complexité!de!l'environnement.!!!

234

!SPACE&WATER:+Hydological+modeling+with+SWAT+ 14E183++Semestre++

printemps! 4X8h/sem,!total!32h!

ECTS++

3!

Jour++

4!cours7bloc!journalier,!9h7!17h!dates!à!confirmer!!

Lieu++

Uni!Carl!Vogt!!

Mode+d’évaluation+!

examen!écrit,!exercices!associés!aux!4!thèmes!proposés.!

Pré&requis+ Connaissances!et!géomatique!de!statistique!bienvenues!!

Sessions+d'examens++

juin!+!rattrapage!août7septembre!

Responsable+!

Monsieur!A.!LEHMANN!7!022!379!00!217!anthony.lehmann@unige.ch!

Enseignant++

Monsieur!A.!LEHMANN!(pas)!

Contenu+Le!cours!se!déroule!selon!le!programme!général!suivant!:!1.!Introduction!à!la!modélisation!hydrologique!2.!Construction!du!modèle!SWAT!dans!ArcGIS!3.!Analyses!de!sensitivité!et!calibration!des!paramètres!du!modèle!4.!Validation!du!modèle!et!scénarios!de!changement!5.!Interprétation!et!visualisation!des!résultats!de!SWAT!Le!cours!est!organisé!avec!de!brève!séance!d'introduction!théorique!au!début!de!chaque!session!puis!des!exercices!pratiques!sur!ordinateur.!!Objectif+Ce!cours!a!pour!objectif!de!présenter!les!différentes!étapes!de!la!modélisation!hydrologique!avec!l'outil!Soil!and!Water!Assessment!Tool!(SWAT).!!!!

235

!STAGE&EN&ARCHEOLOGIE,&première&approche&métier& 13T040&&Cours&à&choix&pour&le&bachelor&en&archéologie&préhistorique&et&anthropologie&&Semestre&&

4!semaines,!à!fixer! !

ECTS&&

6!

Mode&d’évaluation&!

participation!active!

Responsable&!

Madame!M.!BESSE!:!022.379.6915!:!marie.besse@unige.ch!!!

Enseignant(e)s&&

Mesdames!M.!BESSE!(pas).!J.!DESIDERI!(cc),!T.!STEIMER!(ce),!!L.!MARTIN!(coll.!sc.)!et!collab.!!

Contenu&Il!est!parfois!possible!d'intégrer!une!équipe!de!recherche!ou!une!institution!(Musée,!Université,!Service!d'archéologie,!bureau!d'archéologie...)!pour!une!durée!de!4!semaines!afin!de!découvrir!et!d'exercer!les!premières!facettes!du!métier!d'archéologue.!Il!s'agit!de!valider!un!stage!qui!initie!une!première!approche!du!métier!d'archéologue.!!!!

236

!STAGE&DE&BIOLOGIE&MARINE& 14B667&&Semestre&&

printemps!*!14!jours! 8h/sem,!total!80h!

ECTS&&

6!

Mode&d’évaluation&!

rapport!écrit!

PréDrequis& cours!de!systématique!et!biodiversité!conditions!préalables!:!avoir!suivi!le!cours!et!avoir!réussi!l'examen!de!systématique.!!

Coordinatrice&&

M.!HOLZMANN!*!022!379!30!84!*!maria.holzmann@unige.ch!

Responsable&!

Monsieur!J.!PAWLOWSKI!*!022.379.3069*!jan.pawlowski@unige.ch!

Enseignant(e)s&&

Madame!M.!HOLZMANN!(adj!sci.)!*!maria.holzmann@unige.ch!Monsieur!R.!COVAIN!(adj.!sci.)!*!raphael.covain@ville*ge.ch!!!

Divers&A&LIEU&TOUS&LES&DEUX&ANS&

&LE&STAGE&AURA&LIEU&EN&2019&

&Ce! stage!a! habituellement! lieu!en! juillet/août,!pendant!14! jours!dont!3! de! cours! théoriques!dispensés!à!Genève.!!Il!traite!de!l'étude!systématique!des!communautés!animales!de!divers!milieux!marinsb!ce!stage!est!un!complément!au!cours!obligatoire!de!Systématique!animale.!!!Pour!tout!renseignement!vous!pouvez!contacter!les!enseignants!pendant!le!premier!trimestre!du!semestre!de!printemps.!!!Le!nombre!de!places!est!restreint!à!16&participants.!!Contenu&Ce!stage!aborde!des!notions!théoriques!diverses!liées!à!l’écologie,!à!la!diversité!du!milieu!marin!côtier!et!au!traitement!de!données!biologiques.!Les!collectes!sur!le!terrain!(sorties!en!mer,!excursions,…)!permettront!de!se! familiariser! avec!divers!aspects!méthodologiques!de!la! recherche!en!biologie:!collectes!sur! différents! faciès!en!se! centrant!sur! certains! groupes!d’intérêt,!prises!de! données!environnementales,! identification! des! spécimens! et! prise! de! données! biologiques,! analyses!statistiques!des!données.!L’ensemble!de!la!formation!sera!centré!sur!un!projet!personnel!qui!fera!l’objet!d’un!rapport!scientifique!écrit.!!!Objectif&Acquérir!une!expérience!de!terrain!dans!le!domaine!de!la!systématique!animale!et!biologie!marine.!!

*! Savoir!mettre!en!œuvre!sur! le! terrain!les!connaissances!théoriques!acquises!(prospection,!identification,!prises!de!données…).!

*! Savoir! analyser! les! données! récoltées! (maîtrise! des! bases! statistiques! et! logiciels!nécessaires).!

*! Savoir!synthétiser!et!présenter!ses!résultats!face!à!un!auditoire.!Savoir!rédiger!un!rapport!scientifique.!!!

237

!STAGE&DE&BOTANIQUE&ET&DE&BIOGEOGRAPHIE&ALPINES& 14B668&Stage&à&choix&de&2ème&et&3ème&années&&Semestre&&

printemps! Nbre!de!jours!par!année!5!

ECTS&&

3!

Jour&&

5!au!10!juillet!2020!

Lieu&&

Champex;Lac!(VS)!et!région!!Excursions!incluant!des!rappels!théoriques!à!partir!du!lieu!d’hébergement!Centre! alpien! de! Phytogéographie,! Fondation! J.;M.! Aubert,! 1938!Champex;Lac!!

Mode&d’évaluation&!

examen!oral!de!15!minutes!sur!le!terrain!directement!à!la!suite!du!stageQ!reconnaissance!d'une!vingtaine!de! plantesQ!si! examen!à! une! autre!session:!reconnaissance!de!plantes!sur!images!et!matériel!d'herbier!!

Responsable&!

Monsieur!Louis!NUSBAUMER!;!022.418.52.26!louis.nusbaumer@unige.ch!et!louis.nusbaumer@ville;ge.ch!!

Enseignant(e)s&&

Madame!Y.!NACIRI!(cc)!Monsieur!L.!NUSBAUMER!(cc)!!

Divers&Nombre!de!participants!:!minimum!5!;!maximum!15.!&Nécessité&de&s'inscrire&au&cours&également&par&email&:&louis.nusbaumer@unige.ch!ou!louis.nusbaumer@ville;ge.ch!!Contenu&Connaissance!de!la!flore!et!de!la!végétation!alpines!au!moyen!d'excursions!en!montagne!réalisées!à!partir!du!jardin!botanique!alpin!de!Champex;Lac.!!Objectif&Apprendre!à!:!;reconnaître!les!principales!espèces!de!la!flore!alpine!et!comprendre!leur!signification!écologique!;connaître!les!caractéristiques!du!milieu!alpin!et!comprendre!son!fonctionnement!;connaître!l'organisation!de!la!végétation!en!fonction!de!l'altitude!!;comprendre!l'importance!des!hautes!montagnes!pour!la!biodiversité!!!!

238

!STAGE&DE&BOTANIQUE&TROPICALE& 14B669&Stage&à&choix&de&2ème&et&3ème&années&&Semestre&&

2!semaines! 6h!par!jour/!total!56h!

ECTS&&

5!

PréIrequis&!

Cours!14B016!de!botanique!tropicale!

Responsable&!

Monsieur!L.!GAUTIER!G!022.418.5147!–!laurent.gautier@villeGge.ch!

Enseignant(e)s&&

Monsieur!L.!GAUTIER!(cc)!et!collaborateur(trice)s.!

Divers&Le!stage!a!lieu!en!région!tropicale.!Il!est!réservé!aux!étudiant(e)s!inscrit(e)s!à!un!master!en!botanique!tropicale!et!s’effectue!dans!le!cadre!de!leur!travail!de!terrain.!!Objectif&Familiarisation!avec!les!techniques!de!terrain,!mise!en!pratiques!de!notions!acquises!au!cours.!!!!STAGE&DE&LABORATOIRE& 14B670&&ECTS&&

Variables!selon!le!stage!effectué!

Descriptif&Tout3e!étudiant3e!inscrit3e!au!bachelor!ou!au!master!de!biologie!peut!réaliser!des!stages!de!laboratoire!de!durée!variable,!dont!les!ECTS!peuvent!être!validés!par!la!Section.!

C’est!à!l’étudiant3e!d’entreprendre!les!démarches!nécessaires!auprès!des!professeurs!ou!chercheurs!de!la!Section,!ou!hors!Section!(Faculté!de!médecine,!autre!institution,!entreprise!privée),!pour!trouver!une!possibilité!de!stage!(par!exemple!pendant!les!vacances).!

Un!stage!de!laboratoire!peut!être!validé!selon!les!règles!suivantes!:!

3! un!seul!stage!par!titre!(bachelor,!master)!peut!être!validé!H!3! au!niveau!master,!l’accord!préalable!du!directeur!de!master!ou!du!responsable!de!l’orientation!est!

exigé!H!3! la!demande!de!validation!de!crédits!ECTS!doit!être!adressée!au!secrétariat!de!la!Section!de!

biologie!AVANT!le!début!du!stage!(un$formulaire$ad$hoc$de$«$pré3attestation$»$de$stage$est$à$télécharger$sur$le$site$Internet$de$la$Section$de$biologie)=!

3! APRES!le!stage,!la!validation!de!crédits!ECTS!nécessite!une!attestation!écrite!du!responsable!du!stage!contenant!un!descriptif! sommaire! du! travail! effectué,!une!appréciation!du! travail! de!l’étudiant3e,!et!l’indication!du!volume!réel!de!travail!investi!(dates!de!début!et!fin!de!stage!et!nombre!d’heures!total).!

Le!calcul!des!ECTS!se!fait!par!la!conseillère!aux!études!de!la!Section!sur!la!base!de!6!ECTS!pour!un!stage!d’un!mois!à!plein!temps!(160!à!180!heures).!Ces!crédits!peuvent!être!pris!en!compte!dans!les!crédits!des!cours!à!choix!libre!du!bachelor!ou!du!master!en!biologie.!

Toutefois,!la!Section!attribue&un&maximum&de&6&ECTS!par!stage,!même!si!la!durée!du!stage!se!prolonge!au3delà!d’un!mois.!

Attention!:!les!enseignants!ou!chercheurs!de!la!Section!de!biologie!ne!sont!pas!tenus!d’offrir!des!places!de!stage.!!!!

239

!STATISTICS&AND&PROBABILITY& 14B057&Compulsory&Master&course&for&option&«&BioInformatics&and&Data&Analysis&in&Biology»&and&for&Neuroscience!!Period& Autumn!

!4!(2.5)!h/week,!year!52!(33)!

ECTS& 5!(3!for!Neuroscience)!!

Day& Monday!14:15!–!18:00!(precise!schedules!for!5!and!3!ECTS!presented!druing!the!first!course)!!

Place&&

Sciences!III,!salle!1S081!et!Pavillon!Ansermet,!salle!119!

Evaluation&mode! Computer!based!written!exam!and!project!report!for!5!ECTS!(to!be!presented!in!detail!during!the!first!course)!!

Exam&sessions& JanuarySFebruary!+!catching!in!AugustSSeptember!& !Person&in&charge&!

J.!M.!NUNES!S!022.379!3683!S!Jose.deAbreuNunes@unige.ch!!

Teacher! J.!M.!NUNES!(ce).!!

Miscellaneous!Course&taught& in&English.!!This!course!presents!a!unified!view!of!common!biostatistical!methods!through!the!use!of!statistical!modelling.!!It!takes!a!practical!an!applied!approach!to!statistical!data!analysis!and!provides!a!refresher!and!an!overview!of!common!methods!used!to!analyse!biological!data.!Besides!the!statistical!theory,!the!course!is!also!an!introduction!to!the!statistical!computing!environment!R,!with!an!emphasis!on!the!exploratory!data!analysis!and!the!reproducible!research!paradigms.!!Contents&Descriptif*sous*réserve,*tous*les*détails*seront*précisés*lors*du*1er*cours!!(Subject!to!change)!–!Exploratory!data!analysis!!!!Numerical!and!graphical!data!summaries!!!!pSvalues:!Significance!and!Hypothesis!Testing!–!Basic!techniques,!from!a!modelling!point!of!view:!!!!Linear!Models:!correlation!and!regression,!analysis!of!variance!!!!Multivariate!analysis!!!!Non!Parametric!Tests!S!Extending!the!general!linear!model!!!!The!generalised!linear!model!!!!Maximum!Likelihood!Methods!!!!Survival!analysis!!!!Classification!!Objective&Upon!successful!conclusion,!the!students!are!expected!to!be!able!to!perform!and!to!comment!on!statistical!analyses!using!basic!and!intermediate!statistical!methods.!In!particular,!they!should!be!able!to!use!statistical!modelling!to!describe!and!analyse!data!sets!including!interactions!between!variables!and!models!ranging!from!simple!linear!models!to!generalised!linear!(logistic)!and!survival!analysis!models.!The!students!should!be!able!to!comment!on!the!appropriateness!of!an!experiment!and!its!statistical!analyses!from!a!technical!point!of!view!and!about!the!relevance!of!the!statistical!results!for!the!question!of!interest,!i.e.,!they!should!become!critical!users!of!statistics.!!!

240

!STATISTIQUES(APPLIQUEES( 14B951(Travaux(pratiques(Cours(à(choix(pour(l’orientation(«(Biodiversité(et(systématique(»(du(Master((Cours(à(choix(Bachelor(en(archéologie(préhistorique(«(Module!2.8!»(((Semestre((

printemps! 20h/sem,!total!20h!

ECTS((

1!

Jour((

TP!bloc!sur!deux!jours!et!demi!sur!ordinateur!personnel!Mercredi!27!mai!2020!à!13h!au!vendredi!29!mai!2020!à!17h!!

Lieu((

Conservatoire!et!Jardin!botaniques,!salle!de!séminaire!de!La!Console!!(192!rue!de!Lausanne!1202)!!

Mode(d’évaluation(!

Rapport!sur!la!base!d’exercices!donnés!en!fin!de!travaux!pratiques!

Responsable(!!

Madame!Y.!NACIRI!Q!022.418.5165!–!yamama.naciri@unige.ch!et!yamama.naciri@villeQge.ch!

Enseignant(e)s((

Madame!Y.!NACIRI!(cc).!

Divers(Nombre(d’étudiants(plafonné(à(15.((S’annoncer(à(l’enseignante(indépendamment(de(l’inscription(officielle.(Les!étudiants!sont!vivement!incités!à!proposer!leurs!jeux!de!données.!!Contenu(Analyses!univariées!(liste!non!exhaustive):!!

QTests! paramétriques! (testQT,! F,! KhiQ2,! Fmax...)! et! conditions! d’utilisation! (normalité,!homoscédasticité,!etc).!QTests!non!paramétriques!appliqués!à!différents!cas!de!figure.QAnalyses!de!variance!(simples,!hiérarchiques,!croisées)!et!conditions!d’utilisation,!méthodes!alternatives.!QRégressions!simples!et!multiples.!QAnalyses!de!fréquences.!!

Analyses!multivariées!(liste!non!exhaustive):!!

QAnalyses!en!Composantes!Principales!QAnalyse!Factorielle!des!Correspondances!QAnalyses!discriminantes!

!Objectif(Ce!module!est!orienté!vers!la!pratique.!Il!est!entièrement!bâti!sur!des!jeux!de!données!fournis!par!l’enseignante!ou!les!étudiants,!et!nécessite!que!les!participants!travaillent!sur!leur!ordinateur!personnel.!Le!but!de!ce!module!est!de!donner!aux!étudiants!les!moyens!et!les!connaissances!de!base!pour!leur!permettre!de!poser!des!hypothèses!claires!puis!de!s’aiguiller!vers!les!analyses!statistiques!univariées!et! multivariées! adaptées!à! leurs!questions,! tout!en!évitant! les! erreurs! les! plus! grossières.!Les!ressources!d’internet,!d’Excel!et!du!logiciel!R!sont!utilisées.!!!

241

!SYSTEMATIQUE*ET*ECOLOGIE*DES*LICHENS*ET*DES*BRYOPHYTES*

14B070*

*Semestre**

printemps! total!56h!

ECTS**

5!

Jour**

le!cours!aura!lieu!entre!janvier!et!juillet!en!accord!avec!les!étudiants!intéressés.(Lu9ve!:!5!journées!dont!une!d’excursion).!!!

Lieu**

Conservatoire!et!Jardin!botaniques!de!la!Ville!de!Genève!!Ch.!de!l’Impératrice!1,!1292!Chambésy/GE!!

Mode*d’évaluation*!

sous!la!forme!d’une!présentation!orale!d'un!article!dans!le!cadre!d'un!séminaire!et!d’un!rapport!final!à!rendre!après!le!cours!!

Responsables*!!

Monsieur!Ph.!CLERC!9!022.418.5128!9!philippe.clerc@unige.ch!Madame!M.!J.!PRICE!9!022.418.5148!9!michelle.price@ville9ge.ch!

Enseignant(e)s**

Monsieur!Ph.!CLERC!(cc),!Madame!M.!J.!PRICE!(pa).!

Divers*Inscription!avant!la!fin!mars!par!e9mail!:!philippe.clerc@unige.ch!!Ouvert!aux!publics.!!Contenu*Les!lichens!et!les!bryophytes!(mousses!au!sens!large)!vivent!souvent!dans!des!endroits!ou!des!régions!où! les! plantes!à! fleurs!atteignent!leurs!limites! physiologiques!et!n'exercent!que!peu!de!pression!compétitive.!Organismes!poïkilohydriques!doués!de!reviviscence,!ils!ne!sont!physiologiquement!actifs!que! lorsqu'ils!sont!hydratés,!ce! qui! leur! permet!de! survivre! à!des!conditions!environnementales!extrêmes.!D'autre!part,!ces!organismes!sont!parmi!les!premiers!à!avoir!colonisé!la!terre!ferme!et!sont!donc!d'un!intérêt!tout!particulier!pour!comprendre!l'évolution!des!plantes!terrestres.!Nous!aborderons!principalement!l’identification!des!espèces!de!lichens!et!de!bryophytes!du!bassin!lémanique.!Au!travers!de!l'observation!au!microscope,!de!séminaires,!de!lectures!et!du!terrain,!nous!nous!proposons!d'étudier!la!morphologie!et!l'écologie!de!ces!organismes.!!!Excursions*Des!excursions!dans!le!canton!introduiront!à!l'étude!sur!le!terrain,!à!la!récolte!et!à!l'identification!des!espèces!de!lichens!et!de!bryophytes.!!Objectif*Acquérir!les!connaissances!taxonomiques!nécessaires!permettant!d’identifier!et!de!placer!dans!l’arbre!de!la!vie!les!principaux!groupes!de!bryophytes!et!de!lichens.!Acquérir! les!connaissances!physiologiques!et!écologiques!nécessaires!permettant!de!comprendre!l’adaptation!et!la!réussite!des!bryophytes!et!des!lichens!dans!leurs!habitats!respectifs.!Acquérir!les!connaissances!morphologiques!et!anatomiques!nécessaires!permettant!d’identifier!les!bryophytes!et!les!lichens!les!plus!communs.!!!

242

!SYSTEME&IMMUNITAIRE&(LE)& 13B013&Cours&à&choix&restreint&de&3ème&année&&Semestre&&

automne/printemps! 2h/sem,!total!50h!

ECTS&&

6!

Jour&&

vendredi!10h30!9!12h30!

Lieu&&

CMU,!salle!D60!

Mode&d’évaluation&!

contrôle!continu!écrit!début!novembre/fin!décembre/fin!mai!!choix!des!questions!français/anglais!examen!oral!(en!juin!pour!remplacement!contrôle!continu,!en!septembre!pour!rattrapage)!!

Responsables&!!!

Mesdames!Pascale!ROUX9LOMBARD!–!022!372!94!10!pascale.roux9lombard@hcuge.ch!!

Stéphanie!HUGUES!–!022!379!58!93!9!stephanie.hugues@unige.ch!!

Enseignant(e)s&&

Mesdames,!P.!ROUX9LOMBARD!(pas),!S.!HUGUES!(pas),!!A.!SANCHEZ9MAZAS!(po),!V.!DUTOIT!(ma),!!M.9L.!SANTIAGO9RABER!(cs),!C.9A.!SIEGRIST!(po)!!Messieurs,!N.!BREMBILLA!(pd),!P.!EIGENMANN!(pas),!T.!McKEE!(pas),!!J.!BERTRAND!(pas),!W.!REITH!(po),!J.!SEEBACH!(po),!J.!VILLARD!(pas),!!P.!WALKER!(mer),!P.!LALIVE!(pas),!C.!GABAY!(po),!O.!HARTLEY!(pas),!!V.!JAQUET!(col2),!P.!JANDUS.!!

Contenu&Comment!nous!défendons9nous!contre!les!incessantes!infections!des!pathogènes!qui!nous!entourent!?!Grâce!à!notre!système!immunitaire!!!!Notre!système!immunitaire!nous!permet!en!effet!de!résister!aux!virus!et!bactéries!environnants!grâce!à!un!mode!d’action!d’une!étonnante!spécificité.!Dans!la!première!partie!du!cours,!nous!détaillerons!les!différents!composants!moléculaires!et!cellulaires!du!système!immunitaire.!Ensuite,!nous!décrirons!les!phases!d’activation!et!de!régulation!du!système!immunitaire.!Enfin,!dans!une!dernière!partie,!nous!étudierons!les!pathologies!associées!à!un!mauvais!fonctionnement!du!système!immunitaire.!Nous!verrons! ainsi! les! mécanismes! impliqués! dans! les! réactions!auto9immunes,! les! allergies! et! les!immunodéficiences.!La!transplantation!et!la!possibilité!de!réaliser!un!vaccin!contre!le!cancer!seront!également!abordées!dans!cette!partie.!!Ce!cours!est!dispensé!en!français.!!!Objectif&Connaître!les!composants!du!système!immunitaire.!Comprendre!les!mécanismes!essentiels!de!fonctionnement!physiologique!du!système!immunitaire!(au!repos,!infections,!vaccins).!Comprendre! les! conséquences!d’un! dysfonctionnement!du! système! immunitaire! au! cours! de!différentes!pathologies!(immunodéficiences,!allergie,!auto9immunité).!!!

243

!TECHNOLOGIE*PREHISTORIQUE* 14B067*Cours!obligatoire!du!bachelor*Sciences*en*archéologie*préhistorique**Semestre**

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS**

3!

Jour**

jeudi!13h15!–!15h00!

Lieu**

Sciences!II!salle!449!au!4ème!étage!

PréIrequis**

suivre!le!séminaire!14B767!Technologie!préhistorique!

Mode*d’évaluation*!

examen!oral!

Sessions*d'examens**

janvierKfévrier!+!rattrapage!aoûtKseptembre!

Responsable*!

Madame!A.!MAYOR!–!022!379!69!49!–!anne.mayor@unige.ch!

Enseignant(e)s**

Mesdames!A.!MAYOR!(mer),!K.!DOUZE!(ad.!Sc.)!Monsieur!V.!SERNEELS!(prof.!externe!Fribourg)!!

Divers*Ce!cours! est!destiné!aux!étudiants!de!biologie!et! d'archéologie!et!ouvert!aux!étudiants!d’autres!facultés.!!

A*LIEU*TOUS*LES*DEUX*ANS.*N’A*PAS*LIEU*AU*SEMESTRE*D’AUTOMNE*2019*

!Contenu*Les!approches!actualistes!et!cognitives!montrent!que!les!techniques!sont!des!éléments!de!la!culture!particulièrement!révélateurs!de!l’identité!et!de!l’histoire!des!producteurs.!Ce!cours!propose!d’aborder!de!façon!approfondie!les!techniques!et!modalités!de!fabrication!des!objets!préhistoriques.!L’accent!sera! mis! sur! les! chaînes!opératoires!dans! le! domaine!des! industries! lithiques,!céramiques!et!métalliques.! Les! référentiels! seront! tirés! tant! des! observations! ethnographiques! que! des!expérimentations.!!Objectif*L’objectif!du!cours!vise!à!donner!les!bases!théoriques!et!méthodologiques!nécessaires!pour!aborder!!le!domaine!de!la!technologie!en!archéologie!préhistorique.!!!

244

!TECHNOLOGIE*PREHISTORIQUE* 14B767*Séminaire!obligatoire!du!bachelor*Sciences*en*archéologie*préhistorique**

Semestre*

*

automne! 2h/sem,!total!28h!

ECTS*

*

3!

Jour*

*

jeudi!15h15!–!17h00!

Lieu*

*

Sciences!II!salle!449!!

PréHrequis*

*

suivre!le!cours!14B067!Technologie!préhistorique!

Mode*d’évaluation*

!Présentation!orale!et!travail!écrit!

Responsable*

!Madame!A.!MAYOR!–!022!379!69!49!–!anne.mayor@unige.ch!

Enseignant(e)s*

*

Mesdames!A.!MAYOR!(mer),!K.!DOUZE!(ad.!Sc.)!Monsieur!V.!SERNEELS!(prof.!externe!Fribourg)!!

Divers*

*

A*LIEU*TOUS*LES*DEUX*ANS.*

N'A*PAS*LIEU*AU*SEMESTRE*D’AUTOMNE*2019*

!Contenu*

Approfondissement!du!cours!par!des!exercices!pratiques,!expérimentations,!visites!de!collections!ou!labos,!et!analyse!d'articles.!!Objectif*

L'objectif!du!séminaire!vise!à!mettre!en!pratique!les!bases!données!au!cours!à!partir!de!l'observation!de!matériel!et!d'analyse!critique!d'articles.!!!!

245

UNDERSTANDING BIOLOGICAL COMPLEXITY AND DIVERSITY 14B024 Cours à choix restreint 3ème année biologie Period

Spring 2h/sem, total 28h

(20h de cours + 4h d’exercices + 4h de laboratoire)

ECTS

3

Day

Tuesday 18h15 -­ 20h / or day and time in agreement with all students

Place

Sciences III, room 4059

Evaluation mode

Oral exam

Exam sessions June + catching up August-­September

Person in charge

M. MILINKOVITCH -­ 022.379.33 38 michel.milinkovitch@unige.ch

Teachers M. MILINKOVITCH (po), E. JAHANBAKHSH (ma), S. ZAKANY (Phd),

Miscellaneous This course is given in English The number of students is limited to 12. Please, register by sending an email to: Michel.Milinkovitch@unige.ch The course is additionally open to 3rd year in biochemistry, or physics as elective course, and for master students and graduate students. Content Cells, developing embryos, the brain, colonies of organisms, ecosystems are all examples of ‘adaptive complex systems’: they each exhibit collective behaviours that go way beyond the capabilities of their isolated components. We will discuss various concepts pertaining to the emergence of order, complexity, and diversity in these biological systems: non-­linearity, chaos theory, information theory, genetic algorithms, self-­organization, swarm intelligence, modularity, etc. We will also discuss the tools used to study these concepts: mathematical modeling, numerical simulations, artificial life, etc. One session of exercises on computers (numerical simulations) and once session in the laboratory (setting up simple examples of complex systems) will be organized . Objective Realise the importance of self-­organisational processes in the emergence of biological complexity and diversity.

246

!!VULNERABILITY,OF,THE,CENTRAL,NERVOUS,SYSTEM,IN,AGING,AND,IN,NEURODEGENERATIVE,DEMENTIA,:,MOLECULAR,BASIS,

14B077,

,Period,,,

Autumn! 2h/week,!year!28h!

ECTS,,

3!

Day,,

vendredi!12h15!8!14h!

Place,,

Sciences!II,!salle!A150!

Evaluation,mode!!!

examen!écrit,!en!anglais!et!en!français,!2!heures!

PréJrequis,,

formation!de!base!en!biologie!et!biochimie!

Exam,session,,

January8February!+!August8September!

Person,in,charge,!!

Monsieur!A.!SAVIOZ!8!022.305.5310!8!armand.savioz@hcuge.ch!Département!de!Psychiatrie!

Teacher,,

Monsieur!A.!SAVIOZ!(privat!docent).!

Miscellaneous,Ce!cours!est!destiné!aux!étudiant(e)s!en!biologie,!en!biochimie!et!neurosciences!de!3ème!et!4ème!années.!!Le!cours!est!ouvert!aux!étudiants!des!autres!Facultés.!!L'enseignement!sera!dispensé!en!anglais.!The!course!will!be!taught!in!English.!!Contents,The!course!addresses!the!dysfunction!of!nerve!cells!and!neural!networks!of!the!central!nervous!system! in! aging!and! in! neurodegenerative!diseases,!such!as! vascular!dementia,!Alzheimer’s!disease,!frontotemporal!and!Lewy!body!dementia.!!Bibliographie,Chamillo! (in! English)!+!Livre:!Savioz!et!coll.!2010,!Introduction!aux!réseaux!neuronaux:!de!la!synapse!à!la!psyché,!De!Boeck,!Bruxelles.!!Objective,Acquisition!of!knowledge!in!neurobiology!of!the!central!nervous!system!and!more!particularly!in!the!neurobiology!of!aging!and!dementia.!!!!

Section de biologie

!

!

• Autres masters ouverts aux titulaires du bachelor en biologie

• Formation approfondie et formation continue

• Ecoles et programmes doctoraux

Partie VI Les formations rattachées

247

AUTRES MASTERS OUVERTS AUX TITULAIRES DU BACHELOR EN BIOLOGIE

(en plus du master en biologie)

MASTER EN ARCHEOLOGIE PREHISTORIQUE Ce master de la Faculté des sciences présente une spécificité dans le paysage universitaire suisse et européen, notamment par le caractère scientifique des enseignements qui font largement appel à des disciplines appartenant au domaine de la biologie, des sciences de la Terre et de l'environnement.

Il offre un programme d’enseignements original, mêlant cours méthodologiques et cours thématiques, portant aussi bien sur la préhistoire en général, et plus particulièrement sur celle de l'Europe, de l’Orient et de l'Afrique. Une part importante est réservée au terrain, avec l’apprentissage de la fouille archéologique. Enfin, le plan d’étude de ce master laisse aussi à l’étudiant une certaine souplesse, avec la possibilité de s’orienter vers de nombreux domaines de la préhistoire, comme la paléoanthropologie, l’archéozoologie ou l’ethnoarchéologie. Durée 4 semestres (120 crédits ECTS) au minimum et 8 au maximum

Plan d'études Le programme d’études du master en archéologie préhistorique

comporte deux axes. Un axe d’enseignements obligatoires et à choix (60 crédits ECTS) et un travail de recherche (60 crédits ECTS).

Responsables

Madame Marie BESSE – 022.379.6915 marie.besse@unige.ch Monsieur Eric HUYSECOM – 022.379.6973/67 eric.huysecom@unige.ch

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE du Master en archéologie préhistorique : http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/formations/masters/archeo/

MASTER EN SCIENCES DE L'ENVIRONNEMENT (MUSE)

Le Master en Sciences de l’Environnement (MUSE) est proposé dans le cadre de l’Institut des sciences de l’environnement (ISE) de l’Université de Genève par la Faculté des sciences, la Faculté des sciences de la société et la Faculté d’économie et de management. Cette formation universitaire a pour vocation l’enseignement et la recherche interdisciplinaires dans les domaines très actuels et porteurs de l’environnement que sont le climat, l’énergie, l’eau, la biodiversité, l’écologie humaine, l’urbanisme et la gouvernance, ou encore la santé. La volonté de bâtir des passerelles entre ces domaines est à la base du cursus MUSE qui propose aux candidats se destinant aux métiers de l’environnement ou à la formation approfondie une approche interdisciplinaire des sciences de l’environnement basée sur les sciences naturelles et les sciences économiques et sociales. Au terme du MUSE, les étudiants sont capables de traiter des problèmes environnementaux dans un contexte interdisciplinaire loin de l’approche sectorielle habituelle. Cette large compréhension des disciplines des sciences naturelles et des sciences économiques et sociales impliquées dans la gestion de l’environnement est une offre unique en Suisse.

Durée 4 semestres (max. 6 semestres) 120 crédits

Plan d'études Interdisciplinarité et immersion 16 crédits Fondamentaux 18 crédits Méthodes 8 crédits Enseignements spécialisés 27 crédits Enseignements à choix 18 crédits Travail de fin d’études 33 crédits

Renseignements Mme Catherine Cornut 022 379.07.97 -­ catherine.cornut@unige.ch (secrétariat étudiants) – UNI CARL VOGT Mme Nicole Efrancey-­Dao 022 379.08.76 -­ nicole.efrancey@unige.ch (conseillère aux études) – UNI CARL VOGT

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet du MUSE de l’UNIGE. https://www.unige.ch/muse/

248

MASTER IN NEUROSCIENCE The Master in Neuroscience is an interdisciplinary neuroscience program awarded jointly by three faculties from the University of Geneva (Sciences, Psychology and Educational Sciences and Medicine). The master program placed under the responsibility of the Geneva University Neurocenter will provide students with: a) a broad theoretical knowledge in the domain of neuroscience as well as technical skills specific to this field;; b) a research training c) an introduction to scientific communication. The master is intended for students with a bachelor degree in Sciences, Medical Sciences, Psychology or any other equivalent degree, willing to pursue a career in neuroscience through research or/and education bodies at the university or the hospital. The degree gives access to the Lemanic Doctoral School in Neuroscience as well as other advanced studies at the associated faculties (subject to the acquisition of the prerequisite of the chosen faculty). Study duration A minimum of 90 credits must be obtained for the master degree. The

minimum study duration is three semesters and the maximum is five semesters.

Language No French exam is required for the master in neuroscience admission. All the compulsory courses and half of the optional courses are given in English. A B2/C1 level in English is highly recommended.

Admission requirements

The student can be enrolled in the master if she/he fulfills two conditions: 1. The student holds a bachelor of Sciences, Medical Sciences, Psychology or any other degree considered equivalent by the faculties and the Geneva University Neurocenter committee. Information regarding the equivalence cannot be obtained before the documents submission to the student administrative center. 2. The student is accepted by a research lab for the master project before the beginning of the master. 3. The student has been selected based on the quality of his/her application.

Contact Director of the Centre: Monsieur D. JABAUDON –022.379.5387

denis.jabaudon@unige.ch Information: Madame D. JOCHAUT – 022 379.5228 delphine.jochaut@unige.ch Biologist Member of the Committee : Madame E. NAGOSHI -­ 022.379.6346 emi.nagoshi@unige.ch

For more information veuillez consulter le site internet de l’UNIGE Master in Neuroscience http://neurocenter.unige.ch/master/

249

MASTER BI-­DISCIPLINAIRE EN SCIENCES (pour l’enseignement)

Le Master bi-­disciplinaire en sciences offre la possibilité aux étudiants ayant effectué leur bachelor en mathématiques, informatique, physique, chimie, biochimie, biologie ou sciences de la terre et de l’environnement, de poursuivre leur cursus dans une autre branche d’étude (la mineure) que celle choisie lors du bachelor (la majeure). L’objectif visé est d’adapter le cursus d’études aux besoins croissants de la recherche scientifique qui touche souvent à plusieurs domaines et nécessite des compétences élargies. L’obtention du master bi-­disciplinaire en sciences donne en principe accès à l’Institut Universitaire de Formation des Enseignants du secondaire genevois (IUFE). Durée 4 semestres (max. 8 semestres) 120 crédits ECTS en fonction (ou

encore parfois) 3 semestres (max. 6 semestres) 90 crédits ECTS du plan d’études de la mineure considérée.

Plan d'études Ce cursus se déroule sur 4 semestres (120 ECTS) ou parfois 3semestres (90 ECTS), mais ce délai peut être prolongé jusqu’à 8 semestres, respectivement à 6 semestres. Le programme comprend des enseignements obligatoires, des enseignements à option, des travaux pratiques et un travail de recherche à réaliser dans la discipline majeure en tenant compte des différentes notions abordées dans la mineure.

Renseignements Directeur Xavier CHILLIER – 022.379.6715 -­ xavier.chillier@unige.ch

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE du Master Bi-­disciplinaire en Sciences. http://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/formations/masters/bi-­disciplinaire/

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FORMATION APPROFONDIE ET FORMATION CONTINUE

Les programmes universitaires de formation approfondie et de formation continue permettent de mettre à jour et d’acquérir de nouvelles connaissances, afin d’obtenir des qualifications supplémentaires. Ils ouvrent de nouvelles perspectives professionnelles ou accompagnent le développement personnel.

MASTER D’ETUDES AVANCEES (MAS) EN MICROBIOLOGIE Ce programme d’études offre une formation à caractère professionnalisant et permet d’acquérir des compétences pratiques et théoriques de haut niveau dans des domaines de la microbiologie médicale, industrielle et environnementale. Il offre l’occasion de se familiariser avec des thématiques aussi diverses que les méthodes d’isolement et d’identification des bactéries de l’environnement, les processus de fermentation, les mécanismes de résistance croisée entre métaux lourds et antibiotiques, les bases moléculaires des interactions entre humains et micro-­organismes pathogènes ou plantes et bactéries fixatrices d’azote, en étant complètement intégré à des laboratoires de recherche accrédités, ou encore d’approfondir ses connaissances, par exemple avant une thèse de doctorat. Renseignements Monsieur P-­ LINDER -­ Patrick.Linder@unige.ch – 022 379 5484

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE MAS en microbiologie http://www.unige.ch/formcont/cours/mas-­microbiologie-­2018

FORMATION CONTINUE (MAS) IN TOXICOLOGY

Provide specialist education and training in toxicological sciences and risk assessment with a focus on human toxicology, leading to a recognized academic qualification. Fulfill the educational requirements of national and international professional bodies towards registration as a toxicologist.

Renseignements Dr Marc FATHI & Dr Caroline SAMER, Department of Anesthesiology,

Pharmacology and intensive Care Faculty of Medicine/Geneva University 022.372 9947 mas-­toxicology@unige.ch

Pour plus d’information veuillez consulter le site internet de l’UNIGE MAS in Toxicology http://www.unige.ch/formcont/cours/mas-­toxicology-­2018

251

CERTIFICAT COMPLEMENTAIRE EN GEOMATIQUE Durée

2 semestres 30 crédits ECTS (18 en cours et TP, 12 en travail de recherche personnel).

Modes d’évaluation : examens (session de juin et septembre) et mémoire avec soutenance Ce certificat permet d’approfondir des connaissances de base en géomatique du point de vue théorique et pratique. Il est organisé de la manière suivante : -­ un enseignement obligatoire introductif sur les géodonnées, les sources de données et les

géotraitements (3 ECTS) ;; -­ trois enseignements méthodologiques à choisir parmi cinq proposés : télédétection et

traitement d’images ;; modélisation de bases de données spatiales ;; méthodes statistiques et géostatistiques appliquées à la géomatique ;; automatisation des géotraitements ;; infrastructures de données spatiales (3 x 3 = 9 ECTS) ;;

-­ deux enseignements spécialisés à choisir parmi dix proposés : application de la géomatique en géologie, géographie humaine, urbanisme, aménagement, gestion des risques, climatologie, énergie, géo-­énergie, écologie, hydrologie (2 x 3 = 6 ECTS) ;;

-­ un travail de mémoire -­ éventuellement réalisé dans le cadre d’un stage -­ qui fait l’objet d’une soutenance orale (12 ECTS).

Admission : sur dossier. Tout titulaire d’un bachelor ou d’un master, prioritairement de Sciences ou de Sciences de la Société, motivé à se former dans ce domaine de spécialisation, peut être candidat. Toutefois, sont considérés comme prioritaires les étudiants en cours de formation de master désireux de se donner une formation complémentaire en géomatique. Pré-­requis : les étudiants doivent avoir déjà suivi dans leur cursus un cours d’introduction aux SIG (ou cours jugé équivalent). Prestations requises : 6 examens + 1 mémoire réussis Directeur du programme : Pr Hy DAO – hy.dao@unige.ch Comité de direction (autres membres) : Pr Bernard DEBARBIEUX, Pr Andrea MOSCARIELLO, Pr Anthony LEHMANN, Pr Hy DAO

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE certificat complémentaire en géomatique https://www.unige.ch/cgeom/ CERTIFICATE IN INDUSTRIAL LIFE SCIENCES Academics from the Faculty of Science, Life Sciences employers and the Career Center of the University of Geneva (Uni-­Emploi) have put together the Certificate in Industrial Life Sciences (CILS). This Certificate aims at improving the employability of graduates who hold a university degree in Life Sciences and the program has been designed to bridge the gap between Academic and Industrial Life Sciences (ILS). The deadline for application is September 30. Online registration only: cils.unige.ch For any question/request contact : CILS@unige.ch Renseignements : Dr. Xavier CHILLIER Sciences III, office 0001 Office hours: Mondays from 5 p.m. to 6 p.m. and Tuesdays from 10 a.m. to 12, or by appointment. Tel: ++41 22 37 96715 -­ Academic-­Advisor-­Sciences@unige.ch Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet de l’UNIGE Certificate in Industrial Life Sciences See: https://www.unige.ch/sciences/fr/enseignements/cils/

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ECOLES ET PROGRAMMES DOCTORAUX

DOCTORAL PROGRAM IN ECOLOGY AND EVOLUTION Programme doctoral en Ecologie et Biologie évolutive des Universités de Berne, Fribourg, Genève, Lausanne et Neuchâtel Coordinatrice Dr Marta BELLONE

ecologie-­evolution@cuso.ch Tél. : +41 26 300 88 91

Chemin du Musée, 10 Université de Fribourg CH-­1700 Fribourg Suisse

Informations et directives sur le site internet de CUSO https://biologie.cuso.ch/ecologie-­et-­evolution/welcome/ Répondante à l’UNIGE : Madame A. Sanchez-­Mazas – 022.379.6984 alicia.sanchez-­mazas@unige.ch

PhD school in Life Sciences from the Faculty of Medicine and the Faculty of Science

A new Doctoral School in Life Sciences shared between the Faculties of Medicine and Science, launched in June 2018, will jointly award a Doctorate of Science. The doctoral school proposes six specific programs: • Biomedical Sciences • Ecology and Evolution • Genomics and Digital Health • Molecular Biosciences • Pharmaceutical Sciences • Physics of Biology

Website of the PhD school : http://lifesciencesphd.unige.ch/

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MOLECULAR BIOSCIENCES PHD COURSE 19B001 Period Autumn/Spring No of hours per week 3

No of hours per year 90 (30 weeks)

ECTS 12

Day Every Monday morning (starts at 9.15 : 2-­3 hours depending on activity) from the beginning of October to the beginning of June (students can start either in October or in March as long as they complete one full cycle).

Place

Sciences III, seminar room 3079

Evaluation • Attendance is compulsory to obtain the credits and checked through an attendance sheet.

• The course also constitutes a preparation for the qualifying exam at the end of the first year.

Person in charge

D. PICARD (po) -­ 022.379.6813 -­ didier.picard@unige.ch

Contents This course is for the students enrolled in the program "Molecular Biosciences" of the doctoral school in "Life Sciences from the Faculties of Medicine and Science". It is taught by PIs participating in the program and several external teachers. It will cover a wide range of selected topics in biology and biochemistry, in complementary skills, and will also include two sessions on the ethical conduct of science. Objectives and teaching format Teaching objectives:

• get a sense of the local scientific environment. • foster criticial scientific thinking. • criticial reading and discussion of scientific papers. • get to know available platforms and services. • learn about the ethical conduct of science.

• complement scientific knowledge with additional skills. Teaching format:

• 30 weeks of interactive teaching and sessions.

• Paper discussions (5 sessions): at the end of each block of teaching associated with a particular department, students will split up into small groups (typically 3-­5 groups of at most 5-­6 students) for a session of paper discussions. Each group will meet with one of the teachers of a department for an interactive session to discuss several papers. Within limits, students will be able to choose their teacher, but will be expected to read all assigned papers and to be prepared to present and to discuss them.

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NEUROSCIENCES LEMANIQUES

The Lemanic Neuroscience Doctoral School (LNDS) organizes student training both in theoretical and experimental aspects of neuroscience. Research projects take place at affiliated laboratories in Geneva and Lausanne. About 130 PhD students receive their training through comprehensive coursework within the LN Program and by attending seminars, journal clubs and workshops. They are also encouraged, and often sponsored, to present their research at national and international neuroscience conferences. Facilitating interaction between students and senior researchers helps the students build a network for future collaboration and employment. Our graduates have successful careers in a variety of areas including academia, teaching, research foundations, industry and scientific editing. Renseignements : Monsieur A. HOLTMAAT -­ anthony.holtmaat@unige.ch Monsieur J.-­P. HORNUNG -­ jean-­pierre.hornung@unil.ch Lieu : UNIGE, UNIL, EPFL.

Pour plus d’information, veuillez consulter le site internet Lemanic Neurosciences Doctoral School. http://www.unil.ch/ln/en/home/menuinst/ln-­doctoral-­school.html

Section de biologie

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• Index alphabétique des cours

Partie VII Les index

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

14B013 Advance studies in Systematicsà choix master & master oblig. orient. BDS

2 automne Mme Naciri Y. 113

14B701 Anthropologie biologique et culturelle -­ séminaire à choix 3 automne Mmes

& M.

Sanchez-­Mazas A. & Bordessoule Gilleron N. & Hubert Van Blyenburgh N.

114

14T015 Archéozoologie : ostéologie comparée à choix 2 printemps NN 117

14T900 Archéozoologie II Etude d'un ensemble faunique préhistorique master préhist. 3 annuel NN 116

14T010 Archéozoologie II La domestication des animaux master préhist. 3 printemps NN 115

14T014 Archéozoologie La chasse à choix 3 printemps NN 116

10A001 Astronomie générale à choix 2ème 2 automne Mme Charbonnel C. 118

14E 156 Bes mesures de la diversité à choix 3 printemps 5 jours M. Castella E. 119

12C002A Biochimie II -­ Biochimie pour biologistes 2ème 4 automne M. Roux A. 39

12C00PX Biochimie II -­ Méthodes 2ème 1 printemps M. Roux A. 40

13C008A Biochimie III à choix 4.5 automne M. Soldati T. 121

13C008P Biochimie III à choix 4.5 printemps M. Soldati T. 122

13C008A Biochimie III à choix r. 3 automne M. Soldati T. 121

13C008P Biochimie III à choix r. 3 printemps M. Soldati T. 122

13C908X Biochimie III -­ Travaux pratiques à choix r. 3 automne M. Soldati T. 120

14B005 Biodiversité : origine et évolutionà choix master & master oblig. orient. BDS

3 automne Mrs Perret M. & Montoya J. 124

14B078Biodiversité dans le temps et l'espace, des singularités de notre système solaire à l'anthropocène

à choix 3 printemps M. Alvarez N. 123

13B003 Bioéthique à choix r. 6 annuel Mmes Hurst S. & Clavien C. 125

14B007 Biogéographie à choix 3 pritnemps M. Perret M. 126

14F018 Bioinformatics for interpreting functional -­ OMICS DATA à choix 3 printemps Mme Lisacek F. 127

12B012 Bioinformatique + travaux pratiques intégrés 2ème 1.5 printemps Mme F. Lisacek 41

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

12B010 Biologie et société I : Les enjeux actuels des sciences de la vie 2ème 2.5 automne Mrs Strasser B. &

Kampourakis K. 42

12B011 Biologie et société II : Analyser les controverses scientifiques 2ème 2.5 printemps Mrs Strasser B. &

Kampourakis K. 43

11B001 Biologie fondamentale I 1ère 9.5 automne M. Martinou J.-­C. 17

11B001 Biologie fondamentale I 1ère BAP module 1.1 9.5 automne M. Martinou J.-­C. 85

11B001 Biologie fondamentale I -­ travaux pratiques intégrés 1ère automne Mme Demarsy E. 18

11B001 Biologie fondamentale I -­ travaux pratiques intégrés

1ère BAP module 1.1 automne Mme Demarsy E. 86

11B002 Biologie fondamentale II 1ère 7.5 printemps Mme Demarsy E. 19

11B002 Biologie fondamentale II & travaux pratiques intégrés 1ère printemps Mme Demarsy E. 20

11B003 Biologie fondamentale III 1ère 8 printemps M. Pauli D. 21

11B003 Biologie fondamentale III & travaux pratiques intégrés 1ère printemps M. Pauli D. 22

13B004Biologie humaine I : Diversité biologique et moléculaire des populations humaines actuelles

à choix r. 3 automne Mme Sanchez-­Mazas A. 128

13B005 Biologie humaine II : Evolution du genre humain, des origines à nos jours

à choix r. & master 3 printemps Mme Sanchez-­Mazas A. 129

13B001 Biologie moléculaire de la cellule 3ème 9 annuel M. T. Halazonetis 63

13B901 Biologie moléculaire de la cellule -­ travaux pratiques à choix restreint de 3ème année à choix r. 3 automne M. T. Halazonetis 64

12B013 Biologie végétale 2ème 3.5 printemps Mme & M.

Fitzpatrick T & S. Loubéry 44

12B013 Biologie végétale + travaux pratiques intégrés 2ème printemps Mme & M.

Demarsy E. & S. Loubéry 44

14P017 Biophotonique à choix 4 printemps M. Bonacina L. 130

11M004 Biostatistiques I 1ère 3 printemps M. Sardy S. 25

11M004 Biostatistiques I 1ère BAP module 1.1 3 printemps M. Sardy S. 88

11M904 Biostatistiques I : Applications 1ère 1 printemps Mme Poloni E. 23

11M904 Biostatistiques I : Applications 1ère BAP module 1.1 1 printemps Mme Poloni E. 87

11B800 Biostatistiques I : Répétitoire 1ère printemps Mme Poloni E. 24

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

12B015 Biostatistiques II 2ème 1.5 automne M. Nunes J. M. 45

12B015 Biostatistiques II + TP intégrés 2ème 0.5 automne M. Nunes J. M. 45

14B015 Botanique systématique et pharmaceutique à choix 4 automne M. Stauffer F. 132

14B915 Botanique systématique et pharmaceutique travaux pratiques/excursions à choix 2 printemps M. Stauffer F. 133

14B016 Botanique tropicale à choix 5 printemps M. Gautier L. 131

13T513 Camp de géologie à choix 3 printemps M. Castelltort S. 133

14B047 Cell Biology Journal Club à choix master 3 annuel M. Citi S. 134

11C101 Chimie générale 1ère 5 automne M. Chillier X. 26

11C101 Chimie générale 1ère BAP module 1.1 5 automne M. Chillier X. 89

11C901 Chimie générale -­ travaux pratiques 1ère 2 automne M. Piguet C. 27

11C103 Chimie organique 1ère 9.5 annuel M. & Mme

Lacour J. & Poblador-­Bahamonde A.

28

14T003 Civilisations préhistoriques 1ère BAP module 1.2 4 printemps Mme Besse M. 94

14B020 Classiques de la génétique moléculaire (les) Classical papers in molecular genetics à choix master 5 printemps M. Belin D. 135

14 E150 Climat change à choix 3 automne Mme Cornut C. 136

7414D Cognition comparée: aux origines de l'esprit à choix 3 printemps M. Maurer R. 137

10S010 Communication scientifique et médicale : acteurs et moyens à choix 3 printemps Mme Pellegrini B. 138

14B672 Computer Skills for Biological research : an introduction to GNU/Linux and bash scripting

à choix master & master oblig. orient. BIADB

4 automne Mrs Currat M. & Nunes J.M. 139

14CB01 Current Topics in Chemical Biology and Biochemistry à choix master 8 automne Mme Simitsek Ph. 140

14F016 Data mining for protein function prediction à choix master 5 printemps M. & Mme Bairoch A. & Lane L. 141

12B016 Développement animal 2ème 4 printemps M. Rodriguez I. 46

12 E050 Développement durable I (DDI) à choix 2ème 3 automne M. & Mme

Schilaepfer M. & Krishnakumar J. 142

12B019 Développement végétal 2ème 3 printemps M. Lopez-­Molina L. 47

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

74144 Eco-­Ethologie : Evolution phylogénetique des comportements à choix 3 automne M. Maurer R. 143

13B907 Ecologie -­ travaux pratiques à choix r. 3 printemps M. Ibelings B. 146

13B007A Ecologie I à choix r. 3 automne M. Ibelings B. 144

13B007P Ecologie II à choix r. 3 printemps M. Ibelings B. 145

14B026 Ecologie moléculaire microbienne à choix 4 printemps M. Tonolla M. 147

14 E187 Ecosystems services : A new tool for sustainable development à choix 3 automne M. Schlaepfer M. 148

14B044 Electron microscopy à choix 4 printemps 9 jours M. Bauer Ch. 149

14C003 Eléments d'endocrinologie moléculaire à choix r. 6 annuel M. & Mme

Rossier M. & De Agostini A. 150

14F001 Elements of Bioinformaticsà choix master & master oblig. orient. BIADB

5 automne M. & Mme

Bairoch A. & Blatter M.-­C. 151

14F012 Elements of proteomics and Metabolomics : Translation to human Diseases à choix master 5 printemps Mrs Sanchez J.-­C. & Rudaz

S. 152

14B028 Ethnoarchéologie master préhist. 3 automne Mme Mayor A. 154

14B728 Ethnoarchéologie -­ séminaire à choix 3 automne Mme Mayor A. 153

14B029 Ethnologie à choix 3 automne Mme Mayor A. 156

14B729 Ethnologie -­ séminaire à choix 3 automne Mme Mayor A. 155

13B002 Evolution 3ème 6 annuel Mme Sanchez-­Mazas A. 65

14B021 Exploitation des collections botaniques à choix 5 annuel Mrs Clerc Ph. & Gautier L. 157

14B642 Faune Genevoise à choix master 4 automne M. Ruedi M. 158

14B008Flore et végétation :Cartographie, analyses et indicateurs

à choix, 2ème & 3ème 2 printemps Mme Price M. 160

14B009 Flore et végétation (stage de) à choix, 2ème & 3ème

3 printemps Mme Price M. 159

14B033 Floristique : Chorologie Histoire et connaissance de la flore

à choix, 2ème & 3ème 4 printemps Mme Naciri Y. 161

12B801 Formation documentaire 2èmecertificat printemps Mme

& M. Bellier A. & Huber V. 48

14B635 Fouilles archéologiques bachelor & master préhist. 6 printemps M. Huysecom E. 162

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

13T601 Fouilles archéologiques, stage d'initiation bachelor en archéologie 6 printemps Mme Besse M. 162

12B017A Génétique -­ génétique générale + travaux pratiques intégrés 2ème 11 automne M. Pauli D. 49

12B017P Génétique -­ génétique moléculaire + travaux pratiques intégrés 2ème printemps Mrs Shore D. & Steiner F 50

12B017P Génétique -­ génétique moléculaire + travaux pratiques intégrés 2ème printemps Mme Gabus C 51

14B637 Génétique moléculaire des populations / Molecular Population Genetics

à choix master & master oblig. orient. BDS & BIADB

5 automne Mme Sanchez-­Mazas A. 166

14B637 Génétique moléculaire des populations / Molecular Population Genetics doctorat 3 automne Mme Sanchez-­Mazas A. 166

13B010 Génétique moléculaire du développement à choix r. 6 annuel M. Karch F. 164

13B909 Génétique moléculaire du développement -­ travaux pratiques à choix r. 3 automne M. Karch F. 163

14B038 Génétique moléculaire du développement et de l'évolution -­ chapitres choisis à choix master 4 annuel M. Zakany J. 165

12T408 Géomatique I à choix, 2ème & 3ème 3 automne M. Lehmann A. 167

14B030Histoire des représentations de la diversité biologique et culturelle des humains et de leurs origines

à choix 3 printemps M. Hubert Van Blyenburgh N. 168

14B640 Histologie et imagerie des tissus à choix 3 printemps M. Loubéry S. 169

14B641 Hydrobiologie microbienne -­ Ecologie microbienne et écologie alpine

à choix, 2ème & 3ème 4 printemps

5 jours M. Tonolla M. 171

14B041Hydrobiologie microbienne : Environnement naturel et construit, aspects écologiques, hygiéniques et sanitaires

à choix, 2ème & 3ème 3 printemps

3 jours M. Tonolla M. 170

14B002 Introduction à l'archéologie africaine 1ère BAP module 1.2 6 automne M. Huysecom E. 95

14B702 Introduction a l'archéologie Africaine -­ séminaire

1ère BAP module 1.2 3 automne M. Huysecom E. 172

10S003 Introduction à l'histoire et à la philosophie des Sciences à choix 6 annuel M. Lacki J. 176

12C902X Introduction à la bioinformatique pour biologistes -­ travaux pratiques à choix 1 printemps M. Soldati T. 173

14B043 Introduction à la biologie du comportement à choix, 2ème & 3ème 3 annuel M. Langaney A. 174

14B037P Introduction à la génétique à choix printemps M. Pauli D. 175

14B045 Introduction à la recherche en biologie moléculaire des végétaux

à choix master & master oblig. orient. MPS

4 annuel M. Hothorn M. 180

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

14T019 Introduction au dessin archéologie à choix 3 printemps Mme Besse M. 181

12B021 Introduction au néolithique et âge de métaux africains

2ème BAP module 2.4a 3 automne M Huysecom E. 178

12B020 Introduction au paléolithique africain 2ème BAP module 2.4a 3 automne Mme Douze K. 179

14B779 Introduction aux méthodes de recherche en digital humanities

à choix master & doctorat 3 printemps Mrs Strasser B. & Baudry J. 177

223O305 La génétique dans la pratique médicale au quatidien : du laboratoire au chevet du patient

à choix 3 automne Mrs & Mme

Blouin J.-­L. & Guipponi M. & Sloan-­Bena F. 182

223O321La génétique dans la pratique médicale de demain : de la recherche vers les nouveaux concepts de diagnostic

à choix 2 printemps Mrs & Mme

Blouin J.-­L. & Guipponi M. & Sloan-­Bena F. 183

14B017 Master course in Genetics, Development and Evolution

à choix master & master oblig. orient. GDE

9 annuel Mme & M.

Nagoshi E & Gonzalez Gaitan M. 184

11M000 Mathématiques générales 1ère 4 automne M. Sardy S. 29

223O122 Médecins et scientifiques au cinéma à choix, 2ème & 3ème 3 printemps Mrs Wenger A. & Strasser B. 185

14 E155 Menaces et conservation de la biodiversité à choix 3 printemps M. Lehmann A. 186

14T004 Méthodologie de la recherche en archéologie préhistorique

bachelor en archéologie 6 annuel Mme Steimer T. 189

14T005 Méthodologie de la recherche en archéologie préhistorique -­ travaux pratiques

bachelor en archéologie 6 annuel Mme Besse M. 187

14B068Méthodologie de la recherche en archéologie préhistorique II : cartographie, topographie et statistique

bachelor préhist lettre 6 automne M. Huysecom E. 188

14B751 Méthodologie de la recherche en biologie -­ séminaire à choix 3 printemps M. Currat M. 190

22H002 Microbiologie à choix 5 annuel M. Linder P. 195

13B911 Microbiologie générale -­ travaux pratiques à choix r. 3 printemps M. Perron K. 193

13B011 Microbiologie générale I à choix r. 3 automne M. Perron K. 191

13B014 Microbiologie générale II à choix r. 3 printemps M. Perron K. 192

14B053Microbiologie moléculaire des milieux hydriques : Détection et typage des microorganismes

à choix 3 automne M. Tonolla M. 194

14B063A Microscopy and Imaging Course à choix/master 3 automne M. Bauer Ch. 196

14B023 Milestones in Plant Molecular Genetics -­ selected Chapters à choix 4 annuel M. Hothorn M. 197

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

14X015 Modélisation et simulation de phénomènes naturels à choix r. 6 printemps M. Chopard B. 198

14B778 Molecular Biology journal club and progress reports

à choix master & doctorat 5 annuel M. Halazonetis T. 199

19B001 Molecular biosciences PhD course doctorales 12 annuel M. Picard D. 253

14B037 Molecular Plant Sciences -­ Applied Aspectsà choix master & master oblig. orient. MPS

4 automne Mme & M. Fitzpatrick T. & Ulm R. 201

14B035 Molecular Plant Sciences -­ Basic Researchà choix master & master oblig. orient. MPS

4 automne Mme & M. Fitzpatrick T. & Ulm R. 200

7312D Neurobiologie de la représentation spatiale (la) à choix master 3 printemps M. Maurer R. 203

14N12 Neurosciences : Chemical senses à choix master 3 automne M. Rodriguez I. 202

14P021 Optique et laser à choix 5 automne M. Zbinden H. 204

14T018 Paléoanthropologie I à choix 6 annuel Mme Desideri J. 205

11T007 Paléobiologie et paléontologie à choix 5 annuel Mme Martini R. 206

11T507 Paléobiologie et paléontologie -­ camp à choix 0.5 printemps 2 jours Mme Martini R. 207

11T507 Paléobiologie et paléontologie -­ camp 2ème BAP module 2.8 1 printemps

2 jours Mme Martini R. 207

11T907 Paléobiologie et paléontologie -­ travaux pratiques à choix 2 annuel Mme Martini R. 207

14B062Paléolithique et Néolithique de l'Afrique : des premiers outils à la mise en place des sociétés complexes

master préhist. 6 automne M. Huysecom E. 209

14B762Paléolithique et Néolithique de l'Afrique : des premiers outils à la mise en place des sociétés complexes -­ séminaire

à choix 3 automne M. Huysecom E. 208

14B056 Parasitologie / Parasitology à choix 3 printemps Mme Blasco-­Costa I. 210

14B650 Penser les Sciences : Nouvelles Perspectives de la Recherche à choix 3 printemps M. Strasser B. 211

14B657 Phylogénie et évolution moléculaire -­ stage doctorat 3 annuel M. Montoya J. 212

14B657 Phylogénie et évolution moléculaire / Phylogeny and moleculair evolution-­ stage

à choix master & master oblig. orient. BDS

5 annuel M. Montoya J. 212

12B014 Physiologie animale 2ème 4 automne Mme Frieden M. 52

12B914 Physiologie animale -­ histologie-­Physiologie animale -­ travaux pratiques 2ème 1.5 automne Mme Soulié P. 53

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

13B012P Physiologie végétale -­ Perception moléculaire de l’environnement chez les plantes à choix r. 3 printemps Mme Fitzpatrick T. 214

13B906 Physiologie végétale -­ travaux pratiques à choix r. 3 printemps Mme Demarsy E. 215

13B012A Physiologie végétale Perception moléculaire de l’environnement chez les plantes à choix r. 3 automne Mme Fitzpatrick T. 213

11P085/86 Physique générale B 1ère 10 annuel Mrs Bonacina L. & Giannini

E. 30

11P085/86 Physique générale B 1ère BAP

module 1.1 8 annuel Mme & M. Paruch P. & Bonacina L. 90

11P985 Physique générale B -­ travaux pratiques 1ère 2 automne Mme Tamai A. 31

11P085/86 Physique générale B -­ répétitoire 1ère annuel Mme

& M. Paruch P. & Giannini E. 31

11T903 Planète Terre I / * (Géologie générale I -­ travaux pratiques dans le plan d'étude)

1ère BAP module 1.1 2 automne M. Moscariello A. 92

11T003 Planète Terre I / *(Géologie générale I dans le plan d'études)

1ère BAP module 1.1 5 automne M. Moscariello A. 91

11T905 Planète Terre II / * (Géologie générale II -­ travaux pratiques dans le plan d'études)

1ère BAP module 1.1 2 printemps M. Chiaradia M. 98

11T005 Planète Terre II / * (Géologie générale II dans le plan d'études)

1ère BAP module 1.1 2.5 printemps M. Schaltergger 93

14B648 Plant Science Symposium and Geneva Plant Seminars à choix master 1 annuel Mme

& M. Fitzpatrick T. & Ulm R. 216

11T009 Préhistoire générale 1ère BAP module 1.2 6 annuel Mme Besse M. 98

11T909 Préhistoire générale -­ travaux pratiques 1ère BAP module 1.2 3 annuel Mme Besse M. 98

14T006 Préhistoire régionale 3ème BAP module 2.4b 6 annuel Mme Steimer T. 219

14T017 Préhistoire régionale -­ séminaire 3ème BAP module 2.4b 6 annuel M. &

Mme Pernet L. & Besse M. 217

14T016 Préhistoire régionale -­ travaux pratiques 3ème BAP module 2.4b 6 annuel Mme Besse M. 218

14B010 Principles of cellular and molecular -­ Biology Biologie cellulaire et moléculaire approfondie à choix master 8 annuel Mme Stutz F. 220

24N01 Principles of neurobiology I à choix master 3 automne M. Matter J.-­M. 221

14N11 Principles of neurobiology II à choix master 3 automne M. Huber D. 221

12X020 Programmation + TP intégrés 2ème 3.5 automne M. Falcone J.-­L. 54

14F006 Programming for bioinformatics à choix master 7 automne M. Chopard B. 222

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

14B773 Progress report in Cell Biology -­ seminar à choix master 3 annuel Mme Citi S. 223

14B048 Protohistoire de l'Afrique : de l'appartition du métal à la mise en place des grands empires à choix master 6 automne M. Huysecom E. 224

14B748Protohistoire de l'Afrique : de l'appartition du métal à la mise en place des grands empires -­ séminaire

à choix master 3 automne M. Huysecom E. 225

14T080 Ressources naturelles à choix 3 printemps M. Moritz R. 226

14B651 Sciences citoyennes : des amateurs naturalistes aux bio-­hackers

à choix, 2ème & 3ème 3 automne M. Strasser B. 228

14 E139 Sciences de l’Atmosphère à choix 3 automne M. Goyette S. 227

14B012 Scientific writing and communication à choix master 4 printemps Mme Price M. 229

13B706 Séminaire du cercle genevois d'archéologie 2ème BAP 2.4b 3 annuel M. Huysecom E. 230

14T020 Sémiologie graphique en archéologie à choix 1 automne Mme Besse M. 231

14 E142 SPACE-­Climate (CIG) à choix 3 printemps M. Giuliani G. 232

14 E075 SPACE-­Ecologie : Analyses spatiales en écologie à choix 3 printemps M. Lehmann A. 233

14 E183 SPACE-­Water : Hydological modeling with SWAT à choix 3 printemps M. Lehmann A. 234

14B667 Stage de biologie marine à choix 6 printemps M. Pawlowski J. 236

14B668 Stage de botanique et de biogeographie alpines

à choix, 2ème & 3ème 3 printemps M. Nusbaumer L. 237

14B669 Stage de botanique tropicale à choix, 2ème & 3ème 5 2

semaines M. Gautier L. 238

14B670 Stage de laboratoire bachelor & master annuel Conseillère aux études

de la Section de biologie 238

13T040 Stage en archéologie, première approche métier

bachelor en archéologie 6 4

semaines Mme Besse M. 235

14B057 Statistics and probabilityà choix master & master oblig. orient. BIADB

5 automne M. Nunes J.M. 239

14B951 Statistiques appliquées / Applied statistics travaux pratiques à choix master 1 printemps Mme Naciri Y. 240

12B018A/12B018P Systématique et biodiversité 2ème 8 annuel M. &

Mme Montoya J. & Price M. 55

12B018A/12B018P

Systématique et biodiversité+ travaux pratiques intégrés + TP intégrés 2ème 3 annuel M. &

Mme Montoya J. & Price M. 56

14B070 Systématique et écologie des lichens et des bryophytes à choix 5 printemps Mme & M.

Price M. J. & M. Clerc Ph. 241

INDEX ALPHABETIQUE DES COURS

* enseignements obligatoires de 1ère / 2ème / 3ème année /enseignements à choix / à choix restreint

N° T I T R E D U C O U R S Type * ECTS Semestres Répondant(e)s / Responsables Pages

13B013 Système immunitaire (le) à choix r. 6 annuel Mmes Roux-­Lombard P. & Hugues S. 242

14B067 Technologie préhistorique -­ cours master préhist. 3 automne Mme Mayor A. 243

14B767 Technologie préhistorique -­ séminaire master préhist. 3 automne Mme Mayor A. 244

14B024 Understanding biological complexity and diversity à choix r. 3 printemps M. Milinkovitch M. 245

14B077Vulnerability of the central nervous system in aging and in neurodegenerative dementia : molecular basis

à choix 3 automne M. Savioz A. 246