enzimas de restriccion

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 Enzimas de restricción y electroforesis

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Enzimas de restricción y

electroforesis

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Enzimas de restricción

• Son endonucleasas específicas capaces de

reconocer secuencias palindrómicas de

DNA y cortar los enlaces fosfodiéster delmaterial genético en un punto específico.

• Palindrómicas quiere decir que leen en

direcciones opuestas el mismo orden denucleótidos.

5’ G T T A A C 3’ 

3’ C A A T T G 5’ 

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Tipos de endonucleasas

• Endonucleasa Tipo I  – corta lejos de lasucuencia que reconoce, ya sea río arriba o

río abajo.• Endonucleasa Tipo II  – cortan dentro de la

secuencia que reconocen.

• Endonucleasa Tipo III  – cortan de 5-8bases antes o después de la secuencia quereconocen.

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Enzimas de restricción

• Son suceptibles a cambios en temperatura, pH, etc.

• Estas enzimas se obtienen de células bacterianas.

• El nombre de estas está dado según el género y laespecie de la bacteria de dónde se aisló por

primera vez esta enzima.

• La primera letra representa el género de labacteria, las próximas dos indican la especie, la

cuarta letra indica la cepa y el número al final

indica el número de enzima que se ha aislado de

esa cepa.

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Enzimas de restricción

• Por ejemplo:

EcoRI

• Otros ejemplos:

 –  BamHI  – la primera que se aisló de la cepa H de Bacillus amyloliquefaciens

 –  SmaI  – la primera que se aisló de Serratia marcesens 

 –  HindIII – la tercera que se aisló de la cepa d de

 Haemophilus influenzae 

Escherichia

(género)coli

(especie) cepa R

Primera enzima aislada

de ese organismo.

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Tipos de corte• “Sticky” o pegajosos – es

más fácil para volver a

ligarse los extremos.

 –  Ejms.• EcoRI

• Bam HI

• HindIII

• “Blunt” o abruptos  –  Ejm.

• SmaI

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Enzimas de restricción

• Las endonucleasas son de gran importancia

para la ingeniería genética, ya que permiten

desarrollar técnicas de clonación.

• Además, te permite realizar mapas de

restricción y determinar si existe homología

entre otras moléculas de DNA.

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Electroforesis

• Se define como elmovimiento departículas de cargabajo la influencia deun campo eléctrico através de un mediosemisólido.

• Este medio puede serde agarosa o depoliacrilamida.

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Electroforesis

• El DNA es de carganegativa, por lo quelas partículas migran

del electrodo negativo(cátodo) al electrodopositivo (ánodo).

• Esta migración es

inversamenteproporcional al pesomolecular de lasmuestras.

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Electroforesis

• Materiales necesarios para

llevar a cabo una

electroforesis:

 –  Gel de agarosa  –  generalmente se utiliza de

1% - 2% de agarosa.

 –  Cámara de electroforesis 

 – contiene los electrodos –  “Power supply”  – genera

el campo eléctrico

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Electroforesis –  Amortiguador de

electroforesis - usualmenteTBE 1X; facilita la

migración de DNA ymantiene una estabilidad

 –  Bromuro de etidio  –  compuesto carcinógeno quese entrecruza entre lasmoléculas de DNA y cuandose irradia con luz ultravioletaemite fluorescencia.

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Electroforesis

 –  “Loading dye”  – compuesto

que se añade a las muestras de

DNA; contiene glicerol, que le

da peso a la muestra y nopermite que se salgan de la fosa,

y bromofenol azul que tiñe la

muestra de color azul y sirve

como indicador de migración

 –  Lámpara de UV  – permite ver

las bandas generadas

 –  Cámara  – para tomar una foto

de la gel

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