BIOTECNOLOGIE FARMACOLOGICHE 2010-11 LEZIONE 14
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BIOTECNOLOGIE FARMACOLOGICHE 2010-11 LEZIONE 14 CORSO DI LAUREA SPECIALISTICA IN BIOTECNOLOGIE DEL FARMACO Adriana Maggi
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CORSO DI LAUREA SPECIALISTICA IN BIOTECNOLOGIE DEL FARMACO Adriana Maggi. BIOTECNOLOGIE FARMACOLOGICHE 2010-11 LEZIONE 14. +/-. +/-. ERE 2x. INSULATOR ( MAR ). firefly luciferase. INSULATOR ( MAR ). TK. light. luciferin + ATP = oxyluciferin + AMP +. ERE-Luc reporter mouse. - PowerPoint PPT Presentation
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BIOTECNOLOGIE FARMACOLOGICHE2010-11
LEZIONE 14
CORSO DI LAUREA SPECIALISTICA IN BIOTECNOLOGIE DEL FARMACO
Adriana Maggi
INSULATOR( MAR )
INSULATOR
( MAR )
lightluciferin + ATP = oxyluciferin + AMP +
TKERE 2x
firefly luciferase
+/- +/-
ERE-Luc reporter mouse
The ERE-Luc reporter mouse: a model to study of ER transcriptional activity
Ciana et al., 2001ERE
kinase-dependent activation
ERE-Luc mouse bone
0
2
4
6
thymus
01234
brain
05
101520
P E M D2
intestine
048
1216
bone
0
2
4
6
thymus
01234
brain
05
101520
LUCI
FERA
SE A
CTIV
ITY
(RLU
)
P E D
intestine
048
1216
liver
0
10
20
P E M D2
ovaries
0
2
4
uterus
13579
0
6
12
liver
0
10
20
P E D2P E D
ovaries
0
2
4
uterus
13579
0
6
12 hypothalamus
M D P E
Estr
adio
l(pg/m
l)
1020
30
40
50
day 1 day 2 day3 day 4
SESTRUS
E2 (
pg/m
l)
1020304050
M D P E
Luciferase activity in adult, cycling females
Ciana et al, Nature Ned., 2003
THE COMPLEXITY OFESTROGEN ACTION
ERE
G-protein,
IP3K...
SP1NFKBAP1
THE COMPLEXITY OF ESTROGEN TARGETS
• REPRODUCTIVE SYSTEM- male and female gonads- hypothalamus and pituitary
• SKELETAL SYSTEM• VASCULAR SYSTEM
- endothelium- smooth muscle cells
• RESPIRATORY SYSTEM• IMMUNE SYSTEM• NERVOUS SYSTEM
- central- peripheral
CNS
cardiovascular
reproductive
bone
ERE
SP1NFKBAP1
tissue-specificcoregulators
growthfactors P
ER COMPLEXITY OF ACTION and A NEW CLASS OF DRUGS: Selective Estrogen Recepor Modulators
ESTROGEN REPLACEMENT THERAPY
The efficacy of SERMs on estrogen receptor transcriptional activity was measured in a model
of surgical menopause (ovx mice)
SERMs ability to replace the natural hormone was evaluated by comparison with ER activity in
healthy, cycling mice
Reproductive organs(mammari glands and vagina)
Muscle-Skeletal System
Hepatic area
Measuring bioluminscence in the ERE-Luc reporter mouse
Thymic area
Intestine
Bioluminescence after6h treatment with
15b-estradiol (50ug/kg)
pellet days of treatment
CONTROLS
REFERENCE DRUG
DRUG OF INTEREST
Manual
In vivo analysis of photon emission
Automatic
Rando et al. 2009
REPORTER MICE TO STUDY DRUG ACTION “IN VIVO”
0
5
10
15
20 UTERUS
RLU
0
500000
1000000
1500000
2000000
AUC
VAGINA
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 2110000
40000
70000
100000
VAGINA
Days
Phot
on e
miss
ion
p/s/
cm2/
sr
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 210
100000
200000
300000
400000
CHEST
Days
Phot
on
emis
sion
p/
s/cm
2/sr
0
2000000
4000000
6000000
8000000
AUC
CHEST
0
100
200
300
400
500 LIVERRL
U
VehiclePCUD 3mg/kgBZA 10mg/kgBZA 10mg/kg + PCUD 3mg/kgRaloxifene 10mg/kg
Luciferase enzymatic activityPhoton emission
Biserni et al, in preparation
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 2110000
40000
70000
100000
REPRODUCTIVE AREA
Days
Phot
on e
mis
sion
p/
s/cm
2/sr
0
500000
1000000
1500000
2000000
AUC
°**
VehiclePCUD 3mg/kgBZA 10mg/kgBZA 10mg/kg + PCUD 3mg/kgRaloxifene 10mg/kg
Effects of SERMs on ER activity – in vivo imaging
CHRONIC treatment (21 days)
Biserni et al, in preparation
Effects of SERMs on ER activity – in vivo imaging
CHRONIC treatment (21 days)
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 2120000
40000
60000
80000
100000TAIL
Days
Phot
on e
mis
sion
p/
s/cm
2/sr
0
500000
1000000
1500000
2000000
AUC
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 2120000
40000
60000
80000
100000
LIMBS
Days
Phot
on e
mis
sion
p/
s/cm
2/sr
0
500000
1000000
1500000
2000000
AUC
VehiclePCUD 3mg/kgBZA 10mg/kgBZA 10mg/kg + PCUD 3mg/kgRaloxifene 10mg/kg
Biserni et al, in preparation
limb
0
100
200
300
400
500
AUC
tail
0
50
100
150
200
250
AUC
limb
0
50
100
150
200
250
cts/
cm2 s (v
s cy
c=10
0%)
tail
0
50
100
150
200300400500600
cts/
cm2 s (v
s cy
c=10
0%)
LIMB TAIL
ACUTE
CHRONIC
ovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAMovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAM
Rando et al, Mol. Endocrinol. 2010
hepatic
0
100
200
300
500150025003500
AUC
abdomen
0
50
100
150
200
250
AUC
hepatic
0
100
200
300
400500
100015002000
cts/
cm2 s (v
s cy
c=10
0%)
abdomen
0
50
100
150
200
250
cts/
cm2 s (v
s cy
c=10
0%)
HEPATIC AREA ABDOMENACUTE
CHRONIC
ovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAMovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAM
Rando et al, Mol. Endocrinol. 2010
SERCHING FOR NOVEL MODALITIES TO MEASURE THE EFFICACY OF SERMs
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 210
100000
200000
300000
400000
CHEST
Days
Phot
on e
mis
sion
p/
s/cm
2/sr
AUC
N° peaks, amplitude, frequency
0
3
6
9
12
0
2
4
6
8
0
3
6
9
12
0
2
4
6
8
Peak
s/21
dPe
riod
(d)
GENITAL AREA SKELETAL AREA
***
*
*
* ****
2
3
4
5
6
2
3
4
5
6
Ampl
itude
0
50
100
150
200
250
0
100
200
300400600800
**
* ***
050
100150200300450600
0
50
100
150
200
***
*
**
D
A
B
C
E
AUC
Pote
ncy
ovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAMovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAMRando et al, Mol. Endocrinol. 2010
PHENETICS OF DRUG ACTION
THE APPLICATION OF AGGLOMERATIVE HIERARCHICAL CLUSTERING
(AGGLOMERATIVE NESTING version 1.02 )
2
4
6
8
0.1
1
10
100
1000
10
100
1000
10000**p<0.01
0 2 4 6 81
10
100
2 4 6 8 0.1 1 10 100
**p<0.01
10 100 1000 10000
**p<0.01
peak number period amplitude AUC
perio
dam
plitu
deAU
Cpo
tenc
y
a
period 0.04
amplitude 0.05 <0.01
AUC 0.03 0.05 0.96
potency 0.10 0.05 0.76 0.46
peaks number period amplitude AUC
b
DEGREE OF FUNCTIONAL CORRELATION AMONG THE PARAMETERS SELECTED
Rando et al, Mol. Endocrinol. 2010
Space-temporal analysis of drug action in living animals
clustering data to generate novel families of compounds
Genital area
Skeletal area
ovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAMovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAMRando et al, Mol. Endocrinol. 2010
Genital area
Skeletal area
Reverse Medicinal ChemistryA
B
C
Cl
ovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAMovx cyc E2 CE CE+BZA BZA RAL10RAL2 LAS OSP TAM
Rando et al, Mol. Endocrinol. 2010
…IL MEDICO ADOPRERA’ BENELE MEDICINE QUANDO LUI CONOSCERA’CHE COSA E’ OMO,CHE COSA E’ VITA E COMPLESSIONE, CHE COSA E’ SANITA’…
ERE-Luc mouse
P118.516.514.513.512.5dpc (day post conception) post-natal
day 1
endoderm mesoderm ectodermimaging IHC
A B C D
E
F
G
H
C – intestine 20xD – bone 40xE – heart 40xF – forebrain 10xG – moustache 40x H – skin 20x
16.5 dpc 16.5 dpc
GP Rando, 2007
18.516.514.513.5 15.5
ERE-Luc mouse
ER is transcriptionally active at day 14.5 pc
dpc (day post conception)
Suckling Mice
Pregnancy &
EmbryoDevelopment
13.5
14.5
15.5
16.5
17.5
18.5
19.5
12.5
DAY 18.5
DAY 16.5
DAY 13.5
DAY 14.5
DAY 15.5
DAY 1
DAY 10
Immature Mice
Adult Mice
LIFE
CYCLE
ERE-Luc mice to understand ER involvement in mammals physiopathology
“The whole is more than the sum of its parts “Aristotle (384 BC – 322 BC)Methapysics
The real impact of molecular engineering on drug discovery
MODERN PHARMACOLOGY NEEDS TO REVISIT ANIMAL
MODELS
FARMACI BIOTECNOLOGICI
PROTEINE TERAPEUTICHE DI PRIMA E SECONDA GENERAZIONE
ACIDI NUCLEICI per la regolazione della espressione di specifici geni
VANTAGGI NELL’UTILIZZO DI FARMACI
ANTI-ACIDI NUCLEICI
BERSAGLIO MOLECOLARE PIU’ DEFINITONumero di proteine intracellulari: 1000-100000
Numero di RNA: 100-10000
Numero di geni: 1-2
AZIONE MOLTO SPECIFICABersagli possono essere sequenze anche uniche nel genomaUtilizzando interazioni con altri nucleotidi si possono sfruttare i vantaggi della complementarità tra due catene secondo il modello di Watson e Crick
ESPRESSIONE GENICA IN EUCARIOTE: SEQUENZA DI EVENTI
3’ TRASCRIZIONE
MODIFICAZ.TP
TRADUZIONE
RNA, trascritto primario
Capping e poliadenilazione
Splicing o maturazione
Fuoriuscita dal nucleo
riconoscimento da parte dei ribosomi
traduzione
Modificazioni post-traduzionali
La rilevanza dei processi di regolazione della espressione genica
nel disegno di nuovi farmaci
L’omeostasi cellulare è mantenuta da un efficiente controllo della trascrizione genica che viene assicurato da un complesso circuito molecolare che utilizza fattori di trascrizione individali, l’apparato basale di trascrizione e i complessi multiproteici coregolatori della trascrizione.
La cromatina ha un ruolo fondamentale nella reglazione della espressione genica e la capacità degli istoni di legare il DNA è regolata da enzimi intranucleari che possono apportare modificazioni post-traduzionali soprattutto ai residui di lisina e arginina posti nel dominio N-terminale delle proteine istoniche
Modificazioni degli istoni: acetilazione, fosforilazione, metilazione, ubiquitinazione
MODIFICAZIONI POST-TRADUZIONALI DEGLI ISTONI
Zhang Y , Reinberg D Genes Dev. 2001;15:2343-2360
La metilazione degli istoni aumenta lo stato di idrofobicità e la basicità delle porzioni N terminali degli istoni: questo ne aumenta l’affinità per proteine specifiche e fattori di trascrizione.
Le metilasi necessitano di cofattori: es. la s-adenosilmetionina
Generalmente la metilazione degli istoni si associa a repressione della espressione genica, tuttavia ci sono esempi in cui la metilazione si associa a attivazione della espressione genica (metilazione lella lisina 4 dell’istone 3, il coattivatore CARM1 è una metiltransferasi)
Metilazione degli istoni
PROCESSI DI ACETILAZIONE E DEACETILAZIONE SONO IMPORTANTINELLA REGOLAZIONE DELLA ATTIVITA’ DELLA CROMATINA
ESPRESSIONE GENICA E’ GENERALMENTE ASSOCIATA CON ACETILAZIONE
