Application of the 3D Slicer software in the Study of theBrain’s Ventricular System

Miguel Gonzalo Domínguez

Existen varios tipos de programas que permiten la edición de imágenes médicas

• OsiriX• Amira• Analyze• FreeSurfer • Siena• FIRST• BrainMagix• CIVET• TOADS• 3D Slicer…..

3D Slicer

Elegimos el 3d Slicer por su interfaz intuitiva y a que presenta un perfil de trabajoamplio que se ajustaba con facilidad a su empleo con el sistema ventricular.Permite además una fácil correlación de las imágenes reconstruidas con las Imágenes de referencia en los diferentes planos utilizados.

3D Slicer• Software gratuito de código abierto• Instalable en los tres sistemas operativos mayoritarios: Windows, Linux y Mac.• A diferencia de otros programas de libre distribución incorpora un conversor

de imágenes DICOM, que permite trabajar directamente con este formato.• Compatible con la mayoría de equipos de RM

PHILIPS:• Achieva 2.1.3.6• Achieva 2.5.3.0• Achieva 2.5.3.3• Achieva 2.6.1.0• Achieva 2.6.3.4• Intera 2.1.3.6• Intera 2.6.3.5

Siemens:

• Trio B13• Trio B15• Trio B17• Verio B15VGE• Signa HDx14.0• Signa HDxt 15.0• DVMR 20.0M4• DVMR 20.1

3D slicer• Visualizar, editar y trasformar volúmenes de imágenes

para la obtención de todo tipo de reconstrucciones, desde la reconstrucciones sencillas multiplanares hasta la obtención de procesos tan complejos como la tractografía, la reconstrucciones de superficie o la combinación de varios tipos de resultados.

• Permite implementar Plug-ins de acceso libre que realizan tareas específicas orientadas a diferentes tipos de resultados.

Objetivos

• Extender el software 3D Slicer para realizar una descripción morfológica y volumétrica del sistema ventricular cerebral.

• Conocer las diferentes posibilidad que puede aportar al estudio de este campo.

Metodología• Software: 3D Slicer 4.4.0.• Pacientes incluidos: 452; 279 mujeres y 173 hombres

1. Equipo de RM Signa Excite de 1,5 Tesla General Electrics instalado en el complejo Asistencial de Zamora.

2. Equipo de RM Achieva 3.0T XT de 3 Tesla Philips perteneciente al Hospital Clínico Universitario de Valladolid.

3D FIESTA, 3D T2 FLAIR Y T1 3D FSPGR

Segmentación

• Manual• Automática.

Segmentación manual

1. Efecto Pincel2. Efecto Dibujo3. Efecto “varita mágica”4. Seguimiento de Nivel5. Selección rectangular6. Selección de Isla7. Inversión de Isla8. Eliminación de la Isla9. Guardar Isla10. Efecto de erosión11. Efecto de dilatación12. Ajuste de ventana

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Segmentación manual con pincel

Segmentacion manual con selección de ventana de intensidad de señal

Segmentación automática

Fast GrowCut effect

Resultados

Discusión

• FUTURO ==> Más innovaciones en la visualización y el procesado de imágenes no dependientes de plataformas o sistemas operativos.

Desarrollo de nuevos equipos de adquisición de imagen de alta definición.

Desarrollo de hardware de visualización y de trabajo.

Desarrollo de software que se ajuste a los avances que se van desarrollando.

Conclusiones• El desarrollo tridimensional del sistema ventricular ofrece un visualización

más realista, lo que lo transforma en una poderosa herramienta para la interpretación del mismo, muy superior a las representaciones 2D.

• Útil en la correlación radiopatológica, en la planificación de abordajes y en el establecimiento de las relaciones topográficas.