Afghanistan Polio Eradication Initiative Surveillance Update Week 29 ( Ending on Saturday 19 July...

Afghanistan Polio Eradication Initiative

Surveillance Update Week 29

(Ending on Saturday 19 July 2008)

National Surveillance Office

July 22, 2008

AFP Case Classification Afghanistan 2008

Data up to 19 July 08

Year 2008

Reported AFP cases 754

Confirmed 11

Compatible 0

Discarded 668

Pending 75*

*58 AFP cases pending lab results

12 Inadequate AFP cases pending 60 days follow up

05 AFP cases pending ERC

$

$

$

$

# #

#

#

## #

%

%

$$ $

$$ $

$

$ $$

$

##

#

## #

Recent NSL1 from, Trinkot District of Uruzgan Province, onset is 24 Jun, age 18m, 0 OPV doses

Recent NSL3 from, Jalalabad District of Nangarghar Province, onset is 14 May, age 08m, 10 OPV doses

NSL1=07NSL3=04Comp=0

2008

Confirmed Polio cases & Compatibles Afghanistan 06-08

NSL1NSL3Compatible

$

$

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

# #

#

#

#

#

#

###

#

%% %

%

%

%

%

2006



2007


$

$

$

$

# #

#

#

## #

$

$$

$

$

$

$$

$$

$

##

##

##

2007

NSL1=06

NSL3=11

$$

#

#

####

### ####

###

###

##

##

#

##

# ###

$

$

#

#

$$$$$

$$ $

$$ $

$$$$

$

$

$

####

#######

##

###

####

#

#

### #

######

#

#

##

#

######

##

2004

NSL1= 2

NSL3= 2

NSL1

NSL3

1999

NSL1= 45

NSL3= 18

P1 & P3 Poliovirus Isolates Afghanistan 1999, 04, 06-08

2006

NSL1=29

NSL3= 2

NSL1=07

NSL3=04


2008

Afghanistan & Pakistan P1 isolatesby genetic cluster Jan to June 08


Cluster A-3D

01 Jan 08 Nawabsha

25 Feb Shikarpoor

06 Apr Nferoz

09 Apr Jacobabad

Cluster B-4A

14 May Kohat03 June Maywand

28 May Ghorak

Unclassified

24 June Trinkot

03 July Swat

Cluster A-3A

10 Feb Balab uluk07 Mar Maywand

12 Jan Nadi Ali

20 Jan Nadali

05 April Mir pur khas

25 Jan Haidrabad

01 April Khinorth

23 Apr Dadu

12 May Sanghar14 May Khisite30 May Kabdullah04 Jun Pishin

Afghanistan & Pakistan P3 isolatesby genetic cluster Jan to June 08

Cluster B-1C

Data up 19 July 08

09 Feb Maywand

15 Apr Balabuluk

15 Apr Shah Wali Kot

27 Apr Nowshera

14 May Jalalabad

14 May Nowshera

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10Ja

nF

ebM

arA

prM

ayJu

nJu

lA

ug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

No

of c

ases

Polio Virus Isolates By Type & Month, Afghanistan 05-08

2005

tOPV mOPV1 mOPV3 sNID NID

2006 2007 2008

Short interval additional dose

NSL1

NSL3 Data up to 19 July 08

List Of Confirmed Polio Cases Afghanistan 2008

Data up to 19 July 08*Confirmed by contact

No Epid Province District Donset Prop Fever Asym Sex Age Routine SIAsDlast OPV

Dstool 1 Dstool2 Hcase LabR Cluster

1 AFG/08/08/001 HILMAND NAD ALI 12-01-08 Y Y N M 28 0 3 28-10-07 15-01-08 16-01-08 YES NSL1 A3A

2 AFG/08/08/005 HILMAND NAD ALI 20-01-08 Y Y N M 11 0 1 20-09-07 25-01-08 26-01-08 No NSL1 A-3A

3 AFG/08/08/012 KANDAHAR MAYWAND 09-02-08 Y Y Y M 84 0 15 No date 14-02-08 15-02-08 No NSL3 B1C

4 AFG/03/08/012 FARAH BALABULUK 10-02-08 Y Y N F 26 0 2 22-04-07 20-02-08 21-02-08 No NSL1 A3A

5 AFG/08/08/027 KANDAHAR MAYWAND 07-03-08 Y Y Y M 14 5 12 09-03-08 13-03-08 14-03-08 YES NSL1 A3A

6 AFG/03/08/041 FARAH BALABULUK 15-04-08 Y Y Y F 16 0 12 13-04-08 18-04-08 19-04-08 YES NSL3 B1C

7 AFG/08/08/045* KANDAHAR SHAHWALIKOT 25-04-08 Y Y N M 12 0 0 No date 30-04-08 Died No NSL3 B1C

8 AFG/06/08/070 NANGARHAR JALALABAD 14-05-08 Y Y N M 8 4 6 15-05-08 16-05-08 Died No NSL3 B1C

9 AFG/08/08/063 KANDAHAR GHORAK 28-05-08 Y Y Y M 30 0 0 No date 01-06-08 02-06-08 YES NSL1 PEND

10 AFG/08/08/071 KANDAHAR MAYWAND 03-06-08 Y Y N F 66 0 5 No date 10-06-08 14-06-08 No NSL1 PEND

11 AFG/08/08/081 UROZGAN TARINKOT 24-06-08 Y Y Y M 18 0 0 No date 01-07-08 02-07-08 YES NSL1 PEND

Regional Reference Lab Update Afghanistan-2008


Month of onset Cases

Cases under process Negative

casesNPEV positive (excl PV/NPEV)

NPEV %Within 28

days

Positive cases

Culture ITD Wild (incl W/V)Vaccine (excl

W/V)Jan 97 0 0 79 10 10% 100% 2 7Feb 112 0 0 88 14 13% 100% 2 8Mar 115 0 0 74 14 12% 100% 1 26Apr 125 0 0 83 30 24% 100% 1 14May 132 0 0 83 41 31% 100% 2 7Jun

37 1 0 28 7 19% 97% 1 0Week 1

Jun26 0 0 18 8 31% 100% 0 0

Week 2Jun

31 0 0 20 11 35% 100% 0 0Week 3

Jun44 7 1 23 11 25% 84% 1 1

Week 4Jun total 138 8 1 89 37 27% 94% 2 1

Jul29 24 0 4 1 3% 17% 0 0

Week 1Jul

6 6 - - - - - - -Week 2Jul total 35 30 0 4 1 3% 14% 0 0

Total AFP cases 754 38 1 500 147 19% 95% 10 63 (8.35%)

Contacts 403 27 0 263 83 21% 93% 3* 27 (6.69%)

* Index case as well as its 2 Contacts are NSL3 – AFG/03/08/041

Index case is EV & its one contact is NSL1 - AFG/08/08/045)

AFP Cases Pending ERC, Afghanistan 2008


EPID DONSET District Province Sex Age DosesDstool2 (or 1)

Asym Progress FeverLab

result60d follow-up result

AFG/01/08/095 13-04-08 TALUQAN TAKHAR M 132 7 04-06-08 YES YES YES NVI RES WEAK

AFG/08/08/047 17-04-08 QALAT ZABUL M 48 14 06-05-08 YES YES YES NVI RES WEAK

AFG/02/08/077 20-04-08 BILCHIRAGH FARYAB F 144 2 12-06-08 NO YES YES NVI RES WEAK

AFG/06/08/082 28-04-08 SHINWAR NANGARHAR M 36 16 12-06-08 YES YES YES EV RES WEAK

AFG/08/08/080 27-06-08 ARGHANDAB ZABUL F 6 1 28-06-08 NO YES YES EV DIED

AFP Cases Pending Classification >90 days, Afghanistan 2008


EPID DONSET District Province Sex Age DosesDstool2 (or 1)

Asym Prog FeverLab

result

Days since onset

Reason for not being classified

AFG/01/08/095 13-04-08 TALUQAN TAKHAR M 132 7 04-06-08 YES YES YES NVI 98 PEND ERC

AFG/01/08/084 14-04-08 ARCHI KUNDUZ M 84 20 15-05-08 NO YES YES EV 97 PEND FUP

AFG/08/08/047 17-04-08 QALAT ZABUL M 48 14 06-05-08 YES YES YES NVI 94 PEND ERC

AFG/02/08/077 20-04-08 BILCHIRAGH FARYAB F 144 2 12-06-08 NO YES YES NVI 91 PEND ERC

AFP Cases Labeled As Hot & Pending in Lab, Afghanistan 2008

Hot by criteria=AFP cases have (Fever + rapid progress+ Asymmetric paralysis + Age <48 month)

* UP= Under Process in the Lab Data up to 19 July 08

^ Pending contacts lab result

Lab No

EPID DONSET District Province Sex Age DosesDate of last

OPVDstool2 (or 1)

Hot by field

Hot by criteria

Lab result

1130 AFG/03/08/087 05-07-08 INJIL HIRAT F 24 10 13-04-08 08-07-08 YES YES UP

1153 AFG/08/08/087 03-07-08SPIN

BOLDAKKANDAHAR F 10 2 29-06-08 15-07-08 NO YES UP

981 AFG/01/08/111 18-06-08IMAM SAHIB

KUNDUZ F 48 16 13-04-08 21-06-08 YES NO UP^

Reported AFP Cases, Comparison By Month, Afghanistan 06-08

@ of 2/100,0000 <15 year

@ of 1/100,0000 <15 year

0102030405060708090

100110120130140

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

gS

ep Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

gS

ep Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

gS

ep Oct

Nov

Dec

Nu

mb

er o

f ca

ses

2006 2007 2008


AFP Cases By Week Of Onset Afghanistan 2008

Week (Sun-Sat)

Expected 2= Two cases/100,000 <15 yrs Good AFP= GBS or T. Myelitis, T. Neuritis


Region

AFP Cases 2008Week Number

18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29Exp

ect “2”

Rep

orted

Good

AF

P

03-May

10-May

17-May

24-May

31-May

07-Jun

14-Jun

21-Jun

28-Jun

05-Jul

12-Jul

19-Jul

Badakhshan 10 21 4 1 0 1 1 1 2 0 1 0 0 1 0

Central 62 175 65 6 7 9 9 7 8 8 6 14 6 1 0

Eastern 29 105 34 4 5 9 3 5 3 3 4 3 6 4 0

Kunduz 38 133 39 5 2 3 5 4 5 6 11 7 6 1 0

Northern 46 96 27 3 2 2 3 2 5 4 4 2 7 0 0

South East 34 49 16 4 2 2 0 3 1 1 0 1 1 3 0

Southern 57 87 29 0 7 5 2 3 9 1 2 5 4 0 0

Western 54 88 37 5 7 3 6 1 4 3 2 2 1 1 0

Afghanistan 329 754 251 28 32 34 29 26 36 26 30 34 31 11 0

Population Density Map Afghanistan 2008

#

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

##

## ##

##

#

#

###

##

##

##

##

##

#

#

##

##

#

##

##

#

##

###

#

#

###

#

#

## #

#

#

##

##

#

#

#

#

##

## #

#

###

# #

##

#

####

#

#

##

#

#### #

# # ###

#

##

#

#

#

#

##

###

###

#

# #

#

#

#

##

###

##

# #

## ##

###

#

#

#

##

#

##

#

#

## ##

#

##

#

#

## #

###

#

##

###

# ## ##

####

#

#

##

#

##

#

###

##

# ###

#

#

##

#

#

#

#

#

#

#

#

#

#

#

#

####

## ##

## ##

#

#

#

###

##

#

###

### ###

##

##

#

###

#

#

#

#

##

##

#

###

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

########

#

#

##

#

#

#

#

##

#

##

####

## #

# ### #

#

#

#

###

#

##

##

#

# #

## ##

##

#

##

##########

#

#####

#

##

#

###

#

###

# ####

## ##

#

####

#

#

#

#

##

#

#

#

##

##

##

#

##

##

#

#

#

#

##

#

#

###

#

#

#

#

#

##

###

#

#

#

###

#

####

#

###

## #### ##

#

#

####

####

##

###

# #### ##

## #

#

###

####

### ##

#

#

########

##

# ## #

#

##

####

##

############################

#####################

##############################################################################

###########################################################################################################################

################

#################################################

######################################

###################################################################

#############

#######################

#################################

#####################################################################################################

#############

###################################

####################################################################################################################

##

#

#

##

### #

##

#

##

##

#

# #

#

##

#

#

#

#

##

#

### #

#

#

#

#

###

##

## #

## ###

#

##

##

#

#

#

#

##

# #

#

#

##

#

#

##

##

# ####

#

#

##

## #

#

##

#

##

##

##

##

#

#

##

##

#

## ###

# ###

#

# ###

##

#

#

#

#

#

##

#

#

#

#

##

##

##

#

##

#

#

#

# #

### #

#

#

## #

##

#

#######

#

##

# #

##

# #

#

##

#

##

#

## ###

# ### #### ### ###

##

#

###

##

#### ##

###

#

##

#

# #

##

##

# ##

##

## #

##

##

#

#

## ### ##

##

##

####

# ##

#

# #

#

# #

#

#

#

##

#

##

#

#

#

#

##

#

#

##

# ##

##

#

#

#

#

##

#

##

#

##

# ##

#

##

# ###

#

# ###

# # ###

#

##

###

# #

#

#

##

#

##

#

##

###

#

#

#

#

#

#

##

##

##

#

#

#####

###

###

#

#

###

#

##

#

####

#

#

# #

##

##

##### ###

# ####

#

#

# ## ##

#

## #

#

#

#

#

#

##

#

##

##

#

####

##

##

#

#

#

#

####

###

#

#

#

##

# ##

#

###

#

##

## ##

#

### #

#

##

######

### ## ############

### #

########

#####

#

#

#

# ######

####

#####

####

## ####### ##

######

# ##

#### #### ##### ###### ## ## #### ####

#### ####

# ##########

# ########### ########

#######

#######

###############

########### # ##

#

##

#

#

### ##

#

#

# ###

#

#

#

## ## ####

###### ###

# ##########

# ####### ## #### #

########

# ## #### ## #### #

##

#

#

#

####

###

####

#

#

#### ##

#

##

# ##

#

###

#

#

#

#

#

###

#

#

##

## ######

##

##

##### ##

# ######### ###

#####

###

# ##### #####

##

####

####

###

##

######

##########

###

#######

#########

###

##

##

####

## ####

##

######

##

####

#######

###########

####

###

###

####

##

### #

##

# #

#

# ###

#

#

##

#

#

#

## #####

# ##### ##### ##

##

###

# ## #####

#

## ## #

##

#

##

##

###

####

## ### ##

###

####### ############ ##

###### ############### ##### ## ######### ###

##### ###### ######

######

#######

## ##### ###### ######### ###########

##### #

###

### #### ##

### ##

# ## ###

####

#

###

#

## #

#

####

## ##

##

# ##### #### #### ######## ##### #

###

#####

#

### #####

################################################################################### ####################

###

#

#

#

#####

##

#

######

##

#####

#

##

##

##

#

##

### ##

####

######

###

###

#

########

####

#########################################################################

#

#

##

# #####

# ##

# ### ### ## ### ###

#

##

###### ## ####

#

# #

#

#

# #

##

## ##

###

## # #

# #

#

# ###

## ## ### #

## #

#

# ####

##

# ### #

#

##### #

### ### #

#########

##

#

##

###

####

###

##

#

####

#

#

##

##

#

##

#

### #

#

#

#

##

##

######### ###

#

########

###

####

###

##

### #

#

## #####

##

####### ############

##

######

#

########## ###########

#

#### ####

############# #####

#############

###

##########

##

###

#

###

# ##

#

############## ###

# #

#

########

#######

#

#####

####

######

#####

########

###

#######

#

########

## ######

### #

##########

#######

# ######

######

################

####

#

## #####

##

####

##

#

#########

##

## ### ##

##

##

# ##

#####

#

##

#

##### #

#######

## ## #################

#

####

#

#

########

###### ##

####

#

####

# ###

####

####

##

#

# ######## ######

#######

#############

##########

# ####### ## ##

##

###########

#

# ###

#

#

#

#######

###

#####

###

## ######

#### ##

#### ######

#

## #

######## #####

######

############

### ####

# ####### #######

### #####

#

###

#

#

######

####

## #####

## ######

###

# ### ## #

##

###

### #

##

# #

#####

#

#

##

#####

######################

#######

# ###

#

#

#

####### ####

########### ### ####

####

#

#

##

#######

#

###

##

#

####

######## #####

######

# ###

## ##

######### ##

##

### #####

# #

###### ###

# ######

#

## ### ########

#

###

#######

####### #

##########

#

####

####

######## ######################

# ## ##########

#

#####

######

###########

####

######

####

# ###

#

#

####

#######

# ###

### ######

##

## #

######

#######

###

### #####

#########

#

##

##

####

#

####

###

####

# #########

##

#

#

#

# ###

#

########

########

######

## ##

##################

####

###

##

###

##

#############

####

#

###

#

###

#

#

####

## #

###

######

###

#######

#####

####

#

# ## #####

##

# #

###

##

# ######## ##

###

##

#

# #

#

###########

###

# ######

#### #########

#######

# ############

### ############# #######

##

#####

######### ##### #

#########

## ############## #####

#######

################## ###

##

# ### #

###########

## ###############

#######

#####

####### #

# ###

# ### ###

############ #####

############## ### ###

###

### # ##

#### ### # ###

# ######

###

# ##

### #

##

# ##

#

#####

##

#

###########

# ###

###

####

##

### ###

###############

#

#

#

###

#

### #

##

#

#

### #

#

###

#

####

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

#

####

#########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################

#

#

#

#

##

# ## ##### ##

#################

###

####

# ##

####

########

#

###

###

##############

## #

# ###

#

# #########

################

##

#####

#

#

#

#

#

#

##

##

#

#

#

#

#

##

###

##

###

#

##

#

##

######

# ##

## #

## ### ##

####

######

##

##

# ####

####

#

######

###

###

##

##

##

#### ############

### ##### ######### ###### #

#####

#### #####

##

#

# ##

#

##

#

#

##

######

#

####

####

#

#

#

##

##

#

#

##

#

####

####

###

#

##

###

#

##

#####

#

# ## ##

#

#

###

##

##

#

##

#

##########

#

##########

#

#

##

# #

## #####

######

####

####

#### ##

##

### ###

### #####

### ## ###

##

#

#

#

##

#

#

##

##

## ##

##

####

#

#

#####

#######

#

##

#

###

##

####

#

## ##

#

##

##

#######

######

##

#

#### ##

###

#

# #

####

#

#

####

###

#

##

## ####

#

#

#

#

##

##

#######

# #

# ##

#

#

#####

#

#

####

#

#

###

########

## ##

#

###

#####

#

## ##

#

# ###

##

##

# #

#

#

#

#

##

#

##

##

#

###

###

##

#### #

#

##

#

##

#

#

#####

#

#

##

## ##

#

#

### #######

####

#

###

###

#

#

#

##

##

#

#

#

## #

#

#

#

#

##

#

#

##

#

#

#

####

#

###

###

#

### ###

#

#

#

#

#

#

# #

#### #####

#

#### #

##

#

##

# ###

#

### ######## #####

#####

##

# # ##

####### ##

##

##

###

#

#####

# ##

#

#####

#########

#

## # ##

#

##

##

####

##

##

#

#

#

###

#

###

##

##

##

####

##

##

#

##

#

###

##

####

#

#

## #

#

# ###############

#

# ##

###################

########## ###### ###########

#####

#

#

#

#

#

#

#

##

######

###

######

##

#

###

# #

###

###

####

# ######

#

##

##

#

####

#

#

#

##

#

#

## ### #

#

##

######

##

#

##

##

# ###########

#

#

##

###

#

#

##

###

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

#

#

#

#

##

##

#

#

#

#

#

##

####

###

#

###

###

###

#

##

#

#

#

##

#

#

##

###

#

##

###

# ## ## #

#

#

##

#

##

#

#

## ## # # ## ## #

###

##

#

##

# #

#

#

#

#

##

#

##

##

##

#

#

###

##

#

#

#

#

# #

##

##

###

##

##

##

##

##

## #

#

##

#

#

####

#

## #

#

#

#

#

#

# #

#

# #

####

# ## #

#

##

####

#

##

##

#

#

##

#

#

## #

#

#

#

#

#

##

## #

# ## #####

#

#

### #

#

#

#

###

#

## ##

#

#

##

#

##

##

####

#

#

##

#

#

###

#

#

## ##

#

### #

#

## ##

#

#

#

#

#

## ##

##

###

## ## ###

#

#

###

##

#

###

###

####

#

##

#

#

#

#

#

#

###

#

#

#

# ##

#

## #

##

#

#

#

##

#

##

#

##

##

##

#

#

####

#

###

#

# #

###

##

#

#

##

#

### #

###

## #

Hirat

Farah

Ghor

HilmandNimroz Kandahar

Badakhshan

Uruzgan Ghazni

Balkh

Zabul

Faryab

Paktika

Baghlan

Badghis

Sari Pul

Takhar

Bamyan

Jawzjan

Parwan

Wardak

Nuristan

Samangan

Kunduz

Paktya

KunarKabul

Nangarhar

Khost

Pakistan

Uzbakistan

Turkmanistan

Iran

Tajikistan

China

Dot=10 Persons/Sq Km

Non-Polio AFP Rate by Province, Afghanistan per 100,000 under 15 years

2008

2007

2006

0-0.991-2.993-4.995+


2.96

2.30

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Badak

hshan

Centra

lEas

t

North

East

North

South

east

South

Wes

tAFG

Per

cen

tage

Y06 Y07 Y08

% of AFP cases reported within 7 days of paralysis onset by region Afghanistan 06-08


Proportion Of Adequate Stools By Region Afghanistan 06-08

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Badak

hsha

n

Centr

alEas

t

North

East

North

South

east

South

ern

Wes

t

Nation

al

Per

cent

age

2006 2007 2008


0102030405060708090

100

Badak

hshan

Centr

al

Easte

rn

North

East

North

ern

South

easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

2006 2007 2008

AFP Cases with Stool Specimen Reaching The RRL Within 3 and 7 Days of 2nd Specimen Collection By Region, Afghanistan 06-08

Within 3 days

Within 7 days

0102030405060708090

100

Badak

hshan

Centr

al

Easte

rn

North

East

North

ern

South

easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

2006 2007 2008


0

2

4

6

8

10

12

14

16

18

Badak

hshan

Centra

l

Easte

rn

North

Easth

ern

North

ern

South

Easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

Pe

rce

nta

ge

Y06 Y07 Y08

Percentage of Entero -Virus and SL isolation Afghanistan 06-08

0

5

10

15

20

25

30

35

Badak

hshan

Centra

l

Easte

rn

North

Easth

ern

North

ern

South

Easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

Pe

rce

nta

ge

Y06 Y07 Y08

Entero Virus

SL

Per

cent

age

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

Jan Feb Mar Apr May Jun Jul Aug Sep Oct Nov Dec

Y06 Y07 Y08

EV % by month 06-08


Afghanistan Polio Eradication Initiative Surveillance Update Week 29 ( Ending on Saturday 19 July...

Documents

Transcript of Afghanistan Polio Eradication Initiative Surveillance Update Week 29 ( Ending on Saturday 19 July...