ERCC  2.0  Workshop  

Day  2  July  11,  2014  

Sarah  Munro  and  Marc  Salit    

WELCOME  

Charge  to  the  Workshop  

•  Develop  consensus  on…    –  Concept  

•  Shared  interests  –  PorDolio  

•  Controls  •  Analysis  •  Documentary  Standards  

•  Develop  consorGum  structure…  – Working  groups  –  Steering  commiHee  

What  we  heard  yesterday…  •  Stage  in  complexity  •  PrioriGze  clinical  applicaGons  •  PrioriGes  we  heard  yesterday…  

–  Update  formulaGons  of  ERCC  1.0  controls  –  Refinement  of  “monolithic”  transcripts  –  Cancer  fusion  transcripts  –  Transcript  isoforms  

•  Allele  specific  expression  could  be  included  applicaGon  –  miRNAs  –  Use  of  controls  in  FFPE  samples  –  Allele  specific  expression  is  an  important  applicaGon  to  consider    

•  Not  combined  in  one  mixture  or  product  •  Nothing  is  off  the  table  •  Establish  principles  for  growing  porDolio  

Blue  text  added  during  discussion    

Agenda  

•  ParGcipant  PresentaGons  –  James  Willey  –  Tyson  Clark  –  Elizabeth  Tseng  –  Joel  Myerson  

•  Open  Pitch  Session  

•  Break:  10:30  –  11:00am  •  Planning  our  work  •  Steering  CommiHee  SelecGon  

•  MeeGng  Summary  Discussion  &  Next  Steps  

PARTICIPANT  PRESENTATIONS  

OPEN  PITCH  SESSION  

MEETING  SUMMARY  DISCUSSION  &  NEXT  STEPS