Primary Data for Chemistry

9. DINI-Jahrestagung und Herbstsitzung des DBV, Sektion 4 „Wissenschaftliche Bibliotheken“ | 22. und 23. Oktober 2008 | Hamburg

Hochschulen zwischen Konkurrenz und Kooperation – die Vernetzung der Informationsinfrastrukturen für die Wissensgesellschaft

DataCite Summer Meeting 2010, Hanover, June 7/8, 2010

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DataCite Summer Meeting 2010Making Datasets Visible and Accessible

June 7/8, 2010

Primary Data for Chemistry

Susanne Haak,1 Guido F. Herrmann,1 Irina Sens,2 Jan Brase2

1 Georg Thieme Verlag KGRuedigerstrasse 14, 70469 Stuttgart, Germanywww.thieme-chemistry.com

2 German National Library of Science and Technology (TIB)Welfengarten 1B, 30167 Hannover, Germanyhttp://www.tib-hannover.de; http://www.datacite.org

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Thieme Chemistry Part of the Thieme publishing group, based in Stuttgart (Germany)

Publishes highly evaluated information about synthetic and general chemistry for professional chemists and advanced students since 1909.

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BACKGROUND

Gap in the scientific record between published research and the underlying data

• Published work held by publishers and libraries

• Datasets held by data centers

• No effective way to link between datasets and articles

• No widely used method to identify datasets

• No widely used method to cite datasets

As a result, datasets are• Difficult to discover

• Difficult to access

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BACKGROUND

Source: www.perkin-elmer.com

In chemistry research data are created:

• Using the vast array of chromatographic methods (GC, HPLC etc.)

• Employing spectroscopic methods (NMR, MS, UV/VIS, IR, X-ray etc.)

• As a result of theoretical calculations (quantum mechanics, simulation of spectra etc.)

• Or by using the various high-throughput technologies in medicinal chemistry

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source: www.perkin-elmer.com

Estimation:

Primary Data in Organic Chemistry

500.000 to 1.000.000Datasets Per Year

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What is needed:• Servers/Data Centers

• Metadata

• DOI

Digital Object Identifier (DOI)http://dx.doi.org/10.1055/s-2008-1067226

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PROCESS

1. At the same time with the article the author submits the research data to Thieme.

2. Thieme hosts the research data in a data center (FIZ Karlsruhe).

3. TIB assigns a DOI to the data.

4. At the same time the article is published the primary data are published as independent entity but in connection with the article.

5. The article quotes the research data as reference items with the assigned DOI.

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BACKGROUND

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RESULTS

ppm (f1)0.01.02.03.04.05.06.07.08.0

0

5000

10000

ppm (f1)050100150

-500

0

500

1000

1500

2000

2500

3000

ppm (f2)0.01.02.03.04.05.06.07.0

0.0

1.0

2.0

3.0

4.0

5.0

6.0

7.0

ppm (f1)

ppm (f1)050100150

-500

0

500

1000

1500

2000

2500

3000

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BACKGROUND

PROCESS

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Benefits

• Citability of research data

• High visibility of the data

• Easy re-use and verification of the data sets

• Avoiding duplications

• Motivation for new research

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Benefits for authors

• More work

• Proof of quality

• Documentation of validity

• More exposure for results

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Benefits for users

• Quick evaluation of papers

• Find structures by spectra

• Find similar patterns

• Understand individual peaks

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Open questions

• No specific regulations so far

• Copyright

• Centralized data hosting

• Data compatibility

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