Post on 10-Aug-2020
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
MIC, microbiologically influenced
corrosion
Lasgroep Noord
Sabine Doddema
(MIC specialist)
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Aaltje Joldersma
(Moleculair biologisch specialist)
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Bioclear – Microbial Analysis
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Interpretatie &
Advisering Veldondersteuning
Identificatie & detectie van
Micro-organismen
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Wat zijn “Micro-organismen”?
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Waar denk je aan?
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Waar denk ik aan?
Bron: Micropia, The Netherlands
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Korte introductie.
Definitie:
“De verzamelnaam voor alle niet met het blote
oog waarneembare organismen, meestal
bestaande uit één cel”
Bacteriën, archaea, schimmels en virussen”
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Feit: Micro-organismen zijn overal!
Soil
108/gram Water
106/ml
Bacterial Life
Air
103/m3
Sou
rce
of
pic
ture
: 4ev
er.e
u
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Water, bron van leven
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Proost!
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Groot, kleiner, kleinst
decameter meter dm cm mm 100 µm 10 µm µm 100 nm 10 nm nm
Blauwe Vinvis 3 30 300 3000 30000 300000 3000000 30000000 300000000 30000000000 300000000000
Mens 0.2 2 20 200 2000 20000 200000 2000000 20000000 2000000000 20000000000
Muis 0.01 0.1 1 10 100 1000 10000 100000 1000000 100000000 1000000000
Vlieg 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000 10000 100000 10000000 100000000
Vlo 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000 10000 1000000 10000000
Huisstofmijt 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000 100000 1000000
Menselijke cel 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 10000 100000
Bacterie 0.0000001 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000
Virus 0.00000001 0.0000001 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100
Viroïde 0.000000001 0.00000001 0.0000001 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10
Molecuul 0,0000000001 0.000000001 0.00000001 0.0000001 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Korte introductie.
Micro-organismen
zijn overal!
150 verschillende soorten bacteriën
1.500 per cm2
Gemiddeld bureau: 400x zoveel bacteriën dan
een toilet
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Micro-organismen die metalen beïnvloeden
Meerdere benamingen:
Microbiële corrosie
Biologische corrosie
Bacteriële corrosie
Biocorrosie
Microbiologisch beïnvloede corrosie
MIC (Microbiologically Influenced Corrosion)
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Korte introductie.
Definitie MIC:
“Corrosie geïnitieerd en/of versneld door de
activiteit van micro-organismen”
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Effect MIC
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
De activiteit van micro-organismen leidt tot 100 keer snellere corrosiesnelheden
Bij ~ 40% van de corrosie gevallen is MIC betrokken
Bij ~15% van de corrosie gevallen is MIC de directe oorzaak van schade
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Hoe herken je MIC?
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Eigenschappen van MIC
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Checklist voor het vaststellen van MIC
Morfologie:
Putcorrosie? Biofilm? Kleur? Geur?
Chemie:
Omgevingscondities (nutriënten,
biocide, flow, chloriden)
Mineralogie:
Samenstelling corrosieproduct
Microbiologie:
Aanwezigheid van micro-organismen
RVS
Koolstofstaal
Beton
Corrosieproduct
Bacteriën
Schimmels
Archaea
Water
Temperatuur
pH
C-bron
N-bron Zuurstof
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Micro-organismen betrokken bij MIC
Sulfaatreducerende bacteriën
Zwaveloxiderende bacteriën
IJzerreducerende bacteriën
IJzeroxiderende bacteriën
Slijmvormende bacteriën
Zuurproducerende micro-organismen
Methanogenen
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Principe MIC
Veel bacteriën en archaea zijn
betrokken bij MIC
SRB worden vaak als indicator
organisme gebruikt
Meten op de groep bacteriën
is niet bruikbaar om MIC te
meten Petroleum Microbiology Research Group, Department of Biological Sciences, University of Calgary, Canada
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Hoe meet je micro-organismen eigenlijk?
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Bijvoorbeeld via kweek (culturing)
Voorbeelden kweek:
BART ™
MICkit III, MICkit IV
Sani-check
Voordelen van deze techniek:
Gemakkelijk uitvoerbaar
Goedkoop
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Nadeel kweek versus voordeel moleculaire methoden
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Detectie of Identificatie?
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Kijken naar genetisch materiaal (DNA of RNA)
Kwantificatie en gedetailleerde identificatie
Ook van een complexe biologische samenstelling
Hoe veel? Wie?
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Detectie Identificatie
Welke aanpak past bij de vraagstelling?
Illustratie aan de hand van een hypothetische dierentuin
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Voorbeeld: Meten binnen een dierentuin populatie
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Detectie middels QPCR
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Meten van soorten: Target op Apen (vergelijkbaar met meten op Gallionella spp. (ijzeroxidatie))
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
QPCR meting op soorten
Monstercode Eenheid 001
(N/swab)
Detection limit 1x100
Target op apen Cellen 7x100
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Detectie middels QPCR
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Meten op functionele genen: Target op gen
verantwoordelijk voor vleesetend (vergelijkbaar met Sulfite Reductase voor SRB activiteit )
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
QPCR meting op functionele genen
Monstercode Eenheid 001
(N/swab)
Detection limit 1x100
Functioneel gen op ‘Vleesetend’ Cellen 1.0x101
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Identificatie (Bioprophyler®)
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Meting op aanwezige soorten:
Target op bacteriën, archaea op schimmels
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Bioprophyler ® (soorten) Monstercode Eenheid 001
(N/swab)
Aap Celllen 7x100
Zebra Celllen 2x100
Olifant Celllen 2x100
Panter Celllen 2x100
Leeuw Celllen 1x100
Slang Celllen 1x100
……………………..
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Identificatie (MetaPathViewer)
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Meting van aanwezige soorten and functionele genen:
Target op alle organismen and hun functies
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
MetaPathViewer (soorten en functies) Monstercode Eenheid 001
(N/swab)
Functioneel gen op ‘Vleesetend’ Cellen 10x100
Functioneel gen op ‘Grasetend’ Cellen 3x100
Functioneel gen op ‘Bladetend’ Cellen 3x100
Functioneel gen op ‘Insectenetend Cellen 2x100
Monstercode Eenheid 001
(N/swab)
Aap Celllen 7x100
Zebra Celllen 2x100
Olifant Celllen 2x100
Panter Celllen 2x100
Leeuw Celllen 1x100
Slang Celllen 1x100
……………………..
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Zelf aan de slag!
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
Je eigen DNA!
+31 50 520 54 70 | microbialanalysis@bioclear.nl | www.microbialanalysis.com
keep MIC in mind