Madagascar: need and opportunity Brian Fisher, California Academy of Sciences Madagascar...

Post on 04-Jan-2016

218 views 0 download

Tags:

Transcript of Madagascar: need and opportunity Brian Fisher, California Academy of Sciences Madagascar...

Madagascar: need and opportunity

Brian Fisher, California Academy of Sciences

Madagascar Biodiversity Center

Alex Smith, Guelph

MBC inventory team

1. What living things exist?

2. Where do they live?

178 inventory sites

HL

HW

EL

worker head measurements

90% of taxonomic products

never used

Museum: warehouse of dead creatures

Not a spatio-temporal portal on life

Is taxonomy dead?

no

in the middle of a breakthrough

but

taxonomists are dying

Does this matter?

If you study

less so

But, if you like

you are in trouble

Why does this matter?

Species Scape

Organisms drawn proportional to number of species in each group

Lots of undescribed species

Fewer taxonomists

"suicidal" experiment

linked to understanding impact of human

activities

Dow Jones index to the environment

Original Habitats:10% remain

Using taxonomic data, the

government will triple protected

habitat in 5 years

178 inventory sites

Industrial-strengthspecimen processing

streamlines data management

Develop inventory methods

Establish processing centers

Accelerate identification

Apply to conservation

HL

HW

EL

worker head measurements

Madagasc

ar

Bio

div

ers

ity C

ente

r

Madagasc

ar

Bio

div

ers

ity C

ente

r

Madagasc

ar

Bio

div

ers

ity C

ente

r

2%

6000 specimens from 600 species

8,000 sequences 600 species

Anochetus grandidieri

Heterogeneity in the CO1 barcode for Malagasy Anochetus

A T C G N

1 200 300 400 500 657

Anochetus madagascarensis

1 200 300 400 500 657

Anochetus goodmani

1 200 300 400 500 668

Anochetus boltoni

1 100 200 300 400 500 657

Anochetus pattersoni

1 200 300 400 500

Anochetus goodmaniMorphologically one species with deep within-species CO1 divisions.

CASENT0015325

CASENT0432938

CASENT0428100

CASENT0499020

CASENT0505299

CASENT0076507

CASENT0015325

CASENT0499942

CASENT0498310

99

99

99

95

100

100

CASENT0022239

Ergatoid queens with extremely

localised dispersal

Voucher Specimens and minimalist barcodes

de facto database of Pacific region invasive ants

Formicidae – Madagascar – Estimation of Diversity

CASENT0001355

CASENT0001355-D01

268 specimens collected from 4 different sites.

Morphospecies

Barcode OTU

Cat aul acus sp. | CASENT0107723- D 01| Am bat o

Cat aul acus sp. | CASENT0107010- D 01| Am bat o

Cat aul acus sp. | CASENT0107722- D 01| Am bat o

Cat aul acus sp. | CASENT0107597- D 01| Am bat o

Cat aul acus sp. | CASENT0107063- D 01| Am bat oCat aul acus sp. | CASENT0107006- D 01| Am bat o

Cat aul acus sp. | CASENT0053861- D 01| Bi nar a

Cat aul acus sp. | CASENT0053726- D 01| Bi nar a

Cat aul acus sp. | CASENT0053821- D 01| Ant sahabe

Cat aul acus sp. | CASENT0053694- D 01| Ant sahabe

Tet r aponer a sp. | CASENT0053791- D 01| Ant sahabe

Tet r aponer a sp. | CASENT0053710- D 01| Bi nar a

Tet r aponer a sp. | CASENT0053869- D 02| M ar oj ej y

Tet r aponer a sp. | CASENT0053869- D 01| M ar oj ej y

Cer apachys sp. | CASENT0053843- D 01| Bi nar a

Cer apachys sp. | CASENT0053755- D 01| Bi nar a

Cer apachys sp. | CASENT0053713- D 01| Bi nar a

Cer apachys sp. | CASENT0053759- D 01| Bi nar aCer apachys sp. | CASENT0053758- D 01| Bi nar a

Cer apachys sp. | CASENT0053680- D 01| M ar oj ej y

Cer apachys sp. | CASENT0053863- D 01| M ar oj ej y

Tet r aponer a sp. | CASENT0107712- D 01| Am bat o

Tet r aponer a sp. | CASENT0107683- D 01| Am bat o

Tet r aponer a sp. | CASENT0107043- D 01| Am bat o

Tet r aponer a sp. | CASENT0107012- D 01| Am bat o

Tet r aponer a sp. | CASENT0107150- D 01| Am bat o

Tet r aponer a sp. | CASENT0107088- D 01| Am bat o

Tet r aponer a sp. | CASENT0107507- D 01| Ant sahabe

Tet r aponer a sp. | CASENT0053812- D 01| Ant sahabe

Tet r aponer a sp. | CASENT0053826- D 01| Ant sahabe

Tet r aponer a sp. | CASENT0053695- D 01| Ant sahabeTet r aponer a sp. | CASENT0107685- D 01| Am bat o

Tet r aponer a sp. | CASENT0107087- D 01| Am bat o

Tet r aponer a sp. | CASENT0107008- D 01| Am bat o

Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107594- D 01| Am bat o

Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107235- D 01| Am bat o

Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107151- D 01| Am bat o

Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107070- D 01| Am bat o

Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107061- D 01| Am bat o

Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107069- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107686- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107143- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107022- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0052522- D 01| Am bat oCam ponot us sp. | CASENT0107138- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107674- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107586- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107583- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107040- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107582- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107090- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107673- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0053811- D 01| Ant sahabe

Cam ponot us sp. | CASENT0053809- D 01| Ant sahabe

Cam ponot us sp. | CASENT0053784- D 01| Ant sahabe

Cam ponot us sp. | CASENT0053764- D 01| Bi nar a

Cam ponot us sp. | CASENT0053763- D 01| Bi nar aCam ponot us sp. | CASENT0053864- D 01| M ar oj ej y

Cam ponot us sp. | CASENT0053845- D 01| Bi nar a

Cam ponot us sp. | CASENT0053799- D 01| Bi nar a

Cam ponot us sp. | CASENT0053824- D 01| Ant sahabe

Cam ponot us sp. | CASENT0053823- D 01| Ant sahabe

Cam ponot us sp. | CASENT0053796- D 01| Bi nar a

Cam ponot us sp. | CASENT0107684- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107672- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107047- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107082- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107024- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107023- D 01| Am bat o

Cam ponot us sp. | CASENT0107080- D 01| Am bat oCam ponot us sp. | CASENT0053788- D 01| Ant sahabe

Cam ponot us sp. | CASENT0053787- D 01| Ant sahabe

Cam ponot us sp. | CASENT0053892- D 01| Bi nar a

Cam ponot us sp. | CASENT0053850- D 01| Bi nar a

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107720- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107716- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107147- D 02| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107147- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107062- D 02| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107062- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107028- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107508- D 01| Ant sahabe

Nesom yr m ex sp. | CASENT0053945- D 01| Ant sahabeNesom yr m ex sp. | CASENT0107710- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107682- D 02| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107682- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107026- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107191- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107191- D 02| Am bat o

Aphaenogas t er sp. | CASENT0107658- D 01| Am bat o

Technom yr m ex sp. | CASENT0107730- D 01| Am bat o

Technom yr m ex sp. | CASENT0053815- D 01| Ant sahabe

Technom yr m ex sp. | CASENT0107231- D 01| Am bat o

Pachycondyl a sp. | CASENT0107708- D 01| Am bat o

Pachycondyl a sp. | CASENT0107702- D 01| Am bat o

Pachycondyl a sp. | CASENT0107018- D 01| Am bat o

Pachycondyl a sp. | CASENT0107015- D 01| Am bat oPachycondyl a sp. | CASENT0107695- D 01| Am bat o

Pachycondyl a sp. | CASENT0053774- D 01| M ar oj ej y

Pachycondyl a sp. | CASENT0107700- D 01| Am bat o

Pachycondyl a sp. | CASENT0107032- D 01| Am bat o

Pachycondyl a sp. | CASENT0053877- D 01| Ant sahabe

Pachycondyl a sp. | CASENT0053714- D 01| Bi nar a

Pachycondyl a sp. | CASENT0053704- D 01| Bi nar a

Pachycondyl a sp. | CASENT0053672- D 01| M ar oj ej y

Pachycondyl a sp. | CASENT0053805- D 01| M ar oj ej y

Pachycondyl a sp. | CASENT0107042- D 01| Am bat o

Anochet us sp. | CASENT0107699- D 01| Am bat o

Anochet us sp. | CASENT0107590- D 01| Am bat o

Anochet us sp. | CASENT0107696- D 01| Am bat oAnochet us sp. | CASENT0107592- D 01| Am bat o

Anochet us sp. | CASENT0107083- D 01| Am bat o

Anochet us sp. | CASENT0053881- D 01| Ant sahabe

Anochet us sp. | CASENT0053792- D 01| Ant sahabe

Anochet us sp. | CASENT0053793- D 01| Ant sahabe

Anochet us sp. | CASENT0053848- D 01| Bi nar a

Anochet us sp. | CASENT0053711- D 01| Bi nar a

Anochet us sp. | CASENT0053798- D 01| Bi nar a

Anochet us sp. | CASENT0053684- D 01| Ant sahabe

Anochet us sp. | CASENT0053890- D 01| Bi nar a

Anochet us sp. | CASENT0053884- D 01| Ant sahabe

Anochet us sp. | CASENT0053785- D 01| Ant sahabe

Anochet us sp. | CASENT0053814- D 01| Ant sahabeAnochet us sp. | CASENT0053944- D 01| Ant sahabe

Anochet us sp. | CASENT0053696- D 01| Ant sahabe

Anochet us sp. | CASENT0053760- D 01| Bi nar a

Anochet us sp. | CASENT0053870- D 01| M ar oj ej y

Anochet us sp. | CASENT0053776- D 01| M ar oj ej y

O dont om achus sp. | CASENT0053868- D 01| M ar oj ej y

O dont om achus sp. | CASENT0053772- D 01| M ar oj ej y

H ypoponer a sp. | CASENT0107717- D 01| Am bat o

H ypoponer a sp. | CASENT0107706- D 02| Am bat o

H ypoponer a sp. | CASENT0107004- D 01| Am bat o

H ypoponer a sp. | CASENT0053697- D 01| Ant sahabe

H ypoponer a sp. | CASENT0053859- D 01| Bi nar a

H ypoponer a sp. | CASENT0053724- D 01| Bi nar aH ypoponer a sp. | CASENT0053935- D 01| Ant sahabe

H ypoponer a sp. | CASENT0053756- D 01| Bi nar a

H ypoponer a sp. | CASENT0053773- D 01| M ar oj ej y

H ypoponer a sp. | CASENT0053780- D 01| M ar oj ej y

H ypoponer a sp. | CASENT0053777- D 01| M ar oj ej y

Lept ogenys sp. | CASENT0053885- D 01| Ant sahabe

Lept ogenys sp. | CASENT0053857- D 01| Bi nar a

Lept ogenys sp. | CASENT0053719- D 01| Bi nar a

Lept ogenys sp. | CASENT0053717- D 01| Bi nar a

For m i ci dae| CASENT0053893- D 01| Bi nar a

Lept ogenys sp. | CASENT0053804- D 01| M ar oj ej y

Lept ogenys sp. | CASENT0053671- D 01| M ar oj ej y

Lept ogenys sp. | CASENT0053878- D 01| Ant sahabeLept ogenys sp. | CASENT0053790- D 01| Ant sahabe

Lept ogenys sp. | CASENT0053853- D 01| Bi nar a

Lept ogenys sp. | CASENT0053762- D 01| Bi nar a

Lept ogenys sp. | CASENT0053803- D 01| Bi nar a

Lept ogenys sp. | CASENT0053856- D 01| Bi nar a

Lept ogenys sp. | CASENT0053712- D 01| Bi nar a

Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107704- D 01| Am bat o

Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107593- D 01| Am bat o

Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107035- D 01| Am bat o

Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107005- D 01| Am bat o

Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0053854- D 01| Bi nar a

Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0053844- D 01| Bi nar a

Pyr am i ca sp. | CASENT0053722- D 01| Bi nar aSt r um i genys sp. | CASENT0053771- D 01| Bi nar a

St r um i genys sp. | CASENT0053770- D 01| Bi nar a

St r um i genys sp. | CASENT0053782- D 01| M ar oj ej y

St r um i genys sp. | CASENT0053781- D 01| M ar oj ej y

St r um i genys sp. | CASENT0053779- D 01| M ar oj ej y

Pl at yt hyr ea sp. | CASENT0107701- D 01| Am bat o

Par at r echi na sp. | CASENT0107733- D 01| Am bat o

Par at r echi na sp. | CASENT0107718- D 01| Am bat o

Par at r echi na sp. | CASENT0107149- D 01| Am bat o

Par at r echi na sp. | CASENT0053939- D 01| Ant sahabe

Par at r echi na sp. | CASENT0107591- D 01| Am bat o

Par at r echi na sp. | CASENT0107002- D 01| Am bat o

Pr i onopel t a sp. | CASENT0053874- D 01| M ar oj ej yM el i s sot ar sus sp. | CASENT0107665- D 01| Am bat o

M el i ssot ar sus sp. | CASENT0107663- D 01| Am bat o

Tapi nom a sp. | CASENT0107714- D 01| Am bat o

Ter at aner sp. | CASENT0107698- D 01| Am bat o

Ter at aner sp. | CASENT0107589- D 01| Am bat o

Ter at aner sp. | CASENT0107675- D 01| Am bat o

Ter at aner sp. | CASENT0107670- D 01| Am bat o

Ter at aner sp. | CASENT0107693- D 01| Am bat o

Ter at aner sp. | CASENT0107692- D 01| Am bat o

Ter at aner sp. | CASENT0107585- D 01| Am bat o

Ter at aner sp. | CASENT0107009- D 01| Am bat o

Ter at aner sp. | CASENT0053820- D 01| Ant sahabe

Ter at aner sp. | CASENT0053686- D 01| Ant sahabeTer at aner sp. | CASENT0053709- D 01| Bi nar a

Ter at aner sp. | CASENT0053708- D 01| Bi nar a

Aphaenogas t er sp. | CASENT0053752- D 01| Bi nar a

Eut et r am or i um sp. | CASENT0053682- D 01| M ar oj ej y

Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107071- D 01| Am bat o

Pl agi ol epi s sp. | CASENT0107001- D 01| Am bat o

M yst r i um sp. | CASENT0053888- D 01| Bi nar a

M yst r i um sp. | CASENT0053720- D 01| Bi nar a

Phei dol e sp. | CASENT0107724- D 01| Am bat o

Phei dol e sp. | CASENT0107719- D 01| Am bat o

Phei dol e sp. | CASENT0107715- D 01| Am bat o

Phei dol e sp. | CASENT0053775- D 01| M ar oj ej y

Phei dol e sp. | CASENT0053942- D 01| Ant sahabePhei dol e sp. | CASENT0053941- D 01| Ant sahabe

Phei dol e sp. | CASENT0053936- D 01| Ant sahabe

Phei dol e sp. | CASENT0053689- D 01| Ant sahabe

Phei dol e sp. | CASENT0053842- D 01| Bi nar a

Phei dol e sp. | CASENT0053767- D 01| Bi nar a

Phei dol e sp. | CASENT0053688- D 01| Ant sahabe

Phei dol e sp. | CASENT0107057- D 01| Am bat o

Phei dol e sp. | CASENT0107506- D 01| Ant sahabe

Phei dol e sp. | CASENT0053872- D 01| M ar oj ej y

Phei dol e sp. | CASENT0107711- D 01| Am bat o

Phei dol e sp. | CASENT0107084- D 01| Am bat o

Phei dol e sp. | CASENT0107091- D 01| Am bat o

Phei dol e sp. | CASENT0107016- D 01| Am bat oPhei dol e sp. | CASENT0107190- D 01| Am bat o

Phei dol e sp. | CASENT0107679- D 01| Am bat o

Phei dol e sp. | CASENT0107681- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107731- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107726- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107705- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107233- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107054- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107013- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0053827- D 01| Ant sahabe

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107707- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107025- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107184- D 01| Am bat o

Cr em at ogast er sp. | CASENT0107059- D 01| Am bat oAphaenogas t er sp. | CASENT0107660- D 01| Am bat o

Aphaenogas t er sp. | CASENT0107662- D 01| Am bat o

M onom or i um sp. | CASENT0107689- D 01| Am bat o

M onom or i um sp. | CASENT0107671- D 01| Am bat o

M onom or i um sp. | CASENT0053783- D 01| M ar oj ej y

M onom or i um sp. | CASENT0107064- D 01| Am bat o

M onom or i um sp. | CASENT0107081- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107146- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107052- D 01| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107060- D 02| Am bat o

Nesom yr m ex sp. | CASENT0107060- D 01| Am bat o

Tet r am or i um sp. | CASENT0107713- D 01| Am bat o

Tet r am or i um sp. | CASENT0107003- D 01| Am bat oTet r am or i um sp. | CASENT0053946- D 01| Ant sahabe

Tet r am or i um sp. | CASENT0053943- D 01| Ant sahabe

Tet r am or i um sp. | CASENT0107703- D 01| Am bat o

Tet r am or i um sp. | CASENT0053940- D 01| Ant sahabe

Tet r am or i um sp. | CASENT0053828- D 01| Ant sahabe

Tet r am or i um sp. | CASENT0053822- D 01| Ant sahabe

Tet r am or i um sp. | CASENT0053685- D 01| Ant sahabe

Tet r am or i um sp. | CASENT0053691- D 01| Ant sahabe

Tet r am or i um sp. | CASENT0053687- D 01| Ant sahabe

Tet r am or i um sp. | CASENT0053813- D 01| Ant sahabe

Tet r am or i um sp. | CASENT0053894- D 01| Bi nar a

Tet r am or i um sp. | CASENT0053769- D 01| Bi nar a

Tet r am or i um sp. | CASENT0053725- D 01| Bi nar aTet r am or i um sp. | CASENT0053723- D 01| Bi nar a

Tet r am or i um sp. | CASENT0053889- D 01| Bi nar a

Tet r am or i um sp. | CASENT0053858- D 01| Bi nar a

Tet r am or i um sp. | CASENT0053802- D 01| Bi nar a

Tet r am or i um sp. | CASENT0053860- D 01| Bi nar a

Tet r am or i um sp. | CASENT0053757- D 01| Bi nar a

Tet r am or i um sp. | CASENT0053806- D 01| M ar oj ej y

Tet r am or i um sp. | CASENT0053808- D 01| M ar oj ej y

Si m opone sp. | CASENT0107029- D 01| Am bat o 5%

RESULTS

No significant difference between morphospecies or barcode OTU’s estimates of taxonomic richness

0

10

20

30

40

50

60

Ambato Marojejy Antsahabe Binara

Sites

Ric

hn

ess

0

10

20

30

40

50

60

Ambato Marojejy Antsahabe Binara

Sites

Ric

hn

ess

0

10

20

30

40

50

60

Ambato Marojejy Antsahabe Binara

Sites

Ric

hn

ess

Morphospecies

3% Barcode OTU

2% Barcode OTU

Smith et al 2005

processed loaned barcoded

3,000,000

719,000

10,000

25 %

0.3 %

Dow Jones Index

Mystrium fallux

Mystrium mysticum

Mystrium sp. nov.

Mystrium obertheri